3BUZB

Crystal structure of ia-btad-actin complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
publication title Structural basis of actin recognition and arginine ADP-ribosylation by Clostridium perfringens iota-toxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 103
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3buzB03
4NB4A 3EKUA 1P8ZA 4AM6A 4BC4A 3UB5A 3KHYA 5AQLA 2Q31A 2D4WA 3O8MA 4BR0A 5AQNA 4H0YB 5JMVA 2QWMA 3R8EA 3D2EA 4Y0WA 3QBXA 1MA9B 3KVGA 4GNIA 4LC9B 2EWSA 3GE1A 3P4IA 2ZWHA 5CE3A 2PBDA 3G25A 2HF4A 1MWMA 4CZGA 3C7NA 4B1VA 1ZBSA 1NGJA 3VEZA 1BO5O 1KAZA 3D2EB 3A5NC 1NGDA 3O08A 4K42A 2CH6A 4RTFD 3AY9A 1TYQA 3VF6A 5F1XA 4FWMA 1GLJO 2P9KA 4JHDA 3C7NB 3U8XA 4KBOA 3B8AX 3FZKA 2V51B 4FWLA 5EX5A 2YJEA 1T6CA 4QS7A 3A0IX 3H1QA 4BG8A 4FWNA 4J8FA 3ATUA 4DQ8A 2V52B 1TYQB 5BRFA 5AFUH 3WQTA 4DCHA 3AARA 5FPEA 4JHDB 3VETA 2FXUA 5LJVA 1V4TA 2E20A 2Q36A 3CJ9A 4E1JA 3HM8A 4WYBA 2P9IA 5AZJA 5BR9A 2QWNA 4QS8A 4JN4A 5E84A 4XEIA 1U2VA 1HUXA 2GEMA 4EIAA 4WQ5A 5KPTA 4RWTA 1H1VA 1CZAN 1QZ6A 2VCPA 1S3XA 3DXKA 3CJBA 3H1VX 4DB3A 1JCGA 3GDQA 4IXCA 2P9IB 4BVOA 5AZJB 3EKSA 1NBWA 3RSEA 1BUPA 2IVPA 1ATNA 2HF3A 3QBWA 3J8AA 3WEEA 1G99A 1BU6O 1HPMA 4CD3A 4QS9A 3R9PA 4CZEA 1NGBA 3DXMB 2ZF5O 1RGIA 1DGKN 1Z05A 2ASMA 1QQMA 3UE5A 3UKUB 3MN9A 4CBWA 2CGJA 5BPLA 4IO8A 4CZIA 3MK6A 1NGEA 3RSEB 4IWVA 3UKRA 3WXKA 3WEEB 5B8HA 4JD2A 1HLUA 4O8KA 5FPNA 3CJCA 1GLDG 2QXLA 3VEXA 3MN6A 4FWKA 2E1ZA 2Q0RA 3UKRB 4H5NA 2ZGYA 2P9LA 4XH5A 3HSCA 4BC3A 3ZX2A 3QFUA 3WXLA 4M7XA 3BF3A 5AQXA 1SAZA 4JD2B 2A6AA 1DKGD 3JS6A 3ZX3A 2BTFA 2IVNA 5AQHA 4WQ4C 1C0FA 2QWPA 4CZFA 1ZXOA 4BC2A 2E2QA 5AQYA 2NZTA 4FSVA 4C23A 1E4GT 5FPMA 2P9LB 4H0VB 4BC5A 3FZMA 5BRDA 4H0PA 2CGKA 2QWLA 1K8KA 1HKGA 2YCHA 5KPZA 4CZLA 3ZEUB 4FL9A 3ENOA 3VGMA 4BRHA 1NLVA 4RCHA 3R6MA 3O1BA 3CQYA 3FLCO 3ENHA 4I6MA 3A5LC 4PL8A 3VGKA 2YHWA 3TU5A 1WUAA 2QM1A 4M7YA 4FWOA 1U6ZA 4BRNA 1SQKA 4IJNA 1BG3A 4MLHA 1NGHA 4CBUA 4F9OA 2FSNA 4FO0A 1D4XA 4CD1A 