3C34A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with rubidium at 1.82 angstrom resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 79
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c34A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c34A02
3H3GA 1ZKBA 4OHNA 1ZBMA 5BWJA 4FEBA 2QMWA 3W15C 1YTVA 3B6TA 3PMWA 3R7XA 4NTLA 3S9NC 2X26A 3O6HA 4YMAA 4KHZE 4KCCA 1B52A 1O7TA 1B51A 4P0IA 5H8FB 1MH3A 2RINA 1MXZA 1B5IA 3TTRA 1A7LA 4JWXA 2GFEA 2HAVA 3MUQA 3IAZA 3LBSA 3G7WA 1A99A 4GOTA 1XVXA 4R9GA 2UVIA 3TODA 2H99A 4EQ7A 2ZNSA 5K2YA 2RKMA 4DIGA 5JTYA 1DPPA 3T9HB 4LUBA 1SYIA 4LP2B 4ELQA 1SDXA 4HW8A 1B05A 3TCGA 4IO3A 4H5GA 2ZYKA 1VFEA 3V83A 4F22A 5L9MA 2QS3A 1PEBA 2I0BA 1PC3A 2V3UA 4EDPA 1SW1A 3EHTA 1FQFA 3EN3A 3B6WA 3VE1B 1B3FA 1F9BA 2R9JA 3IB2A 1QUKA 2F7AA 5I57B 2RC9A 3G3FA 5H8QA 1B7HA 4PE5B 3TTMA 4KYEA 5TP9B 1H43A 4F2OA 1URSA 4XKQA 3T9XB 1N7WA 3E4RA 2DE3A 4MFIA 1LFHA 1QULA 2I0CA 3SERA 3SEUA 2A5TB 1D9YA 4OENA 2GHBA 1MH4A 1TT1A 3KEIA 4OMBA 1TFAA 1I6AA 4YB6A 3W9VA 1M5DA 2Q9TA 1YCJA 4RY1A 3D4GA 1GV8A 3IOVA 1P1WA 2QS4A 1ZJLA 4DDDA 1SW2A 3IK6B 2D21A 4X48A 3LUYA 4BDMA 4KQPA 3MPKA 2G29A 3BFUA 3RT8A 4LVQA 2DP8A 2VGQA 1BKAA 4KI0E 4NWCA 1FTMA 4L17A 3N6UA 2QMXA 2RCAA 3JZJA 3K6UA 1Y1MA 4PFUA 2LAOA 4DXBA 4NEDA 4HCYA 4R6HA 1SVXB 1B58A 1B0HA 1LBCA 1CB6A 1N0TA 1NL5A 4GXSB 3IORA 3UORA 4THIA 2DS9A 4RXLA 2ZNTA 2OCUA 5A5XA 1B46A 2I58A 3MBPA 4OZ9A 4WXJA 2F6PA 5AA2B 5HPQA 3DP8A 4U1OA 1Y3NA 3RLFE 5AE4A 1S7YA 1B2HA 1B32A 3OSQA 1MQDA 4TLMB 3FUZA 3KJTA 2PVUA 2Y7KA 2YJPA 1H76A 1A8EA 2ONRA 1P99A 4GD5A 5F1QA 3RUMA 4GXAA 4R9FA 3K1NA 1RYOA 4RPOA 1A40A 2R6GE 2R71A 4JSOA 2O68A 3I6VA 4G68A 4YKKA 3OO9A 3IB0A 1B9JA 5FTHA 4H8IA 4JDFA 4O3BA 1SW5A 2HFBA 3T9UA 1PB8A 1USYH 3G3KA 3LC8A 1HSLA 3K6XA 4IB2A 4R73A 4KD5A 3H6TA 3FV1A 2M8CA 4I1DA 4M4GA 1SD3A 3OELA 4MLVA 3UN6A 2NWJA 2O84X 4QF9A 3OD7A 3CFLA 2DSFA 4XIGQ 1M5FA 3N5LA 