3BUZB

Crystal structure of ia-btad-actin complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of actin recognition and arginine ADP-ribosylation by Clostridium perfringens iota-toxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
total genus 103
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3buzB03
3ZEUB 5AZIB 2ITMA 1EQYA 3CI5A 3QMLA 4IXCA 5FPNA 4CBUA 1S22A 2NLXA 5BR9A 5AZJA 2IVOA 3CJ9A 2F9WA 4B1ZA 3QFUA 2V51B 2CH5A 1RDWX 4K25A 5AQYA 2Q31A 4DCHA 1X3MA 3BP8A 3WXKA 4H0OA 1D4XA 4EFHA 4IJNA 3ENHA 5KQDA 2Q97A 2P9PA 3HBTA 4RTFD 2FLOA 4FWLA 4FWOA 4Y0WA 3BF3A 3EKSA 4BRCA 4LC9B 3QDKA 5BPLA 3FZLA 4CBXA 3VF4A 3A5MC 3CERA 1E4GT 3CQXA 3VESA 2HOEA 1QQMA 4FSVA 4K42A 2D0PA 1TUUA 3AY9A 1NGEA 1NLVA 4MO5A 4BRLA 4BQZA 3O6WA 1U2VA 4PL7A 4BC2A 3JS6A 4H5RA 5AQUA 2HMPA 5AQGA 2YJFA 5JLHA 5JLFA 1K8KB 3WQTA 1YXQA 1NGGA 2A40A 3VGLA 4BRMA 1GLEG 3H6EA 2W40A 5FPEA 3DXMB 4CZGA 2QW9A 4WQ5A 2P9IA 5AQZA 1XQSC 1BG3A 1YUWA 4ISFA 2FSJA 1HKGA 4JD2A 2GUPA 3O5BA 2A42A 4EAHD 3LM9A 3U8XA 1E4FT 4PL8A 4CI6A 5E84A 2QWQA 3VEZA 3VERA 3AARA 1ZC6A 2W41A 1X3NA 3M6GA 4RWTA 2PBDA 2YJEA 1XC3A 4WYBA 3FLCO 2WUSA 4A2BA 4BC5A 3D7EO 2P9UB 1KAXA 3UKUA 4BR7A 3MN9A 4ISEA 3WEEB 3ATVA 3R6MA 2V7ZA 4H5NA 3WXLA 3U4LA 4BRIA 3LM2A 4DQ8A 1XUPO 3S41A 3GE1A 3UB5A 3U9ZA 5ADXH 1IG8A 4FWMA 2P9SB 2HF4A 4H0TB 2D0OA 4FWNA 3QBXA 4JNEA 2Q2RA 2QM1A 3O1BA 5KQ8A 3R8EA 3C0BA 4B1UB 1BA0A 1NWKA 3MDQA 4XH4A 5AQTA 5EVZA 4BGAA 1GLDG 2P9LA 4YDUC 2YCHA 5AFUA 2Q0RA 4H0XB 3R9PA 3WUHA 3UKRA 2V52B 4XEIA 3DAWA 3VENA 5EX5A 1LCUA 2E8AA 4BRPA 2Q36A 5AQVA 5KPZA 2A5XA 3W3DA 4B1XB 3LDQA 4H5WA 3ZETB 1OKJA 3RSEB 5EY4A 2QWLA 2I7NA 4K43A 1NM1A 1SAZA 3LDNA 1T6CA 3L6QA 5AQNA 1HPMA 4ISGA 5FPMA 4BROA 3ENOA 2ASMA 2I7PA 3H3NO 4C23A 3VETA 5AZIA 3LDPA 4BR9A 5KPTA 3CETA 1C0GA 1Z05A 3AAQA 3FGUA 1KAZA 1TYQB 5AQIA 5AQLA 2OANA 1NGCA 5BPMA 3D2FA 2E2NA 3SMSA 1QZ5A 2YI1A 4H03B 1JCEA 1GLCG 3DXKB 3FR0A 3SMPA 3I8BA 3QFPA 4XH5A 5JMVA 3GL1A 3MN5A 5AQQA 3C7NA 3QB0A 