3C34A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with rubidium at 1.82 angstrom resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c34A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c34A02
1B6HA 4KYSA 3O6HA 1ZBMA 1LGBC 4YKJA 4H8IA 4QSEA 3H03A 4XKRA 4EF1A 3T22A 1VR5A 1MPDA 4FE8A 4EUOA 4OERA 1URSA 3IB2A 4R9GA 3TYHA 1B7HA 1DPEA 2XXTA 1LB8A 4R75A 1A8FA 2VOZA 4LP2B 2R6GE 1NL5A 5BWJA 1N3WA 4IO7A 1USYH 4PFTA 4C1UA 5H8QA 1XOCA 5I59B 2O69A 1NNPA 3FVOA 3H6TA 3MP6A 1H43A 1N7XA 1IXIA 1J1NA 3K01A 5L9SA 4KPTA 2F78A 1JETA 5K2YA 1LFHA 5ELVA 3LC8A 5L8DA 5I2NB 4AQ4A 1S50A 2ZYNA 4WEDA 1CB6A 3FV2A 3O28A 1LCFA 2O6AA 3S9NC 4ZZEA 5AA2D 3EHTA 3PMXA 4U21A 2O51A 1AL3A 1I6QA 1QULA 1XVXA 1P1QA 3EF7A 4QRZA 3T9XB 1SW5A 5I2KB 4O3BA 4ECFA 5KDTB 3MVYA 3LBSA 1B3LA 4U1OA 4HS7A 4G8NA 4RPOA 3U92A 4HCWA 3KFMA 3I3VA 2O7UA 3K6WA 3IO6A 3VDFA 1OLAA 1B9JA 5FHMA 2QJEA 3TQWA 1D9VA 4N13A 4GWOA 4GLIA 1Y20A 2XD3A 3S9LC 3IOVA 4UA8A 2V84A 4FEDA 1MY1A 4BLAA 4F1YA 3SEXA 2PYYA 5H8HB 1QUJA 1AIVA 4F22A 3ECRA 5AA1A 4GL8A 3KN7A 1Y9UA 1FTLA 3OEKA 3CFZA 5FHOA 1MDP1 1EZOA 2ZYOA 4UACA 3SESA 1YCJA 5H8FA 4ND9A 1LAHE 3RPWA 3HCQA 4FAJA 1CE2A 1ZJLA 3QAXA 4QFKA 2OLBA 3O97A 2AL4A 4GVOA 4IGTA 4EF2A 2DWIA 5I58B 3KJ7A 2I0BA 3LSWA 2ZXTA 1URDA 4MF3A 2RINA 1NFTA 4EQBA 3FD3A 4X48A 1MY0A 2XXPA 4ZEBA 5TPAA 1BLFA 1LFGA 4QF9A 2X7QA 4QSCA 3Q25A 2P0SA 1D3KA 2VP1A 4H1XA 4GIZA 4LUBA 4MFIA 2V3QA 3E3KA 3KJTA 3LSFB 1MDQA 3OSRA 1PB8A 4YB5A 3ZKLA 3QYTA 1DPPA 2XXWA 4GF8A 3TFLA 1VSOA 5I57A 2THIA 3CSBA 2A5SA 3PV0E 1BKAA 3H6UA 1EZPA 4JSOA 1IIWA 3VLVA 2OCUA 1N3XA 3CG1A 3C32A 2ABHA 1GR2A 3O6GA 1MQIA 1B3GA 4NWDA 2XXYA 5DVFA 5I56A 4F3PA 1NNFA 3PPRA 3BKIB 1MXXA 3OO7A 2GFEA 4ELRA 3M3KA 3CFLA 2V3TA 1SW1A 5CBSA 1B1HA 2UYFA 4WEPA 1ZMGA 2OWTA 3U1OA 1QUKA 3TTLA 3TQLA 1B1XA 2LAOA 4GQOA 5H8NA 2PBWA 3G3JA 3FVNA 1N04A 3GLBA 3G7WA 3MQ9A 4U23A 3QXMA 2R71A 2I4BA 2RC7A 5CMMA 3B6TA 4TLMB 3T9VA 3Q27A 3CI8A 3PGFA 4KR5A 4R6HA 4JB7A 3M3LA 4OFOA 3IK6B 2VGQA 4C1TA 1WVJA 2OK2A 2Y7IA 2OZZA 1MY2A 2DQVA 2GHAA 2NXOA 3H3GA 4YU0A 4ZECA 3MZBA 1BTJA 1B5JA 5KCJB 3N5LA 1JNFA 