3C7MA

Crystal structure of reduced dsbl
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
FTEGTDYMVLEKPIPNADKTLIKVFSYACPFCYKYDKAVTGPVSEKVKDIVAFTPFHLETKGEYGKQASEVFAVLINKDKAAGISLFDANSQFKKAKFAYYAAYHDKKERWSDGKDPAAFIKTGLDAAGMSQADFEAALKEPAVQETLEKWKASYDVAKIQGVPAYVVNGKYLIYTKSIKSIDAMADLIRELASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbA-like
publication title DsbL and DsbI form a specific dithiol oxidase system for periplasmic arylsulfate sulfotransferase in uropathogenic Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 75
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3c7mA00
3I43A 1A0RP 2XBIA 2RM6A 5G1KA 5IPHA 4ECCA 1WP0A 2DLXA 2CZ3A 4V1Ap 4F0CA 2WFCA 1O7UA 1GP1A 2V1MA 4FYBA 4IP6A 4F0BA 3IXRA 5F0GA 1GSEA 5D8IA 1K3YA 1AXDA 2K8VA 1F3BA 5ECMB 4WBRD 1S3CA 4JRRA 2MMNA 4HS1A 2HYXA 3UVHA 1EEJA 3ZMKA 1Z7PA 4LL4B 1ZZYA 4YQVA 3L9UA 3D0ZA 1UVZA 3CYNA 4IS0A 2L4QA 2YWIA 1EP8A 1R4WA 2K18A 2NPBA 5ECKB 3TKQA 1USBA 1T3BA 4GXZA 5LD0A 5A4WA 2LEGA 2IWTA 5E59A 3H93A 2R5GA 4WEYA 2O89A 4KW6A 5ECIB 4HOJA 4J56E 2DJ1A 1OC9A 2FWGA 4JU5A 3V1WA 2XHFA 2L6DA 5IIZA 2IFQA 1G7OA 4I5QA 2F3MA 4TRXA 4K1FA 4L5OA 2C3TA 4PX1A 3WYWA 1PD21 2HXKA 1HNBA 1GULA 2CVBA 1EGRA 1GUKA 1GH2A 3H79A 3M8NA 3L9SA 5LNKe 2H72A 1SKSB 4IELA 3GKXA 1QUWA 3Q74A 3IV4A 1GSQA 2GTUA 4O32A 3BOAA 1GTIA 5ECLB 5ENUA 1I5GA 3NZNA 3RPNA 4OWYA 1MD4A 4TR3A 2EC4A 2JZSA 1BJXA 2IFQB 3HA9A 2OACA 4X1UA 4IQAA 1KTEA 3TJKA 3HKRA 3UMAA 3LFLA 4GSTA 3WGEA 1FHEA 2LJKA 2F9SA 2H73A 2R6KA 4LA1A 4BA7A 1XCCA 2KUCA 2I1UA 4G19A 1ABAA 4L5LA 2V6OA 4HU9A 5C00A 1SK1A 2XBQA 3QAGA 4XS4B 4EF0A 4ACSA 3W8SA 3E9JB 1ST9A 1AQVA 1V9WA 3GH9A 4WR4A 5DJLA 2HI7A 5B8AA 2C3NA 1V2AA 1YF1A 4TXVA 4ZBDA 3TDGA 1R26A 2HSHA 2HLSA 3FY7A 3WD6A 2CZ2A 3SWLA 3QPMA 2HZEA 5CAXA 2VL3A 2HFDA 5INYA 5IPGA 4ZBAA 4IJIA 1O73A 3HCZA 1LJRA 4LMVA 5F06A 3EINA 1HD2A 1J08A 2JZRA 2YN1A 4EXJA 4MF6A 6GSYA 2H01A 4IP1A 3LXTA 1M9BA 2OJLA 3VI7A 1AC1A 3LSZA 1JHBA 2VL9A 3H4KA 2B7JA 4F03A 4XHMA 5J5NA 4MH2A 1R7HA 1ZL9A 5HR0A 5IOWA 