3C33A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with potassium at 1.78 angstrom resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c33A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c33A02
1Z7NE 4JB7A 2F36A 3PD9A 4GIZA 1MH3A 3U8QA 1NNPA 5BWJA 1Y3QA 3GZGA 2RCBA 1B3FA 1B58A 2NWJA 3TMGA 1VE4A 1DTZA 3R6UA 2X26A 3B7DA 3UP9A 3PPRA 2RKMA 1LB8A 3SESA 3DP8A 2VHAA 3E13X 1JW4A 3Q28A 3G3FA 4FEDA 4OWDA 1QULA 4U4XA 4R6YA 5DTBA 4N6PA 4G68C 3RQTA 2Q2AA 2P1SA 3MUQA 1Q35A 4ELQA 4DLDA 4NE4A 2KLFA 4BDNA 4KFQA 2I6EA 1WDNA 4OVJA 3K6WA 2NUVA 2ONSA 1TFAA 2R9JA 3MVXA 3QXMA 3G3JA 2HQ0A 2A5SA 4O3BA 3G7WA 4QHQA 3GXAA 1GVCA 2UVIA 5H8NA 1PB8A 1MDP1 5I2NA 3S9NC 1MY1A 3TUSA 4OZ9A 3KSJA 4U22A 2M8CA 2I4CA 4GF8A 1AL3A 1LB9A 2XXWA 3G3HA 4XTCQ 5AA2D 4OTEA 4RPNA 5AA2B 4R75A 4FECA 3RNNA 2NXOA 2H98A 1ZBMA 3T9XB 4IO5A 2I49A 1B7HA 1MM6A 3IORA 3H7MA 1XHYA 2HAUA 4EQ7A 4OHNA 3IL1B 5DYHA 1FQBA 5ITPA 1VFDA 1B3LA 1MXYA 4P11A 5L8DA 4YKJA 2B3BA 1B2HA 1FTOA 3U72A 1N84A 5AA3A 1AOVA 3A09A 5A5XB 3O97A 3PD8A 3TTRA 2F34A 1IITA 3JZJA 4MLVA 4N13A 1B3GA 1R1NA 3I3VA 3N94A 1LAGE 1ZMGA 1P1OA 2F7BA 4QF9A 5ICQA 1XVYA 2Y7PA 3K1PA 1LCFA 2RCAA 4F1UA 5ELVA 1PEBA 1HSEA 2UVGA 4R6HA 3VV5A 3LSLA 5DT6A 3O6HA 3K01A 3HHGA 2WKYA 1LAFE 2QL3A 3KOTA 1B1HA 4ZZEA 1UIUA 1PBPA 3H6UA 4EXKA 1B5JA 3TODA 3A3CA 3OOAA 1VFEA 3H6TA 1LAHE 4K3FA 4POXA 3MVWA 1A8FA 2GHBA 4H8IA 3O66A 1USYH 2CZLA 5LOMA 4KYEA 3FV1A 4DCYA 4LQ2A 4YICA 3DP6A 4OQOA 1OQGA 4EQ9A 1HSLA 3CFXA 2HZLA 3O2AA 5JEIA 1T0KA 1B3EA 3TCGA 1MQJA 3KBRA 4M4GA 3O6IA 4THIA 4ZE9A 2ZNUA 3EHSA 3PMXA 2H9BA 4N07A 1MY4A 1IXIA 1MXVA 4YMAA 1MXUA 4ELOA 4X48A 4ZEIA 1US5A 3SKPA 5ICTA 4U4SA 3V8XB 4FJPA 4ECFA 3U93A 2OZZA 3MP6A 2Y7WA 5IKBA 3MJNA 3USDA 4OMBA 1MDQA 2DWHA 3I6VA 3KN7A 3O9PA 4FEBA 3TCFA 3ILUB 3WAFA 3QAXA 5AA4B 2F97A 1MPCA 1B0LA 1LLSA 3TAJA 1OLCA 3D4GA 4NF6A 1RKMA 3MWBA 2HXWA 5CM6A 5KCJB 2Z8EA 3TPAA 4R73A 4U23A 1IZ1A 3UORA 4BDLA 3MZBA 4OXVA 1B6HA 3FATA 3C32A 1LBCA 5TP9B 4PE5B 1ZIUA 5JTYA 4KHZE 3PMWA 2XX8A 5ITOA 3ZSFA 1B51A 4Q30B 4IO4A 3QSLA 4L17A 4QSDA 1B46A 1URDA 1UIVA 2O1MA 5L9MA 4H1XA 