3C7ZA

T4 lysozyme mutant d89a/r96h at room temperature
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYASLDAVRHCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Contributions of all 20 amino acids at site 96 to the stability and structure of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteriophage t4
total genus 54
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3c7zA00
3DMZA 3EMLA 1SX7A 1L10A 128LA 184LA 3PBLA 3CDRA 4PK0A 1L31A 192LA 1L75A 3VW7A 1L85A 1L14A 137LA 118LA 140LA 4W59A 171LA 131LA 4ARJA 3JR6A 3D4SA 110LA 1OVHA 4I7NA 3DN4A 1QTHA 3FADA 1DYBA 1L21A 3C8SA 126LA 1L96A 1JTMA 1QT3A 3HH6A 252LA 1L97A 1SSWA 1QUHA 1LGXA 2B72A 2OU9A 107LA 1T97A 3DN2A 3HT9A 1L41A 5I14A 209LA 1C6HA 170LA 1LW9A 3DKEX 3OE0A 1OWYA 2OTYX 1L08A 1LPYA 1P2RA 3DN6A 1L60A 109LA 1L77A 259LA 2RBNA 3HU9A 1L74A 151LA 247LA 3HT6A 1XEPA 1L64A 4ARMB 1L68A 1D3FA 1LLHA 1L30A 1JTNA 1DYEA 3C7WA 119LA 222LA 1L40A 1OVJA 1PQJA 1D3NA 108LA 3V2WA 1L53A 1C6TA 1OV7A 1L71A 166LA 1D9WA 1L59A 178LA 3NY9A 1L26A 1OV5A 4ARQA 162LA 1DYAA 2B74A 102LA 3NYAA 1CV5A 233LA 251LA 242LA 1LI3A 1ZURA 182LA 176LA 2O7AA 1L66A 1LYJA 1DYDA 1L84A 163LA 3SB9A 2B6XA 130LA 1L56A 3HUKA 1G1WA 1OYUA 1QS5A 1G0PA 3CDOA 2HUKA 254LA 185LA 3HDFA 1L57A 211LA 189LA 142LA 1TLAA 3DN0A 1LWGA 3OE6A 239LA 2F47A 1G0KA 4EJ4A 120LA 4LDEA 1L54A 245LA 227LA 258LA 206LA 1CU6A 3SBAA 1C6CA 1OVKA 1PQDA 3F9LA 1QSBA 218LA 1L99A 158LA 1LGUA 246LA 1L86A 1L89A 115LA 1L15A 1L43A 1L02A 1NHBA 2B6YA 2NTGA 1P2LA 2OE4X 4E97A 2O79A 1C6NA 2CUUA 5LZMA 1L82A 1CUPA 2RBSA 4K5YA 229LA 1QTZA 3HT8A 4YX7C 1L29A 4I7OA 1P3NA 3UONA 1CV0A 3QAKA 1JQUA 1LYGA 4EPIA 2RBQA 2RBRA 4W51A 4LZMA 2HULA 4I7MA 2B7XA 172LA 1C6AA 3FI5A 168LA 3G3XA 223LA 2LC9A 1L49A 3V2YA 256LA 1P7SA 219LA 1L63A 1QT7A 3OE9A 155LA 145LA 1DYCA 253LA 2L78A 1L39A 1L83A 1SWZA 156LA 1C62A 1L34A 230LA 210LA 215LA 1L81A 1C6FA 1C6GA 1L27A 3GUIA 1PQMA 4DKLA 2OU0X 4EKRA 1G1VA 1G0QA 2ANXA 144LA 220LA 1D2YA 190LA 1C66A 228LA 2OE7X 1L18A 1LYDA 1L19A 226LA 4I7JA 4ARLA 3DN1A 1L50A 4W53A 4W55A 1L51A 4I7TA 3CDVA 112LA 3FA0A 3HU8A 262LA 1CX7A 186LA 1LI6A 1SSYA 3L64A 1L35A 3G3VA 2B73A 