3BW2 | Genus

Total Genus 123

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	123
sequence length	350
structure length	347
Chain Sequence	SALTDLFPLPIVQAPMAGGVSVPQLAAAVCEAGGLGFLAAGYKTADGMYQEIKRLRGLTGRPFGVNVFMPQPELGAVEVYAHQLAGEAAWYETELGDPDGGRDDGYDAKLAVLLDDPVPVVSFHFGVPDREVIARLRRAGTLTLVTATTPEEARAVEAAGADAVIAQGVEAGGHQGTHRDSSEDDGAGIGLLSLLAQVREAVDIPVVAAGGIMRGGQIAAVLAAGADAAQLGTAFLATDESGAPGPHKRALTDPLFARTRLTRAFTGRPARSLVNRFLREHGPYAPAAYPDVHHLTSPLRKAAAKAGDAQGMALWAGQGHRMARELPAGRLVEVLAAELAEARTALS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Streptomyces ansochromogenes
publication title	Crystal structure and site-directed mutagenesis of a nitroalkane oxidase from Streptomyces ansochromogenes pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-nitropropane dioxygenase
total genus	123
structure length	347
sequence length	350
ec nomenclature	ec 1.7.3.1: Nitroalkane oxidase.
pdb deposition date	2008-01-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03060	NMO	Nitronate monooxygenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bw2A00

1DQXA 3W86A 4QITA 1EB3A 3GZ3A 1L6WA 1XBZA 3W2NA 3U2OA 1JUKA 4POCA 4Z0JA 3W7GA 4RCXA 3M7WA 4R34A 1SO3A 4UTKA 4ZZ9A 4MFEA 4Y90A 3DFTA 4TMCA 3FFSA 1TTJA 2BTMA 4JDBA 3W23A 1GPWA 3M43A 1T0OA 2GPTA 3W7PA 3MHUA 3PR2A 3ABSA 3QM3A 4RZ4A 1M7PA 3I68A 5G1TA 1DOSA 2J24A 2GVLA 3W7LA 3NL5A 3INPA 3ZR4A 3DFQA 4OU1A 3TQKA 4OQVA 5C6MA 5J5DA 2YX0A 4IOTA 4EF8A 4ZQNA 5FEXA 3NNTA 3LM7A 5CPNA 1RQHA 1JCMP 3GKFA 3W9ZA 3EWXA 3R5EA 3W2MA 1QOQA 3DH7A 1B3OA 2RDWA 1SZFA 2EHHA 3LRKA 4YMZA 1UUOA 1ICSA 4ORIA 3JR2A 3M5XA 2NLIA 1N8FA 2PRMA 1QAPA 3TSMA 1QDSA 1R2RA 3S6DA 3G8EA 1FBAA 4Z0SA 1WX0A 1IXNA 5AHNA 3R2GA 1KFEA 3NQ2A 3HGRA 3RMJA 3NQMA 4QSHA 3UWYA 4CNPA 