3C32A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with sodium at 1.72 angstrom resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A02
3OO6A 1LB8A 3V89B 1IZ1A 2UVIA 1VFEA 3A3UA 4GVOA 1WDNA 4FJPA 2Z8DA 1I6AA 2XXYA 1B0HA 4P0IA 3T96B 3JZJA 1N76A 4G77A 5H8NA 1RYOA 1MRPA 1BKAA 1IXGA 3MUQA 2A5SA 3TTNA 4XXUA 1LFGA 5TP9B 4GWOA 4OEUA 3T66A 3IOWA 3KJTA 3HPIA 3MZ1A 3RT6B 1IUDA 2A5TA 4M1VA 3O6IA 2CZLA 1LAFE 3H3GA 2HXWA 4WKMA 2AYSA 2ZYKA 1EH3A 3Q27A 3S9MC 4JWYA 4XTCQ 2F8DA 2HZLA 2F36A 2D5WA 4Q8RA 1FW0A 5TPAB 3CG3A 1H45A 1LB9A 1M5EA 4GQOA 4U21A 3EHTA 2ZMBA 1MS7A 3W15C 2V3UA 2O68A 4H67A 3L6GA 1POTA 5AA4A 4KFQA 1O63A 3TTMA 2OZZA 4NF6A 2ZYOA 3R7XA 4OVJA 4G8HA 2F7CA 3C35A 5K2XA 1ZU0A 3OO9A 4OFLA 1MXYA 3MWBA 1SBPA 4GXSB 3VFJA 4YMAA 2Y7PA 2XD2A 3DLNA 4OZ9A 1ZMGA 2Q2CA 4G8MA 2X7PA 4QRZA 1D4NA 4DXBA 3VV5A 1FQBA 3RQTA 4O3CA 4IGTA 3G3JA 3S9EA 4G68B 2OLBA 4R75A 3EQ1A 1MDP1 2XXQA 3MW0A 2YJPA 2F6PA 1LGBC 1VR5A 2Y7IA 4XKPA 2P1SA 2B65A 3SEWA 2RKMA 2CMOA 3K0VA 2AL4A 3N6UA 1GGGA 4F3BA 3G3HA 3THIA 1Y4TA 1P1UA 4U1OA 1DTGA 2O69A 2F97A 2H25A 1ZKBA 5AA2B 2DYXA 3MJNA 1B1HA 3FV1A 5F1QA 3DP8A 4QSEA 1F9BA 4G2ZA 4R2FA 1B3HA 3ZKLA 2NVUB 1UTBB 2QSXA 1USYE 2DWHA 4EQ7A 3HHFA 4PQJA 1OQHA 1QULA 3B6WA 4WEPA 1B7HA 1S50A 3HHGA 2QS3A 3GBBA 1A8EA 4F39A 3BKIB 4LP2B 1B3FA 4HS7A 1PBQA 1FTMA 4NWCA 3U94A 3GLBA 1DTZA 4QFPA 5CMMA 2I0CA 1ZTYA 4K3FA 3OMBA 2KLFA 1YTVA 4OWDA 4X1DA 5EYFA 3EN3A 4LZ5A 4F1UA 1EZ9A 1M5BA 2UXAA 4KPTA 2F7BA 5DT6A 4BDOA 3S9LC 2I4BA 5TP9A 1TT1A 2R71A 1MG1A 1OQGA 5JK4A 2V25A 4F3GA 5I58B 3UIFA 2XX8A 1MXUA 1AOVA 5DVJA 3UN6A 2Z8EA 4P11A 1M5DA 3PMWA 4OESA 4IB2A 4DCYA 3RNNA 2XXUA 3RLFE 1NMUA 3C34A 4MFIA 1N0TA 4DLDA 1MQHA 5KDTB 1PDAA 2B3FA 3ZSFA 4YAHX 1LAHE 1TFDA 2PYYA 3FJ7A 3T9HB 1P1NA 2QMWA 5TPAA 3ODBA 1LAXA 1MQJA 2XX7A 4IO6A 1FQAA 3HCQA 2F7AA 1QJMA 4GXAA 4OYVA 4Q0CA 3N94A 1GR2A 5JEIA 4F19A 1B5JA 1B9JA 4MF3A 1NKXA 3TCGA 1B3LA 3PUVE 3K1NA 5DEXB 3FGSA 1NNKA 3TUSA 1N84A 1JETA 4GLIA 1NFTA 4FIMA 2O51A 3LBSA 5FHNA 2ZNTA 3FJMA 3H7MA 4ZS9A 4F2QA 5DVFA 4X9TA 4QFNA 3MBPA 2O7UA 3L6HA 2I3VA 