1L62A 1LYEA 2RAYX 1L23A 139LA 1L28A 3K2RA 129LA 3CDQA 4DJHA 197LA 2RAZX 174LA 1SX2A 1KS3A 1L32A 3SB7A 1L20A 1QTVA 1CU2A 2RBOA 1QTBA 3GUOA 2B70A 103LA 2B6WA 2B6ZA 1L90A 1PQKA 2LZMA 1L06A 147LA 257LA 1D3JA 169LA 3LZMA 3SB5A 1L12A 1L42A 2RB2X 4ARQB 1G0GA 1QT6A 1G0JA 114LA 234LA 175LA 1L67A 1KNIA 3HTGA 4GRVA 2A4TA 113LA 2OTZX 143LA 1T6HA 1WTHA 157LA 1G0LA 1L24A 1QUGA 2B75A 1L87A 3RZEA 1C6DA 1EPYA 212LA 4AQNA 3NY8A 1C6MA 4W54A 198LA 1G0MA 191LA 104LA 2LCBA 2QB0B 225LA 1B6IA 1L93A 236LA 1L95A 1C60A 4W58A 4I7QA 1CV1A 1CTWA 1QSQA 152LA 1L52A 3SB6A 1KY0A 123LA 1DYFA 148LE 146LA 2F2QA 187LA 237LA 1L33A 1L46A 1T8AA 3OE8A 1OWZA 2ANVA 183LA 1L09A 196LA 173LA 4IAPA 4I7SA 4LDOA 3HTBA 1L48A 244LA 1C6LA 1XJUA 1P6YA 2Q9DA 3SB8A 1L01A 2Q9EA 1QS9A 122LA 1L72A 1C61A 1L05A 3DNAA 181LA 3SN6R 1P64A 3GUPA 213LA 188LA 1CU0A 1L04A 3HDEA 3PDSA 4EPFA 4W57A 1C65A 1L58A 1L76A 1LYFA 3HH3A 3DMVA 3HH5A 3C7YA 1L69A 4I7RA 1CV4A 1L91A 4I7PA 1P5CA 160LA 1QTCA 1C6KA 167LA 1L80A 164LA 1L25A 1L98A 1L92A 261LA 3HTFA 1XJTA 1L17A 1LYHA 1DYGA 3HWLA 3HTDA 149LA 201LA 1P37A 1L07A 1G06A 3RUNA 141LA 1KW7A 238LA 3HT7A 1L44A 1QUOA 127LA 214LA 3GULA 250LA 4DAJA 1L88A 2B6TA 240LA 1KW5A 1L38A 4LDLA 200LA 4I7LA 1CVKA 1PQOA 3C80A 2RB0X 1D3MA 1C6IA 1C6QA 3SBBC 255LA 180LA 4OO9A 205LA 3DN3A 3C81A 1CUQA 1C6JA 1L37A 1P36A 1L13A 1ZYTA 221LA 4ARMA 1L47A 1L22A 3GUJA 165LA 248LA 2NTHA 241LA 1QTDA 1L55A 3G3WA 1C64A 1L03A 1L65A 1LYIA 3C7ZA 4EKSA 1L36A 1L70A 150LA 217LA 1L45A 1L73A 2IGCA 177LA 3C8RA 4I7KA 1CV3A 2O4WA 2OE9X 1P46A 3GUMA 3HH4A 1CV6A 195LA 1CX6A 4YXAC 3DMXA 3CDTA 2Z6BA 111LA 3GUKA 1L11A 2RBPA 4EKPA 3C82A 243LA 1CU3A 4EKQA 1C6BA 1QT8A 1PQIA 1D2WA 3C83A 1C63A 4W56A 1L79A 138LA 1QT4A 4ZPUA 1L00A 1K28A 231LA 3DN8A 7LZMA 199LA 3L2XA 1T8FA 1LGWA 4PJZA 1L0KA 2QARC 1CU5A 235LA 2RH1A 159LA 1C68A 232LA 1C6PA 2OU8A 1C67A 1C6EA 2OEAX 1L94A 1SWYA 1C69A 3HUAA 1QT5A 1ZWNA 2HUMA 161LA 1LWKA 1L0JA 2F32A 1P56A 4W52A 249LA 1T8GA 4ARPA 1QUDA 3ODUA 1G07A 125LA 4GBRB 3HUQA 1KY1A 1L61A 224LA 260LA 1I6SA 3F8VA 4EXMA 6LZMA 216LA 3C8QA 3GUNA 4S0WA 2RB1X 1LI2A 1L16A 4YXCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EMLA 