5G5IA 2ZCGA 3JS3A 1XCFA 1ME7A 2VELA 3W1AA 1CW2A 2E6AA 3THQA 2Y89A 3PAJA 2TSYA 3KFTA 3WJYA 3UYCA 1O60A 1ZY9A 4GFSA 2GQ8A 4ZQMA 5HQEA 4NVTA 3W2JA 1OYCA 3UWWA 1H60A 3F1QA 1Q45A 4PA8A 4GXMA 4JGDA 5EYWA 3H55A 2WSYA 3QRHA 3PUEA 1FWRA 1UJPA 4LW7A 1R2SA 3SGZA 2YYUA 4PCFA 3HMJG 2ZDRA 2V81A 1OYAA 4N2YA 5LNWA 3ABQA 5AYZA 1W5PA 2OJPA 5D33A 3NR0A 1D9EA 1N7KA 3EEGA 4OHQA 2Y7DA 2QF7A 3EKLA 3BVJA 1B57A 2D73A 4NJIA 3MJYA 4RK8A 3QPZA 2E1DA 3LHZA 5AYYA 1LYXA 1H50A 1VHNA 2G96A 3PG8A 3B4UA 2V82A 3SIZA 1W5MA 2JKEA 3LBCA 1PL9A 5DLCA 3JRKA 1A53A 4O19A 2I14A 3B8DA 1FDJA 4H6KA 1JR1A 4NJKA 2Y70A 3R13A 3IEBA 1M6JA 1KM4A 4ORMA 2GVJA 3LHYA 5K9CA 2NUYA 2CZEA 5LKYA 1J5TA 3IGXA 1JQXA 4QISA 4Z08A 3W7IA 3BLFA 4DELA 3PUOA 1G4SA 3P8JA 4N9DA 2RDTA 4L4LA 2WSQA 1Q6OA 1I2NA 3NQCA 4TR9A 3S5ZA 3SY5A 4UMBA 3YPIA 2GJLA 4GC4A 2J9XA 4MJZA 1FXPA 2ZZ2A 4MYXA 3KVMA 4DQWA 4JDYA 3Q2DA 3PBUA 5BMXA 5EL1A 1FWNA 1KM2A 3UY7A 5FESA 3CB8A 5TBOA 4PC8A 2FLIA 5EKYA 4TO8A 3Q58A 4O0KA 2Z0IA 5K4ZA 2E09A 3UD6A 4K37A 3FA5A 4BR1A 3OEXA 2ISVA 2CLOA 1GVSA 2WNZA 4H3DA 2GQAA 4N6FA 4JEQA 5G2IA 4A2RA 4AWTA 5LNVA 2PRLA 3S5YA 1QPOA 1TJRA 2P10A 5HINA 3O15A 2FJKA 4YWIA 1H7PA 2C19A 2E77A 4MY8A 4UIOA 4N6EA 4M7TA 4AHOA 2YFNA 3N73A 2X16A 1EWDA 5FF4A 3MW7A 1AW2A 4Z1DA 1RV8A 2GOUA 1OG0A 3QYQA 2G5WA 5F4WA 3W71A 3MHGA 4HN4A 2Z6JA 3QPYA 1LBLA 2JKPA 3PBWA 1K8ZA 1TRDA 1VLWA 1EP2A 4UNLA 2NV1A 3NL2A 5AC6A 4O1BA 5E0KA 3HO8A 1EUAA 1T8XA 3THAA 1XI3A 3W85A 3ABRA 1SU5A 5CPOA 3SSJA 4FIQA 4TMBA 1OFPA 3WJSA 3LRMA 3TU9A 1NAL1 3TUUA 4FX7A 5F2MA 6ALDA 5C54A 5LHEA 2OX1A 1VGAA 1G6CA 1JVNA 4UC5A 3DI0A 3TA6A 1YXDA 1ML1A 3E96A 2Z2UA 4DBEA 4XTIA 1LROA 1GZGA 3C2VA 2E6DA 3W75A 3NQGA 4OV4A 1OK4A 4Y6GA 4RR4A 3W1LA 3W84A 5I3GA 1QPNA 4DF0A 2Q8ZA 1OFOA 3PWAA 1A5SA 3LHWA 3SFKA 