3C4MA

Structure of human parathyroid hormone in complex with the extracellular domain of its g-protein-coupled receptor (pth1r)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
519
structure length
469
Chain Sequence
AKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFDDVMTKEEQIFLLHRAQAQCEKRLKEVRPCLPEWDHILCWPLGAPGEVVAVPCPDYIYDFNHKGHAYRRCDRNGSWELVPGHNRTWANYSECVKFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular recognition of parathyroid hormone by its G protein-coupled receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Pa
molecule tags Membrane protein
source organism Escherichia coli
total genus 154
structure length 469
sequence length 519
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c4mA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c4mA01
4.10.1240.10 Few Secondary Structures Irregular Hormone receptor fold GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain 3c4mA03
3U94A 4PETA 4POXA 1XC1A 3S2VA 3S9LC 3T9UA 5LOMA 1M5FA 2DYXA 3PUYE 2JNCA 1UIVA 4XKPA 1FTLA 1MM6A 3LUYA 2IA4A 2PT2A 3KN3A 2ONRA 4G8HA 3QXMA 5H8NA 1ZKBA 2X7QA 3FXRA 2O68A 5HPQA 1MM7A 1Q35A 1PBQA 4N13A 4ERSA 1VFEA 1UIUA 1N7XA 3CFLA 2O1LA 1ELJA 4KYSA 1QUKA 3IX1A 4HS7A 4G8NA 4ONYA 4FE8A 4Q30B 1GV8A 2OLBA 4KFQA 4DLDA 4C0RA 2W7YA 5CBSA 1B7ZA 1L5TA 3N94A 1A55A 2GH9A 1NFTA 4OFLA 1JVYA 3MZ9A 1AOVA 2YPNA 3ECRA 2ZYOA 1XT8A 3ILTB 1QUJA 3RTWB 5I56B 3OXNA 4GLIA 2I49A 1OQGA 1FQBA 1JEUA 3KZGA 3SESA 4F29A 2H98A 2ABHA 4JWYA 4PFWA 4P11A 3DLNA 2GHBA 3WAFA 1JW1A 2UXAA 3FJMA 3RNNA 1MQGA 3F11A 2Q2CA 3PMXA 3VVEA 3RQTA 3S9EA 5AE4A 1LAXA 4RYAA 2REGA 5FTHA 3VFJA 1POTA 4IO6A 4QHQA 1SVXB 1ZJLA 1DSNA 3FJGA 5A5XA 5TP9B 1EZ9A 1FQAA 4MBPA 3PMWA 5DT6A 4Q0CA 2RCAA 3FVKA 2XD3A 3N5LA 4NTLA 3TPAA 4GXAA 1MDQA 4EQBA 5CC2A 5I59B 3RT6B 3PPNA 2O6AA 1KWHA 3CSGA 1B1XA 3TELA 2F34A 1D4NA 1H76A 3TTKA 2XDGA 3G3HA 3V89B 3VDFA 2O7IA 4THIA 3G3KA 1SW1A 2AIXA 3PUVE 4OFJA 4QFLA 1OVBA 4F2QA 4JB7A 2F5XA 1B46A 4YMBA 1BTJA 3KN7A 4TQUQ 3RT8A 1Z7NE 1XHYA 4KPTA 2DVZA 3BFUA 1I6AA 4G8MA 3FXUA 3B6QA 4KYEA 