3CCLN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535c. density for anisomycin is visible but not included in model.
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cclN00
1JJ2M 3PIOL 5MLCQ 1YJ9N 1YI2N 2ZJQL 3CCJN 4WF9L 1W2BM 1S72N 4IOCL 1VQ6N 5GAHP 3CC4N 1KD1O 4WCEL 3CF5L 1YJNN 3CCSN 2QA4N 3I56N 5GAEP 1VQKN 5DM7L 1Q81O 1OVYA 3CCRN 1VQ8N 2QEXN 1KQSM 1QVGM 1KC8O 3CC2N 2OTLN 1YJWN 1VQLN 1QVFM 3CD6N 3DLLL 1VQMN 2OTJN 1K73O 3CPWM 1VQ4N 3CCMN 1N8RO 1M90O 3CMEN 4IO9L 5GAGP 1K8AO 3PIPL 4IOAL 3OW2M 3CCVN 1VQPN 4WFBL 3CCEN 1VQ7N 5JVGL 5H1SQ 1YIJN 1NJIO 3CCQN 3CCLN 1YHQN 1ILYA 5GADP 3J7ZO 1VQ5N 4WFAL 3CCUN 3CMAN 4WFNL 1YITN 2ZJPL 1VQNN 5JVHL 5HL7L 1Q82O 1VQ9N 1K9MO 4U67L 3CXCM 3I55N 2ZJRL 3G6EN 3G71N 3G4SN 5DM6L 1M1KO 1VQON 1Q7YO 1Q86O 4UY8O 3CC7N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JJ2M 3L6QA 3H08A 3BP8A 3WXKA 1NK7A 4XH5A 4AQYK 1ZBLA 3V81A 1SL2A 3VF2A 4IOCL 1NU0A 5ADXH 4A5AA 2HF4A 4FWKA 1ASWA 5AQPA 5AZJB 1RILA 3K0SA 2WBNA 4B3OA 1T8EA 3KD5E 3QNNA 3S3OA 2G8FA 1NGHA 1GLCG 3NH1A 5LJVA 3AVGA 3HRGA 5KPRA 3CCRN 1WBDA 5KPZA 2F4VK 1C0FA 3THWA 1KQSM 1XQSC 5HP1A 4RWTA 2IVPA 1KAZA 4CD1A 2Z1JA 5EXWA 2OTJN 1TUUA 1O13A 3THVA 3QICA 5HRPA 3O4QA 3SPZA 4CJ4A 1RNHA 3HTVA 1GLAG 4HCCA 1SZ2A 4H0TB 3NAEA 4DU3A 2BDPA 4LC9B 4CJUA 3T1AA 4DMNA 4FJKA 3DOLA 2P9UB 3THXA 2IOCA 4NYFA 4IOAL 4E3SA 2O4IA 1UA0A 1VSEA 4IFYA 1K8KA 1NNEA 1HNXK 4XH4A 4DU1A 4BC4A 2HNDA 1FJGK 2YV0X 4N47A 4A62A 1NJIO 1KTQA 3A5OC 2OZMA 4PY5A 2IIRA 3VQ4A 1RGIA 1GOAA 2D0BA 2D0PA 1YHQN 1KXPA 4NCAA 3C65A 3RMCA 4PUOA 2HHQA 1NLVA 4EZ6A 3FZFA 4BR5A 4CZEA 5I42A 3ULEA 2IC3A 4W5QA 3UB5A 2KZMA 3UKUA 4ID1A 3CM5A 3PSFA 1S6PA 3DI6A 4IWVA 5I9EB 3G25A 1W9HA 1MDUB 4KHSA 3OYFA 1UOCA 5HOOA 2Z1IA 4CJ5A 4L3QA 4JV5K 4B9UA 4DQSA 4J8FA 4QS9A 3WQTA 4KHPK 2QWQA 4F2RA 4F9OA 1ATNA 2I7NA 4FK4A 1Q8IA 5LJWA 1VQ6N 4H8KA 1X9JA 2ASOA 