3C7MA

Crystal structure of reduced dsbl
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
FTEGTDYMVLEKPIPNADKTLIKVFSYACPFCYKYDKAVTGPVSEKVKDIVAFTPFHLETKGEYGKQASEVFAVLINKDKAAGISLFDANSQFKKAKFAYYAAYHDKKERWSDGKDPAAFIKTGLDAAGMSQADFEAALKEPAVQETLEKWKASYDVAKIQGVPAYVVNGKYLIYTKSIKSIDAMADLIRELASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title DsbL and DsbI form a specific dithiol oxidase system for periplasmic arylsulfate sulfotransferase in uropathogenic Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbA-like
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 75
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3c7mA00
4WR5A 2BJXA 3VK9A 2YWIA 5HFGA 1KEBA 1MDJA 4DSQA 5CNWA 5DCHA 2LRNA 4ZB6A 1FVJA 1HNAA 4MDCA 4OFMA 7GSSA 5CRWA 4MLYA 3GMFA 4CDOA 4MZWA 1ZOFA 4QQ7A 5ENUA 3CMIA 1TK8B 2C0DA 2QGVA 2X8GA 2B5EA 2HSHA 4OFNA 2GTUA 1VGLA 2GQLA 1FB6A 4IVFA 3LEFA 5H5RA 4L8EA 4O92A 2CZ2A 3RPPA 4MK3A 2CV4A 4Z7XA 3HJMA 3DXBA 5EY6A 1GTIA 1M2DA 2NBSA 2K9FA 3RHBA 2CVDA 2JL4A 1PN9A 4XS6A 4POMA 4HQSA 1V40A 4IHUA 4X1UA 2GT6A 3EVIA 4IKHA 2YJ7A 5JCWA 1U88A 3IPZA 4OCEA 2GZPA 2OE0A 2IFQA 2VLUA 1XWKA 1SKWB 2BMXA 3ZYWA 5INYA 1BQ7A 2AHEA 1PX7A 2YJHA 2MBTA 1AW9A 5D93A 5HR2A 3KTBA 3DVWA 2C80A 3DKSA 3FW2A 4MZBA 1EV4A 1H4OA 4F0CA 2B5YA 4OMVA 6GSXA 1Y6EA 3V1WA 4PXOA 1VRSD 1ERUA 4G2EA 4LMWA 4NMUA 3AY8A 1YF0A 1USBA 3KEBA 1R5AA 4DSRA 2VM2A 5CP1A 2B1KA 5IM9A 4XRDA 1YY7A 3IBHA 3M1GA 1A0RP 4JZQA 3EURA 9GSSA 1FVKA 2L6CA 1F3AA 3MSZA 4TRXA 4WXTA 1UA5A 5ELGA 1T3BA 1XWAA 6GSYA 3IC4A 3EC3A 4ID0A 4L5LA 2H1BA 4KUNA 4ZB8A 3GKXA 2PWJA 4GSSA 1J08A 5ECNB 2LJKA 4I2TA 4ZBBA 3LXTA 1V2AA 4KCEA 1JZRA 1YDKA 4KSOA 3PR8A 1XVWA 3TJBA 3VWUA 2LRTA 5JCGA 3ZL5A 1PKZA 4EC0A 1WJKA 3D6IA 1WE0A 3VFIA 1G0TA 1GH2A 5F07A 2IMFA 1M99A 3HKRA 1NW2A 5HFKA 3QAVA 1XWCA 1AIUA 2X99A 1U87A 1LBKA 3QMXA 3W8JA 1B4PA 4I6XA 2H72A 2YWNA 2O87A 3A2VA 2NTOA 1A8LA 3QAGA 1KNGA 1SL0B 1GLQA 1Z3EA 5A4WA 3VI5A 4ECCA 4WF5A 3TOUA 4F0BA 4RQXA 3G9BA 4HZ2A 2G2QA 4N30A 2IMIA 1RW1A 5HFIA 