The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
|
| molecule tags |
Ribosome
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| total genus |
18
|
| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CME Q; 1VQO Q; 1VQP Q; 3CXC P; 1YJW Q; 1W2B P; 1N8R R; 1NJI R; 3CCE Q; 1KD1 R; 3CCJ Q; 1VQM Q; 1K73 R; 3OW2 P; 1KC8 R; 3CCV Q; 1K8A R; 1QVF P; 3CCL Q; 3I56 Q; 1YJ9 Q; 1Q81 R; 1VQK Q; 2OTJ Q; 2QEX Q; 1VQ4 Q; 2OTL Q; 1VQN Q; 3CCU Q; 1YI2 Q; 1YIJ Q; 1M90 R; 1VQ9 Q; 3CMA Q; 1YJN Q; 1Q82 R; 1KQS P; 1K9M R; 3CC4 Q; 1JJ2 P; 3CCQ Q; 1Q86 R; 3CCM Q; 1YIT Q; 1VQ6 Q; 1VQL Q; 1YHQ Q; 3CD6 Q; 1VQ5 Q; 1M1K R; 3CC7 Q; 3G6E Q; 3G71 Q; 1VQ7 Q; 3CCS Q; 3I55 Q; 3CCR Q; 1S72 Q; 3CC2 Q; 3CPW P; 1Q7Y R; 1QVG P; 2QA4 Q; 3G4S Q; 1VQ8 Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M77 F; 2KK4 A; 4EMG A; 1Y0M A; 3OW2 S; 4RTY A; 3JB9 D; 1QVF S; 2CP3 A; 4X9C A; 4OGE A; 2NYS A; 2QGF B; 2M9U A; 4F7U A; 4J83 A; 1OX9 A; 3SWN C; 2EIF A; 3J7A F; 3J80 E; 2ZPI B; 3H0H A; 1Q7Y C; 4C5G A; 3J81 E; 4IIO A; 1IZ6 A; 2KYM A; 3JCM X; 1WQ7 A; 3OW2 P; 2DMO A; 3RDV A; 3EG3 A; 2GNC A; 1RAE B; 1VQL A; 4DOW A; 3TSZ A; 1K9M C; 2YLC A; 2QQA A; 1KHI A; 1RI9 A; 2RI3 A; 4M78 G; 2RJC A; 4M7A B; 1K9A A; 4C92 C; 1VQ5 Q; 5DM7 R; 4FIB A; 2HBP A; 3MP8 A; 2E4H A; 4RG8 A; 3WXM B; 4C8Q C; 3EHR A; 4OMN A; 3CCV A; 1VQ6 T; 4ZGE B; 5GAN 8; 4R55 A; 1M3C A; 4EDU A; 3EG9 B; 2K2V A; 5DY9 A; 5GAO r; 1KQS S; 2ZPB B; 1G3Y A; 2NUP A; 3CCQ Q; 1PNJ A; 1RAG B; 1YJN A; 3MPU B; 3P8B B; 4IUT A; 5GAN j; 4J6Y A; 2GBQ A; 3CCE A; 4N0A A; 3HP9 A; 3QG1 A; 5D6X A; 3SEM A; 1AZG B; 1PWT A; 2FPF A; 5FWC A; 5J26 A; 1YI2 A; 2KSS A; 5CVI A; 1Q95 G; 2CZ0 B; 3C0C A; 2DL5 A; 4J7F A; 4A4F A; 2DYI A; 1BKB A; 3VS1 A; 1VQP T; 5LJ3 g; 4BE1 A; 1N27 A; 1M4Z A; 4C92 F; 2XG8 D; 2MI6 A; 3ME9 A; 3PIP A; 1KQS P; 4C8Q F; 4C0Z A; 3MCA B; 2L5Q A; 2GQI A; 2E70 A; 2CSQ A; 4M78 C; 2DEU A; 2HKN A; 4FYX B; 3TQ7 P; 4PJN A; 