3BUZB

Crystal structure of ia-btad-actin complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Structural basis of actin recognition and arginine ADP-ribosylation by Clostridium perfringens iota-toxin
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 103
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3buzB03
4EIAA 3EO3A 1GLBG 3CJ1A 3U8XA 1YUWA 2UYTA 3TU5A 1T6CA 1H1VA 1ATNA 1QQOA 5ADXH 4BQLA 4Z94A 1GLLO 2P9NA 3R6MA 3VPZA 3DJCA 1KXPA 3C7NB 5ADXA 4XEIA 2YJFA 4BVOA 3WXLA 5B8HA 2P9LA 4PKGA 2Q31A 3ZX2A 4BC5A 1BWFO 3ZX3A 5AQZA 4BRNA 5JICA 1HLUA 1JCEA 1NGBA 3H46O 1V4TA 2V7ZA 1GLFO 3UB5A 4CBWA 3O1BA 3EL2A 5AQNA 4FPBA 3RSEB 2CGLA 1NWKA 4CZLA 3WQTA 1BO5O 3O6WA 2WUSA 1Z6RA 5AQWA 5LY3A 4BRKA 3VESA 2QWOA 1U2VB 4LC9B 3C0BA 1NM1A 4B1WB 1D4XA 1KAYA 5AZJB 2F9WA 3GOIA 4EHUA 2Q0RA 5F0XA 1ZBSA 3WXIA 1CZAN 1TUYA 5F2RA 1SZ2A 2CH5A 5AQYA 2HF4A 5FPEA 1S3XA 2CGKA 5BN9A 4FWKA 4H0OA 5BRDA 4FPAA 1NLVA 3VGMA 1MA9B 3TPQA 2ASOA 2FSJA 3VEVA 4BRLA 1MWMA 2ZGZA 4BG9A 2ZGYA 1QZ6A 3O1WA 4XH4A 2E2NA 5JLHA 3BP8A 3O08A 4HTLA 2ITMA 3GE1A 3H1QA 2HF3A 4EAHD 4DHYA 3AAPA 3D2EB 2ZF5O 4BRAA 1BUPA 4PL8A 3WT0A 2V52B 3I33A 1EQYA 1NGAA 1QQNA 3JS6A 5KQDA 4FOIA 3A5MC 3MK6A 1ZXOA 5AQSA 4PKIA 3S41A 4BRHA 3WEEA 4PKHA 4BVPA 1K8KA 2EWSA 4H5VA 3ULEB 3A0IX 4MO4A 3CQXA 2Q1NA 1J6ZA 4O5FA 4FWRA 3R8EA 1ATRA 3O8MA 5AZIB 2ZWHA 4BR4A 3MN7A 4K42A 4A61A 1TYQB 2J4RA 3QBXA 3HTVA 1V4SA 1NGCA 5AQKA 2H3GX 2D0PA 4I6MA 2CH6A 4CZKA 4L3QA 1WUAA 5ELZA 4BRQA 1X9JA 4CZGA 1E4FT 3ATUA 4B1VA 2P9KA 4M7XA 1LCUA 2P9IA 4JD2B 1BOTO 4H5RA 2W41A 3L0QA 4M7YA 3W0LA 3B8AX 4BRDA 3W3DA 5AQQA 5BRFA 1U6ZA 1RDWX 3A5OC 4BR9A 1NGHA 3FZHA 1IJJA 5KPRA 3LDOA 2P9PB 5CE3A 1R59O 3U9ZA 5FPMA 4CBUA 3C7NA 4BC4A 5BRHA 4JN4A 5AQRA 1BA1A 4A62A 2CGJA 4CZEA 4FWQA 5AQJA 4K43A 4DB3A 3O5BA 3KHYA 4CI6A 4JAXA 4QS9A 4BRCA 3UKUB 3RSEA 1G99A 2VCPA 4IJAA 1IG8A 2Q0UA 1HJOA 3CQYA 2QWPA 3MCPA 3MMVA 4MLEA 1U2VA 1LOTB 5FPDA 1T44A 4FWSA 3H6EA 3QFPA 4FO0A 5E84A 5AZJA 5BPMA 