3CCLN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535c. density for anisomycin is visible but not included in model.
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cclN00
5H1SQ 3I56N 5GAGP 3CXCM 1S72N 1OVYA 1VQKN 1VQ4N 1M90O 1VQ5N 3CCSN 3CCVN 4IOAL 1Q86O 1ILYA 1Q7YO 4UY8O 3CCEN 3CCUN 1QVFM 1KC8O 3J7ZO 1VQNN 3CMEN 3CPWM 3G6EN 3CCJN 1N8RO 1VQLN 1NJIO 5GAHP 1YI2N 1YJWN 3G71N 1VQMN 3CCRN 3CC2N 3PIOL 4WFAL 1K73O 2ZJQL 3CC7N 3CMAN 2ZJRL 3CC4N 1JJ2M 3G4SN 1K8AO 5GAEP 3CD6N 4WFNL 3OW2M 1YJ9N 3CCQN 1VQ7N 1VQ8N 1K9MO 1M1KO 1VQON 1KQSM 1Q82O 3CCMN 1YJNN 1YHQN 2QA4N 2QEXN 3DLLL 1VQPN 5GADP 3CF5L 1YITN 1Q81O 4IO9L 1KD1O 1W2BM 4WFBL 3PIPL 4IOCL 1VQ6N 4U67L 5HL7L 2ZJPL 1VQ9N 1YIJN 2OTJN 3CCLN 4WF9L 5JVGL 2OTLN 5DM7L 4WCEL 3I55N 5JVHL 1QVGM 5MLCQ 5DM6L
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MX2A 2AJQA 3WQTA 4B9SA 1S72N 1OVYA 1WLJA 1Z26A 4B3MK 3FZFA 4RTFD 1CXQA 3MN9A 4DLGA 3MXIA 3FZKA 4AM6A 3RR7A 5J2MA 1WSGA 2NUBA 2KFZA 1HX1A 5AQTA 1NGDA 4MLHA 3RVCA 4A5AA 1NK7A 3OYLA 3UIQA 2O8CB 1FK9A 3KLGA 3K9JA 1X9SA 1LAWA 4KB1A 3P39A 3KD5E 3ENBA 1H1VA 3RWUA 2A1RA 3CHWA 3H6EA 4BGBA 3HSTB 3OYMA 1ATSA 5AZIA 4BC2A 4MO5A 3WXKA 4WQ5A 2E2NA 1LWCA 1QQMA 1JLAA 1GLDG 3QEVA 1NMDA 2DFFA 2HF3A 2XO7A 3L2QA 3OJSA 2QK9A 2YNGA 1GOAA 2G8UA 2ZD1A 4DTNA 2UXDK 1LW2A 4O0JA 1C0UA 4OO1J 3AVGA 3BP8A 3V1OA 1IKVA 1JCGA 3T1HK 4EFHA 1HQUA 4W5NA 3CCMN 4M3RA 2OZMA 4KHSA 2F9TA 4GKJK 3SMPA 1IV0A 4DTOA 2FBXA 1GOCA 3I8BA 2P9SA 4WQ4A 1RBSA 4BRLA 3OA9A 3K2PA 4CGFA 4ID1A 4B9UA 2PBDA 2E88A 3RMAA 5AQSA 4MQ3A 3HJFA 3VF2A 1S22A 1Q9YA 1YIJN 4EP5A 3ULDA 5JVGL 1NBWA 4KI4A 3DLGA 4CF2A 3ZT4A 2OTLN 3K59A 4KREA 4BRIA 4Y1CA 1WSFA 3DI6A 3VF6A 2AP1A 1KXPA 4IJNA 5AZJB 3LDNA 1GLLO 3AO5A 3WEEB 2P9SB 4B3SK 1YUWA 3LP3A 3OYFA 2HW3A 3CXCM 1I3AA 1CXUA 4DQSA 4E0DA 2HVHA 4HVJA 3VESA 3WEEA 4XH5A 1JLCA 2FBYA 2NRTA 2OYQA 3V9UA 5F1XA 4NCGA 5JS2A 2E1YA 3BF1A 1KVBA 4A59A 1U2VA 1VSJA 4RWTA 1R0AA 2WOMA 4BREA 3HRGA 3NH1A 2Q2RA 4LD0A 1IBKK 3TAFA 4JEPA 4UY8O 3CCEN 3W3DA 4ZHRA 3SV3A 1D4XA 5AQRA 2CGKA 3CMEN 4ID5A 