3C34A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with rubidium at 1.82 angstrom resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
b'RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 79
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c34A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c34A02
4RA1A 5I2NB 1OMPA 1SI1A 1FCKA 3JYRA 2GHBA 3M3FA 3CG1A 1P1UA 3BBRA 2QMXA 2F36A 3OELA 4R73A 3T66A 4PETA 4BDQA 4IO2A 1MXUA 5KCJB 3WAEA 4EXLA 3R26A 5I59B 3T22A 5DVFA 3TDJA 1B3HA 3PPPA 4OENA 1QKAA 2THIA 4XKQA 5EYFA 2ALUA 3H4ZA 3CI8A 1VE4A 4U22A 4IO7A 5TP9B 3TEPA 1OLCA 3G3FA 1TFAA 1I6AA 1Y1MA 3KFMA 4IO3A 3T93B 2ZNSA 2HEUA 4ECFA 5I2KB 1B4ZA 3Q28A 3K00A 1D3KA 3DLNA 4QSCA 4C0RA 2ZYMA 2A5SA 3RQTA 4Q8RA 2D3IA 3GXAA 2QS3A 2R9JA 4R2FA 5JK4A 4ZEDA 4FEBA 3SESA 4P0GA 2XXHA 4L17A 1XS5A 4I1DA 3G3KA 5F7VA 3IK6B 1NKXA 4FE8A 1T0KA 2XXQA 4ELOA 2F78A 3OD7A 3GLBA 3PV0E 5IAIA 3N6TA 3FXUA 3MJNA 5A5XA 3K01A 1XVXA 4NF6B 3FVKA 4AQ4A 3RLFE 1I69A 4ESXA 2ZYNA 4KR5A 4IY6A 2AIXA 4OEUA 1ANFA 1PBPA 1XVYA 4JWXA 2ONKE 1B3GA 1VFDA 5AA1A 4JWYA 3RNNA 1A40A 3H6VA 1B32A 3CG3A 4H65A 4JSDA 4GWOA 1N04A 3HSTA 1PB9A 4OWDA 3C33A 4OYVA 1LB8A 2E0SA 1H45A 3OO9A 1US5A 4U1OA 3M3LA 2UYFA 1LSTA 2IEEA 4QFPA 1MY0A 3IB0A 3E13X 2Z22A 1SI0A 3PPQA 5DT6A 3ILTB 5AA4B 1VFEA 3Q26A 2QS2A 3G7WA 2WKYA 5BWJA 5KDTA 5B70A 1R6ZA 3H6WA 2PYYA 2F34A 3UK4A 1A54A 3LBSA 1ATGA 1AIVA 3U93A 1Y9UA 4F2OA 3WAFA 1QJMA 5DEXA 3IOTA 4R9FA 5A5XB 1N76A 3C35A 4RXLA 2I0CA 1D4NA 2DYXA 4R74A 4FORA 2DXRA 1LGBC 3CFXA 5CMMA 2AL5A 3E9XA 3KG2A 1EH3A 3SDFA 1XT8A 3QIMA 3N26A 2OLBA 1I6BA 1B51A 4ZZEA 3O6GA 2O68A 1MY3A 2ZXTA 2Q8JA 4TQUQ 4QHQA 2I0BA 2V3QA 3MP1A 2ABHA 1UQWA 3MBPA 1RYXA 4QFNA 1O63A 1LFHA 1BTJA 1GR2A 3K4UA 3QUJA 1UTHA 3KGCA 2B3BA 1S50A 4AB5A 4NMYA 4MF3A 2OZZA 1US4A 1SQYA 5H8QB 1P1NA 3Q29A 3OSRA 1OLAA 3A3CA 2OWTA 5JEIA 3SEYA 1DTGA 4KI0E 3UGWA 1B5HA 4XXUA 3FV1A 4U4XA 4HS7A 1I6QA 2QMWA 3E3KA 1S9TA 1LCFA 1CB6A 2DP8A 4ZEFA 1L5TA 1B58A 4NTLA 4FIMA 5L9OA 4YMAA 3KEIA 5JTYA 1MQHA 3VDFA 2Z8DA 5M2VA 3KN7A 2R6GE 4F3BA 1DPEA 3MZBA 4THIA 1FW0A 5K2YA 1IZ1A 3VVFA 3TKDA 4DDDA 1EZPA 