3BUZB

Crystal structure of ia-btad-actin complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Structural basis of actin recognition and arginine ADP-ribosylation by Clostridium perfringens iota-toxin
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 103
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3buzB03
3WXLA 3WT0A 3SLCA 5BREA 2P9UA 5F0XA 3VERA 4CBXA 5AQPA 2ZGYA 3C7NB 3EZWA 3ATVA 2GWJA 4H5NA 4BRMA 3U4LA 4BRFA 1BA1A 2FF3B 2GELA 3D2EB 3A0IX 5AQLA 1BA0A 4JD2B 3LDNA 1NGCA 1IJJA 4BRDA 3SJHA 5AQNA 1NGDA 3KHYA 3DXMB 2P9LB 2QWMA 3S41A 3WUHA 3G25A 2FF6A 3CJ1A 1XUPO 2I7NA 3ENHA 5AQTA 3CIPA 3MK6A 2P9SB 2A41A 1BU6O 3IFRA 4BR4A 1JCEA 3GOIA 4WYBA 2YHYA 1NGAA 2P9PB 3CI5A 1QZ5A 4I6MA 2NLXA 3MMVA 4YDUC 4CD3A 1MA9B 2ZF5O 4M63C 3D7EO 3M3ZA 1HKGA 2VWBA 5AQHA 3VOVA 4BQZA 2QWQA 3DXKA 3O08A 3SMSA 1ESVA 3ZETB 4PKGA 1NGHA 4BRAA 1DGKN 4CZGA 4M7YA 4EIAA 1RDWX 3DAWA 1TYQA 2P9KA 3O5BA 5FPNA 1K8KB 1BG3A 4DB3A 4IJNA 5AQSA 4BROA 5BPMA 1BO5O 1JCFA 1HX1A 1QQMA 4MO4A 5F2RA 4K25A 2P9NA 5EVZA 2FLOA 4BRHA 1QQNA 4JN4A 5AQGA 5BN9A 3CJ7A 2W40A 3ZEUA 4A2BA 2Q31A 3FE1A 4FPAA 4CBWA 5FPDA 4MLHA 4A62A 2BUPA 5AQVA 2F9WA 5E84A 4B1VA 1X9JA 5AQZA 4B1UB 1X3MA 2QW9A 1NGJA 3BUZB 3H3NO 3BEXA 2A5XA 5EXWA 3WEEA 1SAZA 5KPZA 2E20A 4CZMA 2E1ZA 2YJFA 5AZIA 2EWSA 2VCPA 4E1JA 1YVNA 4BRLA 2IIRA 5JLHA 3OHRA 4BRQA 5CE3A 4BC2A 3IDHA 4WQ4C 3VF4A 3HTVA 2P9IA 2GTDA 3AY9A 1ZXOA 1HKBA 3TU5A 5FPEA 5AQUA 1KXPA 1C0GA 4CZEA 1GLEG 1RFQA 3LM2A 3WQUA 2QWOA 5B8HA 1C0FA 3AAQA 3A8YA 4JHDA 3RSEA 4BQLA 3C0BA 1HKCA 2IVPA 3LDLA 5AQXA 2V7YA 3VENA 3FZKA 1NBWA 4BC4A 3DJCA 2E1YA 1KAZA 4IZ9A 5ELZA 3QFUA 5ADXH 5LJWA 3W0LA 1ATSA 1QHAA 3H3OB 4RWTA 3H46O 3QDKA 2GWKA 3O80A 2D0PA 4ISEA 4NB4A 2OANA 1YAGA 3CQXA 3O4WA 3I33A 4QS7A 5EOYA 5AFUH 3HBTA 3JXUA 2A40A 4L3QA 1GLCG 2YCHA 5F1XA 1T6CA 3ATUA 4O8KA 4FWMA 4MO5A 3LDQA 4NO7A 1HUXA 1GLFO 4HWIA 4BG9A 1NLVA 4JAXA 4IJAA 2YHWA 3ENOA 3IMXA 3SK3A 3VEYA 3BF3A 1GLJO 2WUSA 3U9DA 5KQDA 4O5FA 4PL8A 