1QW0A 4NE4A 5JK4A 3MC2A 3E13X 4G77A 5L9OA 3R7XA 2O51A 4QSEA 3EPEA 5KCJA 3RY3A 4WKMA 4G4PA 5TU0A 3D4GA 5JEIA 3MUQA 1O63A 1US4A 3OSQA 1B05A 3K2DA 1ZU0A 5I2NA 3B6TA 5EYFA 4FEDA 1AIVA 1ZLQA 4O3AA 4NF6A 2XHDA 1ZMGA 5H8NB 4IO7A 4R74A 3TYHA 5I2KB 3AQFB 2YLNA 2UVJA 3H6UA 1MRPA 1N3XA 3W9VA 4PFTA 3N7PA 1B9JA 1NNTA 3M8UA 4MLQA 2QL3A 4E0WA 3I5OA 1B32A 3IJOB 4NF8A 4KYDA 3PPRA 4DXCA 1WVJA 2OWSA 3PUWE 4DXUA 2RCBA 5M2VA 1IQ7A 3DP4A 3QYTA 2DWJA 3IOTA 1HSLA 1NNFA 3EQ1A 3K6VA 3PPPA 3TCFA 1XVXA 4NWDA 3VXCA 4OENA 1N3WA 4IO5A 3DELB 4PE5B 4F3BA 3QAXA 2ZMBA 4IO4A 1OQHA 4WEPA 3LSWA 1I69A 5CMKA 4GL8A 3OENA 4I9DA 1QULA 2PVUA 1LBBA 1MS7A 1P99A 3OELA 2Y7RA 2YJPA 5H8QA 4TLMB 2E1SA 4YZZA 3N7SA 1LBCA 1B7UA 1NMUA 4JDFA 1FTJA 3LSXA 4ZGMA 3E3KA 4RPNA 5AA4B 3SEVA 3H7MA 1TWYA 2D21A 3Q28A 4UA8A 1N0TA 4IGRA 1MXYA 4AB6A 3FZVA 2XXYA 3H6WA 2I3WA 1MQHA 3TZAA 3I3VA 1B51A 1EZPA 4F3SA 2Q2AA 4YKKA 5ITPA 1JEVA 2FNCA 1QKAA 4R9GA 2B3BA 2OWTA 1FTOA 4QSDA 2NVUB 1MPBA 5H8HB 3T93B 4IO2A 2HEUA 1A54A 4U1ZA 1NH8A 4LZ7A 2F7CA 3K00A 2VD2A 1LAHE 1ZTYA 2Z23A 4HCWA 4NF4B 2H25A 2I0CA 3KGCA 2QKHA 3MZBA 4H5GA 4JXIA 3GLBA 3S4UA 3MPLA 5AA2D 4ECFA 1URGA 1P1QA 2I4CA 2Z22A 5L9SA 3H3GA 2X26A 1H44A 3R6UA 3KN8A 3JZJA 4Z7EA 1A8FA 3HHFA 5DEXA 4ND9A 1URDA 2F36A 5I2NB 4MFIA 1MXZA 1YAEA 3PPOA 2R9JA 4LZ5A 3UP9A 1A7LA 3CRBA 4NF6B 3MP1A 1JNFA 1P1OA 4JSOA 5I57A 4LONB 2XXTA 2XX7A 5CI5A 3TCHA 1SQYA 1B3GA 3P7IA 5II0A 1B0LA 2XXVA 3G7WA 3TEPA 2DE4A 3V8XB 4R6YA 1Y20A 3N7RA 2V84A 1PB8A 3CR9A 1P1WA 1P1UA 4ELRA 4FIMA 2DXRA 1M5DA 3KEIA 4G68A 1ATGA 4C1TA 3K6UA 3C59A 3T9VA 1OMPA 2RC8A 2F78A 2JNDA 3C9HA 2QJEA 3HV1A 3MJNA 4R2BA 1TFAA 3IOUA 4EF2A 3IR1A 5DYHA 3H06B 2JODA 1NH7A 2BJJX 1UTBA 1B5IA 3PD8A 4EDPA 4X48A 1FQCA 3B7DA 3VXBA 1B4HA 4BDQA 2NUVA 4GIZA 2I4BA 5DTBA 1XVYA 1B3HA 2Z8EA 2O69A 1Y4TA 4GWOA 1XOCA 4X9TA 3QIMA 4JBZA 3VV5A 3SEWA 3VLUA 3T66A 1U34A 1Q1KA 3TUSA 4AB5A 4F22A 3KJTA 3RUMA 3IB2A 4BDOA 4EQ7A 4M4GA 1FQFA 1I6BA 1N76A 1B6HA 4XTCQ 2AL4A 3N6UA 3PMVA 4BDRA 5HBCA 4OHNA 5CM6A 4DE8A 4Q8RA 3IOLA 2LAOA 2AL5A 4DCYA 2Z8FA 3C35A 3MPKA 4U4SA 