3C32A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with sodium at 1.72 angstrom resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A02
3A3UA 1RKMA 2Q8JA 5TP9B 3R6UA 3CRBA 4OFJA 1JVXA 2F97A 4GIZA 3IL1B 3KOSA 3G3GA 3K6VA 4XKRA 3V89B 5L9OA 3OMBA 1SW5A 4F1UA 2I0CA 4EDPA 2RKMA 3G3KA 5ITOA 1QVSA 2DE4A 2F35A 5H8NB 4YKJA 1F9BA 3W9VA 1IXCA 2OWTA 3PU5A 4X9TA 4IGTA 4R6HA 4R73A 3KN3A 3FIRA 1ELJA 1NNPA 2DS9A 1P1UA 2O7IA 2Q9TA 4ND9A 4YKIA 3RTFB 4F3SA 1B58A 4GF8A 2THIA 4OVJA 2ESNA 4ZEBA 2XXXA 3PPRA 2QS3A 1H45A 4IO6A 4QFPA 3T9UA 3TDJA 3U72A 4ELQA 5I58B 3T96B 1NH8A 2UXAA 3H6WA 4YB6A 1MXWA 1IXGA 5DT6A 4Z0IA 4JWYA 1B3GA 2XXHA 1P1QA 1ZBMA 3EQ1A 1MG1A 3H06B 4F1VA 5I56A 1T0KA 4G2ZA 2BJJX 1Y4TA 1B46A 2AIXA 3MP1A 4R75A 5DVJA 5HBCA 1EU8A 3S2VA 1CB6A 4IGRA 3SEYA 3VVDA 2NWJA 5CRYA 1A54A 1NNKA 5I58A 1MPBA 2PMSA 2V25A 4QRZA 3UORA 2NUVA 3R7XA 2GRVA 3IOTA 5H8FA 4XTCQ 4OHNA 1FQBA 1MY4A 5EHSA 5KCJB 3G7WA 4QFOA 4QSCA 4R9GA 3RT8A 5TPAB 3WAEA 4U21A 3GXAA 3OSRA 1ZTYA 4ZEIA 2F6GA 3THIA 3VLWA 3ECRA 3TQWA 3JZJA 4LUBA 3RY3A 2XXQA 2ABHA 3HO7A 2VD2A 3QUFA 5CI5A 3SDFA 1US5A 4H5FA 1DTGA 1NFTA 1ZIUA 2HEUA 2YJPA 1OMPA 2UVIA 5TPAA 4F18A 1B0LA 3G3JA 3WAFA 1QUJA 2DP8A 4HCWA 4QFLA 2DVCA 1MY1A 1Y1MA 1Z7NE 1UIUA 3I6VA 3OO8A 4X48A 5CMCA 1SBPA 4QFNA 2CMOA 4QF9A 4PQJA 1OQGA 3UN6A 3HCQA 4YKPA 3KSXA 1SVXB 3PD8A 4ZEFA 2B3FA 1B1XA 2DOJA 4R74A 1VFEA 5HPQA 2V84A 1ANFA 4FIMA 2OCUA 4KQPA 4OQOA 5I2KA 5H8QA 1R9LA 1B3LA 4EQ9A 5L9SA 1S50A 2Y7WA 3M3KA 2O68A 5JK4A 2RINA 3U8QA 1ZKBA 4DXUA 3U92A 2F7BA 5I84A 1HSJA 2RC8A 4U1OA 1N84A 1N76A 1TFAA 2D5WA 2XXRA 3QYTA 4RA1A 3ZKLA 3M3FA 2OWSA 4C1TA 1B4ZA 3VDFA 2XX7A 3FVOA 1BP5A 1OLCA 2OZZA 1N3WA 2ALUA 2UVJA 3MP8A 4GXSB 4U22A 5DYHA 5JTYB 3MPLA 2ONKE 4R6KA 1AMFA 4YICA 3TCFA 3V8XB 3USDA 3PUWE 4GWOA 1YAEA 2NVUB 4ECFA 1XHYA 4DLDA 4FE8A 4EUOA 2P1SA 1US4A 2OLBA 1AL3A 3FV1A 3PMVA 2XD3A 1FQCA 2XXPA 1FTKA 4G68A 4GFRA 4OEVA 4ONYA 1GVCA 1MQJA 1NNFA 1ZLQA 2WKYA 3MW0A 3FZVA 3TODA 4DXCA 3W9WA 3CFLA 4FATA 2I6EA 4O3AA 4RYAA 5K2YA 4OESA 4AB5A 4OENA 2XX8A 1IEJA 4LVQA 3RT6B 1Y3NA 1B5JA 