3C82A

Bacteriophage lysozyme t4 lysozyme mutant k85a/r96h
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLAPVYDSLDAVRHCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Contributions of all 20 amino acids at site 96 to the stability and structure of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteriophage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3c82A00
1L44A 1ZWNA 120LA 3G3XA 1C6IA 1LLHA 2RB0X 3HTDA 4EXMA 1DYDA 3OE8A 167LA 4EPIA 1C6BA 3HH6A 1L38A 1LGXA 183LA 1LI3A 2Z6BA 1TLAA 1ZYTA 3SB5A 4EKQA 4I7KA 186LA 212LA 253LA 1QTCA 1C6HA 196LA 2Q9DA 1LWKA 1CU5A 234LA 2OU8A 3CDVA 1C66A 3L2XA 3RUNA 3GUKA 2HULA 3L64A 1G06A 3OE9A 4I7OA 1SWYA 162LA 1G0MA 1L66A 180LA 1L12A 1B6IA 1QUHA 1CV4A 223LA 3G3VA 1L86A 3HWLA 181LA 1L42A 3CDTA 199LA 1OWZA 1L54A 3HUAA 119LA 2B6ZA 1C6NA 1L50A 158LA 4LDEA 160LA 1L55A 111LA 191LA 210LA 157LA 232LA 235LA 1QUGA 131LA 256LA 3HH5A 1DYBA 1L21A 252LA 128LA 1C67A 1L63A 174LA 125LA 209LA 3CDRA 1L94A 2RH1A 1JTMA 3DN8A 1L89A 1G0PA 1L06A 1L97A 1ZURA 2O4WA 6LZMA 1WTHA 2RB1X 237LA 129LA 1L47A 1QUDA 3C81A 1C6MA 3OE0A 1L32A 1G0JA 1CUQA 1L60A 1L40A 2A4TA 1CU6A 4W53A 1P37A 2O79A 187LA 4E97A 1L0KA 152LA 1C6CA 1L96A 2RBSA 146LA 255LA 227LA 3HDEA 1L33A 2HUKA 2HUMA 170LA 1LGUA 1G07A 1NHBA 161LA 3SB9A 1P2RA 1L73A 1C6LA 1L83A 1L11A 2IGCA 3DN6A 231LA 4YXAC 236LA 1CV3A 4EKPA 1L70A 163LA 2B6TA 2NTHA 1I6SA 144LA 1KY0A 1L27A 188LA 1DYAA 1L36A 190LA 4W57A 3DN4A 1QTZA 2B6XA 4I7PA 1C68A 1L88A 3GUPA 166LA 1L64A 176LA 3PDSA 1T6HA 3C8RA 102LA 1L65A 201LA 3HT6A 155LA 3DN1A 2B7XA 2B6WA 2F47A 1G1WA 1QT3A 1L31A 1G0KA 2NTGA 4DJHA 149LA 185LA 1KNIA 1QTDA 198LA 1D2YA 143LA 145LA 168LA 3SBAA 1L90A 3HT9A 165LA 1PQKA 1OVJA 4LDOA 1QT7A 4W54A 1SX7A 164LA 1SSYA 150LA 1C62A 4I7SA 3D4SA 1D3JA 1L46A 1L81A 1SX2A 4W59A 1C65A 140LA 1C6JA 220LA 245LA 1L67A 1QT4A 3HUKA 241LA 230LA 1QSBA 1SSWA 211LA 4PJZA 4DKLA 189LA 2OU9A 1CX6A 3DNAA 3NY9A 4I7NA 197LA 1L08A 3SB6A 109LA 3C7YA 3C7ZA 118LA 3CDOA 1L20A 1G0QA 1C60A 156LA 1L99A 2OE9X 1L09A 4W52A 1L26A 3VW7A 1L95A 2B74A 2QB0B 3HTGA 1L71A 159LA 137LA 1CU0A 238LA 228LA 1XJUA 261LA 3C8SA 123LA 1LYEA 2B6YA 