3CCQN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation a2488u
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 48
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccqN00
3G4SN 3CC4N 3PIOL 2OTJN 5GAGP 3CCMN 3PIPL 2ZJRL 1M1KO 4WCEL 3CC2N 5JVGL 5MLCQ 5DM6L 1KD1O 1YJNN 3I55N 1YI2N 1OVYA 3CMAN 1VQKN 1VQLN 1VQ6N 5H1SQ 1VQMN 4WFNL 1S72N 3G6EN 5DM7L 1VQPN 5GADP 1W2BM 1K9MO 3CPWM 1VQON 1YHQN 1M90O 4IOCL 1KC8O 3CF5L 3I56N 3G71N 4U67L 1Q7YO 4IO9L 1NJIO 1QVGM 4WFAL 1K73O 4IOAL 4UY8O 3CCJN 2ZJQL 3CXCM 1VQNN 1VQ9N 1QVFM 3CD6N 1YJ9N 3J7ZO 1YITN 3CCVN 3CCRN 1VQ7N 3DLLL 3CCSN 1Q81O 1VQ5N 1VQ8N 2OTLN 5HL7L 3CCEN 3OW2M 1JJ2M 1KQSM 5GAHP 3CCLN 5JVHL 3CCUN 2ZJPL 5GAEP 1N8RO 2QEXN 2QA4N 1ILYA 4WF9L 1K8AO 1VQ4N 3CMEN 3CCQN 3CC7N 1YJWN 1Q86O 1Q82O 4WFBL 1YIJN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BI4A 1BQMA 4HUGA 1TYQB 5KI6A 4HHTA 4JD2B 3TAQA 3DOKA 5AQNA 3HI0A 5MLCQ 1BISA 4BRHA 1BA1A 1OVYA 3BF3A 4CEQA 3CJ7A 3OS2A 3QEWA 4ICLA 1QQMA 2W42A 2YV0X 3ZT4A 1K8KA 1N5YA 3HJFA 3EE9A 3OVNA 1RT4A 5AQXA 2O8FB 1RT7A 4DTSA 4JD2A 3L2RA 3D0PA 1WBBA 3OYCA 5AQMA 1NJYA 4DF8A 1YHQN 2NNWA 2PBDA 2ITMA 3IRXA 3CF5L 2GWKA 4PKHA 3G0ZA 1MWKA 2FXUA 3ZEUA 2IC3A 4KV8A 2KTQA 1QTMA 4DFPA 3G25A 3CFOA 3DMJA 2QWOA 3L2QA 1NGCA 4BWJA 3H6EA 4KI6A 2X78A 2JWKA 1NMDA 3CFPA 2X6NA 2IGIA 3SQ4A 3MWTA 4CESA 4DTNA 3L2VA 1YJ9N 1G15A 4C8NA 3FZLA 5AQVA 2OANA 4CFAA 2VWBA 3CCRN 2XY6A 3CCSN 4MDAA 3ZT2A 3OYAA 3V4IA 4OJRA 4H4OA 4CJUA 4KTQA 4DLGA 1GOAA 2YHXA 4C1NI 3F2KA 1MWMA 3VEZA 3O5BA 3VQPA 5BN8A 1Y97A 4H0TB 1BHLA 3KLIA 3V9ZA 2AA4A 4HCBA 1NJXA 3O9SA 1E4FT 4KPYA 1HUXA 1BUPA 3NDKA 1Q9YA 1I3AA 5HRNA 3B6PA 3MEDA 3ULEB 4DR3K 4BVOA 5KQDA 3ID6A 4OVLA 4A61A 2BE2A 1TAUA 1QHAA 3OY9A 1WAJA 3CC2N 3L8BA 4FWPA 1NK6A 4N5SA 2OYQA 2PZSA 3ITHA 4YOXA 4FVUA 3ULEA 3RR7A 1S1WA 3P1GA 5AQOA 3ATUA 2QI2A 2HF4A 4JI8K 1DGKN 3OYDA 3RMDA 4LFAK 3V81A 1QZ6A 4XIUA 3M1FA 1NK9A 1BQNA 4BR4A 4A57A 4JV5K 1LWCA 3NH1A 3IAYA 5AQQA 1NGEA 3DLKA 3IMXA 3NF9A 2JLEA 3TAEA 2W6LA 1HNVA 4Y0WA 3BZKA 4BRNA 4A2BA 4CZEA 5CY4A 1YTAA 3V9UA 