1KWHA 3U94A 2OWSA 3S2VA 5B70A 4NF5A 3Q26A 4R6YA 3TTKA 5IAIA 1AL3A 5I58A 4FECA 2PMSA 4IO2A 1MQHA 5KCJB 3MPLA 1UTHB 4XTCQ 1DSNA 2D3IA 2DVCA 1JNFA 1JW1A 4YZZA 4GL0A 4FATA 1OVBA 3MJNA 4QFNA 4PQJA 3IJOB 2OBGA 1OQGA 1YPNA 4ZE8A 3MC2A 1TFDA 4H8JA 1M5CA 4ZEBA 4IY5A 2QS1A 1FTJA 3DELB 2F7BA 2NUVA 2XXVA 3T9VA 3UA8A 3SKPA 1MDQA 3PUWE 5CBSA 3RY3A 3VVEA 2Y7IA 1S50A 2OJTA 3GBAA 2XXXA 3KN3A 3FIRA 1MM7A 2DWAA 3HSTA 1S9TA 3A3CA 3EF7A 3SEXA 1B0LA 4IO6A 4FJPA 3KOSA 2B3BA 1B3GA 4ELRA 3KN7A 3TQLA 3MZ1A 2AYSA 3VDFA 1J1NA 3BBRA 3PUXE 2IEEA 3SETA 3O66A 4F1VA 3CFZA 4DCYA 1N3WA 3CFXA 4DZ1A 2F6GA 4ZZAA 3PPNA 1Y4CA 4O3AA 1UIUA 4F3BA 3QYTA 5CI5A 2Q8JA 2DVZA 1MY2A 1UTBA 1FTLA 4F19A 1MY3A 1JVYA 1MPDA 3VXBA 2Y7RA 4F31B 5CRYA 5B7DA 5JTYB 4AQ4A 4GF8A 4ESXA 3FVNA 5ITPA 2F7CA 4QFOA 4IY6A 2REGA 1P1OA 1GVCA 1JW5A 2ALUA 4ZDMA 3H6VA 2UVJA 4POWA 3IB1A 3EHSA 4QSCA 4GLIA 5CMMA 5KDTA 2Y84A 1PB9A 1MPBA 4YU0A 1MM6A 2Q88A 2B3FA 4DLDA 3FATA 2HXWA 1ZU0A 4G68C 2Q2AA 3FGSA 2RC8A 4HTGA 3QAXA 5H8QB 1A8FA 4FE8A 2O7UA 1JETA 4OFJA 3KZGA 2X7QA 1WVJA 3MP6A 1L5TA 1B3HA 3H06B 1MXVA 4LATA 4XKNA 5CBRA 5FHNA 1IUDA 1R9QA 3FVGA 3ILTB 1Q1KA 3HCQA 3MVZA 5CM6A 1H44A 4GRKA 4I8CA 3Q27A 3TTLA 4R2FA 4F3GA 1NNKA 1ZMGA 3PPOA 3F11A 2F34A 1FQDA 4U4XA 1FTKA 3DLNA 3THIA 4Z0IA 1MXWA 4NE4A 3O6GA 3MVXA 1ZIUA 3IJXB 3TELA 1VFDA 1SYHA 4OESA 3OSRA 3CR9A 1AOVA 3B7DA 5ISUA 2DWIA 1NNTA 3FXQA 4KYSA 1JEUA 1GGGA 2P0SA 4MLQA 2F97A 2DE4A 4ESWA 1N3XA 1AH5A 1LGBC 5CMCA 3MVWA 2HAUA 1NKXA 4OETA 3C36A 3KJ7A 1ZTYA 2UVHA 4OXVA 2DQVA 5L9OA 3UK4A 4LZ5A 4EQ9A 1IXCA 5HBCA 4IO4A 5ITOA 4LQ5A 4DXUA 1MXXA 5A5XB 3OEKA 2P1SA 4YB7A 5F7VA 3HN0A 1B3LA 3ILUB 3TQWA 2DOJA 3V8XB 3RQTA 3C34A 3IR1A 1LAGE 1NH8A 4ND9A 3K00A 2V3QA 3E13X 1NNPA 1JQFA 4JXIA 1USYE 5H8NA 5TU0A 2ZYMA 3FVOA 4LZ7A 4OFOA 5BUUA 4XKRA 4QFKA 4I9DA 4KYDA 3QIMA 4FORA 3SDFA 3PGFA 3KGCA 2XXWA 2Z22A 3IL1B 5AA4A 4EF1A 1EZ9A 3A3UA 1BLFA 3FJMA 4TQUQ 