4H4MA 2X6NA 4H0XB 4H5VA 3VGKA 3D7EO 3ZSZA 3CCSN 4J2AA 4JAXA 1WUAA 1RBRA 3S3NA 1ITGA 4JEPA 4B1YB 3V6DA 2Q3SA 3AO2A 3SPYA 1Q18A 3TR8A 3OBYA 3SNNA 3LDSA 4N41A 4G9ZA 1E3MA 4YOTA 4F2SA 4Z4HA 3L2RA 4CEQA 2UYTA 1JL2A 4O4GA 1ZC6A 4CZLA 5EY4A 1CLQA 1E4FT 4PKGA 5FPNA 1YJWN 5AZJA 1J5OA 3HJFA 1EETA 4C1NK 4CZGA 3P83D 3TU5A 4MO5A 2HHWA 1LOTB 3OY9A 2DFFA 3WUHA 4CEAA 1SL0A 1EO1A 4DV0K 1VSDA 3EE9A 2WONA 4X65K 1RDBA 2VG6A 4CD3A 4JKAA 1XC9A 5J2QA 4H03B 1W97L 3CCEN 2RF2A 2E20A 3DM2A 3KD1E 2QKKA 3VETA 5CZ1A 4YOVA 5T7BA 4M3YA 3AGRA 3CJ7A 4AHRA 3AA2A 4DSKA 3K9JA 1OH8A 4B3RK 2Q1NA 3T19A 3VQEA 3HM8A 2P9UA 4BACA 1C6VA 2ITMA 4BRLA 2ZJPL 1HJOA 2E2PA 2VWJA 2NRTA 1I39A 4I2QA 1VK0A 4DV6K 1JCFA 3EN9A 4EFHA 4M7XA 4JS5A 1XHXA 3LP0A 3MAQA 2V52B 4FLVA 3LANA 2E6MA 1WSIA 2NRXA 1OH5A 2E2NA 4YOXA 4A61A 1QZ6A 5FRNA 2HOEA 4LF6K 2HBJA 3L4QA 4CGIA 2O8DB 4JKHA 4BREA 1SS6A 3AVMA 4K41A 2ZJQL 3SQ1A 3KLGA 1CZBA 3QDKA 3AVHA 1RDWX 1C1BA 3SYZA 2YKNA 5DK5A 4CF1A 3CQXA 5F0XA 3VF6A 4IEIA 4M41A 1NGAA 1HX1A 1WSEA 1L3TA 4O5FA 3KK3A 2GWJA 1ZBUA 1BOTO 5KGXA 1SAZA 3PX6A 2CH5A 2KHOA 2I7PA 4CJQA 2PY5A 2AA4A 2FF3B 5AFUA 1U49A 4B1VA 4X64K 5JLHA 1T7PA 1YTUA 3ZCMA 3PSIA 4MQ3A 1XMOK 5C25A 5CZ2A 4ISFA 4IXCA 4U7BA 4CFBA 5KRSA 4R79A 2FBTA 4M63C 2H3GX 3O9RA 4CERA 1CZ9A 4CK1A 1NGDA 3DLGA 3M8SA 4AF1A 3VQ8A 2E2QA 2ASPA 2IGIA 2D5RA 2OPPA 1TL1A 4DUZK 1Y64A 3U6FA 2WTUA 2HHTA 1HPZA 1HYSA 3AY9A 3VQ9A 4FW1A 3HPOA 2FSKA 4DR5K 4CIFA 3AAPA 4BR9A 3K59A 4I6MB 3BGRA 1NJXA 1WN7A 3OVNA 3CERA 4XH1A 1VQNN 1EKEA 2EHGA 2HNYA 5JVHL 4CJPA 3GL1A 1L3VA 1U2VB 2BH1A 1FXXA 4FJJA 3HP6A 2ATQA 1TV6A 3P4IA 1G15A 2VG5A 2Q36A 4KREA 5EU7A 1VQON 1QHAA 4KB0A 1WLJA 2NRRA 3G10A 4E7LA 3VTHA 2YCHA 1SL1A 4FWMA 4BRHA 3EY1A 1RDCA 1KCFA 3OYDA 4AM7A 4RCHA 3NBPA 1QQCA 5J1EA 1D4XA 5FPDA 1JL1A 2JGUA 1YXQA 3OBWA 3QBXA 3QIOA 1WOQA 1O1WA 2UXCK 2O8DA 4KKOA 1RTIA 4F3OA 3CJBA 