3H03A 4DE8A 1TFDA 3RGYA 4ZECA 4IB2A 1SD3A 3VDFA 4C0RA 5FTIA 2PX1A 3KN3A 4LVQA 4BDMA 2Y7IA 3Q26A 3N5LA 2F35A 3LSXA 5ISUA 5TU0A 1H3DA 4MFIA 4F39A 1A8EA 5EHSA 4M1VA 3MVZA 5FHOA 2G93A 4JSOA 3SERA 3VVDA 1ZLQA 3VLWA 3K4UA 5HM4B 3KJTA 1IQ7A 5CC2A 1UTBB 4H65A 1JVXA 4YKPA 2B3FA 1B05A 5EHMA 3DLNA 5FHMA 3PPOA 3E3KA 2YPNA 1B5HA 2G29A 3FVGA 3FVKA 1OVBA 4JWOA 4OFLA 1P1UA 4RYAA 2VD2A 4HS7A 3BBRA 4FAJA 1QVSA 4O3AA 5EYFA 4ZEDA 2XXXA 3ONMA 3IOWA 4KYDA 4G8MA 2QMXA 3TKDA 4QFLA 2RF1A 3KEIA 2XX7A 4F2QA 3R26A 3W15C 1B4ZA 2B65A 1LFIA 1O7TA 3H4ZA 5I2KB 1YTVA 4F1VA 1Y1MA 2VGQA 3IAZA 3RPWA 5H8HB 3P7IA 5HPQA 3KN8A 1Y9UA 4H8JA 3RY3A 2H4IA 4H6DA 4HCYA 3M3LA 4F18A 4BDQA 4F22A 1B32A 2OWSA 4KI0E 1N3WA 3E9XA 1A40A 2QS3A 5AA4A 1XT8A 2XXYA 4NMYA 1S7YA 1B9JA 1USYE 5CMMA 1MQGA 3D4CA 5TPAB 2ESNA 2YJPA 3UGWA 2Q2CA 3PPNA 5TP9A 4WEPA 2F5XA 3M3KA 4LATA 4R2BA 3F11A 3MZ1A 1P1NA 4Q8RA 3SETA 3CFLA 3N6TA 3UIFA 2O6AA 3I5OA 2DP8A 2I3VA 5I59B 1P99A 3CRBA 1NFTA 1POTA 4PFWA 2NOOA 2PT2A 4TLLB 4F3BA 4Z0IA 1MM7A 3LUYA 1F9BA 4POWA 3PGFA 1NNTA 1NH8A 1BIYA 4AQ4A 3TTMA 2DE3A 1NL5A 2P2AA 1QW0A 2HEUA 2VP1A 4IY5A 1MXWA 3TQWA 1FQCA 3QUJA 4HTGA 4AB6A 1J1NA 3T9UA 3OEMA 3PUXE 4JXIA 5KDTB 5CI5A 1JVYA 3IX1A 1XVXA 4ND9A 4YU0A 4Q0CA 1Y1ZA 4F29A 3K1MA 3PPPA 1SW4A 3MAMA 4RK2A 2F8DA 3BKIB 1QKAA 3O28A 3V83A 2QSXA 5JK4A 1POY1 1WODA 1RYXA 1Y20A 1LFGA 1LCTA 1ZKBA 4QSCA 2F6GA 5J1DA 4P0IA 2ZMBA 4QFNA 3S9EA 4RPOA 3FJMA 4NF5B 3IOVA 3FXRA 1QKBA 1SDXA 3FASA 1B1XA 3IK6B 1S50A 2DS9A 5L9OA 1LGBC 2Z8DA 5DVFA 3VVFA 5F1QA 4OYVA 4RNSA 1EU8A 3CSBA 3JYRA 3LC8A 5CBSA 3GLBA 3RN8A 5I2KA 1JW5A 4RA1A 1TT1A 4X1DA 5K2YA 2DVZA 4GLIA 3MZ9A 5H8HA 3CG3A 1SBPA 2Q88A 3B6WA 3RT6B 4OENA 2HAVA 1N76A 1O64A 1DMBA 2PMSA 4IO3A 3PUZE 1YAEA 3KFMA 1I6BA 4G4PA 3L6HA 4PFUA 1SI1A 1PC3A 2GHAA 4WKMA 4YKIA 2PBWA 4H0WA 1Y4CA 4ZS9A 3S9LC 5I58A 4FORA 2A5TB 5FTHA 1GV8A 2H99A 1A54A 1QUJA 3N26A 3U92A 4LP2B 4H5FA 4QRZA 4NEDA 2UYFA 2E1SA 5H8QB 4KCDA 3K1NA 3HN0A 1WVJA 2ABHA 1ZU0A 1Q1KA 4MF3A 4ZE8A 5I59A 3FV2A 1QUKA 3PUYE 3IB0A 4AB5A 1FQDA 3WAEA 2OLBA 2ZNTA 1UTHB 2I58A 2XXPA 1B4HA 3SEVA 3Q27A 