1BTJA 1VSOA 3SEUA 4QSDA 2QS1A 2X26A 4PP0A 4TQUQ 1II5A 3LSXA 4NE4A 1PEBA 3SEXA 4DXCA 3IR1A 5CMCA 4G68A 1NL5A 1D9VA 3U1OA 3KSJA 3HN0A 4E0XA 3LSLA 4KHZE 2GHAA 4LZ7A 1J1NA 3O6GA 1FTKA 3O9PA 4R74A 5L8DA 1FQFA 4ONYA 4ZEIA 1RYXA 3RPWA 5AA2A 1B46A 1CE2A 3T9XB 4DIGA 3C36A 3MPKA 3CIJA 3WAFA 1I69A 4POXA 1UTBA 4THIA 4BDNA 4H5FA 2GRVA 4AB5A 4YKJA 1OLCA 3SDFA 3FUZA 1SQYA 3FJGA 4JSDA 3TMGA 1FQCA 2ABHA 2XHDA 3TTLA 3IJXB 1IIWA 4MH5A 3OO8A 5I2KB 4BDRA 3PPPA 5EHMA 1OVBA 3DP4A 4ZEKA 3KOTA 4ELQA 1BLFA 1PB9A 4ZDMA 3C9HA 1JQFA 4DZ1A 2QS4A 1IEJA 3LR1A 1FQEA 3BFUA 5A5XB 2F5XA 3TODA 2G93A 1YPNA 1GVCA 3USDA 4LA9A 1MQGA 1ELJA 3ECRA 3K4UA 2PX1A 3IORA 1Q1KA 4OEVA 2OCUA 2P2AA 2XXPA 1AH5A 2OWSA 3IB0A 3EHSA 4GL0A 1POY1 1YCJA 3S2VA 1OMPA 1Z7ME 3MQ9A 5CI5A 1DPPA 5I58A 2RC8A 4YKPA 4NF5B 3O28A 3QAXA 3CFXA 3KN7A 3IO4A 5M2VA 3MC2A 3IB2A 1S9TA 3PUXE 1GV8A 3PMXA 3MZ9A 1MXWA 5ISUA 3K6WA 1RKMA 5KDTA 3TAJA 1A55A 2DVCA 3CSGA 1QKAA 3IB1A 1WVJA 1JW4A 1UIUA 5DYHA 1MH4A 1BIYA 4YKKA 4AB6A 2OWTA 1LFHA 1CB6A 1MY2A 4DXUA 2LAOA 2DXYA 4IO3A 2PBWA 3U8QA 4R6KA 1O7TA 1ATGA 5H8FB 1MPBA 1MXXA 1URGA 3B6TA 2ZYMA 3MAMA 3N26A 3KN8A 3G3KA 2I58A 4E0WA 2O84X 2H9BA 3PU5A 1ZIUA 5ITOA 4F1VA 3T22A 4C1TA 1A8FA 1MXVA 4RA1A 5DEXA 2ZNUA 4R73A 4LQ2A 2QS2A 4Q5TA 1SDXA 3OO7A 1JNFA 4BDMA 2DQVA 2DWAA 3PUYE 1HSJA 3TEPA 2YPNA 4IGRA 2I49A 2DOJA 2AIXA 1PB7A 4MLQA 3M8UA 1SW4A 2RCAA 5B70A 2E0SA 4ZE8A 3IOTA 4FAJA 2VD2A 4R6YA 2V93A 3FATA 3FZVA 3G3IA 1GTKA 2UVHA 4G4PA 4C0RA 4FORA 4F1YA 2PT2A 3MP6A 3FASA 3PV0E 3OELA 5DTBA 1P1OA 3KFMA 3K02A 4U4XA 4JSOA 3PD9A 4N13A 2OBGA 2VOZA 4FE8A 2GH9A 3QK6A 4LVQA 2XXVA 3FIRA 4OMBA 1FTOA 4KCDA 1B58A 4OENA 1Y3PA 4JWOA 1B51A 1JW1A 2Q8JA 5I59B 2V3QA 4R9GA 3SERA 1LCFA 2O7IA 4QF9A 2HZKA 1FTLA 3IO6A 2ALUA 1H3DA 4KD5A 1MQIA 5I56B 4MLVA 3ILUB 3LSWA 3TFLA 3K1MA 3U92A 1MM7A 3I5OA 2Q2AA 4OFOA 1A54A 3SKPA 3CFZA 4N07A 3TTKA 4XKRA 1XHYA 1B5HA 1URSA 1FTJA 2D21A 2Y84A 4LONB 5LOMA 5AA1A 5I2KA 4AQ4A 4YB5A 1KWHA 1SYIA 1XS5A 2ZYNA 3FVGA 1S7YA 1B4ZA 4L17A 3LSFB 3O97A 1B2HA 5A5XA 1QKBA 4YB6A 2D3IA 2ANJA 3KN3A 2RF1A 4JBZA 3PGFA 