3CCQN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation a2488u
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 48
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccqN00
1YJ9N 1K9MO 2QEXN 2ZJRL 1KQSM 1VQKN 1YJWN 1NJIO 3PIOL 1YI2N 1VQNN 3CC2N 4UY8O 3DLLL 1VQMN 1OVYA 3CCSN 3CCMN 1W2BM 5H1SQ 1KD1O 5HL7L 3CCQN 4IOCL 3CC7N 4WF9L 2QA4N 1VQ4N 5JVGL 5GAHP 5DM7L 3CCEN 1S72N 4WFNL 3PIPL 1ILYA 4WFBL 5MLCQ 5JVHL 1YIJN 5GAEP 1YITN 1QVGM 4WCEL 1YHQN 3CPWM 3I56N 1VQ5N 1VQ7N 3I55N 3CMAN 3CC4N 1VQ6N 2OTLN 5DM6L 1VQ8N 5GAGP 5GADP 1N8RO 1Q86O 3CCUN 4WFAL 3G71N 3CCJN 4U67L 3G6EN 1Q82O 3OW2M 4IOAL 1JJ2M 1K73O 3CD6N 2ZJQL 1YJNN 3CCRN 1K8AO 3CCVN 3CXCM 1M90O 3G4SN 3CCLN 1M1KO 1VQPN 2ZJPL 3J7ZO 3CMEN 1VQ9N 1Q7YO 1KC8O 1VQLN 2OTJN 1Q81O 1QVFM 1VQON 4IO9L 3CF5L
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E2OA 1RT4A 3TAQA 2NRTA 2QEXN 3VERA 4CF1A 3ZX2A 1KQSM 4E89A 3WNHA 1UA1A 3P1GA 5AQHA 5KRSA 3VGLA 1C0TA 4KHSA 2ETJA 2E88A 3L4QA 1VQMN 4JN4A 3VENA 1NGJA 2ASOA 3R9PA 1WAFA 2HBJA 2FLOA 4KHYA 2AJQA 2GEMA 1WUAA 4CEAA 3D7EO 3CCQN 3L2UA 4CGJA 1WLJA 4CK3A 3CC7N 1HNWK 4HTUA 4A5AA 4CBUA 1NU0A 5FPNA 4FWPA 2AP1A 3H1VX 2F7TA 1YVNA 4IOXA 3S9HA 1NGDA 3QFUA 4FJ7A 4OO1J 4M3WA 5JVHL 3VPZA 3NF7A 4LY7A 3SPYA 4KHWA 3LAMA 4OJRA 3SPZA 3EL2A 3FGUA 2HB5A 2Q2RA 3QETA 3DOLA 1RDUA 4DV2K 4CGIA 5AQFA 4BQZA 5CYMA 2QKKA 4DSJA 4JI7K 1TKXA 2D0OA 3E66A 4JKEA 5GADP 4K43A 5BPMA 3J7YP 3O9RA 3CETA 1Q86O 3QIOA 1WSEA 5AZJA 5F2RA 3B6OA 1Q82O 1N6QA 1Q18A 3SJJA 3SV3A 5KTQA 3SQ0A 1O1WA 3G0ZA 5BREA 3OTOK 4GV6A 3OS1A 1F21A 5AQWA 1ZBSA 4DTOA 4FW1A 3E9LA 1T6CA 4NXNK 4Q5VA 2RKIA 4PWDA 2E5LK 2WC9A 1UOCA 2PYJA 3SBTA 2O8CA 4DU1A 2P9UB 2X6SA 1VSDA 1JLAA 4BR7A 4IO9L 4GNIA 5M1PA 3SMSA 3V6DA 1KFSA 4A2BA 2HVIA 2OANA 4CJLA 4BGBA 1K9MO 4CEZA 3O3HA 4M41A 4NCBA 2NRRA 2QTDA 1VSLA 4DQ8A 3DI6A 3TAEA 4J8FA 1DTQA 1NMNA 1SZ2A 3CQYA 2FC0A 2OPPA 3L2WA 4WE1A 2YJFA 4MQ3A 5AQOA 1OH5A 2DFEA 2IC3A 4CHNA 1C0UA 3ZYYX 5KQDA 4DLEA 3VGMA 5ADXH 1WOQA 3THYB 4B3SK 4C8OA 1NGBA 1WB9A 1S1XA 1TL1A 4FWKA 1MU2A 2IVOA 5JLHA 2IOCA 