4NF8A 3O6IA 2W7YA 5AA2D 4G2ZA 4PFYA 1DMBA 4G68B 2H4IA 2O1LA 1I6QA 4F39A 1I6BA 3C4MA 5TPAA 2AIXA 3ZKKA 3VLUA 1FQCA 1IZ1A 1MXYA 2I6EA 3P7IA 4X9TA 4YKPA 3UGWA 3Q29A 2OK2A 4NF6A 2DE2A 4NF4A 3MP8A 3LR1A 2VD2A 4RA1A 3H6UA 3O2AA 2RCBA 4FAJA 1O63A 3G3HA 2Z23A 2NVUB 4R72A 2P2AA 3TEPA 2UYFA 5DVFA 5I58B 4RNSA 5DVIA 2O69A 4IO7A 3RNNA 3VVFA 4C1UA 3IO4A 3ZSFA 2I48A 4EQBA 2RF1A 4FIMA 3RT6B 3CSBA 4QSDA 2G93A 2F78A 2ESNA 1Y1ZA 2I4CA 3PPQA 1NFTA 4Q0CA 5KZTA 1YAEA 3OEMA 1SI1A 2ZXTA 3PD8A 2Z8EA 1JEVA 1NNFA 5CMBA 4Z7EA 4GIZA 1URDA 1OLCA 4H5FA 1M5EA 4LONB 4N07A 4PFWA 3TAJA 1PBQA 3FZVA 4YKIA 4POXA 3L6GA 4KFQA 4M1VA 1B1HA 3SEWA 1B7ZA 1A55A 1OVTA 3SEVA 1ELJA 2VOZA 2F8DA 3PPPA 3H4ZA 1XC1A 5CC2A 2ZYOA 3D4CA 1Z7ME 3C32A 1R9LA 3TZAA 3PUZE 3Q25A 1DTGA 2O1MA 1XHYA 2HQ0A 1B40A 1HSJA 1MQJA 1LAXA 3VLWA 1UTBB 1R1NA 2THIA 3QK6A 3C35A 1FCKA 3USDA 3KN8A 4YKJA 5M2VA 2HCAA 2X7PA 4X1DA 3TCHA 3CG1A 5I2KA 3RTWB 4R6KA 1Z7NE 5I59A 1QVSA 3KSJA 4WEDA 3PMVA 3RPWA 3T93B 1CE2A 1R6ZA 4TLLB 4YMBA 4Q5TA 4ZZEA 3RTFB 4JBZA 5EHMA 4ELOA 2O51A 3T66A 3VV5A 3L6HA 3VLVA 4QRZA 3QSLA 3O29A 4U2RA 1MY1A 1MY4A 1QW0A 3HHFA 4OVJA 2XXYA 2ZYNA 4BLAA 2QS2A 3N26A 1P1QA 1QKAA 1P1NA 1QUJA 1B4ZA 4OWDA 4JWYA 1LCFA 4GFRA 3PUYE 2Q2CA 1D4NA 3K4UA 3E9XA 2FNCA 1II5A 1AIVA 1DTZA 4DE8A 1SBPA 4ELPA 5AA3A 5H8HA 3A09A 3GLBA 4U1ZA 1LLSA 1Y20A 4G77A 4ECFA 2FYIA 3MW0A 4H1XA 3C31A 4G8HA 4H0WA 3CVGA 3MP1A 4F3SA 1WODA 2PBWA 2QRYA 4RYAA 4UA8A 4I62A 4AB5A 1XT8A 3PPRA 2GHAA 4RK2A 4Q8RA 5J1DA 5I56A 5EYFA 3G3IA 4AB6A 3I3VA 4ZEFA 2RC7A 2VP1A 3WAEA 2Y7PA 1GR2A 4ZEKA 4XXUA 2QJEA 3FASA 4QFLA 1IEJA 3M3FA 4F1UA 3GXAA 3TCFA 1JW4A 2XXPA 4P11A 2Z8DA 3TKDA 4DXCA 4Q30B 5DEXA 2DWHA 1MDP1 3TMGA 3ODBA 3GBBA 3K02A 2H25A 3V5AA 1B5HA 2XXHA 2IA4A 3IO6A 4DCXA 1I69A 3SEYA 4F18A 1NH7A 4OEUA 1LB9A 3C33A 1SQYA 1XOCA 1Y4TA 4LA9A 2E1SA 5I2NA 2O6AA 2YLNA 4JSDA 1EH3A 3IOUA 5H8NB 3KBRA 4QHQA 1M5BA 2F5XA 3Q28A 