1RT5A 4CK2A 2YNFA 3L4QA 1YTUA 5LY3A 3DRRA 3NVMA 1IV0A 5F2RA 3TR8A 1WN7A 3LPTA 3V1QA 4CJTA 4IO8A 5J2QA 1RTJA 1HQEA 4GKJK 4DUYK 1VQNN 1VQ9N 2VG5A 1V4TA 4OGEA 3J8AA 5EX5A 4JI0K 4PL7A 4NXNK 2HNZA 1OH6A 4XEIA 1DTTA 1T03A 2OZMA 4JI3K 4M3ZA 2Q3SA 2V51B 4E7JA 3QEPA 4FJGA 4CHQA 2NRXA 1S9EA 3VA0A 2HB5A 3NF7A 2E1ZA 2ZJPL 4DV7K 4E0DA 3NF8A 1TV6A 1OVQA 2E88A 1NK7A 2QEXN 2ZQBA 2YNGA 3AA4A 3AAQA 3EN9A 5LMUK 1HMVA 4NXMK 3PX6A 4B9QA 4DR7K 3MEEA 4CK1A 1VQ4N 4QOZB 2DFFA 3ZETB 4CECA 1GOBA 1KAYA 4JKDA 4ELVA 3OJSA 2I7NA 3LPUA 1Q86O 4DQRA 1NK8A 1JLEA 3NF6A 3I8DA 3G10A 4CGDA 3LANA 5LJWA 4Z0UA 3CC4N 1E4GT 4FPBA 3FZFA 4JKHA 4LSNA 4DV0K 4FZZA 4ID1A 3SYZA 3ZETA 3V9XA 1HNIA 1J54A 3AARA 4CGFA 2OPQA 1QQCA 1VQ6N 2IVOA 1J53A 1JCGA 3AGKA 1S72N 4JKAA 1KFSA 2GELA 3G6EN 2ZWHA 1FW6A 3C95A 4XH1A 1RTHA 3HSCA 4FJKA 4CD3A 2B6AA 3HSTB 4DF4A 3CPWM 2FF3B 4BRLA 3T1HK 1HKCA 1QZ5A 4KREA 5AQZA 3ZCMA 4B9MA 1S5JA 4KB0A 2YJFA 1DLOA 1CZAN 3TABA 4RCHA 4CIGA 3OYJA 1NJIO 3FZHA 4M3XA 3O3GA 3HPOA 3M8QA 3TPQA 2G8IA 2ZGZA 1DEJA 1TL1A 4KHWA 1WBDA 3PO5A 4IOAL 4MFBA 5E26A 4IJNA 1VSFA 3FGUA 3M8PA 4CHOA 4Z4GA 3VQ5A 1NOZA 4LC9B 4EZ9A 5JMVA 1X9JA 4B1ZA 1JLBA 1JXEA 3QESA 1XMOK 3MCAB 1VQ7N 1NLVA 1X1PA 2BDPA 4FJLA 3KK3A 1QSYA 4X62K 4F8RA 5BRDA 1VK0A 1ASWA 5EU7A 4FW1A 2P1JA 4CERA 4E1MA 3LDNA 3U8XA 1N8RO 4DSLA 2QA4N 1KVBA 1RT3A 2VYPA 4WQ4C 1U45A 1K8AO 1X9MA 5E84A 4FJ7A 3ULDA 3C6UA 5A2QO 2NZTA 1RDCA 2NUBA 3Q7BA 2E4LA 4AHTA 5C42A 2RN2A 2HHVA 4JKEA 4H5WA 4CF1A 5FDLA 4CZHA 4DQIA 4B9LA 3GDQA 3KD5E 3L4IA 3D7EO 2WUSA 4DQQA 2P9IB 5JVGL 3BUZB 4JHDA 1VSJA 2KLAA 3KZBA 1XI1A 3RR8A 4OLAA 3ENBA 1WLJA 2WOMA 1QQNA 5H1SQ 4BWMA 2CGKA 3TAFA 1XNQK 2JWLA 4CZGA 1RTIA 2Z1IA 3CJBA 5J2PA 4DKWA 4HWIA 4CZKA 1QHTA 4MLHA 2P5OA 2P9IA 4FJHA 4FLUA 1JLFA 3P4IA 1K9MO 4DR4K 4IEIA 1MU2A 4CF9A 4M3UA 1KVAA 3DLGA 2P5GA 3P5JA 1YVUA 3BZCA 3I56N 2D0CA 3A2FA 3FR0A 4MDBA 1S1VA 4BRQA 4X64K 3ZSOA 3ZSWA 2G8WA 4HCCA 3KVGA 3KLEA 1D5AA 1NM1A 2HMPA 5C2FA 4GV3A 4CJVA 3VOVA 3I33A 3QETA 3LZIA 4MQ3A 4NCAA 4L8RB 2P9PB 5CR4A 1IBLK 3K2PA 3THYB 3HOTA 1KFDA 2X74A 4A5BA 