3BUZB

Crystal structure of ia-btad-actin complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of actin recognition and arginine ADP-ribosylation by Clostridium perfringens iota-toxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 103
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3buzB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3buzB03
1NGHA 1NLVA 2ZWHA 4BRHA 1MDUB 5AZIA 2CGJA 3KVGA 3J8AA 4I6MA 4MLHA 4IJAA 5AQGA 1Z05A 2YHWA 4WQ5C 1GLCG 1CZAN 4BRNA 1R59O 2FLOA 3AAPA 3D2EA 4FWRA 1YVNA 3D2FA 1KAZA 1RFQA 3WXKA 1QQOA 3UKUB 1NGGA 5E84A 4JD2A 5LJVA 1NGEA 4H5RA 4B1WB 1OKJA 4Z94A 5KPRA 4FWPA 1H1VA 5EOYA 1GLBG 3HZ6A 4CZGA 1JCFA 4FL9A 5FPNA 4AM6A 4H0VB 4BC5A 1ZC6A 5AQPA 3MN7A 3IDHA 3M3ZA 3TU5A 2P9LB 5KPTA 1TUUA 2P9UB 5CE3A 1GLJO 1Q18A 3ATUA 4BR4A 1IJJA 1E4FT 3GL1A 1JCGA 5AQJA 2BUPA 1HUXA 1ATRA 3IUCA 2HF4A 4BRFA 3U4LA 2FXUA 3S41A 3H3OB 2V7YA 4ISGA 2P9NA 3O80A 2HOEA 1IG8A 5BPNA 2V52B 1MWKA 5FPEA 3ENOA 2ZF5O 2IIRA 4BQZA 4M7XA 3A5OC 4RTFD 3QFPA 1NBWA 1NWKA 3SJHA 3TPQA 2H3GX 1XUPO 4BVPA 1S22A 1V4SA 1V4TA 1KXPA 4DB3A 3SMSA 5BPLA 4XH4A 1YUWA 2VYPA 4B1YB 2D0PA 2Q0RA 5AQMA 2P9IA 3ULEB 2V51B 5BRHA 2GELA 4BGAA 3L6QA 2W41A 4BRGA 1NGAA 3EO3A 4H5NA 5JLFA 2E2QA 5AQIA 1HPMA 2QWPA 3RSEB 2ASPA 3AARA 4BRDA 3WXJA 2QWRA 1HJOA 4FWLA 2E88A 1T6CA 1ATSA 5AZJB 1BO5O 1QZ6A 2ASOA 2I7NA 4ISEA 4FSVA 5EY4A 3EN9A 1HKCA 5BRDA 2A5XA 4CZFA 3VF2A 5AQNA 2E1YA 4BROA 1LOTB 1U2VB 4A61A 4CBUA 3FZLA 3ID8A 2ZGZA 4CBWA 1SQKA 2F9WA 4FWMA 1Z6RA 2W40A 1NGCA 1WOQA 3O8MA 4XEIA 3CJAA 3EL2A 4FWSA 2FF6A 4BR0A 2D0OA 4CZIA 1GLEG 4FOEA 3CERA 1K8KB 3UKUA 4JHDB 2NLXA 5KPZA 5KQDA 3VEOA 3GE1A 3FZHA 4K42A 4LC9B 4WYBA 3FZFA 4F9OA 4FPBA 4PL7A 4YDUC 2P9LA 5AQVA 4EIAA 3EKUA 4GNIA 1MA9B 3VEZA 3WXLA 3U9DA 1T44A 3GDQA 5ELZA 1BDGA 1DEJA 4FWQA 1KAXA 3C0BA 3CJCA 3DJCA 4A62A 2P9KB 3MN5A 3H45C 3WQTA 2CGLA 4CBXA 4CZMA 3UKRB 3CJ1A 2BTFA 4FWNA 4BRAA 2YHYA 4BVOA 2ASMA 2CGKA 1ESVA 2A3ZA 2E20A 3BP8A 4EHTA 3VEYA 4WQ4C 4BRCA 4FWKA 