3C4MA

Structure of human parathyroid hormone in complex with the extracellular domain of its g-protein-coupled receptor (pth1r)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
519
structure length
469
Chain Sequence
b'AKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFDDVMTKEEQIFLLHRAQAQCEKRLKEVRPCLPEWDHILCWPLGAPGEVVAVPCPDYIYDFNHKGHAYRRCDRNGSWELVPGHNRTWANYSECVKFL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular recognition of parathyroid hormone by its G protein-coupled receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Pa
source organism Escherichia coli
molecule tags Membrane protein
total genus 154
structure length 469
sequence length 519
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c4mA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c4mA01
4.10.1240.10 Few Secondary Structures Irregular Hormone receptor fold GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain 3c4mA03
3HN0A 2DVZA 2DWIA 4LZ8A 2Z8EA 4LF3C 3PD9A 3R7XA 1Y1ZA 4AQ4A 3IOUA 4DIGA 3T96B 1ZTYA 4OFOA 1MXXA 4OWDA 5AA2D 3FVGA 2OBGA 2Q9TA 1ZMGA 1I69A 1Y3NA 2I4BA 2QL3A 4LONB 2YPNA 3QIMA 1OIBA 5I59B 1QULA 3VVFA 3QUFA 1UIVA 3T9HB 2B3BA 1OQHA 3RLFE 3E4RA 4HJ0A 3EN3A 2QPQA 2HZLA 1ZIUA 4RJZA 2DSFA 4G68B 3DLNA 3TEPA 1M5FA 4NWCA 1QUKA 1ANFA 4M1VA 4PFTA 2O1MA 1B0LA 5A5XA 2UXAA 3ECRA 2QS1A 2NUVA 2VGQA 1SYHA 1B32A 4RK2A 3OXNA 5K2XA 1EZ9A 2O51A 4X1DA 4KYEA 2A5SA 3H3GA 2PT2A 4ZEIA 2Y7KA 4YKKA 2Z23A 1ZU0A 1LB9A 3Q29A 4K3FA 4R6YA 5F1QA 4GLIA 2O1LA 3AXFA 3KJTA 2B3FA 3LC8A 1MXYA 3PU5A 1FTOA 4HW8A 4I62A 3FUZA 4GXAA 1YTVA 4ECFA 1LAFE 4OQOA 3Q26A 3U93A 1FQAA 4YKPA 1B9JA 4QSCA 4KD5A 2ZYKA 4OEUA 5AA3A 5LOMA 4ERSA 3EPEA 5CRYA 2O69A 3IOTA 3TQWA 1T0KA 4BLAA 3FJMA 2ZXTA 1B52A 1MY4A 5TP9B 1AIVA 4OESA 2F5XA 3Q25A 3TAJA 1B5IA 3IR1A 4BDRA 5KCJB 4OXVA 1CB6A 2ONKE 5CMMA 5H8FA 5H8QA 2Q88A 2DVCA 1VFEA 4GXSB 1MM6A 3K1NA 3KSJA 2CZLA 1DOTA 1R9QA 4XIGQ 1SW5A 3LUYA 1MQJA 5AA4A 3O97A 3VVEA 5CMCA 3K00A 2RC8A 3S9LC 4LVQA 1J1NA 3IORA 5CI5A 1H43A 1UIUA 3MC2A 3FXUA 2XX9A 1LBCA 1MH4A 5HBCA 