3OSQA 4XIGQ 4RK9A 4OETA 1DPEA 1PC3A 1US5A 4RJZA 2V84A 1HSLA 2DE4A 3RTWB 1B3EA 5ELVA 3IAZA 3S9NC 3RGYA 1N04A 3MVXA 4NF5A 2PT1A 3N5LA 4H8JA 2I0BA 3TYHA 3PMVA 4HCYA 4ZZEA 1UIVA 2VD3A 2E1SA 2R6GE 3CVGA 4H5GA 4GFRA 4HW8A 2DE3A 4YB7A 3FVKA 4Z0IA 2UYEA 2VHAA 1B32A 1TFAA 4F18A 1R1NA 3MPLA 1MXZA 4RNSA 5H8FA 1USYH 2RC7A 3SEVA 1MDQA 3H6TA 1BP5A 2V3TA 4GRKA 1B7UA 3W9WA 2RINA 1A40A 1MPDA 4H1XA 4M4GA 3VXCA 2FYIA 4N6PA 3VVEA 3PPRA 3BFTA 3DP6A 3VLUA 4F3PA 4LUBA 3OXNA 3H06B 1A7LA 1LSTA 3D4CA 3EPEA 1LFIA 1US4A 3TDJA 2DE2A 4KQPA 4X1BA 5KZTA 2OK2A 5K2YA 1N3WA 4TLLB 4Q30B 5H8QB 1IXCA 3E3KA 4LQ5A 4PFUA 1ZJLA 1O64A 1NNFA 3FVOA 4C1UA 1UTHB 3QUFA 2ONSA 4FEBA 3CFLA 2ESNA 1OLAA 2XXRA 4X48A 4JB7A 3OD7A 1XC1A 4KYDA 4YKIA 1WODA 1H44A 3VLWA 5CMBA 1AL3A 1PB8A 2F35A 2X7QA 5J1DA 4R9FA 3CI8A 4JXIA 1IXHA 3TCHA 4EXLA 5I59A 4EDPA 3QSLA 3VLVA 5I56A 4QFOA 2ZNSA 5ITPA 2DSFA 3IJOB 3W9VA 1Q35A 1UQWA 2B3BA 3S4UA 4DDDA 5L9SA 1EU8A 4OERA 4ELPA 3VDFA 1NNTA 3Q26A 3QUJA 4NEDA 1SW1A 4WXJA 1N7XA 3O66A 4GD5A 4QFKA 3R6UA 1Y3QA 1YAEA 2RCBA 3PPOA 4YZZA 3DM0A 3TELA 3TZAA 3M3FA 4EUOA 2AL5A 1JVXA 3A09A 4U2RA 1AIVA 5TU0A 5I57B 3VXBA 3PUWE 5F7VA 4TLMB 2QJEA 3B7DA 3U93A 5I2NB 4I1DA 1SYHA 1P99A 3Q29A 4RYAA 5CMKA 4F29A 1T0KA 4GL8A 2Y7WA 3Q25A 2Z22A 2Q9TA 2R9JA 3K01A 1JEUA 1Y20A 4F22A 5KCJB 1R9QA 3D4GA 5AA2D 4ZZAA 3A3CA 3ONMA 3PD8A 4HCWA 4NWDA 4H0WA 4QFLA 4JDFA 1URDA 4GIZA 3KJ7A 4Z7EA 1FCKA 4F31B 4DE8A 1SVXB 1HSEA 4KR5A 5CBRA 4YICA 4H8IA 3H6VA 1LBCA 3O29A 3UP9A 3V5AA 3H03A 5HPQA 3FD3A 3R26A 4ISUA 3VVFA 3KBRA 1IITA 2VP1A 4I8CA 1ZBMA 1MH3A 3FXUA 3UA8A 3E4RA 1Y1ZA 1MM6A 4IO7A 1D9YA 3K00A 4DCXA 5IAIA 4XKQA 1DSNA 3C4MA 5JTYB 2WKYA 2GHBA 3RUMA 4RXLA 3FVNA 1PBPA 4OQOA 5I84A 3V8XB 3F11A 5L9OA 2HEUA 3KGCA 3OEMA 5H8QA 3GZGA 4U23A 2RC9A 2ONRA 3TQWA 1UTHA 1QUIA 2NWJA 1B5IA 4WEDA 4H6DA 5CM6A 2DXRA 1SW5A 3O6HA 4GOTA 2UVGA 1MY1A 4FEDA 4F2OA 2O6AA 5CRYA 1SD3A 5EHSA 5H8SA 4ELRA 2IA4A 1SI0A 2XD3A 3G3FA 2Y7KA 2Y7RA 2UVJA 1Y9UA 2NXOA 3C31A 3GXAA 1MPCA 4TOZA 3OSRA 2XXIA 2O1MA 3CR9A 4EQBA 1XT8A 2M8CA 4ECFA 3MP8A 1Y3NA 2P0SA 4QHQA 5ICQA 