3CI5A 5AQXA 1C0GA 2Q2RA 4CZKA 3DXMA 4JN4A 3VERA 4IJNA 1GLAG 2V7ZA 1DKGD 3QBXA 4H0XB 4AM7A 1KAYA 2Q36A 3L0QA 4CD1A 2UYTA 1J6ZA 5LY3A 3VGKA 2GWKA 4CZJA 2KHOA 2YCHA 4BQLA 4BC3A 2GUPA 3FR0A 4BR2A 3BEXA 3A5NC 5AQSA 4XH1A 3IMXA 3VEWA 1D4XA 4EFHA 4BREA 2IVOA 5ADXH 1QHAA 4H0PA 4MLEA 3MN6A 1MWMA 2QWLA 2YI1A 3DAWA 1HX1A 3AAQA 1HKGA 3RSEA 4IWVA 2EWSA 5AZJA 4A2BA 3M1FA 2P9SB 5AQYA 2QWNA 3LDLA 3O1WA 3L4IA 1ZXOA 3FZMA 4DQ8A 5AQFA 2A42A 3LDPA 2E2OA 3QB0A 3HBTA 2YJFA 4H5TA 3D2FB 4WQ5A 4HWIA 5ADXA 3I33A 1E4GT 1U2VA 5AFUH 2QW9A 3R6MA 3O6WA 5FPMA 2VWBA 2ITMA 2FSNA 3R8EA 1QQMA 1JCEA 4RWTA 1BA1A 1SAZA 5KQ8A 3VEVA 2D1KA 3AY9A 2YHXA 4CZEA 3VPZA 1K8KA 4JHDA 4B1UB 1T6DA 4H0TB 5EX5A 4E1JA 5AQKA 1HKBA 4B1ZA 4IO8A 4C23A 4CI6A 4B1XB 3C7NB 4BRKA 2E2NA 3VESA 3JXUA 3WQUA 4HTLA 4H0YB 2A6AA 5BRFA 2YJEA 3B8AX 3CJ9A 3QFUA 5B8HA 4QS9A 4L3QA 3VOVA 3P4IA 1BOTO 2HMPA 5F0XA 4RCHA 3H1QA 1ATNA 1QZ5A 2P9KA 4K25A 5AR0A 5AQTA 3SLCA 3UKRA 1NGBA 3DXKB 3EKSA 3W3DA 2QM1A 1XQSC 3MN9A 3O4WA 4H5WA 3IFRA 4BC4A 3OHRA 4DHYA 3ZX2A 1TYQB 4BRLA 4BR7A 2P9IB 3R9PA 5JICA 2FSJA 5AQQA 4DCHA 2AA4A 3VGLA 3QMLA 3SK3A 3LDNA 2P9UA 2DPNA 2NRHA 1SZ2A 3LDQA 4JNEA 2GTDA 3GBTA 3FZKA 4QS7A 3VEXA 3O1BA 4MO4A 3BF3A 4H03B 3UB5A 4BG8A 3G25A 3U9ZA 1RGIA 3QBWA 5AQWA 3GG4A 5BPMA 4BGBA 3WEEB 4BC2A 4M63C 2FF3B 4BRMA 1C0FA 3A8YA 4EAHD 3BUZB 3CQXA 2I7PA 1X3NA 2E8AA 3ATVA 4NB4A 1NMDA 2P9SA 1ZBSA 3CETA 5EXWA 3GOIA 1NM1A 1DGKN 4BRPA 3ZEUB 3A5MC 1S3XA 3ZETB 1Y64A 2PAVA 2A40A 2QWOA 1BA0A 4PKHA 3VF4A 4H0OA 3VENA 2Q1NA 4H5VA 1BUPA 2Q0UA 3ULEA 4FWOA 2E2PA 1EQYA 1NGJA 4K41A 3FLCO 3LDOA 3KZBA 4IXCA 3U8XA 2CH5A 4Y0WA 4CZHA 2P9PB 4BRIA 3WT0A 3BF1A 1GLFO 4XH5A 3O08A 2Q31A 2WUSA 1BG3A 4YDUA 2FSKA 1LCUA 3HM8A 1YAGA 2NZTA 5AZIB 4I6MB 5AQRA 4FPAA 5EVZA 3H6EA 5AQLA 5F1XA 3A0IX 3C7NA 3EZWA 3HI0A 3D2EB 4ISFA 4PKIA 1NGFA 1X9JA 4CJ7A 5F2RA 4PKGA 3CIPA 1U6ZA 4O8KA 3F9MA 4FO0A 3MDQA 4JD2B 4M7YA 3JS6A 5AQUA 2GWJA 2A41A 4WQ4A 2QWQA 3DXMB 3I8BA 2J4RA 1WUAA 3LM2A 5JLHA 3VF6A 