2NLXA 1X9JA 2Q2RA 3M3ZA 4I6MB 4BR7A 4IJAA 3DJCA 4CZHA 4DHYA 4BRLA 3EL2A 1NGGA 5BN8A 2HOEA 3L4IA 2A40A 4FOIA 1T6DA 2FSJA 4BR4A 4H0XB 3MN7A 5BPMA 4GY2B 3O4WA 3ATVA 2D0PA 1BA0A 3LM9A 1Z6RA 5E26A 3ZX0A 3VEWA 4B9QA 1V4SA 3ZETA 1C0GA 2ASPA 3SMPA 3H3NO 3A5OC 3WXIA 1DEJA 3H46O 2P9KB 3WQUA 2GUPA 4A62A 5KQ8A 3BP8A 2I7PA 4H03B 5AQOA 4K41A 1MDUB 1RFQA 2P9UA 2BUPA 4H0TB 3D7EO 3IMXA 3KZBA 4FWQA 3CJ7A 3A5MC 1NGIA 1Q18A 3EZWA 2W40A 5AQSA 2FF3B 3W3DA 3H45C 3CIPA 5AQPA 2E8AA 2HMPA 3ID8A 5TKYA 1U2VB 2P9UB 5BREA 4YDUC 3VESA 1NGFA 5ADXH 1LOTB 3LDQA 3GG4A 4BRGA 1ESVA 5EY4A 5AFUA 1NGAA 4BRDA 4H5TA 3DXKB 3GBTA 4CZJA 3CERA 5LY3A 3U4LA 5F0XA 3CI5A 1BWFO 5AQFA 5KPRA 4FPBA 4PKGA 1T44A 3QB0A 1XC3A 5AZIA 4CJ7A 3DWLA 4H0OA 3VEOA 3VENA 3O1WA 1S22A 1GLLO 2Q0UA 1J6ZA 3AAPA 4EFHA 1BOTO 2QW9A 4CZKA 3W0LA 5BPNA 1BDGA 4MO4A 5AQMA 2NRHA 2P9SA 3LDPA 5AQKA 4HTLA 1YAGA 2A3ZA 3VF4A 1HJOA 5JICA 4H5VA 1QHAA 2P9NA 1ATSA 3CQXA 3QICA 1Y64A 4BGBA 1JCEA 5AQIA 3D2FA 2YHXA 2DPNA 4A2AA 1JCFA 1XQSC 3FGUA 4L3QA 4FWRA 4JNEA 4BVPA 1GLAG 4NO7A 2QWOA 2GWJA 3WUHA 2P9SB 3H6EA 2E1YA 4FOEA 3WXJA 2A41A 3CHWA 3U9DA 4M63C 2QWQA 3BUZB 2P9NB 4BRPA 1GLCG 4A61A 1TUUA 2D1KA 4HWIA 5ELZA 3D2FB 4FWPA 4Z94A 4BQLA 2E2PA 4JAXA 1HKBA 1KAYA 4BRCA 3MN5A 3DAWA 3EO3A 4ISFA 2V7ZA 5BN9A 2Q1NA 3SLCA 5JLHA 1KAXA 3LDNA 2IIRA 4CBXA 2A42A 4BR5A 1K8KB 5AQRA 1NMDA 3QFPA 1X3NA 4FPAA 5AQTA 4XH1A 3VOVA 4O5FA 5AQUA 3HZ6A 1OKJA 3M6GA 3SK3A 3FZLA 4BRKA 5JLFA 3EN9A 2F9WA 3JXUA 2WUSA 4BQZA 1QQOA 5EOYA 4PL7A 4EAHD 1E4FT 1NWKA 1RDWX 3VEYA 1HKCA 3IFRA 3LDLA 2AP1A 5I9EB 5EVZA 5AQGA 3CJ1A 2W41A 1GLFO 3A8YA 2I7NA 2GWKA 4MO5A 4BROA 5AR0A 3VPZA 3WT0A 5AQVA 3FE1A 5F2RA 3QDKA 2ASOA 4EHTA 3BF1A 3LDOA 1GLBG 1WOQA 3IUCA 4B1WB 3ZETB 4B1YB 1KXPA 1HX1A 4H5WA 3ULEA 3VGLA 2J4RA 3I33A 5AQJA 2KHOA 3H3OB 3LL3A 4K43A 2E2NA 3QMLA 2AA4A 3SMSA 1QQNA 3IDHA 3O80A 1BA1A 2YI1A 4B1XB 2H3GX 4EHUA 3ULEB 2CH5A 3O5BA 1YXQA 2FSKA 3SJHA 3FZHA 3GOIA 4BR2A 3OHRA 3VEVA 4YDUA 1LCUA 4WQ5C 3MCPA 