1YKAA 2PUKC 3VPTA 10GSA 2GLRA 2I81A 3UARA 1XPVA 3F8UA 3ZRDA 2QC7A 3H1NA 3Q6OA 1XBSA 3GYKA 4FYBA 3SBCA 1ZCPA 3UOMA 1OVNA 2P5RA 2OACA 3TB2A 4G9HA 3FZ9A 3RBTA 4AF2A 4JU5A 1U3AA 1Z6MA 4E8HA 5IMCA 1MEKA 4K6XA 3UAPA 3UBKA 1GNWA 3TRXA 3QFBC 1XWGA 4O7HA 4XS4A 4TN8A 2VCZA 2F8AA 2HRFA 2OE3A 1O8XA 2QSIA 2DSAA 3IE3A 3HJPA 2WZ9A 4N11A 2PU9C 2GS3A 4KA0A 3RAZA 2IMEA 1ERTA 3MAKA 4ZBAA 3GTUA 2ZUPA 1XXUA 3D4MA 3D0ZA 1YF1A 4POBA 4EKZA 4AJ8A 5ECSA 4FIWA 4MJEA 4GXZA 1PQNA 2FA4A 2JSZA 4ZL9A 2DLXA 3L4NA 3ERWA 1K0NA 1OE8A 4WBRD 5CYYA 3QFAC 2JSYA 5DQSA 1WIKA 4EE0A 3H93A 1TW9A 4ML1A 4IJIA 1LU4A 4V1Ap 3WGEA 4MJBA 4N0ZA 3WT2A 4V1Ag 3TRQA 4DSSB 16GSA 3LYKA 1MTCA 2H1GA 3E9JB 4EDYA 4KH7A 4LL1B 3K8NA 2C3QA 3F63A 2CX3A 4PUAA 1PMTA 4TW5A 5IOXA 2FWFA 5COHA 2GVPA 3GURA 1NHOA 1E6BA 3HVXA 4TR1B 3G7IA 1THOA 2PMTA 3BOAA 3FHKA 1NSWA 1DE1A 2L4QA 3IK9A 2MZCA 2KP1A 3UMAA 2YN1A 4Q5FA 3SWLA 2LSTA 4D73A 1B8XA 4ZILA 3GUSA 22GSA 1ACVA 3HZ8A 19GSA 3ZZXA 3C1SA 1AQWA 1M2BA 2GSRA 4TXOB 3TRPA 1SL2B 2H1AA 1RQMA 3NOFA 1OE7A 2C0GA 4EUYA 5GAND 5DVBA 3ZITA 1OC9A 2WB9A 4OO5A 1GNEA 2J23A 1R7HA 2AUVA 2FD3A 4KDXA 5IMFA 5J5NA 1QK8A 3ZTLA 3ZVJD 1AXDA 2K8VA 1M7TA 4POKA 2IL3A 2DJ2A 2HZFA 3EE2A 4FH8A 3VURA 4F2IA 2H01A 2CVBA 5LNKe 4AGSA 5DQYA 5ECRB 4HI7A 1A24A 4AJ7A 1R5PA 4ZBDA 4MABA 4ZL7A 4DVCA 2MMZA 5G31A 3C8EA 5EVOA 3L78A 5B8BA 3KZQA 1BYEA 3ED3A 5AIXA 1C72A 5J41A 1PA3A 1J9BA 2OJLA 3A2XA 1GTUA 4WF4A 2PVOC 5D9XA 3PH9A 2M72A 3G7YA 1X9SB 3L9SA 2ES7A 4YQMA 5DALA 1EP8A 1EZKA 3KIJA 1K3LA 2IN3A 2XC2A 5KN1A 4ML6A 2I3YA 2TRXA 1SKSB 1M9AA 4ECBA 3FZ5A 18GSA 4GF0A 20GSA 2WFCA 5HR1A 5EL8A 5JWQB 2X8CA 1K0MA 4I2UA 1HNBA 2H30A 2O8VB 3MNGA 2GZYA 3HD5A 1VF3A 3APOA 3TKQA 2O7KA 2VCVA 4XS1A 1URMA 5CRHA 3KCMA 4BVYA 4TR4A 1ILOA 5AIVA 4KW6A 3TUEA 1MDKA 2YNXA 2DMLA 4YAVA 5ECMB 3DMLA 1GL8A 2V41A 3UBLA 3NZNA 5ECKB 4EF0A 1I9DA 4EVMA 2LUSA 2HE3A 1PRXA 3KM6A 3WYWA 4OO4A 2NPBA 1ERVA 4V2LA 2HYXA 3HVVA 5E59A 4ZIJA 3ERGA 4YQUA 5LCZA 2YOIA 3BBYA 2PERA 5FT3A 3CRTA 3M0FA 3FEUA 1PL2A 2I9HA 4JEDA 2HZEB 