1TFDA 4YKKA 4EF2A 2FA7A 1EH3A 3FXRA 3GZGA 3I3VA 3OELA 4NF5A 3VXBA 3LSWA 1S7YA 4H65A 3SETA 4ZE9A 1YPNA 1A99A 1A55A 2QJEA 3D4CA 2QMXA 3K00A 1ZJLA 3RNNA 3TYHA 5CMBA 4ZEDA 3E3KA 2DXYA 3G3HA 4JWXA 4RPNA 3V5AA 5CMKA 2XX9A 3PPQA 2RC7A 3IK6B 4I8CA 3UGWA 1LAHE 2QPQA 2NOOA 4LONB 3V83A 4YB5A 1IXHA 4F2QA 1D4NA 1HSLA 4Q0CA 3MZ1A 1SYIA 1TXFA 3LUYA 1I69A 2HZLA 1B05A 3KJ7A 1B6HA 4JDFA 4NE4A 5AA3A 3HHGA 4H8JA 4M1VA 4ZECA 1YTVA 3JV9A 1II5A 2ANJA 3MAMA 5AA2D 4RK9A 1POY1 5TP9A 4H8IA 1UTHA 5KDTB 1RYXA 4ISUA 2DQVA 5I56B 3T22A 4E0XA 4DCXA 3PMXA 2I48A 2ZNSA 3O2AA 4GOTA 4G68C 3H4ZA 4KYDA 4R9FA 2DXRA 2AL4A 4PFTA 1M5EA 4O3BA 3OSQA 4P11A 2PYYA 3BFUA 1PC3A 3MC2A 4IB2A 1FTLA 3OO6A 5KCJA 3PUZE 1SI0A 1WDNA 4WEDA 2O7UA 4H5GA 1VR5A 4IO4A 2V3QA 2A5SA 2HZKA 2V93A 2XHDA 4Z7EA 3PUYE 4G8HA 4DXBA 1GR2A 3P7IA 2P2AA 3OENA 3IJXB 3FJMA 1B3EA 1H3DA 4EQ7A 1M5DA 4LQ5A 5EHMA 2RC9A 4R2BA 5BWJA 3VV5A 1B32A 2KLFA 4F31B 4N6PA 4NF6A 2GHAA 3K6XA 1FTJA 1USYH 3E4RA 3MVYA 1LSTA 3KBRA 3ZS6A 2HAVA 1AH5A 3L6GA 3L6HA 4G4PA 2ZYOA 1N04A 2UYEA 4RJZA 4PFUA 1B40A 1FQAA 1JW1A 4POWA 3GLBA 3T9VA 4F3PA 1TT1A 1P99A 3TTNA 4POXA 1OLAA 4DDDA 1TWYA 3S4UA 5ICQA 5CMMA 2H9BA 4Q8RA 1IZ1A 3CFZA 4EQBA 1FW0A 1URSA 5CC2A 2Z23A 3IB2A 3Q28A 1O7TA 4NF6B 4JSOA 3TMGA 3W15C 2H99A 2NXOA 3EF7A 3GBAA 4GVOA 2DWJA 4NWCA 4NF4A 5KZTA 2LAOA 3C35A 1SQYA 1MDQA 1N3XA 2QMWA 3BKIB 2HCAA 5CBSA 1JETA 4ZDMA 3LBSA 3BBRA 2DWHA 2X7PA 5FHNA 1MQGA 3OO7A 3MUQA 3TKDA 3UK4A 4YAHX 4F22A 2B3BA 2PBWA 1R9QA 3B7DA 3IAZA 2OJTA 4UACA 4OFOA 1PDAA 1SW1A 1Y20A 1IQ7A 3SKPA 1AIVA 2PX1A 3O9PA 2GHBA 3PV0E 4MH5A 4XIGQ 1KWHA 2V3UA 3HHFA 5A5XA 4IY5A 3FV2A 1R6ZA 1MM6A 4RK2A 2GFEA 1YCJA 2B65A 3C31A 1FTOA 1GGGA 1PBQA 1MY0A 2I4BA 3O29A 4H67A 3RTWB 2Q2AA 2DSFA 5AA4A 1B51A 1ZU0A 2XXTA 4U2RA 2PT2A 4NF5B 4XKQA 1XS5A 3E13X 2I49A 3K1PA 1XC1A 3PPOA 4ZEKA 5I59A 2F34A 2Y7PA 5CM6A 3H6UA 4F2OA 3RPWA 4OEUA 3VLUA 2Z22A 3G3IA 4PETA 1UIVA 2I4CA 2UVGA 3FUZA 4HS7A 4TOZA 1D3KA 4L17A 1Y3QA 3FJGA 1DPEA 2A5TB 2PVUA 2RF1A 4NEDA 4H1XA 4LP2B 2OBGA 4FEBA 2R9JA 4I9DA 3M8UA 4X1DA 2DYXA 1UTBB 2IA4A 1LCTA 2ZYMA 