1QVG P; 2HL5 C; 2I0N A; 2O9S A; 4KUL A; 4LN2 A; 1NJI R; 4PJO A; 2GF7 A; 3M0R A; 1NE8 A; 1U3O A; 2D0Q B; 5FU6 B; 2RQU A; 3I55 A; 2QDL A; 4JS4 A; 1VQK T; 1BBZ A; 2LMJ A; 2YUN A; 1B3Q A; 4PFO A; 1VQ9 T; 3MEU A; 4PK4 A; 1QKX A; 2NUT A; 4M7D B; 1HYO A; 5KYU A; 3LGL A; 3EG2 A; 2EYY A; 2HNI A; 2ROL A; 2MCN A; 3AT1 B; 1JBM A; 2Y4X A; 2PZ1 A; 4Y28 E; 4DOV A; 3CPW A; 4M78 F; 4M75 D; 2H3J A; 1I81 A; 1SG5 A; 1VQO A; 2CP2 A; 1QWF A; 1UEC A; 1MMG A; 3CXC S; 1VQ8 Q; 5LJ3 e; 4X1V A; 2VV5 A; 2EYQ A; 4IUV A; 5IH2 A; 1KK7 A; 4YTL A; 3I56 Q; 1X43 A; 4LDW A; 1VQN Q; 2ROT A; 2DRM A; 1YIJ Q; 1U1T A; 4FW1 A; 1K4U S; 3CCM Q; 2VGN A; 1WHG A; 1WNL A; 3OB9 A; 1BB9 A; 2DIQ A; 3CC7 Q; 1RAA B; 1MMA A; 4RTZ A; 3M0U A; 1EX4 A; 2ABL A; 3CEY A; 1JEG A; 2V1R A; 2XK0 A; 4K11 A; 3CXC P; 5KYN A; 2HKQ B; 4JDS A; 2WSE E; 1KC8 C; 4LD6 A; 4M7A A; 1V29 B; 1RAD B; 2EKO A; 5I21 A; 2CZ1 B; 1YJ9 Q; 2OTL Q; 1OEB A; 3A8G B; 2RO0 A; 3UAT A; 3DB4 A; 3EG9 A; 3RMS A; 1GCQ A; 3KFV A; 2ZPE B; 1ABO A; 3WVD B; 4OF1 A; 2PVO B; 1I8F A; 2KGT A; 2GTO A; 4BD3 A; 3JAM E; 4HVW A; 1AD5 A; 2OI3 A; 3SFM A; 2EVR A; 4QVZ A; 1BYM A; 2JM8 A; 1VQ6 A; 5IXB A; 1M27 C; 3I5S A; 2V8K A; 1M2V B; 5IN1 A; 3MO8 A; 4KT0 E; 4N4G A; 3VRZ A; 3X26 B; 5KE3 A; 4CC2 A; 3OYN A; 4AFZ C; 1AWJ A; 2X4J A; 3HFN A; 4HCC A; 3TU4 K; 3OA6 A; 2LP5 A; 3VU3 C; 3REB B; 1OU9 A; 1R77 A; 1BI0 A; 1K1Z A; 1RAH B; 5GAM f; 2DER A; 1VYU A; 3C12 A; 1M2O A; 1SHF A; 2I2L A; 2Y90 A; 2CGH A; 2ZPF B; 2CT4 A; 1XQH A; 2KYB A; 4J6X A; 2F5K A; 1R8O B; 3OYH A; 4E7Z A; 2JTF A; 1FYN A; 2MIO A; 1JJ2 A; 2DLP A; 3M9Q A; 4DQ2 A; 1NJI U; 4HVU A; 4X34 A; 2R5M A; 4BI8 B; 1UDL A; 3CCJ T; 3CCR A; 4M7D A; 2V1Q A; 3NMZ C; 2BZX A; 2W10 A; 4Y92 A; 1W70 A; 1QLY A; 3V7C A; 1VQ7 Q; 2L3R A; 3EHQ A; 4J9I A; 4MZP A; 1IGU A; 3S3M A; 1LCK A; 3M4G A; 5GAM j; 1VQK A; 4OMF B; 1G3W A; 2RHZ A; 3OYD A; 1VQ9 A; 1M3A A; 2EQK A; 3R6N A; 5GMK m; 1CKB A; 4MZT A; 5FU7 C; 5GAN