3BLAA

Synthetic gene encoded dcps bound to inhibitor dg153249
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
293
structure length
286
Chain Sequence
LPFSGFRLQKVLRESARDKIIFLHGKVNEEDAVVILEKTPFQVEQVAQLLTGSPELQLQFSNDIYSTYHLFPPRQLNDVKTTVVYPATEKHLQKYLRQDLRLIRETGDDYRNITLPHLESQSLSIQWVYNILDKKAEADRIVFENPDPSDGFVLIPDLKWNQQQLDDLYLIAICHRRGIRSLRDLTPEHLPLLRNILHQGQEAILQRYRMKGDHLRVYLHYLPSYYHLHVHFTALGFEAPGSGVERAHLLAEVIENLECDPRHYQQRTLTFALRADDPLLKLLQEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title DcpS as a therapeutic target for spinal muscular atrophy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Scavenger mRNA-decapping enzyme DcpS
total genus 73
structure length 286
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.59: 5'-(N(7)-methyl 5'-triphosphoguanosine)-[mRNA] diphosphatase.
pdb deposition date 2007-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05652 DcpS Scavenger mRNA decapping enzyme (DcpS) N-terminal
A PF11969 DcpS_C Scavenger mRNA decapping enzyme C-term binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3blaA01
3.30.428.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich HIT family, subunit A HIT-like 3blaA02
4QEBA 4NDFA 5IPDA 3SZQA 1AV5A 2EO4A 3WO5A 1VLRA 5ED3A 4INCA 6FITA 5IPEA 5RHNA 3N1TA 3I24A 2Q4HA 1GUPA 3SP4A 3OHEA 3OMFA 3KSVA 4RHNA 4EQEA 1FITA 3O1CA 1FHIA 3O1ZA 1EMSA 3TW2A 3O1XA 4XBAA 1HXQA 5I2FA 4NDHA 4QDVA 3QGZA 5IN3A 1RZYA 1XMMA 3BLAA 5FITA 4ZKLA 3R6FA 1KPCA 1Z84A 3RHNA 1KPAA 1HXPA 4NK0A 3ANOA 1GUQA 3SPLA 4NDGA 4NDIA 2OIKA 4NJYA 3OXKA 1Y23A 4NJXA 4INIA 4EQGA 4FITA 4ZKVA 3NRDA 5BV3A 3BL9A 3LB5A 1ST4A 3I4SA 3FITA 3O0MA 4YKLB 1KPBA 2FITA 6RHNA 1ZWJA 3P0TA 3N1SA 3BL7A 1KPFA 4QDEA 5ED6A 1ST0A 1KPEA 3IMIA 4NJZA 5IPCA 1XMLA 4ZGLA 4EGUA 5IPBA 2FHIA 5I2EA 5EMTA 5CS2A 4EQHA 3SPDA 2H39A 3L7XA 2Q4LA 3OJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GHVA 1Y8YA 2ZB1A 2R3KA 4ZLZA 1M17A 2W9ZB 3K54A 4DN5A 1WBOA 1G5SA 2GNJA 2OFVA 3AMAA 3SRVA 3MPMA 3R02A 4JIAA 4AXFA 2EO4A 2BUJA 1ZWSA 1JOWB 3EYGA 3Q04A 3K2LA 3HEGA 4ZSEA 2OXYA 3VUIA 3DJ7A 3VBVA 2VX3A 1PXLA 3H9FA 4NZWB 1M14A 1XWSA 3CP9A 5KZ0A 2PE0A 5F94A 5E8XA 3I79A 3LXPA 2WAJA 2Q4HA 4BY9E 2OJGA 3ZTXA 5A6NA 3QKMA 2UZBA 4M13A 5KBRA 3DJ5A 4KS8A 3QD2B 5BVEA 2JDVA 3CKWA 4S31A 5ANJA 1J7IA 3BKBA 3C13A 4JQ7A 4JRNA 4P5ZA 5FQDC 5KMLA 2PVLA 1GZ8A 3VJNA 3I0QA 1FGKA 1Q97A 4XBAA 3C0IA 5JGDA 1ZY5A 4MD9E 4QP6A 2PVJA 3IQ7A 3PY3A 5EW9A 3SG8A 4IB0A 4NDHA 4GV1A 2ZDUA 5C4KA 4FNXA 4MQ2A 2B0QA 4PTCA 3QTRA 4AU8A 4DHZA 3TYKA 5CX9A 4DEDA 4NT4A 2YIRA 4WA9A 4LFIA 4YC6A 3F5XA 3MDYA 4TNBA 4FYOA 1Q8WA 2YIWA 3PP0A 4JS8A 1PMVA 5ANDA 3PZEA 2V22A 4BVUA 2B1PA 3FI2A 4JL9A 4XG6A 1Q4LA 3ZUVA 4FYNA 3GC7A 3OF0A 2J0KA 3HRBA 4ANBA 1DS5A 2JAVA 2PPQA 3WOWA 2UW4A 5ANEA 3IS5A 2NO3A 3WE8A 4Z7HA 3P7BA 2VTTA 5EH0A 4KBAA 4J52A 2PUNA 1E9HA 4L9IA 4EK4A 3BGPA 3G6GA 3WBLA 4BBMA 4YMJA 3LB5A 2GHGA 4MQ1A 4QMUA 3E7VA 4QQJA 2WMRA 5JK3A 5M4IA 4DT9A 2XJ1A 2BZKB 4XS2A 1AGWA 3CC6A 3TUBA 1ZY4A 3Q9WA 5AIRA 3V8TA 3I5ZA 4XRLA 4I20A 3PUFC 2XK6A 2J2IB 4M69B 1QMZA 4ZTMA 5L2TA 1Q62A 2QG7A 5HCYA 5DHJA 2VO0A 3JVRA 4KIQA 2JGZA 4IM0A 5CAUA 3I81A 4IAIA 4I92A 3T9TA 1A48A 3FMEA 4JX7A 3R21A 3OUNB 5IPCA 4USEA 2XJ2A 5KHWA 4HJOA 2OZAB 3S2PA 5A4CA 4C34A 4R1YA 3QLGA 3KXNA 1KSWA 1V0BA 3LM5A 4WG5A 5ETFA 4C36A 1YXVA 2GFSA 3P79A 4CFWA 4AN2A 1MRUA 2YIQA 3PIXA 3OVVA 3OXZA 4U43A 5E92A 3DB6A 4LOQA 4Z9LA 3AC3A 1U54B 2IVTA 2VNWA 3G6HA 4PNIA 5LMKC 4TYIA 2FO0A 5BVDA 4L53A 1RW8A 3CJGA 3HMOA 4GL9A 4MCVA 5CEQA 4C58A 4CT1A 4INCA 4AGDA 2GTNA 4U8ZA 4YLJA 3DAEA 4TT7A 4EOMA 3MPAA 4CMTA 3FXWA 1URWA 3FLWA 1Q24A 4LV7A 4YJVA 4C61A 4CFNA 4LOOA 5JH6A 4EL9A 3IO7A 4CRLA 5I5ZA 3GCQA 4F7LA 1QPJA 2W1DA 5CANA 2QI8A 3BQCA 5BQ0A 