3C33A 1FCKA 1VR5A 4GD5A 3RLFE 2A5SA 4GFRA 3HHGA 1N7WA 1R9LA 1GTKA 3OOAA 5FHOA 5KDTB 3GBBA 2ONKE 3HSTA 1FW0A 4R9FA 3THIA 4DZ1A 4YU0A 5B7DA 3Q27A 2OJTA 1ANFA 3M3FA 4KHZE 2F7BA 1A40A 3U72A 3U92A 3MVXA 2VGQA 3MBPA 4H65A 4OFOA 2HQ0A 1UTHA 3MVYA 1T0KA 1Y1ZA 1JVXA 1IXGA 3IL1B 4KR5A 5ISUA 3O6GA 1QJMA 1GVCA 4PQJA 4NF5A 3TTRA 5AA2A 4OVJA 4GF8A 5DEXB 3IK6B 3C31A 3TTNA 1M5EA 5H8FA 4X1BA 4XKRA 2CMOA 1SI1A 2F6PA 4LATA 3N26A 3PPQA 4P0GA 3MVZA 3G3JA 2XX9A 2X7PA 4KD5A 2P1SA 2ZNUA 3KSXA 3O29A 3MQ9A 1BLFA 3PD9A 1MQIA 5DVJA 5EHMA 5CMMA 4QFOA 1MY4A 1IXHA 5DVIA 3MAMA 4EXLA 1DMBA 4F1VA 3O9PA 4F3GA 2V93A 2Y7WA 4XKNA 3IO6A 3FV2A 4OEVA 2ANJA 5HM4B 2G29A 3IB0A 2Q89A 2G93A 1MXWA 1RYXA 2XXPA 3MW0A 1M5BA 1TT1A 2FYIA 5I58A 4R6KA 3FV1A 4YAHX 3O28A 2F35A 4DLOA 1MPCA 3Q29A 1DOTA 5JTYA 5FHMA 1IUDA 1QVSA 3KSJA 3ODBA 4LQ2A 2RC9A 1ZBMA 3EHSA 1UTBB 4GQOA 1S7YA 4ZEBA 2I48A 2QS1A 4KI0E 4LUBA 3N6TA 4NWCA 5IKBA 5BWJA 5FTIA 3OEMA 4H6DA 1O64A 3USDA 1LB8A 1R9QA 4U1OA 2O1MA 3QK6A 3VVFA 2RKMA 1MY2A 1XS5A 3CIJA 3TODA 3U1OA 4X1DA 4H8JA 3MP8A 1NNPA 2QMWA 3FGSA 2UVGA 3TKDA 3OMBA 2VOZA 2I6EA 4EXKA 3GZGA 4U4XA 2H99A 3K02A 3K1PA 5CRYA 3JYRA 2XXRA 3SDFA 4O3CA 3OO7A 1BKAA 3EN3A 4PP0A 3L6HA 2Y7PA 5B70A 3U93A 4OERA 3ZKLA 1QKBA 3BFTA 4RNSA 4OESA 3VVDA 4NEDA 4XKQA 4ZE8A 2KLFA 3K6WA 5A5XB 4BDLA 2DE3A 4XIGQ 1B52A 2ZYMA 1WDNA 1UTHB 3IOWA 1HSEA 3K6XA 1WODA 2P0SA 3SKPA 3L6GA 2HZLA 1O7TA 3A3CA 1LSTA 2Q9TA 3MVWA 3LBSA 1Y3PA 1IITA 4BLAA 1QUIA 3UA8A 4ZZEA 5CMCA 4G68C 4OXVA 4NF5B 2VP1A 4PFYA 1CE2A 1Y3QA 1RKMA 2QSXA 4LZ8A 1MDP1 5H8FB 3OSRA 4LVQA 4RK9A 1IEJA 2WKYA 1B40A 4JWXA 3G3GA 4R73A 2ZYNA 5K2XA 4IY6A 1IXIA 3S9NC 1OLCA 2DS9A 2PBWA 1AH5A 1UQWA 2CZLA 1H3DA 3TFLA 4DXBA 5ELVA 4UACA 1SW4A 3IJXB 3QUJA 3K4UA 5K2YA 1POY1 2ZXTA 4EUOA 1MH3A 5KZTA 2PX1A 2B3FA 1LLSA 3V5AA 1LB9A 3E4RA 2I0BA 4OZ9A 3TMGA 3GBAA 5L9MA 4KCCA 3I6VA 3ZS6A 1D9YA 3B6WA 4BDNA 2ESNA 4XXUA 3O97A 1MG1A 4LP2B 5KCJB 1EZOA 2DWAA 1SYHA 4QSCA 3SERA 4HW8A 2D3IA 2HAUA 4ISUA 4RA1A 4YKJA 2GFEA 2QS4A 4EQ9A 3HPIA 4RXLA 1Y9UA 5BUUA 3D4CA 1BIYA 4LQ5A 4M1VA 5I59A 4U22A 