3BUZB

Crystal structure of ia-btad-actin complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of actin recognition and arginine ADP-ribosylation by Clostridium perfringens iota-toxin
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 103
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3buzB03
5BN8A 2VCPA 5BRHA 3QMLA 1X3MA 2YHXA 4BRFA 3SK3A 3WXIA 2V7YA 3KVGA 1NGHA 1WOQA 3UKRA 2NRHA 5BR9A 4JNEA 2FSKA 5EY4A 2YI1A 3FZHA 3VGLA 4BG8A 1T6CA 1JCEA 4H5WA 4LC9B 4CBWA 4WQ4A 5AR0A 5BREA 4MLEA 1H1VA 5BRDA 2Q36A 1DEJA 4FPBA 1BA0A 1Q18A 1TYQA 3QFUA 4H0OA 3ZETA 4A61A 4BGBA 5KQ8A 4IO8A 1XQSC 2QWPA 3H1QA 2GTDA 4CZEA 2QWQA 4BRQA 5FPDA 3BF3A 1ATRA 2AP1A 3AY9A 5AZIB 3ID8A 5BPMA 5I9EB 4M7XA 2WUSA 5AQQA 5EX5A 1D4XA 3MN6A 3UB5A 3ENOA 3WT0A 3J8AA 2P9IB 3LDPA 5KPRA 3VOVA 2V7ZA 3U9DA 2EWSA 4HTLA 2HF4A 3DXMB 3MDQA 3UKUA 3VF4A 2F9WA 4GY2B 2Q31A 3VEXA 3WEEA 4B1XB 3H3NO 1DGKN 4BR2A 2P9KA 4WYBA 2FF6A 2ZGYA 5ADXA 2NLXA 3VPZA 5AQGA 5ADXH 3IFRA 2Q1NA 1ATSA 5CE3A 3LDQA 3VGMA 4O8KA 1WUAA 1MDUB 3A5OC 4C23A 1E4FT 3CJ9A 3DXKA 3IMXA 4L3QA 3I33A 2DPNA 1TYQB 2W41A 5AQKA 2E8AA 3IDHA 4MLHA 3O8MA 2E2NA 2BTFA 1HUXA 3KZBA 4NB4A 2V51B 3WXJA 3KHYA 3L0QA 2YHWA 1SQKA 4EIAA 2Q97A 2P9LB 1QZ5A 5AQNA 4PL7A 5F1XA 2VYPA 3CI5A 1QQMA 3H46O 3VETA 3VEYA 1CZAN 4H0YB 2P9NB 5AQYA 2YHYA 3VF6A 1SAZA 3WQTA 3MCPA 2ITMA 4BC5A 4BRNA 4EAHD 3QFPA 4JD2A 1ZXOA 1JCFA 1LOTB 2A41A 3CETA 3WXLA 4CZKA 5AFUA 2YJFA 2GWKA 4BRMA 4IXCA 4YDUC 3C0BA 3VEZA 3CERA 1YAGA 4QS7A 4BROA 1XC3A 2CGJA 3EZWA 3HTVA 3OHRA 4PKHA 3VESA 2V52B 5AQLA 4EFHA 4RCHA 1U2VB 3DXKB 3H45C 1G99A 3GE1A 3O4WA 4J8FA 3ATUA 2CGKA 3VGKA 3GDQA 4H03B 3D7EO 2FSJA 4FSVA 4JHDA 1MWKA 3FZFA 1P8ZA 4M7YA 2A40A 4XH1A 4CBXA 2W40A 4JAXA 3BP8A 4BREA 1HKGA 1BUPA 3AARA 4ISGA 1NGIA 1V4SA 4H5VA 4WQ5A 4A62A 4DHYA 3FZKA 2GELA 4PKGA 2HF3A 3JS6A 4ISEA 1BOTO 3VEWA 4CI6A 2IVPA 3WQUA 4BG9A 4BRLA 3FGUA 4O5FA 1BA1A 3LDOA 4BQLA 3HBTA 4H5NA 3U4LA 1ATNA 4B1UB 3C7NB 4BVOA 3LL3A 4XEIA 3U8XA 