g; 4RUG A; 1RI0 A; 2FEI A; 1UHC A; 1BIB A; 1WHH A; 1G2B A; 1ZA1 B; 2JVV A; 1PCX A; 2X35 A; 1X6G A; 3R6O A; 5FRN A; 1Q7Y R; 2DIL A; 2EW3 A; 3M55 A; 2J05 A; 2PUK B; 2CH4 W; 1NPP A; 2J6F A; 2D9T A; 3JCM d; 1V1C A; 4JS5 A; 3RR6 A; 2HSP A; 2EQI A; 1VQL Q; 2KT8 A; 2M0O A; 5CKE A; 5GAN 2; 4J9H A; 2RK1 A; 3H0F A; 1GCP A; 4JRK A; 1VIF A; 2LT4 A; 3BE3 A; 2QAZ A; 1H3Z A; 2F5T X; 4NS5 A; 4E47 A; 1VYV A; 3INZ A; 2X4Y A; 2H8H A; 1VUB A; 2FYK A; 2KRN A; 5LJ5 f; 1M2V A; 1MMN A; 5FLX E; 1NJI C; 1T0H A; 2VXF A; 3CCE Q; 2P0Q A; 4OML A; 2ZPG B; 2EAY A; 3U23 A; 3A8M B; 1M1F A; 1YHQ A; 2RJD A; 1YI2 Q; 2DAQ A; 3CC2 A; 1B34 B; 3UPU A; 2DXT A; 2X51 A; 1WHM A; 2E6N A; 2E3I A; 1O9S A; 1SF9 A; 1XJW B; 2RNA A; 4QQD A; 3RBB B; 3DLM A; 1IHW A; 2K5L A; 3G6E T; 1VIE A; 2D0N A; 4XQ3 A; 3VUZ A; 4BE0 A; 1QP3 A; 3GLX A; 1M8M A; 2CZ7 B; 5LJ5 j; 1UGQ B; 2HZY A; 3OS1 A; 4B9W A; 4CC4 B; 3OYF A; 3RIR A; 3QZ5 B; 5CKF A; 3LWI A; 2GFA A; 3I55 Q; 4QVC A; 4FYW B; 2ENM A; 2E12 A; 1GCQ C; 1OU8 A; 1W1F A; 4ZTF A; 1D1A A; 4LDX A; 2VUB A; 1PG5 B; 2DE0 X; 1D0X A; 3UA7 A; 1WJQ A; 2Z0W A; 2RMO A; 1UUE A; 3EGX A; 2CSI A; 1YIT A; 1SKU B; 2ZPH B; 2A0F B; 2LRQ A; 1ZBX A; 2DTO A; 2XDB A; 3CCL T; 5GMK h; 5CKH A; 1TUD A; 4BAC A; 5EC7 A; 5AYF A; 2Y4Y A; 3MHX A; 2ZAE A; 1WA7 A; 3PIO A; 4C5I A; 1VQO Q; 5J3B A; 5KCO A; 1GBR A; 4C0D B; 2B86 A; 1ZSZ C; 5I2S A; 1M5Q 1; 1Y07 A; 3PE0 A; 2E5Q A; 1GFC A; 3RKX A; 1OZ2 A; 3G1J A; 3ZEH A; 1ZLM A; 3ASK A; 2XKO C; 3OS5 A; 1WGS A; 1GL5 A; 3KXT A; 3JB9 J; 2R58 A; 1QCO A; 3CMA T; 3KBG A; 1OYX A; 1M3B A; 4ZN3 A; 4EMK B; 1U8R A; 1Q7Y U; 4MDX A; 3JCM b; 4XU2 A; 2ECZ A; 2O31 A; 3ZL7 C; 1KC8 R; 1N9R A; 3OYK A; 3HSB A; 1VQ4 Q; 1TU0 B; 2LX9 A; 1X01 A; 1CKA A; 1OV3 A; 2MK5 A; 5GMK e; 3D7S B; 1I07 A; 5KYX B; 1TUC A; 2L3P A; 2PTK A; 3QYG B; 1NYF A; 2X3X D; 3I9Q A; 1GFD A; 1NEG A; 4ELY C; 2EYX A; 3N5B B; 5GAM g; 2AIR B; 3L2W A; 2QXF A; 3GF5 A; 4N4I A; 1PD1 A; 