3CCQN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation a2488u
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 48
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccqN00
3I56N 4U67L 1QVFM 3I55N 1Q86O 3CCEN 3PIPL 1VQ9N 1S72N 2QA4N 3CCSN 3CCQN 3CCMN 5JVGL 4IOCL 3CMAN 1VQPN 5GAGP 1YJ9N 1KC8O 1Q7YO 3G4SN 3DLLL 4WFAL 4WFBL 3CPWM 1YITN 1YI2N 3CCLN 5GAHP 4UY8O 1YJNN 1K9MO 3CCRN 1N8RO 5GADP 1YIJN 2QEXN 3CD6N 1JJ2M 4IO9L 2OTJN 1KQSM 3CC4N 2ZJRL 2OTLN 1VQ6N 5JVHL 4WCEL 1VQLN 4IOAL 1M90O 5HL7L 1QVGM 3CCJN 1W2BM 1K8AO 1Q81O 1M1KO 1VQON 1OVYA 2ZJPL 1VQ4N 1YJWN 1VQ7N 1ILYA 5DM6L 3PIOL 5DM7L 3CC7N 1NJIO 1VQ8N 3CCUN 1VQ5N 3CCVN 4WF9L 1KD1O 1VQMN 3CMEN 5GAEP 2ZJQL 1VQNN 3G6EN 3CXCM 1K73O 3CF5L 5MLCQ 5H1SQ 4WFNL 1Q82O 1YHQN 3OW2M 3G71N 3J7ZO 1VQKN 3CC2N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N5YA 3CJCA 3I56N 1NJZA 1VSKA 5EOYA 4ILJA 3QIPA 4CHZA 2CGLA 5HOOA 1Q9YA 5AQVA 4IEIA 3OYFA 2HF4A 1ASVA 1R0AA 1RT2A 4G9ZA 3TAEA 5AQRA 4B8AB 3E9OA 2KZZA 2YKMA 1GLEG 3EKUA 4PKGA 5JVGL 3CQXA 1Q9XA 2OPQA 1BG3A 3KK1A 3L0QA 3CPWM 2PYJA 2IIRA 4QCLA 1TKXA 2YHWA 4PKHA 4Z4EA 2G8HA 4DV6K 1N8RO 2NRVA 3R3LA 1RT1A 3EZ5A 1DGKN 3EE8A 1GLJO 4RWTA 4BC5A 3ZT1A 1KQSM 4IO8A 3CC4N 3A8YA 3HVTA 3MDQA 3QFPA 1ZBSA 1DKGD 1XI1A 1B92A 3FZMA 1NOZA 3TANA 1C0UA 3LP3A 3VQQA 1S5JA 3EEQA 4FJNA 1FKOA 4BGAA 1KTQA 5C42A 5HL7L 3C6TA 4FLXA 2P9NB 2D4WA 3NCIA 3LALA 1NGIA 4J2AA 3MCAB 3K9KA 4DTRA 3T1HK 4FWMA 1WOQA 2VQFK 3R9PA 2HHXA 4MO4A 4DSIA 1TAUA 3VQEA 4G1QA 3CCVN 4E1NA 4DWIA 4EZ9A 1RDCA 3ID8A 2RPIA 4B9UA 4TSXA 2KFZA 3L8BA 2F96A 4LY7A 4FPBA 4XH1A 3ZX0A 3P39A 2DFEA 5KQDA 4CZJA 3G6EN 5FLXO 4W5NA 3ZT3A 4CJRA 4IFVA 1K73O 3CF5L 4DQQA 4DFJA 4OLAA 3R6MA 3K59A 5H1SQ 4AQYK 1WBDA 1XUPO 1FW6A 2NLXA 4CEQA 4I9LA 4MDAA 4I9QA 1NK6A 1U48A 4BR4A 2NRWA 3Q7BA 4N47A 4C8NA 1S9EA 3ZX3A 3THWA 3DLKA 4FM2A 3TABA 3GDQA 4NXNK 3OYJA 3KZBA 5DK5A 1NGDA 3CCQN 2XY6A 4XIUA 4IOCL 1O13A 4H5NA 4CVNE 1SQKA 4BDPA 3PO4A 1QSYA 1U4BA 3PSFA 3VEYA 4FJ9A 5TKYA 4BWMA 5LJWA 4UY8O 1U04A 1HX1A 4JS4A 3O6WA 1HR0K 4EP5A 3SUPA 4CJ5A 