1B9JA 1NNTA 3MZBA 1NH7A 4KD5A 3SEVA 3TCHA 1Y9UA 2F7CA 3SEUA 1QKAA 2Q2CA 1QUIA 4KFQA 3LSFB 3O6GA 4RY1A 5FHOA 2GH9A 4IO5A 4DIGA 4OXVA 4P0GA 1M5BA 2Z8DA 3KN7A 1B7HA 1JNFA 3DP8A 2VGQA 3K6UA 1MQDA 3MQ9A 2F78A 4BDLA 1WVJA 1XOCA 1JEUA 1QUKA 1UTBA 3O6IA 1FQDA 3CFXA 4N07A 4NWDA 4EXLA 1B7UA 3RGYA 4EF1A 1IUDA 1EZPA 4NF8B 1M5FA 1B5HA 2DWIA 4O3CA 3T9HB 3ZSFA 1O63A 4WXJA 4MLVA 4LATA 3LSLA 4GRKA 3RLFE 5BUUA 2XXWA 3C33A 4ELRA 1LB8A 3PD9A 1FQFA 1LAXA 1MPCA 1P1OA 1Z7ME 2XXIA 3BFTA 1N7XA 3CVGA 3C34A 3MBPA 2R71A 3TAJA 3VFJA 5DEXA 3B6WA 3G3FA 1JQFA 3RUMA 2FYIA 5B7DA 3M3LA 2QRYA 3IOUA 3N6UA 2VD3A 4TQUQ 1JW5A 4ESWA 1I6AA 1UTHB 1OQHA 2O1LA 1H76A 1HSEA 1QKBA 3MZ9A 4Q30B 5LOMA 2YPNA 2ZMBA 5ITPA 1LBBA 2DE3A 2ZNTA 4F3BA 3H6TA 2G93A 1S9TA 4FAJA 3QK6A 5ELVA 3OO9A 5H8SA 5H8HA 3DM0A 3OEKA 3PPNA 3TTMA 3U1OA 1QJMA 1VSOA 2G29A 1JVYA 1O64A 3K0VA 4OERA 1DTZA 3MWBA 3EHUA 3CG1A 1LAGE 4U23A 1PBPA 4F39A 3EPEA 3S9MC 5I57B 3S9NC 1D9YA 4E0WA 3U94A 3IX1A 1BKAA 3DP4A 2ZYKA 1VE4A 4NTLA 4G8NA 3N6TA 4KI0E 2W7YA 2I3WA 2XXVA 2DVZA 2E1SA 3FGSA 5H8FB 2I3VA 1IXIA 1PB9A 1R1NA 2I58A 3CSGA 3IB0A 2ZNUA 1B3FA 1B5IA 1FTMA 2F8DA 3KOTA 2DWAA 4G77A 4K3FA 4KYSA 5I57A 1SDXA 1LB9A 4R2FA 5DVIA 3PPPA 2Z8FA 3TELA 3MVXA 5H8QB 3UA8A 1MXUA 4AQ4A 1N7WA 3Q29A 3IOVA 1MXXA 1LGBC 1A40A 3F11A 4F1YA 4XKPA 3N5LA 3B6TA 2QS1A 5FHMA 4ELOA 3O28A 4ELPA 1H43A 4FORA 3QAXA 1DSNA 1JW4A 3TTLA 3H3GA 1MXZA 3H03A 5AA2B 4M4GA 4GLIA 4I62A 4U4SA 5FTHA 1UQWA 3DELB 1LFGA 2RCBA 3QUJA 4NF4B 2VP1A 3U93A 4AB6A 1WODA 1B3HA 3OOAA 2ONSA 3IO6A 1MY2A 2CZLA 4MBPA 4GL0A 1POTA 1H44A 5F1QA 1QULA 1Q35A 3PGFA 5AA2A 4ZZEA 3MP6A 2QSXA 3D4GA 4THIA 4TLMB 3O66A 3PUXE 3TPAA 4BDQA 5J1DA 3C36A 2X7QA 3FVKA 2RCAA 1DOTA 3FVGA 2UVHA 4JBZA 4DZ1A 1MXVA 1MXYA 1N0TA 1USYE 2D3IA 5H8HB 4GD5A 3KGCA 3TTKA 3TEPA 2I0BA 2F6PA 2P0SA 4GQOA 1B2HA 3K02A 5AE4A 1Q1KA 4XXUA 3FXUA 3MJNA 1ZMGA 3IJOB 4NMYA 3O6HA 4KCDA 4R6YA 1I6QA 1PB8A 4C1UA 4EXKA 3JYRA 3PUVE 4G68B 3EHTA 4H6DA 4ZZAA 1OIBA 2VHAA 1EZOA 1Y4CA 3DLNA 3H6VA 1MRPA 3HSTA 1VFDA 3A09A 3KG2A 4YMBA 2UYFA 2F7AA 3FXQA 3MVZA 4KR5A 4MLQA 4NF8A 