4NF4B 3MVWA 1JEVA 1IQ7A 2Q88A 1MY4A 3RTFB 5IKBA 1NNPA 4UA8A 1AMFA 5AA3A 3LUYA 1R9LA 2H99A 3T9VA 3PPQA 3SEYA 5CC2A 2QMXA 2XX9A 3KOSA 4ESWA 1EZPA 4RY1A 3FV2A 5BWJA 3SETA 3TPAA 3AXFA 3JYRA 4BDQA 1H43A 3SESA 2I3WA 5B7DA 4U1ZA 4YMBA 5I57A 1LCTA 1VE4A 1N7WA 4ND9A 3MVZA 3UK4A 3DELB 4IY6A 2W7YA 1B0LA 1Y4CA 3OEKA 5I2NA 2VGQA 1QUKA 2I6EA 4NMYA 3RT8A 1Y1MA 5CBSA 3CRBA 3TCFA 5FHMA 3P7IA 4OHNA 1H76A 2IEEA 3FXQA 1TWYA 1B1XA 3IL1B 4IY5A 4ZEBA 4ZECA 2QRYA 3IOUA 5KCJA 4RPOA 1D3KA 5FTHA 1A99A 4UACA 2DWIA 2G29A 1MY0A 1XOCA 3IK6B 3RY3A 3K6UA 5HBCA 1JW5A 2YLNA 5ICTA 3G7WA 4NF8B 4G8NA 2ZXTA 2BJJX 5H8HB 1TXFA 4FECA 1B4HA 5BUUA 1NH8A 3BBRA 3IOVA 3K2DA 3K1PA 4IO4A 4H65A 1B40A 3EF7A 4IO5A 3RN8A 3I3VA 4KYEA 2Q89A 4EXKA 3ZS6A 2UYFA 4O3AA 3HO7A 3UORA 4PFWA 2HQ0A 3I6VA 5JTYA 3KG2A 1I6BA 3TQLA 3M3LA 5AE4A 2F34A 5FHOA 5HM4B 2Z8FA 5H8NB 3E13X 3O2AA 1I6QA 5DVIA 1B7ZA 2XXTA 4NTLA 3PUZE 3KSXA 4EQ9A 2REJA 4LZ8A 3H4ZA 3H6UA 2H4IA 4OXVA 3ZKKA 2H5YA 3QXMA 3CG1A 2A5TB 1XVYA 4IO2A 4R2BA 4JWXA 1ANFA 2GFEA 1B6HA 4I9DA 3VE1B 4U4SA 1B52A 2XXHA 4G68C 3M3KA 3HV1A 4OFJA 3U72A 1LLSA 3MZBA 2THIA 1N3XA 4KYSA 4ZEFA 1LBBA 2PVUA 3HSTA 3K6XA 2XXWA 3JV9A 2XXXA 1OVTA 1MY3A 4NF4A 2FA7A 1ZLQA 4POWA 4KI0E 5AA4B 4YU0A 3EHUA 2H98A 3UGWA 4HTGA 1DMBA 4NF6B 4BDLA 3G3GA 3C32A 1MQDA 1QUJA 1LAGE 3T9UA 2DP8A 4U22A 1EZOA 1QW0A 4FATA 3TKDA 2PMSA 1R6ZA 1P1WA 2ONKE 1IXIA 3H6WA 5L9MA 4PE5B 4R72A 4MBPA 4F3SA 3TTRA 3WAEA 4ZEDA 3Q28A 1OIBA 3N6TA 4P0GA 4LATA 2HCAA 4R6HA 2F78A 3ILTB 4RPNA 3IX1A 2DVZA 1VFDA 4RK2A 3V83A 4OTEA 1FQDA 4ELOA 3T93B 1P1QA 3PPNA 4QSCA 2QPQA 2NOOA 1Z7NE 2HAUA 1B05A 1M5FA 3QIMA 4GF8A 4EF2A 3VVDA 2F6GA 5FTIA 3E9XA 3CSBA 3C33A 1XVXA 2Z23A 4EF1A 4XKNA 4BLAA 2HFBA 3OOAA 3MP1A 4PFTA 3GBAA 2O1LA 1SW2A 3LC8A 2I4CA 2DS9A 1QVSA 4KCCA 4ESXA 1B3GA 1NH7A 3KEIA 4I62A 2REGA 2QL3A 4PETA 3K6VA 4ZE9A 2FNCA 4NF8A 2HAVA 1DOTA 5H8HA 3FXRA 2NUVA 2I48A 3MVYA 1M5CA 4O3BA 2OJTA 1JVYA 4PFYA 3KZGA 1SI1A 1L5TA 3OENA 3QYTA 2DWJA 3B6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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