3HO7A 2XX9A 1N84A 4G4PA 1IQ7A 1PBQA 5CC2A 2CZLA 3OOAA 1AMFA 3QK6A 3N6UA 1UTHB 1MDQA 3IORA 4U4SA 3G3GA 3H6UA 4KCCA 1II5A 4NE4A 1D9VA 1MXVA 4LA9A 3QAXA 1LAHE 1MQIA 4GLIA 3LSWA 2V93A 4G8NA 4TOZA 4M4GA 2UVGA 3TELA 4IB2A 3IJXB 4G68A 2DWJA 1URDA 3O66A 1B52A 4WXJA 3U1OA 4RYAA 1B2HA 2VD2A 3E4RA 4G68C 3TMGA 2P2AA 3ZKKA 4P11A 1DOTA 3K6VA 1PEBA 1VR5A 3O9PA 3MPKA 4FATA 2Y7RA 4JXIA 4IY5A 5JTYB 4DXUA 2XD3A 1B5IA 4OHNA 1FTOA 4ZZAA 1FTLA 1M5BA 2UYEA 1Y4TA 2XXTA 4X1DA 1DPPA 4ZECA 1YPNA 5TU0A 4KD5A 2XXVA 2DVZA 1P1QA 4ZE8A 5ELVA 4KYDA 3USDA 2B3FA 1MY2A 4R9GA 3PD9A 3PUWE 1HSEA 1GVCA 2DE4A 1R9LA 3FJ7A 3TQWA 1ZU0A 2O69A 4OQOA 5I2NA 3S2VA 2XXRA 5BUUA 2DE2A 2GH9A 4GL8A 4HCYA 5EHMA 4MBPA 5H8NB 3QYTA 3HN0A 1FQCA 5KCJA 4F31B 4FEDA 5I84A 5I59A 4EF2A 3U94A 4YKKA 3SEVA 2OCUA 5J1DA 1M5CA 1USYH 5FTHA 1B3FA 5DTBA 4MLQA 4FECA 5AE4A 4LQ2A 4JBZA 3FJMA 3T96B 4F1UA 3C9HA 1KWHA 4F3GA 3RTWB 1J1NA 2P0SA 4G8HA 3C31A 1Z7NE 3VLVA 3LR1A 3K02A 1UTBB 3N5LA 3EHTA 4EF1A 3FXRA 1QULA 2Z8FA 4P0IA 3P7IA 3IOVA 2KLFA 1B05A 3UP9A 2QS4A 3LUYA 4LVQA 4OFLA 4GOTA 1SW4A 1B46A 1IITA 3ZSFA 1OQHA 4ELQA 4GIZA 4ONYA 2NWJA 1B5JA 4Q5TA 2Y7PA 2V3TA 3VVDA 3O2AA 5H8SA 3ONMA 1FTKA 3RTFB 1R9QA 3L6GA 4NF6A 3V8XB 2XHDA 3SEWA 5ITPA 3FVGA 4O3BA 4E0WA 4F39A 3S4UA 4JB7A 3SERA 1N3WA 1MQDA 3ODBA 1Q1KA 1IIWA 5FHMA 5LOMA 3PUYE 4U2RA 1FQEA 3PPRA 5H8HB 1MH3A 3KJTA 3TPAA 2X7QA 1SDXA 3H3GA 1B40A 2XX8A 5ISUA 1ELJA 2AL4A 3PUZE 4XTCQ 3M8UA 4YB5A 3HHFA 4TLMB 4QSEA 1SBPA 1A99A 2I48A 5AA4A 3OO7A 3S9EA 1FQBA 1PDAA 1Y4CA 2CMOA 1Z7ME 3MUQA 2REJA 4MFIA 1N7WA 1SD3A 1M5DA 5ICQA 2XX7A 3LC8A 5CMKA 3M3KA 4Q30B 4F3PA 3EPEA 1O64A 3FGSA 3H7MA 4H1XA 2M8CA 4IGRA 4N6PA 4BDLA 4YICA 3U72A 2FA7A 5EHSA 3FASA 3W9WA 4UA8A 4IO5A 4F29A 2A5TA 2ZYKA 3CSGA 4GVOA 1JEVA 3R7XA 3MZ9A 2HZKA 4WEPA 3OO8A 2I3WA 2XXPA 3KN3A 3VXCA 3CSBA 2F7BA 1AH5A 2PVUA 4X1BA 4IO4A 3FUZA 3EF7A 2HXWA 4UACA 1NH8A 5AA2A 5H8QA 4QFOA 2I49A 1B3LA 3OO6A 2Q88A 2GFEA 3IOUA 4BDOA 4NEDA 4NWCA 4OETA 3SKPA 4KPTA 1MDP1 2ONSA 3PMXA 3IAZA 4GD5A 3A09A 4Z7EA 2F7CA 1SYHA 3IO6A 4OEVA 4GFRA 2Y7WA 1TXFA 1F9BA 2H5YA 1MS7A 3O6IA 1LCTA 3O29A 3K1NA 4QFLA 2P1SA 2IA4A 