3C34A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with rubidium at 1.82 angstrom resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 79
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c34A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c34A02
4KFQA 3RUMA 2OJTA 2A5TB 2Q2CA 1WODA 1DTZA 2VGQA 1Y4TA 4DCYA 2ZYOA 4OZ9A 1B4HA 4G68B 4FECA 4ND9A 1M5BA 4FORA 1B1HA 4JDFA 3GBBA 2XXIA 4U23A 3LSWA 2DSFA 3TTNA 3VVEA 1LCFA 3EQ1A 1FQAA 1GV8A 4Q30B 3K6VA 4XXUA 4G8HA 1Y20A 4XKNA 5HBCA 4R9FA 3PUXE 5ITPA 2GHAA 1Z7NE 5L9SA 3LR1A 4WEPA 3MPLA 2VD3A 3UA8A 4F3PA 3MUQA 4X1BA 3FZVA 4QF9A 2RCAA 2H98A 4PFWA 1JETA 4GL0A 3TCHA 4I1DA 2DWHA 1P1QA 4HCYA 1VR5A 4H8IA 4ZEIA 3PGFA 3G3FA 1O63A 4ELPA 4LATA 3T93B 1SYIA 1B4ZA 1IQ7A 1B40A 1P1NA 3B6TA 1B9JA 1JW5A 1Z7ME 1A7LA 3QUFA 2Y84A 1UTHB 3IAZA 4UACA 4F39A 4IY6A 3MP6A 5IKBA 4PFTA 1SW1A 2O7UA 1LFGA 2I0BA 3O28A 1AMFA 2F36A 4YKJA 3SESA 4FEDA 2OLBA 3OOAA 4QSDA 2QMWA 1POTA 2XXPA 3O97A 3SERA 3SEUA 4G68C 4F1YA 3OO6A 3LSLA 1NFTA 3KJTA 4Z0IA 3Q29A 4M1VA 3TAJA 2AYSA 5CMMA 3QAXA 2VD2A 4N07A 4LONB 1MM7A 1IXIA 1UQWA 1P1UA 2DXYA 4JSOA 3PV0E 1NH7A 4U2RA 3VLWA 3SEVA 4H67A 2Q88A 3TUSA 4KD5A 1QVSA 1QULA 3LSXA 3ILUB 3OEKA 4GLIA 3RTFB 2B3FA 2XXTA 4QFNA 3B7DA 3FXUA 4IGTA 3DM0A 5DEXA 4F1UA 4GQOA 3RTWB 2E0SA 4F31B 2UYEA 3ZS6A 5AE4A 5IAIA 3RY3A 3V5AA 3RGYA 1JEUA 2YPNA 1D3KA 2Z8DA 3PPPA 4GD5A 4WEDA 4EQ9A 1F9BA 4OFLA 2IA4A 4NWDA 1US5A 3WAFA 4OEVA 2R6GE 1ZBMA 5ELVA 1Y3NA 2O1MA 3WAEA 4BLAA 3CI8A 2CZLA 2OZZA 5TPAB 3FIRA 4ESWA 3E13X 1B32A 1XVYA 2B3BA 3H6WA 3FJMA 2I6EA 1B05A 3H6UA 3BBRA 1M5CA 2I0CA 2LAOA 3O29A 1B52A 2AL4A 4RXLA 5AA2B 5CMBA 4Z7EA 2UVGA 4IO4A 3FJGA 2Y7WA 5CMCA 3G3HA 3TYHA 5K2XA 2OBGA 1OMPA 5DYHA 4LQ5A 3A09A 3TELA 5KCJA 1JEVA 1URSA 3FGSA 1USYH 3VE1B 1LB9A 1ZJLA 3IOUA 3V8XB 4ESXA 3KG2A 3K02A 1USYE 3CRBA 5ICTA 4EF1A 4QHQA 4TQUQ 4ECFA 1B2HA 1KWHA 2AL5A 2DE2A 4QSCA 4O3CA 1LAXA 1UIVA 1BLFA 1WDNA 4LP2B 5I56A 1MH4A 4U22A 3FASA 3K4UA 3U72A 3QSLA 1FTLA 2UVJA 1FQFA 1LCTA 4R9GA 1PC3A 3G3KA 3TEPA 2QJEA 4N13A 3VDFA 3O6IA 1Q1KA 5CI5A 3TTKA 3IOTA 3S4UA 5HM4B 3MPKA 3IB2A 3IL1B 1B6HA 