2DXYA 4R74A 3R6UA 4ISUA 3BFTA 1HSEA 3MWBA 2AL5A 5AA4B 1VR5A 1ANFA 5EHSA 4BDNA 4JB7A 3VXCA 4NF8B 3EQ1A 4MH5A 4C1TA 1Y3QA 3TTNA 4GQOA 3K1PA 3CIJA 5TPAB 3MQ9A 4JWOA 2ZMBA 4BDRA 4H6DA 3O97A 4TOZA 2Y7WA 1OQHA 1RKMA 3FJ7A 3U1OA 1QKBA 4U4SA 2DWJA 2DYXA 4HCWA 4LQ2A 5DVJA 4LZ8A 3ZS6A 3VFJA 1POY1 4OERA 3IOWA 3SESA 4NF6B 4NF4B 1N04A 4C0RA 2REJA 1PBPA 3FD3A 1Y3PA 3FVKA 3PV0E 3PD9A 4F3PA 1D9VA 1OLAA 4GVOA 3KSXA 3N6TA 3S9LC 5FHOA 3MAMA 4MF3A 1QUIA 2OWTA 1IQ7A 2XD2A 4RK9A 3U72A 1IXHA 1NMUA 4PP0A 3TDJA 2NOOA 5FTIA 3JYRA 5ICTA 4ONYA 2F35A 1B5JA 1UQWA 1EZOA 3UIFA 3CG3A 1SW4A 3U93A 3TYHA 2F36A 2XHDA 3EPEA 2XXIA 3M3KA 3HHGA 3TUSA 1POTA 4YAHX 3HV1A 4ZEIA 1BP5A 1Y9UA 3GZGA 4KCDA 3ONMA 5ELVA 2GH9A 1OIBA 2XX7A 3OO6A 1LSTA 3IX1A 3LSLA 3S4UA 1WDNA 4XKPA 3H6WA 1GTKA 1B1XA 3DP6A 5H8FA 1MY0A 4U22A 2I3WA 3EHUA 3T22A 2XD3A 1H45A 1QJMA 1TWYA 1BTJA 3OO8A 3MZ9A 4U23A 2XXUA 2ANJA 4IGTA 5DT6A 4P0GA 5AA1A 4RPNA 2HZKA 2I4BA 3CRBA 1XS5A 1RYXA 4QSEA 4HS7A 3W9WA 3K1MA 3LSWA 1FQAA 4PETA 3S9MC 3RN8A 3C9HA 3G3GA 1PB7A 5JEIA 4KR5A 1H3DA 4NF5B 4X1BA 2KLFA 1LAHE 5I84A 4NWDA 3QUJA 1JVXA 3H7MA 4G8NA 3KOTA 1B4HA 2HZLA 3K6WA 2D5WA 4F29A 3TFLA 1DOTA 2O7IA 2Z8FA 3M3LA 1Q35A 5I57A 2PT1A 1PDAA 2HEUA 3ZKLA 3BKIB 1B7UA 2A5SA 1XVYA 5TP9A 1O64A 1MQGA 3FXUA 2ZNUA 3JV9A 5I2KB 5CMKA 3KFMA 2VHAA 5I59B 5IKBA 4GL8A 2H98A 4ZECA 3O28A 3S9EA 2A5TA 3TPAA 3G3JA 4EF2A 4E0XA 3AXFA 3OOAA 5H8SA 5ICQA 2I49A 4F1YA 2DXRA 4K3FA 5L9SA 4OYVA 2ONKE 1MS7A 5HM4B 1DPEA 3K0VA 1IITA 2PX1A 1EZPA 2XXRA 1P1UA 1MQIA 1B3EA 5DTBA 2QPQA 3FJGA 1N76A 4F2QA 2YPNA 1FW0A 3OO7A 1N7XA 3QUFA 1US4A 3LSFB 1SI0A 5H8HB 2GRVA 4KPTA 4N6PA 5L8DA 4ZEDA 2QSXA 2AL4A 1D3KA 1BIYA 1MG1A 3FXRA 3CI8A 3PUVE 1FTOA 2H9BA 2XX8A 4OTEA 3FV2A 3ECRA 4G4PA 5AA2A 1ATGA 5I56B 2ABHA 3O9PA 4R75A 4ZS9A 2UXAA 4R2BA 4WEPA 2V93A 1FQBA 1MRPA 3U92A 4ZE9A 4O3CA 3R26A 5K2XA 2WKYA 1LFGA 3MZBA 1B6HA 4EUOA 5DEXB 4G8MA 3K2DA 3N94A 