3O4NA 1HQEA 2BANA 1HJRA 4C8OA 4CHOA 4K43A 2WFBA 4B1UB 4AHCA 3I0SA 1CXUA 5TKWA 4QS7A 1NK6A 2QWOA 4FLTA 1T05A 3ZSQA 1RBSA 2CGLA 3ENBA 2JLEA 1VQ4N 1L5UA 3E01A 1IBLK 1IBMK 3CETA 4CHPA 5BRDA 4NXNK 1GLDG 1HNIA 3WNFA 1S3XA 3CMEN 3OHRA 1QTMA 3L3UA 3WNHA 4LFAK 3M8PA 3NCIA 2QWNA 1BISA 4K42A 3DRPA 3DLEA 4FSVA 3M3ZA 3PUFA 3WEEB 2I5JA 3DRSA 4OPJA 3OJSA 4B1XB 3HPGA 1VQ7N 2OA8A 2XY7A 3AVIA 4RW9A 4BDYA 5H1SQ 1BIZA 3AVLA 5AQIA 3MXIA 1R59O 2NLXA 3HSTB 4WFAL 1S1UA 2FBXA 3CMAN 4W5NA 3LM2A 3TAMA 4CEZA 3B6PA 4M3UA 1Q82O 1K9MO 5HRNA 1ZXOA 4RW6A 1LCUA 1XHZA 1LW0A 1S6QA 2NRZA 5HRRA 3ID8A 3VA3A 1OH7A 2EWSA 3I55N 4I6MA 1Q86O 3LPUA 4FJ9A 1XI1A 4DR1K 1NJYA 4AHTA 1ZYQA 4CI6A 5BN9A 1NWKA 1YJ9N 1U2VA 1H1VA 4HVJA 3PLAA 4IDHA 3I0RA 3D2FB 4FYDA 2YNIA 1JLBA 4CZMA 3J7YP 3J80O 3VQ6A 3KK2A 4KTQA 4YHHK 1XWLA 3ZT2A 3DWLA 1MU2A 2KW4A 3EEQA 4BR2A 4GKKK 1L3SA 2QM1A 4FK0A 3ZX2A 3MMVA 2PYLA 3RRGA 1OKJA 1YAGA 4QS8A 4DTUA 3AVCA 3V1RA 1NK9A 4B9VA 4ILGB 1A5WA 2Q97A 2OPSA 4CJKA 3KLIA 3NGYA 2G8UA 4JK8A 4FJHA 2XY5A 3SQ4A 5B8HA 4BR4A 4CJTA 3ZT1A 4CF9A 3ZSWA 2QW9A 3OYKA 5GAGP 3D6RA 3BF1A 3QFPA 3M5RA 3OW2M 3LZIA 5SZTA 2WOMA 3Q7BA 1Q9YA 2B4JA 5AJ3K 3ZT4A 3M1FA 1RBTA 5E26A 3AVFA 1TKDA 5IT9O 3KWIA 2E6LA 2D4WA 4E0DA 3BZCA 1X9SA 3LAKA 4LH4A 4FJ8A 4DR6K 5AQNA 3OYIA 1S1WA 3WEEA 4RW4A 4I2PA 1KAXA 2E1YA 1NGGA 4GW6A 3GG4A 3QNOA 2UUAK 3DLKA 5M1FA 4JI8K 4IBNA 3CXCM 3C95A 4M42A 1D9FA 4A5BA 2KTQA 5C12A 4KAZA 4NB4A 4WQ5A 1YUWA 4BVPA 3WT0A 3CC7N 4DV3K 3IUCA 5AZIB 4BQLA 5MLCQ 3ISNC 4BWJA 4M7YA 4AHVA 4CJVA 3ULDA 1W2BM 5GINA 2PYJA 1GLBG 4CF2A 3SMPA 3LDOA 1NK0A 4HCBA 5LMNK 3H3OB 4GV3A 3N4QA 4YFUA 3FZHA 4KO0A 4Q0BA 1BGXT 1QQNA 4FLZA 2W41A 3SZ2A 2YX6A 3KK7A 4BR0A 3TARA 3D2FA 4RG8A 4CZHA 3SBTA 2Q2RA 3GBTA 5C2FA 4IG0A 4DSEA 1QVFM 1VSMA 3LDPA 2OANA 3H3NO 3NF8A 3O6WA 4HWIA 4CEFA 2HMIA 1Z6RA 4X66K 1N8RO 1NMNA 4FJ5A 4V19S 3HP9A 4CE9A 4OPAA 