5TKYA 3FGUA 5E26A 3WUHA 3CJBA 5BR9A 5JMVA 1NGIA 4IZ9A 3QDKA 3DXKA 3HTVA 5BREA 2IVPA 3LL3A 2ZGYA 1NGDA 3CHWA 3FE1A 2QWMA 3VGMA 3M6GA 1TYQA 2HF3A 5FPDA 3UE5A 3CJ7A 4KBOA 1GLLO 5BN9A 4CD3A 1HLUA 4B9QA 5AQHA 5AFUA 4BR9A 3MMVA 1XC3A 4BRQA 4GY2B 3D7EO 3VETA 2P9NB 3W0LA 3MCPA 3H1VX 1YXQA 3ZX3A 4K43A 4B1VA 2CH6A 5BN8A 4QS8A 3WEEA 3FFKB 2AP1A 2GEMA 3QICA 1BWFO 1G99A 1X3MA 4O5FA 2IVNA 3KHYA 3MK6A 2F9TA 4A2AA 2VCPA 4PL8A 2Q97A 3ZEUA 2QXLA 4J8FA 3ZX0A 3ZETA 3HSCA 3H46O 1GLDG 3WXIA 4CZLA 1P8ZA 4EHUA 3LM9A 3ENHA 3DWLA 1RDWX 2E1ZA 5AQOA 4MO5A 3A5LC 1QQNA 5I9EB 3CQYA 2D4WA 2OANA 4JAXA 5AQZA 2P9PA 4BR5A 2PBDA 3O5BA 4BG9A 3SMPA 1BU6O 1TUYA 4FOIA 3H3NO 5LJWA 4NO7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QQCA 1NGHA 1NLVA 4BRHA 2CGJA 4I6MA 3NAEA 3NF9A 2YHWA 4WQ5C 2OPRA 1NKEA 1GLCG 1R59O 3AAPA 1ASWA 4OKJA 2XHBA 1YVNA 4J2EA 3WXKA 1BIUA 4OO1J 5E84A 1O13A 3P39A 1VSEA 2X74A 1WBDA 3S3MA 2X6SA 1Y97A 3UIQA 1H1VA 5HRSA 1JCFA 1KTQA 4DS5A 3DLLL 1ZC6A 3MN7A 3TU5A 2P9LB 3I0RA 4JI0K 2KW4A 5CE3A 4CIFA 1S6QA 2X6NA 4I2PA 3OJUA 4Z4GA 1QE1A 5LL6Z 2OYQA 1HUXA 2GBZA 4ZTJA 1XI1A 1HYVA 3S41A 3TAQA 2HB5A 3LZJA 4ISGA 4DV6K 1MWKA 3EEQA 3ENOA 4BQZA 4X66K 4O55A 2H3GX 1XUPO 4BVPA 4CIGA 4KHSA 1ZBUA 3U6FA 4FLXA 1NU0A 2HW3A 2VYPA 4B1YB 3OA9A 2D0PA 2JLEA 5M1NA 1VQPN 1KSPA 3VA3A 5JLFA 2JGUA 4CJ4A 4FJHA 4IKFA 2ZM6K 3RSEB 4E72A 4YOXA 2O8DB 5AZJB 4QOZB 4RW8A 5EY4A 2O8CB 3EN9A 5GAHP 1HKCA 1HJRA 2A5XA 1BQMA 4CZFA 3VF2A 3SUQA 4M3RA 3TI0A 4NYFA 4BROA 3OW2M 4AHUA 4DFPA 4CF0A 4F8RA 4CERA 2ZGZA 4DR4K 3L3UA 3OS2A 1ZBFA 1NGCA 4E1NA 4KTWA 1WOQA 4XEIA 3VTIA 3ZSWA 4E7IA 3EL2A 1GLEG 4UY8O 1K8KB 3UKUA 5KPZA 2P5OA 1NJWA 3ZSOA 2PFUA 1RT1A 1K73O 3FZFA 2X78A 1HNZK 4CGHA 3TARA 2NRRA 3MX2A 4PL7A 1C0UA 4GNIA 4DQIA 1MA9B 4JI1K 3WXLA 4LFBK 1W9HA 3GDQA 3DLGA 4M41A 3C0BA 3T1AA 4CBXA 4DF8A 4BVOA 4BRAA 3MAQA 2YHYA 1VQ8N 2ASMA 2CGKA 3SV3A 2E20A 4EHTA 2VWJA 1NNEA 2Q2RA 3DXMA 3IG1A 4DF4A 4IJNA 2V7ZA 4AM7A 4H0XB 2OPSA 3NFAA 1KVBA 3KLFA 5J1EA 