3C32A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with sodium at 1.72 angstrom resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A02
2HFBA 1VFDA 1EH3A 2REGA 1IZ1A 4FEDA 5CM6A 4NF6B 5AA2D 1PBPA 2XD2A 2H25A 1XVYA 4OYVA 1TT1A 4NWCA 2F35A 4TLMB 3QYTA 2UYEA 1SD3A 1SYHA 1J1NA 3CG1A 4TQUQ 4F31B 3A3CA 5ITOA 1XT8A 5I2KA 1A8FA 1OVBA 3IORA 3CVGA 3ZSFA 4U2RA 2WKYA 1M5BA 4P11A 3OO6A 2DE3A 2Q2CA 1GVCA 3MJNA 3UP9A 3O6GA 2CZLA 1KWHA 4ELOA 1FW0A 1CB6A 5H8HA 4F39A 2UVJA 2OBGA 2VP1A 3U93A 3L6GA 3RN8A 4GOTA 1MM7A 4FORA 5H8FA 2PBWA 1IXGA 3DP8A 4RK9A 5H8QB 2Z8DA 5H8NB 4RY1A 4OZ9A 1SI1A 3TTRA 1NNTA 2O1MA 3IAZA 1R9LA 3KSXA 3S2VA 5FTHA 3O6HA 1LCTA 2OZZA 3FATA 1P1UA 3IO4A 1Y9UA 4R72A 3O66A 2D5WA 1YPNA 1BP5A 2W7YA 3RLFE 5EHMA 1B3FA 1S50A 2XHDA 4PE5B 4YB5A 4P0GA 4U23A 1MPBA 3N5LA 3RT8A 3M3LA 4ND9A 3SEUA 4N6PA 1MRPA 4EXKA 2PX1A 3K1NA 3C33A 3KFMA 3V89B 1MXVA 2PVUA 3UK4A 2F5XA 1IXHA 5I2NA 4OFOA 4R75A 3TCHA 4XKNA 4H1XA 1SDXA 3TZAA 1JW1A 1UTBB 4KI0E 2XX9A 5M2VA 3WAEA 4JXIA 3SETA 2F97A 3SEYA 2UYFA 2IEEA 3H06B 4YKPA 4I9DA 1YTVA 3I3VA 1IUDA 2FA7A 4ZE9A 2I0BA 3UN6A 1B52A 3C9HA 3QUJA 3DP4A 5H8SA 2GRVA 2E1SA 1JEVA 4H5GA 3PV0E 4WXJA 4G68C 4IO2A 3O97A 5CMCA 1POTA 4GVOA 1OQGA 2DP8A 2NOOA 3SDFA 4BDNA 4E0XA 3TQLA 3EHTA 1URDA 4FIMA 4F3SA 5BWJA 4EXLA 2RKMA 3G3KA 4NF8B 3ZKLA 5F7VA 2OWSA 3Q29A 3T9VA 3M3KA 2ZMBA 4BDMA 1FQFA 3MWBA 4HCWA 1R6ZA 3E3KA 5F1QA 2Z23A 1QKBA 2Z8EA 4OENA 3GBAA 3HCQA 4F18A 1R1NA 2ZYKA 1LCFA 3K0VA 5ISUA 1CE2A 3N26A 2DOJA 2ZNUA 2ZYNA 3MZ1A 3PMXA 3FASA 1N7XA 2QS2A 4PFWA 2DWAA 2Q8JA 5K2YA 4OEUA 1JW5A 3O29A 1I6QA 3PPNA 1PB7A 4G4PA 4X1DA 2AIXA 3TDJA 4JWYA 4ELRA 5DEXA 3MZBA 3R6UA 5L8DA 2VD3A 2THIA 3SEXA 4DXBA 3GXAA 1QW0A 4ZE8A 2O84X 1I6AA 4F3GA 3N6TA 1S9TA 5JEIA 3LSXA 1AMFA 2YJPA 4LVQA 3PMWA 3QUFA 2ONRA 1UIUA 3T9XB 4KQPA 3KSJA 1D3KA 4KCCA 5K2XA 2GHBA 1LAFE 3KJTA 2KLFA 3CFXA 1ZU0A 3RUMA 5IAIA 1OIBA 