3C32A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with sodium at 1.72 angstrom resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A02
3C33A 4EDPA 4BDNA 4IGTA 3HSTA 3O6HA 3C36A 2RC9A 2B3FA 3K02A 2DWJA 5JTYA 2ZYOA 4C0RA 4HW8A 4JSOA 5KDTB 4ZE8A 2ABHA 2QL3A 4MBPA 3U92A 4JBZA 3TCFA 5KCJA 5DEXB 4ZEKA 4EQ9A 1EZOA 3VVDA 3E13X 3C32A 3IJOB 2GFEA 3Q28A 4F2OA 3EHUA 3KN3A 2H9BA 1B7HA 1OIBA 4MF3A 4IO2A 1QUIA 2DOJA 4ZZEA 1GVCA 4G2ZA 1ZIUA 3KN7A 2B65A 3TTNA 5CBSA 1MG1A 3IORA 1NFTA 2Q89A 3O9PA 1MRPA 4IO6A 5DVIA 3B6TA 1AOVA 3RTFB 5H8NB 1JNFA 3RNNA 3S9MC 4LUBA 2YJPA 2ONKE 4OHNA 1DPEA 3FXQA 3JV9A 1A8FA 3M3KA 4XKNA 1B9JA 1B51A 2O84X 1SQYA 3PU5A 1P1UA 4Q0CA 1B7UA 4M1VA 4U2RA 1LCFA 1FQEA 1O63A 3KBRA 3V8XB 1BP5A 4OEUA 1NL5A 3K6UA 1GTKA 3B6WA 3CFZA 4QSDA 1MY2A 3PUWE 4IY5A 3DM0A 5ITPA 3OENA 2I4BA 2I0CA 4U22A 3QSLA 1I69A 1N3WA 2LAOA 5K2YA 2NOOA 1UIUA 3G3JA 4LQ2A 1B52A 3IOUA 4G68A 2Z23A 1SD3A 3V83A 2D5WA 4OMBA 2QPQA 1Y4CA 3SEXA 2P2AA 4RY1A 1IEJA 4DCYA 1URSA 3FV1A 4R6YA 4H6DA 4IO3A 5FHNA 3IOTA 1PB8A 4EUOA 1MXWA 3Q29A 3O29A 1JVXA 4F18A 1LAGE 5I56A 4GWOA 3V89B 4BDLA 3D4CA 3R26A 3KZGA 1N04A 3O6GA 4WKMA 4H8JA 2ONSA 3MP8A 3LSXA 4FECA 1S9TA 4F3GA 3S9LC 4NE4A 1LAFE 4FATA 4G77A 1TFDA 2ONRA 1PB7A 4Q8RA 1B1HA 3VV5A 1J1NA 4BDRA 1LSTA 1IUDA 2RKMA 2R6GE 2V3QA 4JWOA 2DWIA 5B70A 2Y84A 1TXFA 2DE3A 5FHMA 3RTWB 1LFGA 2HAVA 2XXWA 4ZECA 3I3VA 3H7MA 4GF8A 5JK4A 4ND9A 4QFOA 1MXXA 2O69A 4EXKA 3W9VA 4L17A 4R73A 1FQCA 3K4UA 2F7BA 4F1UA 3PPQA 3SEVA 4QFPA 3QIMA 4OFJA 1A55A 3T9XB 1FQBA 5A5XA 3RUMA 3K6XA 2UYFA 2PBWA 4IGRA 3LR1A 5B7DA 1NKXA 5H8HA 1P1QA 1DMBA 1FQAA 2QS2A 2G29A 2F6GA 1KWHA 1USYE 4R6HA 3FD3A 1F9BA 1IITA 4PFTA 4GD5A 1QUJA 4ISUA 1UQWA 3FJMA 1LFIA 5H8FA 2XXVA 4ELRA 4LA9A 3MVWA 1XS5A 1A40A 5I2KB 2V3UA 5TPAA 4YKIA 3FVGA 1DTGA 3L6GA 3UN6A 1TFAA 2HEUA 1I6QA 1Z7ME 1OVTA 2XD3A 1MDQA 2O7UA 5I56B 3P7IA 4PFYA 4F3SA 4X48A 2PVUA 2I0BA 3TZAA 4U1OA 1PBPA 1OLAA 1M5FA 4GVOA 3USDA 2QS1A 3RY3A 3U1OA 1HSEA 3GBBA 2UVGA 4R2FA 1B0HA 3KJ7A 3I5OA 4O3AA 3FATA 4LATA 3OO9A 4MFIA 2ZNTA 2M8CA 2O6AA 1P1NA 2AYSA 