3U9DA 1W0HA 4BRIA 3TAPA 3O3FA 1HYVA 2NZTA 1TK5A 4CK3A 4C1NI 3QEVA 1DEJA 3CM6A 4FXDA 4WYBA 1ZBFA 4KHWA 3AARA 4H5WA 2UUBK 4F4KA 4AH9A 5JVGL 1YIJN 3TTDA 1YVUA 4I7FA 4DFPA 4BRQA 5BPNA 2OPQA 3CFOA 4W5TA 1SKSA 1U6ZA 2QXFA 4OLAA 3KKSA 1YF5L 4DLGA 1N5YA 5E41A 1J9AA 2P51A 1BA0A 3DOKA 1VQ9N 3Q7CA 4CEBA 2UXDK 4CJEA 2O8BB 4OKKA 5I3UA 4KI4A 4ZTFA 4E7IA 4WQ4A 1HKBA 2W42A 4E7KA 4DV5K 5KTQA 3V1OA 5J2NA 4UQGA 4FWSA 4HUEA 3SV4A 4KH4A 4DUYK 3BF3A 1EQYA 5M1KA 1RDDA 3FZKA 4FPAA 4DG1A 3M8QA 4EIAA 2VGNA 4WF9L 3GE1A 3H1QA 4BVOA 1T44A 2Q0UA 4KTZA 5AQMA 3AVNA 3CF5L 4DTRA 4CEOA 5BREA 3CG7A 1HQUA 4CK2A 1U04A 5AZIA 2HBMA 4Z0UA 2D0OA 4K25A 1K6YA 5KGWA 3EZ5A 4JI4K 4C8KA 3A0IX 4E89A 3NMUA 3VQPA 4JI0K 3DLLL 2OPRA 1RDAA 3ZLJA 4YOUA 4KB1A 4CBUA 3H46O 3VF4A 3OYAA 2P9SB 1HPMA 1BL3A 5AQKA 3CPEA 3BZKA 3RMAA 4CEEA 1QSLA 3WXJA 2O4GA 1DLOA 4FJIA 3OYLA 4TSXA 3CQYA 4CZIA 1BQNA 4O0IA 3SI6A 4CFAA 1TK8A 1EXQA 2W6LA 1WAJA 3V9UA 2VQFK 1NJWA 3OS0A 4OKJA 4KHYA 1BCMA 3E66A 1IJJA 4MDAA 2YHAA 3L3VA 1RT2A 2YJFA 5HBMA 3OYCA 5BR9A 1LAWA 1JLCA 4ZHRA 4OX9K 4FWRA 1JLQA 2Q0RA 4JNEA 1EWRA 3SCXA 4CCHA 5CYMA 4JI6K 3U9ZA 5FRMA 4DTJA 4CVNE 4BE0A 2ZJRL 3G71N 3F2KA 4PKIA 3O80A 4RW8A 1M1KO 3P1GA 3M8RA 2YKMA 4CJ3A 2GELA 4DS5A 1DKGD 2XO7A 4E7HA 3A2FA 4MO4A 3AA4A 4KH5A 3HPHA 5AQJA 2O8BA 3VQ7A 5AQOA 1TYQB 1X3NA 3DMJA 2G8IA 4HUGA 3L0QA 3FZLA 3RTVA 5TKYA 4KHQA 4O8UA 3CC4N 3TAGA 3D0PA 3ENHA 3SMSA 4K8ZA 4A2BA 4FLUA 4FK2A 4JHDB 3AGKA 2LSNA 1IKWA 4DWIA 3QESA 1KAYA 1S9GA 1Q81O 4IG3A 3JXUA 4FLYA 3HI0A 4DU4A 2PBDA 2HBLA 1ASVA 1G99A 4JK7A 3PO4A 4LSNA 5BPMA 4C8LA 1N32K 4JK9A 3PX4A 4FZZA 4LH5A 3O08A 2KLAA 4PQUA 2VQEK 2YHWA 3BDPA 4CBXA 4O8KA 1GLLO 3VEOA 1X9MA 3JYTA 3V9WA 5LY3A 5AQGA 1WSJA 3VQDA 4CZFA 1BI4B 1IG8A 1JXBA 3QEWA 4YOWA 2RKIA 3NGIA 4IKFA 2WC9A 3T7ZA 2F9TA 4DCHA 1NM1A 3NE6A 4CHZA 1RT5A 3HVRA 1IKVA 4H4OA 3H6EA 4DTXA 2P9SA 2D0AA 3QEPA 