1SL0A 1ZBUA 3V1OA 3HPOA 3THYA 4Z4IA 4GKKK 4BC3A 4B1VA 3KIOA 3KKRA 1Y97A 1CZAN 3KTQA 3RRHA 4FPAA 2G8FA 4M63C 2KKZA 4FOIA 4JD2A 5GINA 2WTUA 4B9MA 4ISFA 5AQHA 5C12A 1IKXA 3QLHA 4LH5A 3E1YA 4BRIA 4I2PA 1Q81O 1K8KB 4DV7K 2ASOA 1N36K 4HCCA 3VQDA 2GBZA 4FM0A 2GX9A 2NRRA 5AQSA 1ZBLA 4MO5A 1QS4A 5HRPA 4IZ9A 4CJ7A 1RTHA 3VENA 4CJ3A 4DR1K 1NJIO 4MFBA 4BRQA 3OY9A 1L3UA 3CPEA 3QICA 5F2RA 3QDKA 4BRCA 4OPJA 4CK2A 4Z4GA 3FZLA 5BN9A 2YHBA 3LDPA 4H03B 3N4PA 3SQ2A 4GKJK 1U49A 1VQNN 5CZ1A 2O8DB 1GLLO 3IFRA 1ESVA 4DG1A 3VQ5A 4F9OA 3NE6A 4WFNL 1X3NA 2QXFA 3AVKA 3FLCO 4CCHA 2E4LA 1VAZA 3K5OA 2Z1JA 3QO9A 5JICA 2BE2A 3ULEA 4AM6A 4CZLA 3F5TA 3R1XA 3IG1A 3ZYYX 1NU0A 3O4NA 2RF2A 3MEEA 3WEEB 2E88A 4Z4CA 3DRRA 3VEXA 4OPHA 1A5XA 3GE1A 3HPGA 4OPAA 3IKMA 1X9WA 3V9XA 4GVMA 2WONA 4KH4A 4FYDA 4CEFA 1W7AA 4EHTA 1U45A 3RMDA 2HVHA 3VF6A 4HWIA 2VWJA 4H0TB 5E84A 2Y1IA 4QS9A 2A1RA 1C0TA 2D0OA 3IUCA 4HHTA 3PX0A 1LWCA 2FXUA 4J2EA 4CZGA 5AQWA 4KH5A 2GTDA 3ZSXA 3ZSWA 3EYZA 1TYQA 5BPLA 3ATUA 3RVCA 5J2NA 4DF8A 2CGKA 4PA1A 1VSDA 4IO9L 3C6HA 4O55A 3OYKA 4FWOA 3DLHA 3THVA 3QBWA 4JI1K 4AF1A 3DYAA 1C1AA 2W6KA 4FM1A 2YX6A 4BROA 4JKEA 2HNYA 1M90O 3TSQA 3FGUA 1D9DA 2Z1HA 3QEWA 4HUGA 4EIAA 4CIEA 4AH9A 4CJWA 1SL2A 1IG8A 4C8MA 3DAWA 4L8RB 3D2EA 4CJQA 3MK6A 1YTAA 1NGEA 2B6AA 3QETA 4O0JA 1TK5A 1HJRA 2CH5A 4ZTJA 4B3RK 1LAWA 5JLHA 4RW8A 3CI5A 3CFOA 3J7AP 3L6QA 1Q18A 2A3ZA 5CZ2A 3MWTA 4LF7K 3LZJA 3AO2A 4DFPA 2YHAA 1NK8A 2HBLA 4XEIA 4O8UA 4FXDA 1GLBG 4K43A 5HLFA 4IDHA 5MLCQ 4ILHA 3D2FB 2O8FB 3DLGA 1JCEA 1EQYA 2P9NA 5HRRA 4FK4A 3NBPA 3QINA 4DV4K 2ASMA 2KHOA 1RBUA 1QQMA 4RW6A 4Y0WA 2W40A 1GLFO 5AZIB 5KI6A 4C1NI 3I55N 3HPHA 3O9SA 4F2SA 4CJUA 2PAVA 1T6CA 4LSNA 4FWQA 3VF4A 4CF8A 4DQRA 4DUZK 4C8LA 1ASUA 3SQ4A 3LDNA 3DLEA 2FLOA 3GBTA 5SWMA 2IAJA 3F73A 1YJNN 2UXDK 2GUIA 1JL1A 2O4IA 3VQPA 4M7YA 3PV8A 4PY5A 4NCBA 4W5TA 1VSEA 1UWBA 3CD6N 4CF2A 1X9JA 1BQMA 2JLEA 3AARA 3ULDA 4N5SA 3UKRB 3AVCA 4GW6A 3AAQA 2YNHA 3CG7A 4IDKA 3AA4A 2I7PA 3AA5X 3VQAA 2Y1JA 2BTFA 4AHTA 3QBXA 4WCEL 3SZ2A 3KD5E 4ISEA 4AM7A 4BDZA 3HOSA 1EX4A 