4CZHA 5BPNA 1J6ZA 4EAHD 5JLFA 1GLBG 3C7NA 3H1QA 5BPLA 5LY3A 1GLDG 3O1WA 4H0PA 4MLEA 2H3GX 3D2EA 1E4FT 1S22A 2QM1A 4JD2A 3D2FB 1QQOA 3EL2A 1X3NA 1MWMA 3J8AA 3CJCA 3ZX0A 4F9OA 1ZBSA 2Q36A 3VF6A 1NGFA 2E2NA 4H5WA 3UKUB 1NGBA 1TUYA 2P9LA 3DXMA 3MN6A 3VGMA 3MDQA 3HZ6A 5BRFA 3VGLA 3VETA 3ZX2A 1P8ZA 2P9KB 3EO3A 3QFPA 5AZJB 2P9SA 3HSCA 3W3DA 3UB5A 2CGJA 4CZJA 2QXLA 3FZFA 5AQYA 3H1VX 2P9PA 1BWFO 5I9EB 4BREA 4FL9A 5BRDA 1IG8A 4IWVA 1MWKA 4K43A 3I8BA 4K42A 3CJAA 4FOIA 1DKGD 4LC9B 3M6GA 1WUAA 4KBOA 2E8AA 4BGBA 5AQWA 3EKSA 3ZETA 1U2VB 2QWLA 4GNIA 4IO8A 3BF1A 1XC3A 1OKJA 2ZGZA 4CZIA 1V4SA 1K8KA 4FWSA 1H1VA 3ID8A 3O6WA 2AP1A 4ISGA 2Q0UA 3R6MA 5E26A 3CJBA 4FWPA 2ZWHA 4EHTA 3QB0A 2YJEA 2NZTA 3VEZA 3GBTA 1DEJA 1Q18A 1T6DA 3EN9A 2IVOA 3A5NC 4C23A 5AQMA 5AQQA 4BRGA 1NGGA 2A3ZA 2CH5A 3VEXA 1GLLO 1ZC6A 1RGIA 2YI1A 3UKRB 3ULEB 3CERA 5KPTA 5BN8A 4PKIA 5ADXA 3F9MA 1T44A 2W41A 1YUWA 4BRIA 2CGKA 2IVNA 1V4TA 4FPBA 2V7ZA 2Q2RA 4RCHA 1JCGA 4WQ5A 3KVGA 3U9ZA 4BRPA 4H0OA 3QBWA 3KZBA 2J4RA 3CQYA 2P9UB 2YHXA 5FPMA 5LJVA 4QS9A 2PBDA 5AFUA 4BVPA 2D4WA 3GDQA 2FSKA 3A5OC 2D1KA 1QZ6A 4BC3A 2E2PA 3HI0A 3FZLA 3CETA 4CD1A 3VPZA 1XQSC 4EHUA 3FR0A 5AQIA 4QS8A 3MCPA 3L6QA 3VGKA 3TPQA 3VF2A 3HM8A 5AQFA 4BRNA 4Y0WA 4CBUA 1Y64A 1NWKA 1ATNA 1Z6RA 3VEWA 3A5MC 4BR0A 3IUCA 3P4IA 1MDUB 4DCHA 2NRHA 3AARA 5AR0A 3CJ9A 1HLUA 2GEMA 4RTFD 4XH5A 4PL7A 4BR7A 2ASPA 1S3XA 2ASMA 4XH4A 4Z94A 2QWNA 1LCUA 4H0VB 3M1FA 4BR2A 2V51B 2Q1NA 3R8EA 2FXUA 4B1YB 1NMDA 2QWPA 2A6AA 4JNEA 2E2QA 4B1ZA 2AA4A 4I6MB 2ASOA 4CZLA 1HPMA 5KPRA 2PAVA 4BRKA 5TKYA 2FSJA 3L4IA 4H0TB 3A5LC 4YDUA 1KAXA 3DXKB 3FZHA 4A2AA 4AM7A 1ATRA 4FWKA 1R59O 3WXKA 1TYQB 3GL1A 4H03B 3VEOA 1BUPA 4FWRA 2ITMA 4J8FA 4CZKA 4PKHA 2VYPA 3FFKB 4FWNA 1YXQA 3D2FA 1EQYA 1E4GT 5EY4A 4B1XB 3LM9A 2P9NB 3O8MA 2GUPA 3H6EA 2D0OA 5BRHA 3VEVA 3ZEUB 2UYTA 1D4XA 1SZ2A 3CHWA 3UKUA 3O1BA 4BRCA 4EFHA 3H45C 4H0XB 2CH6A 3QICA 4ISFA 3QBXA 4GY2B 3LDOA 3WQTA 1NGIA 4CJ7A 5AZJA 4IXCA 4FWLA 