3QTIA 3HV6A 2BPMA 3QUDA 2PVNA 4YJTA 5CU2A 1EMSA 3AXWA 4FEXA 4IM2A 4WHZA 4RC2A 4GU9A 5CU3A 2XNMA 3UZTA 2WQBA 4ZY5A 4QMVA 3BBTB 4RX5A 4GJ2A 2C30A 3QUPA 4IAZA 5HX8A 4AAAA 2WTDA 2O5KA 3VS6A 2CGXA 2POFA 1KE8A 1REJA 1UKIA 2WU7A 3H9OA 3JPVA 4L3JA 4YO6A 2CHLA 5IUGA 4XOZA 3P5KA 5GJFA 2C1AA 2PVMA 5EW8A 1H1PA 3R73A 2O8YA 2R3JA 4F99A 1KPCA 3R6FA 4A9SA 3AKJA 4LG4A 2QOLA 4UWBA 4XH6A 4D55A 1ZZ2A 2JD5A 3EH9A 4G0JA 2W5AA 2VTAA 4I5PA 4EZ3A 2VN9A 4Y5HA 1FMKA 1Q3DA 3I1AA 4JI9A 4IH8A 2BKKA 4I3ZA 5E8ZA 2CMWA 2OIKA 2RFDA 4I41A 4EOLA 4L46A 2R64A 4BBFA 4U7ZA 5A4TA 1KOBA 2WMUA 2R3QA 4G9RA 4EQGA 2VGOA 5CXHA 5CEMA 1APME 4F4PA 1Y8GA 1TQPA 4NUSA 5AV4A 4FV7A 3PG3A 4WNKA 4V05A 1DAYA 4R77A 4H36A 2QURA 2BIKB 2R3HA 3COKA 3WF6A 2CNVA 2P2IA 4AA5A 4AQKA 3OW4A 4FIFA 4RWIA 3UPXA 5A14A 2JBOA 3LCOA 4AOIA 3F3TA 4BR3A 4RT7A 5AUUA 2CDZA 5HLPA 4OBOA 3WIGA 3HGKA 5CT0A 3CBLA 4A9UA 4FV1A 4O0UA 4E4NA 3UJGA 2R3MA 4CG8A 4F78A 3VUMA 3RNIA 3DBFA 1OUKA 4K6ZA 1AQ1A 3DFAA 2OWBA 4LGHA 4XV3A 4EH7A 5JQ8A 3RHKA 4F9CA 5AAEA 4F70A 5EYKA 4BZDA 2NP8A 3UYTA 2JIUA 1ZLTA 4QMQA 2JAMA 3AD6A 3S95A 2C3KA 4ZLOA 4FTIA 4E1ZA 3LFDA 4P5QA 4IANA 3QQLA 4FTRA 4E4XA 4F7JA 1U59A 4D28A 5LVMA 3QTXA 5CS2A 5C4LA 4AZTA 5LARA 3UDBA 4YZNA 4EWHA 3HAVA 4X7QA 4RVTA 4CFMA 3M2WA 3DK6A 3C1XA 3NAXA 4BCJA 1GNGA 4Y85A 3E8CA 3QGWA 4H58A 3C5UA 3SW7A 5HX6A 1KE7A 3TTJA 5EKOA 4IVDA 4C0TA 2V55A 2WB8A 1OBGA 5IDNA 2AC5A 3FL4A 2YM7A 4M68A 2XNPA 4ALWA 4B0GA 3EFWA 4NWMA 2W1IA 4U44A 2E9NA 5FM3A 5B7VA 4AT4A 2BCJA 5CNOA 1BUHA 5ACKA 4G6OA 2QHNA 3WZJA 4FKVA 3NW5A 3KRWA 2YCFA 3AC2A 3TKIA 1HCLA 5AUVA 5KHXA 4E8AA 3FJQE 3AC1A 3QCSA 4W4YA 2IG7A 3KXMA 3RAHA 3EQPA 4D2RA 3W18A 1H0WA 2FSTX 2JIVA 2Q0NA 2XRUA 3FI3A 1XBAA 3LLAA 2C6EA 4FUYA 4QMPA 5IN3A 5IEXA 4R3CA 5HLNA 1NVQA 2O65A 4DH5A 3FMDA 1U4DA 1P4FA 1JSUA 2EXCX 2VWYA 1WCCA 4FIHA 3II5A 4Q5HA 2B9IA 5CT7A 4AGWA 4AT3A 