3VGLA 3LDLA 5AQQA 1YAGA 5C10A 2G8KA 2XY8A 3VQ8A 1NJWA 1KVAA 1OKJA 4CERA 4JKAA 2P9KB 4CD3A 3SUOA 1IKWA 2E2QA 3CYMA 3A0IX 4FLUA 3LDSA 5C25A 1WSJA 5F1XA 1W9HA 3QEIA 4DU3A 2E2OA 1QZ5A 5J2MA 1XQSC 4B8CA 1GLDG 3I0RA 1Q82O 1T6DA 4DR3K 2X6SA 3KLHA 4JYAK 4CHQA 1HYVA 3DOKA 2P5GA 2VWBA 1WUAA 5AQXA 3FZFA 4JLHA 4BACA 4RG8A 3V9UA 2YJFA 4MLEA 3O08A 2X6NA 4RCHA 4BGBA 2UUCK 4LC9B 3KK2A 4Q0BA 1Q86O 3PO5A 3O3HA 1HNVA 1ATRA 4NYFA 2QA4N 1QHAA 2BUPA 3M1FA 4X64K 3AVGA 2J4RA 2IS3A 3QEXA 4FWRA 1NGHA 1BI4B 2O8EB 3K5MA 1HRHA 1QQCA 4O0IA 4M3YA 2QWQA 5M1PA 3SCXA 4YDUA 4WFBL 2O8DA 4OKEA 3TTDA 3QFUA 1IV0A 3O9RA 4I7FA 1NGJA 1NMDA 4FSVA 4BRDA 2ZWHA 3MXIA 1D5AA 3HJFA 4A57A 3KK7A 4DF4A 1N32K 4YOWA 1NM1A 2Q3SA 4B9VA 4LFBK 3EKSA 2OTLN 4DR6K 4MLHA 4CF9A 3EN9A 3I33A 3B8AX 3N4QA 4KV8A 3AVBA 4CW7B 5J2QA 3D45A 3HBTA 3NHGA 3AVJA 1RTJA 4JI4K 3CCJN 3KJVA 1EETA 3SJJA 3V9WA 3WXMB 4BRKA 4CEBA 4JKCA 3ISNC 3OTOK 1HNXK 2BGGA 2NRHA 4JKBA 3QEVA 1NNEA 4EZ6A 1LWFA 1P8ZA 2NRTA 3H45C 1H1VA 1WNSA 5DM6L 5BPMA 4LF9K 1IBLK 4JKGB 4A2AA 4H5TA 1VQ5N 4M3XA 2IVOA 5JS2A 3TAGA 4DV1K 4CIFA 3NH2A 3SBTA 2W6LA 4HVJA 5LL6Z 3TR8A 3E9PA 4DLEA 2B4JA 5KRSA 3HSCA 2GWKA 3SV3A 3OS1A 3O5BA 1OH8A 4CEOA 4CJLA 4IBNA 1Y64A 1ZBHA 3VQBA 4DSEA 2CH6A 4JEPA 3VN5A 5BR9A 2YV0X 3IDHA 3PLAA 5AQOA 1MWKA 3V9SA 5LMUK 3KWGA 2F9TA 2I7NA 4LF5K 2QI2A 5AQMA 1RDAA 1VQPN 5GAGP 5AZJA 4BE1A 2G8VA 2OA8A 2YHXA 1S1WA 2QWMA 4WQ4C 5CYQA 3ZETA 2V52B 2O8FA 1XMOK 4PL7A 1UAXA 1QSLA 3T1AA 2QEXN 3ZSVA 4CF1A 1MA9B 3VQ4A 2Q97A 1BQNA 2HF3A 3K57A 2E20A 3UKUA 2IDOA 4I6MB 4EAHD 3CM5A 2FC0A 1D4XA 4B9SA 5HP1A 2ZE2A 4N41A 3CQ8A 3C95A 1XNQK 3SYZA 1HPMA 3DM2A 1NK0A 4ID1A 4JI3K 4OLBA 1MWMA 1J9AA 3FE1A 2OPSA 1VSLA 1QQNA 1N33K 3VA0A 3A5NC 2P9PB 1U2VA 3AVAA 2DFFA 3VEVA 3WNHA 1HUXA 2P9LA 3H1QA 1FXXA 1IH7A 4M7XA 3UKRA 4NB4A 3C0BA 4CFAA 3WT0A 1LAVA 1TKZA 1NOYA 4WYBA 5AQTA 1GOBA 2AJQA 3FZKA 3NAEA 3O9QA 4PL8A 3SV4A 1XMQK 5BRDA 1NJXA 3SAGA 3ASMA 4JK7A 1TUUA 4QS7A 3P4IA 1X1PA 4BR9A 1BA1A 1NGCA 3A2FA 3MN5A 4CGIA 4DR7K 2LSNA 4BRNA 4CI6A 1G99A 1NBWA 2WUSA 3MX2A 1N34K 3DRSA 3TAFA 