4QFOA 1S9TA 4H5GA 4JBZA 1PB7A 3R26A 3ZSFA 4MBPA 5CMKA 5TP9A 1FQDA 1ZKBA 1FCKA 3FVOA 1B3LA 5FHOA 2PVUA 1Y4CA 3PMXA 3HV1A 4H6DA 3DP6A 2P1SA 4KPTA 5ITOA 5I59A 4ELOA 1US4A 1LGBC 3RLFE 1UTBA 4XKRA 3Q28A 2X7PA 2H99A 3T9HB 1IIWA 3PPRA 5CC2A 1MY1A 4F3SA 3VV5A 3OENA 2GH9A 1PEBA 2A5TA 1IITA 1Q35A 4R72A 1R1NA 1NNKA 3HSTA 3GZGA 5AA2D 4FEBA 3K6UA 3KEIA 5H8QB 4G68A 5TU0A 4ONYA 3K6WA 5H8NA 3HHGA 4U21A 2F6GA 2HCAA 2HZLA 3MW0A 3MC2A 4YAHX 1N84A 2XX7A 4RY1A 2XXVA 4H0WA 1B3GA 1PBQA 4H5FA 3T22A 4BDLA 1LAGE 4NF8B 1SYHA 3B6WA 3DLNA 3O2AA 5DVJA 1VE4A 4ZE8A 4F1VA 3GBAA 4GOTA 1FQEA 2I58A 1XS5A 3KOSA 4ZDMA 1UIUA 2OCUA 2H5YA 1DSNA 1ELJA 3KN8A 4P11A 4FIMA 3ECRA 3C35A 4DXUA 4XTCQ 3PMVA 2PMSA 1IUDA 1R9QA 4POXA 3KFMA 3LSFB 4FE8A 3TCFA 2I3VA 4E0XA 2VP1A 4IB2A 2XXWA 4GFRA 1N04A 3P7IA 4JWYA 3HN0A 3I6VA 3H6VA 1QW0A 3EF7A 3RNNA 2PX1A 3PD9A 2H25A 1RYXA 3VVDA 3HCQA 3OO9A 3OO8A 2QPQA 1FTJA 3C32A 1NH8A 5JK4A 5L9MA 1S7YA 5KZTA 4GVOA 1TT1A 4DZ1A 4POWA 1R6ZA 3L6GA 1N3WA 4JWOA 4HW8A 5DVFA 4NF4B 3U93A 3GLBA 4OETA 1B3HA 4ZS9A 4EQBA 4N6PA 1MH3A 1IXCA 5AA4B 5I58A 2ANJA 4OTEA 4EUOA 4HS7A 4KYSA 1YCJA 1B7ZA 3S9EA 3S2VA 1I6BA 1MXZA 3VFJA 1EH3A 5H8FB 4KYEA 1HSEA 4ZE9A 2DS9A 2F7BA 5I2KB 3MWBA 4IGRA 2RINA 5JEIA 1SDXA 3KZGA 3O66A 2XXHA 1ATGA 1ZTYA 3FJ7A 2NWJA 1IXHA 1AH5A 4QFPA 4G4PA 1LSTA 2XXXA 4JB7A 2A5SA 1TFAA 1DMBA 3IOVA 3PUVE 2PBWA 4OVJA 1Y1MA 1JW1A 4MF3A 2XX8A 4TOZA 3A3UA 1M5FA 3V89B 2RKMA 3LC8A 4ZEKA 3IJOB 4R75A 2V3TA 2Q8JA 4GF8A 1CE2A 3T9UA 5B70A 3T96B 4H8JA 1H43A 2Z8EA 3BKIB 3SEYA 1Y9UA 1N7XA 3VXBA 1XHYA 4R73A 4R6YA 4KQPA 5JTYB 3H4ZA 4X9TA 2BJJX 3D4GA 1YPNA 1GTKA 1HSJA 4AQ4A 1ZIUA 1QKBA 2ESNA 3U94A 1I6QA 3USDA 3PMWA 4YB7A 5HPQA 5FHMA 1T0KA 3C33A 3FV1A 2DE3A 3K01A 1RKMA 3IX1A 2KLFA 1XC1A 3KJ7A 4RPNA 4F2OA 1XVXA 1CB6A 2RC7A 5I57B 1FTOA 3G3IA 1B0HA 2XD2A 1B3EA 4GIZA 1A8EA 1YAEA 5I2NA 1HSLA 4ZEFA 3TFLA 3M3KA 4LZ7A 2HAVA 3TZAA 4HCWA 3CIJA 3MZBA 4FJPA 4OESA 1R9LA 2ONRA 2ALUA 2XXQA 5KDTA 2ZMBA 2ZYKA 1EZPA 5J1DA 1M5DA 3QXMA 4I62A 1VFEA 4F3GA 1BIYA 3G7WA 4F3BA 2OWSA 3OO7A 4RYAA 2R9JA 3KSXA 4IO7A 2Z8FA 3IOWA 1SD3A 4HTGA 3E4RA 1ZMGA 