1MWKA 3BEXA 2ITMA 4H5RA 3HI0A 2PAVA 3DXMA 3C0BA 3UKUA 1EQYA 4ISGA 2GELA 2E2OA 1R59O 3CETA 1IG8A 4IZ9A 4PKIA 3CJAA 1ZC6A 4BRQA 4BREA 4ISEA 2UYTA 3FZFA 3I8BA 5LJWA 3MDQA 2FLOA 4BGAA 4CZMA 2E88A 4B1UB 5FPDA 3FFKB 2QWRA 3TPQA 3M1FA 3FR0A 2YJFA 4K25A 4MLEA 4BG9A 2YHYA 4A2BA 3U9ZA 1NGCA 4BRAA 4BRIA 3VERA 5AZIB 2V7YA 2A5XA 2GTDA 5ADXA 3HTVA 2VYPA 1X3MA 1GLEG 1SZ2A 2OANA 4BRMA 3LM2A 3F9MA 3L6QA 5EXWA 4WQ4A 2CGLA 3O6WA 5AQZA 2F9TA 2IVOA 3GL1A 3S41A 1QZ5A 1IJJA 3VF2A 4AM7A 4BR9A 2FF6A 1NM1A 4XH4A 1YVNA 1YUWA 2D0OA 1ATRA 2P9PA 5AQWA 3HBTA 1TUYA 5BRHA 5KQDA 2VWBA 3ZEUA 4CI6A 3L0QA 4PKHA 4B1ZA 2Q97A 3MMVA 1XUPO 2P9PB 4BRFA 4FWSA 2ZGZA 3AAQA 5AQQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G6EN 1SL0A 2O8DA 4J2AA 3K59A 4M3RA 1JKHA 2ZJQL 5C24A 3PY8A 2QWMA 3R8EA 3HM9A 4IDKA 4RW8A 3SPZA 3AO4A 4DS5A 1HR0K 1JLEA 4IOXA 5SWMA 3CFOA 2HF4A 2Z1IA 3C7NA 3DRPA 3AO5A 1N32K 1KAZA 4MFBA 3CM6A 4CEQA 2C1GA 3AY9A 1TYQA 4UQGA 4DKWA 3THWB 4FWMA 1JLBA 4JHDA 1XHZA 4YOUA 3HPHA 3HPOA 1RT2A 4QS7A 2UUBK 2KLAA 3OVNA 4FWNA 4J8FA 4NCAA 3ATUA 3LP0A 4HUEA 1NKCA 4FLXA 3NF8A 5BRFA 4QAGA 4DCHA 1YJWN 5LJVA 4ELUA 2Q36A 3V9ZA 3DOLA 5AZJA 4FJGA 1HYVA 3PX0A 4XEIA 2GEMA 1YVUA 4EIAA 4LH4A 4WQ5A 4BE1A 1RT4A 1VQ6N 3QEXA 2XRIA 3S9HA 3OY9A 4KI4A 4AHSA 5KRSA 4FYDA 2HVHA 4ILGB 4B9LA 1JCGA 3EKSA 3TANA 2RKIA 2UUCK 3THVA 4QS9A 3M8QA 3UE5A 4GVEA 3AGRA 4CBWA 3L4QA 2HBLA 2OCEA 3E01A 4FJ5A 3K5OA 5GAHP 3RR8A 4JI4K 3WEEB 2KW4A 4KKOA 5B8HA 3E1YA 2HSTA 3PX4A 1TAUA 1HLUA 4BECA 1GLDG 1RBSA 5M1PA 4HCCA 1I94K 4CK3A 5IT9O 3CC2N 4H5NA 2ZGYA 5JVGL 2P9LA 3HSCA 3ZX2A 3WXLA 1RTDA 3JYTA 2HHIA 2I5JA 2Z1HA 4JKFA 2NRZA 3JS6A 2GUIA 2JWKA 4WQ4C 4CHPA 3QNNA 3ZSQA 5AQYA 1VQ8N 2P51A 3HVRA 1C0MA 3HRGA 4DV0K 2QWLA 1K8KA 4H4MA 2YCHA 1NMNA 4CZLA 1Q82O 5HRRA 3ZEUB 3R6MA 2DTUA 3TU5A 1WUAA 2DFFA 1IBMK 3LDSA 4DV7K 1RDAA 3O9TA 4JI2K 1NGHA 2Q3SA 4CK2A 1X9JA 3M3ZA 4DHYA 4BRLA 3K0SA 1RBRA 3EE8A 3ZSRA 4CGDA 4LFBK 3MAQA 2XHBA 3TARA 3VQEA 1VQMN 4CJ3A 4KH5A 