3CCQN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation a2488u
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 48
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccqN00
3CCUN 3CCRN 1VQ8N 1S72N 1OVYA 3PIOL 1KD1O 2OTJN 4WCEL 2OTLN 5GADP 1KC8O 4U67L 3CCEN 3I56N 1JJ2M 5GAGP 3CMEN 1YJ9N 1N8RO 1YHQN 4IO9L 1Q7YO 1VQ7N 1VQON 3CMAN 1VQMN 3CPWM 4UY8O 1K73O 1KQSM 4WFBL 1Q81O 3CCSN 4WF9L 5H1SQ 3CCJN 3PIPL 3G4SN 1Q82O 1YITN 2QA4N 3G71N 5MLCQ 4WFNL 3CC4N 3G6EN 1VQLN 4IOCL 1M90O 3OW2M 5DM7L 1VQ9N 1YI2N 5GAEP 1Q86O 3CD6N 5GAHP 1QVFM 3CXCM 1VQ6N 1QVGM 1NJIO 5JVHL 1YJNN 3CC7N 3CCLN 5HL7L 3DLLL 3J7ZO 1W2BM 1YJWN 1VQ5N 2ZJRL 2ZJPL 3CCMN 5JVGL 1VQNN 1VQPN 5DM6L 2QEXN 3CCQN 4IOAL 1M1KO 1K8AO 1K9MO 3CC2N 1VQ4N 2ZJQL 3CCVN 1VQKN 3I55N 1ILYA 3CF5L 1YIJN 4WFAL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RBSA 1T8EA 2ZM6K 5AQHA 4BRMA 4KKOA 3SQ0A 4H5RA 3LDLA 4B3TK 1S72N 2O8DA 2B5JA 4K0KK 1VSKA 1BU6O 2YNIA 3SK3A 2OTJN 1DTTA 5FPDA 3NH0A 2Q31A 4WCEL 1EQYA 4NYNA 3EO3A 4KRFA 3R1XA 1DKGD 3R6MA 4H5VA 3UKUA 3LPTA 4BWMA 4DFMA 3D2FA 4O0IA 1UWBA 1QSYA 5EVZA 4FJ7A 4JS5A 5AQJA 4NXNK 2GWKA 3C95A 3CJAA 3FFKB 1GLBG 4Y1DA 3TSPA 4UQGA 3TPQA 4AF1A 4CJ5A 3E01A 4FWOA 3WQTA 5J1EA 3LZJA 4BROA 3PIPL 1BQNA 5AQYA 4CK1A 3G4SN 4JD2B 4IEEA 1LWFA 3SAGA 1W97L 4ISEA 4KH5A 2A1SA 1NJWA 4WQ5C 4BREA 4CIEA 1YI2N 3QEPA 4KAZA 2ZD1A 3V4IA 3EYZA 3SCXA 2DFHA 3Q7CA 5M1OA 2A3ZA 4CBXA 3TAQA 4CF1A 3BEXA 3F9MA 4HCBA 1RT3A 4FVMA 2IDOA 3DYAA 2FSNA 4KHPK 3C65A 4AHUA 2QK9A 4NYFA 1A5XA 2E2NA 4YDUA 3A8YA 1HNWK 4CK2A 4I2PA 1K9MO 4NO7A 1RDCA 1SUQA 2G8WA 2W6LA 4C8MA 5AQGA 2RPIA 4FWMA 3QBXA 4Z0UA 3T1YK 3FR0A 3ID6A 4LC9B 5C12A 4OLAA 4JK7A 2AP1A 4NLCA 3V1OA 2DPNA 1T05A 5KPZA 1RT6A 5EOYA 4H4OA 3HXMA 2D0CA 2ETJA 2Y1JA 3V9WA 4LSLA 1TK5A 4B9SA 1J9AA 3BUZB 3HT3A 5TKWA 3P1GA 4AQYK 4KHWA 4MDBA 4BRIA 3KVGA 3CCEN 1BI4B 1T7PA 1U6ZA 4BQLA 1ATSA 4OLBA 3P39A 4DR2K 4YOYA 4DFPA 2HNDA 1LWEA 2V51B 1HLUA 4CF9A 2IVOA 5C2DA 4PHTX 1IKWA 4ZTFA 4BRFA 3TARA 3H46O 1NBWA 1K8KA 4FWSA 1BA0A 4JI0K 5GIOA 2HVIA 2CH5A 4CHQA 1P90A 