3C81A

Mutant k85a of t4 lysozyme in wildtype background at room temperature
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLAPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacteriophage t4
publication title Contributions of all 20 amino acids at site 96 to the stability and structure of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 60
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3c81A00
1NHBA 1P7SA 210LA 1L51A 1P64A 190LA 3FI5A 187LA 1JTMA 1QTVA 241LA 110LA 1G1WA 1L48A 2RAZX 1L34A 1L54A 1LGXA 3GUOA 1CX7A 3C80A 2F32A 1LGUA 166LA 3SB7A 234LA 2L78A 1LYGA 4EKQA 1L59A 1PQDA 1QT8A 1L10A 1L22A 3CDTA 248LA 3HUQA 2RBNA 1L41A 112LA 147LA 3D4SA 1L70A 3SBBC 1P2RA 1PQOA 1LYIA 2OE4X 165LA 151LA 152LA 213LA 4PJZA 1QS9A 3OE6A 1L63A 1QSQA 2RBRA 4K5YA 3HTBA 4E97A 206LA 1L01A 1T8GA 4LDEA 2NTGA 1D3FA 1L95A 3GULA 1CU0A 4ZPUA 1QUOA 2O79A 4I7PA 160LA 3C8SA 223LA 1OWYA 186LA 3RZEA 2Q9DA 140LA 4I7KA 2B6TA 199LA 1L66A 2B6ZA 3DKEX 189LA 1OVJA 1D3JA 3V2WA 1QTZA 3HTDA 1L11A 1CV6A 1CVKA 1QSBA 2QB0B 243LA 3GUKA 1I6SA 1L07A 2LCBA 3SB9A 1L39A 1WTHA 1KY0A 118LA 2OTZX 164LA 183LA 113LA 261LA 4ARMA 3DN3A 7LZMA 5I14A 1CU6A 1L89A 3SB6A 1L68A 1PQJA 1L45A 205LA 1LYHA 4I7NA 1C6KA 4GRVA 3HT7A 161LA 215LA 242LA 1C65A 214LA 3CDQA 1C6PA 2RAYX 4EKRA 1C67A 1P6YA 111LA 2RB0X 1OV5A 157LA 1L56A 1QTBA 262LA 1P46A 1L15A 1G0LA 109LA 3DMZA 1SX7A 182LA 237LA 1JTNA 1KW5A 1C6QA 171LA 3CDOA 4PK0A 1L82A 4S0WA 1L60A 2F2QA 4ARJA 3HT6A 1C6HA 1L33A 1QT6A 2B6YA 211LA 1CV5A 3SN6R 1QUDA 221LA 141LA 4I7RA 1L75A 1L28A 2O4WA 1D2WA 1L38A 1OYUA 259LA 3GUPA 1L57A 4W54A 1XEPA 2OEAX 1QT4A 201LA 1LI6A 1D2YA 3DMXA 4LZMA 1LYEA 1SWZA 1L14A 4YXAC 1L44A 155LA 195LA 1L92A 2QARC 168LA 1C68A 2O7AA 2OU8A 4LDOA 1L18A 235LA 2RBPA 3JR6A 1L83A 170LA 172LA 1L29A 1L85A 1T8FA 1L23A 1CV4A 3DN1A 2OU0X 5LZMA 3HU9A 2RBQA 257LA 119LA 1C66A 122LA 1C6MA 230LA 1C6BA 4W52A 1LYJA 1L94A 209LA 1QUGA 1PQMA 244LA 236LA 108LA 150LA 139LA 238LA 4ARQA 4YXCA 1C6CA 1L26A 1L12A 1LI3A 1SSWA 2RBOA 1L49A 3HDEA 1CUPA 254LA 1P5CA 1KW7A 1G0JA 102LA 1L64A 2B6XA 1L19A 191LA 4I7SA 1C6JA 3G3XA 246LA 3NY8A 1L80A 1CX6A 1D3MA 1TLAA 1L36A 