1JLVA 4EDZA 2RM6A 5H5SA 1BJXA 3KGKA 3WGDA 1CQHA 3F0IA 4YAPA 1K3YA 2YV7A 2DJKA 4K7IA 2WCIA 2H0GA 2GQMA 1R26A 4PQHA 4MA9A 4RI6A 2N5BA 1O81A 2HFDA 2REMA 3KD0A 3VLNA 2LTKA 2ZCTA 2FWHA 1ZL9A 2HRNA 1OAZA 6GSWA 3GSTA 2HSYA 3FZAA 1TRWA 4HS1A 3CXGA 1THXA 2H19A 3LFLA 1X5CA 2M46A 3W6GA 5L71A 1JFUA 4FYCA 1ZYEA 3EMXA 2FUG2 3RPNA 3A3TA 2C3NA 1NHYA 4ISDA 1T00A 3VPQA 2VAFA 4TXVA 3TGZA 5J9BA 3ME8A 2IWTA 2FNOA 2B7JA 1SYXA 1BX9A 4G19A 3U6VA 2RUFA 4V2NA 5D9VA 5G1KA 3HDCA 5HR3A 4L0UA 4EXJA 5HQPA 1XWBA 1XFLA 4HU7A 3QD9A 1SL1B 1LJRA 3E3EA 1EOGA 2VCXA 3EWLA 3FR6A 4NHZA 3CTFA 3O3TA 3HYPA 4LLRA 1GTBA 5CO3A 3FY7A 3HJOA 4MPGA 4K2DA 5GSSA 4GSNA 4K7NA 5J4UA 1WPIA 2R6KA 2VCWA 4OCFA 2CAIA 1TDIA 2X8HA 1AAZA 2VOCA 2C8UA 5KN3A 3HY2A 3ZMKA 5CAXA 1JLWA 2A2SA 4HDEA 2H6XA 2B6MA 4MF6A 2GSTA 1PSQA 4XHMA 5IMZA 4DEJA 3KH7A 4ZB9A 2RM5A 4ZXGA 2E2MA 1GULA 1GSQA 5EPFA 1GUHA 2O89A 1SK0A 4JR4A 2JADA 2R37A 3ZIJA 2N5AA 5KEJA 2G0FA 1NM3A 1BG5A 3Q74A 1FO5A 4Q5NA 2L59A 2OBKA 1SJ6A 4J56E 5IMDA 3ZVJA 3C71A 8GSSA 3CSJA 1XW5A 2AYTA 3IHQA 5DAKB 5ECOB 2WRTA 1IYIA 5C00A 3JCML 2VLVA 3ZLPA 5JWOB 4TVEA 2FHEA 5F0GA 5B8AA 1E2YA 2VM1A 1TU8A 3CSHA 2E7PA 2E0QA 2VLTA 3UIWA 2V6KA 3F4RA 4ECJA 3CSIA 1KTEA 3DYRA 4JE1A 1Z5YE 3ZFBA 1XIYA 4J57E 3M3MA 3APQA 5D96A 2CVKA 3TJGA 4XIHA 5ID2B 4JBBA 2H71A 1XW9A 2V1MA 3FRCA 1QUWA 3Q18A 4KGIA 3I6AA 2K6VA 6GSUA 5ECPB 1AUCA 2B5XA 1JHBA 3H8QA 5A4UA 4CHSA 3EINA 3FR9A 4IS0A 2HLSA 2YANA 3MWHA 1YQ1A 1K0OA 3D22A 2IIYA 3F3QA 3DRNA 3IAM2 5CRGA 2AJQB 5D8IA 1VF4A 4L5OA 4PNFA 3GRXA 2DJ3A 3D5JA 1U3IA 5DJMA 1O73A 1V58A 1TU7A 5AISA 2LKUA 3F3RA 2FY6A 3LJRA 1TRSA 5IOWA 4GQCA 5FWGA 3C7MA 1FG4A 4WBJA 2CQ9A 3PGTA 1EEJA 2LQOA 4V2MA 1FB0A 6GSSA 3I9V2 4IJ3A 5GAPD 1PX6A 4I8BA 4TR0A 1G6YA 5KN0A 4GLTA 2GQKA 5F8BA 1TJDA 5DJLA 2FA8A 1Q98A 1UC7A 2H70A 1KBNA 4JR6A 1YEPA 2NDOA 1AQVA 2H73A 2IMKA 1SYRA 4GQFA 2MMNA 1F3BA 1BEDA 1OC3A 1FW1A 1K0BA 1M0UA 1I5GA 2B3SA 2HXKA 1DSBA 3LQ7A 2HI7A 1OC8A 3TJFA 1CQGA 1ST9A 1WOUA 4PQ1A 2C4JA 3GNJA 2YZHA 4RQRA 2F9SA 2VCQA 4HOJA 2H6YA 