3CCRN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation a2488c. density for anisomycin is visible but not included in the model.
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccrN00
4U67L 3CCUN 1VQ5N 1K73O 4IO9L 1M1KO 3CCJN 5GAEP 4IOCL 3CPWM 1YI2N 1VQ4N 5MLCQ 3CCRN 1Q7YO 5DM6L 5JVHL 1YJNN 4WCEL 3CCMN 3I55N 1KQSM 3CC7N 1VQ9N 2ZJQL 3CMEN 3CXCM 1JJ2M 1VQNN 4WFAL 1YJWN 3DLLL 1N8RO 2QEXN 1NJIO 1VQ8N 1W2BM 1Q86O 3OW2M 3CCLN 3CCVN 5GADP 3CCQN 4IOAL 1VQON 1QVGM 3PIOL 1YITN 5H1SQ 3CC4N 3PIPL 1YIJN 5GAGP 3CF5L 1KC8O 4WFBL 5GAHP 5DM7L 3J7ZO 1KD1O 2ZJRL 1YJ9N 3G4SN 1K8AO 1Q81O 2QA4N 3CD6N 1VQKN 1ILYA 3G71N 1VQ6N 5HL7L 1VQLN 1VQMN 1VQPN 3CCSN 2OTJN 1QVFM 1Q82O 3I56N 5JVGL 1S72N 4WFNL 4UY8O 3G6EN 3CMAN 2ZJPL 3CC2N 2OTLN 3CCEN 1K9MO 1YHQN 1OVYA 1M90O 1VQ7N 4WF9L
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1U4BA 1JXEA 4HTLA 4IO9L 3MN9A 3HSTB 1JLCA 4CZHA 1IBLK 4NLBA 4E89A 3H6EA 1XWLA 1YVUA 4FOEA 1WAJA 4CF1A 3ZSXA 2XRIA 5F2RA 3SYZA 4N41A 2A5XA 1BO5O 4QS9A 3C6TA 4JHDA 4HUFA 3PX0A 1K6YA 4Z4IA 2P9SB 1UOCA 5FRNA 1NKBA 4IEIA 3VA3A 1CZBA 1ITGA 3K0SA 4LF9K 2V7YA 3LL3A 3UKUA 3ASMA 4CESA 4FCYA 3UB5A 2D0CA 3K59A 1KLMA 4Y0WA 3SAFA 3O6WA 1QZ5A 1RTHA 4MO5A 3CCLN 5GADP 3HJFA 1OH7A 2VCPA 3ZT2A 4CJPA 3BF1A 3FE1A 3F73A 3IAYA 2HHVA 3OTOK 1NGEA 4I6MB 2HVIA 3P39A 4DR5K 1NGBA 4DV5K 1HRHA 3MEGA 4O8KA 1RDAA 4BQLA 1NGAA 1ILYA 3LPUA 4FWPA 4DFJA 3SAHA 3DXMB 4M7XA 4H0PA 1G99A 5FPMA 4CEEA 5KQDA 4DR1K 3HYFA 4CIFA 2XY7A 2WUSA 4MDBA 3H1QA 2FBTA 4OPKA 4DQIA 1TAQA 3CMAN 4M3XA 1IBKK 4DLEA 1BL3A 3CJAA 1H1VA 1TK5A 1IKXA 3DM2A 4UQGA 1YHQN 2P1JA 2OANA 3AVGA 3LWLA 4KAZA 2NRWA 4LH5A 4ID5A 3AGKA 4BC5A 2E2OA 1JLGA 3ZSOA 3SPYA 5HRNA 4CI6A 1GLBG 1Q7YO 2HHTA 3CM6A 1KCFA 3G0ZA 3TSPA 5KPRA 4JKHA 1N32K 4I9LA 3MECA 2Q1NA 3T3FA 1FKOA 4C23A 2ZJQL 3S3NA 1TK0A 2O8CA 4X66K 3CJCA 4Y1DA 3EE9A 3HPGA 1C1CA 3QERA 4JI7K 3MXMA 1T05A 3A2FA 1A5XA 4FJLA 2O8BB 1BISA 2OPRA 3RMBA 2OZSA 3L3VA 1L3TA 3VGLA 3THYB 4JKAA 4CIEA 