3TXVA 5C2XA 3GR7A 2OCZA 4Q32A 4O28A 3ZS4A 4K7VA 1KFLA 3RFAA 2WKJA 3P82A 1UASA 1WOBA 2V5LA 1FY6A 3SECA 1OFAA 2B7NA 3MWAA 3MI2A 4JTJA 3BG9A 4NJJA 5DY2A 1I8JA 4BI6A 3PVFA 4QM1A 3EXRA 4HPJA 1OJXA 3LV6A 4IMCA 4GNJA 4QQ3A 1VYSX 4JX6A 1S5TA 2QJHA 1K3UA 3WJZA 3P74A 4MLRA 5CSSA 3M1ZA 3FJLA 4KFNA 4GUJA 1MEWA 3BLIA 1H7RA 4DPPA 5U7SA 4JN6A 4X2RA 3O1NA 2QKFA 4FF7A 3TK7A 1B4KA 3A22A 3RLUA 3W1PA 3L5AA 3UQNA 1QO2A 4GE8A 2CZDA 4GRSA 1UCWA 4UTTC 3MMTA 1YTEA 3CT7A 3LI0A 2A0NA 2C16A 5EPDA 2QAFA 2ZZ7A 3CWNA 3O06A 2A4AA 1ZAHA 2ZA1A 5AN7A 2VFGA 4JX5A 4CQ8A 2VFEA 2ZRYA 1L2UA 5EY5A 1BTMA 4LUIA 2QUVA 4G1KA 3G1AA 3IV3A 3NQEA 2PE4A 3L0KA 5FF7A 3C2EA 1Z41A 1SSDA 3LOTA 1H5YA 3L9CA 3L68A 1PCKA 2DZPA 1X6UA 3DFPA 3W7NA 2RH9A 2DZUA 2ZQ0A 4MKNA 3NVTA 3LBMA 4E2BA 5KZEA 5CZ0A 3RF9A 4BK9A 4AMAA 4GUGA 4IMFA 1MZHA 1AW1A 4NXSA 3Q94A 3NQFA 1GTEA 5AHLA 3DXIA 2WNNA 1TMHA 5EBUA 2CU0A 4O14A 4ZVJA 3M44A 1IIGA 2CLHA 4HNVA 4FX8A 4K8EA 2BZNA 4UFKA 1K03A 2E5BA 3NZRA 3OHIA 3TSDA 4C1LA 2E5DA 2B7QA 4A22A 4I9AA 4O12A 1IF2A 1XKYA 4UFMA 2ZTJA 1IXOA 3EX6A 1Z44A 3QFEA 4NZFA 1DV7A 3PY2A 4PH6A 4ZQPA 3T4CA 3H54A 1D3GA 4PFMA 1O95A 3BW4A 3L21A 3W1TA 4DO5A 1XUZA 2IQTA 5KTLA 5DCBA 4A21A 4NXKA 4R53A 3TH6A 1P4CA 2HTMA 3LXAA 5CPMA 1I2OA 1W5NA 4UCGA 4S2CA 1DL3A 2FPVA 4UTMA 2TYSA 2RKXA 3UNDA 4M7SA 3W1UA 1UUMA 3CWOX 3NPUA 1FCQA 1W31A 3KOFA 4JTEA 5CZJA 5HWNA 3NPWA 3EX4A 1JJKA 1KM5A 2CLKA 2ZZ3A 1FWSA 2YZRA 3GKAA 3PS7A 3BG3A 4O1CA 4WX2A 1H51A 3LV5A 2ZRXA 3NXFA 4S2BA 3DFSA 3MP3A 4IX2A 5CG7A 2DZXA 2HSAA 2ZA3A 5D2VA 4OBTA 5G4EA 1QFEA 3HGSA 2W79A 4WY0A 3FS2A 4AB4A 1WBHA 4MZ8A 1IXPA 3GB6A 1ICPA 5G2HA 4QAIA 4N02A 4LV4A 3W70A 2TPSA 1AL8A 2GUUA 2J9ZA 3EXTA 1LOQA 3O05A 2I1OA 4E0CA 3C56A 1DQWA 1F2JA 1T99A 3W74A 5HNRA 2P1FA 1PHWA 1WYIA 1P0NA 