1N84A 2V84A 1MY0A 2XXWA 5I57A 4C1UA 1MH3A 4U23A 4QSDA 1LB8A 2ESNA 3UA8A 4NE4A 4BDNA 1SDXA 3DP8A 3S2VA 1NNPA 3AQFB 3OSRA 1B7HA 1TT1A 2ZNUA 4R6KA 5BWJA 4GWOA 4IO5A 1PEBA 3JYRA 1US5A 4P0GA 4JWOA 4X9TA 3IOWA 3RNNA 3O6IA 3SKPA 1TFDA 5DYHA 4E0WA 1ZKBA 4IY6A 3GZGA 4ZEDA 2QMXA 3PUYE 1BP5A 3TMGA 3O28A 1B3FA 5H8HA 1LAHE 3HO7A 2Y7PA 4P0IA 1JW4A 4C0RA 4KPTA 1N3XA 1PBQA 3IB2A 3VLUA 4ISUA 2PT1A 3FIRA 1A55A 2DXYA 1NKXA 3K01A 3ZKLA 3IO6A 1PBPA 4EF1A 3TDJA 2ALUA 2H25A 1HSJA 1R6ZA 1F9BA 4ZS9A 4G8HA 4U2RA 4G68C 4I1DA 1XOCA 1N04A 4M4GA 3OELA 4RNSA 2DS9A 4KYDA 3Q28A 5JTYA 3RY3A 2D21A 3A3UA 2D3IA 4F1VA 3DP4A 5EHSA 1IITA 1HSLA 4YMBA 3A09A 2Y7IA 3C59A 4F3PA 3U94A 1SQYA 2ZMBA 5HM4B 4UACA 2QJEA 4NTLA 1M5DA 2V3QA 1N0TA 3TCFA 2I3VA 2I3WA 2XXUA 5DT6A 5H8QB 1B05A 4DCXA 2XXVA 3VFJA 1A99A 2VP1A 4EQBA 2A5TB 3L6HA 4GQOA 1CE2A 3G3IA 2DE3A 5L9SA 3OEKA 3LSWA 4XKQA 2Q2AA 1FTLA 2F7AA 4G8NA 5AA4B 4LA9A 3SEVA 3UORA 5HPQA 3ODBA 4JXIA 5BUUA 1JNFA 2XX7A 3MP1A 2GFEA 1URGA 4THIA 2Z8FA 2QKHA 5ITOA 3LR1A 2X7QA 3C4MA 3G3HA 2VHAA 3MVYA 1QUJA 3HV1A 1O64A 2REJA 2DWJA 2Z8DA 3RTFB 4C1TA 4PE5B 2XXXA 4O3BA 1Q35A 3KOTA 3PUZE 3C9HA 3TZAA 1ATGA 3PD8A 2ANJA 1MXUA 4DLOA 4RXLA 4PFUA 5DVIA 3K4UA 3T22A 3VV5A 2HXWA 3FGSA 1B58A 2OZZA 3FASA 3K6XA 3MVZA 4R9GA 2AIXA 2GHAA 4LQ5A 4F29A 2F34A 1PB8A 4RPOA 2RCAA 3FZVA 1B3GA 1B7ZA 1BKAA 1MY1A 2OWTA 4F3BA 4OEVA 3EHTA 4O3CA 1Q1KA 1VR5A 5B70A 2HQ0A 4F3SA 3I5OA 3I3VA 3QUJA 1B2HA 2E0SA 3FV2A 3OD7A 3MBPA 1S7YA 3CSGA 2H99A 1D9YA 3H7MA 4HCWA 3IJOB 4XTCQ 3ONMA 4DXUA 1B40A 3F11A 2FNCA 4DLDA 1B0HA 3RTWB 3R26A 1NNFA 1URDA 1KWHA 2PMSA 3GXAA 1A54A 3LBSA 4U21A 2H98A 4NF5A 4ESXA 4YB7A 3PV0E 4Q0CA 1B3LA 1OLAA 1B5HA 4GL8A 1MM7A 3CFLA 1NL5A 4IO4A 3SEYA 4NF4A 1USYE 2QMWA 1JVXA 4RK9A 3S9NC 3RGYA 1SVXB 1B51A 1SW4A 5FHMA 2AYSA 1RKMA 1RYXA 2HFBA 3RT8A 2VOZA 1N7XA 4IY5A 3C33A 1II5A 1FW0A 1SI1A 1IXIA 1MXZA 4YKJA 4OVJA 1O63A 5FHOA 1LCTA 3FJ7A 2VD3A 4JSDA 1L5TA 2ONSA 5ITPA 4TLLB 2XX8A 3TCGA 2DP8A 3BFUA 1WDNA 3B6QA 3K1PA 2YLNA 2PBWA 1B4ZA 3PPOA 5TU0A 3E9XA 5AA1A 4MBPA 2DOJA 3GBBA 3B6WA 1GGGA 3CVGA 1MQHA 