4NTTA 5I0BA 2IZSA 1PMNA 2WQMA 2NRUA 4I1ZA 2PK9A 1OIRA 4ITJA 3U87A 3UVQA 4I6LA 3ZEPA 4UY9A 5E8SA 2YM8A 4IW0A 3UZRA 3GBZA 1RJBA 3EQIA 3WE4A 4NJDA 4ASXA 2B7AA 2YM3A 4NKSA 3DAJA 4CTCA 2ONLC 4FKLA 4KKHA 2Z7QA 4FT3A 2FSMX 3CQEA 2XYUA 3I7CA 2VTRA 3LMHA 5ANOA 5L8KA 2VD5A 5CEIA 4OTQA 4XEYA 1WBPA 3BIZA 1IR3A 2OI4X 3MY1A 4G5PA 4XMOA 2IWIA 3BGQA 3I4SA 5EHLA 4FMQA 4V0GA 4ZAUA 5J5SA 1W7HA 4FK3A 3Q4TA 2XK8A 2EU9A 4N70A 4OW8A 4IAFA 3BEAA 3O0GA 4I94A 3Q96A 3GFWA 3D94A 4FT0A 2GNHA 3FKOA 4ZSAA 5HE3A 1G3NA 2HOGA 2O0UA 4LUDA 2XBJA 3PP1A 5CEPA 2WXVA 3DU8A 4FKIA 2XBAA 4XUFA 3BYSA 5BYZA 5HE1A 2F7ZE 3WZUA 1A06A 3L8PA 4ZJIA 3QXOA 4ASDA 1KPEA 5JKGA 4UZHA 3CQWA 3A7IA 4ACCA 1H24A 3ACKA 4WBBB 3GCPA 4L45A 3ZO2A 3E8NA 4QP9A 1SVEA 2OGVA 3GU4A 3UO5A 2ITWA 3NX8A 2YWVA 2X7OA 1TVOA 4DTAA 3CY2A 1PXJA 2PVKA 3KK9A 2RFSA 3QALE 3BYOA 1GZKA 3CE3A 1H27A 4BIEA 3OJ7A 3BWFA 3TNIA 4Q5EA 1OKYA 3ORPA 2XK3A 3DKOA 1PF8A 2J5FA 4TZRA 4DH1A 3SZQA 3RPOA 2Z7RA 2XANA 3TV4A 2ZV2A 3UC4A 1SM2A 4GVJA 1FQ1B 4XRJA 1YXXA 3V3VA 5HU3A 3THBA 3C4CA 3QYWA 3UO4A 2R2PA 1Y91A 2Y6MA 2CCIA 2JC6A 3NCGA 3VW8A 4BDFA 2BR1A 5E1SA 4AA0A 5JFVA 3UNJA 3NUNA 4KA3A 2WTKB 4FSMA 5CQWA 4USDA 3IDCA 2GHLA 2VTJA 3QWJA 1GUPA 1K9AA 3SV0A 3SP4A 4TWOA 4YJNA 3DCVA 1L8TA 3VUGA 3QA8A 3QQUA 2YFXA 4MD7E 2ZV9A 3NVMB 3L8SA 4ZTNA 2WQOA 2QOCA 2Y4IB 1J91A 2OH4A 3VO3A 3EQBA 4XBRA 1H1WA 3VN9A 4BZNA 4I5VA 2HW7A 3O96A 5ANIA 2UW6A 3EWHA 3IDPA 4GKIA 2DS1A 1YHSA 1FVVA 3UDTA 4C7TA 5I9VA 1ZYLA 2PY3A 3PJCA 4FIIA 2GS2A 3FMLA 5AUYA 3POOA 5HIDA 2WD1A 2IVUA 3W2RA 3KKVA 3MJ1A 4MBJA 4EHVA 3A7GA 2Y6OA 3PRIA 2ITUA 1BX6A 1YQJA 2YM4A 3QU0A 4W8EA 5GNKA 3F3WA 4UWCA 3UQFA 4AN9A 5E7RA 1HCKA 2PU8A 2W05A 3COHA 4R7IA 5C1QB 4QYFA 3UBDA 1YI3A 3F3VA 2W9FB 2IZRA 2WIPA 4UXLA 5CTPA 2VZ6A 3HECA 5BVFA 4I5TA 5E9EA 5T68A 3D83A 1FINA 4ZTLA 1VJYA 1BYGA 3OWLA 2X81A 2QR7A 4XYFA 3KC3A 3EB0A 5CS6A 