3C2EA

Crystal structure at 1.9a of the apo quinolinate phosphoribosyl transferase (bna6) from saccharomyces cerevisiae
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
294
structure length
267
Chain Sequence
PVYEHLLPVNGAWRQDVTNWLSEDVPSFDFGGYVVGSDLKEANLYCKQDGMLCGVPFAQEVFNQCELQVEWLFKEGSFLEPSKNDSGKIVVAKITGPAKNILLAERTALNILSRSSGIATASHKIISLARSTGYKGTIAGTRKTTPGLRRLEKYSMLVGGCDTHRYDLSSMVMLKDNHIWATGSITNAVKNARAVCGFAVKIEVECLSEDEATEAIEAGADVIMLDNHFLLECSGGLNLLCDDIDIYSTSSIHQGTPVIDFSLKLAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Comprehensive X-ray Structural Studies of the Quinolinate Phosphoribosyl Transferase (BNA6) from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
total genus 84
structure length 267
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2008-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3c2eA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3c2eA01
3GXNA 1MZHA 2B7OA 3S8HA 2QR6A 5CGQA 1XBVA 3IVSA 1O5KA 1MSSA 2GVJA 4LWWA 3N3MA 1LTDA 3EWWA 2XN1A 4UR8A 4R53A 3FJLA 3S5YA 4UUIA 1LM1A 3B8DA 4M5PA 3HGOA 5CPLA 5CPMA 4N9CA 4UMCA 4I7WA 4AH7A 3F4WA 6ALDA 1TPFA 3UWVA 2QCNA 2R91A 2CLEA 3DH7A 6TIMA 4XTDA 3NR0A 3B05A 4WY0F 3LX9A 1TB3A 4EWND 5BRBA 4GC4A 3NQ6A 2A6NA 1KBIA 3M5YA 1DBTA 3W7OA 1KFKA 3TJLA 3WJWA 2J9XA 4UNLA 1AW2A 4WX2A 1H63A 4K8EA 3TU9A 1TPVA 3NOEA 1IXNA 2VC6A 2VEIA 3HGRA 3EX6A 1KM5A 4FX8A 1ZENA 3NVTA 3BLEA 1VHNA 1L2UA 4POCA 4XWUA 3MO7A 1GEQA 4C1LA 3WK0A 4KWWA 3ATZA 3SI9A 5F4SA 4I7VA 4PA8A 4RR4A 4AWUA 1F76A 4DPQA 4NVTA 4X9SA 2Y7FA 1KM3A 3G1VA 1PE1A 2RDUA 4UTKA 1Z42A 2A7NA 3NPXA 3TQ0A 1U83A 1OFOA 3TW7A 1ZCOA 1SO4A 1YDVA 3PF3A 2XN2A 3UWYA 3PBUA 3DAQA 4IMFA 5KSWA 4UTMA 4PH6A 1SPQA 1QPNA 1FXPA 3DI0A 4HN4A 3LHWA 2LLEA 5LNRA 2JKAA 3L66A 4Z1AA 2WPBA 1K8YA 1THFD 3WFAA 3SSJA 2F7FA 4QNWA 3RK8A 4PCFA 3LCWA 5AHEA 2CLIA 1N7KA 3HO8A 5H91A 1GQNA 4JDBA 2J9ZA 3W1RA 