4OYVA 1QKAA 1XS5A 4DXCA 5I58B 4XXUA 4FE8A 3U72A 4BDOA 2QS3A 4FORA 4QFPA 4TOZA 4ZEBA 2BJJX 3H4ZA 4QFLA 1LCFA 4OFLA 2I6EA 1GVCA 3H6VA 2XXRA 1MPBA 4F18A 4EQ9A 1NFTA 2Q8JA 3CFZA 3KZGA 3PGFA 1SW2A 3LSFB 3KSXA 3CFXA 3L6GA 1NNTA 1IXCA 4LATA 2O68A 2Y84A 1GR2A 1JVYA 4IO2A 1MY3A 3VLVA 3W15C 4BDLA 4OFJA 4JSOA 4XKRA 2O7IA 5AE4A 1U34A 1NH8A 5DEXA 2UVHA 4GF8A 5FTIA 5M2VA 4PETA 3IK6B 1RYOA 2A5TA 4FEDA 4ELQA 3K6WA 5IKBA 1VSOA 4POWA 4H5FA 1QVSA 1PB7A 1Y9UA 4H5GA 3TTLA 2V3UA 3EHSA 3THIA 4TLMB 2HZKA 3VLWA 2UVIA 3IX1A 3MVXA 3C5TA 4BDMA 1S9TA 1Y4TA 4RPNA 1YPNA 5AA2A 1MQIA 4NF5B 2F6PA 3G3FA 3SEUA 2DE2A 4ESWA 3EHUA 3D4GA 3K2DA 3MJNA 1Y3QA 4NF4B 2X7PA 3W9VA 1MXWA 4NMYA 4PFYA 4YU0A 3K1MA 4LUBA 4F19A 4OETA 5ISUA 3M3LA 3KN8A 3SEWA 2RC7A 3C31A 3KFMA 4GD5A 1NNKA 3PPPA 1AOVA 4IO3A 2I49A 4F31B 1DTGA 4F1UA 1EU8A 3TCHA 1BLFA 2F7BA 5II0A 2R71A 4YB5A 1A40A 1MS7A 4KHZE 1HSEA 3N6TA 3DP6A 1LAGE 1A8EA 1N7WA 2QRYA 4UA8A 3R6UA 3MVWA 1OQGA 3MZ9A 3FATA 3H6TA 1GV8A 3FVOA 4XKNA 4R72A 4NEDA 4JWYA 4R6HA 3I6VA 3N6UA 3MZ1A 1D9VA 4L17A 4Q5TA 3C34A 1I6QA 1EH3A 3V83A 4FAJA 3TYHA 4LP2B 1PDAA 1UQWA 4U1ZA 3K02A 2ZYNA 3EF7A 3TFLA 4DE8A 4QFNA 1FQDA 1XT8A 1MY2A 1B5JA 1IXGA 4H0WA 1UTBA 3TUSA 1BTJA 5KDTB 3G3KA 1P1QA 2UVJA 2ZNTA 2OLBA 5CBRA 3KOSA 3U92A 1N3WA 3E13X 2OJTA 1LFIA 3KJ7A 3P7IA 1B46A 3KEIA 4DDDA 1OVTA 3FVKA 3M3FA 3S9EA 1GTKA 3MPKA 4NF8B 5CBSA 1XVXA 5I56B 4QSEA 1OVBA 3PMVA 5DEXB 2X26A 3TODA 4WXJA 4ZEKA 3OO7A 4YMAA 1DTZA 3TELA 2AL4A 1ZBMA 4IO6A 4U22A 4FJPA 1IUDA 3UN6A 4KR5A 3ZSFA 4ND9A 4Q30B 4R75A 3KBRA 2H5YA 3TPAA 1FTJA 3PPNA 4FECA 3DELB 3S4UA 5AA2B 3UK4A 3SERA 4F2OA 1FQCA 3T9VA 3N94A 2HAVA 2Y7RA 1BIYA 1MDQA 1LGBC 3CR9A 2I58A 4AB5A 4H6DA 2OWSA 1M5CA 4KI0E 3B7DA 3H6WA 1USYH 2GRVA 1US4A 4F22A 5JK4A 2Z22A 5I58A 2NVUB 5ICTA 1PB9A 2XXTA 2DWAA 1LSTA 1UTHB 2FA7A 2GH9A 4MFIA 1TWYA 5H8NA 3G3JA 2W7YA 2F36A 3RT6B 3IO4A 2G93A 3N26A 4R2BA 3VDFA 1H76A 2JNDA 2VD2A 1FQEA 2P1SA 2DWHA 5CMKA 3TTKA 1I6BA 3MPLA 1H3DA 3UGWA 2HEUA 3VVDA 3QXMA 1LFHA 3PUWE 1B4HA 1PC3A 4E0XA 1P1NA 4GFRA 2V25A 3MZBA 3ZS6A 1UTBB 1AMFA 1AL3A 