2ZNSA 4DDDA 5CMCA 2RCAA 3KN8A 1USYH 1EU8A 1XT8A 4PFWA 3JYRA 5KDTA 1Y4TA 4C1UA 1VSOA 3S4UA 1B3EA 3C9HA 3LSFB 1NH8A 3VDFA 2XHDA 2F8DA 5ICTA 1R6ZA 5DEXA 4P0GA 2OWSA 3CRBA 4F3PA 4O3BA 1JETA 3VXCA 1H76A 1LCTA 1M5DA 1B4HA 3KG2A 2XXYA 3OSQA 1N7XA 3PMVA 1B32A 1XVYA 1ZBMA 5AA2D 5A5XB 1Z7NE 1P1WA 1ZJLA 4YMAA 2W7YA 3W9WA 1FW0A 1Y1ZA 3MP1A 3A09A 3FJ7A 1VFEA 2ALUA 2R71A 2E1SA 3OOAA 5H8NA 1ZMGA 3OD7A 1SVXB 1R1NA 4GLIA 3UORA 3DELB 2ZYNA 3MZ1A 4GL0A 2Q9TA 3PD9A 5AA2B 1ATGA 3V5AA 4NEDA 1PB9A 3K6WA 4OZ9A 3CFXA 4RJZA 2H5YA 4ONYA 2VD2A 2QSXA 4X1DA 4G4PA 1VE4A 4DXBA 3O97A 3IR1A 2DE4A 4AB5A 3CSBA 3OO7A 1N3XA 3N5LA 2F35A 1WDNA 5DVFA 3OEKA 3H6WA 1LB8A 2THIA 2QS3A 1GV8A 1D4NA 1IQ7A 3IO6A 3VXBA 3SERA 4DZ1A 4H67A 4R74A 3PD8A 1A99A 2O68A 4XKQA 2Y7PA 2OK2A 4G8MA 1B5HA 5L8DA 4DXCA 2XXTA 3GLBA 4FAJA 3Q27A 2OLBA 4IO7A 1RYXA 3C35A 3VVFA 4KHZE 5K2XA 1M5CA 4R6KA 3KGCA 5BWJA 1GGGA 1D3KA 4OYVA 4E0XA 3HHGA 2F97A 2UYEA 4OXVA 1PC3A 5EHMA 2DVZA 4K3FA 4JWYA 4OWDA 3FUZA 5TU0A 3CSGA 3MZ9A 1XVXA 3DP6A 3FZVA 4RNSA 2Y7RA 3TMGA 3SEYA 3TPAA 3K6VA 1YPNA 1Y3NA 1O7TA 1YTVA 2AIXA 5ELVA 3TQWA 2VP1A 3SESA 1FTKA 3QAXA 1US5A 2ESNA 4DXUA 2PT2A 4DE8A 3GBAA 4H5GA 1I6AA 1HSJA 4LONB 1MY0A 3ZSFA 4POWA 3ZKKA 5IKBA 3IOWA 4ZZAA 4KI0E 4U21A 3THIA 4FEBA 1MH4A 2UXAA 3RPWA 3G3HA 3CVGA 4F1VA 2DXRA 3PPPA 2REGA 3SETA 1UIVA 2P1SA 2NUVA 3MVYA 4NF6B 3N6TA 2XXRA 4X9TA 4PQJA 4POXA 1LLSA 1ZTYA 3C34A 4OFOA 1PBQA 3T93B 1YAEA 2AL5A 3MJNA 3PUZE 3MWBA 2D3IA 3IAZA 2NVUB 3N94A 3C4MA 1B6HA 1ZKBA 1O64A 2DVCA 1RKMA 1B46A 3TODA 1NNFA 5I57B 4YB7A 4FEDA 1AL3A 3MVXA 4NF5B 2AL4A 2F36A 4RXLA 2Z8DA 2QS4A 3MC2A 2RF1A 4F2QA 2ZYMA 2Y7KA 2XX8A 4N6PA 4QRZA 3CIJA 5I2KA 2VHAA 2GHBA 4EXLA 3K00A 1B4ZA 3FVOA 3MQ9A 1LBCA 1CE2A 5HPQA 1BTJA 3K1NA 2HZLA 3MUQA 3G3GA 4G68C 4H1XA 5H8QB 5L9OA 2O7IA 3H03A 2HFBA 4AQ4A 5FTHA 3H6VA 3B7DA 4PP0A 1FQDA 2XXXA 3M3LA 1IZ1A 2XX9A 2F7AA 4YKJA 3KEIA 3UA8A 5I58B 2OJTA 4OVJA 3T22A 3QK6A 3RN8A 2H99A 3G7WA 5DT6A 3WAFA 4JDFA 4HCYA 5I2NA 4G8NA 1OQHA 1JEUA 4NF4B 1MS7A 4KCDA 5AA3A 5CM6A 4F31B 4I62A 1US4A 1SYIA 3SEWA 2Q2CA 4ESWA 1QW0A 