3OJSA 4DWIA 1C0FA 2P9IB 3U6FA 5AQLA 5J1EA 4K42A 2Y1JA 4E1MA 4BRIA 3CC4N 3VEXA 1IKWA 1XNRK 3SAHA 4O0JA 1SS6A 3KJVA 4DFJA 3QO9A 3ENBA 3CCJN 1L3UA 4C1NI 1DGKN 4CJFA 2O8DA 3FZMA 1U45A 2I7NA 3AO3A 3O3GA 1JXEA 1BU6O 3CFRA 4C8MA 1ZBHA 3AARA 4EAHD 3HXMA 1YJNN 1R0AA 4JKGB 4CI6A 3A8YA 3KKSA 4IEEA 3VQCA 5AQSA 3R6MA 4L3QA 3QICA 1W7AA 5TKWA 2P9NB 4M7YA 4BRAA 4NLCA 3VA3A 2Z1IA 3AVFA 4HHTA 1IKXA 3CMEN 4KRFA 1HKCA 5CR4A 3P38A 1J6ZA 4E7HA 1GLBG 5ELZA 1VQON 1T44A 4DU4A 2D0CA 2Q31A 5JLFA 2A6AA 1ATNA 4N56A 3KZBA 1LAVA 4DV0K 2ZJRL 3ID6A 5K14A 3J80O 4E7KA 1NK8A 3U8XA 3D6RA 3LDSA 3MWPA 1NJWA 3KD5E 4IKFA 1MDUB 5EXWA 4CCHA 1HNVA 3P39A 2HBMA 1EETA 4NLBA 5AFUA 3VQ4A 4NYNA 1LWFA 4KB0A 4DTSA 3NGZA 4JYAK 4OVLA 3LPUA 3HPHA 3OS2A 4CF0A 2P5OA 3MXIA 1BDGA 5IWAK 3ENHA 4IOCL 4CJUA 1LW0A 2YI1A 4JI4K 2P9PA 2VQFK 4WQ5C 5EX5A 3WUHA 1G15A 5KRTA 3ZT3A 4LC9B 2ZWHA 2NRXA 4YHHK 4HUGA 5FRNA 4FOIA 4PL7A 3FE1A 5LMNK 5J2PA 3VF6A 2UUAK 3KK1A 2ASMA 1YT3A 1ASVA 4EHUA 3THXB 1Z05A 1EQYA 3VQ7A 4KH6A 1KTQA 3NVKA 1BISA 1QZ6A 4DQQA 2GELA 2D1KA 3UKRB 4DR7K 4WFAL 1J5EK 4CHYA 5FPMA 1T8EA 3WEEA 1NKCA 3KD1E 1GLEG 3AVBA 5T7BA 3EKUA 3QEVA 4JHDB 3VN5A 1JJ2M 3CD6N 4DV5K 4EZ9A 2BTFA 2O8EA 3PX6A 1EWRA 4H5RA 4BWJA 3FFIA 2Z1GA 3QEXA 4AF1A 4Z4GA 4CVNE 4FWSA 1FXXA 3O3FA 1NOYA 1WBDA 2ZQBA 3DXMB 3VEWA 3NCIA 2HNYA 4M3YA 2WTUA 3RMDA 4H0PA 3ATUA 1JL2A 1QE1A 4HWIA 2KQ2A 3TTDA 1YJWN 5J2NA 2DFHA 3CFOA 3VTHA 5C42A 2G8VA 5LY3A 1VQNN 3ZX3A 3WQUA 4UY8O 1X9WA 4UQGA 3QLHA 4A59A 3T3FA 2KHOA 2W40A 3THVA 1KCFA 4H8KA 1U49A 1VK0A 3C7NB 4JD2B 3CM6A 1VSMA 4OLBA 2QA4N 3MMVA 1J53A 3M8SA 3NDKA 4IEIA 4M7XA 3AVJA 4FVUA 2G8FA 5LMUK 4WQ4A 3NVMA 4WFNL 3OYMA 4BRNA 3NHGA 3SMPA 4E7LA 4KTZA 3V81A 2OZSA 4FJNA 3GDQA 4DHYA 3LPTA 3JAMO 2W6LA 3UKUA 1HYSA 3HZ6A 3K5MA 2JGUA 4TSXA 3TU5A 1JLCA 4C23A 3BY5A 1I39A 1XWLA 2GWKA 2ATQA 3KWGA 4LFBK 3QEWA 4IDHA 3RRGA 2VG6A 3KK7A 5SWMA 4CJWA 1NK0A 4FWLA 2FBTA 3VQAA 4FWOA 3CHWA 1E3MA 4EP5A 2ZJQL 4YORA 4J2DA 2E1YA 2I5JA 4H0TB 4CJ7A 4CBXA 4Q0BA 3F5TA 1CLQA 2X74A 5HRSA 1QSLA 3H3NO 4CJ5A 4YY3K 3L3UA 2V52B 2HOEA 