1RTDA 2UUBK 1HUXA 4K8XA 3KD1E 1SAZA 4JI6K 1BA1A 2HHXA 5BN8A 1X9WA 2VWJA 4CZKA 3O3HA 4JKAA 2YNGA 4B8CA 2HHHK 2E2OA 2HHUA 4IO8A 1B92A 3EEQA 3IG1A 2BDPA 3HPOA 2JWLA 3VOVA 1IKYA 1RILA 3O4WA 3VETA 4DTSA 1W7AA 2QXFA 3A2FA 3CQYA 3WQUA 5AQNA 4BE1A 1EETA 2VCPA 3M3ZA 3O8MA 4PA1A 3NGZA 2VG6A 2FSKA 3ENOA 1BI4A 3CM5A 3ZX0A 4CJKA 2RKIA 2O8BB 3QEXA 2D4WA 2VQEK 1U48A 3CC2N 4IWVA 3AA5X 4H0TB 1JKHA 3OJUA 3HP6A 3N4QA 3MXMA 1LV5A 1ILYA 4H0YB 2E6LA 2YHXA 2NRTA 4MFBA 1RBRA 3V1RA 1L3UA 4IZ9A 4CVNE 2P5GA 4DR7K 2KTQA 5K14A 4CFAA 4FLYA 3MCPA 4CEZA 3OYJA 2G8IA 2X78A 1T3VA 3DXKB 5T7BA 3TTDA 1WSEA 4B1VA 2A5XA 3TI0A 3AVHA 1KC8O 3IDHA 3KZBA 4ISFA 2O4IA 3DJCA 4I7FA 4DKWA 5GAGP 2ITGA 4CJTA 1RT4A 3R8EA 1YHQN 3HTVA 1V4TA 3THXB 5FLXO 4CF8A 1HKCA 3VTIA 3VA0A 4I6MB 1UA1A 4JI2K 2V7YA 4IDHA 1OH6A 4H03B 3VGMA 2ZGYA 3C7NB 4FWKA 5BPNA 3SPZA 1I94K 5H1SQ 5AZJA 1QTMA 3TAEA 4LFCK 3NF8A 4H0XB 5J2PA 4FLZA 4Y0WA 1KTQA 4CERA 1XMQK 3SV3A 5E41A 4ELVA 2YX6A 5MLCQ 3CC4N 3RMDA 1GLEG 4O5FA 1CLQA 3FZLA 4M3UA 1OH5A 2RF2A 3CD6N 2QW9A 5HOOA 1NK8A 1NK5A 1TGOA 1S9EA 3AO2A 4EZ9A 2ASMA 1RT2A 2PAVA 2OCEA 4I9QA 4RW6A 2ZWHA 5AQZA 1BG3A 1MA9B 1JL2A 4PKGA 1DT9A 2FC0A 2IGIA 1Y64A 4JKHA 1GLFO 3P83D 5LY3A 3LL3A 2NRZA 4IOAL 1GOCA 3VGLA 3UKUB 3ULEA 1NGIA 2YKNA 4KO0A 2P51A 4GV9A 1GLAG 4CJLA 3K0SA 5LMUK 3OYFA 4CEOA 5CR4A 4FJNA 2BTFA 3E9OA 5HRNA 1NWKA 3O6WA 3LALA 3B6PA 1YTAA 4F3TA 3CCRN 1WUAA 3H3NO 4E7IA 3PX4A 1YTUA 1OVYA 5LL6Z 4CJPA 2O8EB 2O4GA 4PL7A 1QHTA 1OKJA 1C0UA 2OTLN 4C23A 3C6UA 3VF6A 2V7ZA 1C1CA 3T7ZA 3I56N 4JI5K 2O8DB 4AHSA 1IBKK 1YUWA 4M63C 1BCMA 2A41A 1K6YA 1Q7YO 3LDOA 3O1BA 5KRSA 4RW4A 3ZSOA 3KIOA 5AQSA 3NF9A 4V19S 3HJFA 4BE2A 4PY5A 4B1YB 5C25A 3ZCMA 3S41A 4AM7A 4E0DA 3O08A 4M7XA 1OH7A 2AJQA 4PWDA 1NGGA 4LY7A 3OW2M 4DFKA 1JLAA 3R3LA 2JWKA 1D9FA 2P9LB 4CCHA 4YOWA 4BDYA 5CYMA 1BUPA 4LSNA 3LP1A 4Z4IA 4BRAA 2WBNA 4A57A 2OPSA 5FROA 1QSSA 3SZ2A 3RTVA 3THWA 4E1MA 3GBTA 5HL7L 4X65K 5AQUA 4IJAA 2EX3A 4CW7B 4DUYK 1NLVA 1YXQA 3U9DA 3KKRA 4CZMA 3QINA 5I9EB 4CZJA 2W40A 4JN4A 1LCUA 1YAGA 1HNZK 4ISGA 3IS9A 4W5OA 