1M5FA 5HBCA 1GGGA 1Y3QA 2D21A 3HCQA 2A5TB 3TUSA 4OZ9A 4U1ZA 2E1SA 1H43A 2OBGA 4LATA 3D4GA 5I58B 1B7ZA 4FAJA 3FVNA 3DP6A 2RCBA 3K6XA 1B1XA 1VSOA 3CFZA 3IL1B 3HPIA 3RUMA 3BFUA 3TQLA 4IO6A 1SW5A 1FTJA 4R6HA 1JEUA 1Q35A 2OK2A 4WKMA 4EQBA 5AA2B 1P1OA 2PMSA 5DVIA 2QPQA 1DMBA 1MQJA 2HCAA 3DP4A 1A55A 4YKJA 2PT1A 3K1PA 3TFLA 4R75A 3G3JA 1N3XA 1QVSA 5H8FB 4GXAA 4ZEIA 2V3UA 2Q2CA 2FYIA 1ZJLA 1JW4A 2XXYA 2I4CA 2O6AA 3T9VA 2VOZA 2GHAA 4PFUA 5CBRA 1B1HA 1NL5A 2HQ0A 4ZE9A 4NF8B 3Q25A 4Q0CA 2RINA 3AXFA 4DCYA 4GRKA 1JVXA 1M5EA 3KSXA 1QUKA 4KHZE 3KBRA 1QKBA 2D5WA 2O1LA 5KZTA 1EZOA 3FZVA 2I3VA 1IXGA 1MH4A 1POTA 4C1UA 4QRZA 1JQFA 1ZMGA 4XKRA 3V5AA 4H8IA 2O7UA 5I56A 2UXAA 3TTKA 3CFLA 2RC7A 1N0TA 5L9MA 4DCXA 5F1QA 5H8NA 4O3AA 4YB6A 3C36A 1Y3PA 3B7DA 3HHGA 3JV9A 4ZEKA 4YKPA 1WODA 1MXZA 4IGTA 4OVJA 1YTVA 1B6HA 2XXXA 4N07A 3K1MA 5CRYA 5ICTA 1JW1A 4KYSA 2ONRA 3SEXA 4EQ9A 3K6UA 1QUIA 4F19A 2X26A 2QJEA 1MG1A 3FV2A 4BDRA 1MPDA 2F5XA 2F97A 1S7YA 1MY4A 3I3VA 4OXVA 3TAJA 1SW2A 2XXWA 2O51A 1UTBA 4RY1A 4QSDA 4NF4A 4K3FA 3RN8A 3ZS6A 4H5FA 2HAUA 5I56B 4O3CA 1BP5A 2Y7KA 2ZYOA 3C34A 3V89B 4N13A 4H5GA 4XKNA 4LZ5A 1ZLQA 2DE3A 2DS9A 4F3SA 4LZ8A 1JW5A 4RJZA 5CMBA 3LSXA 3TODA 3RT8A 3ZKLA 5B7DA 4BLAA 3BFTA 2DWAA 1JETA 3W15C 4PFYA 1SVXB 2NUVA 4G77A 1TT1A 2OJTA 4TLLB 2ZNUA 2PX1A 4DIGA 1WDNA 4ZEBA 3C4MA 2UVIA 3TCGA 3EQ1A 2H4IA 4R2BA 3G3HA 3G3IA 4EQ7A 3IOWA 3W9VA 2VGQA 3UA8A 1N7XA 3N94A 3EN3A 1FQAA 2F6PA 3TTMA 1MY1A 5H8HA 1URGA 1IXCA 4PFTA 4GF8A 1URSA 3CRBA 4NF4B 1IEJA 3H03A 3MZ1A 3IX1A 4YAHX 3PGFA 3VFJA 2F7AA 3CIJA 4YZZA 2PT2A 3B6TA 2RCAA 4DXBA 3TCFA 1OVBA 3CR9A 2VHAA 2I4BA 3U8QA 3OEMA 3LSLA 4JSOA 1MM7A 4F1YA 1CE2A 4ESWA 5CM6A 3OSQA 1GV8A 2H98A 3S9MC 4MLVA 2PBWA 1TFDA 4ZS9A 1H44A 1MXWA 1IXIA 3ECRA 4RPNA 1MRPA 2QL3A 4JWOA 3TTNA 4BDMA 2REGA 1LBBA 1XOCA 3I6VA 2RC9A 5DVJA 3O6HA 4LONB 1MQGA 2I6EA 3KZGA 1AL3A 4RPOA 3RGYA 4RNSA 3MW0A 3S9NC 1LBCA 1B0HA 4F18A 3OMBA 2G93A 4YMBA 2XXIA 4R72A 3TCHA 1AOVA 3PUVE 1NNPA 1YCJA 1D9YA 3CVGA 3Q27A 1SYIA 1XHYA 2Y84A 3MVZA 3T9HB 4GL0A 1B7UA 2DSFA 4OMBA 4I62A 3MP6A 3IO4A 1POY1 2B65A 4I9DA 2BJJX 3FATA 4X9TA 3MWBA 