3PM6A 4HKPA 1PIIA 3IIPA 3NOEA 3TW6A 2VOMA 3DU0A 2X30A 3WFAA 4LVDA 3TJLA 2H90A 1EUNA 3UWUA 1ALDA 2ZTKA 1YXCA 4QJ1A 1LOLA 1JULA 5D2TA 5DXXA 3QEZA 1V5XA 1VLIA 5AHFA 1XM3A 1FWTA 4UNKA 3DI1A 4IMEA 4AAJA 1AK5A 2CLIA 3BW3A 5DBTA 1T96A 3FOKA 3G1SA 3QSRA 5AYXA 2QUTA 4UMAA 4XUGA 1GVRA 1WDWA 1YLVA 1TV5A 5HR6A 4DF2A 2OT1A 3GNDA 2ZRZA 2X1TA 4O11A 5D30A 3S8HA 1O4UA 1KW1A 3GNNA 4JTKA 3MYPA 3Q37A 3EWUA 4FIRA 5F4XA 4UTJA 5HULA 4UR8A 5BRBA 1G7UA 1K8XA 1NF7A 4GUIA 4FNPA 4IPJA 1VJIA 1SW3A 3BGGA 3W73A 3DFOA 3CIWA 3W2KA 4OV9A 3T7VA 3MUXA 2PURA 1KBJA 4MJMA 4LWWA 3U6WA 2YPIA 3NEVA 2UV8G 1E51A 3B0PA 2FTPA 3S9YA 4IGHA 4I7WA 2Y6ZA 5TIMA 1W56A 4KFPA 1XBVA 3P7YA 2C6QA 2GQ9A 1SO6A 1CI1A 1RPXA 2PCQA 1DKWA 1C9DA 2G97A 4KKXA 2WOQA 1YTDA 3GK0A 1LBFA 3A9IA 3S1UA 1Q6QA 4LVFA 1VYRA 5KZDA 1KBIA 1KM1A 3QMTA 2VEIA 5K7JA 4MYAA 1D3HA 2XFWA 3UY8A 1W37A 4U28A 1EPXA 2XN2A 4LRTA 5H2ZA 2CLEA 3EWBX 5KITA 2OMAA 2WJZA 2QCHA 4PODA 4WD0A 1TQXA 3C6CA 1F76A 3GIYA 1TPC1 3CEUA 3V1PA 2ZFAA 4MLJA 1ZENA 2I9EA 3GDKA 3W22A 4J9JA 5K9XA 1QMLA 1TRIA 2HS6A 2ZZ6A 1UBSA 1Q6LA 1PVNA 2QJGA 2B0MA 1FCUA 4ADUA 5KINA 2JBMA 3DAQA 4MOZA 4ZL1A 1YADA 3N9SA 3O8AA 3LLFA 2H8XA 3GLCA 1W3NA 3LHTA 1G69A 1LP6A 4FNSA 3L2IA 4IX0A 5D32A 1W5QA 1PCWA 3TXZA 5HWMA 1I2PA 2H6RA 3P80A 1A5BA 1FCVA 3KVLA 2QJIA 3USBA 5I3KA 3P81A 2Z6IA 3VNDA 3QF0A 1FCBA 3UXDA 2Q3RA 5L6UA 2AGKA 3IIVA 1SO5A 2BX7A 1H62A 3TE9A 3W7HA 1QCWA 3FLUA 2LLEA 3W76A 3O63A 3R8RA 1ZHAA 3I65A 6TIMA 3GAKA 1L9WA 1OFEA 3CLMA 3G0SA 3GR8A 3O16A 5CGQA 3S1XA 4UFIA 4NNAA 3H53A 1VCVA 3KX6A 3BARA 3EB2A 5D05A 1SFJA 2XN1A 2RDUA 5D38A 3B06A 1OFDA 3NQ8A 1M7OA 1O5XA 2CZ5A 3MO7A 5LGXA 3HIJA 2YW4A 4AWSA 1RQBA 1DHPA 4XKYB 2Y7GA 3UXAA 2B7OA 1TTQA 3HPXA 3LHUA 1VCFA 4K38A 3IRDA 4RZ5A 3G24A 7TIMA 1QPRA 2JK2A 3HB9A 