4Z46A 3TXKA 2I6ZA 1UIFA 3PBLA 4PK0A 192LA 3VW7A 1LHMA 1L85A 1L14A 4LYMA 137LA 4ARJA 140LA 1NBYC 5KJ9A 4AXTA 3D4SA 1IY4A 5IHGA 1L21A 2YBNA 4P2EA 1QUSA 252LA 153LA 5DL9A 1L97A 1SSWA 1QUHA 1LGXA 1IWZA 1JJ0A 5KXLA 5KKIA 1LYZA 3CT5A 1LW9A 3A3RX 1D6QA 4NHTA 1EL1A 4E3UA 1GFKA 2OTYX 3B0KA 109LA 5KXYA 133LA 259LA 4RLNA 3WU9A 3W6EA 1L74A 3ZVQA 4OWBA 1XEPA 1L64A 2HECA 1CKDA 1L68A 2ZWBA 5FSTA 1IIZA 119LA 5KXZA 3W3EA 1LHLA 2YBMA 222LA 1L40A 4WG7A 1D3NA 4DDBA 2MEDA 3NY9A 4WO9A 1OV5A 1B5VA 1LJ3A 1JKDA 233LA 1IC7Y 2FYCA 176LA 163LA 2IHLA 1UICA 1OYUA 3CDOA 185LA 3HDFA 3EBAB 4DWXA 189LA 142LA 1TLAA 135LA 1LWGA 1D9UA 2F47A 2F4GA 4QY9A 4ZEEA 245LA 3SBAA 1C6CA 3WH1A 1REYA 218LA 1L99A 4IATA 1B2KA 3W6CA 2GV0A 1LGUA 1L89A 5LINA 1NHBA 2NTGA 3WW6A 1C6NA 1IVMA 1CUPA 4NGWA 4A7DA 1QSWA 1L29A 3WXTA 1GE3A 1KXXA 3B0IA 5KXRA 4H9AA 4EPIA 2X0AA 172LA 1LCNA 3G3XA 1GFGA 1XGPC 1L49A 223LA 256LA 2LC9A 3V2YA 1GD6A 4N8ZA 1L63A 1QT7A 145LA 1DYCA 1LYOA 253LA 4G4HA 1BWHA 1IP2A 4II8A 1ZV5L 1SWZA 3BKVA 156LA 1L34A 1YROA 230LA 3LYZA 154LA 2CGIA 4DKLA 2YDGA 4XYYA 1TAYA 1QTEA 1D2YA 1C66A 2Z39A 226LA 4ARLA 1L51A 4H9IA 1CX7A 3RU5A 1HEWA 3LZ2A 3G3VA 2B73A 4GCCA 1LYEA 129LA 1DKKA 2FYDA 174LA 5K7OA 1IP4A 1BQLY 3IJVA 3GUOA 2W1MA 2B70A 2B6WA 4B4JA 5LVIA 1PQKA 2LZMA 4HTNA 257LA 1D3JA 1HSXA 1FBIX 1L42A 1G0GA 234LA 3AW7A 5KXNA 1F6RA 1KNIA 3HTGA 4GRVA 3AB6A 4HV1A 3AGGG 3AYQA 1WTHA 1CJ6A 1RI8B 1G0LA 2DQJY 2B75A 1L87A 1LJHA 4AGAA 3RZEA 5A3ZA 4H93A 3P64A 3KAMA 1G0MA 1HF4A 3FE0A 3VWOA 2A7DA 2XJWA 1L93A 2MEIA 1C60A 4PPOA 4W58A 1WTMA 1CTWA 1QSQA 5C6IA 2LZ2A 1OUBA 3TMXA 3SB6A 123LA 1DYFA 5C6JA 1V7SA 2F2QA 4ML7A 4NSGA 5LAGA 3OE8A 1OWZA 183LA 1L09A 196LA 4IAPA 4I7SA 2DQIY 2DQHY 1RJCB 1L48A 1D0LA 1H87A 4OW1A 1L01A 1QS9A 122LA 4PGJB 3DNAA 4XJHA 3SN6R 3GUPA 1GFAA 3TXBA 4RDSA 1UIBA 1CU0A 1BGIA 1LZ8A 1IP1A 1LZ6A 4W57A 1C65A 1KIRC 3DMVA 3C7YA 1L69A 1IWVA 160LA 1C6KA 1WQPA 1KIQC 4I0CA 1LZGA 3HTDA 1HELA 4WL7A 1P37A 4KXIA 4ETDA 3HT7A 1G7MC 2Q0MX 4ZFPA 3G3AB 1IP3A 4GCEA 4H94A 4NGJA 3LN2A 2D4KA 1KW5A 4TTDA 1LPIA 4H9CA 1LZTA 4I7LA 1GHLA 1YQVY 4DD2A 1NMMA 3TXHA 4H9HA 4DDAA 1G7LC 2HTXA 4OO9A 205LA 3DN3A 1REZA 