3CCLN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535c. density for anisomycin is visible but not included in model.
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
b'ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cclN00
3CCLN 1Q86O 5DM6L 1K73O 3CCUN 1VQ4N 4U67L 1K8AO 5GAEP 3I55N 1VQNN 1KC8O 1OVYA 4WF9L 3CCVN 1VQKN 3CCQN 1Q82O 1VQPN 3CCJN 3CCRN 3CXCM 3CD6N 3G6EN 2QA4N 3CMAN 3CCEN 1N8RO 5GAHP 1S72N 1JJ2M 1QVFM 1K9MO 1VQ8N 1YHQN 1YJ9N 3CCSN 3OW2M 3PIOL 3CCMN 1YI2N 4WFAL 2ZJRL 1NJIO 5MLCQ 1KQSM 2ZJQL 1VQLN 2OTLN 1ILYA 5GAGP 2QEXN 3CMEN 4UY8O 1W2BM 1VQON 4WFBL 1QVGM 3CC7N 3CF5L 1VQ9N 5JVGL 1YJWN 5DM7L 3I56N 4IO9L 1YITN 1M1KO 2OTJN 1YJNN 5H1SQ 3PIPL 3CC4N 1KD1O 1VQMN 5GADP 3DLLL 5JVHL 1Q7YO 3J7ZO 3CC2N 3CPWM 1YIJN 1VQ5N 4IOAL 1M90O 5HL7L 4WFNL 3G71N 4IOCL 4WCEL 2ZJPL 1VQ6N 3G4SN 1Q81O 1VQ7N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NF7A 3PLAA 4FWSA 5HBMA 3D2FB 1N36K 1P90A 4L3QA 5AQQA 3VESA 1B9FA 4RW7A 2YNHA 1YTAA 4Z0UA 1ZC6A 2HOEA 2IVPA 4OJRA 1NBWA 4NO7A 4BWMA 3CXCM 4A62A 4IOXA 4G1QA 4CZFA 3BEXA 4I7FA 2FBTA 1TYQA 1ZBSA 5GAHP 1WSHA 4BDPA 3GL1A 4ZTFA 2D0OA 4RW6A 1C1BA 5J2PA 3HM9A 5HROA 5LJWA 3FZLA 4B9QA 3V9SA 3L2WA 1NK0A 1YI2N 4CEZA 3NMUA 3R9PA 4E7JA 3HSCA 3L0QA 2WFBA 3WXJA 4FJHA 5GAGP 3S3MA 4JD2A 5F1XA 4RTFD 5IT9O 3W0LA 3TR8A 1RDWX 3LPTA 3NH1A 4ILHA 4Y1DA 1S22A 1S1VA 3E66A 4PKIA 4B1VA 3KK7A 4B9NA 2WTUA 4BRPA 4A5AA 4ELTA 4JI8K 1XHXA 4FLUA 1BQMA 2HNZA 4M45A 3K57A 3SPYA 4AHRA 1VSIA 5BREA 4MFBA 1KTQA 4DTRA 3LDPA 4YOVA 3CC4N 4DS4A 4YOTA 4C8MA 5FRNA 4MO5A 4OGEA 1VSJA 3QEWA 4G9ZA 1VQMN 2ZM6K 2A40A 3V1OA 2IIRA 3AAPA 4LFBK 3JXUA 1NGJA 2FSJA 2P9NA 4BDYA 3C65A 2IS3A 3IS9A 5AZIA 4IOAL 2ASMA 2YHWA 2CGKA 5M1OA 3TANA 4FLTA 3VOVA 3HI0A 5CZ1A 1HNXK 3QERA 2ZJPL 1ASVA 3KTQA 3C94A 3RR8A 3M1FA 3SBTA 3QNNA 3SBGA 2E8AA 4CHPA 1TK8A 2X74A 4FJGA 4DU4A 4AF1A 1RDDA 4E89A 4MLEA 2P9IB 4DB3A 2O8DA 3K5MA 2FBXA 4ELUA 3SI6A 3AV9A 4JNEA 4BVPA 4CJQA 1ZBFA 1LCUA 2YHXA 4H5VA 1YAGA 4O8KA 3CJ9A 3HT3A 3NH2A 4Y1CA 4BREA 1EWQA 1QSYA 3OS0A 1SAZA 2YJEA 1QHAA 2ZD1A 3WNFA 