2V84A 5KDTB 3OXNA 3B6QA 3OMBA 2QL3A 3UP9A 1LCTA 2NXOA 1LAFE 2B65A 4E0WA 1OMPA 4OFLA 2H5YA 4BDLA 5I2NB 2UYEA 5LOMA 4BDQA 3OENA 2PYYA 2UVGA 4RJZA 1FQEA 3U8QA 2BJJX 1N84A 4NMYA 5JK4A 2XXTA 4EXLA 4YICA 4OEVA 4UACA 3M8UA 4OQOA 2OZZA 2XX9A 1A54A 4WKMA 4GWOA 2Q89A 1IXGA 4QFPA 2E0SA 3DP4A 4FEDA 5KCJA 1UTHA 3I5OA 1IXIA 3T96B 1T0KA 2V25A 1TXFA 4YB5A 1VE4A 1US5A 4H67A 4N13A 3MVYA 1IIWA 2V3TA 3KG2A 3LSXA 5FHMA 1ZLQA 3K01A 2CZLA 1MPCA 2FA7A 1VSOA 4H65A 3VVDA 5DYHA 4EXKA 2ONSA 1MXUA 3DM0A 4IGRA 4PFTA 1EU8A 2PT2A 1LFIA 2OLBA 4U21A 1LB8A 3QXMA 3RGYA 1AMFA 2CMOA 4IO5A 3HPIA 3K6VA 3HO7A 3PU5A 2VD3A 4MBPA 3V89B 3CSGA 1URGA 3IOTA 2I3VA 3E3KA 2XXQA 1LBBA 4BDOA 1UIVA 3H03A 3PMXA 3WAFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H3GA 1ZKBA 4OHNA 3ISPA 1ZBMA 5BWJA 1NI9A 4FEBA 2QMWA 2CZIA 3W15C 1YTVA 3B6TA 3PMWA 4N4UA 5EYGA 3R7XA 4NTLA 3S9NC 2X26A 3O6HA 4YMAA 4KHZE 4KCCA 1B52A 1O7TA 1B51A 4P0IA 5H8FB 1MH3A 2RINA 1DCUA 1MXZA 1B5IA 3TTRA 1A7LA 4JWXA 3IFAA 2GFEA 1LBWA 2HAVA 3MUQA 3IAZA 3LBSA 3G7WA 1A99A 4GOTA 1XVXA 4R9GA 2UVIA 3TODA 2H99A 4EQ7A 2ZNSA 5K2YA 2RKMA 4DIGA 5JTYA 1DPPA 3T9HB 4LUBA 1SYIA 4LP2B 4ELQA 1SDXA 4HW8A 4PC9A 4PGNA 1B05A 3TCGA 3BIGA 4IO3A 1FPDA 4H5GA 2ZYKA 1VFEA 4GX3A 3V83A 4F22A 5L9MA 2QS3A 1PEBA 2I0BA 1PC3A 2V3UA 4EDPA 1SW1A 3EHTA 1FQFA 3EN3A 2XWVA 3B6WA 3VE1B 4MNCA 1B3FA 1F9BA 2R9JA 3IB2A 1QUKA 2F7AA 5I57B 2RC9A 1FBHA 3G3FA 5H8QA 4OVSA 1B7HA 4PE5B 3TTMA 4KYEA 5TP9B 1H43A 4F2OA 1URSA 2XXKA 4XKQA 3T9XB 3LV0A 4PDHA 4MMPA 1N7WA 3E4RA 2DE3A 4MFIA 1LFHA 1QULA 2I0CA 3SERA 3SEUA 2A5TB 1D9YA 4OENA 2GHBA 3FXBA 1MH4A 1TT1A 3KEIA 4OMBA 1TFAA 1I6AA 4YB6A 2ZZVA 4NG7A 3W9VA 1NV1A 1M5DA 2Q9TA 1YCJA 1IMCA 4RY1A 3D4GA 1GV8A 3IOVA 1P1WA 4GX4A 2QS4A 1ZJLA 4DDDA 3QMFA 1SW2A 3IK6B 2D21A 4X48A 3LUYA 4BDMA 4KQPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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