1U5JA 3NZRA 3BV4A 3VE7A 3GDRA 3QFEA 4ZZ9A 4MVAA 4WOQA 3E9AA 1TPH1 1QOPA 1KM0A 3G3MA 2C1HA 1I4NA 4Y96A 1XKYA 1D3HA 3DHFA 4BI6A 1F73A 2EGZA 3HG5A 3PS7A 5CZSA 2ZRXA 2GVGA 4Q4KA 3EXTA 4Q33A 3H53A 3UWUA 5DN1A 2X1SA 1F7BA 3ABRA 4MY1A 2NXIA 2QUTA 1W1ZA 1RD5A 1C9DA 3BW2A 4IMCA 5E0KA 3W6YA 1X1ZA 1SUXA 3GB6A 4PODA 3R8RA 1H61A 4NNAA 1Z41A 2QCFA 4ICNA 4RK8A 3BVJA 1W3TA 4ZQNA 4MFDA 3MWAA 4NU7A 3C8FA 1WAUA 4Y90A 4LS2A 2Y6ZA 2ZFAA 1YTEA 5EKYA 2Y89A 5HR6A 4NZJA 3E12A 4MZYA 1S5VA 3ATYA 1DL3A 3G1FA 2TYSA 3G1XA 2QF7A 2ZRYA 2ZA3A 4TR9A 1UUMA 2GQ9A 1OFQA 1R30A 5C5YA 4CNNA 3WK1A 4PEKA 2P10A 1BEUA 2Q3OA 5CZJA 4W9TA 1TJRA 5CKSA 2CLOA 3P5YA 3GR8A 5LSMA 2FPTA 5AC6A 3QPYA 5TIMA 2QKFA 5BNKA 4O11A 4DPPA 3QSTA 3DENA 4O16A 5EA9A 1G4SA 1OX4A 2YSWA 2H3DA 1PL9A 2BSLA 3BARA 4AWSA 2BTMA 3U6WA 3GDKA 1LRQA 4M6VA 1KA9F 5J5RA 3MI2A 1GOXA 2DZVA 1WQ5A 1TSIA 2RH9A 1BWKA 1GTEA 5A8GA 1SFJA 4O18A 4OV9A 1LBLA 1MO0A 4RV8A 2Q8LA 1QR7A 2O7QA 1N8FA 4WY0A 1SQ7A 3BPWA 1Z44A 4O4VA 3UZ5A 3VNDA 2W79A 3QPZA 4JIQA 2QCDA 2HSAA 3YPIA 1KLZA 3W1TA 4LNYA 2GQAA 1JULA 4CNPA 2OCZA 1PS9A 3B0UX 4JN6A 3G0XA 3I6RA 1K03A 3L0NA 2ZZ5A 1OX6A 3EX3A 3UY7A 3UXDA 2Y85A 3JR2A 1LCOA 4KFPA 4MJMA 3KVJA 3THAA 2ALDA 2ZBTA 1FCVA 4OE7A 2Y88A 4L4MA 4LS1A 1XDMA 4QNEA 4HKPA 4YL2A 2TRSA 1FBAA 1BTMA 3FS2A 1KTBA 3S5ZA 2E68A 2W0UA 3SR7A 3O6CA 4JX5A 1ZFJA 2GOUA 2ZZ3A 1ML1A 3N34A 5F2MA 1L6YA 1E51A 4NNCA 4RXGA 2NX3A 3QQ1A 1OHLA 2FFCA 4HNVA 1J4EA 2DZPA 1L6WA 3G1AA 2QDHA 3G8RA 3WJXA 4O12A 2HMCA 3R12A 1AK5A 3SGZA 3GNNA 4M6PA 5CG7A 1R47A 3P82A 4CLMA 4IOTA 2A2IA 1OVDA 3D0CA 4HPJA 4CQ9A 4RJEA 5GVJA 2YX0A 2X1UA 2WO5A 3DFOA 1H62A 5HWMA 4UIOA 2WNQA 4UTLA 3L5LA 4X3ZA 1QPRA 4LVBA 2D73A 2W6RA 5LZLA 3NQCA 1LLZA 4IMEA 3T44A 3OG3A 2TSYA 4P2VA 5AYZA 3TCEA 1TREA 4WJEA 4JTEA 4JTLA 1LDCA 1M7PA 1SW3A 3PBVA 4AHOA 1VLIA 3ZWSA 3NM3A 1KFBA 2B7NA 3LRKA 3M5XA 1TQXA 5ABTA 4OHQA 4MLJA 4FB7A 1PCKA 