3KLGA 5EU7A 4OLAA 3NFAA 3LDQA 2EX3A 1HPZA 3AO4A 2P51A 5AQXA 4LF6K 4B1VA 4BREA 3H46O 4M63C 4BE0A 2B5JA 1X3MA 1GLJO 3K5OA 1IBLK 1L3TA 1YTAA 3C6HA 4RW7A 2E2PA 1IKYA 5I9EB 4DTNA 2YKNA 1YI2N 1BI4B 4EFHA 2X78A 1X9SA 2G8UA 1DEJA 3F2KA 3OYGA 4H4OA 4ILHA 3GG4A 4GY2B 3WNFA 3I8DA 4DLGA 2XO7A 1NGHA 1TGOA 3IS9A 3OYBA 4AILC 1W0HA 4DTMA 5AQRA 2E8AA 3L4IA 1VSIA 2XY6A 3AAQA 1RDBA 3H6EA 4DQRA 2V51B 3LAKA 4F8RA 2YJEA 4QS7A 2F8TA 2E2QA 4YOVA 4H03B 4DTJA 1HKGA 4A57A 5DM7L 2G8IA 4Z0UA 4I6MB 2EHGA 3DXKB 4DQSA 4FK2A 1HR0K 1B9DA 4NXMK 4GKJK 4ICLA 3HP6A 3AAPA 4BROA 1S22A 4X66K 3RMCA 4AHUA 4DQIA 2F9WA 3DLEA 2P9SB 3NBPA 4NYFA 4JRQA 1U47A 1X9JA 2D4WA 3D2FA 2G8KA 4H4MA 4CEFA 3ITHA 3AA4A 5FPDA 3HK2A 2GWJA 3VQ6A 2E2NA 2QWOA 1JLEA 4JKBA 4CD3A 1EO1A 2P9LB 2WFBA 4IG3A 3MX5A 4CFBA 3O08A 1KAZA 3OW2M 4EIAA 5EVZA 4CZHA 3SLCA 3FZKA 3PUFA 5LJWA 1ZYQA 3OJUA 4H0XB 4DS5A 1K8AO 5BRHA 3SQ2A 4DV1K 3E01A 2D5RA 1TV6A 4LFAK 3QERA 3OYIA 4OX9K 4LF9K 2HMPA 4BRLA 5AQKA 3ULEA 4N5SA 3PO4A 3V1OA 4KKOA 3DJCA 2OTJN 4FLVA 4FLUA 4BGAA 4GMJB 3D2EB 4YNQA 1N36K 4DV4K 4EZ6A 1BIZA 2YV0X 3SUOA 5F0XA 5HRNA 4PUOA 1IO2A 4KBOA 4DUYK 3QBXA 1J9AA 3C6AA 5GIPA 3SAFA 4L8RB 2Q97A 3F9MA 4B1WB 3M8PA 4W5NA 5AQPA 1WBBA 4YOYA 2P9KB 4EHTA 4OPHA 5KPTA 3THWA 5I42A 1Z26A 4BDYA 1WSIA 1QQOA 3DOKA 3O6WA 4DF8A 4B1ZA 4KFBA 1BQMA 2KTQA 3K2PA 1RT6A 1JL1A 3VEVA 4F3OA 4HVJA 3ZETB 5AQYA 4BE1A 5KI6A 1BOTO 3KK3A 4CGFA 2QW9A 1HYVA 1P90A 4KB1A 1XI1A 3QNOA 1LV5A 4ELUA 5CZ1A 3VQQA 3M6GA 2WONA 3RSEB 3K9KA 5AZIA 3AA3A 4DV6K 3FZFA 4HUFA 1ASUA 5E41A 2E20A 3RMBA 2BUPA 2F9TA 3L0QA 4C1NK 4MDBA 3ATVA 3VF4A 1NJXA 2IS3A 2QK9A 3S3NA 4CJPA 4C8KA 3MCPA 4PQUA 4IOAL 4CJVA 3HOTA 2IGIA 3O4WA 3VQEA 4KH5A 3R1XA 3TSUA 3O8MA 4F4KA 2HBLA 2YHAA 1JXBA 2BE2A 3PX4A 4KAZA 3QINA 4JKHA 3NF6A 4YDUC 3ZSOA 3OVNA 1I94K 4BVOA 4DG1A 1NJYA 1IG9A 4FPBA 4JI6K 1NGCA 1YJ9N 4H5NA 4H5WA 3HOSA 2F8SA 5AQVA 1IH7A 1S6QA 4IG0A 5TKYA 1U2VA 3A5MC 4K8ZA 1HJRA 2QWLA 3V9WA 4B9LA 4I9QA 2UYTA 3JSMA 4CBWA 3C65A 3FZLA 3TSPA 1SL0A 5KPZA 4ZHRA 3CCMN 3BDPA 2HHXA 5CY4A 2E6LA 4LF7K 1ATRA 3W3DA 3KLFA 