3VERA 1YXQA 4KBOA 3FR0A 1C0FA 1KXPA 1NGAA 2YJEA 5F2RA 4IJAA 3AAPA 4RTFD 1U6ZA 4NO7A 5JLHA 4Y0WA 3D2FA 3GL1A 2D0PA 3M6GA 2OANA 5AQMA 5AQWA 4CJ7A 2Q2RA 2P9KB 4IWVA 3O80A 2Q0RA 4Z94A 5AQSA 4PKIA 3O5BA 5KPTA 4I6MB 1Z6RA 2IVOA 1KAZA 4BVPA 3WEEB 3A8YA 5AQIA 4BRHA 5AZIA 3GOIA 4QS8A 3D2EA 4BC2A 1NGGA 2P9IA 2HMPA 3UKRB 2A6AA 1K8KB 3SMSA 4IJNA 3SLCA 2ASMA 2FF3B 3G25A 4WQ4C 2QWNA 3HM8A 5JLFA 4FWKA 3QB0A 3LM9A 2QWRA 3DAWA 3ULEA 3H3OB 3ZETB 4QS9A 1KAYA 1RFQA 1HX1A 3AAQA 4DB3A 3FE1A 4BR4A 2E2PA 2H3GX 3VEVA 1BDGA 1NGJA 1XUPO 3CIPA 5E26A 1QQOA 4BRAA 5AZJA 4M63C 3A5MC 2P9NA 4BQZA 3FZLA 2CGLA 1BO5O 3RSEB 2IVNA 1NLVA 1QQNA 3EKSA 3R9PA 4BR9A 2UYTA 4BR5A 4BC3A 4FWOA 3VENA 3ZX0A 1GLEG 3MN7A 4CZFA 5AFUH 3BF1A 1BG3A 2P9SB 3WXKA 5FPMA 1IG8A 4AM6A 5JICA 4K25A 2E1YA 3ZX3A 4FWRA 4GNIA 5AQXA 4BRCA 4K41A 3B8AX 3EN9A 4HWIA 2QW9A 2J4RA 3A0IX 4CZJA 1R59O 2A3ZA 5BRFA 2I7NA 4A2AA 5TKYA 3A5NC 1QHAA 5AQUA 4WQ5C 1NWKA 4H0VB 5AQOA 2E20A 1BU6O 1Z05A 4EHTA 5BPNA 4FWLA 4E1JA 1OKJA 3ULEB 4B1ZA 2PAVA 3CQXA 1GLAG 4FWSA 3W0LA 4CD1A 2GEMA 1NGDA 5LY3A 2IIRA 2FLOA 4BRDA 2ZGZA 2VWBA 1T6DA 3RSEA 4A2BA 2P9UB 1IJJA 4H0XB 4FWQA 2AA4A 5AQVA 4PL8A 4CZHA 1C0GA 1KAXA 4FL9A 1S22A 3C7NA 1DKGD 1GLCG 3LM2A 3ZEUA 3SJHA 3CJ1A 5AQHA 1RDWX 1LCUA 4CZLA 4CZGA 1E4GT 3F9MA 4XH4A 4CZIA 4H0PA 3O1BA 4EHUA 3D2FB 3HI0A 2ZF5O 1YUWA 3IUCA 3SMPA 4MO5A 3MK6A 2F9TA 2GUPA 1NM1A 3DXMA 1X3NA 4IZ9A 3TPQA 4K42A 2E2QA 4CD3A 3R6MA 4K43A 2HOEA 4BR7A 2QXLA 2P9LA 4B9QA 5BN9A 3QICA 5AQRA 2E2OA 4BRPA 2QWMA 3VEOA 1Y64A 1HLUA 4DQ8A 3BEXA 4I6MA 3M1FA 3S41A 1S3XA 2P9PA 3QBXA 3P4IA 3CQYA 3HZ6A 3QBWA 3O1WA 3UE5A 1NBWA 1MWMA 4FWMA 1ZC6A 2BUPA 3GG4A 3A5LC 3BUZB 3HSCA 5AQJA 3DJCA 3H1VX 5AZJB 1HPMA 3L6QA 4FWNA 4B1WB 1HKBA 1K8KA 1NGCA 3O6WA 2QWLA 3H6EA 3I8BA 1GLBG 3QDKA 4MO4A 3O08A 4YDUA 4CBUA 1EQYA 3EL2A 5EXWA 5F0XA 5AQZA 4JHDB 3CJAA 4H5TA 2P9SA 1NMDA 5JMVA 2D1KA 4F9OA 4AM7A 3EO3A 2ASOA 5ELZA 2QM1A 4H0TB 3UKUB 3CJCA 2Q0UA 4BRKA 4RWTA 5FPNA 2ZWHA 1NGEA 