2F4VK 1YHQN 3VN5A 3WNHA 1I3AA 3U3GA 5GINA 4EHTA 3AVBA 3W3DA 2VWJA 3DOKA 2X6NA 3PV8A 1NGEA 1RGIA 4IDKA 3PX4A 3P4IA 4C1NI 1FK9A 4FWMA 4CEQA 3CERA 2IVOA 4CZHA 3SQ2A 1U45A 4NYFA 4W5OA 3AO3A 3OBYA 3VTHA 4DR5K 1HYVA 1JLAA 2QWMA 3HXMA 1FJGK 1TAQA 4CBXA 3EYZA 3LP0A 1M1KO 4FJJA 5JS2A 1HX1A 3HZ6A 2O8BB 3O6WA 5AQTA 1JKHA 4N41A 4YHHK 4Z94A 1NJWA 2G8WA 2KTQA 4GKKK 3T1HK 3L4QA 4LD0A 1RBVA 2I7PA 3D7EO 2HHWA 4H5RA 3ZSZA 1U4BA 3L2UA 3CI5A 1BI4A 1G15A 4HTLA 4DTUA 3HRGA 3THWB 1T03A 4KB0A 3EN9A 3H1QA 3EL2A 4DQRA 1YF5L 2Q31A 3ATVA 2FBYA 4AHVA 2EX3A 2W40A 5AQPA 1VQ7N 4NLBA 2PYJA 1J54A 3VQ9A 4F8RA 4NYNA 4PKHA 4WQ4C 2Q0RA 1OVYA 1TKZA 1XC3A 2O8FB 4J2BA 4LF6K 3PY8A 3QNOA 1VQKN 3VQPA 4DR7K 5AQGA 4CJFA 4I6MB 3CCJN 1LAWA 1S1TA 3OBWA 5JMVA 3ULDA 1HR0K 4CFCA 3U9ZA 3EE8A 4W5RA 3K5OA 3CJ7A 1MWKA 1D9FA 1C1CA 4DKWA 1N8RO 4IO8A 3EZ5A 1JJ2M 3ZSOA 4CF2A 3MDQA 2HW3A 3V4IA 2D0BA 2HMPA 3DLGA 2HBJA 4AQYK 4F3TA 3VQ8A 2D4WA 3T19A 3TARA 3CMEN 4CGGA 3ZSQA 3CYMA 3S3OA 3JAMO 4N5SA 1KXPA 3CM6A 2V7YA 1L3UA 4CJPA 4FPBA 1D5AA 4OPHA 1ASUA 2XY8A 4OVLA 4BR4A 3VPZA 2DPNA 3TSPA 3R6MA 1NOYA 5EU7A 5FPEA 4FOIA 1TUUA 1KRPA 3RTVA 1IBLK 1L3SA 2FSNA 4H0OA 3H6EA 5AQJA 3C7NB 4FJXA 3FZKA 3OYKA 5M1FA 4LC9B 3PSFA 5M1PA 1U2VB 5HRRA 1IH7A 4CJ5A 4KHUA 2P9KA 4M7XA 1ZBHA 2BANA 4C1NK 5FRMA 1Z6RA 3H46O 3ZX0A 4CESA 1T8EA 2ZGYA 4W5TA 3FLCO 3P39A 2BH1A 1GLJO 4DV2K 3OA9A 4CJWA 3I0RA 4O8UA 2E1YA 3CM5A 4JRPA 4FXDA 3I8DA 2G8IA 1Q81O 4K43A 3AO2A 2Z1JA 3CCUN 4HTUA 4CHQA 4FYDA 1OKJA 1C0TA 4PKGA 4JI4K 4KAZA 1NWKA 3THYA 4BR2A 2QXLA 4NLCA 2QW9A 2G8UA 1BQNA 4ICLA 1GLAG 3LZIA 3O9QA 3U4LA 3DXKB 1T6CA 4EZ6A 4KBOA 2QM1A 4M7YA 4DS5A 3D2FA 1SL2A 4C8KA 5CYQA 5CYMA 1BU6O 4B3RK 3H3NO 1NGAA 4FPAA 4CF8A 1RT4A 4IZ9A 1HNZK 4OKKA 4IG0A 1SKRA 3CJCA 4OKEA 5AQYA 4WFAL 4DU1A 4BC3A 2QEXN 2Z1GA 1NGHA 3VQ6A 5JLFA 3HPGA 3NHGA 4CD3A 1A5XA 2V52B 4FW2A 1HNVA 4WE1A 3MN7A 3V9XA 1IKXA 2W6KA 3WXMB 1WB9A 2E6MA 2A42A 4BRDA 2Q36A 1U6ZA 4CFBA 3DRPA 3RMAA 3QESA 4B9MA 1WSFA 2F7TA 4PY5A 2GEMA 2WONA 1NK5A 2HF3A 1JCFA 3CIPA 5LL6Z 3WUHA 1JLCA 3NVKA 4DTXA 2Q3SA 2D5RA 1F21A 