4JSDA 3LBSA 1NNPA 3MBPA 2XD2A 1QKBA 3VE1B 1MPCA 1OQGA 3PPRA 1SI0A 5ICQA 1JW1A 2B3BA 4PFUA 2UVHA 4MLQA 1B0LA 4LZ8A 2NXOA 3GZGA 3AXFA 2E0SA 2YPNA 2ZMBA 4PETA 2R9JA 2H98A 1FTJA 1H45A 1I6BA 5HM4B 2IEEA 2HXWA 4LQ5A 1DSNA 2O1LA 4KFQA 4TOZA 4KPTA 4OQOA 3O28A 2I4CA 1IIWA 5AA4B 4EQBA 2A5SA 1A54A 4ELOA 3FVKA 3N26A 1QVSA 5AA2A 4NMYA 3H4ZA 3KOTA 4YKKA 1NNTA 4Q5TA 4GOTA 1VFDA 3Q25A 2DWAA 4TQUQ 5TP9B 1QKAA 2X7PA 3EHSA 3VLUA 3H06B 4EQ7A 3O6IA 4WXJA 3KFMA 3PMXA 4JXIA 4LP2B 2O1MA 1AIVA 4FE8A 1WODA 1QULA 3TTRA 1SBPA 3E9XA 1MXUA 3BBRA 2ZNUA 4XXUA 3TDJA 3I6VA 4F19A 5CI5A 3FGSA 2Y7IA 1MH3A 2DP8A 2ZYKA 3A3CA 4GQOA 1IXHA 3O66A 3BFUA 4IY6A 3ILTB 1IXIA 2QJEA 3DP4A 3DP8A 2PMSA 4RYAA 2Q2AA 3IOVA 4KR5A 3WAEA 2OBGA 3C31A 3DLNA 4YKPA 3U72A 5I2NB 2Z8FA 1N84A 3N6UA 4YB6A 3QXMA 1ZLQA 2V84A 3ECRA 1JEVA 3TCHA 1MY1A 4TLMB 4RA1A 1LBBA 2UVIA 2CMOA 3TFLA 3TELA 4U1ZA 3FXRA 2QRYA 4OFLA 4R9GA 1UTBB 4UA8A 3O2AA 2XXHA 3D4GA 4XTCQ 3U94A 1Y20A 1N76A 4YU0A 2I49A 1R9QA 3ZKLA 2FNCA 4BDQA 2RC7A 4NWCA 3TEPA 2PT1A 1LAXA 4QFKA 3H3GA 1GR2A 5HBCA 1IXGA 3HO7A 4YICA 4DIGA 1MXYA 4FORA 2DYXA 1OLCA 3PV0E 4ZEBA 3RLFE 3EHTA 4KQPA 1A8EA 1MY3A 4QFNA 5CMMA 4JWXA 3MW0A 4GL8A 5CC2A 1ELJA 5CMKA 1BKAA 3ZS6A 1OMPA 2UVJA 1B2HA 4QSEA 3CG3A 4RK9A 1QUKA 4NF6A 1MM7A 4I8CA 4YZZA 3G3IA 3JZJA 3OELA 4KYEA 1H44A 3CR9A 3FJGA 1B5JA 1B3GA 4ELPA 4IO5A 2Q88A 3IB0A 1S7YA 3QUFA 3UGWA 4N07A 5I57A 2A5TB 4NF5A 1POTA 1XOCA 3U93A 2QMXA 3MPLA 4MLVA 1UTHA 2VGQA 3K1MA 4I9DA 4OEVA 4Z0IA 4EF1A 3OXNA 3EN3A 2G93A 3R7XA 4OERA 4NF8B 3QUJA 1LB9A 4GXSB 1A7LA 3TQLA 4R2BA 5H8QA 4KYDA 3EPEA 4OESA 1P1OA 1SW4A 4ZDMA 3UP9A 3ONMA 3TKDA 4XKRA 1Y9UA 2REJA 2OZZA 4NWDA 2F6PA 1MQIA 3BKIB 1BLFA 3FXUA 2V25A 1B5IA 4U4SA 5I58A 4BDMA 1LAHE 1II5A 1AMFA 2FYIA 4IO4A 5AA1A 1XHYA 2HCAA 4THIA 2CZLA 1JQFA 2DE2A 1B1XA 3IO4A 3KSJA 4NF4A 1FTOA 2YLNA 5H8SA 2BJJX 5FHOA 4TLLB 4DLDA 3VVEA 3MPKA 1B3FA 2P0SA 4LZ7A 3OMBA 1MQDA 1NH7A 1DOTA 1SDXA 1ZU0A 2X26A 3IK6B 2NWJA 4BLAA 3FVNA 1WVJA 1M5EA 4ESXA 4RPNA 2HZKA 3H6TA 4I1DA 5L9MA 2XX7A 2DWHA 4HTGA 4ELQA 4G8HA 2PYYA 3ODBA 3K0VA 2DQVA 4X1BA 