4FLTA 4OO1J 3CI5A 4NCAA 3KLFA 3H46O 1SAZA 1C1AA 1KRPA 4RG8A 4FJ5A 3AY9A 1TL1A 3OYAA 2QWOA 3D2EB 2QI2A 1NLVA 1XMOK 1LW2A 2JGUA 4RWTA 1KC8O 1ZBLA 5DM7L 5J2MA 1SL0A 1K8AO 3HP9A 2A42A 5HLFA 3M8QA 4ISGA 1DEJA 3VEXA 4KHYA 4AHUA 5KQ8A 2QKKA 4NB4A 3E01A 3ID8A 4GV3A 4WQ4A 1XHZA 3M8SA 4QS7A 1Q82O 1S72N 4K43A 1T7PA 4CJ7A 2Q36A 4DFKA 3DOLA 2ITMA 2BTFA 4H0YB 4XH1A 5FRMA 2VG5A 5FPEA 1FXXA 3WNEA 1XNQK 3TU5A 4F3OA 3CC2N 1ATNA 4DSLA 4BRQA 4CK1A 1HJOA 4CGHA 4IJNA 4Q5VA 2VWJA 3EO3A 4JKCA 2HF3A 2O8FB 1ESVA 3DLHA 3NH1A 1K8KA 3MDQA 4FWRA 4AHVA 4MFBA 4BQZA 2QKBA 3RSEB 1UA0A 4DF4A 1OH6A 1ASVA 2BGGA 4DKWA 2VG7A 5AQRA 1NK6A 3NGIA 2I7PA 1V4SA 3HI0A 2E8AA 2VGNA 3ULDA 4N76A 1Z25A 2F96A 4WCEL 1X9MA 1WAFA 1HNWK 3AVKA 3HPHA 5IWAK 3HK2A 3ZT4A 3SQ0A 3D2FB 1EP4A 5C15A 2E88A 2F4VK 3T19A 2H3GX 3ZT3A 5EU7A 1G15A 1GOBA 1HMVA 3AO1A 3K2PA 4FJ7A 1S3XA 2Z1JA 4CJSA 5C2FA 4FL9A 2RE2A 4EP5A 3RRGA 1OVQA 1MWMA 1BI4B 3OYMA 3MAQA 1ATSA 1B9FA 5M1NA 4CVNE 4E3SA 1Z26A 1QVGM 4GMJB 5AQZA 4B9UA 4HCBA 2KQ2A 4E7KA 3MXIA 4DS4A 1REVA 4DS5A 3D6RA 2Z1HA 3JSMA 4V19S 4GY2B 3EEQA 1ZYQA 2QXLA 1R0AA 3R1XA 2P9PA 2V51B 4JKGA 4DR2K 1D9FA 3NCIA 3WNHA 3E9LA 3DYAA 3ZSVA 5KI6A 1QVFM 3O9TA 4KH6A 1BCOA 4DV0K 3M8RA 5AQTA 1NU0A 4PL8A 3QNNA 3G6EN 2GBZA 4FLXA 1TGOA 1WUAA 3K5OA 5HBMA 4M7YA 4B1YB 2OTLN 1K9MO 2RHKA 4CJTA 3TARA 4KHPK 1KVAA 4M3WA 1N34K 3NAEA 2P9IB 4BR2A 4CJ4A 3CERA 1P90A 2UXDK 2OYQA 3CCUN 1JCEA 3A5MC 3QINA 4I7FA 3J7AP 3MMVA 3I0RA 1IKWA 4BDYA 4E19A 3DMJA 3E9OA 4Z94A 4F9OA 4JEPA 4CERA 2ZF5O 1BOTO 4DG1A 1ZC6A 3R8EA 1X1PA 4FPAA 1VQ9N 2P5GA 3AVAA 4IFYA 4DU4A 2IOCA 1S6PA 5M1OA 4C8MA 1NK5A 4BDZA 3QLHA 2E2PA 3WXLA 1L5UA 4BDPA 4RW9A 3NHGA 3ZCMA 3K9JA 4XH5A 3PX4A 4EP4A 3L6QA 1VQ8N 5AQOA 4M41A 1ZBHA 2OA8A 4M3YA 3P31A 1VSKA 4DQRA 3HO1A 3TTCA 2D0PA 4BR5A 2GX9A 1N36K 4B9MA 1IV0A 1TVRA 4H0OA 2FXUA 1YITN 3VEWA 2VWKA 1GLDG 1RDBA 1CZAN 3PIPL 1LWFA 3TTFA 3CQ8A 4MDAA 3VQDA 3EL2A 3U3GA 4H0TB 3K57A 4Q0BA 4IG3A 2Q2RA 2LSNA 1YAGA 1BIUA 1QHAA 3ZSZA 1VHXA 4CJKA 