4M3WA 4O5FA 1E4FT 4AHSA 2IOCA 4BRFA 5CYMA 3CCMN 4B1YB 4J2BA 4W5QA 1KFDA 2HMPA 4FJLA 4L3QA 3AVHA 3AO5A 2ZGZA 3JS6A 3ZSZA 3L4IA 4DTOA 1GLCG 3DXKA 1FKPA 4CZFA 2YNFA 3KVGA 2A41A 4XH4A 3ZSQA 3LM2A 2ITMA 3O3FA 1DTQA 4H0PA 2AP1A 4OKKA 1L3VA 4E89A 4LF6K 2EHGA 4KHPK 3OS0A 5C2FA 4KREA 1E3MA 1DTTA 4FWKA 1RTDA 5FPNA 1BIZA 3VOVA 3H08A 3F9KA 1WSFA 1VSMA 1JLEA 1NJYA 5ADXA 1J5OA 3K0SA 2O8EA 4JHDB 2PFUA 1TKDA 5FPDA 2Q2RA 2P1JA 5BPNA 3RRGA 4B1UB 3FFKB 3QESA 3UB5A 1CZ9A 1VQ7N 2UU9K 1EWQA 1QE1A 3THXA 1Z26A 4KH6A 1LWEA 2P9SB 4NXMK 3J81O 3J7YP 4GVEA 3A5MC 5KGXA 4CK1A 3MN9A 4CK3A 4K8XA 4CJEA 1LCUA 4KI4A 2YNGA 1CLQA 1RDDA 1S22A 1RT3A 3CJ1A 5TKWA 4M3RA 3WQUA 3CHWA 4LF8K 4YOUA 1GOAA 2JWKA 3H6EA 5C0YA 2GELA 4NCGA 1XC9A 1WSIA 2QKKA 4HUEA 3PX6A 1X9SA 2V7ZA 4DV5K 1JCFA 2HHSA 1HJOA 2Z1IA 4LSLA 1JKHA 3NVKA 4CHOA 4JKGA 4FWNA 5FROA 2QKBA 2RE2A 3VTIA 3O8MA 4BQZA 4DQ8A 2E8AA 3I8BA 3HP9A 1KLMA 1KAXA 3P83D 3C6UA 4DUYK 2XRIA 4U7BA 4JK8A 1JCGA 4XH5A 5B8HA 1CZBA 1J53A 3WXIA 1VRUA 2W42A 3VEWA 4B08A 3W0LA 1HQEA 1JLAA 1HPZA 3CCRN 1XHXA 4YOYA 1BIUA 3P5JA 4X66K 3C6AA 2HHUA 3LM9A 1JLQA 2GV9A 1KXPA 3AVMA 2I5JA 2WBNA 5E41A 4BR5A 1NGGA 3S3MA 2HBJA 3PUFA 4YHHK 4DV3K 4Z4FA 4CGGA 3WXKA 3M6GA 4OGCA 1TUYA 2O4GA 2D5RA 4KTZA 1BUPA 2QWRA 2DFHA 4O4GA 1W2BM 3L2VA 3ZSYA 3VA3A 3U9ZA 1JXEA 3J80O 4JKHA 1SUQA 1L5UA 3LANA 5M1OA 4E1JA 3V6DA 3OYAA 4FJIA 1Z25A 2F7TA 5EVZA 3AVIA 4O5BA 4IJNA 1VK0A 2D1KA 3F2KA 5AQLA 1T3VA 3ZLJA 4JI0K 2HHVA 4KHSA 1BCOA 1FJGK 2O8BB 2V51B 3CFRA 3V1QA 3VETA 3BF3A 4JN4A 5EX5A 4DLGA 4CGJA 2IVNA 3HVRA 4GY2B 3T7ZA 5J1EA 5K14A 1XWLA 4I6MA 1T03A 3OW2M 4B3TK 2ZD1A 1YXQA 4E19A 3G71N 5EY4A 1S9GA 3BGRA 3M5RA 4V19S 2P51A 4B3MK 4U67L 4YY3K 5D3GA 2DY4A 2QWNA 3RWUA 1RTIA 1S3XA 4KTWA 2AA4A 5CHIA 3I0SA 3TU5A 4CJVA 1RDUA 4B9LA 2P5OA 3S3OA 4Z94A 5LY3A 4H5VA 3OYGA 1TVRA 3K2PA 2Q36A 2ZF5O 3DLLL 3J8AA 4BREA 1YI2N 1HKGA 3TI0A 3HRGA 4C8OA 4Z0UA 3D0PA 4H0VB 4DSJA 3DXMB 2HNZA 2B5JA 1DT9A 1LV5A 4ILGB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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