4H4MA 4FZZA 1LAVA 4ELVA 1QTMA 4IFEA 1GLFO 2DFFA 3ISNC 3VF2A 3UKUB 4FJ9A 4HWIA 2IDOA 5BRDA 2Q1NA 1EKEA 3ZLJA 1HJRA 1RT2A 3SQ0A 1I39A 5GIOA 4DTOA 3P5JA 1XC9A 1NGIA 3V1QA 2GWKA 4E7KA 4AM7A 3MXIA 1Y64A 4M3TA 1VQ4N 3TAFA 1NJYA 1WOQA 4Y0WA 4JI3K 2Z1HA 1W97L 5FDLA 4PL7A 2UXBK 5CY4A 5AQOA 4FWOA 3M8RA 1S6PA 4MQ3A 2E4LA 4DQ8A 3CCRN 1WBDA 3BDPA 1U49A 4FJ5A 4FLVA 5CE3A 3C6AA 4CZJA 3NDKA 3LAKA 1T05A 3DLHA 3CMAN 4FJ8A 1QZ5A 1UWBA 1QSSA 3CFRA 4JKEA 3GOIA 5KGXA 1CZ9A 2P9IA 4N56A 3DM2A 1BIZA 1C1AA 3MCPA 4Q5VA 1EX4A 4IJNA 1RDBA 3PIOL 2HHHK 1YTUA 3O9SA 4E1NA 3DLRA 3RMBA 4Z4IA 3FR0A 3MWTA 3AAQA 4A5BA 1ZBUA 3IAYA 2OZSA 2KHOA 4CERA 4UQGA 3MN9A 4AM6A 1NNEA 3MAQA 2NRHA 3EKUA 2OPRA 4JRQA 2YJFA 2ZGZA 1Z26A 4O44A 1TUYA 2O8CB 5KGWA 1JLFA 1BIUA 3VQCA 4YDUC 4JKDA 1Y97A 2OANA 4CGIA 3PIPL 1TKTA 2GV9A 4H0XB 4QOZB 3PX6A 5E84A 2D0AA 1D9DA 3I33A 4W5NA 2VQEK 4LFAK 4E1MA 4M3YA 1REVA 4XH4A 3ENHA 3CPWM 3TAPA 3DLEA 3NH0A 1J6ZA 5FPNA 3VEZA 4AH9A 3HYFA 2HHTA 1LWEA 3BF1A 4M3UA 5C2FA 3TPQA 3LM2A 3ULEB 1NOZA 5LY3A 3G71N 2YI1A 3ENBA 4FK2A 3OYJA 1JL2A 4E3SA 3QLHA 1VSMA 4CD1A 3KVGA 4DTNA 2ZQBA 2YV0X 3OTOK 1J9AA 4H03B 4Z4HA 3O3FA 4B3SK 4B8AB 4U67L 2P9PB 3O4WA 3HPOA 3FZMA 5EY4A 3BZCA 4DV3K 1VQNN 2CH6A 2XHBA 4CJKA 4DLGA 1XMQK 1U04A 3L3VA 2Y1IA 1QQNA 5EXWA 4CEBA 3THWA 3L4IA 3OY9A 1WN7A 3C6TA 4PA1A 1RDCA 5HRNA 4HUGA 2HVHA 4DQPA 1UOCA 3HSTB 5LMNK 2HVIA 1J53A 3DMJA 3E1YA 3ID6A 4AHTA 3K9KA 5AR0A 3RR7A 2O8FA 4H0PA 4JI5K 3AO1A 3K59A 4B9UA 1SKWA 4DSLA 4I6MA 2XO7A 3LWLA 1RT7A 4DV0K 3GDQA 1OH5A 1NJXA 4FJIA 3TWHA 1S1UA 2G8VA 4JK9A 1IKWA 2HNYA 3LPUA 3RMDA 1QQMA 3TTCA 1DGKN 3MXJA 3O08A 1W9HA 4DQQA 5D3GA 1VQON 3AO4A 3P38A 1HJOA 1QVGM 4IXCA 2W42A 4JKHA 4NB4A 5E41A 2HB5A 2BUPA 1VQ9N 3K5LA 3SV4A 2QTDA 5DM7L 4LF9K 4KH5A 4KO0A 3B6OA 3T7ZA 4R79A 4LH4A 2GUPA 3E9LA 2A41A 3BUZB 5I42A 3ZYYX 4YOUA 1NGDA 4FJKA 2AJQA 1Q7YO 3QDKA 3KLHA 4FM2A 1GLCG 1KAYA 4CJEA 1BOTO 3AA5X 4C8LA 2D0CA 4BG8A 1HQEA 3K9JA 3C7NA 2ATQA 1KVCA 4H0TB 3UB5A 5BN8A 3SAFA 1U2VA 1KFDA 4MLHA 3NGIA 3QEPA 1KAZA 2VYPA 3NF6A 4H4OA 4J2EA 1RBUA 4BR5A 2PBDA 4K8XA 2P9UB 