1MQGA 1IXHA 3SETA 4H65A 4FIMA 4U4XA 1FTMA 5B7DA 3HHFA 3V8XB 3TTMA 3H6UA 1DPPA 5FHNA 3N7SA 2I4CA 3MQ9A 4QF9A 2P2AA 3MUQA 3PMXA 4I9DA 3C36A 3N5LA 1M5BA 2PVUA 4PP0A 4IGTA 3W9WA 1OLCA 3MP6A 5DVJA 2O84X 2JNCA 3PMWA 2XXIA 4POXA 3SESA 2B65A 2IA4A 4G77A 1Y1MA 5J1DA 4YKIA 2Q2CA 4QRZA 2WKYA 2XD3A 4DCYA 4G8MA 3OO6A 4U4SA 3O66A 3V5AA 3T66A 1DPEA 4I8CA 2HAUA 4PFWA 4JDFA 4NF6A 3ILUB 5K2YA 2XXPA 3K6VA 4ZE9A 1QUIA 1ZJLA 4ZEFA 3MP8A 3VE1B 3HCQA 4H1XA 3RUMA 4KCDA 2RINA 2F7CA 3KN7A 4DXBA 4F2QA 2ABHA 4MLVA 1P1UA 4R9FA 2M8CA 5TPAB 2OK2A 4PQJA 1NMUA 3E3KA 4X48A 3MAMA 4WEPA 2F78A 2AL5A 4EUOA 4IO7A 4HS7A 4Z7EA 1I6AA 1POTA 4G2ZA 3PPRA 3H03A 5CM6A 4G4PA 4QFKA 4ZE8A 5H8NB 5KDTA 4H67A 3OOAA 3CSBA 1POY1 3TTNA 1D3KA 4QFOA 3HPIA 4YB6A 3TQLA 2F6GA 4HTGA 2PX1A 3BFTA 2V3TA 1R1NA 2F8DA 3CRBA 1MRPA 3T9XB 4NF8A 4GVOA 3GLBA 4OTEA 3CG1A 2F35A 3M8UA 5I56A 2FYIA 3G3GA 1Y3PA 4ZGMA 4LQ2A 1XHYA 4TQUQ 1SW1A 4ZECA 4BDQA 2DE4A 3GBAA 2DQVA 1SYIA 3IB0A 1JQFA 1FQFA 2NWJA 2NXOA 1P1WA 2QS2A 4NWDA 3D4CA 4P11A 4EXKA 2I0BA 5EYFA 1ZLQA 4MLQA 4FEBA 2HCAA 2CMOA 3A3CA 1IIWA 2F97A 2QSXA 1XVYA 2RF1A 4ZZAA 1QW0A 5I2KA 3MWBA 1R9LA 1LBBA 1LLSA 3K6UA 1LFGA 3OSQA 3ZKKA 4ZZEA 4OMBA 1MDP1 3FXRA 3FD3A 3QK6A 1B6HA 3C35A 3SEXA 2KLFA 4ELRA 2IEEA 1B3EA 1M5EA 5JEIA 1FTKA 2H4IA 4WEDA 4EDPA 4ZDMA 1H44A 4R2FA 1VE4A 3VXCA 3N7PA 1S50A 3HHGA 1UTHA 1B1XA 3TKDA 1O7TA 1TXFA 5F7VA 2UYEA 1WVJA 2XXHA 4OZ9A 1ELJA 4MF3A 4NF6B 2Y7WA 1JW5A 2XHDA 3QAXA 5EHMA 1Z7NE 2E1SA 3S9MC 1IZ1A 4O3AA 2XDGA 3IB1A 1MQDA 5A5XB 3EQ1A 2DXRA 4XKPA 2PYYA 4JWXA 1Y4CA 4H8IA 2YJPA 3RQTA 1Z7ME 2UYFA 4N07A 4GIZA 3IL1B 3QYTA 4DZ1A 4RY1A 3HSTA 1SI0A 3IOVA 3O6HA 4R74A 3N7RA 3B6TA 2ZNSA 2DYXA 4KYSA 3JV9A 3TTRA 4N6PA 1YCJA 3CG3A 2D5WA 4MH5A 3RN8A 5I2NA 1A7LA 3PPQA 3UP9A 2QS4A 2REGA 3OENA 1EZOA 2RCBA 1FQBA 5ICQA 3FXQA 2THIA 2V93A 2RKMA 2I0CA 1JEUA 3O2AA 5DVFA 1NH7A 3M3KA 3UIFA 1B1HA 2ONRA 3H06B 5I84A 3U8QA 2GHBA 4DLQA 3JZJA 4F1YA 4KFQA 1XC1A 1QJMA 3ILTB 2XD2A 4YAHX 3BBRA 2XXQA 5ELVA 3KG2A 1JEVA 5CC2A 1URSA 1P99A 2L27A 4RYAA 2ZYOA 3FV1A 2NOOA 3T93B 2P0SA 1P1OA 3VXBA 