4YXCA 1L59A 3C82A 1QS9A 4PK0A 147LA 1D3MA 1QTBA 177LA 1L16A 3HU8A 4I7QA 110LA 1CX7A 1L72A 1LYDA 260LA 1L39A 1P2LA 215LA 1L23A 1QT6A 3HUQA 3DN3A 4ZPUA 107LA 1L48A 206LA 2ANXA 139LA 1DYCA 240LA 1L35A 3HH4A 3V2WA 1L80A 2RBPA 250LA 1C6AA 1D2WA 114LA 3RZEA 2RBNA 3HU9A 1C6DA 2OTYX 1C61A 2F2QA 229LA 1L10A 1L28A 224LA 217LA 2RAZX 151LA 1G0GA 1KW7A 4EKSA 1L74A 1OVKA 1CV5A 3HTFA 1C6KA 1L37A 2B70A 1CVKA 178LA 1L57A 1L14A 4GBRB 213LA 1LYFA 4ARLA 3SN6R 1DYGA 1L00A 1L56A 1L85A 1PQIA 4ARQA 1LGWA 1P7SA 1L98A 1L77A 1L87A 3HTBA 3GUJA 262LA 103LA 1OYUA 1XJTA 1C6TA 239LA 3OE6A 1CU2A 112LA 2OE7X 113LA 233LA 4OO9A 1T97A 1SWZA 1L24A 184LA 1L75A 126LA 225LA 1D3FA 3HDFA 1L25A 4GRVA 4LZMA 1C6GA 148LE 226LA 2OTZX 1CU3A 1P46A 1L17A 3FI5A 1L41A 1LYJA 1L79A 3F8VA 1L43A 3LZMA 4I7RA 1KY1A 3K2RA 1K28A 2OE4X 3C83A 1LYGA 182LA 4EKRA 138LA 1LI2A 1P56A 3C8QA 3FADA 1LWGA 3DMVA 1QTHA 1CUPA 1L82A 1T8AA 1L22A 214LA 104LA 1L51A 1C6EA 4LDLA 169LA 216LA 3GUMA 173LA 1T8GA 1L19A 1C63A 1QTVA 1QSQA 1QUOA 192LA 3GULA 2OEAX 2LCBA 5I14A 3C7WA 1L01A 1L53A 1L04A 1JQUA 1P36A 2RAYX 1OV7A 2CUUA 3SB7A 1L02A 247LA 249LA 1C64A 3HT7A 3DMZA 3HH3A 2B73A 1C69A 1T8FA 4K5YA 1L05A 2RBRA 4ARQB 1CV6A 1PQOA 1DYFA 1L93A 3NYAA 4I7LA 3SBBC 1CV1A 4ARMA 4I7JA 3CDQA 1L18A 1L62A 2B75A 4W51A 1LYIA 2RB2X 1L69A 1L92A 115LA 1OVHA 2O7AA 2QARC 142LA 1OV5A 218LA 1L52A 1CV0A 2L78A 1QT8A 3GUOA 2Q9EA 1L13A 3G3WA 175LA 243LA 2LC9A 205LA 2OU0X 1L34A 1QT5A 257LA 1LYHA 200LA 3DKEX 3C80A 172LA 1C6FA 4DAJA 3EMLA 1L76A 1EPYA 244LA 1L03A 1D3NA 1L0JA 195LA 4S0WA 1C6QA 4AQNA 1OWYA 4IAPA 2ANVA 3UONA 2RBQA 1KW5A 1PQMA 141LA 1L15A 122LA 222LA 1PQJA 1XEPA 4I7MA 4EPFA 254LA 4EJ4A 1PQDA 1L49A 3F9LA 221LA 1D9WA 3QAKA 1L84A 3FA0A 4I7TA 3JR6A 3DN2A 1KS3A 2B72A 1P3NA 1L30A 1C6PA 2F32A 2RBOA 251LA 1JTNA 1G1VA 4YX7C 3NY8A 1LI6A 127LA 1L68A 1LPYA 1L29A 248LA 4ARPA 171LA 246LA 1QS5A 1L58A 1P6YA 3DMXA 5LZMA 3HT8A 108LA 3ODUA 3GUIA 4ARMB 4W58A 4W55A 1L91A 1L45A 1L07A 1P64A 242LA 130LA 1G0LA 3PBLA 2LZMA 4ARJA 258LA 219LA 1LW9A 1L61A 3V2YA 4W56A 3GUNA 3SB8A 1DYEA 259LA 3DN0A 1P5CA 7LZMA 1CTWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G3XA 