4XS1A 2RM5A 4JE1A 1F2EA 3PR8A 1NSWA 3PGTA 1GWCA 2VM1A 4HEA2 3H8QA 5IM9A 5F05A 4GRFA 1RK4A 4GTUA 1TP9A 3L0HA 2L59A 4ML1A 3ERFA 2OE0A 2FWFA 1N2AA 1EZKA 2N5FA 4IVFA 2YANA 4G2EA 5DDLA 3EU4A 1KEBA 4L8EA 2HZFA 5H5QA 2LJRA 1EOGA 1GUMA 2C0GA 3LGCA 3MWHA 1ERVA 4CDOA 4RQRA 3P8WA 1NW2A 3CTFA 4PQHA 5B7CA 4ISDA 2A4VA 3N9JA 4PQ1A 3DMLA 4FH8A 2P5QA 3IAS2 2KP2A 5JWOB 2GQLA 1ZYQB 5CRWA 1SL0B 5AN1A 3DXBA 1YQ1A 2VCTA 5ID2A 2AUVA 3GV1A 1U6TA 3AY8A 3ZIVA 4ULXA 1M9AA 5CREA 5C04A 6GSSA 4O7HA 3UJ1A 5FHIA 3KTBA 1T7PB 1SU9A 3L78A 1YJ6A 1B48A 2O8VB 5GAPD 4LMWA 1RW1A 1ON4A 1A2MA 3FR3A 3EC3A 4QL7A 2WRTA 3U6VA 1X0RA 2RIIA 2ZNMA 1XWGA 1I9DA 2OKAA 1MDIA 3P7XA 1BEDA 1YY7A 2WULA 2DJ0A 1ERUA 3D6IA 5GAND 4GCIA 4DSRA 4OFTA 6GSUA 11GSA 3KEBA 18GSA 3CTGA 2H30A 2ZUPA 1FW1A 3I6AA 2CAIA 1EV9A 4X43A 4PURA 3WGXA 1TOFA 2B7KA 4JR6A 3IK9A 4TKYA 2AYTA 1J9BA 3TKSC 1SL2B 2LJAA 2OE3A 1SJZA 5D73A 4ZIJA 5D9VA 4RUVA 3GL5A 3MDKA 1OYJA 4EO3A 1VF4A 3S9FA 3TB2A 2FCHA 2G2QA 5L71A 3UOMA 1OE8A 3KD0A 2WJUA 3TKSE 3MSZA 3M9JA 4ZL9A 3CMIA 1QMVA 4QL9A 2H0GA 4LL1B 1TU7A 1VRSD 5IOXA 1A23A 2DJJA 1XVWA 4KB3A 5KN3A 4WF5A 2OADA 2VCQA 2DJ3A 2FA4A 5A4UA 3TGZA 1WPIA 3O3TA 4WBJA 4HQSA 2MBSA 2PU9C 3EVIA 2HNLA 1AQWA 2H0IA 2VD0A 3NIVA 3ZITA 2MMOA 2OBIA 1O85A 2PBJA 3ZVJA 5ECNB 4HZ2A 4POMA 5B8BA 2FWHA 5G1LA 1TRWA 1Z7RA 2NTOA 4MABA 5ECSA 3P90A 4OFMA 5DQYA 1W4VA 2GSSA 2IIYA 3WGDA 1Q4JA 2DBCA 3RHCA 2H66A 1R5PA 1PN9A 1PGTA 2H1DA 1K0BA 3LYKA 1Z9HA 2EIOA 2H76A 4KAEA 4MCUA 1TU8A 2C0FA 5ECPB 2RLIA 5LCZA 4BL7A 1XWAA 2H6YA 1FG4A 1K0DA 1TKDB 1JZDA 2VL2A 2C4JA 5G5EA 4HU7A 5B6MA 2M46A 3EE2A 3LXZA 3CRUA 4E8HA 1QFNA 1CQGA 1NHYA 2YP6A 1OC3A 2AV4A 3UEMA 6GSVA 6GSWA 2YWNA 3KH7A 1M2BA 4EKZA 2L57A 4J2FA 4Q5RA 2YJ7A 3DVXA 4MZBA 2CV4A 3WT1A 3FKFA 3ZLPA 4I2TA 1SKWB 9GSSA 3D21A 3LQ7A 1O6JA 3HJPA 3ZFBA 2LV3A 2B5YA 5E4WA 5KN0A 1WJKA 1H75A 4XRDA 1GSYA 1YKAA 1XXUA 4FO5A 3F0IA 4NHZA 2YNXA 4RI6A 4KCEA 2MMAA 2BMXA 3E3EA 2LRCA 1YDKA 5J41A 3M3MA 1JZWA 2IMKA 1X9MB 1KNGA 2LTKA 3HZ8A 3GUSA 4PNFA 1MDJA 2H19A 2LRTA 4MJAA 