4K41A 3UE5A 2I7PA 4BGAA 2HMPA 3EKUA 3WEEB 2A42A 5AZIB 3MN9A 4BR9A 4BVOA 3MN5A 3GE1A 3L0QA 3VESA 4H0YB 1LOTB 4HTLA 2Q0RA 5AQKA 2HF3A 5AQJA 5EX5A 4CI6A 2DPNA 3LL3A 2BTFA 1CZAN 1G99A 1NGEA 3FGUA 3ZX3A 1KAYA 3AAPA 2QWRA 3LDPA 4FWQA 2P9IB 4XEIA 5AQOA 4XH1A 4BR5A 3BP8A 1TUUA 1BOTO 2Q97A 1HJOA 1U2VA 4WQ4A 4CZFA 2HOEA 1SQKA 2V52B 2E88A 4FO0A 3JS6A 4JHDB 3RSEB 3SMPA 5KQ8A 2KHOA 3GG4A 4FSVA 2CGLA 3QMLA 3U8XA 4B9QA 1BDGA 4A61A 3WXJA 4BG8A 2FSNA 2HF4A 4DQ8A 1U6ZA 1WOQA 3FLCO 2F9TA 4M7XA 5JICA 3R9PA 4BC5A 1Z05A 1GLAG 5JMVA 3B8AX 3UKRA 4AM6A 4DHYA 3ULEA 3DWLA 5BR9A 1NM1A 3WXIA 5AQRA 4WQ5C 3MN7A 4B1WB 4H5VA 4H5TA 4FWOA 4FOEA 4H5RA 3FZMA 2E2OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WNFA 1TAQA 4E7IA 1RTIA 4G1QA 3OS1A 3L2WA 4CBXA 4L8RB 4DV4K 3ATVA 1WSIA 1YHQN 3P83D 2P1JA 4BRFA 3QNNA 2FF3B 4RW8A 2UXCK 5AQLA 2O8EB 1GOAA 3LDNA 4N47A 4FZZA 3KK1A 4KTQA 3TAGA 3SJHA 5AQNA 1WSEA 3S41A 3WUHA 1NKEA 2FC0A 3WNGA 3CC2N 1Q7YO 3ZSRA 4DFJA 2FF6A 2I7NA 5AQTA 2P9SB 5I3UA 1ZYQA 4WYBA 4OKKA 1G15A 2NLXA 4YDUC 2GX9A 1NK6A 1N33K 3J7ZO 3SV3A 1HKGA 1SV5A 2HNZA 2VWBA 3DXKA 2QKBA 3G4SN 3O08A 3ZETB 1ESVA 4PKGA 4BRAA 1DGKN 4M7YA 2ZJPL 2Z1JA 4CJQA 4B3RK 4RW9A 1BG3A 4IJNA 2HHUA 5BPMA 1BO5O 1NJWA 4MO4A 5F2RA 2OPRA 1Q86O 4JKBA 2D0CA 1QQNA 3EEQA 5BN9A 2W40A 1OH6A 4JI5K 4A2BA 1NK9A 3FE1A 3KK7A 2KFNA 3HYFA 5FPDA 4MLHA 5AQVA 4GMJB 1KVBA 3CCVN 2F9WA 3DRSA 4B1UB 1X3MA 2QW9A 4CK1A 4FLVA 3AGKA 1NK8A 3BEXA 5C2DA 3V9XA 3KLEA 4CZMA 2E1ZA 1UA1A 2HHXA 3OTOK 5JLHA 4BC2A 5GIOA 4BDPA 2HHHK 3SUQA 4HHTA 1J53A 3TU5A 1VK0A 3HPGA 1TAUA 1RBRA 3SQ4A 3WQUA 3CFOA 3T3FA 3AAQA 4DU3A 1HKCA 3ZT4A 4E72A 1KAZA 3C94A 1SUQA 4ILGB 5ELZA 2C1GA 5LJWA 2PFUA 1KQSM 3OYHA 3H3OB 3OY9A 4RWTA 4DR6K 3QDKA 1U47A 4DS4A 1ZBHA 1YAGA 3CQXA 3G6EN 3SAHA 5F1XA 2YCHA 3QEPA 1IKWA 4CGHA 4DTJA 1FXXA 2D5RA 3LDQA 1HUXA 4CHPA 2X78A 4I9LA 3PO4A 1CXQA 1NLVA 4IJAA 1VRTA 3ENOA 3SK3A 4E7KA 5CR4A 5J2QA 5BPNA 3K5OA 3H1QA 5LY3A 4V19S 1VQON 1GLDG 2O8CA 1REVA 1WAJA 