3V8XB 1Z7NE 4ELPA 2BJJX 2OWSA 1ZKBA 4F39A 3KG2A 3IAZA 2F6GA 1M5FA 1AH5A 2F34A 4JDFA 2AIXA 3RLFE 1SW4A 1LBCA 1XC1A 1MXVA 1SYHA 3HHGA 4ZS9A 2DWAA 3MVWA 4ESXA 3V89B 3K1PA 4R6YA 2OJTA 3VE1B 2WKYA 1II5A 1A7LA 3G3HA 3KSJA 4LZ5A 4F19A 3IL1B 3TCGA 4BDNA 3B6QA 1JEVA 5F1QA 4Z0IA 3A3UA 1HSLA 1MXZA 2I49A 4DXCA 4MLVA 2REGA 1B05A 4NF8A 1BIYA 3E4RA 1PEBA 2E0SA 4ONYA 2H4IA 4NE4A 1TXFA 1QUIA 4OFLA 4OEVA 4NF4B 1LBBA 4G4PA 2QRYA 2ZNTA 3A3CA 3HN0A 4AB5A 3MJNA 1WDNA 1VFDA 4GFRA 1H3DA 3T9UA 1GTKA 1MQHA 4JWOA 2DS9A 4DZ1A 5TP9B 4H0WA 1P1UA 1P99A 4MBPA 1P1WA 4R6KA 1B3HA 4JXIA 3R26A 3KZGA 5DVJA 1POY1 3LUYA 2UVGA 4H5FA 3IX1A 3L6HA 2R9JA 3VVFA 5AE4A 5H8SA 1JW1A 1I6AA 1B58A 1B0LA 1DSNA 2ESNA 1Z7ME 4YICA 1XT8A 2AYSA 4KYEA 4KYDA 5AA4B 2DWHA 3JV9A 4K3FA 2A5TA 3HHFA 3QUJA 2DXYA 4LONB 1FTOA 1Y3NA 1ANFA 4GXSB 1IUDA 1B46A 4HTGA 1B2HA 3VLUA 3AXFA 4MH5A 3H6VA 2RCBA 5DT6A 5JEIA 3TKDA 1FTMA 1Y1MA 4RK9A 2F7CA 2I4CA 2ONRA 3GXAA 1MY3A 3N6TA 3G3KA 2Q8JA 1KWHA 1ELJA 1O63A 1RYXA 1QKBA 1UTHB 5AA2A 3QIMA 4IO6A 4NWCA 1A99A 4QFOA 3K1NA 1EZ9A 2G29A 2F36A 3K2DA 2QMXA 3MVXA 3T96B 4EQ9A 3IJXB 2YPNA 1MQJA 3Q28A 3CRBA 1UTBB 2HFBA 4H5GA 4IY5A 1RYOA 1OVBA 5ICTA 4XKNA 3C36A 4IB2A 1TFDA 4POXA 5IAIA 4RNSA 2QL3A 5J1DA 4ISUA 1IZ1A 3K6XA 4LATA 2D21A 3DP4A 1MQDA 3KOTA 2X26A 4YKIA 2V93A 1O7TA 2HEUA 1LSTA 4PETA 3QK6A 3G3IA 2Q89A 4G68A 3TAJA 2ZYKA 4LVQA 4HCYA 3ODBA 3CVGA 1FQEA 2DOJA 3O29A 3W15C 1D4NA 2HZKA 3SEUA 1ZU0A 1QW0A 4OTEA 4TLLB 1HSEA 1SDXA 3P7IA 4DDDA 3IB1A 3EN3A 4JWXA 4FJPA 3MW0A 1B5IA 2PT1A 3H4ZA 3SDFA 4QSDA 3VFJA 4NF5A 3QSLA 2RCAA 1A40A 5DTBA 4R72A 4F1VA 3N6UA 4LZ7A 1MPBA 1M5EA 3K0VA 4F2QA 2XXXA 3W9WA 1MXWA 2DVZA 3PMVA 3TDJA 4ZEKA 1T0KA 4IO3A 1A55A 4ZEIA 5A5XA 3FIRA 4XKPA 1NNTA 1LFIA 4OENA 4F31B 3JZJA 4BDQA 4KCCA 4GXAA 2UVJA 4RA1A 2ZYMA 4H65A 4ZDMA 2XX7A 3O66A 3IORA 3TZAA 5ISUA 5K2XA 5H8QB 5CMBA 3K00A 2Y7WA 4KFQA 4DXUA 2FNCA 1FTJA 2RF1A 4NTLA 1OMPA 4LA9A 4FIMA 3UORA 1DTGA 2I0CA 1PBPA 3VV5A 1URGA 3I5OA 4OYVA 4G8MA 2Y84A 2H9BA 3FVGA 4QHQA 2FA7A 1IXHA 1N0TA 4Q0CA 1GVCA 5I84A 2UXAA 3U94A 2YLNA 5CI5A 1MQGA 2RC9A 1TFAA 3MZ9A 