5LJWA 2A5XA 5EOYA 1RGIA 3VF2A 3WUHA 3GBTA 5E84A 5LJVA 4BR0A 1U2VA 2I7PA 4B1YB 4B1VA 3FFKB 4CZMA 3MN5A 4FOIA 1GLFO 2P9PB 3FZMA 1NGFA 4FPAA 3FLCO 4DCHA 2GWJA 3CJBA 2KHOA 2PBDA 1ESVA 1T44A 3DWLA 4BRGA 1HKCA 1V4TA 4BRIA 4BC4A 2P9UA 5B8HA 4JD2B 2A42A 3LDLA 1X9JA 4XH5A 4JN4A 5EVZA 3MN9A 2CH5A 1GLJO 1MA9B 2D4WA 4BGAA 1TUUA 1GLLO 3R8EA 1YVNA 1SZ2A 1TUYA 2FSNA 4FO0A 2E88A 3D2EB 2QWOA 3CHWA 5AQFA 3L4IA 5KQDA 2NZTA 1NGBA 3MMVA 2FXUA 1HJOA 3ZX2A 3LDNA 3ATVA 4H5RA 3U9ZA 3W3DA 3M3ZA 1GLDG 5BPLA 5FPEA 5AQPA 1JCGA 1BWFO 2E1ZA 2YCHA 3ZEUB 2D0OA 4FWPA 3JXUA 2ASPA 1ZBSA 3ENHA 5AQTA 5KPZA 4ISFA 2CH6A 3TU5A 3EKUA 4FOEA 1QZ6A 1J6ZA 3CJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BN8A 5BRHA 2OPQA 4CJ3A 2YHXA 1VSLA 1WB9A 3ZSYA 1NGHA 2ZM6K 1SKWA 4KH5A 1NK8A 2D0AA 1X9MA 4YOWA 1LV5A 2O8CB 3TR8A 2VG7A 4W5OA 4LFCK 3VTHA 3V1QA 3ZETA 3JSMA 4A61A 4BGBA 1U49A 1C1BA 1EWQA 2O8DB 1RBVA 2YNIA 3SAHA 4FVMA 4IO8A 3VQQA 1KFSA 1HPZA 3CPEA 1XQSC 1NJZA 4IFYA 4CZEA 1RILA 1L3TA 4FJMA 4BRQA 4ID5A 5FPDA 2NRWA 5AZIB 5I9EB 4M7XA 1QE1A 1C1CA 1VQON 1EKEA 4DG1A 1D4XA 3ENOA 4OLBA 4OPAA 2HMIA 5A2QO 3LDPA 1ASWA 1NG9A 3D6RA 2DFHA 5EU7A 3MXIA 3CPWM 1JKHA 2KTQA 4AHUA 2A1SA 1RBTA 2FBYA 2E5LK 4HCBA 1IKVA 1S1XA 2KKZA 4WYBA 1S72N 2NLXA 1N5YA 5HP1A 1BL3A 3C6TA 3LDQA 3VGMA 3CC4N 4F8RA 3N4QA 1E4FT 3DOLA 3CJ9A 3DXKA 3VQ8A 4FM0A 3PSFA 3I33A 3OJSA 2DPNA 4C1NK 4DV2K 5AQKA 1L3UA 3NE6A 5T7BA 3O3GA 1UA1A 1JL2A 3THXA 2C1IA 2YHWA 4EIAA 4AF1A 2P9LB 4M3UA 2G8KA 5AQNA 4PL7A 1W97L 5F1XA 2VYPA 1A5XA 1RT6A 4AQYK 4JRPA 3HK2A 4H0YB 4O8UA 4BE7B 3Q7BA 5AQYA 3HT3A 2YHYA 3TTFA 3CXCM 2HVIA 3VQ4A 3WQTA 4DV3K 3SQ1A 1ASVA 4JKGB 3MWPA 2QTDA 1L5UA 3T69A 3CETA 5AFUA 2GWKA 1T03A 4FVUA 3LWLA 4IXCA 3AA5X 4LY7A 4KHPK 3RMCA 4Y1CA 4RCHA 2O8EA 3DXKB 1QQCA 3H45C 5M1QA 3O4WA 4J8FA 1J5EK 1HR0K 3ZCMA 3VGKA 1WNSA 2P5OA 4YOUA 4FSVA 3CMEN 2Z1GA 3G0ZA 4JAXA 3G6EN 3CFOA 4CF1A 4Z4HA 3L2WA 3BP8A 4FJ9A 3OYBA 4ISGA 3I0SA 1KLNA 4LF7K 1NGIA 3VMFB 2ZD1A 