5B7DA 4QRZA 1MXUA 1AL3A 1LBCA 2XXUA 3CSBA 4NTLA 3Q26A 1A99A 3S9LC 4KCDA 1DTGA 2O69A 1FTKA 3KGCA 4OFJA 2PT1A 3M3FA 2REGA 3SKPA 4KYDA 3ONMA 5BUUA 4EXKA 1D9VA 3DP4A 2QL3A 4Q5TA 2F34A 2NOOA 2V93A 3IK6B 4PFUA 1MRPA 4EQ7A 3IR1A 1B5HA 5L8DA 2D5WA 4LZ8A 4OERA 1WVJA 3RPWA 4Q0CA 5H8QA 2W7YA 4DLDA 4YB5A 4L17A 2RC9A 5AA1A 3H6TA 3CFXA 5EHSA 3OD7A 2F97A 1MM6A 2YLNA 3KN3A 3I5OA 5DEXB 4TLMB 4ZECA 5FTIA 1M5EA 4U4XA 4C1TA 1NL5A 1QUKA 5A5XA 2FYIA 4LA9A 2REJA 1TWYA 2F78A 3MZ1A 5K2YA 1POY1 1FQCA 3A3CA 1PB8A 3DP8A 1NMUA 4F2QA 1JVXA 4LQ2A 4YMBA 2O68A 4XKQA 1IEJA 1P1OA 3FD3A 1GGGA 1S50A 1A8FA 4O3BA 3H06B 1QUIA 3TQLA 4MLVA 3SEWA 2DXRA 1N76A 1B51A 5LOMA 2F35A 2QSXA 1N3XA 2X7QA 1FQBA 2Y7KA 4PFYA 2DVZA 4NEDA 2Y7RA 4NF5A 4BDRA 3PPOA 1MXYA 4H1XA 3S9NC 1PDAA 1QUJA 2I4BA 2DQVA 3UORA 2V25A 2F7AA 3CFZA 5KCJB 2UVIA 4KR5A 5AA3A 1LAFE 2OWTA 4XIGQ 4R2BA 1B5IA 4NF4A 4GWOA 2I3WA 2IEEA 5F1QA 3K2DA 3UP9A 2Q9TA 2GHBA 3O9PA 3PU5A 2HZKA 4F22A 1BKAA 4C1UA 1H76A 4DIGA 4YKIA 2Q89A 3MBPA 1URDA 2YJPA 1SW2A 5H8FA 3TCGA 2NVUB 1H44A 2UXAA 3C9HA 2XXRA 3MP1A 4RNSA 4YKKA 2F6PA 2G29A 3TDJA 2PT2A 5H8HB 1AIVA 2QS2A 4F18A 1OIBA 3K00A 2O1LA 3K1PA 4NF6B 3IORA 1A54A 3FATA 4OHNA 3VVFA 2GFEA 3N5LA 1JW4A 2DWAA 4IO3A 2V3QA 4PETA 4G2ZA 3OSQA 3EN3A 3QK6A 3N26A 3T9XB 1DPEA 1ZLQA 1Y3PA 3LBSA 4BDOA 4R6KA 4IY5A 3FVGA 3FUZA 3IO4A 1UTHA 1YTVA 2GRVA 3TTMA 3E9XA 4DE8A 3CR9A 1UTBB 1MPBA 4O3AA 3UK4A 4LUBA 4P0IA 5JTYA 2HEUA 4BDMA 2NXOA 2O51A 2Y7PA 4MLQA 1A40A 1LB8A 4MFIA 5CRYA 3RQTA 4ZEDA 4R2FA 3OXNA 5H8NB 3SEXA 4OYVA 1MDQA 2DOJA 4FATA 1II5A 3PUYE 1XT8A 3THIA 1JQFA 4NMYA 3RT8A 3G3GA 2PYYA 4DDDA 4ZEBA 1MY0A 1N0TA 2VOZA 1O7TA 2HXWA 5I57A 4KHZE 1I69A 3PD8A 4PE5B 4MH5A 3E3KA 3PUWE 1GR2A 2Z22A 1XOCA 3TTRA 2F8DA 1IZ1A 3AXFA 4G8NA 1NNTA 1B46A 1JVYA 4F29A 3R6UA 2VHAA 4YICA 1Y1ZA 2FA7A 1SI0A 2XXYA 3U8QA 2I48A 1SVXB 2DWJA 3BFUA 2FNCA 3W15C 1FW0A 3IB1A 4YB6A 3EHSA 5TPAA 3HO7A 2R71A 3JYRA 1PBPA 2O7IA 1VFDA 1MPCA 4RK2A 4X1DA 4IO6A 2XD3A 2F5XA 2Z23A 5DT6A 2D21A 4Q8RA 1B3FA 4FAJA 4YZZA 3C4MA 5AA2A 1H45A 3MQ9A 3Q25A 1MQDA 3W9WA 2O6AA 2V84A 2QMXA 1L5TA 4ZZEA 2Q2AA 3H3GA 3MVZA 