3MECA 2B6AA 3SUNA 2GUPA 4BR2A 4BE7B 5TKWA 4KV8A 3CCLN 1X1PA 4OLAA 4XH1A 2O8BB 4BREA 1F21A 3TTCA 1YVUA 4MDBA 4MLEA 1OH8A 3VQCA 3DAWA 3TTFA 5JVGL 1NK4A 4MFBA 4DG1A 3SQ2A 1CXUA 2HNDA 2QWNA 3O1WA 3L4IA 3FZMA 1KRPA 2UXCK 3PO4A 4DQ8A 3AVBA 5CHIA 2HHHK 3KKRA 5C42A 3HVRA 1QSYA 4HWIA 1RTIA 1U2VA 2Y1IA 1T3VA 2XY5A 4IO9L 3O6WA 2ITMA 2JWKA 3R8EA 2FSNA 1JCEA 4FJNA 1UA0A 1BA1A 1SAZA 5KQ8A 3QEIA 2ZJRL 5T7BA 2QKBA 5K14A 4JHDA 4B1UB 4UQGA 5M1PA 1KD1O 4FJ9A 5AQKA 1HKBA 4IO8A 1KVAA 3TWHA 1FJGK 3QEXA 1UAXA 3JXUA 3PSIA 3JYTA 3SZ2A 1SKWA 4H0YB 2A6AA 5BRFA 1X9MA 2YJEA 2HMPA 5F0XA 4WE1A 1QZ5A 3EE9A 3IS9A 3QNNA 1NOZA 1JKHA 2P9KA 5AR0A 3VQBA 5AQTA 3WNGA 4JKGB 1U4BA 4LD0A 3EYZA 1EWRA 4F2SA 4KI4A 1I3AA 3IFRA 4B9VA 1WAJA 3QINA 1U48A 2P9IB 3T19A 4B9TA 3K0SA 4CEQA 1KLMA 1HMVA 5AQQA 4DCHA 4AHTA 2IS3A 3LDNA 4CZJA 2NRHA 4QS7A 4JNEA 1Q86O 1OH7A 4FJJA 4H03B 1NK0A 4V19S 1YJWN 3QBWA 5AQWA 4A59A 5BPMA 5CYQA 4BGBA 4B9LA 1VRTA 1ITGA 3DYAA 3AVMA 2HHVA 4J2BA 1RT5A 1K9MO 3CQXA 4KH4A 3C6HA 4NB4A 2KZZA 1LW2A 2P9SA 1W7AA 3CETA 4Y1DA 2C1IA 3TAFA 3THXB 1S3XA 3RMDA 1S72N 2UXBK 4C8MA 4PKHA 5M1FA 3QIPA 1BUPA 1REVA 4AF1A 2Q0UA 3L8BA 1QTMA 2E2PA 2O8EB 4K41A 3OY9A 3CFPA 1Q8IA 3MXMA 1MU2A 1BCMA 2FC0A 1BI4A 3WT0A 3L2QA 4FK4A 1GLFO 4BDYA 4FJGA 4JYAK 3DRSA 2WUSA 2F8SA 3HM8A 4F3TA 1YAGA 1U47A 2NZTA 1Q9YA 4I6MB 5AQRA 4FPAA 5C2FA 2OPPA 1JJ2M 2QTDA 3H6EA 4F4KA 5M1KA 4PKGA 4N47A 3LWLA 1FKPA 3U3YA 1HNIA 4CJFA 4ZHRA 3AVLA 3C65A 1ZBIA 1XMQK 4M7YA 4ZTFA 2GWJA 2A41A 4WQ4A 4C8KA 1RBVA 2RPIA 4NCGA 1WUAA 4LF5K 5TKYA 3FGUA 3WUHA 3CJBA 3OYMA 1NGIA 3K59A 3J81O 1SKSA 2XRIA 5BREA 3LL3A 4B9SA 5HP1A 3CHWA 4CGDA 1EWQA 2WBNA 2HF3A 3K2PA 5BN9A 1SKRA 1JLAA 2ZJQL 4M3WA 4BR9A 3M8SA 2NRXA 1C0MA 2YNFA 3P31A 1YTAA 1XC3A 3NVMA 3C95A 5FLXO 2EX3A 4O0JA 3VETA 3OS1A 1YXQA 1Z25A 3BZKA 4E7HA 2OTJN 1XNRK 3LAKA 3QLHA 1VQ5N 5I3UA 4QS8A 5GADP 3WEEA 3THYA 1L5UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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