2QW9A 4H5NA 2Q2RA 2FF3B 4H0PA 3MN5A 1WOQA 3WQUA 1RFQA 1KAXA 2D1KA 5EOYA 4B1XB 4BC3A 5JMVA 5BR9A 3M6GA 2PBDA 2F9TA 3VENA 3FFKB 2GWKA 3VEWA 4B9QA 3O80A 1ZC6A 4CBXA 5BREA 3UE5A 2BUPA 2IVOA 5AQIA 1C0GA 3DXMB 4KBOA 4BG8A 4A2BA 4BQZA 2QXLA 1MWKA 3MN6A 2NLXA 1BU6O 3VF2A 2BTFA 3UKRB 4JHDB 4ISGA 3QICA 4FWLA 3WUHA 4K25A 2YI1A 4IWVA 5LJWA 2OANA 5EY4A 5LJVA 3D2EA 4H0YB 3CIPA 4XH1A 2ASPA 2E1YA 1Z05A 3CHWA 4HWIA 2IVPA 3JXUA 4B1YB 3GG4A 2GTDA 2P9SB 3A5LC 1YAGA 3GBTA 4Y0WA 3FE1A 1X3NA 4RCHA 4B1UB 2IVNA 1NMDA 5AQFA 5AQOA 3AARA 3KVGA 1RGIA 4BGBA 3ULEA 4F9OA 1DGKN 4QS7A 1QHAA 4FSVA 4A2AA 3ZX0A 5E26A 3H1VX 1HKGA 3LM9A 1NBWA 3U9DA 4WYBA 5EVZA 3VGKA 1ESVA 5AZIA 5KPTA 4CZHA 4IO8A 2YHWA 3ZETB 4CJ7A 3VEZA 3SJHA 1TYQA 2D4WA 4NO7A 4E1JA 1NGEA 2AA4A 3DXKB 1BDGA 3DWLA 2E2QA 2D0OA 4CD3A 2VYPA 1GLJO 5KPZA 1BG3A 3EKUA 3VF4A 2VWBA 4CZIA 3QB0A 2E8AA 3CJ9A 4C23A 5I9EB 3BF1A 4ISFA 3L4IA 4CZFA 1HKBA 2W40A 2FF6A 4JD2A 4K41A 1NGDA 5JLFA 1X3MA 1QZ5A 5AR0A 2PAVA 4IJNA 2A6AA 4AM7A 3MN9A 3I8BA 3P4IA 3H3NO 3M1FA 4YDUA 5AQGA 1P8ZA 5AQXA 2E1ZA 2A41A 1SAZA 2YHXA 1NGJA 2YJEA 3CJBA 2P9PA 3EKSA 3LDQA 3M3ZA 5AFUH 1MDUB 3WXJA 3IFRA 2I7PA 3GL1A 5AFUA 3FGUA 2E2OA 3FZFA 2FLOA 2QWNA 3D7EO 2GELA 2IIRA 1GLAG 3ID8A 2GWJA 4BC2A 4BREA 2ASMA 4GNIA 3SMPA 4H5WA 3HSCA 3AAQA 4FL9A 2V7YA 4WQ4C 3EZWA 5EX5A 3D2FB 2FSKA 2E88A 3CJAA 3HM8A 4YDUC 2Q97A 1HPMA 3ZEUB 2E2PA 4J8FA 2QWLA 4EHTA 3UKUA 4QS8A 2QWRA 3MDQA 4AM6A 3HI0A 4BR0A 2NZTA 3A5NC 4GY2B 3IDHA 1QQMA 2P9NB 4PL7A 1T6DA 2GEMA 4CZMA 1JCFA 4ISEA 1Q18A 3QBWA 2FXUA 3O4WA 4O8KA 2A5XA 5BPLA 3IUCA 3HZ6A 2P9LB 1YXQA 3LDNA 3BEXA 4M63C 1XQSC 3BF3A 2DPNA 4FWNA 1DEJA 5AQTA 3FLCO 3QFUA 2QWMA 3VEXA 2YCHA 2E20A 1YVNA 3BUZB 3DXMA 1DKGD 4B1ZA 2P9UA 3SMSA 1C0FA 1HX1A 3QDKA 3QMLA 3CJCA 4BROA 2P9UB 3LDPA 3UKRA 3U4LA 4JHDA 1BA0A 3G25A 4BRPA 2NRHA 4WQ5A 2A40A 3CETA 5AQHA 4BGAA 4XH5A 4BRFA 1HKCA 3CJ7A 3DAWA 1XC3A 3OHRA 3H45C 4FWPA 5AQMA 4H5TA 3SK3A 4FWOA 4IXCA 4BR7A 3CI5A 5AQLA 2QWQA 2P9SA 