1KAYA 5ADXA 2V7YA 5FPDA 1MDUB 2VCPA 3GOIA 3DJCA 4DHYA 5AFUH 5AQHA 2GEMA 4MO4A 4FWKA 3I33A 4FL9A 5AQWA 3ZX0A 3HTVA 3WT0A 4BR4A 1NGAA 1QHAA 4QS8A 3U9DA 3EKUA 3MK6A 2QXLA 2GWKA 3JXUA 3L0QA 4BG8A 2J4RA 1U6ZA 3CJ7A 1NGDA 3ATUA 4WQ4A 4JHDA 1U2VB 3MN6A 5TKYA 4GNIA 4CZHA 3P4IA 4CZJA 3KHYA 2IVPA 1RGIA 3MMVA 4A2AA 1V4TA 4CZEA 3ULEA 3BF1A 4PKGA 4IO8A 5LY3A 4H0YB 1ATSA 1DGKN 1SZ2A 5BRHA 2FF6A 2H3GX 2P9IB 4K41A 3OHRA 1MA9B 1WUAA 3HI0A 5F2RA 1HLUA 2AP1A 4JD2B 2BUPA 1CZAN 3FZFA 2E20A 4FOEA 1MWKA 2GELA 2P9UA 4JN4A 1Z6RA 3EO3A 5I9EB 4GY2B 4AM6A 3H3OB 1QQNA 4NO7A 3B8AX 3EN9A 2QWMA 5AQRA 3BUZB 5F0XA 4BRFA 3UKUB 5AQMA 1R59O 3AAPA 2P9SA 3EZWA 1ZXOA 1QZ6A 3TU5A 2IIRA 3HM8A 4I6MB 1ESVA 3A5NC 1S3XA 1TUYA 4DB3A 3D2EB 3EL2A 1Y64A 2BTFA 3H45C 5KPRA 2CGKA 4CZMA 2VYPA 2Q1NA 1BU6O 5AQKA 1BDGA 3SJHA 3CHWA 4IZ9A 2P9LB 2D4WA 5BPNA 1C0FA 1HKCA 1YVNA 3QICA 1GLBG 5JICA 1GLLO 1P8ZA 4BVOA 3MCPA 2PAVA 4J8FA 2P9NB 3UKRB 4B9QA 2GWJA 4WQ5C 4BC3A 1NGHA 1GLJO 3O08A 5AQOA 1V4SA 2D1KA 4BRKA 3H1QA 5AQJA 5BN9A 3FE1A 2KHOA 1J6ZA 2P9KA 4H5TA 3O4WA 4IWVA 3ZEUA 4B1WB 2YHYA 3J8AA 5AQFA 2UYTA 3M1FA 4BRNA 3GG4A 1HX1A 1BA1A 2ZF5O 4BRDA 3VEXA 4Z94A 3KZBA 3LDLA 3IFRA 4QS9A 4M63C 4XH1A 4A62A 4E1JA 1WOQA 5CE3A 1BUPA 2E2OA 1MWMA 1QQOA 3LL3A 2E2QA 3FZKA 3O1WA 4FWQA 3VF2A 2YHXA 4CBWA 2Q0UA 1BO5O 1NGBA 3DXKA 5AZJB 2CGJA 5AQSA 4CZFA 5BRFA 4EIAA 1G99A 1RFQA 3WXIA 4CZLA 4HWIA 3IUCA 3D2FB 5AR0A 3WQUA 4IJAA 2AA4A 2FXUA 1KXPA 2E1YA 4RCHA 4B1YB 2P9PB 5AQPA 2ASOA 4BC4A 3VOVA 1T44A 5EOYA 5LJVA 3VEYA 3C7NB 1SQKA 3SLCA 1NGFA 3A8YA 4PKHA 3CJBA 3HSCA 4BRAA 1K8KA 2CH6A 3LDOA 4YDUA 2EWSA 3M3ZA 4HTLA 3DXMA 3IMXA 3CJ1A 4FOIA 3H1VX 4FPAA 4BR5A 1YAGA 2IVNA 4BR2A 4O5FA 3FZMA 3O80A 5LJWA 3VEVA 2GTDA 3GDQA 3TPQA 1Q18A 3ID8A 4AM7A 4MLHA 3VEWA 2ZGYA 4CD1A 4BGBA 5BN8A 3BEXA 2VWBA 2NRHA 4JHDB 5B8HA 1LOTB 3ZX3A 2ZGZA 4FPBA 1BWFO 4B1VA 3A5OC 1IJJA 1JCGA 2QWPA 3ULEB 3VF6A 3VGKA 3IDHA 4BR0A 3L4IA 1GLAG 3WEEA 2E1ZA 5BREA 1H1VA 4H5VA 1HKBA 4PKIA 