1W9HA 3PLAA 4BACA 3F2KA 2YNFA 5M1NA 1X9SA 2BUPA 3KHYA 4DTPA 3CQ8A 1CXUA 4DWIA 3RWUA 2BE2A 4FL9A 1NGCA 4A2BA 3SQ4A 4DTNA 2VWKA 3DMJA 1TV6A 4U7BA 1HYSA 3VQAA 3VEVA 2BGGA 3ZX3A 5A2QO 3ID8A 1NNEA 2XY7A 4B9VA 4CBUA 3MX5A 3VQCA 1JCEA 2E8AA 1NJYA 2GV9A 2IOCA 3KK3A 3CYMA 4DLEA 1J54A 3AVLA 2NLXA 2KKZA 4FLXA 3OS2A 1HJOA 1B9FA 2OPPA 4CFBA 2QWQA 4J2AA 3QFUA 4UY8O 4CJQA 3QO9A 3M6GA 1Q8IA 1KQSM 4DV3K 4EHTA 3V1QA 3A5OC 4EP4A 3AAPA 3VQQA 1YVUA 3E9LA 3IMXA 1NGFA 5C24A 3T19A 1SV5A 4GKJK 3QIOA 1BIZA 1C1AA 1WBBA 1NU0A 3EL2A 1BL3A 2HMPA 4BRDA 2HHSA 2Z1JA 1RT5A 3AY9A 3TU5A 5J2MA 2NUBA 4DTMA 3GOIA 1D4XA 1JXEA 5HRSA 2W41A 2HVHA 4ID5A 3RRGA 2CGJA 2FF3B 3C6HA 3HPHA 3C6AA 3MXIA 4G9ZA 2D0OA 2DTUA 4J2EA 4BGBA 4B1XB 2YCHA 3NVKA 3THWB 3OY9A 5AFUA 1Z6RA 3DRSA 3MMVA 2ZJPL 1N32K 1C0GA 3VEWA 2WOMA 2D0PA 1JLGA 1TKZA 1VQNN 1GLDG 1HX1A 1VRTA 1EO1A 4KHUA 4ICLA 3QEVA 2IVPA 4HTLA 4DSEA 4YOUA 3VEOA 3DRRA 4FCYA 3NVMA 2KZMA 2UXCK 2FLOA 4CE9A 4LF8K 2KFZA 3EZWA 2YJFA 3N4PA 1RTJA 3WEEB 2FBXA 1U49A 1YF5L 4EP5A 4J8FA 2D5RA 3R9PA 3K57A 4FW2A 2IAJA 1QQOA 4DS4A 1XQSC 1BDGA 2NZTA 3SLCA 5JS2A 2I5JA 1KCFA 2HSTA 3B8AX 4N56A 2G8UA 3M8PA 4H0VB 4GVMA 1NK7A 3KLEA 3H1QA 3TR8A 3GL1A 2GELA 4YY3K 1JLBA 3SUPA 3QETA 1XNRK 3T1HK 5FRMA 3MAQA 4W5NA 1VQON 1EP4A 1KFSA 2ITMA 1KSPA 4ILJA 1K73O 4PUOA 3HL8A 4F2SA 2A1RA 3NF7A 2HF4A 4ZTJA 1N33K 4OGEA 3ZSXA 3PV8A 1TYQB 2FF6A 3AAQA 4HUEA 1FJGK 4WFNL 1HJRA 3AVBA 3MWTA 5D3GA 5DM7L 2QWPA 3ATUA 4B1UB 3P31A 2VG5A 3IUCA 3OA9A 3LP0A 2F7TA 3OYCA 3AVFA 4C8KA 4H4MA 2E1YA 4CHPA 3H3OB 3VQ4A 4I2QA 4XH1A 4FYDA 4M3XA 3HM9A 3RR7A 2I7NA 1TVRA 3OS0A 3ATVA 4DR4K 3FZFA 3RMBA 5J2NA 1HNVA 4JKDA 4IXCA 5ELZA 4DR3K 1ASVA 1M1KO 2Z1IA 4F9OA 4CFDA 1HYVA 4B08A 3J81O 3DOKA 5BRDA 1MWKA 2HHVA 4FJMA 3O9TA 4Z4FA 3I55N 2EWSA 4M3RA 4FJ8A 4I6MA 3V9ZA 1JCGA 3O1WA 1X3NA 3M8RA 3WEEA 4JV5K 4JKGB 4OKJA 1T44A 3C7NA 4BR9A 3VF2A 4E3SA 1S1VA 4O8KA 5I42A 4YNQA 4BRCA 4ILGB 3QLHA 3DWLA 2OPQA 2E2QA 1Z26A 3CI5A 3CJCA 3AGRA 3FZHA 3RRHA 1WSHA 4CJWA 3EE9A 4GV6A 5AZIA 2FBYA 3TWHA 4KHSA 2FBTA 4DCHA 3MWPA 5CY4A 3H1VX 1YJ9N 