1O60A 1GYNA 3TNOA 1H50A 2Y63A 3EEGA 3CEPA 3A24A 2CZDA 4EF8A 5FESA 5BMXA 4KWVA 3UY8A 1ZY9A 5U4NA 3GK0A 3FFSA 3L9CA 3W83A 2CLFA 1YTDA 2ZA1A 3HPZA 2C18A 4O1AA 1ZHAA 1O4UA 1P0NA 1G6CA 4HSOA 3W86A 1AL8A 1DV7A 3W1MA 1WOBA 2FQIA 2WNNA 5FF3A 2Y61A 1XL9A 3M43A 4HSNA 1O95A 2NWRA 4OGZA 4K39A 3L68A 4RZ4A 4GFSA 4I7UA 8TIMA 3N2MA 3C56A 3C2EA 3TROA 1DJNA 4UFKA 2NUWA 1XFBA 4JTUA 1WXJA 1GVSA 2WKJA 3O6YX 1OFAA 3U2OA 3W7EA 4O1DA 1M5WA 2QCEA 4LU0A 3GR7A 2J88A 3MP5A 3NQ7A 2YFOA 5F2GA 1P4CA 3EXSA 2NUYA 3EWZA 3L5AA 2V5BA 1TTQA 1IXQA 3NQ2A 1LRNA 3W7RA 2FB2A 4OT7A 4TO8A 2ZA2A 5HNRA 5DBTA 5AYXA 5IBXA 5IBXC 3T4CA 3S42A 4EF9A 5CPOA 1VH7A 1OFPA 1B4KA 3N9SA 3KHJA 5FF7A 1FUYA 3IGUA 2Z6IA 4EIVA 4IMDA 3M41A 4E0CA 2GJNA 1Q3NA 4Y6GA 5EL1A 3HBLA 1ZAIA 5K9CA 1C8VA 1XXXA 1VCVA 1YXCA 1EX5A 3FKKA 3KVLA 1VJIA 3Q94A 4Z1DA 4KFNA 3GDMA 4PC8A 3STCA 4ORIA 1LP6A 1VPXA 3R5EA 3GIYA 1WBHA 1W8SA 3P60A 1SFLA 2YYUA 3S1UA 4QISA 4N4PA 4LUIA 3PY2A 4Q32A 1EP3A 3V75A 3W2KA 1VQTA 5LHEA 1KTCA 2V2HA 4GUIA 4UFLA 4CCEA 3NXFA 2GPTA 2J24A 2PE4A 5KZEA 1JCNA 3N14A 3DI1A 3THQA 4UTTA 4UTTC 1ME9A 4BI5A 4ADTA 1FWWA 2CLMA 4NZFA 5HWNA 1W37A 3WK2A 5CSSA 1A5BA 4UCGA 3UQNA 1YXYA 1GVQA 1QNVA 3BO9A 3JS3A 1QCWA 3M0ZA 3MI6A 5FF2A 2NWSA 4N2YA 2V8ZA 2HTMA 3USBA 1I2NA 5G5IA 3UD6A 3MMTA 1ZAHA 3BGGA 5AB3A 3GNDA 1KFJA 3I7QA 4IUOA 2DORA 1F6PA 1GVRA 4JTFA 3GXPA 1OFBA 3STEA 3DBPA 4DQWA 4Z1CA 2B7QA 5F1VA 4XUGA 2E6YA 1OFRA 3IGSA 2ZZ1A 1ZJIA 3CPRA 3A9IA 3ABOA 3DZ1A 3F03K 3T40A 1XUZA 1SZNA 1VRDA 2I14A 1NVMA 3EWXA 2O7SA 1QFEA 3CEUA 2QCLA 3OVQA 4IJBA 1EB3A 4JIPA 4Z1BA 4XKYB 5IM51 2X1TA 3GKFA 3BK0A 2RDTA 4QITA 3DKLA 5KTLA 3MYPA 2X1RA 1EP1A 1GG0A 3G1YA 5I3JA 2QUUA 1KV8A 3P8JA 2X30A 1GG1A 1RQHA 3PR2A 3HIJA 2BX7A 1YPIA 3GYEA 4LUJA 1W5OA 4LRSA 3TW6A 3LTSA 2QDGA 5F4WA 2DJLA 2P0OA 2QCGA 2WSQA 4J9JA 1ME7A 1Q6RA 1JUEA 3WJZA 3W22A 4TMBA 4RXFA 4NJJA 3H54A 4WXZA 1PHQA 4NX5A 1EIXA 3PUOA 4MLRA 3WJSA 3LRMA 3PM6A 1TJPA 2ATSA 3M6YA 3G22A 4GUHA 4U28A 1K7XA 4RKAA 3GLCA 3P8IA 1GPWA 3B0VC 3INPA 4KKXA 1NF7A 4FNPA 1TTJA 1YXDA 4O19A 4O50A 1D9EA 4M7SA 1F05A 1XUUA 4MYXA 4M19A 1OK4A 4JTTA 2V5LA 3CB8A 5HR7A 1XBXA 4DO4A 5I3IA 4CNOA 3W1LA 1MEIA 2DZTA 4AWTA 3P62A 1F74A 5KZDA 4WOZA 4PL1A 1FQ0A 1HG3A 3PG9A 4MKNA 5T26A 2QJHA 5I3HA 5AC8A 3QMSA 4AHPA 1I2RA 1TRDA 1GJPA 2OMAA 3GKAA 4QSHA 3L0GA 4P61A 5I3KA 2NUXA 3LTYA 4LVDA 4PL2A 5KMYA 3MI3A 3LLDA 4LTSA 5LKYA 4WXYA 1SW0A 1NSJA 4N6FA 1A5CA 3CWOX 1LBFA 1EWDA 2ABAA 3B0PA 1OF8A 2AAMA 4FX7A 4LVFA 3K30A 3CLMA 3P84A 1SO6A 1M7OA 2BWGA 5F4XA 1X6UA 3ABSA 3EWYA 4O15A 4S2CA 1OYCA 1K02A 3W7PA 3O63A 3R89A 2B4GA 4QAIA 1IGSA 3W85A 3KX6A 2R8WA 2GQ8A 4HNNA 1ADOA 1GVOA 2H8XA 2I1OA 4UTWA 4DF1A 4UTWC 5K4XA 3Q37A 2RHGA 2XFWA 3SY5A 4BWLA 5HUPA 4BWLC 4K36A 4AVFA 1J2WA 1JCYA 3KAOA 5K3VA 3MJYA 1QMLA 1GYLA 4AXKA 5LNUA 3HG3A 3LHZA 4LT9A 3BG3A 3NQAA 1EUNA 4WD0A 2Z0IA 4BF9A 4FHAA 2WSRA 3LHTA 1LYXA 3GAYA 4AAJA 5FI8A 3TIMA 1ME8A 2FJKA 3W84A 2VXNA 2YYTA 1RZMA 2ZZ4A 5LNWA 3IIZA 4D2JA 1B3OA 4A2SA 3NL2A 3LV6A 3NGJA 3LI0A 4A2RA 4QIUA 3C2VA 1J5TA 2QJIA 3TXZA 1QO5A 3VCRA 3TDFA 3E02A 1TCDA 3A5FA 7TIMA 3DFTA 3LGEA 3A21A 2E5DA 3W76A 3L0KA 4R33A 3G1DA 3HF3A 4K8HA 1VZWA 1VHCA 1GTHA 4BR1A 1K8XA 3O16A 1KTNA 3KXQA 5D38A 4HNTA 4A22A 3LLFA 4GJ1A 3A23A 5LGXA 1I2PA 1RR2A 3E0IA 3SW6A 4OBTA 3TV8A 2XN0A 3W7CA 1HO1A 5G4EA 3NG3A 1WDWA 3BLFA 3NQGA 3N19B 3FJ6A 1OYAA 3MUXA 3VFLA 2J27A 3W7GA 3NL5A 4DO6A 3W07A 1YPFA 1H7OA 2E6AA 2GUUA 4HIBA 1JCXA 5LNSA 3UNDA 3O07A 5G2WA 4KFOA 4CCDA 3EXRA 4TX9A 3NEVA 5I3GA 1QWGA 1G4EA 3UXAA 3C2FA 2NZLA 3EKLA 1LOQA 2CLLA 4R34A 4LW7A 2YZRA 3MHFA 1QOQA 5TQLA 3M44A 4FNUA 3W1XA 2JGYA 1FCQA 3SIZA 2B0MA 3ZS4A 5I3FA 5L9FA 1T96A 5HWJA 3LTPA 1YTKA 2EPHA 4QM1A 3DHDA 3DFQA 4FIQA 4UTIA 4JGDA 4UFMA 4YCOA 5FF4A 3W2UA 4O0KA 3TAKA 3CTLA 4M7TA 3LBCA 1LORA 3TXVA 3W2LA 