4LZ7A 3RY3A 2YJPA 1YAEA 4QFKA 2QS1A 3TYHA 4FJPA 2DWIA 3R6UA 3EHUA 3C32A 4XKPA 1MXXA 3DELB 4H6DA 1Y20A 3QSLA 4U21A 5I58A 1LAFE 1MXYA 3BKIB 1R1NA 2NXOA 3DM0A 3O97A 4OTEA 1FQFA 4KQPA 5I57A 3PMWA 3OENA 2Y7IA 1NMUA 2AYSA 4EDPA 1H76A 1NNKA 1NNFA 2LAOA 2QSXA 1MPCA 5H8FA 3EHSA 3DP8A 1UIVA 1ZIUA 2DVCA 3VVEA 1PC3A 1RYOA 1LB9A 4F22A 4KFQA 4I8CA 5DYHA 4DXCA 2Z23A 1UIUA 4C1TA 3MP8A 4NF8A 1QUJA 2VD3A 3TZAA 3MVWA 1HSLA 5AA3A 2DOJA 5ITOA 1NH7A 4DE8A 3QUFA 2X7PA 3GBAA 4ZDMA 2NVUB 4MH5A 3T9XB 3PU5A 4KYEA 3IB2A 2Q2AA 1NFTA 4F2QA 3THIA 1MPBA 4AB6A 5I57B 1USYE 4DZ1A 5TPAA 1FTMA 2DQVA 3OXNA 1OVTA 2NOOA 4PP0A 3TTRA 1LFGA 3IR1A 3SEUA 4EXKA 1A8EA 1NNTA 5CBSA 3MPLA 2H9BA 2R71A 3VE1B 4PFWA 5KDTB 5FHOA 2XXUA 2ESNA 5HM4B 4H67A 5K2XA 2ZNTA 4XIGQ 1DSNA 4GQOA 2I58A 5DEXB 1A8FA 3K0VA 1OQGA 1IUDA 4PE5B 4G2ZA 2O84X 4RK9A 2QRYA 3RT6B 1Y3NA 1OIBA 3HV1A 4R6KA 4YU0A 4EUOA 3H6TA 3ILUB 3PD8A 4BDNA 1PB8A 3L6HA 3SETA 4RK2A 4F1VA 3A3UA 4OFOA 4ELRA 3UORA 2Z8EA 2YPNA 3KN8A 4ELPA 2ANJA 3O28A 4GXSB 2RF1A 3KJ7A 3GBBA 3VLUA 4ND9A 2F6GA 4QF9A 5TPAB 1P99A 3FXQA 2HFBA 3MVYA 1LAGE 5AA2D 3V83A 4YB7A 2RKMA 3FVOA 1B4HA 3RPWA 1ZKBA 3T9UA 4R6YA 3MVXA 3IB1A 2UVJA 1RKMA 2XD2A 1B7HA 1HSJA 2O1MA 1BLFA 3F11A 1ZTYA 5CMCA 5L8DA 1BIYA 3K2DA 3I5OA 4OERA 3S9LC 4KCDA 1FQDA 2YLNA 4POXA 4E0XA 3JZJA 3VXBA 4LQ5A 3QXMA 5IKBA 1SW1A 2FNCA 2V84A 2UVHA 3FD3A 1B9JA 4POWA 1EU8A 3D4CA 3MC2A 2DXYA 1MM6A 1DTZA 5FHNA 2G29A 4H0WA 1QW0A 3PPOA 1IXHA 1JNFA 3KSJA 1EZ9A 2DWHA 2Q89A 1LAXA 1H3DA 4H8JA 1LLSA 4NF5A 3B6WA 3VV5A 3PUXE 3GZGA 3MQ9A 2RC8A 3VLWA 4HW8A 4OFJA 2F8DA 1Y1ZA 4NWDA 1TWYA 1B0LA 2O7IA 4DLDA 4G68B 2ZMBA 3IJOB 3H06B 3FJGA 5L9SA 1WVJA 3K6WA 1XC1A 4U23A 1A7LA 2V25A 4ISUA 4WEDA 2HAVA 3TTLA 2Q9TA 4Z0IA 4HCWA 4HTGA 5CI5A 2F35A 1P1WA 2H99A 3LSFB 4LP2B 4JDFA 3OEKA 5FTIA 5TP9A 3PMVA 1B3EA 1BKAA 2GRVA 1PB7A 4LUBA 3UN6A 3KOTA 3B6QA 1GTKA 4X48A 2W7YA 3UIFA 3FIRA 4OESA 5I2KA 2HZLA 3U92A 1JVYA 1ZBMA 1O7TA 1LFIA 2OWSA 3PPNA 2H25A 4PQJA 4NF5B 3MAMA 3KOSA 4G8MA 2VP1A 4M1VA 5HPQA 4YKIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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