1OFRA 1OF6A 1KTCA 2PRHA 4JTSA 4CQ9A 4CNNA 4O13A 5K4XA 4UR7A 1WAUA 4Y9AA 3TCEA 4OT7A 2ZZ4A 2A6NA 2DZVA 1W8SA 4HNTA 4P2VA 1KTNA 3TC6A 3U8GA 3A21A 1TPVA 4KWWA 3EX3A 3N3MA 2Y7EA 3TKFA 3QQ0A 4E2DA 2V2CA 2YDAA 3GVGA 2AQWA 4PTNA 2DU2A 3NM3A 2E6FA 1G4TA 5AB3A 1SSGA 4C1KA 4X9SA 5GVJA 4A2SA 2ZRWA 3M9YA 1G4EA 5KSWA 4FNUA 1ME8A 3GDTA 4X3ZA 1QPQA 1W54A 5D37A 4O18A 3G22A 3ANYA 3OVPA 4LVBA 1F7BA 2BSLA 2X2GA 1XXXA 1OX5A 3HJZA 3LX9A 2A85A 5L9FA 4R7JA 2Y62A 4S1FA 3G18A 1FXQA 4JYFA 4IXHA 1TPEA 3LXBA 4QNWA 3SGUA 4UTLA 3GXPA 4BWLC 3E9AA 3MP5A 1VYPX 4NZJA 2ATSA 1MSSA 4NT0A 4IWWA 4NJGA 1F6PA 1GVQA 4IMGA 1LTDA 4JNMA 1OHLA 3VI2A 1DBTA 4FEZA 2EAWA 3EWWA 1LRTA 1PHQA 1WBJA 2R8WA 4JTHA 2RHGA 4UTHA 1EIXA 2VKZG 3FIGA 4LVAA 4M6QA 4P61A 1VR6A 2ZBTA 2W6RA 3LCGA 1FWWA 3LGEA 1GOXA 3I7SA 4N4PA 1OX4B 2H3BA 1R2TA 1H1ZA 1GEQA 1Z42A 4CCDA 2QUUA 3KRSA 3AO0A 3TROA 1PS9A 1YXYA 3WJXA 4ALDA 2WPBA 1G4PA 2TRSA 2QCLA 2VEPA 2OT0A 4TU1A 3BG5A 4WUIA 1P0KA 4JIQA 3QW3A 4MFDA 5I3IA 5K9DA 4UTUA 1V7YA 3O6DA 5HMSA 1LLZA 5HUOA 2W0UA 4CLMA 1WXJA 4LUJA 4BFAA 3IIOA 4EVZA 3BW2A 3P5ZA 4DPQA 1LCOA 1YPIA 3NGJA 1EP1A 1H7XA 2QCDB 3QH2A 4AEOA 1JCLA 2QCNA 4QNEA 5CKSA 3M47A 3STGA 1XDLA 3W1RA 1KFJA 3DGRA 3M5ZA 3W1MA 2G95A 1B9BA 1SR9A 1TPDA 2A7PA 2NV2A 1OF8A 3SR7A 3OA3A 1I4NA 3NQ7A 4O4VA 4O57A 1YPFA 4LTSA 3W2UA 3W87A 5IBXA 2J27A 4BI7A 2CW6A 1A5AA 3BV4A 3LTSA 5MHBA 3E02A 4CNOA 1H7OA 4W9TA 4Z1CA 4MUZA 5G1YA 1TV7A 4L4MA 4E38A 1H61A 3HF3A 3TR2A 4RJEA 5DCEA 2C0AA 1VCGA 2VENA 4IMDA 5F2LA 3IIZA 3W88A 3NDOA 2NUWA 3B0VC 4JS3A 3RK8A 3DKJA 4BI5A 1H7NA 2BWGA 4O17A 3EWYA 3C8FA 3TV8A 5BOOA 3WK2A 1VHCA 3W2LA 5K3VA 3TQVA 3DHDA 3HG5A 3NQAA 2HS8A 1P5BA 1J4EA 3LCWA 3NQVA 2XN0A 3M41A 3A5VA 4XWUA 3GX9A 1SO4A 1S3HA 1LOSA 4MPQA 3B05A 1I2QA 2QEZA 1K7EA 