4YAHX 2B65A 4X1DA 5DYHA 2XXQA 2QS3A 2NVUB 4RJZA 3U93A 3PUVE 4PE5B 5JTYA 3IOUA 2AL5A 4G68C 1AMFA 3FJGA 3U8QA 1D9YA 3OEMA 1UIUA 4OHNA 3OO9A 1YTVA 2Z8DA 1B4HA 1I6BA 3RN8A 5DEXA 1R9LA 1A8EA 1MS7A 1OQGA 2ONSA 2HAVA 2XHDA 4H8JA 1B5HA 2HAUA 1NH7A 1XS5A 3OMBA 2HQ0A 3RUMA 3KBRA 4P0GA 4H6DA 3PMWA 3FUZA 4L17A 1LCTA 2RC8A 1PDAA 2B3FA 4LZ8A 3TTNA 4N07A 4DIGA 4NF6A 3FJMA 5CM6A 4RPNA 3PPQA 3FVKA 1FQFA 3UA8A 5H8FB 4HW8A 2V3UA 1ZTYA 3K4UA 5TU0A 3N94A 1OIBA 4I9DA 1QKAA 4OETA 2VD2A 4PQJA 4THIA 4WKMA 1B40A 1B7UA 5B70A 2XXIA 2OBGA 2UYEA 1POTA 4KD5A 3O9PA 2HCAA 3RNNA 3D4GA 1WODA 3FXUA 4AB6A 3SERA 3H7MA 4OZ9A 3BFUA 1EH3A 2E1SA 4PP0A 2VHAA 3UK4A 4X9TA 4MLQA 3OSQA 4LQ5A 5ITPA 1PB9A 5TPAB 4F3GA 1N7WA 3H06B 4OMBA 5BUUA 3TPAA 3T66A 3TEPA 4G8HA 2PMSA 1MY4A 3ZKKA 4IO2A 4F18A 4RY1A 3EQ1A 3E9XA 2FYIA 3DLNA 4P11A 1JVYA 2NUVA 3DM0A 5I59A 3PUYE 4F2OA 1XVYA 3TODA 1BP5A 1NMUA 4I8CA 1MPCA 4C0RA 2O84X 3R6UA 4ZEFA 5I57B 4P0IA 4F29A 4IY6A 1Y1ZA 4G2ZA 1M5DA 1MH3A 1UTBA 5I2NA 1R6ZA 1B3EA 3V5AA 1SD3A 5I56B 2DVCA 3TCHA 2KLFA 3FXQA 4XKQA 2IEEA 3FV1A 5I2KA 5KDTA 3MPKA 3BFTA 4R2FA 1YPNA 1MXUA 3HV1A 3S9EA 3IOWA 1IXGA 3IR1A 4I1DA 3UN6A 1R1NA 1TWYA 2XXUA 2ANJA 4FORA 3ILTB 5H8NB 1B0HA 3O2AA 2PT2A 4EDPA 4YKPA 1P1OA 2PVUA 3UIFA 4E0WA 4OFJA 3SEWA 2Z23A 3FASA 3USDA 5H8HA 1JVXA 3M8UA 1MM6A 3CSGA 3SEYA 2M8CA 2Q2CA 1Q35A 5HBCA 4DE8A 1M5BA 4U1ZA 3CG3A 3PU5A 3R7XA 1US4A 4JWYA 3PPOA 3QUFA 3C31A 3S9MC 2F7AA 3VLWA 4DCYA 3HO7A 1B7ZA 4POWA 5KZTA 3I6VA 4DXBA 5ITOA 1OVTA 3OO8A 3S4UA 1DOTA 2Q2AA 3D4CA 1IXCA 2G93A 5AA3A 3L6GA 1UQWA 2HZLA 4OESA 5L9OA 2I3VA 3T93B 4ELQA 3T9HB 2XXHA 2XX8A 1MH4A 5I58A 3OD7A 4IO5A 4OWDA 1SQYA 3RTFB 4YKKA 2PX1A 2DP8A 1FW0A 4OEUA 1M5CA 2ONKE 3VVEA 2I48A 4U22A 4DCXA 3C34A 4OVJA 3UGWA 3UP9A 3PUZE 2ZNSA 2QS2A 3Q29A 4X1BA 1SI0A 4O3AA 2GH9A 3VXBA 1SYIA 1RKMA 2H98A 1EU8A 1ZLQA 1B51A 4NF8B 3MC2A 5L9MA 1UIVA 4QFNA 1SVXB 1JW4A 2H99A 3MP1A 3N26A 1Y4CA 3A09A 1AOVA 4M4GA 3Q26A 3MWBA 1QJMA 3RQTA 3OENA 4KHZE 1HSJA 3SKPA 3DP6A 2F97A 1FQAA 1S7YA 2QPQA 3HSTA 3TTMA 1B3FA 5LOMA 1LLSA 4GOTA 3O6IA 5HPQA 5FHNA 1FQBA 3M3FA 1GGGA 2P2AA 