2RN2A 3U4LA 3CCJN 3QNOA 5KQDA 3U8XA 3ZETB 3NHGA 5BR9A 1YJWN 3KZBA 3SBTA 3KK1A 4W5TA 3K57A 2ASPA 3T19A 5CYQA 4JI8K 4JI7K 4YDUC 3QEPA 4B9VA 3JS6A 3O80A 1NOZA 3ENOA 4EIAA 4K8ZA 4JK8A 4NYFA 4HUFA 5GINA 4DSJA 4FJ9A 5AQFA 4BG8A 4GV6A 4J8FA 3AVHA 3MDQA 3AV9A 4XH4A 4K0KK 2G8IA 5E26A 3SUPA 2FSNA 2F7TA 1IBMK 2QM1A 2HBJA 1T6CA 4KHNA 4FZZA 5AQJA 4BR0A 5F2RA 1RBRA 3VQPA 5KQ8A 3PV8A 3SZ2A 4WYBA 3CF5L 3AARA 4FVUA 3ATUA 2RKIA 3SJHA 2KZZA 1C0GA 1VQ6N 4B3RK 2FBTA 4FO0A 3SUNA 1X1PA 1YXQA 1RT4A 4DV7K 1VRUA 1LAVA 4CJEA 4DV5K 1VK0A 5BR8K 3OHRA 4H5RA 4X64K 2P1JA 4EHTA 3QB0A 1RFQA 3OYEA 2HOEA 3MMVA 4H0PA 4FZXC 2D0PA 4GV9A 5CZ1A 3ENHA 4EHUA 3NF9A 1C1BA 1TKXA 1E4GT 1HYSA 4JLHA 2ZWHA 5BRDA 3HYFA 3NAEA 1TUYA 2Q0UA 4DSEA 4A57A 1SL2A 4IOAL 1NG9A 1BL3A 4CEOA 2HHHK 3AA2A 2KKZA 1Q7YO 5CHIA 4FJJA 3M8PA 5HOOA 4B1VA 4H0VB 3D2FB 1RCHA 1A5WA 4O8KA 1QVFM 5IT9O 2FBVA 4CIEA 2RHKA 1LOTB 1N8RO 3AVBA 4JKBA 1HKGA 2IVNA 2NZTA 2O8EA 3L2RA 2EHGA 3RSEA 3VEYA 5E84A 1NMNA 4CFAA 3OYCA 2VGMA 1W0HA 4IO8A 2OZSA 3O9UA 4CJKA 4HUEA 4E7JA 4CECA 2QWPA 4CK2A 5AQWA 3WT0A 1QS4A 3CCQN 2XHBA 3G25A 4DV4K 4FJMA 3MN7A 2WBNA 3Q7BA 3O8MA 4H4OA 2E6LA 2GEMA 4FM0A 4X65K 4CJ5A 4JK7A 4CJFA 4DU1A 4DS4A 2KQ2A 2VWJA 5GADP 3KKRA 1YITN 1NKEA 4JI5K 3DRSA 1X9JA 1RT6A 2FF3B 1FKPA 3MXJA 3CI5A 4JKHA 4DV1K 3MCPA 4O5BA 4CEFA 1NKCA 1C6VA 3UE5A 1GLFO 4CJLA 2P9NA 2X6SA 3VEOA 4CF9A 4JNEA 4PKIA 1ZBUA 1NWKA 2X78A 1O1WA 5JVHL 3AO2A 3OS1A 3C65A 4JI0K 4ISFA 3TAEA 5FPDA 1RT3A 3S3NA 4B1ZA 4XEIA 4DF4A 1QE1A 2IVPA 1ASVA 3NGIA 3E9PA 3CCVN 4CJPA 2E2QA 2E4LA 4TSXA 4AHUA 1KLNA 1RTJA 4CZKA 3C95A 3N4PA 1ILYA 1QZ5A 4JV5K 4DKWA 5BPLA 4Z4CA 4BE2A 4FPBA 3IKMA 3HPGA 2DFEA 2O8DA 3VQBA 4CZHA 2GWJA 1HJRA 3OBYA 3GE1A 1ZC6A 5M1QA 1U2VB 5J2PA 4FSVA 3T1AA 4QAGA 1K6YA 1T6DA 1T03A 5T7BA 4CZMA 1KAXA 3CMAN 2ASMA 1UA0A 3HVTA 4FJLA 4AHTA 4FJXA 4OKJA 1BWFO 3G4SN 3K0SA 5GAEP 5AQXA 4B9NA 4DR2K 2HHUA 4IG3A 2VGNA 4WQ4C 3KK7A 3L0QA 1F21A 4CCHA 5JS1A 3THWA 5C15A 3THYA 4JS4A 4C23A 4O55A 4B9TA 4GKKK 3OYGA 2QWRA 5KRSA 3QICA 1KAZA 2JWKA 1VQON 2XRIA 2BDPA 1KFDA 4A2AA 2QWQA 