5F7VA 4ZZAA 1OVTA 5DTBA 1LAHE 2RC8A 1JNFA 2XHDA 5I58B 2ONSA 4G8MA 4LZ5A 4OQOA 3O6HA 3TPAA 3CG1A 3H7MA 3KN7A 4X48A 3JZJA 4THIA 3MVXA 3H03A 3EHUA 2HFBA 3FXRA 2ZNTA 4QFLA 2DWIA 2UVHA 3BFTA 4WXJA 5FTHA 3GXAA 4YU0A 3KBRA 3ODBA 4OENA 1J1NA 2HQ0A 3OSRA 1B58A 2XX9A 2ZNUA 3TMGA 3M8UA 2RF1A 3HPIA 1SBPA 1TFDA 3N94A 5FHNA 2QS1A 4JXIA 4OWDA 3CFLA 1OLCA 1AOVA 1P99A 3C36A 4PQJA 4KCCA 3F11A 3MP8A 2OK2A 2DE4A 4DXBA 3OEMA 4BDQA 1LFIA 3RT6B 1MQIA 1I6AA 2ABHA 3VXCA 3FVKA 3MZ9A 4M4GA 1LFHA 1RYOA 1OQGA 4U4SA 1TXFA 3MAMA 2DYXA 5EYFA 3SDFA 2H4IA 4GL8A 3CVGA 1NNPA 2ZYMA 4RK9A 3HHFA 2E1SA 3UN6A 1DPPA 5CM6A 3S9MC 3M3LA 5BWJA 1BP5A 3KSJA 1B7UA 4TLLB 4AB6A 1MQHA 3C31A 1LLSA 3LUYA 2Y7IA 3L6HA 1MQJA 1MDP1 2P0SA 3K1NA 2D3IA 1D4NA 3MVYA 1EZ9A 1MY3A 3ZKKA 5L9OA 2B65A 2ZNSA 1VSOA 3SETA 3EHTA 1B5JA 4QSEA 1MY4A 1PB9A 4U1OA 4C0RA 2CMOA 1MXWA 3FXQA 1MPDA 4RPOA 4NWCA 4XKPA 1QJMA 1SW4A 2WKYA 2M8CA 2UYFA 3I3VA 4OMBA 3QUJA 3TTLA 1OQHA 1MY2A 4YKPA 4R6HA 1B0LA 4DCXA 5I2NB 4ELRA 4EF2A 1BTJA 3ILTB 5H8SA 2X26A 3R7XA 3IB0A 5M2VA 3D4CA 3T66A 4NF8A 3PUZE 5KDTB 4ISUA 4OFOA 3PPNA 3MVWA 3K0VA 2NUVA 3MJNA 2DP8A 2I49A 2THIA 3QIMA 5DVIA 2ONKE 4R74A 5H8HA 4PP0A 4P0GA 4NF6A 3RN8A 1OVBA 1DOTA 4IO5A 4U1ZA 3CG3A 4RJZA 1QKAA 2DVCA 3N6UA 1SW5A 3U1OA 3UIFA 4JWXA 3CSGA 4UA8A 2QS3A 4JSDA 4WKMA 1LBBA 1FTMA 5CBSA 3VLVA 3O6GA 5ICQA 1SQYA 3FVNA 4OXVA 3IJXB 3Q27A 1A55A 2RCBA 3V83A 4RA1A 3T9VA 1N7WA 1B7HA 3EPEA 1EU8A 1NNFA 3TQWA 4E0WA 2HAUA 1MXVA 5EHMA 5AA4A 5I84A 1EZOA 2O84X 2P2AA 3W9VA 3FV2A 5I56B 5CBRA 2V3UA 3TKDA 3U92A 3UGWA 4BDNA 5I2KA 3G3JA 1URGA 4AB5A 2AIXA 1MS7A 2I4CA 3IO6A 4EDPA 5A5XB 1P1WA 1D9YA 3B6QA 4OEUA 4I9DA 2ZYNA 1B1XA 4YMAA 1MG1A 4GXSB 2ZXTA 3C34A 4KI0E 3DELB 3ZKLA 2QS4A 2H9BA 1OLAA 4H65A 1IXGA 1GVCA 3K6XA 5TP9B 2G93A 3PPQA 4I8CA 3N6TA 1MXXA 1SI1A 1Y3QA 4QFKA 3TODA 3VLUA 3K1MA 4F19A 4NE4A 3OMBA 3OELA 1ZU0A 4ELQA 5ISUA 3QYTA 1H3DA 4GXAA 5I59B 2F7CA 1O64A 3KOTA 1MQGA 4DXCA 4NF5B 2QRYA 4IO2A 4LVQA 4GRKA 4G77A 1ANFA 1NKXA 4EXLA 4K3FA 3JV9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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