4HTKA 1C6JA 1OUDA 1L13A 1BB6A 4ARMA 4ET8A 1L47A 4HPIA 1L22A 248LA 2BQLA 4B0DA 3TXJA 3D3DA 4C3WA 1I56A 1RCMA 1L65A 1LYIA 1L70A 1BVXA 1GFHA 177LA 1FDLY 1HFYA 4I7KA 1LSZA 1HEPA 1IWXA 3HH4A 4YXAC 3DMXA 3CDTA 2PC2A 5HNLA 4WM6A 2RBPA 5D5FA 5A3EA 4NFVA 1DQJC 4EKPA 3WVXA 1IP5A 5FDJA 1C6BA 4EKQA 1D2WA 4W96A 5L3HA 4MR1A 1B7MA 3MGWA 1K28A 231LA 1JWRA 199LA 3L2XA 5J7CA 4NIJA 2QARC 5B59A 3TXDA 159LA 2ZQ4A 2OEAX 2C8OA 1B5XA 1SWYA 2Z19A 1OUIA 4DC4A 1T8GA 3T6UA 4ARPA 1DI3A 4NGYA 4N5RA 1LYSA 2IFFY 4EXMA 4J1AA 1BB7A 1NF5A 1AM7A 4TWSA 1LZDA 1EQ5A 3DMZA 4LZTA 2EPEA 1KXYA 3M18B 1GB2A 3CDRA 2D6BA 1UIAA 1LZBA 118LA 4W59A 3JR6A 1VDSA 4I7NA 3DN4A 3FADA 1UA6Y 1DYBA 4HPEA 1LSAA 1JTMA 1HC0A 2B72A 2D4JA 1XGRC 5I14A 1XGQC 1LPYA 3DN6A 1L60A 3E3DA 2BQNA 1L77A 4LYBA 2RBNA 2LYZA 4H9EA 3HT6A 1JTPL 3WUNA 1D3FA 1LLHA 1QTKA 4H9FA 1T6VL 1GB8A 3C7WA 4NWEA 4G4BA 3GXKA 1D0KA 1OVJA 1GDWA 1OV7A 1C6TA 3CT0A 1JEFA 1RE2A 166LA 178LA 1L26A 4NHQA 4ARQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EML A;  4Z46 A;  3TXK A;  2I6Z A;  1UIF A;  3PBL A;  4PK0 A;  192L A;  3VW7 A;  1LHM A;  1L85 A;  1L14 A;  4LYM A;  137L A;  4ARJ A;  140L A;  1NBY C;  5KJ9 A;  4AXT A;  3D4S A;  1IY4 A;  5IHG A;  1L21 A;  2YBN A;  4P2E A;  1QUS A;  252L A;  153L A;  5DL9 A;  1L97 A;  1SSW A;  1QUH A;  1LGX A;  1IWZ A;  1JJ0 A;  5KXL A;  5KKI A;  1LYZ A;  3CT5 A;  1LW9 A;  3A3R X;  1D6Q A;  4NHT A;  1EL1 A;  4E3U A;  1GFK A;  2OTY X;  3B0K A;  109L A;  5KXY A;  133L A;  259L A;  4RLN A;  3WU9 A;  3W6E A;  1L74 A;  3ZVQ A;  4OWB A;  1XEP A;  1L64 A;  2HEC A;  1CKD A;  1L68 A;  2ZWB A;  5FST A;  1IIZ A;  119L A;  5KXZ A;  3W3E A;  1LHL A;  2YBM A;  222L A;  1L40 A;  4WG7 A;  1D3N A;  4DDB A;  2MED A;  3NY9 A;  4WO9 A;  1OV5 A;  1B5V A;  1LJ3 A;  1JKD A;  233L A;  1IC7 Y;  2FYC A;  176L A;  163L A;  2IHL A;  1UIC A;  1OYU A;  3CDO A;  185L A;  3HDF A;  3EBA B;  4DWX A;  189L A;  142L A;  1TLA A;  135L A;  1LWG A;  1D9U A;  2F47 A;  2F4G A;  4QY9 A;  4ZEE A;  245L A;  3SBA A;  1C6C A;  3WH1 A;  1REY A;  218L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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