5EYFA 3K6WA 2A5TA 3VXCA 3CIJA 1NL5A 4OETA 3FATA 3FVNA 3Q26A 5F7VA 1LCFA 1MH4A 3SERA 4H0WA 2M8CA 2ONRA 3FJ7A 3HN0A 1J1NA 2Q89A 1M5CA 1LBCA 2XXUA 1XVXA 3OEMA 4JSDA 4RXLA 1L5TA 4BLAA 3AXFA 4YMAA 5B70A 1B1HA 4R72A 1A8EA 2YLNA 4YB7A 3TCGA 3S9LC 3K01A 4KYEA 1A8FA 3LC8A 1QW0A 2Q88A 2X26A 2Y7RA 4KPTA 5DTBA 3VVFA 4DE8A 4WEPA 1CE2A 1JEVA 2HQ0A 2O51A 2QS2A 3H7MA 4OMBA 4C0RA 2E0SA 2Z8EA 4PE5B 4UA8A 3C4MA 4U4XA 4F29A 5H8NA 2HAUA 4FEDA 3CSBA 5CBRA 2Y7IA 3TUSA 1D9VA 3C9HA 3S9EA 4ESXA 1BLFA 2QL3A 1XVYA 2AL5A 5KDTA 2QS4A 3QSLA 4IO3A 3T93B 4F19A 2H5YA 4YZZA 3I5OA 4U1ZA 1PEBA 1BTJA 3ILUB 4IO2A 4ZS9A 3RQTA 4QHQA 5HM4B 3K2DA 1MS7A 1P1NA 3EHSA 5L9MA 5DEXB 1AOVA 3VLVA 1B7ZA 1B52A 3TTRA 1B0HA 2REGA 4GL8A 4IO7A 2H25A 4P0IA 5IAIA 1FCKA 3LR1A 3QIMA 3TQLA 4BDOA 3CR9A 3K1NA 1BIYA 3KEIA 4N13A 3SEXA 2O1MA 1I6BA 4LA9A 3TFLA 3TZAA 3MPKA 3HV1A 5DVFA 4PFWA 1MDP1 3ODBA 1SW4A 4JB7A 3VE1B 4DCYA 1SW2A 3FASA 3ILTB 4LZ8A 1SYHA 3RN8A 3HPIA 3GBBA 3E9XA 1MY3A 4KHZE 3Q27A 3IB1A 2PT1A 4PP0A 3UP9A 4ZE8A 2O84X 5M2VA 4I1DA 1Y3PA 3EN3A 4LQ2A 1MH3A 4GXAA 3KSJA 1IITA 1MPDA 1RYOA 2Y84A 3KJTA 1DPPA 3ONMA 4G8MA 4JWOA 4OFLA 1GTKA 4PFYA 3T66A 2ZYNA 3KFMA 1DMBA 4OYVA 3N26A 2V3TA 3LSXA 1B4HA 1MQIA 1URDA 2H98A 4LZ5A 4Q5TA 3R26A 4F3GA 1A7LA 1MM7A 4RNSA 3CG3A 4RPOA 3C32A 4MFIA 2REJA 3DP6A 4OTEA 3KN8A 3B6QA 5ICTA 3IR1A 4OWDA 3UIFA 1EZ9A 2Y7KA 3OD7A 5JTYA 1P1WA 3K4UA 3T9XB 4HCYA 3A3CA 1XT8A 3ZKKA 5JEIA 2F36A 3KZGA 3O97A 1LAFE 4BDNA 4IY6A 1NKXA 4KCCA 1GV8A 5I59B 4YU0A 5AA1A 2D21A 2R6GE 2XD2A 2FNCA 4QSDA 4BDRA 2H4IA 3MVWA 5K2XA 5I2KB 2XXYA 3SESA 3N94A 1URGA 1NMUA 5ISUA 3CI8A 4HW8A 2HXWA 3IOWA 2VOZA 1OVTA 3Q25A 1PB7A 3VVEA 2OK2A 5A5XB 1LFIA 4MF3A 4QFKA 1FQEA 4OZ9A 2IEEA 3K1MA 3SEWA 5I2NB 5IKBA 4JXIA 3IO4A 4X1BA 3OXNA 4HTGA 2F5XA 3FD3A 5AA4B 1SI1A 2AYSA 1OVBA 4BDMA 4FECA 3PMWA 3IORA 5FTIA 1MQHA 1SD3A 2ZXTA 1IIWA 1LFHA 4XKNA 5I2NA 1ATGA 1Y1ZA 3QXMA 1LLSA 4FJPA 4TLLB 2O69A 4QSEA 4WKMA 5L8DA 2O6AA 5TU0A 2HFBA 2DE2A 4LZ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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