1KC8O 4IFVA 2QWOA 4BE1A 4FLWA 2O8EB 5EX5A 4E19A 3KLIA 5AQKA 4CHOA 3NF9A 2BGGA 1MDUB 3OJUA 3M8SA 4CGDA 2W6LA 3ZEUB 5C0YA 4QCLA 3O1BA 3QO9A 1XQSC 1RDUA 3AVKA 5AQFA 2D0PA 3VMFB 3GG4A 4X62K 4JS5A 1VSFA 5F0XA 3VQ4A 3K2PA 4DWIA 3DXKA 5J2MA 4B08A 2OPPA 3OYMA 4CJRA 2GBZA 3KKRA 4GVEA 3TTFA 4CJ7A 4IG3A 3QEVA 4WQ4A 2QWLA 1ILYA 3QBXA 1NKBA 3U6FA 2BTFA 3KLEA 4FK0A 2YNGA 2VG5A 5BR9A 3HPHA 1NK8A 4CJVA 3V9WA 4WFBL 4OPAA 2G8FA 3GE1A 3L3UA 1GLLO 2HBMA 3WEEA 3HL8A 4U7BA 1HKGA 3THVA 4CEOA 5SZTA 2B4JA 1BO5O 4DR4K 4KHSA 4BVOA 4N76A 4FZXC 4BE0A 5AQXA 1QE1A 3OYGA 1NGBA 4KHYA 4K41A 4QAGA 3LDLA 3A5NC 4DR2K 1C0MA 2FLOA 3SUOA 2FBVA 3OHRA 1O13A 4BQZA 4BY9C 4IEEA 4DTJA 4GY2B 5C15A 3G0ZA 4BRGA 1YT3A 4B9VA 3LDNA 2XY6A 1T7PA 4HVJA 3R1XA 3HBTA 1W0HA 1R59O 2GTDA 4DV6K 3IMXA 5M1NA 3QEIA 3O80A 4H8KA 3UKUA 5J2QA 4A2BA 4BQLA 2ZE2A 1EXQA 3EY1A 4DQSA 4O5FA 4BDZA 4BRHA 4B1XB 4YOWA 4CJLA 1Q82O 1RDAA 1LWFA 3CPEA 3QINA 2UUCK 3ZX3A 1YVUA 4OPJA 2NRWA 1SS6A 1C0GA 3K58A 4BRMA 3SNNA 4F2RA 5E26A 3RRGA 2KFNA 3PX0A 4DSKA 3AO5A 1X9SA 3SK3A 3VEWA 3K0SA 1N34K 1YJ9N 1JLBA 2F8SA 1HUXA 4KH4A 3DOLA 3ZSVA 1SQKA 3CCMN 5AZJB 2ZJRL 1ATNA 1ESVA 2E20A 3DRSA 2OTLN 2ZJQL 3SJHA 4Z4CA 4KRFA 2G8HA 2RKIA 3QETA 3ZSYA 1W2BM 4KREA 3VEXA 3S3NA 4JKFA 2LSNA 3SPZA 4IDHA 1YJWN 1WAJA 4B8CA 1NGFA 1J5OA 1IJJA 2FF3B 2E6LA 3WQTA 3U3YA 1YJNN 5TKYA 4L8RB 3BF3A 2WOMA 1CZAN 3FFKB 4NCBA 4BRCA 5HLFA 2AP1A 1D4XA 4FLXA 4K0KK 3NBPA 5JVHL 1K8KB 1RBTA 2O8CA 4JI7K 1ATRA 4B9LA 1YIJN 1TL1A 3L8BA 2ETJA 3M8PA 5BPLA 1KAXA 1ZBIA 2A3ZA 1JLEA 3OYNA 3BZKA 1BL3A 4BWJA 5AQMA 5AQSA 4OLBA 4YFUA 4DR1K 3WXLA 1S9EA 1RFQA 3TAQA 3L2QA 2HBKA 3TSUA 3OYAA 1VRUA 3HJFA 5M1KA 4RWTA 3CQXA 4JAXA 1H1VA 1IKYA 2HHVA 1DEJA 1TV6A 4J2DA 3CJ1A 2VGNA 3VEOA 4CVNE 2G8KA 5C42A 2UYTA 4HCBA 1RILA 4OO1J 1VQPN 4E0DA 3DJCA 2VQFK 4BRIA 3A5LC 1RT6A 3KWGA 3ZSWA 2YHAA 4DMNA 2P9PA 4GV6A 3LANA 3MN5A 2NRVA 3KK3A 3AVLA 4O4GA 3U8XA 2A1RA 4B3TK 4KHPK 4IJAA 5AFUH 4BGBA 4HUEA 1OH7A 4CBUA 3D45A 1RT5A 2VWBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CCL N;  1Q86 O;  5DM6 L;  1K73 O;  3CCU