1SBPA 3KJ7A 3HO7A 3UORA 2RC7A 3O6HA 4Q5TA 3C34A 2ALUA 1RYOA 4KCDA 3G3IA 3K0VA 2ZNTA 1B4ZA 5F7VA 3MZ1A 1MQJA 2V25A 4AQ4A 3T22A 3EHUA 4NF8B 4TLLB 4YKIA 4OQOA 1YCJA 3KFMA 1MXUA 3SEXA 3TQLA 1R6ZA 5L8DA 2Q88A 3K1MA 4LF3C 5AA3A 1JW4A 4ELQA 1IZ1A 4I62A 3LSLA 2XX8A 2HZKA 3FIRA 4IGTA 3GXAA 5I84A 1BP5A 4C1UA 1JQFA 4OEUA 2Y84A 3L2JA 3W15C 1AL3A 5AA1A 2F97A 3IORA 3KBRA 1PB9A 4I8CA 4BDMA 3EF7A 2QMXA 2DSFA 3IOVA 4MF3A 4DCXA 4QFNA 3C4MA 4L17A 2V3QA 5H8QB 1USYE 4JWOA 1SW2A 5I2KA 4ELPA 3T9XB 2OZZA 4IY5A 2GRVA 3SEUA 3HN0A 3O2AA 1NL5A 4RPOA 3TDJA 3C32A 4F3PA 1M5CA 3ZKKA 4YB5A 4O3BA 3WAEA 1R1NA 2QS2A 2I58A 4FEBA 3FUZA 4HTGA 2GHAA 1HSJA 4F19A 2FA7A 3C5TA 4DIGA 4YMAA 2NXOA 4ZECA 1OLAA 4TOZA 3CSBA 4DDDA 1MY1A 1A99A 1Y4CA 4POWA 3A3UA 4F39A 4LA9A 4ZEDA 2Q8JA 4I1DA 4OTEA 1B3FA 3MWBA 1MQDA 1NKXA 3S9MC 2QRYA 3PUXE 4H1XA 3UGWA 3KOTA 3FVOA 3R26A 1SD3A 4H8IA 4HJ0A 2A5TA 4JSDA 3RN8A 4MH5A 3DP6A 4YKPA 3LSFB 1B5JA 1H43A 3QUFA 2H5YA 3FASA 1VSOA 4QFPA 4ZZAA 1B7HA 4U2RA 4GVOA 3T9HB 3ILUB 2UVHA 4F1UA 3E9XA 1B0HA 3TQWA 1PDAA 4DLQA 1SDXA 1FTKA 3G3FA 4FJPA 4GOTA 5AA4A 1OVTA 1LAFE 1B3EA 4P0IA 1B1HA 4FORA 2PT1A 1S9TA 4GL0A 5I57B 5IAIA 2PYYA 3HCQA 3K1NA 2XXHA 2OCUA 5CBRA 3TTLA 2H9BA 4WXJA 2R6GE 5TPAA 1A8EA 1J1NA 3Q26A 3FD3A 1D3KA 5F1QA 3RGYA 4F18A 3OO8A 4RY1A 2Y7IA 4F1YA 2THIA 3H03A 5H8HA 3MP6A 1DTGA 1MPDA 4ZEKA 1Y3NA 3OEKA 4NF4A 4G68B 2M8CA 2XXQA 2E0SA 1MY0A 3M3KA 3FXQA 3TTMA 3FVGA 3ONMA 3UN6A 1GR2A 3BKIB 1S50A 2XD2A 1LCFA 3UIFA 4YICA 4OYVA 4KQPA 3M3LA 4F31B 2DWHA 4R75A 1FQEA 4ESXA 3ZSFA 1PBPA 3O66A 2D5WA 4YB6A 1US5A 1YPNA 3PU5A 3PGFA 1IIWA 2B65A 2DOJA 2O84X 2REJA 2AYSA 2VD3A 3LR1A 1JETA 1OIBA 1B2HA 4IO3A 2DP8A 2Y7KA 1DTZA 4H67A 4R6HA 3OO6A 5ICQA 4OWDA 4F2OA 2O7UA 3TCGA 1B58A 1Y1MA 3LC8A 2XXUA 4WEDA 4ESWA 5DVFA 3H6TA 4ELOA 1USYH 1YTVA 2HXWA 1N84A 5J1DA 1AMFA 3VLWA 3K01A 4QF9A 1MH4A 3AXFA 2UYEA 2IEEA 1PC3A 2A5TB 2HAVA 1EH3A 4H0WA 2DE2A 1LGBC 2RINA 4R2FA 2R71A 4K3FA 4N07A 2DVCA 3CG1A 4OMBA 3CI8A 2OBGA 1FQDA 2HCAA 3DP8A 3QSLA 4RK2A 1MY3A 1ZIUA 2V3TA 3PV0E 4FECA 2DWIA 3TAJA 4RJZA 3IB1A 2HFBA 