4RWTA 3ENOA 4BRIA 2YHYA 3VETA 1JCGA 3FZMA 1TUUA 3FR0A 3VF6A 2I7NA 3VEOA 4WQ5C 3F9MA 3LDLA 1GLEG 4BRGA 2HOEA 5AQVA 2KHOA 3ATVA 5TKYA 3VGLA 2A42A 3ZETA 3WXKA 5AQPA 3CERA 5KQ8A 5FPNA 4BRMA 1KAZA 2V51B 2AP1A 3DXKA 3R9PA 1OKJA 3A8YA 1Y64A 2GUPA 1GLCG 4BR2A 3LL3A 3FZKA 4CZJA 4DCHA 1SQKA 2Q36A 4IZ9A 3WEEB 3J8AA 2FSNA 3AY9A 4H03B 1GLDG 1K8KB 3LM2A 1HUXA 3IMXA 5BN8A 5BPNA 1NGFA 4EFHA 4MLHA 4FWMA 3GDQA 5EXWA 4WQ4A 5F1XA 1NGGA 4FOEA 1NGIA 3EN9A 4MO5A 1S22A 3ENHA 2HMPA 3SLCA 4H0VB 3FZLA 3VERA 2A3ZA 4NB4A 3VEYA 4JNEA 4BR5A 3L6QA 3HBTA 2QM1A 4I6MB 3H3OB 4CD1A 4H0XB 1ATSA 3KZBA 5AQUA 4DQ8A 1XUPO 2P9KB 3D2FA 2P9IB 3VOVA 4RTFD 3ZEUA 1E4GT 4H0TB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AHUA 1TAQA 3U8XA 4JKGA 1YUWA 4CESA 3AO2A 1S1UA 1GOAA 2IC3A 3KTQA 1GLLO 2KQ2A 5HOOA 5ADXA 2C1GA 3F73A 4BE7B 2HHIA 1WNSA 3IG1A 2D0CA 5B8HA 4LF8K 2P9LA 4F2SA 3OVNA 1Z25A 3OYCA 5JICA 4BRNA 4M3WA 1HLUA 1JCEA 2A1SA 3VQ8A 1V4TA 3TR8A 3O1BA 5FLXO 3ZCMA 2ZM6K 3EL2A 5AQNA 3RR8A 5IT9O 4FPBA 2CGLA 1NWKA 1N36K 4CZLA 3O6WA 1WSEA 1EO1A 1NNEA 1JL2A 3DI6A 5H1SQ 4LC9B 4A57A 1XNRK 1K6YA 2WFBA 4HHTA 2F9WA 5C2FA 4M3TA 2BE2A 4Q0BA 3G6EN 4HCBA 4K8ZA 4DFKA 4DWIA 2HBMA 4OPAA 3LDSA 4JI5K 1TUYA 3HP9A 5AQYA 4N41A 4YOWA 1S3XA 5BN9A 1QVGM 3PSFA 3TPQA 2ASOA 4JI4K 5GIPA 1N33K 2VG6A 3VQ9A 3O1WA 3BP8A 4DG1A 4FXDA 2DFFA 1HJRA 1VQMN 3K0SA 4DR7K 3HXMA 4JKFA 1LAWA 4BDYA 4ELVA 4IOAL 4FM1A 3AVBA 4FJ5A 2V52B 3I33A 1NGAA 3CYMA 4AHCA 1NK4A 3A5MC 4IDKA 2IDOA 5JVHL 4HTUA 5AQSA 4J2AA 4GKKK 3MXIA 4BRHA 3RTVA 4PKHA 3D45A 3N4PA 2EWSA 3ULEB 4M3RA 3NH2A 4IFEA 4Y1DA 3CQXA 3CC4N 3PX6A 1XC9A 3QERA 3QEPA 3AVCA 3SQ1A 1YJNN 4BR4A 4FLTA 3NVMA 1TYQB 2NRWA 4DTNA 2J4RA 3QBXA 4FLWA 1OH5A 1S1TA 3NGYA 4AHVA 1IBLK 5FDLA 1REVA 1QVFM 2D0PA 4ZTFA 2CH6A 4LH5A 4CZGA 3MCAB 2HHVA 4AHTA 2OPQA 4M7XA 1T7PA 2P9IA 5J2PA 3DYAA 3W0LA 2ITGA 3B8AX 4LFAK 5AQQA 1VSKA 3A5OC 4JKAA 4KFBA 1K9MO 4FJKA 4J2EA 4I7FA 5KPRA 2UXCK 1ASWA 2P9PB 3ALYA 3PO5A 2O8FB 3C7NA 1KRPA 4BC4A 