1QVFM 1VSDA 3J81O 3LP3A 4RW9A 4BGBA 3CERA 4BRGA 3O4WA 4K0KK 4YOTA 2O8BB 3UE5A 2ZE2A 2KW4A 1Q81O 2P9PA 1D9FA 5TKYA 1IG9A 5M1QA 1UAXA 4LFCK 2P9KB 3CHWA 4DV5K 3THYA 1J5OA 5FLXO 2HBJA 4KH5A 4B3RK 4A5AA 4FLWA 1C0FA 4JNEA 4IJAA 3VTIA 3RWUA 4NO7A 2O8BA 3DAWA 4K8XA 4BR5A 3EYZA 4EFHA 3VQBA 3OBYA 1HNWK 3M8SA 4WF9L 2P9KA 4J2BA 1JCEA 3U9ZA 5BPMA 2YNIA 4X65K 3HPGA 2VWKA 3N4QA 5BR8K 4KTZA 1QSSA 1YUWA 4BRAA 1XNRK 3M3ZA 3QEVA 4GMJB 4JKFA 1GLJO 1RDDA 1ATRA 4NLBA 3G4SN 1W0HA 5C10A 1LCUA 4DSFA 4LF7K 4AHSA 3KLFA 3KWIA 2E6LA 2P9SB 3EZWA 4DCHA 1KD1O 3M5RA 3AV9A 2HHHK 4CHYA 3VGMA 1ZBHA 5DMRA 3PX0A 3CM5A 1ASVA 4BQZA 3P38A 5M1FA 1NBWA 1R59O 5AR0A 3RSEB 5DM7L 1VQPN 4DWIA 2WBNA 1W2BM 1T44A 4A62A 3BDPA 1ZBIA 1HYZA 3TI0A 2B4JA 4JK8A 3A5LC 5BRFA 4BRIA 4H0VB 4M41A 4IOXA 3U9DA 1VSIA 3WNHA 4KHUA 3AAPA 4B8CA 4PKIA 2FSJA 3NBPA 3TARA 5CHIA 3T19A 1DT9A 3L0QA 3DLRA 3VQ8A 4BRDA 3A0IX 4FWMA 1UOCA 3MWPA 2QKBA 2VGNA 1TK8A 3C7NB 1IBKK 4N41A 2QWRA 2J4RA 5M1OA 1N32K 3AO1A 4B3TK 3DLLL 2I5JA 4YOUA 2E2PA 4LFBK 1VQ5N 5AQGA 4JS4A 3OW2M 1BCOA 1ZBUA 3AO4A 4PA1A 3NVKA 3C7NA 5GAHP 1XMQK 3DRPA 5JVHL 2ZGYA 1QSLA 2F8SA 1EETA 4H0YB 2QWQA 4FCYA 3L2WA 2YHYA 4RWTA 5EVZA 1JL2A 2VWJA 2QW9A 2KFZA 2GBZA 1L3TA 3B6OA 4LF8K 3L6QA 3SUPA 2D1KA 4JLHA 3GBTA 3IDHA 1VSMA 5AQTA 4FJNA 3DI6A 4FO0A 1TK0A 3VEWA 1RCHA 4J8FA 1ESVA 1NJWA 3BP8A 3K59A 4G1QA 3PIOL 4CJ3A 2QXFA 1L3UA 4AHUA 3OYNA 3DJCA 4CEZA 1C1BA 4CGJA 1YJNN 1BI4B 3NH0A 4BY9C 3MCPA 4O8KA 1EXQA 4DMNA 3MN7A 1XC3A 1EKEA 1LW0A 2CH6A 2UXCK 2CGLA 3AVIA 5HRSA 3LDQA 5J2MA 4K25A 2XHBA 1K8KB 4LH4A 4CJFA 3VQDA 2Y1JA 4AQYK 2YI1A 4KBOA 4CF2A 3P31A 3AA2A 4FPAA 1BIUA 4BC5A 2O8EB 3G71N 1REVA 5HP1A 2UXBK 2NRRA 4OPHA 4M3WA 2A1SA 3RRHA 2OPSA 1HQUA 2QXLA 4ELUA 4M7XA 4B1XB 5JLFA 3WXIA 2AP1A 3ZEUB 4JK9A 3VGLA 4FM2A 4CJLA 1Z25A 4ZTFA 4CF8A 3TAPA 2O8EA 4M3TA 1Q18A 1S1TA 4CHPA 4IDKA 2WTUA 4DV1K 4GNIA 3ZT0A 1NK0A 3V1RA 1JLAA 4YOWA 3QEIA 1B9FA 4O4GA 3TTFA 3RMCA 3VN5A 2FBYA 2UYTA 1VRUA 4FOIA 4K42A 4DU1A 1HX1A 1TKXA 1VQ8N 4IZ9A 3OYIA 4H0XB 1GLLO 1TL3A 3O9UA 3VQAA 4FJ8A 4JS5A 4EAHD 2HBLA 