1FTOA 2NXOA 1MQJA 4YAHX 2I4BA 4ZEFA 4HCYA 2ZXTA 1LFHA 2XXUA 3BFTA 4R6KA 4F3PA 3MAMA 2F8DA 3U8QA 1UTHA 3PUZE 4G8MA 4O3BA 1B32A 4EQ9A 1MM6A 3K01A 4XKPA 4EF2A 1PDAA 2DWJA 5L9MA 3QXMA 3V83A 2VHAA 4PP0A 3U92A 2Q89A 1SBPA 2V25A 3LSFB 3QK6A 1M5EA 2XXVA 5TP9B 2HAUA 1P1OA 2UVGA 1XOCA 1ZJLA 5I59A 5HM4B 1ATGA 4ZEIA 2DWHA 3O6IA 3HHFA 4ZZAA 3VXBA 2D21A 2PYYA 5DVIA 3IOVA 1B0LA 1N04A 2AYSA 3EPEA 1B3LA 4PQJA 3KBRA 2I49A 4MLVA 4N07A 1Y1MA 4F29A 1B0HA 3N6UA 3KEIA 4DXCA 1B5IA 4OHNA 2Y7WA 4NF4A 1ZKBA 2O69A 3QIMA 5AE4A 1HSJA 3M8UA 2RC7A 2X26A 4OWDA 3ECRA 2Q2AA 2HZKA 3TPAA 4Z7EA 3EHUA 4GFRA 4C1TA 4C0RA 3T96B 4ZZEA 1MXXA 4GF8A 3FXUA 2QJEA 3IOUA 3OEKA 2QS1A 5DYHA 3HV1A 5ICQA 4ESXA 1FQBA 5KCJB 5EYFA 4OTEA 2F6GA 2HEUA 4YU0A 3TKDA 2OLBA 4EQBA 3O28A 3IJXB 4H6DA 2O7IA 2F7BA 2Y7KA 1BIYA 2IA4A 4PETA 1VE4A 5KDTA 4POWA 2OK2A 2UXAA 4FEBA 3K02A 2QMWA 1D4NA 4YMAA 4EUOA 1WVJA 1H3DA 2F36A 3RNNA 1B3HA 1N7WA 2PT1A 4RPOA 3FVOA 3JV9A 2R6GE 3TAJA 1MDP1 1Y1ZA 3OO9A 4M1VA 3K6VA 2P2AA 3OENA 1LFGA 3RTFB 4IB2A 4YKKA 3O2AA 1ZLQA 4FE8A 2ONKE 3OEMA 4OETA 4I8CA 3O9PA 4TOZA 2DSFA 3FJGA 4R74A 4LQ2A 2G29A 1QUKA 3BFUA 1P1QA 5H8QA 3SEWA 5I2KB 1MH4A 1JVYA 3ODBA 1DSNA 3MQ9A 4LZ8A 2HCAA 1YCJA 2XX8A 4G8HA 3SEVA 4HTGA 1LLSA 5TPAB 3CFLA 4XTCQ 1P99A 1US5A 2GFEA 3CIJA 1H44A 4R9GA 4RYAA 4DCXA 3V8XB 3HO7A 5H8HB 3USDA 2Y7RA 1AH5A 4P0IA 1NNKA 4NTLA 3N94A 4U22A 3PUWE 1FTKA 5H8FB 3TTLA 3MVYA 2DXYA 4GXSB 2XXIA 2A5TA 2Y7IA 1MDQA 4AB5A 1RYOA 4OEVA 1SVXB 1RKMA 1PC3A 4TLLB 2ZYMA 4LP2B 3VVFA 3D4GA 1XHYA 3S9LC 3MP8A 1B05A 3G3IA 3MP1A 3C36A 1WODA 1JQFA 1O63A 4BLAA 3IL1B 1B5HA 3IOWA 4UA8A 4ZEDA 3V5AA 2DVZA 2XXTA 3H6TA 1NKXA 3KGCA 4GIZA 4GL8A 2BJJX 3G3HA 1IXCA 3M3FA 1UQWA 1PEBA 1B5JA 2QL3A 4LZ5A 5CC2A 1B4HA 3DLNA 2V3QA 4IO3A 3EF7A 1B1HA 3IB1A 3UGWA 3K1MA 4H67A 2YPNA 3MPKA 4KYSA 4KPTA 1HSEA 3IO6A 4ONYA 3TODA 3TQWA 4NF5B 1R9QA 3RQTA 1JNFA 4OXVA 4RPNA 4JBZA 