4EFHA 4F2RA 3LDNA 4IO9L 4JI8K 3SUOA 2GX9A 4FZXC 1YT3A 1QZ6A 4CESA 1JLFA 3CPWM 3OYLA 1ESVA 2VGNA 4BR5A 4OPKA 3B6OA 2YKMA 2E20A 4H5NA 3ZX2A 4KB0A 4CEDA 3L2RA 1YITN 1HMVA 3VGKA 3DLEA 1X1PA 1NGDA 4IOCL 3KWGA 4FJJA 3P5JA 2UUCK 1RBUA 4CJFA 3O9RA 1QVFM 3QB0A 3T3FA 1D8YA 2OZMA 2HBJA 5KGXA 1WBDA 1S6QA 5HROA 3VTHA 4H5TA 5KI6A 1L3VA 1XI1A 1SL1A 4LF5K 2B4JA 1QQMA 4IG3A 1GLLO 3OHRA 4CI6A 2WUSA 5CHIA 3BDPA 2VQFK 4NCAA 3C94A 3THVA 3ZLJA 2D0AA 1VQPN 2QEXN 4LFAK 1WNSA 3NBPA 3OTOK 3VA3A 4GY2B 2J4RA 4R5PA 4DU4A 4FWQA 3KK2A 4DQQA 2E88A 3TAFA 3PX6A 2WONA 3VN5A 4BG8A 2JGUA 4KPYA 4FJKA 2YI1A 4JAXA 3CQXA 4OKEA 2XY8A 4CZGA 4CD3A 4BDZA 1ZBFA 4WQ4A 5F2RA 4JI4K 3TSQA 4K41A 4MO5A 5AQQA 4DS5A 5CYQA 1NJXA 1WSJA 4MO4A 1TKXA 1L5UA 3DLBA 4M7YA 1A5WA 1NG9A 3FZKA 3LAMA 3LAKA 3D45A 4U67L 3WXKA 4CECA 3BP8A 3U4LA 1RFQA 1NJZA 2ASOA 4F4KA 5B8HA 3VQ6A 3L4IA 2UXDK 1VSIA 4MQ3A 4FWRA 1SL0A 3OYBA 4J2BA 4LF9K 1HRHA 4HUFA 4YFUA 3BF3A 5KGWA 2HBMA 2F4VK 5C0YA 1O13A 4N5SA 3OYKA 3V9XA 3BZCA 1IKVA 4CZFA 1WAJA 3AA3A 3QBWA 1WSIA 2YHAA 1T6DA 2F9TA 4KI6A 1C0MA 4E19A 3ITHA 1Q86O 5HP1A 5JLHA 5GAHP 2P9KB 3A5MC 2W6KA 4DFJA 4BRLA 3VERA 5E26A 3CC7N 3WNHA 2IS3A 3VQ5A 4CK3A 3U6FA 1B9DA 1YJWN 2YHWA 4DV6K 1WN7A 1IBLK 4FJHA 4Z4EA 4KTQA 3C6TA 3KK7A 3DXKA 3D2FB 2HNYA 3CETA 4H8KA 1S5JA 3DM2A 4KH4A 3HSTB 1SQKA 1HNIA 5KTQA 1G15A 2B6AA 3CCVN 4IOXA 4Q0BA 3NFAA 3HOTA 4WFAL 4IFYA 1NKCA 3THXA 2Q2RA 3LDPA 3OJSA 4QCLA 3VQBA 4J2DA 4LH5A 3VMFB 3HP9A 4BRNA 4OPAA 1ATNA 4C1NI 1CZ9A 1I39A 4RCHA 4CF2A 4IJNA 1ZXOA 3ZSRA 3U3YA 3SQ2A 3O9SA 1L3TA 1LW2A 4KH6A 3HBTA 2QI2A 4BC5A 5J2QA 1RTHA 3NH2A 3DLGA 2OA8A 4B9MA 4FK2A 4CZEA 3AV9A 1ZC6A 4AM6A 1VQ7N 4BRKA 4QS9A 4BVOA 3RMAA 3KWIA 1VSLA 4BDPA 3SAHA 3DXMA 3CCSN 3ZSVA 1XHXA 3OYNA 2QTDA 3CCJN 2OYQA 4DV7K 3DOLA 5GINA 1A5VA 2E5LK 1RT1A 4BE0A 2QA4N 1E4FT 5HBMA 2QWNA 2HB5A 1NKEA 1S1TA 5BN9A 2RE2A 4JHDA 4E89A 1VQ9N 4DHYA 3ULEB 3KKSA 4Z4GA 3D0PA 4CGDA 1RGIA 3EZ5A 1RCHA 5HRPA 1VQ6N 3AO1A 1WSFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CCU N;  3CCR N;  1VQ8 N;  1S72 N;  1OVY A;  3PIO