3CCUN 4WQ4A 3V6DA 1KAZA 2FSNA 3NMUA 1J6ZA 4CE9A 5BR9A 3LP2A 3SJJA 3THWA 1FJGK 2D0AA 4GV6A 1BU6O 3CMEN 4RTFD 4Q5VA 1EX4A 5KPTA 5BPLA 1YJWN 1QQOA 2Q36A 1YIJN 3AVMA 5J1EA 1CZBA 1BOTO 2V52B 2HNYA 3ISNC 3TSUA 1V4SA 3I55N 4FZXC 3HZ6A 5AQSA 3VQQA 3QEXA 4KHYA 1VSHA 4BDZA 2WONA 4LH5A 4FXDA 1R0AA 5FPNA 5AQFA 3SQ0A 3LDOA 2GTDA 4CW7B 4KRFA 2QM1A 1S6QA 2FC0A 1ITGA 2O4IA 4DG1A 5KQ8A 4DV4K 4G9ZA 4KHNA 3LM2A 3O80A 3AO3A 4H4MA 1VQON 1C0UA 4M42A 3S3NA 3AVNA 1NKEA 4OPJA 3SUOA 4PWDA 3WXKA 4UQGA 4QS7A 1T6CA 2JGUA 4OPKA 4B1VA 3LWLA 3AVJA 2IIRA 3CG7A 2PYJA 1DKGD 1WSIA 3DWLA 1C0GA 3O9QA 2R7YA 4DV6K 4FM1A 5I42A 4TSXA 3OYHA 1ATSA 3CJAA 3SV4A 3SBTA 5HOOA 3SZ2A 4QS8A 3KWGA 1KAXA 2HVHA 3TWHA 4I9QA 4DTUA 1A5WA 3QB0A 4W5RA 3S9HA 2E5LK 2DFHA 4ELTA 2A42A 3U4LA 4FLTA 4DFKA 1YITN 3SAHA 1YAGA 2D0PA 1RDBA 3V9WA 4DFJA 3QFPA 4DTXA 3OS1A 3MMVA 1Q9XA 3TANA 3SUNA 5KTQA 3OYFA 5AQKA 4CJWA 4GV9A 5GAEP 4IG0A 3P39A 3C6TA 1D9DA 3ZSZA 3LM9A 1S1UA 4E7HA 1X3NA 1KCFA 5ELZA 3E9LA 4E7IA 2RF2A 3NHGA 3DYAA 1NGAA 2QWPA 1LAWA 3K5LA 3CCQN 3DXMB 3O4NA 4BQLA 2Z1HA 2YNHA 1Q82O 3CETA 3EEQA 2ASPA 4PUOA 1GLAG 5AZJB 4BRCA 3J80O 4FJXA 3VESA 4CJPA 3AVCA 3H3NO 4BR0A 3BEXA 3HP6A 1SKWA 4CIFA 3DXMA 3KTQA 3MN5A 1HYSA 3THVA 3VQ4A 1GLCG 5AZJA 3MDQA 4CHNA 3LP1A 3WT0A 1HJOA 3JAMO 4E89A 2DTUA 2F4VK 4IDHA 3EZ5A 3WXMB 3KIOA 4LF6K 2E6MA 5FRNA 2A1RA 4MLEA 1YVNA 3K5OA 2UUAK 4DSJA 2OCEA 2RPIA 3VEXA 4DUZK 3OTOK 3SMPA 4AHCA 4ZHRA 3DLEA 3E01A 3LP0A 3A5NC 4E1JA 2F8TA 4LF4K 4B08A 4WFAL 1N36K 1RBTA 2Q0UA 5E41A 3CCJN 1X9WA 4MO5A 5HRPA 3TU5A 1ATNA 4J2DA 3P83D 3CD6N 4PY5A 1HPMA 4H5VA 1WB9A 1HNXK 1ZBLA 1FKOA 3RMBA 5ADXH 3SJHA 3MN6A 1RT6A 1RDUA 1XQSC 1X3MA 4CJSA 4BR7A 4BR2A 1NGGA 3ZX2A 5AJ3K 4FYDA 1SKSA 4KTWA 3OA9A 4M45A 5F1XA 3BY5A 4CJKA 1K6YA 3T7ZA 4BR9A 1NG9A 4ID5A 4E1NA 4DTOA 4O5BA 4OKEA 4DQ8A 1SL2A 4B9UA 5AFUH 3ZSQA 1CXQA 4KHSA 4AM6A 1B92A 3PSIA 1LOTB 4I2PA 4JKCA 2Z1GA 4NB4A 3AVLA 2YHAA 3DM2A 1RNHA 2KQ2A 5KGXA 4JYAK 4Z4EA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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