249LA 1DYCA 255LA 1L86A 130LA 1QS5A 1C6FA 176LA 156LA 2OU9A 1L55A 1L97A 3DN4A 4I7LA 115LA 1L24A 3C7YA 1L32A 3K2RA 1C6EA 1G1VA 1OWZA 104LA 4AQNA 1CV1A 1L31A 4I7QA 4DAJA 3DMVA 1T97A 1PQKA 1B6IA 1L93A 1D9WA 1PQIA 138LA 1L62A 1P56A 1T8AA 1G06A 1CUQA 146LA 253LA 3HTFA 4ARPA 180LA 3OE8A 4OO9A 4EKSA 1K28A 1LPYA 1DYEA 188LA 1L16A 1C60A 4EPIA 1C6IA 225LA 1G0KA 123LA 1L05A 2B7XA 4W56A 1DYBA 1DYGA 128LA 1L27A 1G07A 1QTDA 198LA 1L0JA 131LA 4LDLA 200LA 114LA 4EKPA 3PDSA 127LA 3HU8A 4W59A 142LA 163LA 1L81A 1L76A 3DNAA 3L2XA 1L43A 1ZWNA 3ODUA 3G3VA 1C6TA 1L72A 3UONA 1L58A 3OE9A 247LA 1L88A 2CUUA 3F9LA 192LA 4W51A 216LA 1G0PA 1L77A 1L99A 2ANVA 217LA 1KS3A 1L21A 212LA 3F8VA 2LZMA 1L08A 3HTGA 1CTWA 2A4TA 2RBSA 2NTHA 4I7TA 145LA 1L90A 1L52A 1D3NA 158LA 1LW9A 1L69A 1L53A 1ZYTA 219LA 3C81A 1L79A 1L30A 196LA 228LA 2B75A 120LA 4EJ4A 1L67A 4W57A 224LA 3SB5A 174LA 4ARLA 4ARMB 3L64A 4EXMA 4DKLA 258LA 3VW7A 4DJHA 125LA 2IGCA 1L13A 1QT3A 2Z6BA 1XJTA 1L46A 3RUNA 3G3WA 3DN8A 2B72A 3HH3A 3FA0A 1LLHA 3HUAA 1EPYA 1QT5A 1CU5A 240LA 2OE9X 1C63A 245LA 4YX7C 4W58A 1L00A 1L47A 2RB1X 173LA 184LA 3HT9A 1DYAA 3GUMA 2RB2X 1C69A 1LWKA 3SB8A 2OTYX 220LA 1L03A 1L02A 1L20A 3C8QA 1T6HA 1P37A 1C6LA 1LYDA 2F47A 3HH4A 1L09A 185LA 1G0GA 1L61A 2ANXA 3FADA 3GUNA 3V2YA 1SWYA 4W53A 3GUIA 129LA 1CU3A 251LA 4GBRB 3HDFA 4I7JA 3SBAA 226LA 6LZMA 3HUKA 1KNIA 1SSYA 1C6NA 222LA 3C7ZA 218LA 1L0KA 2OE7X 2B6WA 1OV7A 256LA 1L98A 1CV3A 3OE0A 1LYFA 1L91A 1DYDA 167LA 1JQUA 178LA 3LZMA 1KY1A 1OVHA 4I7MA 1C64A 107LA 1DYFA 1QUHA 229LA 3HT8A 3HH5A 1QT7A 1CV0A 250LA 1L87A 1LWGA 2Q9EA 3EMLA 1P2LA 4ARQB 4EPFA 1ZURA 3QAKA 1QTHA 1L71A 231LA 1L65A 175LA 1L06A 4IAPA 3C8RA 177LA 2B74A 2B73A 3C7WA 3PBLA 1L74A 2HUKA 3DN2A 162LA 1XJUA 149LA 1LI2A 148LE 3DN6A 232LA 2RH1A 3NYAA 1C6DA 1L04A 1C6AA 1OVKA 1L37A 197LA 1L25A 143LA 1P3NA 137LA 1C61A 227LA 2HUMA 2HULA 126LA 1LGWA 1C62A 3HH6A 233LA 1G0QA 1P36A 1QTCA 1L73A 2LC9A 159LA 3C83A 1SX2A 1L50A 103LA 181LA 1G0MA 1L35A 3GUJA 3C82A 3NY9A 1L42A 260LA 1L96A 2B70A 1C6GA 1CU2A 239LA 3HWLA 4I7OA 3CDRA 252LA 1L40A 1L84A 1L17A 144LA 169LA 3DN0A 3CDVA 4W55A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HECA 