2R3XA 1DUGA 3UVTA 3WGXA 2LQQA 2RUEA 1G6WA 4F9ZA 4BPYA 4XCSA 2V2GA 1ABAA 5FHIA 5ELAA 1TRVA 2I4AA 5HR0A 3GKNA 2C3TA 2FWGA 2C1YA 13GSA 1GSFA 2KLXA 2FGXA 4K0GA 4F82A 2VCTA 1XZOA 3BCIA 2KHPA 4JRRA 4MF7A 2YWMA 3H79A 5IO2A 2H0HA 4N10A 3GL3A 3N9JA 1T4YA 2D2ZA 3NIVA 4BWQA 4EL1A 1A0FA 3RDWA 2YWOA 3J7Yk 4GRFA 2X64A 3UJ1A 3FR3A 2L6DA 4G10A 3F6DA 2CAQA 1K0AA 3IXRA 3VWXA 1SKRB 1O8WA 4QL7A 1JZOA 5E4WA 5ABRA 2JU5A 3I43A 2VUPA 4HU9A 1T1VA 2WDUA 3QDNA 1U6TA 4HJMA 1QXHA 1XOBA 2DC5A 3M9JA 5DBQA 4K1FA 4HJ2A 3ME7A 1K3OA 3TKRA 2TRCP 3R2QA 5GZZB 4K7OA 1JZWA 5C04A 1EWXA 3P90A 3CRUA 2H74A 2GSQA 3N5OA 2P0GA 4DSSA 2H1DA 1TRUA 1ZYQB 2FCHA 1O85A 3H4KA 1WRYA 3TKSA 3FKFA 3QCPA 3DD3A 2IFQB 2WJUA 2VO4A 3GH9A 4XRAA 3HZ4A 4TR1A 4FYUA 1Z7RA 3TCOA 5IPHA 4MCUA 3IA1A 2H76A 1VF1A 1MDIA 3LXZA 2A2RA 3KJYA 3M9KA 4KAEA 5B6MA 3DIEA 17GSA 3UEMA 5CREA 4WEYA 4WETA 2LV3A 4TXOA 1HQOA 3O6TA 1TP9A 2F3MA 2JZRA 3P2AA 1BAYA 2C0FA 3HCZA 4P3YB 4KX4A 2H6ZA 1XW6A 3GHAA 1YEXA 2AB6A 2P31A 4MH2A 2IJYA 5AGYA 2E2GA 1AC1A 3TKSC 3D4TA 4I97A 1PL1A 3LORA 1V9WA 1ML6A 5CRDA 1YJ6A 4K0NA 1QMVA 3GN3A 3F4SA 2LJRA 3W8SA 3VWWA 2PN8A 3HXSA 3BD2A 1A2JA 5A5KA 5B7CA 1GP1A 3KP9A 1Z9HA 4XTSA 3F6FA 4AJ6A 1S3AA 3GIXA 2N5FA 3J7Yb 3EMPA 2GDRA 1GWCA 2EIQA 5IPGA 1GSYA 1TI1A 1N8JA 4O32A 1XVQA 4ACSA 1J0FA 3PINA 2MMOA 3QAWA 1N2AA 2ALBA 1PD21 1JZDA 3P8WA 2AV4A 1A2LA 2MBSA 3ZIVA 2LEGA 1F2EA 4IP1A 3RHCA 4KSMA 1DE2A 3KP8A 3WD6A 5G1LA 2KUCA 3IK7A 2WULA 1SK2A 2YP6A 3HVSA 4Q5QA 1X9WB 2ON5A 4MPFA 3US3A 3LWAA 2HT9A 2Z9SA 1SD8A 2LNTA 4MJAA 2LJAA 4OWYA 2L5LA 5H5QA 1DBYA 3GX8A 1TK0B 3Q19A 3FYGA 4XS4B 4IGJA 3DEXA 2KOKA 2K18A 1SENA 3ZFLA 1ERWA 3GKMA 1UN2A 1EP7A 5JWRB 1QQ2A 4TR3A 2AAWA 3LGCA 1X9MB 4I5QA 4GTUA 1R4WA 3TKPA 2OADA 11GSA 4IQ1A 3GTUB 1SK1A 1ZGNA 3KTLA 5ECLB 2QKEA 3FK8A 2HZEA 4IP6A 2PBJA 4ILFA 5F06A 2DMMA 1Y25A 2YCDA 4MZCA 5G5FA 5A4VA 1FOVA 3GSSA 3KMOA 4EO3A 4H86A 1HD2A 2VL3A 2P5QA 1GSDA 2LRCA 3CYNA 4BWSA 2ZNMA 1T4ZA 2XHFA 3TKSE 2H75A 3G7JA 3IAS2 5IMVA 3F9UA 4POLA 5ECIB 2CX4A 3EU3A 1X5DA 12GSA 