4O1BA 2X16A 1H1YA 3H55A 1UJPA 3QSRA 4K38A 2JBMA 3P7YA 4JTJA 2ZZ2A 1W5QA 3LERA 4GBUA 3TE9A 2CLHA 1B57A 4BI7A 1OX4B 3UYCA 2DZXA 3W7KA 5G2HA 2ZDRA 3STGA 1WX0A 2NXGA 1XCFA 4IPIA 1FXQA 2FIQA 3PC0A 3PSWA 1XBZA 4XQ6A 4JR5A 2QCMA 1W3NA 1W5NA 1UCWA 1DJQA 3O8AA 4JD4A 1LLWA 3FOKA 3W75A 1D3GA 1W5PA 4UFJA 1TYGA 2VFHA 5F2LA 3MW7A 4WY0B 2WQPA 1I8JA 2V0TA 4PTNA 3HQ1A 4AB4A 1UBSA 2WV8A 1R2SA 5BMWA 2QCDB 3GAKA 4XTIA 1OX5A 3W1UA 2CFFA 5AHLA 1L9WA 1K7FA 2ATMA 4O1CA 2OZ0A 4OU1A 2BZNA 1EP2A 1HFBA 1FWNA 4QJ1A 1G7UA 1IF2A 4UFHA 3RF9A 5D02A 1YYAA 3UWQA 3C61A 1KFEA 1KV5A 3IV3A 4AF0A 5D05A 3C2OA 2J9YA 1AW5A 3OVRA 2VENA 5AFDA 2G97A 1P0KA 1HO4A 2JKPA 2ZQ0A 2DZSA 3OVPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1ITU A;  2VRQ A;  2CET A;  4QNW A;  4CNS A;  5AHE A;  3HO8 A;  4DWS C;  5H91 A;  4L6O A;  3V3W A;  1PBG A;  4WFN J;  1U5J A;  5A1A A;  4IUG A;  1R3Q A;  1EF2 A;  3MUY 1;  3QFE A;  4JTC A;  2ZUV A;  3MAN A;  4F0L A;  3S1G A;  1ONW A;  4MVA A;  1YIJ H;  4WOQ A;  3E9A A;  1QOP A;  3UJF A;  2C1H A;  3CHF A;  5DMM A;  1D3C A;  3U48 A;  4Y96 A;  1W2B H;  1LUC B;  3AI0 A;  1UWT A;  2EGZ A;  1OSE A;  3HG5 A;  1E5J A;  1LQA A;  3FVD A;  4J7R A;  2ZRX A;  3WQG A;  3WDP P;  3EXT A;  3ZMR A;  2W3R B;  1MUW A;  4U33 A;  5DN1 A;  3RU8 X;  3QR3 A;  3GHT A;  1US0 A;  1A3H A;  2YJQ A;  1W32 A;  5A6B D;  1UZ4 A;  1N8I A;  3LPO A;  1DJH A;  3PPC A;  4BJH A;  3WNO A;  3M0H A;  4JZ5 A;  5GAG N;  3GB6 A;  4RK8 A;  4MB4 A;  2FYM A;  4DNM A;  2ZVR A;  1W3T A;  4WJX A;  3QC0 A;  3C3U A;  3HV8 A;  4HNC A;  4US5 D;  4ATL A;  1MVY A;  4EAY A;  2AOS A;  1EJS C;  4W93 A;  2NQ5 A;  3G1X A;  4QE5 A;  2ZRY A;  3P0X A;  2EG6 A;  2CNC A;  2GQ9 A;  3EDE A;  5C5Y A;  1WKY A;  1MNS A;  5HAN A;  1MW3 A;  1ECE A;  1TWI A;  3QV6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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