1EWQA 1YHQN 2Z1GA 3UB5A 1S9GA 2UUCK 5E41A 4DUZK 4B9LA 2O4IA 3VEZA 3QIOA 1SV5A 4O44A 5EVZA 2W6KA 2NRRA 5BPMA 2QEXN 1J54A 1TKTA 3H1VX 1Q81O 4F3TA 1SKWA 4FM2A 3LM2A 1IG8A 4DMNA 3SQ0A 4FCYA 3P5JA 1DT9A 2IOCA 2E5LK 4H0XB 4RW6A 4KHWA 2NNWA 2UXCK 5HRPA 5JLHA 4DR5K 3H45C 3OJUA 4JK9A 4N5SA 1WBDA 3KK3A 5MLCQ 1GLEG 5DM6L 3HM9A 1TK0A 4DQRA 3LDQA 1EETA 4J2DA 3SLCA 4FWNA 3F9MA 2OCEA 2F4VK 2BUPA 3TSPA 3TAQA 1V4TA 4CEQA 2P51A 2H3GX 1HNWK 4CVNE 1SKSA 3VQCA 3AVKA 3J80O 4NO7A 3M5RA 4DR4K 2V51B 5AQKA 3NE6A 5HBMA 5AFUA 4KFBA 2QW9A 4LSLA 1EXQA 2UUAK 3TSUA 1LV5A 1P8ZA 1SL0A 1RDCA 3CERA 4DLEA 3QMLA 4AHCA 5C12A 2D4WA 4IG0A 3AAPA 3PO5A 4I9QA 2YX6A 1LWEA 4N41A 1YTAA 4CGJA 1L3UA 2YHXA 3C6HA 1S3XA 1RTIA 4H0TB 1S5JA 4RW4A 3EY1A 4M3XA 3VQ5A 5LMUK 4J2EA 3V6DA 3J8AA 3CC4N 2WUSA 3L3UA 4FW2A 3PX6A 2E1ZA 2YNFA 1JCFA 3O6WA 3ULEB 3DXMB 3KIOA 3PX0A 3CJAA 1M1KO 3K58A 3VQAA 1TGOA 1YJNN 5CZ2A 1XHXA 1G15A 4C1NI 1C1AA 3O4WA 4DS5A 4KHQA 3TWHA 1J9AA 3LAKA 3U3YA 5CY4A 2OPRA 2P9IB 4YY3K 4HCBA 3ZLJA 2JGUA 4CGGA 3WQUA 1WSJA 4IEEA 4ZTFA 3V4IA 3ZSZA 4GNIA 4JN4A 2A1SA 3HSCA 3LANA 3LP2A 4EAHD 1NGJA 2Y1IA 2YI1A 4IFVA 1W9HA 4WCEL 5M1FA 2BE2A 2O8FB 1JLBA 3VQ7A 4H4MA 3HPHA 5FPNA 1XC9A 1MWKA 2W42A 2V52B 5AZJA 1EKEA 4X66K 3GG4A 4FLZA 3VF4A 4R79A 5FRNA 4DTXA 5DK5A 5AQVA 1U48A 5CYMA 1IJJA 1LWFA 3A0IX 1GLAG 3KLIA 2HHWA 1RDDA 4KH4A 1SKRA 2O8DB 4Z0UA 1N32K 4BQLA 3MXMA 4K42A 4H8KA 2QWLA 1X9WA 4LFAK 3IFRA 3LPUA 4FZYA 2P9LB 1QSLA 4CK1A 1RDBA 1QQOA 3QDKA 3JYTA 5GIOA 1UAXA 3SAHA 3QEIA 4OKKA 4CJTA 3C7NB 4C8LA 5KGWA 1HPMA 4E7IA 3KVGA 3VQ6A 2ASOA 2BGGA 3TPQA 3DYAA 3ATVA 3E66A 3IUCA 1JLFA 2QWNA 2A42A 2IVOA 3FFKB 1VHXA 2QKKA 3VQQA 2WTUA 3ZEUA 1VQ7N 3J7YP 2VCPA 2VQFK 2D5RA 5TKYA 1CZBA 3IRXA 3P83D 4GY2B 4IJAA 4FWKA 1D9FA 3THVA 1T3VA 3H1QA 3IS9A 4CF1A 4OJRA 4G1QA 4B08A 1VQPN 3VOVA 3MWPA 3NMUA 1IKXA 4DR6K 3ID8A 3LDPA 3WXIA 1UWBA 4IEIA 5JMVA 1VQ9N 3E9OA 3B6PA 5C0YA 3WXMB 3TTFA 3O9TA 3RRHA 4YORA 3HVRA 3CCLN 1LW0A 1S1UA 3M1FA 1G99A 1Z25A 4PY5A 4FWRA 4KAZA 4CJ7A 4NCBA 4CE9A 5HROA 2HMPA 4AHRA 3ZT3A 2P9NB 4CZLA 2G8KA 