2O8CB 3O4WA 4QOZB 3LM9A 5C2FA 1S6PA 4DTXA 3TAEA 3CCVN 4MDBA 4GV3A 2ASPA 4DSIA 3SMPA 3WXIA 3H46O 4FJNA 2GUPA 4DTOA 3OA9A 1LWEA 5FRNA 2O8BB 3NHGA 3OBWA 2P9UA 3D7EO 3CCSN 4C1NI 1TGOA 2ZE2A 1NGIA 2W40A 2LSNA 4OPJA 4TSXA 5AQPA 2E8AA 4EZ9A 2HMPA 4CK1A 1ZBFA 1U2VB 3CD6N 1T3VA 1NGFA 1LOTB 3LDQA 5EY4A 3SYZA 3SAFA 1NGAA 4YOWA 3OTOK 1ASVA 3DXKB 1X1PA 3VQ7A 4JRPA 2VG7A 4DU4A 2F96A 1BWFO 4PKGA 1VQLN 4GKJK 3O1WA 4OPAA 1S22A 4DTUA 1J6ZA 2QW9A 1M90O 4OLBA 5BPNA 3G4SN 4LF4K 1JLCA 3LDPA 3C6AA 5HRSA 4DUYK 4FK4A 1YAGA 2A3ZA 5JICA 1WAJA 4FLYA 4CF0A 4CEAA 2P9NA 4JK9A 1Y64A 3D2FA 2NRWA 3L3UA 4A2AA 3ZYYX 4KREA 5J2NA 3L2QA 3PLAA 2GWJA 3WUHA 4CF1A 5D3GA 3B6OA 2E1YA 4FOEA 4Z4HA 3EZ5A 2A41A 2QWQA 3TAQA 2KFNA 1NJIO 4BQLA 2E2PA 1BIUA 1KAYA 4E72A 2OPSA 3MN5A 5JLHA 2V7ZA 2HBJA 1KAXA 3LDNA 1TV6A 2IIRA 5GAEP 4BR5A 1JJ2M 3O4QA 3CPWM 4CIEA 5AQTA 4HHTA 3QESA 4ELTA 1VSDA 4O8UA 3VOVA 1E3MA 3C6UA 1NJYA 3C6TA 2A1SA 3BZCA 4M3TA 4C8MA 2OTJN 3EN9A 1HMVA 1QQOA 1REVA 5EOYA 4BQZA 4PL7A 3MCAB 1NOZA 4FJJA 3CMEN 4DG1A 1NWKA 4KHPK 3VEYA 1W9HA 4DTNA 1HKCA 3IFRA 1Q86O 3ENBA 3KWIA 1N6QA 4OGCA 3RMBA 3LAMA 4DTJA 2I7NA 2GWKA 1XMQK 1YIJN 4GVMA 4BROA 1NK8A 1VQ7N 5F2RA 4PQUA 4EHTA 2QKKA 1TKTA 1IH7A 2JLEA 3IUCA 4NXMK 4E19A 1YITN 1HX1A 5FRMA 3ULEA 3QEWA 2WC9A 3I33A 4K8ZA 4M42A 4CJUA 3C65A 3LL3A 1TL3A 1OH6A 4X64K 5HP1A 2GBZA 4N41A 1QQNA 3EYZA 2HNDA 4K8XA 1UWBA 1YXQA 3SJHA 4KB1A 1LCUA 1VSLA 3WXMB 2ITMA 4FW2A 1S1TA 3CCLN 2G8IA 1NG9A 1VSIA 1O13A 3SV4A 1EQYA 3TAFA 4DSKA 2GELA 3AVLA 4FJIA 2HBMA 1ZBHA 3VA3A 4BRQA 3NH1A 3PIPL 4B3OA 3I8BA 2A1RA 3MXMA 2EX3A 2FLOA 3D6RA 4BGAA 3O3GA 2Y1JA 3NAEA 3CQ8A 2QWRA 4JKDA 3TWHA 3TPQA 3M1FA 4K25A 4JI0K 3UIQA 1NGCA 4W5RA 2V7YA 3HTVA 4AF1A 2G8FA 3OYIA 3T1HK 4CESA 1GLEG 3SUOA 4YOTA 3F9MA 3L6QA 3HK2A 2CGLA 4DLGA 4CIGA 5GADP 2IVOA 1L5UA 4IFEA 2YX6A 1QZ5A 1U47A 1IJJA 2D5RA 4H8KA 1OVQA 2VGMA 3VF2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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