3QOUA 2B7KA 4KE3A 1FAAA 1OYJA 3L0HA 2GGTA 1PKWA 1GTAA 2R4VA 5J9CA 1RK4A 2MMAA 1O6JA 2DIZA 3GA4A 2V32A 1EGOA 4PX1A 2IMDA 4QL9A 2H8LA 4KCAA 1YZXA 3BJ5A 4TKYA 4IELA 4PURA 1H75A 3KXOA 2FLSA 1O7UA 3HHVA 1WMJA 3ERFA 4WKWA 2WGRA 3A5WA 1WP0A 1GUKA 6GSVA 4D73B 4K9ZA 1SD9A 1B9XC 4IQAA 3UL3A 1YKCA 2JZTA 4OD7A 3EYTA 4IBPA 4KB3A 2M80A 1G7EA 1QFNA 2OBIA 4HZ4A 2GT5A 1M2AA 1GRXA 5IO0A 1OC9B 2EIOA 2YPMA 3QR6A 1QGVA 2VL2A 2VD1A 2JZSA 3A2WA 4PNGA 4NHWA 3LG6A 2EIRA 3KMNA 5IMAA 3TJJA 1W4VA 4J2FA 2C0EA 1GSUA 4YH2A 1FHEA 4TOPA 4NAXA 4RUVA 3LYPA 1Z6NA 4PQIA 5D73A 3VWVA 2CA8A 3I69A 3GKKA 4GCIA 1F37A 3S9FA 2XPEA 4KDUA 2O85A 1XCCA 1GSSA 2OE1A 2VIMA 2RIIA 4CW9A 1GUMA 3CBUA 1MD3A 2DBCA 4PGTA 4LL4B 1B9YC 2H0IA 4MJCA 2R2JA 4X43A 5G2ZA 2XBQA 2PPTA 1M9BA 3DWVA 2KP2A 2NVLA 5DAKA 1EV9A 2BTOT 5AN1A 3QPMA 3APSA 5DALB 3IRAA 4NV2A 2FWEA 2VD0A 5GSTA 4ZL8A 4KDYA 3ZREA 3C1RA 1Z7PA 1EEMA 1EGRA 2VL2C 1F6MC 3GX0A 1GLPA 5LD0A 4Q5RA 2DJ0A 2GZZA 3IR4A 2XBIA 2A4VA 4F03A 3WT1A 5G5EA 5ID2A 1X5EA 4GWRA 3TOTA 3VI7A 3O76A 3GL5A 1XOAA 1W89A 1T7PB 4ULXA 2GSSA 3EU4A 4HQZA 3D21A 1V57A 1A8YA 5ECHB 2CZ3A 2LNSA 1UVZA 3MDKA 2CT6A 3M8NA 3TJKA 4MH3A 2ON7A 2RLIA 4BA7A 1ON4A 5ECQB 3ISOA 1HNCA 3IV4A 2OA7A 3KH9A 4MMMA 4HEA2 5B6NA 3UVHA 4HUAA 2R5GA 3BCKA 2DJ1A 3IOSA 4K8MA 4KNDA 1A23A 14GSA 1SJZA 2JACA 2MYGA 2IPAA 1TXXA 3HA9A 2YZUA 3GH6A 1PGTA 1B4QA 1IYHA 3L9VA 2J9HA 2EC4A 2V6OA 1MD4A 4N0VA 4BL7A 2OKAA 1V98A 5KN2A 2PGTA 2F8FA 5DDLA 4LA1A 2K8SA 4IW9A 4E8EA 1TTZA 2DJJA 4ECIA 2I1UA 4NXIA 4MP4A 5G30A 5F05A 4FO5A 3GFKA 4LMVA 3TDGA 1WWJA 3ZMLA 1TKDB 3L9UA 4NPBA 5D9TA 4PUFC 1TI3A 5JCUA 2DIYA 5IIZA 1G7OA 4L0WA 5DCGA 3P7XA 1SU9A 2F51A 4WR4A 2TIRA 2YV9A 3CTGA 1S3DA 1K0DA 1ZZYA 1X0RA 2L5OA 2HNLA 4RI7A 3U5RE 1EOHA 2B1LA 4NV5A 1K0CA 1SJIA 1TK5B 6GSTA 1OKTA 2H66A 1Q4JA 1OKDA 3GV1A 4GSTA 1ZMAA 4MF5A 4BVXA 1T8EB 1GSEA 2PVQA 3IDVA 1B48A 4NWYA 2L57A 4OFTA 5IQYA 3E0UA 1TOFA 1S3CA 5J3RA 5D9WA 1VF2A 1HYUA 1AQXA 4X0XA 2XPDA 4YQVA 2LS5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite