The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Ribosome
|
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| total genus |
18
|
| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VQ7 Q; 1VQO Q; 3CCV Q; 3CD6 Q; 3CCM Q; 3CCS Q; 1QVF P; 1YI2 Q; 1K73 R; 1KD1 R; 1Q7Y R; 1K8A R; 1VQP Q; 2OTL Q; 1VQN Q; 1JJ2 P; 3CME Q; 1K9M R; 2QEX Q; 3G71 Q; 3CC2 Q; 1VQ6 Q; 1KC8 R; 1VQL Q; 1YJW Q; 3OW2 P; 3CCJ Q; 1VQ8 Q; 1Q81 R; 3CCL Q; 1YJN Q; 1VQ9 Q; 3G4S Q; 3I55 Q; 1QVG P; 1VQ4 Q; 3CCR Q; 1VQM Q; 1Q86 R; 3CCQ Q; 1N8R R; 3I56 Q; 2QA4 Q; 1YHQ Q; 3G6E Q; 3CPW P; 1YIJ Q; 1W2B P; 3CC4 Q; 1Q82 R; 1NJI R; 1VQK Q; 3CCE Q; 3CMA Q; 1VQ5 Q; 3CC7 Q; 1YJ9 Q; 3CXC P; 1S72 Q; 1M1K R; 1YIT Q; 1KQS P; 1M90 R; 3CCU Q; 2OTJ Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ZPI B; 4CC3 A; 4DBF A; 3OYY A; 4EMH A; 5GAN j; 2KXD A; 1WXU A; 4A53 A; 2EBP A; 2RH2 A; 1G3S A; 3REB B; 3I55 Q; 3JB9 I; 2K57 A; 5GMK h; 1ZLM A; 1Y57 A; 3CCS A; 4E7H A; 2CT4 A; 1V1C A; 4JJC A; 3WVD B; 3KUF A; 2ED1 A; 2LJ0 A; 2RHY A; 1WHG A; 1ZQ1 A; 5HKC A; 1JJ2 P; 2E12 A; 1WZO A; 2CP0 A; 5CQX A; 4M77 E; 2MWO A; 1X43 A; 2SEM A; 2DYB A; 3CME T; 1OEB A; 2XG8 D; 4X1V A; 4BI8 B; 1YHQ T; 1UTI A; 3EG3 A; 1K8A R; 2E64 A; 5HCK A; 2VXF A; 3U23 A; 2IPO B; 2QQB A; 4EIK A; 5GAM g; 3EGX B; 2ROL A; 5I2M A; 5FRO A; 5LJ3 j; 4Y92 A; 1W2B S; 4JLG A; 2DLP A; 4AG2 C; 2YXY A; 4LUD A; 2HEQ A; 3LLR A; 1AT1 B; 4OML A; 3C94 A; 2DM1 A; 4B6M A; 2R58 A; 3CC7 T; 4GBQ A; 1M4Z A; 4UC4 A; 4E47 A; 2VGN A; 5CR2 A; 2QK0 A; 4M78 E; 3L2Q A; 2DD4 A; 1M1K U; 1W6X A; 4R56 A; 2SRC A; 1AOJ A; 3FJP A; 1VQ5 Q; 4N4H A; 2VGM A; 1PSE A; 3PMI A; 2CGH A; 1M1K C; 5IT9 E; 3CD6 Q; 5FU7 C; 3DB4 A; 4LNP A; 5CKD A; 4E7L A; 3FIF A; 1VQN Q; 1MMG A; 1B3Q A; 1NJI U; 1WPY A; 2DET A; 4C92 E; 3CCL Q; 1W70 A; 2WAC A; 3CBP A; 3CCU A; 1WQ7 A; 1QVG P; 5EC7 A; 1QKX A; 2A36 A; 2E1H A; 4J8O A; 3A8G B; 4J6Y A; 3VJP A; 1KQS S; 3R6N A; 3RBB B; 2KRN A; 4FL6 A; 3QWX X; 3L2U A; 4HVV A; 5KE3 A; 3HL8 A; 1N27 A; 3OYE A; 3OW2 A; 4KRT A; 5LJ5 g; 2OTJ T; 3VUZ A; 2EGC A; 2CP6 A; 1JXO A; 4OMO A; 1NG2 A; 1Q82 U; 1VQ8 Q; 1LPL A; 4J6X A; 2QGF B; 4BDZ A; 2OTL T; 3JCM b; 1H64 1; 4XTV A; 2LC4 A; 1NM7 A; 3X26 B; 3J80 E; 1WI7 A; 1X6G A; 3EFO A; 3QXE B; 5LJ5 e; 4M7D G; 5GAN 7; 2HAX A; 5KYU B; 3R6O A; 3PT9 A; 2K3X A; 3VUB A; 4M7D A; 2FZK B; 2EJG A; 3EAE A; 2V26 A; 1M30 A; 1UGP B; 2E41 A; 3M0Q A; 2X4X A; 1Q86 R; 2FL7 A; 1UGR B; 4L59 A; 2HKQ B; 1GBQ A; 5CKH A; 2EAY A; 1YCY A; 1RAH B; 3CME A; 8AT1 B; 5C6S A; 3M57 A; 4KT0 E; 1VQ8 A; 3G6E T; 3JCM d; 4FCY A; 3JB9 F; 2CSQ A; 4FW2 A; 1C6V X; 2L3P A; 4C0D B; 2QGG A; 5I2S A; 2LCL A; 4FYV B; 3X20 B; 4DOW A; 1GRI A; 4Y28 E; 2GTJ A; 2KBT A; 2K7A A; 3VYG A; 2XDD A; 1OOT A; 2HSP A; 1N6A A; 3EG1 A; 3VS3 A; 1VQ4 T; 1ZHI A; 2XKO C; 2BUD A; 3E1S A; 3CC4 T; 2VXE A; 5LJ3 g; 3SWN C; 3KFV A; 5GAN f; 2CP2 A; 2F5T X; 3SWN A; 1GFD A; 2KAF A; 3CC7 A; 2K9G A; 1I4K 1; 2GGR A; 4ME7 A; 1UUE A; 3BE3 A; 1KFZ A; 1FWZ A; 5C0M A; 2FRW A; 2YSQ A; 1M2V B; 3KBG A; 2O9S A; 2BE9 B; 3GOX A; 1UDL A; 1Q7Y U; 3CCV Q; 4FT2 A; 3X25 B; 5HY6 A; 4ZGD B; 3QJY A; 4JLI A; 4ZNX A; 2MWP A; 3LYI A; 1FMK A; 3WVE B; 4M4Z A; 2JW4 A; 2DTO A; 1Q7Y C; 2E65 A; 5FWB A; 1M1G A; 2BZ8 A; 4C5H A; 3H9N A; 3PIP A; 1RAE B; 1G2B A; 3OS2 A; 3HFN A; 2P0P A; 4MZT A; 4PJN A; 1VYT A; 2IG0 A; 3CCR T; 2DXC A; 1TUC A; 3EFR A; 2QA4 A; 2EGA A; 2RHZ A; 1ZUK A; 2EQM A; 3CMA A; 2RNA A; 1OX8 A; 2RI5 A; 2VAS A; 4E6R A; 3AHU A; 1KC8 C; 5J26 A; 4FM4 B; 4HCZ A; 5GMK l; 3RKX A; 1JRI A; 3TEE A; 1OX9 A; 2P0Q A; 1I81 A; 4AFZ C; 4J9C A; 4GY5 A; 4KGV B; 5CVI A; 1NLP C; 1A0N B; 4TVR A; 4FU6 A; 2M0O A; 1XQH A; 1M9S A; 4OMN A; 4ESR A; 1U8R A; 2OX7 A; 3A1P A; 3QDF A; 2XMF A; 1VQP T; 3J7A F; 1WHM A; 4A54 A; 2IVW A; 1GCP A; 2LQ8 A; 2OAW A; 4C92 D; 1YIT Q; 4A4F A; 1C0M A; 3NPF A; 5GMK e; 4JRP A; 3I35 A; 2KVQ G; 1CSK A; 1AHJ B; 1QVP A; 1IB8 A; 2LRQ A; 4AMC A; 1D1B A; 3G6E A; 1TXQ A; 3JAM E; 1TSF A; 1VQO T; 3QO3 A; 2YHT A; 1W2B A; 3OSS C; 5J3B A; 4ELY C; 2A3L A; 2DZ9 A; 1VQ6 T; 3CCJ T; 4A4K A; 3VS7 A; 3LX7 A; 4DBH A; 2AK5 A; 2F2X A; 5KYW A; 2VB6 A; 2DO3 A; 1KD1 R; 2L3Q A; 2QDY B; 1M27 C; 3CC4 A; 3JCM c; 4ZGJ B; 1R0C B; 3BW1 A; 3HFO A; 4ZN3 A; 5IHK A; 1FMV A; 2JOY A; 4F7U G; 3S3O A; 2HBP A; 3RNJ A; 3P8D A; 5CKE A; 3CXC S; 3PIO A; 1B34 B; 2E6N A; 3CCQ T; 3F70 A; 1OZ2 A; 4F7U A; 2KXC A; 2KR3 A; 4JPB W; 1RAD B; 2DVE A; 2I2L A; 3CCM Q; 1UGS B; 2J05 A; 2KEA A; 4IUR A; 1BI0 A; 2XDP A; 3A8O B; 5LJ5 d; 1YJW Q; 2DBK A; 1G3W A; 1QWF A; 4IIM A; 4OMF B; 4AG1 C; 2D8H A; 3RES A; 4PNO A; 1MV0 B; 4PJO B; 1YIJ Q; 1T0J A; 1KQS A; 2LQK A; 2J7I A; 3DKM A; 3OS0 A; 4RKU E; 2A28 A; 1UG1 A; 2EKH A; 1ZUY A; 4FT4 A; 1ZSZ C; 3C0C A; 4A4E A; 2EQJ A; 1ZSZ A; 3CCR A; 4QKU A; 1S72 T; 2LDM A; 4NL3 A; 4QQD A; 4XU1 A; 1OPL A; 1RAF B; 4LDV A; 3OMC A; 1VOM A; 4RTW A; 1K73 C; 4XQ3 A; 2EJ9 A; 1VQ9 Q; 3FC3 A; 3I9Q A; 3CCM A; 2I0N A; 2ZPE B; 1LOJ A; 2AZV A; 4LUE A; 1QP3 A; 4ZGE B; 1RI0 A; 2DRM A; 4BDY A; 1E6H A; 1MHN A; 2ROT A; 1BI2 A; 4CRI A; 2BZX A; 4A4G A; 1YIJ A; 1Y96 B; 3I56 A; 2EQK A; 3SEM A; 1N9R A; 4FYW B; 4A4H A; 2C0O A; 2LNV A; 3JSC A; 3TCJ A; 2V1R A; 1KK7 A; 2RI2 A; 4RTY A; 5GAN h; 4KGX B; 2RO0 A; 2EPD A; 4HKE A; 4NL2 A; 2M16 A; 2NUT A; 2JXB A; 3M56 A; 2ENM A; 1KHI A; 2NUP A; 3NTK A; 3FRN A; 4EMK C; 1B07 A; 3EG9 A; 4EMK A; 3CEY A; 2DER A; 2E5K A; 2QTX A; 2RJF A; 4Z88 A; 4PJO F; 4XU2 A; 4JJB A; 3FB9 A; 5GAO l; 1VQK Q; 2J6F A; 2ABL A; 1X2Q A; 4M77 C; 4IUQ A; 5GAN 2; 4M78 F; 1KSW A; 2PQW A; 3I55 T; 3OYL A; 1NZ9 A; 5GAM j; 3CCJ A; 2MK5 A; 3BY7 A; 5A0G A; 5FU6 C; 1WYX A; 2WSE E; 3G71 Q; 2F69 A; 2R57 A; 1GBR A; 1K0X A; 1M3B A; 5CCA A; 2QTV A; 2XK0 A; 1M90 U; 4HVU A; 3MKD A; 1UFF A; 2WSF E; 4C0Z A; 1VQ7 Q; 2DL4 A; 3JCM g; 4OGC A; 2G6F X; 3G1J A; 1M90 C; 2DYI A; 3CCQ A; 2DAQ A; 