5F9XA 4I0CA 3VWOA 4EXMA 3AW7A 2BQIA 3OE8A 1B7RA 3LYZA 4PGJB 1C7PA 4IJ4A 1LGXA 5KXNA 186LA 3KAMA 212LA 253LA 1C6HA 1LWKA 234LA 3TMWA 4H9BA 1FLWA 1G06A 4HTQA 4I7OA 1D6PA 2ZIKA 4TX7A 2W1MA 4U3XB 4WLXA 4HV2A 4NSHA 181LA 1IR8A 1L55A 1GE0A 2BQOA 210LA 5IDDA 232LA 1MELL 5LYTA 3AGGG 3TXDA 1JJ3A 1C67A 2MEDA 4B4EA 1GFAA 2RH1A 4N5RA 3HBEX 1ZURA 1GD6A 1WTHA 1QUDA 3C81A 3OE0A 2HEFA 5I4WA 4RW1A 1I20A 3EBAB 3A91A 1P37A 4N9RA 1C6CA 1FN5A 3P65A 3AB6A 3D3DA 5F9UA 4DYGA 1IR9A 2DQGY 2HUMA 5KXWA 1UIFA 4II8A 3B6LA 1NHBA 2A7DA 2W1XA 3W6AA 1L83A 1CKCA 2LYZA 4X3BA 1JKDA 163LA 9LYZA 4DDAA 4DD7A 1IP4A 5B59A 1GDWA 1CNSA 2XJWA 188LA 2BQBA 4LT3A 2AUBA 1BB4A 4LYCA 2CGIA 5FCPA 1UCOA 2MEFA 3C8RA 1UIHA 4H9AA 201LA 1IWYA 1XGTC 3TXHA 1VATA 1GDXA 1TEWA 1XFPL 2B7XA 2B6WA 2F47A 1QT3A 4DJHA 1IWWA 4TTDA 1LSMA 165LA 4LT2A 2N5ZA 4N1EI 1T3PA 4W54A 1SX7A 150LA 1GFEA 1SX2A 1GFUA 1C65A 1LZEA 3AZ5A 1QT4A 4DWXA 1QSBA 4PJZA 211LA 4DKLA 5HQ1A 134LA 1HSXA 1IOSA 1AKIA 3DNAA 5LA5A 3TXGA 1LKRA 5B05A 109LA 4GLVA 3QY4A 3RU5A 4DDBA 1WTNA 1KIQC 1L20A 1G0QA 8LYZA 1IY4A 1L99A 1JHLA 1HEMA 1L09A 5L3HA 3HTGA 1G7MC 4OWAA 1L71A 1KXXA 4HJVA 3N9CA 1LZ1A 4NGVA 4OWHA 3P4ZA 2LZTA 2MEAA 2W1YA 147LA 2F2NA 1D9UA 2Y8PA 1LYDA 2FYCA 1AM7A 1L39A 1DZBX 2ZNXY 1DXJA 1LSNA 5IHGA 1WTMA 1DPWA 3HUQA 4H9HA 4QEQA 3N9AA 3WPJA 1GXXA 4DD1A 5A3ZA 3A92A 2RBPA 4H92A 4LYZA 3T36A 7LYZA 2ZNWY 3RZEA 1GE3A 3HU9A 5LVJA 4ETAA 1VFBC 2YDGA 4CHXA 2F2QA 4G4CA 1LSPA 1L28A 224LA 217LA 4NGOA 3ZEKA 4H9FA 4NG8A 4EKSA 1L74A 1RFPA 2G4PA 4H1PA 3B72A 1L37A 3A8ZA 1CVKA 1LYYA 1L57A 1XGRC 5D5FA 4BAPA 3RT5X 2BQNA 1YQVY 1L00A 1L56A 4ARQA 1LGWA 4ETCA 4H91A 4OOTA 1L77A 5HLLA 1L87A 3HTBA 262LA 1C6TA 3OE6A 5KXKA 2CWIA 233LA 1ALCA 2HU1A 1L24A 1L75A 4ETEA 225LA 3WYHA 1UIDA 2ZWBA 1LZYA 4GRVA 1B7PA 1P46A 3F8VA 3LZMA 1HMKA 4EOFA 138LA 3DMVA 1QTHA 5LVHA 1L51A 3TXJA 1G7HC 1G7IC 1UACY 5ILFA 2XBRA 1L19A 1GFRA 1HEWA 3GULA 2OEAX 5I14A 1L01A 4XADA 3QE8A 1C46A 3HH3A 5F81A 3W6FA 1C69A 1IOQA 4K5YA 1L05A 1BHZA 1LYSA 1XGPC 3ZVQB 4I7LA 4I7JA 4KT3A 4NIJA 2B75A 4W51A 1YKXX 1LYIA 1OP9B 2RB2X 6LYTA 115LA 1GB6A 2O7AA 3W6EA 1L52A 1B5WA 3GUOA 2L78A 4PRQA 3BKHA 1OUEA 1QUTA 1QUSA 