3IK7A 4N10A 3APQA 2M80A 1YEXA 3EMXA 2BTOT 3F9UA 4TXOB 3EURA 4PUAA 5ECRB 4YQMA 1K0NA 5IQYA 4RI7A 2FHEA 2I81A 1A2JA 3IHQA 4ML6A 2PVOC 2TRXA 5CRDA 13GSA 3DD3A 3KXOA 1HQOA 1Q98A 2V32A 2FD3A 1TI3A 2JADA 5IMAA 3FW2A 1XFLA 1U87A 4AJ7A 3F4TA 3CSJA 4JZQA 2HSYA 1SK2A 2LKUA 1XWKA 1OVNA 3A2WA 4ZL7A 3EMPA 3HJOA 4I97A 1TRVA 4MF7A 1K0CA 4Q5FA 5CNWA 3IPZA 2DJ2A 3ERGA 2REMA 4CHSA 4TR0A 4XTSA 4H86A 2IMDA 1ML6A 4IW9A 3UARA 1DUGA 1KBNA 3KJYA 2DIZA 4XS4A 1OKDA 3TRQA 1PX7A 4POBA 4WXTA 1F3AA 3M9KA 5HR3A 4DSQA 4TR1B 1JLWA 3GYKA 3HD5A 1M2AA 2VAFA 4AGSA 2AAWA 4IHUA 2RUFA 1OKTA 2FGXA 3J7Yk 2F8AA 1BX9A 3VK9A 2C0EA 3A2XA 2H0HA 3HDCA 3GKMA 4F9ZA 3F3RA 1N8JA 2R3XA 3DRNA 1T4YA 4JR4A 4ZXGA 4J57E 3F63A 1M0UA 3I9V2 4MZWA 1AAZA 3F3QA 2GVPA 5ELGA 2AB6A 2WB9A 2GQMA 2VLVA 1TW9A 2FUG2 2PMTA 1DBYA 1XOBA 5AISA 2YJHA 4KSOA 1FAAA 3QD9A 1O8XA 3F6DA 3H1NA 5A5KA 4GWRA 2CX3A 4IGJA 2MBTA 4ZL8A 2NVLA 4F82A 4ID0A 1A8LA 2F51A 3FK8A 4TR4A 4NWYA 2ON7A 1QK8A 3KH9A 1GTUA 3A3TA 3RAZA 3TJGA 4K8MA 2KP1A 4BVYA 5EL8A 5J9BA 4HDEA 4IJ3A 5JWQB 4EDZA 1EWXA 1B8XA 3G7YA 4O92A 3CBUA 1HNCA 2YCDA 2B1KA 1XVQA 4G10A 4K7IA 4KUNA 3VPQA 3IA1A 3A2VA 5ABRA 1OE7A 5KEJA 2V41A 1PKZA 2GSTA 1QQ2A 1OC8A 4EE0A 1JZOA 4OMVA 2X99A 2WZ9A 3LORA 1TTZA 2DIYA 3IE3A 3O6TA 1UN2A 1G7EA 4N30A 3GX8A 1PMTA 4XS6A 2C80A 5D9TA 1FOVA 1ERTA 5JCWA 2H1GA 1YEPA 3BCIA 3LYPA 4KE3A 1GTAA 2I4AA 2FA8A 4K9ZA 3A5WA 1T8EB 5ECQB 2PN8A 2EIQA 3LEFA 4QQ7A 4WETA 5DCHA 5G31A 2FNOA 2C3QA 1GNEA 1B9XC 3PH9A 5CYYA 2GT6A 3BCKA 5CRHA 2A2RA 2H1BA 3G9BA 2X64A 1BYEA 2R2JA 4KX4A 1V40A 3Q19A 3GFKA 2C8UA 2K8SA 1BAYA 2VO4A 4NHWA 2PUKC 4GF0A 4HI7A 1SYXA 4WR5A 1G6WA 5J4UA 3DEXA 4BWQA 1DE2A 3ZIJA 3L4NA 20GSA 1GNWA 3C71A 3G7IA 5D93A 5DCGA 2HRNA 1O8WA 4HUAA 1M7TA 3C7MA 4WKWA 3EWLA 2GZYA 2JSZA 3UBLA 1R5AA 1K0OA 2O87A 2YV7A 4HJ2A 1THOA 1VF3A 5FT3A 1K0MA 1WRYA 4XRAA 2DJKA 2GZZA 4YAVA 2P5RA 4LLRA 3M0FA 2E2GA 2LNTA 2O85A 1X5DA 4JBBA 7GSSA 4NMUA 2HRFA 1ERWA 3IOSA 1FO5A 1PRXA 3IAM2 4ECJA 1GLQA 4AJ8A 3DYRA 4POLA 3FZ4A 3TJJA 4PGTA 2H70A 3FYGA 