1VQK A; 1N8R U; 2KDS A; 3RKW A; 5LJ3 h; 2E10 A; 4Z02 A; 1IRX A; 2AKK A; 1Y71 A; 3JCM W; 3CPW P; 1WJR A; 4C8Q F; 1GFC A; 1TWB A; 3VKI A; 3MEW A; 3G71 A; 2KE9 A; 3ZL7 C; 1K0S A; 1X6B A; 2RJE A; 1ZBX A; 2FZC B; 4XU3 A; 1OUL A; 4C0G A; 3FJ5 A; 2PUO B; 1D0Z A; 4FSX A; 4V2S A; 4N0A C; 1D09 B; 4XTY A; 3NTH A; 4N0A A; 3M4Y A; 2HL3 A; 3CCU T; 1MMD A; 5KYN A; 1VQ7 A; 1XNI A; 3MJX A; 1N8R R; 4C92 G; 3EGD A; 2VVK A; 4L6V 5; 3M53 A; 4CI0 C; 3OS5 A; 5LJ5 j; 4C92 C; 1K9A A; 2PVO B; 3L2W A; 4C92 A; 3SDZ A; 2MYS A; 2PTK A; 4MML A; 1QVF S; 1SPK A; 5IH2 A; 1QCF A; 4PLI A; 2EQI A; 3CCE A; 5CIU A; 4II1 A; 3V8K A; 2MPX C; 2RI3 A; 2DBM A; 3CD6 T; 2XI9 A; 1SRL A; 3UA6 A; 1VQM Q; 2VC8 A; 1SHG A; 3VS1 A; 2MI6 A; 5IAY A; 3M54 A; 2DK3 A; 4QT7 A; 1YJ9 Q; 1BCO A; 4JRQ A; 4D6W A; 1I1J A; 1X01 A; 1K8A U; 1F1B B; 1SF9 A; 1D1C A; 1KHC A; 2G3R A; 2PVG B; 4QVC A; 1QLY A; 2VYT A; 2X3X D; 4P5N A; 1K8A C; 2JS0 A; 3EFS A; 1YJN Q; 2GTO A; 3E19 A; 7AT1 B; 3SFM A; 1OQK A; 3E9G A; 4QW2 A; 4N4I A; 1VQ8 T; 1MUZ A; 3SD4 A; 4KUD K; 3ZBD A; 1OI1 A; 3QZ5 B; 1AVZ C; 2DA9 A; 4KBM B; 3I55 A; 1VQM A; 1N9S A; 4M7D B; 4O5V A; 5FWC A; 3TSZ A; 3LWI A; 5KYX A; 2YUQ A; 2XDB A; 3BDU A; 4LD6 A; 1WHH A; 5GAN 3; 1BBZ A; 3CXC A; 4ZN1 A; 1MV3 A; 2K5F A; 2GNC A; 3ASK A; 2COW A; 1WQW A; 3NFC A; 3LH5 A; 3V7C A; 3OBY A; 4PJO E; 4F17 A; 2VWF A; 3MO8 A; 3TSW A; 1QKW A; 5KYY A; 4FYX B; 3OSV A; 4J9H A; 2DFU A; 2NLU A; 4FIB A; 5GAO q; 3LGF A; 2X51 A; 3H0H A; 3PVQ A; 3ME9 A; 5LL6 S; 3SWN B; 1V29 B; 3AT1 B; 4HT9 A; 2EIF A; 3VS6 A; 4EMG A; 4M75 B; 3JCM J; 3JB9 H; 4Y91 A; 2KYB A; 3L2V A; 1LNX A; 1BIB A; 5KCH A; 3JB9 J; 5A0D A; 3GPL A; 1NJI C; 1M3C A; 2QA4 T; 2AKL A; 4LDY A; 4M7D F; 5GAM f; 1PHT A; 4OB0 B; 3DB3 A; 1H92 A; 2C06 A; 3CMA T; 1Q95 G; 1VQ5 A; 1Q86 U; 4C8Q E; 2BTT A; 2MIO A; 3ZFJ A; 4EDU A; 2F5K A; 2K2M A; 3P8H A; 2LP5 A; 1AZE A; 3BFM A; 3CD6 A; 1LJO A; 3OYC A; 2KI7 A; 4LN2 A; 1I5L A; 