3OO9A 4RK9A 2XD3A 4ZEFA 3V5AA 3H6WA 4RY1A 2D3IA 2DWIA 4TOZA 1II5A 1R9LA 5I56B 2F6PA 1B5IA 2R71A 3CVGA 1GGGA 2DOJA 4G8HA 4DXCA 4XXUA 1B3HA 3MPLA 1MY0A 2BJJX 3IJOB 2Z22A 1URSA 4JBZA 2HFBA 3L6GA 3PPQA 1MY2A 3MQ9A 1XOCA 2FA7A 3UA8A 1VSOA 3HSTA 4YAHX 3T9VA 2QJEA 1I6QA 1Y3PA 4XIGQ 4EQBA 1URGA 3UN6A 3E4RA 4NF5A 4LZ7A 5DVIA 1JEUA 1Y3NA 5AA2A 1IXCA 1JEVA 1FTKA 4NF8B 4LONB 1PDAA 1MS7A 3V89B 1M5EA 3EPEA 2D5WA 1N7WA 1MQIA 3Q29A 3CG1A 4EDPA 4YB6A 1ZTYA 3N6UA 1M5BA 3O6GA 3PMVA 4O3CA 2O7UA 2V3QA 2XD2A 2ZYNA 2DXRA 4XKPA 3K2DA 4YMBA 5A5XA 1MH4A 4YKKA 3PU5A 3PUWE 1S9TA 2F78A 1H45A 3IOUA 3OMBA 4G77A 4LA9A 2ZYKA 2ZYMA 4PFYA 3FD3A 3QK6A 3FXUA 2A5TA 1MRPA 4MBPA 3MPKA 4IGTA 1B7UA 1H76A 1FTMA 2Q8JA 1XS5A 1LFHA 4G68B 2UXAA 3QUFA 1HSJA 4RXLA 3T9HB 4QFOA 4OEUA 4DXUA 4PQJA 1CB6A 4DCXA 2I3WA 4QFKA 3KJ7A 2PYYA 3EHUA 1Z7ME 3U94A 3G3GA 4XKNA 2DSFA 3LR1A 1NNFA 4BDOA 3SEYA 2O68A 1D9VA 1P1QA 1UTHA 3RTWB 3TQLA 3KG2A 3VLVA 1NNKA 2OWTA 3VLUA 1B7ZA 1MPBA 4X1BA 3T96B 1QJMA 1EZ9A 1O63A 4F19A 5H8FB 3TDJA 5I56A 1JNFA 2GH9A 3KZGA 5H8NB 2UVJA 3ZKLA 4BLAA 3OD7A 1PB9A 4MLQA 4PFTA 4YB5A 1B40A 1NKXA 4IY6A 1M5DA 1GTKA 2O69A 3G3IA 4GQOA 3VE1B 3RLFE 1R9QA 2DXYA 3C9HA 4U2RA 5M2VA 2V84A 1TWYA 2H5YA 3UK4A 1UQWA 4NTLA 1FQEA 1ZJLA 3FVNA 2X7PA 4OEVA 3ODBA 4F31B 2I0CA 3CI8A 3OO8A 2YLNA 3S9MC 5AE4A 3HPIA 4OFOA 5KCJA 1JQFA 2DE4A 2D21A 3OSRA 5DVJA 4C1UA 1OMPA 3HO7A 4EF1A 4ELPA 3IJXB 2DQVA 3AXFA 4F3PA 1OQHA 2V25A 2THIA 1N04A 3G3KA 4P0GA 2QPQA 1IXGA 2XXQA 3MP1A 5KZTA 3MW0A 3KOSA 3LBSA 1ATGA 2OK2A 3RT8A 2ZXTA 1B0HA 2W7YA 3TELA 2VOZA 1MPDA 3EF7A 4G2ZA 1YCJA 5DEXB 1SW2A 2XXTA 2XXUA 1US4A 1FQAA 2OBGA 4TQUQ 4G68A 5CBRA 4OERA 4IO7A 3FIRA 3DM0A 4U1ZA 4Z7EA 1D3KA 4R72A 2ANJA 1UTBA 2Z23A 3C34A 4JDFA 1OLAA 1IEJA 2V3TA 3M8UA 4GVOA 1DPPA 3IB2A 3HV1A 2ONRA 3A3UA 3TEPA 3TTLA 1H43A 4R74A 1DPEA 3VVEA 3PUVE 4I8CA 2V3UA 3JV9A 3B6TA 1CE2A 4I9DA 1AH5A 2XXVA 1AMFA 4GXSB 1L5TA 1MXXA 5H8FA 2QMWA 1BP5A 4XKRA 1IXHA 3K6XA 4U21A 1DSNA 3MP8A 1DOTA 2PVUA 1FQFA 2V93A 4ZZAA 4R9GA 3CFZA 2XX9A 1SVXB 2O1LA 1OVTA 4OETA 5FHNA 3K0VA 4NWDA 4ESXA 2I0BA 4NF6B 2XXHA 4ZEBA 