3TMGA 2P1SA 4EQ7A 4R74A 4GRKA 4FEBA 4NMYA 1ATGA 2I3WA 2DXRA 1US5A 3MUQA 3IOTA 2A5TB 2Z22A 1JQFA 2D3IA 1SI1A 3RTWB 1A54A 5HM4B 1IQ7A 1JEUA 1H76A 4BDOA 1P1NA 3FJ7A 4I62A 3RGYA 1FQCA 3ZS6A 1SW2A 3B7DA 2XD2A 3GZGA 3HPIA 4ESWA 4EXKA 4YB7A 4QFPA 3KGCA 2W7YA 5EHSA 1MRPA 4GD5A 2H5YA 3ONMA 3TUSA 4ZE9A 2QMWA 1DTZA 3VVDA 2VD3A 1O64A 2H25A 3ZSFA 4KI0E 4YMAA 4G77A 3W9VA 5AA2B 1PB7A 4DLDA 4KQPA 2GHBA 5KCJA 4ZEDA 3DP8A 3VXCA 1NKXA 3OO6A 3PPPA 3FXRA 2X7PA 1NNKA 2HXWA 1MM7A 3PPNA 1IEJA 3CIJA 4QFLA 4TQUQ 1N84A 1L5TA 4BDRA 1Y3QA 4F3BA 2O1LA 1OLCA 1FCKA 2O68A 2ZMBA 1FTKA 1OQHA 1JW5A 4YB6A 4GL0A 4Q30B 3OOAA 3MP8A 3MPLA 5M2VA 3G3FA 2I58A 4BDMA 4M1VA 5EHMA 1H45A 2Y7RA 3G3GA 1GV8A 3K6VA 3PD8A 4G68B 4H67A 3FGSA 3TELA 3ILUB 3H6WA 2GRVA 3KN3A 2F8DA 2Y7PA 2Q9TA 2QS1A 3MZ1A 3TTKA 4NF4A 3MVZA 2O1MA 2F35A 4JSDA 2D5WA 1R9QA 3SEVA 1LAFE 5ICQA 3DELB 3BBRA 2DE3A 4WXJA 4JBZA 1PC3A 3IO4A 2XXRA 2I6EA 1B52A 1B32A 4NF5B 3JYRA 4OXVA 3GBBA 5EYFA 5TP9A 4OQOA 3LR1A 4F3SA 3K1MA 4IGRA 2QSXA 3S2VA 1TT1A 2F7BA 3MBPA 3LSLA 4U4XA 4FECA 4R2BA 1H44A 4E0XA 3TTRA 3PUWE 1Q1KA 2DE4A 3KN8A 2QS4A 5DVIA 5A5XB 3SETA 3KOSA 2O7IA 4FATA 2CZLA 3K6UA 1MXYA 3K02A 2Z8EA 1ZIUA 3KEIA 5AA4A 3OELA 5FTHA 1LAXA 4XXUA 4U2RA 2V25A 4ZE8A 3CR9A 1F9BA 3TCFA 2ALUA 2Y7KA 2YJPA 2F6PA 5CMCA 2B3BA 2Q88A 3IB0A 1NH8A 3E13X 4LQ2A 3PUXE 4ZZAA 4Q8RA 3EPEA 4R73A 3OXNA 3B6WA 3MAMA 1DMBA 4PFWA 4RXLA 3WAEA 1IITA 1LB9A 2DSFA 3KSXA 3IJOB 4BDLA 1UTHA 4ELOA 3U72A 4YMBA 1MG1A 2Z8FA 2CMOA 3C4MA 5JTYB 2RKMA 4RK2A 4PFYA 5F7VA 4U4SA 4PFUA 4XIGQ 2NWJA 2IA4A 3EHSA 4XTCQ 4F1UA 3RT6B 2REJA 4EXLA 3CFXA 4NEDA 1XHYA 1LAGE 3WAFA 2DE2A 5DEXB 1YAEA 1QVSA 1N76A 1B4ZA 1Y4TA 5JK4A 5FTIA 2XXVA 1PBQA 3FZVA 5IKBA 1SBPA 4KCDA 1VFEA 2F5XA 4O3CA 3C35A 2ZNUA 3PD9A 4R9FA 3RT8A 1Y3PA 3THIA 1S9TA 5CC2A 2UVIA 5B7DA 5CRYA 3C33A 3C9HA 4YZZA 5CMKA 3RY3A 3V83A 4Z7EA 1I69A 3GBAA 2NOOA 2DWJA 3F11A 3LSXA 4NF6B 2DYXA 4Q5TA 4IO4A 1VE4A 3EHUA 4N6PA 5CBRA 4TOZA 4RYAA 2XX9A 1FQDA 2UVHA 1USYE 3FATA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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