2DXYA 4U23A 3RPWA 2QPQA 1PB7A 2OK2A 1EU8A 2H4IA 3FVNA 4QFKA 3IAZA 5AA2B 1JW5A 1MXXA 4HCYA 3SEYA 2I3VA 3EHTA 3UK4A 1PEBA 4ZEFA 1TFDA 3VE1B 3VLVA 1GGGA 3RTFB 5I56A 5ITOA 3H4ZA 4Z0IA 5CMBA 4ZEIA 5TPAB 1LAGE 2XXXA 4IB2A 5EHSA 1H45A 1P1NA 4ZS9A 2F8DA 2NWJA 3DM0A 1FTMA 4U21A 3V83A 3C36A 4NMYA 4EF1A 2ZYKA 4G2ZA 5H8SA 4E0XA 3U8QA 5KDTA 1D9VA 3KG2A 2ZNSA 4R72A 3A09A 1TXFA 3T96B 2XXWA 3CFZA 5I58B 3SETA 4QRZA 2UVIA 4GRKA 2P2AA 2V3UA 1VE4A 4YB7A 2F7AA 5TP9A 1SYIA 1LFHA 3KOSA 1B5HA 1B3LA 2PMSA 3FJ7A 5FHNA 3W9WA 1II5A 5JTYB 1IXCA 4OETA 2XXIA 2QS3A 3CFXA 1MXVA 1SI0A 1DPPA 1I6QA 1N04A 2RF1A 4ZDMA 4PFUA 3FATA 4MLVA 3BBRA 1SW5A 3Q25A 4FAJA 3CVGA 1VFDA 2NOOA 4N6PA 4FATA 1F9BA 1LFIA 2DQVA 5ICTA 3OD7A 2UYFA 2VHAA 3PUZE 3O6IA 2F6GA 1DPEA 1URSA 2Z8DA 3IO4A 3CG3A 4H5FA 1CB6A 1Z7ME 2L27A 3JV9A 2ONSA 3H6VA 1LFGA 1NNKA 3OO9A 1LCTA 4GXSB 4ZE9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U94A 4PETA 4I40A 2B4MA 4POXA 5T3JA 3KBZA 1XC1A 3S2VA 3S9LC 3T9UA 5LOMA 5IZ3A 1M5FA 2DYXA 3PUYE 2JNCA 1UIVA 4XKPA 2PFYA 1FTLA 1NV5A 1NUYA 1MM6A 3LUYA 2IA4A 1FBGA 2PT2A 2XWIA 4LN5A 3KN3A 2ONRA 4G8HA 3QXMA 5H8NA 1ZKBA 2X7QA 1FPKA 3FXRA 2O68A 5HPQA 1Q35A 1MM7A 1PBQA 4N13A 4ERSA 1VFEA 1UIUA 1N7XA 3CFLA 2O1LA 1ELJA 4KYSA 1QUKA 3IX1A 4HS7A 3FXBA 4G8NA 4ONYA 4FE8A 4Q30B 1GV8A 2OLBA 4KFQA 4DLDA 4C0RA 2W7YA 5CBSA 1B7ZA 2CZHA 1L5TA 3N94A 3HFUA 1NV6A 1A55A 2GH9A 1NFTA 4NN3A 3ISPA 1JVYA 4OFLA 3MZ9A 4PFRA 1FBHA 5EQ8A 1AOVA 2YPNA 3ECRA 2ZYOA 1XT8A 3ILTB 1QUJA 3RTWB 5I56B 3OXNA 4GLIA 2I49A 5IM2A 1OQGA 1FQBA 1JEUA 3KZGA 3SESA 3T0JA 4F29A 2H98A 2ABHA 4JWYA 1FRPA 4PFWA 4P11A 3DLNA 2GHBA 3WAFA 3IFCA 1JW1A 2UXAA 3FJMA 3RNNA 1MQGA 1FBCA 3F11A 2Q2CA 3PMXA 3VVEA 3RQTA 3S9EA 5AE4A 1LAXA 4RYAA 2REGA 5FTHA 3VFJA 1POTA 4IO6A 4QHQA 1SVXB 1ZJLA 1DSNA 3FJGA 5A5XA 4GBVA 5TP9B 3BIHA 1EZ9A 1FQAA 4MBPA 3PMWA 3D1RA 5DT6A 4GX3A 4Q0CA 4P56A 2RCAA 3FVKA 2XD3A 3N5LA 4G61A 4NTLA 5EYGA 3TPAA 4GXAA 3KC1A 1MDQA 4EQBA 5CC2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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