5H5SA 1IYHA 2AHEA 3GMFA 3ZFLA 2IMIA 1K3OA 3CSIA 4D73A 3ZMLA 2JL4A 14GSA 4PQIA 4MDCA 1GLPA 5J9CA 4ECIA 3BBYA 2K6VA 4MJEA 1LBKA 4Q5QA 3FR6A 2LQQA 2DSAA 4DVCA 3ZVJD 4F2IA 2GDRA 1E6BA 4GSNA 4MPGA 3KMNA 1TK8B 4K2DA 4NV5A 1UA5A 2E2MA 1QXHA 1YKCA 2YZHA 3FHKA 3TUEA 4MH3A 4D73B 4NAXA 2IMEA 3WT2A 4K6XA 3F8UA 2H8LA 5IO2A 3GTUA 1EGOA 2MZCA 3TRPA 1AIUA 2GGTA 2X8GA 5IO0A 2PPTA 2B6MA 4Q5NA 1MEKA 1URMA 3M1GA 3IRAA 1TRSA 2L5LA 5HFKA 1WWJA 4BWSA 2QSIA 2R37A 3NOFA 3RDWA 2OE1A 5DALA 1ZYEA 3TKSA 5EPFA 3GTUB 2X8CA 1XW5A 1X9WB 4KDXA 1PKWA 3FZ5A 1HNAA 4KCAA 1BQ7A 1WE0A 4AJ6A 5CRGA 2RUEA 1SENA 4L0UA 5EY6A 1TRUA 2V6KA 2GLRA 4EC0A 1SD8A 1Y6EA 3IC4A 17GSA 1XWCA 1XBSA 4KDYA 2A2SA 3KM6A 1FVKA 2CVDA 2PGTA 3EU3A 2VLUA 2VIMA 3QMXA 5HR1A 5IMFA 1ZCPA 2GQKA 5DALB 2H1AA 3GHAA 4KSMA 2P31A 3RHBA 2LQOA 2DMLA 4N0VA 3C8EA 1ACVA 1VGLA 2YZUA 5H5RA 2LRNA 3ED3A 3GIXA 3D5JA 2K9FA 1QGVA 2YOIA 5IMZA 1A0FA 3CSHA 5F8BA 1EV4A 3IR4A 1X9SB 2ALBA 4TVEA 3MAKA 4I2UA 2MMZA 3C1SA 4DSSA 5GSSA 3Q6OA 1O81A 4I6XA 4G9HA 4ECBA 3R2QA 4TXOA 3HYPA 2KLXA 4XCSA 3KIJA 2C1YA 2J23A 4PNGA 3OR5A 1HYUA 3GL3A 2L6CA 5DJMA 3W8JA 3L9VA 1YZXA 1Y25A 4GLTA 2N5BA 3ERWA 3PINA 3F6FA 2XC2A 5J3RA 3ZRDA 4DSSB 2LS5A 1XPVA 5JCUA 4L0WA 3GSSA 1GSUA 1U3AA 1XW9A 1J0FA 2KHPA 2NDOA 4E8EA 1ILOA 5G5FA 2GT5A 3QFBC 2DC5A 5B6NA 5D9WA 4EL1A 2H75A 2YWMA 5COHA 4ZB6A 3APOA 2TRCP 5DBQA 4V2LA 5DVBA 2OBKA 2IMFA 1PL2A 4TR1A 3GSTA 4KH7A 3QFAC 3ZL5A 1K3LA 4FYUA 2GSRA 1MD3A 5F07A 3P2AA 1AQXA 3F4SA 1X5CA 2HT9A 3VWVA 1F9MA 2VOCA 3FRCA 3LWAA 1AW9A 1VF2A 1A8YA 1PX6A 2CX4A 1GL8A 3KP9A 4OCFA 5AGYA 2PWJA 3HVXA 2E0QA 1CQHA 1GRXA 1YF0A 1THXA 2HE3A 1EOHA 2IJYA 2H6XA 1OC9B 3IBHA 5CO3A 1B4PA 12GSA 4POKA 2P0GA 1TK0B 3BJ5A 3HY2A 5GZZB 1IYIA 2VCZA 4YAPA 1G0TA 2Z9SA 2LNSA 4BVXA 3C73A 1TI1A 3FEUA 3QCPA 5IMDA 10GSA 2B5XA 2VM2A 1V98A 3KMOA 2H71A 1TJDA 1GTBA 2PVQA 3LG6A 5DQSA 3GNJA 5DAKA 5EVOA 1A24A 2QGVA 5ECHB 1FB6A 4MZCA 4MA9A 3ZYWA 5AIVA 2VUPA 1JLVA 4TW5A 3IDVA 3ISOA 1M99A 2C0DA 16GSA 4OCEA 5HQPA 1DE1A 4KGIA 1AUCA 6GSXA 2M72A 