1NM1A 3ZSWA 3TAPA 3H08A 2FSJA 4JKGA 4CHZA 2NRZA 3T69A 4CIFA 2QXLA 3C6TA 4Q5VA 3CCSN 1DEJA 5AQNA 1HNIA 4CJSA 4M45A 1NGFA 4YHHK 4DSIA 3B6OA 5HRNA 4YDUA 3OYDA 1V4SA 3LP1A 4HTLA 3V9ZA 1SZ2A 2YV0X 1C0FA 1RNHA 4JKEA 1VRTA 2VWBA 3G6EN 4FLUA 4DFJA 2AA4A 2ZGZA 4JKDA 2XY8A 1YI2N 3BDPA 1JLGA 1TVRA 3R9PA 3PIOL 3O9RA 3DXKA 3CM5A 3NF7A 3DAWA 3IAYA 2P5GA 3TAMA 2HNYA 4A5BA 3LZIA 1MDUB 1VSHA 4FLXA 1NLVA 2BTFA 4A2BA 2HMIA 5AQIA 4CEAA 4CZEA 4LFBK 3EE9A 2Q1NA 1YVUA 1MA9B 1EO1A 3HO1A 3EZWA 3FR0A 5CE3A 1NGEA 3KJVA 5LJWA 1Q82O 4LF4K 3VA0A 4MDBA 3HPOA 3TSQA 1BQNA 3HBTA 2YHWA 4I6MA 3LWLA 2O4GA 1WSHA 3SQ4A 3SI6A 4EZ9A 5FLXO 1QQCA 4F4KA 4IOCL 4M3UA 4BE1A 5LL6Z 3TTCA 4AF1A 3F5TA 3K5LA 3EEQA 3P4IA 4NLBA 5EX5A 1NGHA 1IBLK 5DM7L 4J2BA 1W97L 4Y1DA 1I39A 2ZM6K 1CZ9A 4QOZB 3NVMA 3OYBA 4UQGA 3TANA 5H1SQ 1OVQA 1VAZA 4NLCA 1FKOA 4FXDA 3VERA 5GAGP 2EWSA 3OVNA 4DFPA 1VQ4N 1KFSA 4JAXA 2UYTA 3LDOA 3SUQA 1QQNA 3T7ZA 2GV9A 2GBZA 1VQ5N 4GW6A 2GX9A 4O8UA 1NGAA 4NCAA 3DM2A 1NKBA 2PY5A 1S1TA 1HKBA 2B5JA 3ZX2A 4BWMA 3QINA 3OYKA 1XI1A 1U45A 4BRQA 3VQDA 3VQ8A 4LY7A 3CCUN 3S3OA 2FXUA 1VSDA 4Z94A 1NK9A 4Z4IA 4KH6A 4CJQA 4JI3K 4A61A 2P9PA 4EP4A 1OH7A 1X3NA 3LZJA 3P31A 4BRKA 3ZSOA 2Q36A 1KRPA 4E1NA 1RBVA 3I8DA 4JYAK 4KKOA 1NJWA 3O1WA 1WSEA 3DOKA 2B4JA 2DPNA 1K8AO 1WSIA 1ITGA 4CFDA 2NRWA 1VSIA 3D0PA 1BQMA 3SV4A 2OPQA 1MU2A 3SPZA 2FC0A 3QBWA 3J81O 3L3VA 3OYNA 5KPRA 3L6QA 4CZFA 2Q97A 2D0AA 3NF6A 1EWRA 1U47A 4FK4A 3BZCA 5AQUA 4N47A 3MWTA 3CIPA 1ZBHA 1XQSC 4BROA 3FE1A 4B9QA 3VEXA 4E7HA 2IC3A 3E1YA 1DTQA 3DJCA 1C0TA 3THXA 3LL3A 3L2WA 3CJ1A 4DSFA 3D2FA 5AQYA 4BC5A 3OS2A 3PIPL 4JHDB 4IOXA 4I7FA 3LALA 4DFKA 4FW1A 4RW8A 3SNNA 1HJOA 1I94K 2YHBA 4QCLA 1NOYA 1CLQA 4DF8A 5LJVA 5KPZA 3L2UA 3V9WA 1BDGA 2P9KA 1TUUA 1YTUA 1VSEA 2KZMA 4OX9K 4MO4A 3G10A 3S9HA 1TK8A 4LF6K 4H0OA 4FK0A 2P9IA 3EKUA 3LP0A 4DU4A 1NK6A 4N56A 1TKDA 2E2OA 3J7AP 4H5TA 4Y0WA 4DR3K 1GOBA 3WNHA 4E7LA 1Q8IA 1N34K 2UXBK 1RGIA 1TKZA 3FZLA 2JWLA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5H1S Q;  3I56 N;  5GAG P;  3CXC M;  1S72 N;  1OVY