1H45A 3WAFA 3O9PA 4F39A 5L9MA 2O6AA 3IAZA 5H8FB 3QSLA 3T9UA 2XXYA 3FVNA 3IJXB 3G7WA 4GL0A 3LSLA 4FATA 5I59A 1MG1A 4GOTA 4LZ5A 1B3HA 5I2KB 1YAEA 3OMBA 4IGRA 3DM0A 1VFDA 4G68A 3FJGA 4ELOA 4LZ7A 5DTBA 3SDFA 3OO9A 2I48A 2O7UA 4EF2A 5TPAA 5L8DA 2ZYMA 1IQ7A 4Z0IA 3WAEA 3OO8A 4F3GA 2Q89A 5I57B 1DMBA 4H8JA 4OENA 1FCKA 1EZPA 1AH5A 3LSXA 3BKIB 2LAOA 4OHNA 4YZZA 4AB6A 1SD3A 1IEJA 4U1OA 4EXLA 4ELPA 3CI8A 3U1OA 1MXVA 5H8SA 1D4NA 2UVGA 2G29A 4WKMA 4JB7A 4IB2A 2OCUA 1TFAA 4N13A 3KGCA 5FTHA 3PUVE 4X1BA 3O6GA 4KCCA 4QHQA 2RC9A 3PUXE 5IAIA 3O29A 5H8HB 5L9OA 2R6GE 4YICA 3K0VA 1LAXA 4JBZA 1JW1A 4HCYA 5CMBA 3MW0A 3V89B 1JETA 5I2NB 1N76A 3C32A 2R9JA 1B7UA 3OEMA 1DSNA 4EQ7A 5TP9A 1OMPA 3USDA 1MPDA 4KQPA 5KZTA 1A8FA 5KCJA 1Y20A 4OERA 4RA1A 1QKBA 1SBPA 1MPCA 4ONYA 1WODA 4R73A 3CIJA 3L2JA 5JTYB 4Q8RA 2H9BA 3Q27A 3IOLA 4GRKA 3KN3A 3RPWA 2JODA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HN0A 2DVZA 2DWIA 4LZ8A 4JVCA 2Z8EA 4LF3C 1JP4A 3PD9A 3R7XA 1Y1ZA 4AQ4A 3IOUA 4DIGA 3T96B 1ZTYA 4OFOA 1MXXA 4OWDA 5AA2D 3FVGA 2OBGA 2Q9TA 1ZMGA 1I69A 1Y3NA 2I4BA 2QL3A 4LONB 2YPNA 3QIMA 1OIBA 5I59B 1QULA 1NUYA 3VVFA 3QUFA 1UIVA 3T9HB 2B3BA 1OQHA 3BIGA 4NX1A 3RLFE 3E4RA 1FBEA 4HJ0A 3EN3A 2QPQA 2JJKA 1LBWA 2HZLA 1ZIUA 4RJZA 2DSFA 4G68B 3DLNA 3TEPA 1M5FA 4NWCA 1QUKA 1ANFA 4M1VA 4PFTA 2O1MA 1B0LA 5A5XA 2UXAA 3ECRA 2QS1A 2NUVA 2VGQA 1SYHA 4GWWA 1B32A 4RK2A 3OXNA 5K2XA 1EZ9A 2PFYA 2O51A 4X1DA 4KYEA 2A5SA 3H3GA 2OWZA 2PT2A 4ZEIA 2Y7KA 4YKKA 2Z23A 1ZU0A 1LB9A 3Q29A 4K3FA 4R6YA 5F1QA 4GLIA 2O1LA 4DI3D 3AXFA 3KJTA 2B3FA 2CZHA 3LC8A 1MXYA 4OVQA 3PU5A 1FTOA 4HW8A 4I62A 3FUZA 2PFZA 4GXAA 1YTVA 4ECFA 1LAFE 4I3YA 4OQOA 3Q26A 3U93A 1FQAA 3PTYA 4YKPA 1B9JA 4QSCA 4KD5A 4O7MA 2ZYKA 4OEUA 4MNIA 5AA3A 4OA4A 2Q74A 5LOMA 4ERSA 3EPEA 5CRYA 2O69A 3IOTA 3TQWA 1T0KA 4BLAA 3FJMA 2ZXTA 1B52A 1MY4A 5TP9B 1AIVA 4OESA 2F5XA 3Q25A 3TAJA 1B5IA 4AS5A 4NGUA 3IR1A 4BDRA 5KCJB 4OXVA 1CB6A 1IMEA 2ONKE 5CMMA 5H8FA 5H8QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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