L;  1KD1 O;  2OTJ N;  4WCE L;  2OTL N;  5GAD P;  1KC8 O;  4U67 L;  3CCE N;  3I56 N;  1JJ2 M;  5GAG P;  3CME N;  1YJ9 N;  1N8R O;  1YHQ N;  4IO9 L;  1Q7Y O;  1VQ7 N;  1VQO N;  3CMA N;  1VQM N;  3CPW M;  4UY8 O;  1K73 O;  1KQS M;  4WFB L;  1Q81 O;  3CCS N;  4WF9 L;  5H1S Q;  3CCJ N;  3PIP L;  3G4S N;  1Q82 O;  1YIT N;  2QA4 N;  3G71 N;  5MLC Q;  4WFN L;  3CC4 N;  3G6E N;  1VQL N;  4IOC L;  1M90 O;  3OW2 M;  5DM7 L;  1VQ9 N;  1YI2 N;  5GAE P;  1Q86 O;  3CD6 N;  5GAH P;  1QVF M;  3CXC M;  1VQ6 N;  1QVG M;  1NJI O;  5JVH L;  1YJN N;  3CC7 N;  3CCL N;  5HL7 L;  3DLL L;  3J7Z O;  1W2B M;  1YJW N;  1VQ5 N;  2ZJR L;  2ZJP L;  3CCM N;  5JVG L;  1VQN N;  1VQP N;  5DM6 L;  2QEX N;  3CCQ N;  4IOA L;  1M1K O;  1K8A O;  1K9M O;  3CC2 N;  1VQ4 N;  2ZJQ L;  3CCV N;  1VQK N;  3I55 N;  1ILY A;  3CF5 L;  1YIJ N;  4WFA L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RBS A;  1T8E A;  2ZM6 K;  5AQH A;  4BRM A;  4KKO A;  3SQ0 A;  4H5R A;  3LDL A;  4B3T K;  1S72 N;  2O8D A;  2B5J A;  4K0K K;  1VSK A;  1BU6 O;  2YNI A;  3SK3 A;  2OTJ N;  1DTT A;  5FPD A;  3NH0 A;  2Q31 A;  4WCE L;  1EQY A;  4NYN A;  3EO3 A;  4KRF A;  3R1X A;  1DKG D;  3R6M A;  4H5V A;  3UKU A;  3LPT A;  4BWM A;  4DFM A;  3D2F A;  4O0I A;  1UWB A;  1QSY A;  5EVZ A;  4FJ7 A;  4JS5 A;  5AQJ A;  4NXN K;  2GWK A;  3C95 A;  3CJA A;  3FFK B;  1GLB G;  4Y1D A;  3TSP A;  4UQG A;  3TPQ A;  4AF1 A;  4CJ5 A;  3E01 A;  4FWO A;  3WQT A;  5J1E A;  3LZJ A;  4BRO A;  3PIP L;  1BQN A;  5AQY A;  4CK1 A;  3G4S N;  4JD2 B;  4IEE A;  1LWF A;  3SAG A;  1W97 L;  4ISE A;  4KH5 A;  2A1S A;  1NJW A;  4WQ5 C;  4BRE A;  4CIE A;  1YI2 N;  3QEP A;  4KAZ A;  2ZD1 A;  3V4I A;  3EYZ A;  3SCX A;  2DFH A;  3Q7C A;  5M1O A;  2A3Z A;  4CBX A;  3TAQ A;  4CF1 A;  3BEX A;  3F9M A;  4HCB A;  1RT3 A;  4FVM A;  2IDO A;  3DYA A;  2FSN A;  4KHP K;  3C65 A;  4AHU A;  2QK9 A;  4NYF A;  1A5X A;  2E2N A;  4YDU A;  3A8Y A;  1HNW K;  4CK2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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