1NHBA 3TXEA 1GB8A 1GB3A 2BQJA 4HJVA 2LYOA 3A6CY 3TMWA 4L41A 187LA 4WM6A 241LA 1XEJA 1FBIX 4LFPA 1GB9A 2RAZX 1HEQA 1L34A 1L54A 4Z46A 1CX7A 5DL9A 5IHGA 4FDYA 3C80A 4KL7A 3SB7A 4ETBA 234LA 1LYGA 1C45A 1G7HC 4EKQA 1L59A 3FI7A 1L10A 1IOQA 1L22A 112LA 147LA 4ZFPA 1GAYA 4IASA 3CT5A 1L63A 1QSQA 2RBRA 2VB1A 4K5YA 1BB4A 1T8GA 1D3FA 1L95A 2B5ZA 1GDWA 2O79A 1QIOA 4RLNA 3CSZA 3C8SA 186LA 4DD9A 5I54A 2B6TA 1L66A 1TBYA 2B6ZA 3DKEX 4H91A 1LHHA 1V7SA 189LA 1OVJA 5B07A 4B4EA 1HEWA 1CV6A 3RT5X 3GUKA 1D6QA 2I26L 4LYMA 4DC4A 164LA 5KXRA 113LA 4B4JA 2BQMA 4NSHA 5F14A 1IWWA 1GF6A 1IP7A 3SB6A 1L45A 3J6KA 1NBYC 3SP3A 1GBXA 1SLYA 2F30A 2FBDA 1CKDA 1C6PA 1IR7A 2RB0X 1FN5A 1QTBA 4GLAA 1G0LA 109LA 3DMZA 1LSYA 4AXTA 1JTNA 1KW5A 1GFUA 1LKRA 3P66A 2BLYA 4NSGA 3WPKA 1C6QA 4PPOA 1GXV2 4R6CA 1BQLY 5LVGA 1L60A 4WMGA 1L33A 1QT6A 2HU1A 5LXWA 3WMKA 1QUTA 4H8XA 2HEBA 2BQEA 3WW5A 4J7VA 2G4PA 5KXKA 1L75A 2O4WA 1L38A 1GE2A 259LA 1GB0A 3GUPA 1QT4A 4WLXA 1D2YA 153LA 1CJ7A 1RI8B 3QNGA 1L44A 5LAFA 1GE3A 2YBHA 2O7AA 2DQAA 1L18A 170LA 1L85A 1T8FA 2BQOA 3DN1A 2OU0X 2ZYPA 1VATA 1DKJA 1OUGA 1L94A 3ZEKA 1PQMA 244LA 236LA 108LA 150LA 5LIOA 4C3WA 1YQVY 5LYMA 2HUBA 1LZEA 1KW7A 1OUFA 1IP1A 2H9KA 4NHQA 1GBOA 4I7SA 4B4IA 246LA 1LSPA 3TXGA 3NY8A 1L80A 1RJCB 1REZA 3A93A 2G4QA 4G4BA 249LA 4OWEA 1LZ8A 1CKCA 1GEVA 2CGIA 4LYBA 1KXYA 4KXIA 1WTNA 1CKFA 5B1GA 4I7LA 5KJ9A 4OW1A 3C7YA 1RFPA 2HTXA 1C6EA 1B7LA 2ZIKA 3FE0A 1T97A 1B6IA 2A7FA 146LA 1LZSA 3OE8A 4MR1A 2EQLA 2C8PA 1L16A 1UACY 1C60A 2LZ2A 1G0KA 123LA 2B7XA 1IC7Y 4GCBA 1DYGA 128LA 1G07A 1KXWA 4DT3A 200LA 3CB7A 3BKVA 163LA 4EJ4A 4ETAA 4H94A 1L43A 4DWXA 1C6TA 1CJ8A 1LMTA 4WO6A 1LZRA 1LMOA 2CUUA 3A94A 4W51A 4A7DA 1G0PA 1VAUA 1L77A 1DI4A 1L99A 4WL7A 3F8VA 1GFGA 5B1FA 3EXDA 2MEFA 1CTWA 4IJ4A 3AGGG 2RBSA 4QEQA 3WH1A 1ZYTA 5APDA 1E8LA 4TX7A 3EMSA 1L30A 5LVHA 120LA 1LJ3A 1F6RA 4W57A 1WQOA 1CKHA 4EXMA 258LA 2CWIA 1LSGA 4PRQA 2DQDY 1PZYA 125LA 2IFFY 1XJTA 3FA0A 1IY3A 5FSTA 5APFA 3T36A 1L00A 4LYTA 3HT9A 5II3A 2BQAA 1C69A 2RSCA 4B0DA 2OTYX 1L03A 5D5CA 4YF2A 1QSWA 207LA 1P37A 1C6LA 4YM8A 4DDBA 5K7OA 4AGAA 4NSJA 1G0GA 3FADA 3QE8A 1CU3A 4GBRB 226LA 