3VEWA 4CI6A 2W42A 4BG9A 5IT9O 1IV0A 1RTIA 3K57A 2NRZA 4RW6A 1ATNA 1HJRA 1TV6A 1VQ5N 4BVOA 2PY5A 2B6AA 3U8XA 1YXQA 4KBOA 4IJAA 1O13A 5IWAK 1U6ZA 3V9WA 3CD6N 5AQWA 3O80A 4Z94A 5AQSA 1N32K 3PIOL 5HROA 1HNWK 3KK1A 4NYFA 3A8YA 3CCVN 4DTJA 5AZIA 4E0DA 2ATQA 2P9IA 2HMPA 3UKRB 1K8KB 3T1HK 1VQ4N 4LH5A 3G25A 2QWNA 3NMUA 3HM8A 5JLFA 4E7JA 3THXB 4J2EA 3N4PA 4N41A 1RDBA 5JVHL 1RFQA 1QSLA 1VSHA 3FE1A 2H3GX 3CIPA 3SYZA 5E26A 4BRAA 1S9GA 4OVLA 3A5MC 2P9NA 3FZLA 2O4IA 3LDSA 1VAZA 4DSIA 3IRXA 2IVNA 2UYTA 3MXJA 1XHZA 4E7HA 4FWOA 4CJVA 5M1KA 2D0CA 3VENA 4JS4A 1VQKN 2JWLA 1HNXK 2F8SA 4CZFA 5AFUH 3K9KA 3I8DA 1BI4B 1I3AA 4K25A 2D5RA 3C6AA 3FFIA 2P5GA 3C94A 3ZX3A 4E72A 4PUOA 1IKYA 1Q7YO 2DTUA 4HWIA 2QW9A 3A0IX 4FM2A 2I7NA 4KREA 5AQUA 3S9HA 1VRUA 1SL1A 2E20A 5BPNA 1CLQA 5CR4A 1TKZA 3HPGA 3PX0A 1OKJA 4DSEA 1OH7A 4B1ZA 4FWSA 1VSIA 1GLAG 1WLJA 4CD1A 1NGDA 1DTTA 2IIRA 2UUBK 4BRDA 3ZSQA 4CJPA 1JLGA 1T6DA 2F8TA 4R79A 2C1GA 3AV9A 1IJJA 2GUIA 2NRRA 5DK5A 2AA4A 5AQVA 1JLBA 3RMAA 1N36K 4NLCA 5KI6A 4DR5K 1M90O 4C8LA 1NJIO 1DKGD 1M1KO 3LM2A 2E4LA 3SBGA 3SJHA 4IEIA 5AQHA 4CEAA 4DMNA 3TTDA 3CCRN 4CZGA 2YKNA 1D5AA 4XH4A 1O1WA 4H0PA 3OYHA 4FXDA 4MO5A 1FK9A 3OYDA 3K5LA 2GUPA 1NM1A 3DXMA 3TPQA 3AVMA 1VQ7N 3R6MA 2E6LA 4JRQA 3J7ZO 4DTMA 2P9LA 2WONA 4JLHA 3L8BA 3C65A 5AQRA 4KB0A 4FLWA 1IH7A 1T05A 1TK8A 3VEOA 3ZSWA 3MEDA 5DM7L 1S3XA 3QBXA 1S5JA 1KRPA 1LAVA 3M5RA 2BUPA 3T19A 4B8CA 4JI8K 4CHYA 1P90A 5AZJB 1OVYA 1K8KA 3O6WA 2QWLA 5C25A 1EXQA 4BWJA 3HP6A 4LF8K 4DV6K 1EQYA 3BGRA 4CEFA 5EXWA 4KFBA 1EETA 4B9TA 4LF9K 3AGRA 2QKBA 4H5TA 3QINA 4FJ7A 3UIQA 3HL8A 5JMVA 3P38A 4ILGB 4AM7A 1TK5A 1TKXA 4E19A 5GIOA 4G1QA 1A5WA 4BRKA 3CM5A 4RWTA 2HBKA 1F21A 3HYFA 1FXXA 1I39A 1NGEA 5CHIA 5LJWA 5EOYA 1RT3A 3WUHA 4FJKA 1BCMA 3GBTA 4CJ5A 4CHPA 1U2VA 3V1OA 4B1YB 4CGFA 2XY5A 2P9PB 4FPAA 3FLCO 4LF5K 1VSKA 3HRGA 3AA4A 3OYCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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