2XY6A 4O5FA 3I8DA 4DTXA 1NGFA 4I2PA 4FK4A 1KXPA 3O4WA 3QEXA 1BGXT 1S1XA 3G71N 4OKEA 4NLCA 4JLHA 1VQPN 3P4IA 4KHUA 3KK7A 2F7TA 3DLGA 4RCHA 2ITGA 1Z05A 4F8RA 4BE0A 1T44A 4CZEA 5HRSA 3VEYA 2O8DA 2P9KB 2IVPA 1NGHA 3OYHA 1NGGA 2CGKA 3MX2A 3GOIA 3DAWA 1XNRK 4KH4A 3ALYA 3S41A 1RILA 2ZWHA 3MCPA 3VEVA 3VOVA 3WNFA 5KGWA 4CEBA 4C1NI 5AQKA 3SUPA 4MO4A 1D8YA 3ULEB 3HRGA 1GLFO 2YHBA 1RTIA 4CF0A 3V1RA 2O8EA 4FLUA 2YKNA 3TSQA 3IDHA 1YT3A 2O4IA 3HOSA 3TANA 1EO1A 2A6AA 4FM2A 3NVKA 1KFDA 4JRPA 2NZTA 1VQ4N 2UUBK 4KI6A 1T8EA 2GEMA 1VAZA 2HSTA 1VSLA 2RN2A 4K8XA 2CH5A 4W5NA 1O1WA 2G8WA 2BE2A 3THXB 1L3UA 1EWQA 3AAQA 4RW6A 4A62A 1TYQB 4BGAA 4B9LA 3ENBA 2UXCK 2UYTA 4JI0K 4DTPA 4FVMA 3LDSA 2HHXA 5AQWA 1BQNA 4KI4A 5C12A 4KREA 4EFHA 1N8RO 3LANA 2QXFA 1T6DA 4JD2B 5JLHA 4FWOA 1XMQK 4WYBA 3M6GA 4KFBA 3OYIA 3KLEA 2IC3A 4DQQA 3IKMA 2CH6A 4CF2A 4PKIA 4IOXA 1U45A 4W5OA 1SZ2A 3C6UA 1QE1A 3OYNA 1NGJA 4O4GA 5LY3A 1RNHA 3BGRA 3SV3A 3NF7A 3KK3A 4KO0A 5GIOA 3THWB 2AJQA 1ASUA 4B8CA 1U47A 2OCEA 2VYPA 4BRCA 4LF8K 4I2QA 3SJJA 2UUAK 4DWIA 1NOYA 2E5LK 3QO9A 4HVJA 4YOUA 4DV7K 4KHSA 3VPZA 3CJBA 1XC9A 4NCBA 3SJHA 3RR8A 3JS6A 3MN5A 1D4XA 3WNGA 4WQ5A 3VENA 4M45A 2P9LB 3Q7BA 4CBXA 1RBSA 2ZD1A 3GL1A 2YNIA 5AQVA 3ZX0A 2NNWA 3W3DA 4JK9A 4KB0A 1UAXA 3LDNA 1C0MA 1WSFA 1RTDA 2FF3B 3OYFA 1RGIA 2HBJA 3FLCO 3CHWA 4YY3K 4OX9K 2A41A 3QICA 4FSVA 1KVBA 1X9WA 3O9SA 3E1YA 1C0FA 1HYVA 3DOKA 3I8BA 1QSYA 4JI8K 4DSIA 5KPTA 5DM6L 3LZJA 2HNZA 4TSXA 5JVHL 4Z4EA 5EX5A 2ZGYA 3K9KA 3WXMB 5AZJB 3L8BA 1JLAA 4N5SA 4CK2A 3KJVA 4LFAK 3ZSWA 3RR7A 5LL6Z 1NJWA 1VK0A 4LFBK 3LP2A 3KK2A 3B8AX 3B6OA 3DLRA 4AILC 4CEDA 1S1TA 4M42A 3HOTA 2OPQA 3WT0A 3C0BA 1S6QA 5BR9A 4PWDA 1L3SA 3K5LA 3W0LA 3KKRA 1KAXA 3DJCA 3SLCA 2NRHA 3H45C 3VA0A 4ILHA 4OKKA 1NJZA 3CC4N 4BRAA 3V9WA 4H0VB 3CF5L 2IDOA 2IAJA 3J7ZO 4LY7A 3U9DA 3O3GA 2FBVA 2ZGZA 3QBXA 4JHDB 2QA4N 4ZTFA 2PFUA 3CD6N 4JI1K 3PY8A 3AVFA 4JKFA 3O4NA 3ZSQA 5ADXH 4JI6K 1EQYA 2NRRA 1SKWA 5LJWA 1RDUA 2X6NA 3AVLA 3QEIA 