1VQN A; 2RN8 A; 3CQT A; 1Q82 C; 2YDL A; 3OMG A; 2NWM A; 3E2U A; 4DQ2 A; 3CCL A; 3MEU A; 3INZ A; 4QVZ A; 4JDS A; 2L3S A; 1X75 C; 1JXM A; 4IIO A; 1VQL Q; 4F14 A; 2LTO A; 2CS7 A; 2DJZ A; 1AWO A; 5DY9 A; 1AZG B; 2LX9 A; 1LVK A; 1R77 A; 2EYW A; 5GJV B; 2QQA A; 2EYY A; 4GLK A; 2PZ1 A; 1PKT A; 3A5Z B; 1U5S A; 4BE0 A; 1YI2 Q; 2LT4 A; 2LCS A; 2RJC A; 1TTH B; 2CRE A; 2DKG A; 1BIA A; 3JCM Q; 4RUG A; 4M75 F; 4LXC A; 3RIR A; 4DBQ A; 2DEU A; 1M8V A; 3VV0 A; 4ATO A; 1H8K A; 2ED0 A; 5I11 A; 1EX4 A; 5LJ5 f; 1AD5 A; 4RG8 A; 4JJD A; 2KT1 A; 4JJN K; 4JZ4 A; 3C95 A; 3GP8 A; 1H3Z A; 1YIT T; 3TRE A; 4OB3 B; 1JJ2 S; 2HQE A; 1HJD A; 5FRM A; 2RPN A; 5CK9 A; 1Z9Q A; 1YP5 A; 4JRK A; 3OYH A; 4M77 D; 4PJL A; 5KYW B; 5FLX E; 3UAT A; 3JB9 G; 4XK8 E; 2JJ9 A; 1KJW A; 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2QQR A; 4PFO A; 4XAX B; 1Y07 A; 2R5M A; 2NUT B; 1VUB A; 2BKD N; 1M3A A; 5M9O A; 2E4H A; 3LW5 E; 4EMK B; 5DM7 R; 2QEX Q; 3OB9 A; 4Q5W A; 1T3L A; 1YIT A; 1CKA A; 2RJD A; 3M58 A; 3CBM A; 2EWN A; 5GAM h; 2K2V A; 1PRM C; 2RK1 A; 1NBE B; 4DBR A; 1PD1 A; 4B9W A; 2HL5 C; 2KT8 A; 4M7A B; 3M5A A; 1VQK T; 4M75 E; 2DL8 A; 5AT1 B; 1WFW A; 1ZUU A; 3GBQ A; 4XTU A; 2BIV A; 4OMM A; 5GAO p; 4HVW A; 2L5Q A; 3M9Q A; 4LDW A; 2ZPH B; 1QQJ A; 1VA7 A; 3M0R A; 3G71 T; 2KGT A; 3GNF B; 4KUI A; 2QEX A; 4E7K A; 2QXF A; 1GXI E; 3Q1J A; 3I5S A; 4AFQ C; 3QJ6 A; 5L8R E; 5IXB A; 5D7U A; 1RAG B; 5GAO r; 1K9M R; 2DZC A; 3RMQ A; 1VQ7 T; 2DIG A; 1T0H A; 2XIC A; 2KSS A; 2CP3 A; 2ECZ A; 5I21 A; 2W0Z A; 4OF1 A; 5GAN d; 4OMQ A; 4PK4 A; 1ZSG A; 3HPW A; 4C5G A; 1PRL C; 3QSU A; 2KRS A; 2O2O A; 1HXD A; 4OP0 A; 1FX7 A; 4WTO B; 3UF4 A; 3BDL A; 1YJW A; 5CO7 A; 2P4R A; 3NTI A; 4J9D A; 3CCE T; 2COY A; 3LWH A; 2FB7 A; 1WIE A; 1VQP Q; 4D8D A; 1RLQ C; 5D6W A; 2VV5 A; 2H3E B; 1NYG A; 2YRC A; 4F16 A; 5LJ5 h; 3H6Z A; 1ZA1 B; 1RL2 A; 1WHK A; 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