4NB4A 1DKGD 4M7YA 5ELZA 4MLEA 2ZWHA 4BQLA 4EHTA 2QWOA 2QWNA 3CQYA 3CJCA 3GBTA 4FO0A 5E26A 3O8MA 4CZIA 4BREA 1ATNA 2NZTA 3G25A 3DWLA 1NMDA 1JCFA 4I6MA 3UE5A 3VEOA 5F1XA 4FWPA 2DPNA 2HF3A 3F9MA 3W0LA 1T6DA 4JAXA 1ATRA 2FF3B 3MN7A 4EHUA 3D2EA 2YHWA 1HUXA 3A0IX 4BG9A 2ASPA 4F9OA 5AQXA 4BRQA 3VPZA 4BVPA 3QBWA 3WXJA 4CZKA 4H0PA 4FWSA 4KBOA 4BRHA 3VGMA 1DEJA 4CD3A 3ZETA 3CIPA 3RSEA 1NBWA 2A3ZA 2CGLA 4WQ4C 2F9TA 2P9NA 2A6AA 2FSKA 2E2PA 3KVGA 1X9JA 3SK3A 1GLFO 4BRGA 4QS7A 4H0VB 1NGIA 1NGJA 3HZ6A 2FSNA 4CJ7A 4A61A 1BOTO 5EXWA 4M7XA 3ZX2A 1HJOA 2E88A 5BRDA 3H46O 1TYQA 1ZBSA 3FZHA 4O8KA 3CJAA 3FFKB 2QWRA 4FWRA 3A5LC 4L3QA 2P9KB 2A41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M8SA 1O13A 2ITMA 3RRHA 2BDPA 3K57A 4IXCA 1HNXK 4CBUA 4DFKA 2F96A 3VQ8A 3PIOL 2Z1IA 1Q86O 5C24A 1J9AA 5I3UA 3VMFB 4DTPA 4YY3K 4B1ZA 2V51B 1RDWX 5AQYA 5J2MA 2G8IA 3BP8A 4Y1CA 2P5GA 1VQ8N 4FJ7A 4QAGA 4JLHA 4DWIA 1NKCA 3EE8A 5KQDA 3SPYA 4FWOA 4FJMA 1VSFA 3D45A 4BRCA 3QEPA 5HP1A 3HYFA 4UQGA 3CQXA 3BY5A 4CJVA 3V9SA 1IH7A 5M1QA 4OJRA 3C6HA 3O6WA 4BC2A 1RDBA 3DLEA 4H5RA 3ZSZA 4AHCA 2PZSA 1VSEA 4DF8A 1HPZA 4FVMA 2OTJN 1ZBLA 1RT4A 2FBTA 4G1QA 3O9SA 3RR7A 1SL2A 1Q9XA 1XQSC 3M8RA 3CC2N 3PUFA 4CEQA 1KQSM 4JI3K 2GUPA 3VN5A 2OZMA 4CGIA 1JKHA 1SL1A 3HT3A 2AJQA 1HJRA 4DR6K 2PFUA 4JEPA 4JI2K 3I0SA 2BE2A 2YJEA 1XC3A 3FLCO 1TV6A 3D7EO 3JAMO 2O8FB 3UKUA 4CCHA 2HHSA 4WF9L 1L3TA 3OS2A 2BGGA 3P1GA 4AH9A 3HP9A 1QTMA 2NRXA 4H5NA 4OKEA 4ICLA 3WXLA 4JRQA 4KHUA 1TK0A 1XUPO 3S41A 5IWAK 3GE1A 3QEIA 3WNFA 1C1CA 1WBBA 1VQLN 1BIUA 1JL2A 2HF4A 2D0OA 1TAQA 1XWLA 3OYCA 1RILA 2EX3A 4KH5A 4DU4A 4B1UB 3HOTA 1I94K 3VQ7A 4FJGA 2HB5A 3AA4A 1SKRA 4LF8K 1LW0A 4CJKA 3CQ8A 1LWEA 3R9PA 1NK5A 3B6PA 2V52B 4XEIA 1LCUA 2E8AA 4KHSA 3P39A 1FXXA 2RE2A 5KPZA 2G8HA 3W3DA 3NCIA 2KLAA 2I7NA 2ZE2A 2ZD1A 3ZT1A 4JI6K 2VQEK 1HPMA 4DR3K 4ISGA 4FLTA 4KREA 4C1NK 3VQAA 3IKMA 1EP4A 1HYVA 4C23A 2D5RA 3DRRA 4BR9A 1BL3A 3VTIA 5FRMA 1KAZA 1TKTA 4RW8A 3CYMA 