5I84A 5DVFA 3MVZA 3H6WA 3ILTB 3IB2A 4YB6A 4YMBA 4QFLA 4KCDA 3K4UA 2I3VA 3H03A 1DPPA 3UORA 2I58A 2A5SA 1B7ZA 2D3IA 4AB6A 1TWYA 4IO6A 3FV1A 1NFTA 3EQ1A 4LZ7A 3R7XA 3T66A 4H5FA 2QMXA 4R2BA 4XKQA 3PPOA 4KHZE 2H5YA 3K6UA 1M5CA 4N13A 3G3JA 5I58B 3ILUB 4XKRA 1FTJA 3T9HB 4GL0A 2DE2A 3TYHA 3VDFA 5JTYA 3SESA 4NWDA 3FVKA 3FXQA 3H7MA 1SW4A 4WKMA 2QPQA 1USYE 1XVXA 4DE8A 3KOSA 3R26A 3VFJA 3CG3A 4FJPA 1Y3NA 1A7LA 1Z7NE 2ALUA 1M5FA 1Y3PA 4QFNA 4FAJA 3IX1A 3C4MA 4F1YA 1LAHE 1Y3QA 1B9JA 4QFOA 1F9BA 1QUJA 2OJTA 4OQOA 1A99A 1NMUA 2X7PA 4UACA 2V84A 1MQGA 1QVSA 3K00A 1ANFA 3C32A 5I56A 4EF1A 3LUYA 5DTBA 4ZDMA 2V3UA 3H6UA 3U94A 5DEXB 1SW1A 2F7CA 2ANJA 3HN0A 2DYXA 2R71A 1IXIA 1VSOA 1A8EA 3TCGA 3FVGA 3RPWA 1H43A 5HPQA 3TCFA 1FQEA 3W15C 3MZ9A 4G68A 1POY1 1Y20A 4K3FA 3C34A 2B3FA 3MUQA 2XXHA 1NNPA 3RGYA 4NE4A 4U1OA 5FTIA 2I4CA 3H3GA 1MH3A 1DOTA 1MXWA 3I6VA 4WEPA 3B7DA 4MLQA 4OFLA 3E9XA 3KN3A 2Z8FA 3CI8A 4HW8A 4DIGA 3FVNA 1IIWA 1UTHB 1YAEA 1II5A 5AA4A 1FCKA 2F7AA 4ZECA 3T93B 3Q28A 2DWIA 1QULA 5ITPA 1MY2A 4I62A 1BKAA 3ONMA 2XX7A 3CSBA 4PFUA 3G3FA 1SW5A 3QAXA 3VVDA 3E4RA 1AOVA 3MVXA 1TXFA 2H4IA 1A40A 1NNFA 1B4ZA 3TTKA 5I59B 4U4XA 4U4SA 5HBCA 5A5XB 3HPIA 1FQCA 5CMKA 3MP6A 1FQDA 4ESWA 3KOTA 1BLFA 3CRBA 4G77A 3TELA 2O7UA 2NVUB 1S7YA 2I6EA 4U21A 1B51A 1OMPA 2B3BA 5DT6A 4QFKA 1DPEA 1B1XA 3DP6A 4Q5TA 2HXWA 4NF4B 1Y4TA 2ZYOA 3H6VA 2VOZA 5KZTA 4U1ZA 3DELB 1FTMA 4MF3A 5JK4A 3G3GA 3S9MC 3CR9A 4LONB 2HAVA 1ZTYA 3SKPA 5CI5A 1LBBA 1EZ9A 2I48A 2P1SA 4H0WA 5I57A 4JWXA 4BDOA 2ESNA 3PUYE 5TU0A 2DE4A 4I1DA 3U1OA 3PUVE 4ZEKA 4NF6A 4DDDA 3PD8A 3KJ7A 1PB8A 4XIGQ 4H8IA 4PFYA 1MY1A 3FV2A 4NMYA 3PPRA 4JSOA 3TTMA 4OVJA 3OXNA 5CBSA 3VLWA 4THIA 3WAFA 2RC9A 3VE1B 1H45A 1HSLA 5KDTB 4Q8RA 2G93A 4F19A 2LAOA 3VV5A 2O1LA 5AA2B 4OESA 3TUSA 4LQ5A 1H76A 4DCYA 1MPDA 5CMMA 4WEDA 3IR1A 1B7UA 2O68A 2PMSA 3OSQA 1I69A 1LB9A 1SYIA 1LAXA 4G2ZA 4GXAA 4IO4A 