5BRHA 3ENBA 4JRQA 4JK7A 1VSDA 1RNHA 3BY5A 2IOCA 3NF9A 3CCRN 1JJ2M 1UA0A 4KHQA 4CZEA 2GV9A 1VSEA 2RE2A 1SKRA 5KRSA 2O8DA 3O5BA 4CI6A 4QS9A 4Z4GA 1SUQA 3UKUB 4KHPK 1G99A 4IJAA 4C8MA 3AVAA 4I2QA 3ZT3A 5FPDA 5E84A 3SZ2A 5AZJA 2QW9A 4KAZA 2WTUA 3AVLA 2Q2RA 1FK9A 2B5JA 3MN5A 1WOQA 3WQUA 3O9TA 3K5NA 4LF4K 2UUCK 5KGWA 4B9QA 1HNVA 4KI6A 5GAHP 3M5RA 3B6PA 5AQIA 1C0GA 1NK9A 3J7YP 4BEBA 2OPRA 1XNQK 2BTFA 1NJXA 4JHDB 3C95A 4OGCA 3VN5A 4IWVA 2F96A 1Q86O 4DR6K 3FFIA 4XH1A 4E7JA 4U7BA 1Z05A 3RR7A 1N32K 1KSPA 1J54A 4B1YB 2B6AA 4Z0UA 3A5LC 3GBTA 3FE1A 3O9RA 4RCHA 3JSMA 2IVNA 4KHUA 4F8RA 4F9OA 4FM0A 4QS7A 3CCUN 1QHAA 1Z26A 3ZX0A 4KI4A 4DU3A 1NBWA 1HNIA 5EVZA 2IGIA 1ESVA 3L2UA 4CZHA 1DTTA 4BWMA 3KLEA 2FC0A 3SJHA 1JLBA 1BIUA 4BDPA 2X74A 3T1YK 3J7ZO 4AHSA 3L4QA 5T7BA 2VYPA 1WAFA 1GLJO 5KPZA 3EKUA 3LP1A 4O0JA 4OVLA 5HRSA 3VF4A 1YJ9N 3QB0A 5I9EB 3CJ9A 2EX3A 3TTDA 3VQEA 4K41A 1NGDA 1WLJA 4KHWA 1X3MA 4H4MA 4OKEA 2ZJQL 4DMNA 4H8KA 4A5AA 2KLAA 4AM7A 4O0IA 2Y1JA 1QTMA 1BGXT 4BDZA 3TAPA 2ZJPL 3EE9A 1FXXA 3M1FA 1P8ZA 5AQXA 1SAZA 2NUBA 1NGJA 5AFUH 3RWUA 4N5SA 1MDUB 4DQQA 3IFRA 2I7PA 4OPHA 2YNIA 2FLOA 3FGUA 3FZFA 1GLAG 4X62K 4BREA 3SMPA 4E3SA 2UXBK 1RT5A 1BL3A 4CHQA 1WSGA 1BISA 3SV3A 2FSKA 3AA5X 1JLAA 3HRGA 1YT3A 2XRIA 4PUOA 4G9ZA 2W42A 4KH6A 3HI0A 2NZTA 3TABA 1EWQA 1RDCA 4GY2B 1T8EA 4F3TA 3K5LA 4CHPA 4PL7A 3V81A 1VHXA 4X66K 2FXUA 1Q7YO 4CJ4A 1S9EA 2A5XA 4E89A 4JI2K 2X6NA 4CJ5A 3SAGA 1XQSC 3BF3A 4JKBA 3NHGA 1RBTA 3BZCA 1KVBA 4BE1A 2E20A 1FJGK 4DSIA 4BE2A 2RN2A 4FVMA 3QMLA 4IO9L 1RT3A 4BROA 4DTSA 4B3OA 1SS6A 3OYLA 3V1QA 3CCVN 2OCEA 3VTHA 2A40A 4K8XA 3OA9A 5M1NA 4CJSA 5GAGP 2X6SA 4RW8A 4OKKA 4I9QA 3CJ7A 4OLBA 2VQEK 3SBGA 3OHRA 2OZSA 3H45C 3SK3A 4FWOA 4BR7A 2W00A 3CCLN 2HBLA 3DLRA 3O4NA 2O4GA 1QS4A 4BRIA 2YHYA 3M8PA 1JCGA 3KWGA 3SI6A 3VF6A 3OYDA 2I7NA 2DY4A 1DT9A 4WQ5C 3F9MA 3KD5E 3AO4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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