3EGU A; 5D6W A; 3UA6 A; 5M9O A; 3VS7 A; 3QDF A; 3CPF A; 1NEB A; 2KAF A; 4O5V A; 3GNG A; 4OMQ A; 1N5Z A; 4ORZ A; 3FJ5 A; 2C0I A; 1B34 A; 3VYG A; 2O9V A; 1IHV A; 4M77 E; 2QA4 T; 2SEM A; 1UJ0 A; 2A28 A; 4PJM A; 4PFP A; 3RKY A; 2RI2 A; 3REA B; 1WXB A; 2GTJ A; 4C92 G; 3OYC A; 4C8Q G; 4QQG A; 3OW2 A; 5GJV B; 4M7D D; 1QVF A; 2ED0 A; 3OYA A; 4LUD A; 1W2B S; 5IT9 E; 1VYT A; 4JUV A; 2CT3 A; 3EG0 A; 1AWW A; 3CME T; 4V2S A; 3G6E A; 1K0X A; 2XHC A; 2YT6 A; 2E65 A; 2MWP A; 4DBQ A; 3CD6 Q; 3CCR Q; 4XU1 A; 2V8J A; 4KGX B; 2RQV A; 2VKN A; 2EBP A; 4AG2 C; 3OYI A; 1W2B P; 4BY6 C; 5GAM e; 2EGA A; 1SRM A; 1K73 R; 5L23 A; 1Y96 B; 3H6Z A; 1K8A R; 2QG9 B; 5GAN f; 3SB2 A; 4M77 D; 4EMH A; 1YJW T; 2DIG A; 2JMA A; 1GBQ A; 4HXJ A; 2HBW A; 2C0T A; 3QHS A; 2P4R A; 1X2K A; 2KR3 A; 2GFU A; 5CK9 A; 4FYV B; 5FRO A; 5GAO m; 3CCL A; 1YN8 A; 1AEY A; 3G71 T; 2H3E B; 2DL4 A; 2QGG A; 1KQS A; 4Z8A A; 4VUB A; 3OQ5 A; 2D6F A; 4XAX B; 1D0Z A; 2YLB A; 2FZC B; 3OBY A; 2F1L A; 4EMK A; 1ARK A; 2KXD A; 1RLP C; 5KE2 A; 4KRT A; 4NL2 A; 4C92 E; 5CIU A; 2O88 A; 4C8Q E; 3M53 A; 1QVG S; 1QKW A; 5KYW B; 1BI3 A; 5LJ5 g; 2SRC A; 3CMA A; 1VQM Q; 2DTI A; 4RTU A; 5KYX A; 2CZ6 B; 1KC8 U; 3QSU A; 3T9N A; 4M75 C; 3FEO A; 1M1K C; 3IQL A; 1DJ7 B; 1EZZ B; 5LJ3 h; 4RCB A; 1ACM B; 3URG A; 3S3N A; 4JJB A; 1CSK A; 3PNW C; 1S72 T; 2HD0 A; 4LUE A; 2G3R A; 2O4X B; 3EFO B; 1NLP C; 2COW A; 2IIM A; 2QQS A; 3CC4 Q; 1E7O A; 4JZ3 A; 1IB8 A; 2P0P A; 4JRI A; 2EQU A; 3G4S A; 1YHQ Q; 1U06 A; 2F2V A; 3FLG A; 4M78 E; 4C92 D; 3CCS Q; 2AKK A; 3CC2 Q; 4RTT A; 3QDR B; 3LX7 A; 4XTY A; 3NHN A; 3KUF A; 2OAU A; 2COZ A; 4ZTJ A; 3PTA A; 2K3Y A; 5GAO p; 4M75 F; 3JCM V; 3OBW A; 2OTJ Q; 3LLR A; 2K2M A; 1NM7 A; 2JNG A; 3BDU A; 5A0G A; 3CXC A; 2M16 A; 1ZA2 B; 3GIB A; 4QW2 A; 5CR2 A; 2L3S A; 4NL3 A; 2RN8 A; 3O8V A; 1VQ5 T; 3VV0 A; 1XTD A; 4OP0 A; 1ZQ1 A; 4GLK A; 3JCM f; 1MND A; 3S3O A; 4AFS C; 5C6S A; 1OI1 A; 1D09 B; 1M90 