2VFDA 5DXYA 4EOUA 3B03A 1H1YA 5G2WA 1SZEA 1CX9A 1DJQA 3C4UA 4HT3A 2YSWA 3UZJA 1SQ7A 1L6SA 1GVOA 3MHFA 1HO1A 3LCHA 4ZQRA 3HQ1A 4TX9A 3I7RA 3KAOA 3GDMA 5ABTA 1GT8A 1GG1A 1Y0EA 3C3NA 4WXYA 1KLYA 4M6PA 5EA9A 1BKSA 3LTYA 4JD4A 3UZ5A 3C2FA 1TQJA 2ZA2A 5HUPA 2Y63A 3C0JA 1IGSA 5I3FA 3N2XA 1RZMA 4YL2A 3P61A 4Y8FA 4I7VA 5A5WA 3W7DA 3SJ3A 5FEZA 4GJ1A 3CQ0A 2KZHA 2NX9A 1SW7A 4RZ6A 3LXCA 1KA9F 3C52A 1HUVA 1ADOA 1LLWA 2A7NA 2FDSA 3G3MA 5C5YA 3KVKA 3L5LA 1FUYA 4FX6M 4WXZA 1ZCOA 2FQIA 1HO4A 2CLMA 3E12A 4KFOA 2NXHA 3BGJA 3S5NA 4JXCA 1TREA 5FF2A 3BO9A 3KHJA 3S1VA 3TQ0A 4JICA 2FIQA 3L66A 4JTFA 1A5CA 2H3DA 2VEMA 4ADTA 4Q4KA 3S42A 3CIXA 2C15A 3C2OA 1W3IA 4HPXA 5BW6A 3NG3A 3NA8A 1AG1O 1QOPA 3TFXA 2CWNA 5AC8A 4EWND 2Y85A 4WOZA 1GG0A 1EX5A 5TQLA 4IPIA 1OK6A 3QMRA 3N34A 2ZYFA 4UFLA 2F84A 3G1FA 1JCJA 3TMLA 4JYEA 4O1DA 2CLLA 3P8IA 2RFGA 3BLEA 3UWVA 4NNCA 3BPWA 1X1OA 3NL3A 4H4IA 3F4NA 4JIPA 4YCOA 1K02A 3PUDA 1LORA 3N14A 2E6YA 3W1QA 2PC4A 4DO4A 3ATYA 3IVSA 3SW6A 2ZRUA 2YCEA 3LERA 5CPLA 1R30A 2Y7FA 4O50A 3P60A 1NEYA 4BF9A 3QQ1A 4UUIA 1NF0A 3ABOA 4LOCA 4DEFA 4LRSA 3M0ZA 1O5KA 2VXNA 1HTIA 2ABBA 4UMCA 4JTLA 3PSWA 3LCFA 3M6YA 4Q33A 2V2HA 4DXVA 2QCMA 3ZWTA 2R14A 1X1ZA 3HOJA 4R33A 1C8VA 3W7OA 3G1YA 1BWKA 2B7PA 1R46A 1JQVA 4FNRA 3L67A 5F4SA 3FYPA 1R47A 1I45A 5LNSA 4LT9A 1JCXA 1FDYA 3M5VA 3CHVA 1M5WA 1NSJA 4UTWA 3O07A 1TTPA 3R12A 4NQ1A 4ADSA 3NQDA 3QMSA 1VRDA 4AVFA 4AHQA 3OIXA 2WO5A 1KFCA 2YGYA 1K7FA 1YYAA 5KMYA 2NX3A 1KFBA 4D2JA 4HSOA 3QC3A 1TB3A 2A2IA 2TMDA 3LRLA 3TAKA 4PL2A 4RKAA 2NX1A 2DORA 2A21A 3W7KA 4O54A 3TW7A 3FJ6A 3LCIA 4PEKA 4LVGA 4CQAA 2Q8LA 4LC8A 3CPRA 1EA0A 3OBKA 1KLZA 4K7YA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3BW2A

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