3WU9A 1HFYA 1L0JA 4IATA 1BWJA 5FELA 1LZGA 2RBQA 1LHLA 4DQ5A 3G3BB 1JKBA 141LA 1XEPA 4EJ4A 1L49A 3QAKA 1QDRA 4I7TA 1W6ZA 1GFGA 2DKVA 2YBIA 2BQDA 4UWNA 1JTNA 1LMQA 1JKAA 1QQYA 2CJLA 1L58A 3DMXA 3HT8A 2BQMA 4LFPA 1IX0A 2DQJY 1L91A 1GHLA 3RW8A 4LYBA 2VB1A 4RW2A 5JENB 5KXOA 1A2YC 1GE2A 2I6ZA 219LA 4OOOA 1L61A 1V7TA 1DYEA 2C8PA 3W6BA 4OWCA 1ZWNA 3LN2A 120LA 1CJ8A 1LLHA 2RB0X 4TUNA 4WL7A 1CKHA 3N9EA 4XENA 5LYZA 2DQFC 2Z37A 4NHIA 3WULA 2Q9DA 4DD9A 3CT0A 3RUNA 3OE9A 1NBYC 1NBZC 1LMCA 1GE1A 180LA 1CV4A 1GF6A 3HWLA 199LA 1B7SA 1HELA 1UIAA 4YF2A 3T6UA 3HUAA 4H90A 119LA 1LYOA 1C6NA 133LA 4B1AA 4B4IA 158LA 191LA 4H8YA 1KXWA 6LYZA 2BQAA 1QUGA 4C3WA 1B5YA 1L63A 2C8OA 1JTMA 2MEHA 3DN8A 1IIZA 2O4WA 6LZMA 2RB1X 1B5XA 1LYZA 5FHWA 1L32A 1CUQA 1HERA 2MEEA 1L60A 153LA 2A4TA 1IC5Y 3RZ4A 1CKGA 2O79A 5APFA 1J1OY 152LA 4BAFA 1GF0A 1L96A 2RBSA 227LA 4LYTA 1JPOA 2DQHY 170LA 1LJEA 1LGUA 3HBHA 3SB9A 5J7CA 1LHHA 1VEDA 1L11A 3E3DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3G3X A;  5F9X A;  4I0C A;  3VWO A;  4EXM A;  3AW7 A;  2BQI A;  3OE8 A;  1B7R A;  3LYZ A;  4PGJ B;  1C7P A;  4IJ4 A;  1LGX A;  5KXN A;  186L A;  3KAM A;  212L A;  253L A;  1C6H A;  1LWK A;  234L A;  3TMW A;  4H9B A;  1FLW A;  1G06 A;  4HTQ A;  4I7O A;  1D6P A;  2ZIK A;  4TX7 A;  2W1M A;  4U3X B;  4WLX A;  4HV2 A;  4NSH A;  181L A;  1IR8 A;  1L55 A;  1GE0 A;  2BQO A;  210L A;  5IDD A;  232L A;  1MEL L;  5LYT A;  3AGG G;  3TXD A;  1JJ3 A;  1C67 A;  2MED A;  4B4E A;  1GFA A;  2RH1 A;  4N5R A;  3HBE X;  1ZUR A;  1GD6 A;  1WTH A;  1QUD A;  3C81 A;  3OE0 A;  2HEF A;  5I4W A;  4RW1 A;  1I20 A;  3EBA B;  3A91 A;  1P37 A;  4N9R A;  1C6C A;  1FN5 A;  3P65 A;  3AB6 A;  3D3D A;  5F9U A;  4DYG A;  1IR9 A;  2DQG Y;  2HUM A;  5KXW A;  1UIF A;  4II8 A;  3B6L A;  1NHB A;  2A7D A;  2W1X A;  3W6A A;  1L83 A;  1CKC A;  2LYZ A;  4X3B A;  1JKD A;  163L A;  9LYZ A;  4DDA A;  4DD7 A;  1IP4 A;  5B59 A;  1GDW A;  1CNS A;  2XJW A;  188L A;  2BQB A;  4LT3 A;  2AUB A;  1BB4 A;  4LYC A;  2CGI A;  5FCP A;  1UCO A;  2MEF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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