3W15C 1D9VA 1SW5A 3A3UA 3T9VA 5F7VA 3TYHA 1MDP1 5AA4A 4H8IA 4XKPA 4ECFA 3UIFA 1UTHB 4GXAA 3CG1A 4AB6A 1XC1A 1B05A 2XXUA 1FTLA 3IL1B 5TP9A 1CB6A 2DXYA 4R72A 1IXCA 1MQGA 4E0WA 1JW4A 4Q30B 1FTMA 2PX1A 3HPIA 5EHSA 4OENA 4R75A 5BUUA 3TTKA 5I59A 5JTYB 4JB7A 4LVQA 3RQTA 3G3KA 3HN0A 3FV2A 5DVJA 3UK4A 1BIYA 4F1YA 2Q8JA 1LFHA 4BDOA 4HCWA 5ITOA 2F7CA 4IB2A 1RYOA 1OVBA 5KCJB 1NMUA 4NTLA 1TWYA 2VD3A 4P11A 4XIGQ 3B6QA 2D21A 4YMBA 3Q26A 4U4XA 1R9LA 3MVZA 4KYSA 2XXIA 3T66A 2GH9A 3FASA 3RGYA 1MY4A 4H5FA 2OCUA 3T9HB 2F5XA 3L6HA 3MAMA 2O51A 1L5TA 3LC8A 1SW2A 2XXPA 4Z7EA 4H65A 2DS9A 4C1TA 1PDAA 4YAHX 3IB1A 4P0IA 4F3BA 5FTIA 1UTBA 2I48A 5EYFA 3E4RA 1B7ZA 1EH3A 3FIRA 4FIMA 1B40A 1M5BA 3OO6A 2F34A 3PPOA 3T9UA 2GRVA 1T0KA 1SYHA 3QYTA 3G3FA 3K01A 3VLVA 3EQ1A 3OO8A 4U23A 3VFJA 2KLFA 5F1QA 1Y3QA 5IAIA 2I3VA 3IB2A 2IA4A 2V3TA 3U8QA 3BFTA 4DCXA 3MP6A 1DTZA 1S50A 4G68B 3LSLA 5M2VA 1URGA 3TCGA 3KSXA 3PUYE 2ANJA 1EZ9A 3PPNA 4RPOA 3HV1A 1MQHA 5I84A 3PMWA 5I59B 3K2DA 5CBRA 1B3LA 4HS7A 3LUYA 1MQJA 1JW5A 2HQ0A 4ZEIA 1N0TA 1MM6A 1NNKA 1LGBC 4F29A 2Y7WA 2A5TA 3SDFA 3PUXE 5J1DA 5ISUA 3SKPA 1Q1KA 2Z8EA 2FA7A 3OEMA 2I58A 2Z22A 3TTMA 1JVYA 3CI8A 4N13A 1P99A 1FQFA 4RK2A 5JEIA 3RT8A 2RC8A 4MH5A 4GIZA 1Y1MA 1FCKA 3K1PA 4NF8A 1SI1A 4O3CA 2VOZA 4PE5B 1MXZA 1DPPA 4FJPA 3PGFA 3TTLA 3M8UA 3PUVE 3R6UA 4QSCA 4WEPA 1EZPA 2RCBA 3MZBA 3S9EA 4EF2A 1SW1A 2OWTA 2V93A 3GXAA 1H3DA 3ILUB 4OETA 4ZEDA 4F39A 1MPDA 3M3FA 3HCQA 4ZS9A 2RINA 1B3HA 3LSWA 2HAUA 1AH5A 1YCJA 3OSRA 4ZEFA 4UACA 3T96B 5LOMA 2F78A 3KJTA 3IJXB 2GHAA 4ZE9A 4F22A 4H0WA 3S9NC 4OTEA 1HSLA 5H8HB 3VLWA 3TUSA 2X7QA 4QFLA 3SEUA 3TAJA 4M4GA 4YB5A 5AE4A 4R9FA 5CMBA 1POY1 4GRKA 1URDA 5DTBA 1VR5A 2H25A 4LZ5A 1N7WA 1B58A 3RT6B 5H8FB 1Y3PA 2H4IA 1TT1A 1MXVA 5TPAB 1ANFA 1Q35A 5KZTA 4QHQA 5L9SA 3EF7A 4GFRA 4QF9A 2QMWA 2XXQA 1MPBA 2ZXTA 3IX1A 2WKYA 3CFLA 1H43A 4WEDA 3S2VA 3HHFA 1D9YA 2I3WA 4KCCA 5DYHA 3KOSA 5CRYA 1PEBA 3E3KA 4KD5A 3H6UA 1QJMA 2DSFA 3F11A 2I6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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