4CEQA 3JYTA 1BG3A 2P9IA 1LW2A 2FBVA 5AQNA 3DMJA 4Y0WA 1Y97A 4OPAA 2RN2A 1ILYA 3EYZA 3SNNA 1GLLO 2GV9A 3S41A 2HHQA 4Z4HA 5AZJB 4KI4A 1VQ5N 4OKJA 2WOMA 5C24A 4B1XB 1GLCG 3LALA 4IZ9A 4CW7B 3CFPA 1DLOA 1UA0A 3EE9A 1HNIA 5M1KA 4J2BA 2CGLA 3AO2A 3MDQA 4K0KK 4JAXA 3BZCA 3LDNA 1S1WA 3IKMA 4U67L 3VEOA 2ZGZA 3HSTB 3ZT0A 4E7JA 4FJXA 3EEQA 4DKWA 5C15A 1S6PA 3L6QA 5HRRA 3UE5A 3ULDA 2YCHA 3DRSA 5C10A 3SZ2A 5C2FA 1TYQA 3ZSYA 1WNSA 3CXCM 4FCYA 2O8CB 4LH4A 4CECA 2QKBA 1MWKA 3MCAB 5M1NA 4BG9A 1O13A 3HM9A 4BR4A 2Q1NA 3ZX0A 3CQ8A 3IAYA 3SYZA 3VQ5A 2HW3A 2J4RA 2V7ZA 1W9HA 2O8BB 3L2QA 2A5XA 3NH2A 1S1VA 3B8AX 3TTCA 2VGNA 4CZFA 5CE3A 4B9MA 3SI6A 4RW9A 2VYPA 1RNHA 5BN8A 2A1RA 1V4SA 2GUIA 3OYLA 3MK6A 3E9OA 2CGKA 3C94A 1HLUA 3HPGA 3NE6A 2Q0RA 1OVYA 1RTJA 4OGEA 4G9ZA 2NRHA 2OPRA 5KPRA 1NKBA 3NGYA 2Z1JA 2OA8A 1GLDG 2FSKA 1U04A 5LL6Z 3K58A 3ZLJA 1XUPO 4DTRA 3OHRA 5HOOA 1L3VA 1Z6RA 3RRHA 1HKBA 1SL2A 3P31A 4AHCA 1N5YA 1EKEA 3AO1A 4GVMA 2VWBA 3AA5X 4H0VB 4JS5A 4CZEA 4XH5A 3CG7A 5GAEP 3A2FA 2FSNA 1E4GT 2UU9K 1YHQN 4JI1K 3SBGA 3CJAA 4BRFA 3CPWM 1NK7A 2OPSA 3BF3A 4FO0A 2IVPA 2G8HA 3I55N 2O8DB 1RBUA 1L3SA 2F4VK 2NRWA 4YOUA 1RBTA 3VQDA 1Y64A 4JI0K 1QSSA 4LF5K 4JHDA 4OPKA 1N8RO 2X6NA 4JKAA 3BF1A 2VGMA 2Q0UA 4FVMA 1C1BA 2QWPA 4FK0A 4F3TA 1ZC6A 3HM8A 2HHWA 2HF4A 4AQYK 2YHBA 3U3YA 3T69A 3CJCA 3O9UA 4JK8A 4JLHA 3SQ4A 3MEDA 3Q7CA 3ZSWA 3C0BA 4IDKA 3ASMA 3G4SN 3VETA 1BIUA 2HVHA 3VOVA 1VSJA 1XC9A 4KHNA 4CJTA 3RR7A 1JLBA 4I2QA 2IAJA 3VQ8A 1ATSA 2LSNA 3T19A 4CFAA 1HNXK 5SZTA 4FYDA 1Q81O 4DV3K 2E1ZA 1WSGA 4BRQA 3OYEA 4FWNA 4E0DA 4AM6A 2VQEK 3ZT4A 1TKTA 4DS4A 1YTUA 4BDZA 1S9GA 2AA4A 4CGDA 4JI3K 3U3GA 1QS4A 3AGRA 5EOYA 1IJJA 1RFQA 5J2MA 4DQPA 2FBXA 3FLCO 3NMUA 4CIFA 4FLYA 5C25A 4PA1A 1SV5A 2G8WA 3EY1A 3PX0A 5AFUH 4O0IA 1NLVA 4O55A 1NG9A 3MN5A 5AQUA 1GLFO 1FKOA 3LDPA 4F9OA 1CZAN 4B9TA 1XMOK 1S9EA 3MECA 4KPYA 1RDWX 1RBRA 1VQ4N 4HUEA 1YVUA 4JKCA 1TK5A 3S3OA 1WSFA 2NNWA 2D0PA 3HPOA 1JLFA 3NH0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YJ9 N;  1K9M O;  2QEX N;  2ZJR L;  1KQS M;  1VQK