4QGZA 5LYZA 6LZMA 1KNIA 1IWTA 5LAGA 1C6NA 4NGZA 2BQGA 222LA 218LA 1L0KA 2B6WA 4WLDA 1G7IC 1DPXA 1OV7A 2LHMA 3TMUA 5I53A 1DYDA 5C6IA 1OVHA 2AUBA 107LA 1LYSA 4LZTA 1FLWA 1B7RA 229LA 1REMA 4BAPA 1CV0A 5KXNA 2XJWA 1P2LA 2DKVA 1ZURA 1HHLA 1XGRC 1L71A 1GXXA 3ATNA 1L06A 3C8RA 1H87A 4Z98A 162LA 4NHSA 149LA 148LE 3DN6A 232LA 5E4PA 1AT5A 4H90A 3WPJA 1QTKA 1QUSA 1C6DA 1OVKA 1L25A 227LA 134LA 1C62A 1GFJA 4P2EA 5KKIA 5A3EA 2LC9A 1OUCA 181LA 5T3FA 4G4HA 1B5YA 2WARA 4I0CA 1L40A 4XN6A 1EQ5A 4W55A 2Y8PA 1P7SA 4G49A 1QTVA 2YSSC 1NBZC 3G3AB 1XGQC 3P4ZA 4NY5A 1LGXA 2D4IA 2YBNA 3CSRA 1YKXX 1REXA 3WUMA 2F32A 2W1MA 4GCCA 3CT0A 4NIJA 2BQLA 4TWSA 3CDTA 3HUQA 4H8YA 2RBNA 1L41A 5FHWA 3CQLA 5HNCA 3TMXA 3SBBC 5HNLA 165LA 1IEEA 151LA 2FYCA 3W6FA 2ZILA 3W6DA 1QS9A 2YBIA 206LA 4WO9A 4LDEA 3GULA 4ETCA 5KXMA 160LA 4NGKA 1IP5A 1JSFA 2C8OA 140LA 4H9EA 1JJ0A 1F10A 3V2WA 1QTZA 3HTDA 1L11A 2YBJA 1TEWA 2MEAA 1BB3A 1QSBA 2QB0B 118LA 2OTZX 1I56A 4MSTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HEC A;  1NHB A;  3TXE A;  1GB8 A;  1GB3 A;  2BQJ A;  4HJV A;  2LYO A;  3A6C Y;  3TMW A;  4L41 A;  187L A;  4WM6 A;  241L A;  1XEJ A;  1FBI X;  4LFP A;  1GB9 A;  2RAZ X;  1HEQ A;  1L34 A;  1L54 A;  4Z46 A;  1CX7 A;  5DL9 A;  5IHG A;  4FDY A;  3C80 A;  4KL7 A;  3SB7 A;  4ETB A;  234L A;  1LYG A;  1C45 A;  1G7H C;  4EKQ A;  1L59 A;  3FI7 A;  1L10 A;  1IOQ A;  1L22 A;  112L A;  147L A;  4ZFP A;  1GAY A;  4IAS A;  3CT5 A;  1L63 A;  1QSQ A;  2RBR A;  2VB1 A;  4K5Y A;  1BB4 A;  1T8G A;  1D3F A;  1L95 A;  2B5Z A;  1GDW A;  2O79 A;  1QIO A;  4RLN A;  3CSZ A;  3C8S A;  186L A;  4DD9 A;  5I54 A;  2B6T A;  1L66 A;  1TBY A;  2B6Z A;  3DKE X;  4H91 A;  1LHH A;  1V7S A;  189L A;  1OVJ A;  5B07 A;  4B4E A;  1HEW A;  1CV6 A;  3RT5 X;  3GUK A;  1D6Q A;  2I26 L;  4LYM A;  4DC4 A;  164L A;  5KXR A;  113L A;  4B4J A;  2BQM A;  4NSH A;  5F14 A;  1IWW A;  1GF6 A;  1IP7 A;  3SB6 A;  1L45 A;  3J6K A;  1NBY C;  3SP3 A;  1GBX A;  1SLY A;  2F30 A;  2FBD A;  1CKD A;  1C6P A;  1IR7 A;  2RB0 X;  1FN5 A;  1QTB A;  4GLA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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