4FV0A 4YURA 4ONAA 4YZ9A 3W8QA 5M07A 3PWDA 4AWIA 1REKA 3ORMA 4K9YA 5HG9A 5M09A 3KF7A 3OCSA 4PP9A 5HD4A 3HVCA 4FV9A 3QX4A 3SRVB 1E1VA 1PXIA 2PMIA 2H9VA 3DQWA 2ITYA 4FTCA 2PUPA 2YIYA 4F6WA 3PUPA 4MBLA 2JLDA 4WRSA 3NRMA 2X6EA 2UZOA 4HVIA 1OL1A 1RE8A 1XJDA 3VBWA 2DQ7X 4XLVA 4PQNA 4U5JA 4AOJA 5CYIA 3ANQA 4NCTC 3EN7A 4WRGA 3SC1A 3P0TA 2OU7A 5BVKA 2ITTA 3TNWA 3CD8A 4BDAA 4GCJA 2HXQA 4CFVA 5HBJA 2QO2A 2HW6A 3P08A 4NIFB 3SOAA 3AKLA 3FV8A 3KREA 3PWYA 4HZRA 3E88A 1CM8A 2ZOQA 5B0XA 2CNUA 1JKTA 3PXRA 4O7SA 4RQKA 3ZU7A 3IMIA 4NJZA 3R1YA 4EYJA 4FEQA 2WQEA 3LQ3A 5A3XA 2J90A 4EGUA 4EK5A 4DAWA 4EORA 2ITOA 4C4JA 1WBNA 3UDZA 2ITNA 2YZLA 2X8DA 3L9LA 2VWIA 2I0YA 3LFNA 4FIJA 5AP6A 4CNHA 4F64A 3EOCA 3ORLA 4RVKA 2IW6A 1YHVA 3R28A 4FT7A 4FIGA 2B9HA 3PVGA 4OBPA 2A1AB 4QEBA 3FI8A 5BVWA 4N6YA 4BHNA 4BIDA 5FXRA 5HZNA 4HCVA 3W1FA 1BKXA 5KKRC 3FZ1A 1GZNA 1ZARA 3PY0A 3GNIB 2IO6A 4YHJA 5DGZA 4TYEA 2IW9A 5M56A 4QRCA 4IZAA 3QFVA 4DFUA 3R1SA 3AMBA 2R3PA 3CS9A 3V8SA 4BDKA 1TQMA 3AT3A 4KUJA 1BI7A 5J7HA 5JRSA 4IB5A 3REPA 3KF4A 4QYHA 4CXAA 3BPRA 3JUHA 4AX8A 4ARKA 3SXSA 4TY1A 3O51A 4MBIA 4KIPA 3RWQA 1W8CA 2XEYA 3GI3A 3GCUA 4FR4A 4Z3VA 3QKKA 4AACA 3H0ZA 1I09A 4ENYA 1MUOA 4MXXA 3GB2A 4G3GA 4FKRA 4ZTRA 2GQSA 3SA0A 2XB7A 3JY9A 5D11A 3K3JA 5JQ5A 4MNEA 1K3AA 5HNGA 4QQCA 3TUDA 5HI2A 2CKOA 3FLSA 4DYMA 2J51A 4C59A 3UP2A 3FY2A 5CI7A 3ZSGA 4ANLA 3QZHA 3UIMA 4DEIA 5AP3A 5E8WA 4AF3A 3NYNA 4G3EA 3W2OA 4IACA 4B8LA 3NS9A 1F5QA 4E5BA 5CLPA 1GUQA 3OZ6A 4KINA 2BFYA 4HYUA 5CF5A 3C0GA 2FH9A 2X0GA 2GQRA 2YCQA 5E8VA 5E91A 4RFYA 3KRXA 4FSYA 3VF8A 3GU7A 3KK8A 3AT2A 3MA3A 2PWLA 1Q41A 3W55A 3E92A 3MTFA 2UZNA 4OTFA 3EKNA 3I0OA 2OW3A 3Q4CA 4X3JA 3W0OA 2J0MB 1GZOA 3HUBA 3PXZA 5A6OA 5IMEA 2JKKA 2ZM4A 4BCFA 4I24A 3PPZA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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