2XHDA 4KD5A 4KYSA 4OESA 1JW1A 3SEXA 4GFRA 3TZAA 1MQHA 3MBPA 3TCHA 3IB1A 3FXQA 4ISUA 3IO4A 5CMBA 3MC2A 2DYXA 1FW0A 1YPNA 4MH5A 1FTLA 3U1OA 5JTYB 1M5CA 4ELRA 4JWXA 1RYOA 3W9VA 4DDDA 4H5GA 2X7QA 4KR5A 5TPAA 3H06B 1VR5A 1MXZA 3VFJA 4UACA 4ZDMA 3KSXA 5B7DA 3TFLA 4F3GA 2H25A 1SW5A 2Y7RA 2Y84A 3RTFB 3C31A 4ZEKA 3GBAA 2RINA 3LSFB 4GOTA 3TYHA 2P0SA 4R2FA 2NVUB 1QUIA 1LBBA 2PT1A 2O7IA 3EHTA 5DEXA 2O51A 3C33A 5IAIA 4R6KA 2REJA 3THIA 3FGSA 1M5FA 5HBCA 3HHFA 4NF4B 3C35A 2OJTA 1N7XA 4WXJA 5KDTA 3S2VA 1OIBA 2QRYA 2REGA 2RC9A 3SEUA 5CRYA 3FZVA 3T66A 1EZPA 3VXBA 1JETA 3KGCA 4YB7A 1I69A 3K6VA 2IEEA 4EUOA 2I4BA 3O29A 1SW1A 2E0SA 5CMCA 3IO6A 2F7CA 4UA8A 2Q9TA 5AA1A 3OENA 3SDFA 1NH7A 3OO7A 5F7VA 1B52A 3ECRA 4EF2A 3CR9A 1PB7A 4E0XA 3H6VA 2Y7KA 3EN3A 2QS4A 4KCCA 1MQDA 3CSGA 3C4MA 2R6GE 1PBQA 1IIWA 1D4NA 3SEWA 3T22A 1R6ZA 4U1OA 3IOTA 2AYSA 2UYEA 3FVOA 3EQ1A 4OFJA 1N3XA 3FJ7A 4IO6A 2DE2A 5I57B 3CIJA 3W9WA 2HZKA 4PP0A 2GFEA 4WEDA 3K00A 3T93B 1LAXA 3DELB 1FCKA 4GL0A 2QS2A 1D9YA 1SYHA 5BUUA 3M3FA 4ESWA 3TTKA 1LSTA 4EXLA 3OSQA 4NWCA 2FNCA 3RUMA 3FUZA 3OO6A 2RC7A 4YZZA 1SI0A 2AL4A 3IR1A 4DZ1A 4I62A 1N0TA 5H8QA 3ZKKA 1EH3A 1BLFA 4X9TA 4JSDA 2LAOA 2DWJA 4JWYA 5H8SA 1IUDA 2ALUA 3LSWA 4PETA 3S4UA 3C36A 4IGRA 2OCUA 3ZS6A 4GD5A 4E0WA 4LZ5A 1DTGA 3FJGA 3OELA 4GXAA 4RJZA 3GBBA 2VD3A 3K6UA 2XXRA 2ZNSA 3BFUA 4FE8A 3OXNA 3PV0E 2AL5A 4NF4A 3R7XA 4IO2A 3H3GA 1A99A 2RC8A 1TXFA 4GRKA 4DXBA 5L9SA 1SYIA 4F3SA 1ANFA 3MVYA 4GL8A 3K02A 4F1YA 1FTJA 5I2NB 4G8NA 1MG1A 1SQYA 3HCQA 1ELJA 4LQ5A 4Q5TA 4TLMB 4I1DA 4QFPA 2AIXA 4QSEA 4R9FA 4LZ8A 4C1TA 2ZYOA 1H44A 3QYTA 4GWOA 1AIVA 2O84X 1BKAA 2XXIA 5B70A 4FIMA 2F7AA 1A55A 3Q25A 4FATA 4KPTA 2IA4A 1I6AA 2ONKE 5I84A 4XKQA 4NF8A 5CMKA 2Q89A 4KQPA 5K2XA 3ILTB 4HW8A 2GRVA 1XC1A 4LUBA 2CMOA 2I48A 1EZOA 1Y4TA 2QS1A 3DP4A 2UVHA 2DVCA 2FYIA 4BDRA 1NMUA 4F2OA 1BTJA 5I58B 5I57A 2HCAA 1GR2A 3OEKA 1KWHA 2DWAA 3BFTA 4H67A 3VXCA 4DIGA 1MY3A 2Z8FA 1A7LA 4ONYA 4HCWA 3TTNA 1P1WA 3B6QA 3QIMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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