R; 4M77 B; 5GAN 6; 1YIT Q; 1SRL A; 1Y96 A; 3CME A; 3M5A A; 2YUQ A; 1ZBJ A; 4M78 D; 4OMO A; 3CCQ T; 3WVE B; 1IRX A; 4KH1 B; 4XU0 A; 1C6V X; 5KYY B; 1G3T A; 2DEQ A; 3M58 A; 3V7R A; 3O5Z A; 4PFZ A; 2E10 A; 1WX6 A; 5A2Q E; 1UTI A; 5CAI A; 1K73 U; 4FSS A; 1K8A U; 1GRI A; 4ZGJ B; 1X6O A; 4XU3 A; 1UFF A; 2X9H A; 2DKG A; 1QW1 A; 3VKI A; 3CPW P; 1OUL A; 5C0M A; 3M4Y A; 2K6D A; 2HL3 A; 5I11 A; 1AWO A; 1QMC A; 3PVL A; 2F2X A; 4R0K A; 5CQY A; 1FWZ A; 2AKL A; 3G71 A; 5KYW A; 2K7A A; 1TXQ A; 4IUR A; 5HK0 A; 3G7Z A; 3OS2 A; 2CYZ B; 1MV3 A; 1WHJ A; 1NLO C; 2WSC E; 3SWN B; 4OB2 B; 5GAN 5; 2JZ2 A; 4BDY A; 4RKU E; 4AT1 B; 4Z88 A; 1H64 1; 3PFS A; 2JXB A; 2KY9 A; 4M4Z A; 1M1G A; 1WI7 A; 3QJY A; 4IUQ A; 3GOX A; 2HDA A; 1VQP A; 4RTW A; 2O4X A; 3X28 B; 2ZGW A; 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3QZ9 B; 1UB4 A; 1YJN Q; 5GAN e; 1M8V A; 4PJO F; 2KNB B; 3S6W A; 4LDY A; 3SWN A; 4EPC A; 4AFU C; 5KCH A; 4LDV A; 4BI4 A; 3QJ6 A; 2DM1 A; 1M1K R; 1H8K A; 1AHJ B; 3FDR A; 4C5E A; 4E7K A; 2CP6 A; 2RH2 A; 3E9F A; 1UJY A; 1WYX A; 1KQ1 A; 2MPX C; 2QDY B; 1YBY A; 3VUB A; 3HTR A; 4C92 A; 4M7A C; 2HAX A; 4Q5W A; 5IHK A; 2YUO A; 1PC0 A; 2K4Y A; 2FZK B; 3UF4 A; 3P8D A; 5CO7 A; 5HK3 A; 4OMM A; 1VA7 A; 3JB9 I; 4JLI A; 4JZ4 A; 2BIV A; 3G4S Q; 2MYS A; 3M57 A; 2PNI A; 3FB9 A; 1U5S A; 2EJ9 A; 3AHU A; 4E7H A; 3JCM g; 2MWO A; 4XTV A; 4FW2 A; 1WLP B; 2D1X A; 1M90 C; 1HD3 A; 4B9X A; 3A8L B; 4JJN K; 3JCM Q; 3HRS A; 1VQ8 A; 2RHU A; 3QBY A; 3CCJ A; 2L8D A; 1P92 A; 4PJJ A; 2QTV A; 1VQL T; 2QQR A; 2AHJ B; 1KD1 R; 1RAI B; 3PMI A; 4M7A F; 2NWM A; 4J9C A; 3QWX X; 5GMK i; 4M78 A; 1FMW A; 1NBE B; 2M1H A; 2BUD A; 2E64 A; 2DD4 A; 2XIC A; 2JN0 A; 1C1A A; 4ANJ A; 1YJ9 A; 2DZ9 A; 1PKT A; 2E3H A; 4TVR A; 3CME Q; 2OTL A; 2QK0 A; 2K57 A; 4J9B A; 3V7S A; 5DLQ E; 5FU6 C; 3VYH B; 4B6M A; 2AZS A; 1N8R U; 3OYL A; 4XTX A; 3CCE T; 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