4MLHA 1HNWK 4CW7B 5AQLA 1BHLA 1DGKN 4KHUA 3NGZA 3SBGA 3KK1A 1S9EA 3TSQA 2YHYA 3RSEB 3ZSOA 3MEDA 1ASUA 2P5GA 3RMDA 2NNWA 4LFBK 2UU9K 3VEYA 3OYJA 4JD2B 4FW2A 3NH0A 2E5LK 1GOCA 1Z25A 3MN5A 4CJFA 1IV0A 1F21A 1Z26A 4DR2K 1MWKA 3ZSRA 5J2PA 4FOEA 5AQWA 4DS4A 4W5RA 5BPLA 4JRPA 3SUQA 3RR8A 3QBWA 5FROA 5CHIA 3TANA 2YNFA 5C42A 1QQMA 1XC3A 1ZBHA 5EX5A 3CJAA 5SWMA 5HRSA 3O9QA 4YDUA 4N76A 5JLFA 4DTSA 1RTJA 1BG3A 3CJ9A 3VPZA 1SKWA 4B9NA 2B6AA 3VERA 1TYQA 3C6AA 1KVAA 3HYFA 4FJXA 3AVJA 3QMLA 4DR4K 5HROA 4N5SA 2RE2A 2HBKA 1JLEA 1N34K 4BQZA 4I9LA 5ADXA 4JHDA 4DTOA 4L8RB 5AQRA 3R1XA 1YT3A 3HBTA 4FZYA 3HXMA 4B3SK 4E7JA 3ZETB 4Z94A 2YNHA 2X78A 3J81O 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1TKXA 3BY5A 2G8KA 3NF6A 3ZETA 3AA5X 4FWOA 1I94K 3TAEA 1OH6A 5GADP 4EZ9A 1NKEA 1VQ5N 3CCUN 3TPQA 2QXLA 5C10A 2X74A 3GDQA 4CGDA 3QFUA 4CF0A 1RBVA 2QWPA 3SLCA 2F8TA 2KKZA 4FM2A 2JWKA 4B08A 5AQTA 2OZSA 3TWHA 1LWEA 1CXQA 1VSIA 2ITGA 2VWBA 4QCLA 3WXLA 1U4BA 4M3XA 4BDPA 2P9IA 2GUIA 3TSPA 5C2DA 1GLEG 3SQ2A 4UY8O 2IVOA 4PHTX 1VSKA 1I3AA 3EE8A 3ID6A 2BGGA 3SV3A 1IO2A 2QWMA 2Y1JA 4LY7A 3THYB 1YI2N 5M1NA 3WQUA 3CIPA 4FVMA 5AFUH 3A5NC 1FK9A 4NCBA 5EVZA 4BGBA 3ALYA 5KQ8A 4ELVA 1JLAA 4DFKA 4DV2K 2XRIA 1VQKN 5GIOA 1T6CA 4GVMA 2PFUA 4OPHA 1JCEA 4QAGA 2P9NB 5AQUA 4OGEA 3ATUA 3B6OA 4FWNA 3IRXA 5AR0A 2F9WA 4WQ4C 1GLFO 2VGMA 4EP4A 4DV4K 3AVBA 3F73A 1RT1A 1VQLN 3EKSA 5FLXO 3TSUA 1C0MA 1YTAA 4GV6A 4OGCA 1EWQA 4OO1J 3DAWA 3EL2A 3R9PA 3MN9A 5F1XA 1M90O 4DTNA 4KBOA 4CFCA 3M6GA 2FBYA 4FLXA 2ZE2A 4J2EA 4BGAA 2G8WA 4PA1A 4IEEA 1KLNA 5JS2A 3O8MA 5M1PA 4IFVA 3A5LC 5AQQA 2DFHA 4NO7A 4DTPA 4OJRA 2O8FB 3KWGA 1Z05A 5ELZA 4BWMA 3W0LA 2DTUA 2E8AA 2Z1HA 2AP1A 4KHNA 4BRCA 3TI0A 2QWRA 2P9KB 1YITN 5C0YA 3MDQA 1SKRA 4JN4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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