1MXYA 4O3CA 1RYXA 3E13X 5TPAA 3U72A 2ABHA 4H65A 5B70A 4POXA 2V3TA 5H8NA 1Q1KA 3B6QA 4BDQA 2R9JA 2O51A 5IKBA 2E0SA 4QSDA 3IB0A 1T0KA 3OOAA 4KR5A 1MS7A 4E0WA 2Q9TA 1JETA 1PBQA 4HS7A 5CRYA 4BDLA 1ZIUA 3G7WA 1N76A 1LSTA 1BTJA 2RC8A 3A09A 3W9WA 4MH5A 3RT6B 4LUBA 1PB9A 3UA8A 2HZLA 4LA9A 2VGQA 1L5TA 3B6WA 1MPCA 1OLCA 2F78A 4OMBA 3VVEA 4Q0CA 2Q88A 1B2HA 3Q25A 3C35A 3KZGA 2RINA 2ZNTA 4GWOA 5FHNA 1SW2A 3HHGA 1SQYA 3D4CA 3QSLA 4R73A 4GLIA 3OMBA 1XS5A 3A3UA 3PD9A 2OWTA 2A5TB 4F3BA 1UTBA 4X1BA 1MG1A 5ICTA 1GTKA 3Q27A 1MQIA 2H98A 3FJMA 3MW0A 1B46A 4YKIA 1A54A 2PT2A 3TMGA 4YICA 3DM0A 3HSTA 3OO8A 2B65A 5CMBA 4F2OA 2XD3A 1MQHA 1O64A 4NF5A 2X7QA 4R2FA 1GV8A 5I2NB 1NH8A 1USYH 3CSGA 2Y7PA 2ZNSA 1LB8A 1US4A 3K6WA 4BDRA 3TTNA 3GZGA 2NUVA 4QHQA 4QSCA 5J1DA 1N3XA 2M8CA 3FGSA 1OQHA 2UVHA 4M4GA 1GGGA 4PFTA 3BKIB 4NF8A 4G8NA 1ZMGA 4MFIA 4ZS9A 4L17A 1AIVA 2P0SA 2F6PA 4JDFA 3FD3A 4JB7A 4R9FA 3C31A 2CMOA 5I58A 1LAGE 4YZZA 4F2QA 4YKJA 2OCUA 3BBRA 1B58A 4KYDA 3FIRA 3JYRA 2XXYA 1Q35A 3IJOB 3MPLA 1DMBA 1JVXA 4FATA 3RY3A 2RF1A 1JEUA 4XXUA 2NWJA 1OLAA 1QJMA 4GRKA 3LSLA 3TFLA 4JSDA 3CFZA 4GQOA 3AXFA 2V93A 2GH9A 5DVJA 4ISUA 1EZOA 2QRYA 4F1UA 1MY3A 3IOTA 5LOMA 1AL3A 3S4UA 3I5OA 2XXWA 4EDPA 5JTYB 1GR2A 2Z22A 2YLNA 4JWOA 3P7IA 4EQ7A 4YB7A 3RTWB 3K1PA 4F22A 1P1WA 4F1VA 3OD7A 1SI0A 2FNCA 2FYIA 2VD2A 1B3EA 1DTGA 4H8JA 3W9VA 2UVIA 3VLUA 1MXUA 3S9NC 1IEJA 3FXRA 1URGA 1D9VA 3SERA 4FECA 2I0CA 1B3GA 4IY5A 1N3WA 3T9UA 1WDNA 1LGBC 3KN8A 5I56B 4GD5A 1NH7A 4R6HA 4RK2A 1XC1A 4OFJA 3LBSA 1B40A 1VFEA 4O3AA 2XXXA 1ELJA 4LATA 3PPPA 2QS4A 2GHAA 5AA3A 1QUIA 3TEPA 3LSWA 1MXZA 4KFQA 1IQ7A 4Q30B 1M5DA 5B7DA 5TP9A 1MQDA 2XXPA 3EN3A 1Y4CA 2HQ0A 3PPQA 3IK6B 4G68B 3OO7A 2DQVA 1FQAA 4ECFA 2F34A 4ELQA 1IITA 4RJZA 1OVTA 2ONSA 4OERA 3FJ7A 1VR5A 1UIVA 4KYEA 4KD5A 3MVWA 4IGTA 2QSXA 1NL5A 3ZKKA 4RXLA 2DVCA 1LFIA 1TFDA 5FHMA 1N84A 4IO5A 1TFAA 3T22A 