5AQLA 3O4QA 4GVMA 4IDKA 3D2FA 2E2NA 4JI4K 1N36K 1JLEA 4E7KA 1N34K 3V4IA 3AO3A 3FR0A 3N4QA 2XY6A 4XJXA 5JMVA 3MN5A 1NJWA 4KHWA 1KTQA 3F5TA 4FW2A 3GOIA 3DJCA 1QS4A 3G4SN 3K5NA 4X65K 1CLQA 4MO4A 1QHTA 3QETA 2UXCK 3I33A 4FL9A 3ZX0A 3O3GA 4FJ5A 4F8RA 3OJSA 4BR4A 1X9SA 3P83D 2HHUA 4Q0BA 3C65A 2GWKA 3JXUA 3L0QA 4M3ZA 2D0AA 4M41A 2J4RA 3RMBA 3CJ7A 3ATUA 3NDKA 1U2VB 3L2QA 3KHYA 1T05A 4RW7A 4A2AA 3LWLA 3DRSA 5FLXO 4NCAA 3BF1A 4PKGA 1QE1A 4H0YB 1DGKN 1E3MA 2W6LA 5M1NA 1U4BA 3OHRA 3HPGA 2AP1A 5HL7L 2HHVA 3V6DA 4KHQA 1U45A 4BECA 3EO3A 5I9EB 4AM6A 3ZSOA 1RNHA 5HLFA 4OPKA 3EE9A 3B8AX 3KD1E 1YTAA 2NRRA 3R1XA 4JRPA 5J1EA 1T3VA 1WNSA 4HUGA 3V9UA 4NCGA 2W00A 1R59O 3LZJA 4OGEA 4N76A 1RBUA 1Z26A 1VQ5N 3EZWA 4ILGB 3O3FA 1YIJN 1HR0K 3TAPA 1ESVA 3MWPA 3V1OA 4CF9A 4DB3A 4QOZB 3EL2A 1Y64A 1VQ9N 1S6QA 4NYNA 3TSUA 2DFEA 2QKKA 1BDGA 2B5JA 3SJHA 3TAGA 2D4WA 3AVIA 1C0FA 1ASVA 1HKCA 1B92A 3QICA 4AILC 1GLBG 4C8LA 3KLHA 1P8ZA 3AVCA 2F4VK 4Z4FA 4J8FA 2P9NB 3UKRB 1TKDA 1QQCA 3TTCA 4BC3A 3K5MA 4ZHRA 4KV8A 3K0SA 4DLEA 3SJJA 1QSYA 5GINA 3O4WA 4IWVA 3AGRA 3ZEUA 4DFPA 4B1WB 5AQFA 1QVFM 2HHXA 2OPQA 3GG4A 2HSTA 2ZF5O 3PSFA 2HW3A 4KAZA 1JXEA 1L3SA 1TGOA 4PQUA 3IRXA 4CJFA 1EWRA 4M63C 4XH1A 5CY4A 4NLCA 3TAEA 1MWMA 1QQOA 2YNIA 2E2QA 3LL3A 3O1WA 4FWQA 5IT9O 4E1NA 1RBSA 1NGBA 4DSEA 2CGJA 4EIAA 1ZBUA 4CZLA 1JLFA 4DV0K 5HOOA 4CESA 1LW2A 3IUCA 5AR0A 1CZBA 4IJAA 1KXPA 4RCHA 4BDZA 4B1YB 2FBYA 5FROA 2P9PB 3ZYYX 2GBZA 4JK9A 1J54A 4DV2K 4PKHA 4YOUA 3E9OA 3CCMN 1K73O 3MXMA 3CF5L 2CH6A 3ALYA 3MX5A 1WAJA 4NYFA 3OS0A 3Q7CA 4GMJB 2EWSA 4DTXA 1C6VA 3E1YA 3DXMA 3V81A 4FPAA 1RTIA 4CW7B 1KLNA 1QSLA 2B4JA 3NFAA 4BR2A 4RW6A 3MX2A 5C25A 3C94A 4W5RA 3OVNA 4HCCA 3GDQA 1Q18A 1WB9A 1S1UA 4MLHA 3SV3A 3SYZA 4FVUA 3OYHA 5C15A 2VWBA 3T1AA 4JHDB 2Z1GA 2Z1JA 1OH5A 2ZGZA 4FPBA 4DSIA 5C2FA 2VWKA 3ITHA 4BR0A 4DU3A 3IDHA 4CFAA 4DV4K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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