3D2EA 4KHQA 4KH6A 5HLFA 2NRVA 3ULDA 4CHNA 4F9OA 3PX4A 2Q36A 3U3YA 4H5WA 3UKUB 4KHSA 1TUYA 3DXMA 4JKDA 3DI6A 3VGLA 2ETJA 3KD5E 3VETA 3ZX2A 1RT3A 2YX6A 3HSCA 3W3DA 1BCMA 4E1MA 1NK0A 4F3TA 2CGJA 1S1WA 4GV6A 5I9EB 5C25A 4FYDA 4YORA 3SUOA 4DG1A 3M6GA 3NF8A 4CIGA 5GINA 2E8AA 5BR8K 3V81A 3VA3A 1IKVA 4DR3K 3S3OA 2EHGA 1XC3A 5HROA 3VQ4A 3M8RA 4JI2K 1QQCA 4KV8A 3LWMA 3CMEN 1FKOA 3CJBA 4NYNA 1XHXA 4EHTA 3QB0A 2YJEA 3ZSQA 3HM9A 4LF4K 2NZTA 4FJ7A 1VSHA 3EN9A 3IAYA 2IVOA 3E9LA 1NGGA 3DLRA 2A3ZA 3EY1A 1LV5A 3TARA 3LPTA 3DLGA 4U67L 4PKIA 4M41A 5HOOA 3QNOA 1T44A 2W41A 1YUWA 4DLEA 3AVLA 2IVNA 3NE6A 3VQAA 1U45A 3KVGA 4BRPA 4DQIA 4ILJA 4RW6A 2GUIA 2P9UB 4LF7K 4QS9A 1SL2A 1JLFA 4DV1K 5AFUA 3AA3A 1S1TA 2E2PA 4NLCA 3CYMA 4IFVA 4CD1A 3ASMA 2F8SA 4FW2A 3T69A 4Z4GA 3DOLA 2OPQA 1C0MA 1Y64A 1NWKA 4EZ9A 1N6QA 4JEPA 4PUOA 3CCLN 3DYAA 5AR0A 3RRHA 3CJ9A 4DKWA 1HLUA 4JK7A 4B08A 3RMCA 3BY5A 5HRPA 2GEMA 3C6TA 4XH5A 4PL7A 4M45A 3CCQN 2G8WA 3P31A 1TL3A 4LF6K 1LCUA 3AVAA 3QO9A 4JKGA 2V51B 2WBNA 2Q1NA 1JLAA 3D0PA 3R8EA 4JKEA 3VA0A 1BIZA 1NMDA 3TSUA 3I0SA 3T19A 2YNGA 4A57A 4CK2A 2AA4A 4CZLA 2O8DA 4FM0A 2AJQA 2G8HA 4BRKA 1W0HA 3HO1A 2XHBA 4JI1K 5TKYA 4CEQA 4JLHA 3L4IA 3PX6A 2G8UA 5DMRA 1TKXA 1BL3A 2X74A 3FZHA 4DQSA 1ATRA 4OJRA 3OYBA 5FRNA 4DR7K 4CF1A 1HYVA 4NCBA 3C65A 3GL1A 2W6KA 4DTXA 1RNHA 3V6DA 1KFSA 3PIOL 4CZKA 4ZTFA 4KHWA 2VQEK 1YXQA 3D2FA 4B1XB 4CF0A 2P9NB 3H6EA 3ZSXA 5BRHA 3AVFA 1K73O 1KCFA 2UYTA 5KRSA 1HNVA 3Q7BA 4O0JA 4KTZA 4BRCA 2R7YA 4EFHA 3SPYA 3QICA 3LDOA 3WQTA 2NRWA 4AILC 2O8FB 4DUYK 4K41A 1BGXT 4FK4A 5I42A 3EKUA 3WEEB 4JKFA 1NJXA 2OA8A 1Q81O 4BR9A 4NXNK 4BVOA 4KI6A 1VQNN 3VESA 3ZCMA 4JKHA 2HF3A 1IH7A 1VSMA 4OPKA 3MECA 2DPNA 4FM1A 1ASUA 3V9UA 2YV0X 5AQOA 3O4NA 1SKWA 3T1YK 4XH1A 3MXMA 3BP8A 4M3XA 1EKEA 3P1GA 4WQ4A 4R79A 2BANA 3U3GA 1SQKA 4LFCK 4GVMA 4A5AA 3RWUA 3ENBA 3PX0A 3SBTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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