N;  1YJW N;  1NJI O;  3PIO L;  1YI2 N;  1VQN N;  3CC2 N;  4UY8 O;  3DLL L;  1VQM N;  1OVY A;  3CCS N;  3CCM N;  1W2B M;  5H1S Q;  1KD1 O;  5HL7 L;  3CCQ N;  4IOC L;  3CC7 N;  4WF9 L;  2QA4 N;  1VQ4 N;  5JVG L;  5GAH P;  5DM7 L;  3CCE N;  1S72 N;  4WFN L;  3PIP L;  1ILY A;  4WFB L;  5MLC Q;  5JVH L;  1YIJ N;  5GAE P;  1YIT N;  1QVG M;  4WCE L;  1YHQ N;  3CPW M;  3I56 N;  1VQ5 N;  1VQ7 N;  3I55 N;  3CMA N;  3CC4 N;  1VQ6 N;  2OTL N;  5DM6 L;  1VQ8 N;  5GAG P;  5GAD P;  1N8R O;  1Q86 O;  3CCU N;  4WFA L;  3G71 N;  3CCJ N;  4U67 L;  3G6E N;  1Q82 O;  3OW2 M;  4IOA L;  1JJ2 M;  1K73 O;  3CD6 N;  2ZJQ L;  1YJN N;  3CCR N;  1K8A O;  3CCV N;  3CXC M;  1M90 O;  3G4S N;  3CCL N;  1M1K O;  1VQP N;  2ZJP L;  3J7Z O;  3CME N;  1VQ9 N;  1Q7Y O;  1KC8 O;  1VQL N;  2OTJ N;  1Q81 O;  1QVF M;  1VQO N;  4IO9 L;  3CF5 L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E2O A;  1RT4 A;  3TAQ A;  2NRT A;  2QEX N;  3VER A;  4CF1 A;  3ZX2 A;  1KQS M;  4E89 A;  3WNH A;  1UA1 A;  3P1G A;  5AQH A;  5KRS A;  3VGL A;  1C0T A;  4KHS A;  2ETJ A;  2E88 A;  3L4Q A;  1VQM N;  4JN4 A;  3VEN A;  1NGJ A;  2ASO A;  3R9P A;  1WAF A;  2HBJ A;  2FLO A;  4KHY A;  2AJQ A;  2GEM A;  1WUA A;  4CEA A;  3D7E O;  3CCQ N;  3L2U A;  4CGJ A;  1WLJ A;  4CK3 A;  3CC7 N;  1HNW K;  4HTU A;  4A5A A;  4CBU A;  1NU0 A;  5FPN A;  4FWP A;  2AP1 A;  3H1V X;  2F7T A;  1YVN A;  4IOX A;  3S9H A;  1NGD A;  3QFU A;  4FJ7 A;  4OO1 J;  4M3W A;  5JVH L;  3VPZ A;  3NF7 A;  4LY7 A;  3SPY A;  4KHW A;  3LAM A;  4OJR A;  3SPZ A;  3EL2 A;  3FGU A;  2HB5 A;  2Q2R A;  3QET A;  3DOL A;  1RDU A;  4DV2 K;  4CGI A;  5AQF A;  4BQZ A;  5CYM A;  2QKK A;  4DSJ A;  4JI7 K;  1TKX A;  2D0O A;  3E66 A;  4JKE A;  5GAD P;  4K43 A;  5BPM A;  3J7Y P;  3O9R A;  3CET A;  1Q86 O;  3QIO A;  1WSE A;  5AZJ A;  5F2R A;  3B6O A;  1Q82 O;  1N6Q A;  1Q18 A;  3SJJ A;  3SV3 A;  5KTQ A;  3SQ0 A;  1O1W A;  3G0Z A;  5BRE A;  3OTO K;  4GV6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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