A;  1VQK N;  1VQ4 N;  1M90 O;  1VQ5 N;  3CCS N;  3CCV N;  4IOA L;  1Q86 O;  1ILY A;  1Q7Y O;  4UY8 O;  3CCE N;  3CCU N;  1QVF M;  1KC8 O;  3J7Z O;  1VQN N;  3CME N;  3CPW M;  3G6E N;  3CCJ N;  1N8R O;  1VQL N;  1NJI O;  5GAH P;  1YI2 N;  1YJW N;  3G71 N;  1VQM N;  3CCR N;  3CC2 N;  3PIO L;  4WFA L;  1K73 O;  2ZJQ L;  3CC7 N;  3CMA N;  2ZJR L;  3CC4 N;  1JJ2 M;  3G4S N;  1K8A O;  5GAE P;  3CD6 N;  4WFN L;  3OW2 M;  1YJ9 N;  3CCQ N;  1VQ7 N;  1VQ8 N;  1K9M O;  1M1K O;  1VQO N;  1KQS M;  1Q82 O;  3CCM N;  1YJN N;  1YHQ N;  2QA4 N;  2QEX N;  3DLL L;  1VQP N;  5GAD P;  3CF5 L;  1YIT N;  1Q81 O;  4IO9 L;  1KD1 O;  1W2B M;  4WFB L;  3PIP L;  4IOC L;  1VQ6 N;  4U67 L;  5HL7 L;  2ZJP L;  1VQ9 N;  1YIJ N;  2OTJ N;  3CCL N;  4WF9 L;  5JVG L;  2OTL N;  5DM7 L;  4WCE L;  3I55 N;  5JVH L;  1QVG M;  5MLC Q;  5DM6 L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MX2 A;  2AJQ A;  3WQT A;  4B9S A;  1S72 N;  1OVY A;  1WLJ A;  1Z26 A;  4B3M K;  3FZF A;  4RTF D;  1CXQ A;  3MN9 A;  4DLG A;  3MXI A;  3FZK A;  4AM6 A;  3RR7 A;  5J2M A;  1WSG A;  2NUB A;  2KFZ A;  1HX1 A;  5AQT A;  1NGD A;  4MLH A;  3RVC A;  4A5A A;  1NK7 A;  3OYL A;  3UIQ A;  2O8C B;  1FK9 A;  3KLG A;  3K9J A;  1X9S A;  1LAW A;  4KB1 A;  3P39 A;  3KD5 E;  3ENB A;  1H1V A;  3RWU A;  2A1R A;  3CHW A;  3H6E A;  4BGB A;  3HST B;  3OYM A;  1ATS A;  5AZI A;  4BC2 A;  4MO5 A;  3WXK A;  4WQ5 A;  2E2N A;  1LWC A;  1QQM A;  1JLA A;  1GLD G;  3QEV A;  1NMD A;  2DFF A;  2HF3 A;  2XO7 A;  3L2Q A;  3OJS A;  2QK9 A;  2YNG A;  1GOA A;  2G8U A;  2ZD1 A;  4DTN A;  2UXD K;  1LW2 A;  4O0J A;  1C0U A;  4OO1 J;  3AVG A;  3BP8 A;  3V1O A;  1IKV A;  1JCG A;  3T1H K;  4EFH A;  1HQU A;  4W5N A;  3CCM N;  4M3R A;  2OZM A;  4KHS A;  2F9T A;  4GKJ K;  3SMP A;  1IV0 A;  4DTO A;  2FBX A;  1GOC A;  3I8B A;  2P9S A;  4WQ4 A;  1RBS A;  4BRL A;  3OA9 A;  3K2P A;  4CGF A;  4ID1 A;  4B9U A;  2PBD A;  2E88 A;  3RMA A;  5AQS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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