5A5XA 3PUXE 5AA4B 3MC2A 5EHSA 1O7TA 5BUUA 3KN7A 4RNSA 1Z7ME 4ELPA 3LR1A 1N0TA 2Y84A 3H4ZA 3K6XA 2H99A 3PU5A 3Q26A 1ZBMA 2DS9A 4DZ1A 5FHOA 4ZEBA 4X9TA 3K2DA 1P1NA 1MY0A 1EU8A 3OSRA 1B7HA 5CBRA 3MBPA 5L9OA 4DLDA 4DXUA 5KCJA 3JZJA 1URSA 2RCBA 4NEDA 1D9YA 3B6TA 3KG2A 2QS3A 2AL5A 3OELA 4AQ4A 3VLVA 1FTLA 3PMVA 3PGFA 2REJA 4QRZA 2AL4A 4C1UA 1B6HA 5L9SA 3UIFA 2H9BA 3L6HA 4Z0IA 3FZVA 4QF9A 3VXCA 2RCAA 3EHSA 5ELVA 2I3WA 4IO7A 3F11A 2O6AA 4IGRA 4QFPA 4X48A 3LC8A 2XXQA 1JW4A 3ZS6A 3GBBA 1EZPA 1I6BA 1DTZA 4RA1A 3FUZA 2DXRA 4MBPA 5AA1A 1QKAA 2XXRA 3S9EA 4IY6A 4QSEA 1A55A 3GLBA 4R6YA 3THIA 1MY4A 5AA2A 5I57B 1LBCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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2XX9A 4P9KA 5M2VA 3WAEA 4PE3A 4JXIA 1NV1A 1IMAA 3SETA 2F97A 4PFRA 3SEYA 2UYFA 1FTAA 2IEEA 3H06B 4YKPA 4I9DA 1YTVA 3I3VA 1IUDA 2FA7A 3PTYA 4ZE9A 2I0BA 3UN6A 1B52A 3C9HA 3QUJA 3DP4A 5T3JA 5H8SA 2GRVA 2E1SA 1JEVA 4H5GA 4MEVA 3PV0E 4WXJA 4G68C 4IO2A 3O97A 5CMCA 1POTA 4GVOA 1OQGA 2DP8A 2NOOA 3SDFA 4BDNA 4E0XA 3TQLA 1NV0A 2XWOA 3EHTA 1URDA 4FIMA 4F3SA 5BWJA 4EXLA 2RKMA 1FPGA 3G3KA 4N8GA 4NF8B 3ZKLA 5F7VA 2OWSA 3Q29A 3T9VA 2QFLA 3M3KA 2ZMBA 4BDMA 1FQFA 3MWBA 4HCWA 1R6ZA 3E3KA 4XF5A 5F1QA 2Z23A 1QKBA 2Z8EA 4OENA 3GBAA 2VT5A 3HCQA 4F18A 1R1NA 3LV0A 2ZYKA 1LCFA 3K0VA 5ISUA 1CE2A 1FPDA 2HXRA 3N26A 2DOJA 2ZNUA 2ZYNA 3MZ1A 3PMXA 3A29A 3FASA 1N7XA 2HHMA 2QS2A 4PFWA 2DWAA 2Q8JA 5K2YA 4MIJA 4OEUA 1JW5A 3O29A 1NV3A 3RPLB 1I6QA 3PPNA 1PB7A 4G4PA 4X1DA 2AIXA 3TDJA 4OVQA 4JWYA 4ELRA 1QGXA 5DEXA 4P56A 3MZBA 3R6UA 5L8DA 3SZPA 2VD3A 2THIA 3SEXA 4DXBA 1NV6A 3GXAA 1QW0A 4ZE8A 2O84X 1I6AA 2FVZA 4F3GA 3N6TA 1S9TA 5JEIA 3LSXA 1AMFA 2YJPA 4LVQA 2JJKA 3PMWA 3QUFA 2ONRA 5J16A 1UIUA 2OWZA 3T9XB 3CHGA 4KQPA 3KSJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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