N;  1VQ4 N;  4U67 L;  1K8A O;  5GAE P;  3I55 N;  1VQN N;  1KC8 O;  1OVY A;  4WF9 L;  3CCV N;  1VQK N;  3CCQ N;  1Q82 O;  1VQP N;  3CCJ N;  3CCR N;  3CXC M;  3CD6 N;  3G6E N;  2QA4 N;  3CMA N;  3CCE N;  1N8R O;  5GAH P;  1S72 N;  1JJ2 M;  1QVF M;  1K9M O;  1VQ8 N;  1YHQ N;  1YJ9 N;  3CCS N;  3OW2 M;  3PIO L;  3CCM N;  1YI2 N;  4WFA L;  2ZJR L;  1NJI O;  5MLC Q;  1KQS M;  2ZJQ L;  1VQL N;  2OTL N;  1ILY A;  5GAG P;  2QEX N;  3CME N;  4UY8 O;  1W2B M;  1VQO N;  4WFB L;  1QVG M;  3CC7 N;  3CF5 L;  1VQ9 N;  5JVG L;  1YJW N;  5DM7 L;  3I56 N;  4IO9 L;  1YIT N;  1M1K O;  2OTJ N;  1YJN N;  5H1S Q;  3PIP L;  3CC4 N;  1KD1 O;  1VQM N;  5GAD P;  3DLL L;  5JVH L;  1Q7Y O;  3J7Z O;  3CC2 N;  3CPW M;  1YIJ N;  1VQ5 N;  4IOA L;  1M90 O;  5HL7 L;  4WFN L;  3G71 N;  4IOC L;  4WCE L;  2ZJP L;  1VQ6 N;  3G4S N;  1Q81 O;  1VQ7 N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NF7 A;  3PLA A;  4FWS A;  5HBM A;  3D2F B;  1N36 K;  1P90 A;  4L3Q A;  5AQQ A;  3VES A;  1B9F A;  4RW7 A;  2YNH A;  1YTA A;  4Z0U A;  1ZC6 A;  2HOE A;  2IVP A;  4OJR A;  1NBW A;  4NO7 A;  4BWM A;  3CXC M;  4A62 A;  4IOX A;  4G1Q A;  4CZF A;  3BEX A;  4I7F A;  2FBT A;  1TYQ A;  1ZBS A;  5GAH P;  1WSH A;  4BDP A;  3GL1 A;  4ZTF A;  2D0O A;  4RW6 A;  1C1B A;  5J2P A;  3HM9 A;  5HRO A;  5LJW A;  3FZL A;  4B9Q A;  3V9S A;  3L2W A;  1NK0 A;  1YI2 N;  4CEZ A;  3NMU A;  3R9P A;  4E7J A;  3HSC A;  3L0Q A;  2WFB A;  3WXJ A;  4FJH A;  5GAG P;  3S3M A;  4JD2 A;  5F1X A;  4RTF D;  5IT9 O;  3W0L A;  3TR8 A;  1RDW X;  3LPT A;  3NH1 A;  4ILH A;  4Y1D A;  1S22 A;  1S1V A;  3E66 A;  4PKI A;  4B1V A;  3KK7 A;  4B9N A;  2WTU A;  4BRP A;  4A5A A;  4ELT A;  4JI8 K;  1XHX A;  4FLU A;  1BQM A;  2HNZ A;  4M45 A;  3K57 A;  3SPY A;  4AHR A;  1VSI A;  5BRE A;  4MFB A;  1KTQ A;  4DTR A;  3LDP A;  4YOV A;  3CC4 N;  4DS4 A;  4YOT A;  4C8M A;  5FRN A;  4MO5 A;  4OGE A;  1VSJ A;  3QEW A;  4G9Z A;  1VQM N;  2ZM6 K;  2A40 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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