3VURA 4I8BA 1T00A 4MJBA 3U5RE 1SL1B 1GSSA 3N5OA 1ZOFA 4ZBBA 1PQNA 2EIRA 3VWXA 5A4VA 1PA3A 3HVSA 3GRXA 1M2DA 3HVVA 4KDUA 1PL1A 2G0FA 3I69A 4NXIA 4Z7XA 1BG5A 3HXSA 5FWGA 1V57A 2X8HA 2VCXA 4V2NA 5DAKB 4ZB9A 1ZMAA 3KZQA 3QOUA 3J7Yb 3DVWA 2JSYA 3VWUA 3DWVA 2CAQA 3GKKA 4XIHA 1EEMA 2VCVA 1SJIA 3UIWA 2YV9A 3F4RA 2WS2A 3TRXA 5HR2A 3C1RA 4V2MA 2J9HA 4MLYA 1S3DA 1B9YC 3TJFA 3G7JA 2LUSA 4OFNA 1SK0A 4IN0A 2QKEA 2HZEB 4HQZA 2KOKA 4WF4A 3Q18A 1W89A 3KGKA 2ZCTA 3MNGA 1SYRA 6GSTA 3VPTA 3FZAA 1NM3A 3VWWA 4HZ4A 2CA8A 2XPDA 3DKSA 3KP8A 3TCOA 4X0XA 5HFGA 1E2YA 1G6YA 1GSFA 1H4OA 2GS3A 2ON5A 4BPYA 4EDYA 1K0AA 1T4ZA 3RBTA 22GSA 3VFIA 3W6GA 4OO4A 2WDUA 4KA0A 4PXOA 5CP1A 3QAWA 4ZILA 1WOUA 2JU5A 4O5RA 2I9HA 5ECOB 5JCGA 2L5OA 1JFUA 4GQCA 4IQ1A 3US3A 5ELAA 2YWOA 2H6ZA 3JCML 3APSA 4FIWA 2B1LA 4MK3A 2VCWA 2XPEA 1GSDA 4OO5A 2WGRA 5IMCA 4NPBA 4PUFC 2JACA 4NV2A 4V1Ag 1X5EA 2OA7A 2JZTA 1PSQA 2V2GA 3SBCA 3QR6A 4GSSA 3UBKA 4ILFA 1B4QA 2FY6A 3CRTA 4CW9A 3EYTA 1LU4A 5G2ZA 1RQMA 2I3YA 2MYGA 2H74A 2PERA 4MF5A 3ME8A 3ZREA 3TJBA 2WCIA 2GZPA 2IN3A 5ID2B 4AF2A 2D2ZA 1NHOA 2CT6A 5D96A 3UVTA 1U88A 1Z5YE 5KN2A 1EP7A 1MDKA 1F6MC 1F37A 2DMMA 4N11A 1SKRB 2BJXA 1XOAA 1XWBA 3GA4A 5KN1A 2YPMA 3VLNA 3UAPA 2GSQA 4OD7A 4YQUA 3BD2A 2TIRA 1V58A 2F8FA 4KNDA 2O7KA 1OAZA 1Z3EA 3ME7A 3RPPA 2IPAA 2B5EA 3E0UA 5GSTA 1XIYA 19GSA 1SJ6A 1TDIA 3FR9A 4K0GA 2VL2C 4K0NA 1UC7A 5AIXA 1S3AA 2CVKA 5HFIA 2VLTA 5D9XA 8GSSA 3QAVA 3D4MA 1MTCA 1VF1A 3ZZXA 3CXGA 1GUHA 4DEJA 2NBSA 1Z6NA 1XZOA 4YH2A 4P3YB 3TOTA 2FLSA 1U3IA 4TN8A 2R4VA 2B3SA 4N0ZA 4TOPA 4JEDA 3VI5A 4MJCA 3UL3A 3TOUA 4HJMA 3DGQA 3O76A 4MPFA 3GH6A 1T1VA 3ZTLA 1FVJA 4EVMA 2QC7A 3KCMA 3FZ9A 2AJQB 2LSTA 4RQXA 3QDNA 2ES7A 3GN3A 3HJMA 5G30A 3TKPA 1XW6A 2IL3A 3D4TA 3GURA 2E7PA 1A2LA 3TKRA 3KTLA 1TXXA 4IKHA 2N5AA 4GQFA 3K8NA 4IBPA 2CQ9A 5JWRB 4K7OA 1C72A 1DSBA 1JZRA 1ZGNA 3HHVA 2L4CA 4FYCA 2FWEA 3GKNA 5IMVA 3GX0A 1FB0A 1WIKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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