3N4QA 4DTRA 3O1WA 3UKUB 4DV1K 4K0KK 3VQ7A 2E1YA 4K25A 4KHNA 2QWPA 4ELUA 2PAVA 4A59A 1S1UA 4H8KA 5I3UA 2JWKA 2Q0RA 4CBUA 1HNZK 3A8YA 4CHOA 3GG4A 1GLEG 1BHLA 4N47A 3BF3A 1NM1A 4FYDA 3CCJN 4BRMA 3OS0A 1NK4A 1IG8A 3A5NC 1NJXA 4JI4K 2V7ZA 1S1VA 4KTQA 3WXJA 1XUPO 4JV5K 1RBUA 1CXUA 4LF5K 4CJFA 5DK5A 2HMIA 3TWHA 4FM1A 4GVEA 1NNEA 2YX6A 4HCCA 4AHSA 1HYSA 2KZZA 3VQEA 4FM0A 4E7IA 4AF1A 5I9EB 1W97L 1KAYA 1FK9A 1WOQA 3EN9A 3NF8A 3LDPA 3AO2A 4I9QA 2W41A 4DR4K 3OS1A 1HYZA 2IIRA 1CXQA 1WSGA 2DPNA 5KTQA 3AVBA 1U04A 4KRFA 1QS4A 1XQSC 4EZ6A 1OH8A 3CJ7A 3L2VA 2YI1A 1Q18A 1QSSA 5AQFA 4NXNK 5GINA 2FC0A 3J81O 2UU9K 5DMRA 2HB5A 3M3ZA 4DFPA 1TKTA 3FZLA 1YJ9N 2E2QA 1VSJA 3CM5A 5JS1A 3HZ6A 5AQIA 3KD5E 2RF2A 4GKKK 4GNIA 3F9MA 3TAPA 3TSUA 3LWMA 2G8UA 3ENOA 1SQKA 1KVCA 3A5OC 3LDOA 2ASOA 5AZIA 4ZTJA 2O8CB 4BWMA 4DTNA 1HKCA 2P9UA 3HM9A 1U48A 2DFHA 2KTQA 1S9EA 3IS9A 2NRZA 3LP3A 2GWKA 2HBLA 2DFFA 2YHXA 2F8TA 4CFDA 1LV5A 3F9KA 1OH5A 1QQNA 1A5WA 4LF6K 5KRSA 4QOZB 5M1QA 4BRPA 4CJLA 4L3QA 4M3RA 4XIUA 3O4QA 2FSKA 1Y97A 3SQ1A 4FJXA 4B3RK 5GAEP 2HBKA 3N4PA 3P1GA 4E1JA 4AM7A 1RDDA 4GV6A 3VF4A 3AVNA 3UKRA 2IVOA 3CCMN 3SPZA 4RW4A 3T69A 4CZMA 4W5TA 5BRFA 1JL1A 2WFBA 3ISNC 1JLFA 1HPZA 4B1ZA 3VQAA 1YJWN 4FXDA 5BN9A 1RT2A 3PO5A 4JYAK 5SWMA 1I3AA 4ELTA 3OJSA 1K8KB 2PYJA 2HOEA 3ZX3A 3O5BA 3F5TA 3RTVA 1FKPA 4B9VA 3O3HA 4OJRA 3MXJA 3VQPA 3VF6A 4DV6K 5AQHA 5GAHP 2E2NA 1Z6RA 2EX3A 3VQ8A 4RW7A 4YDUC 4PY5A 1VQMN 3QEPA 3AA3A 4BRDA 1ZBSA 4JKDA 3QDKA 4DLGA 4DTSA 4CJUA 4EHUA 4LF7K 4OLBA 1KTQA 4IFEA 3SUNA 2Q97A 4G9ZA 4AH9A 5TKWA 3V81A 5AJ3K 3CYMA 4CEOA 2QTDA 3AV9A 4A5BA 3DLKA 4DR3K 1XI1A 4WE1A 1OVYA 2VQEK 3HTVA 4KKOA 3O9QA 4B8AB 3VF2A 3LM9A 4DTOA 5CR4A 3AA5X 3BZKA 4JS5A 3NE6A 4B9QA 2KFNA 1EETA 2KHOA 1DTTA 3R6MA 3CCRN 5AQJA 3C7NA 2GELA 2P9PB 4JKGB 1EKEA 4CZGA 3L2UA 3CC7N 4BC3A 4CK3A 3J7YP 4AHTA 1FW6A 1LCUA 1VSIA 3NH0A 4F3TA 3HSCA 2HHQA 1WSEA 2FBXA 5AR0A 4CHPA 4YFUA 2PYLA 1HR0K 2XO7A 1YF5L 4H5NA 3SUQA 1NJIO 1ATRA 5F0XA 2Q31A 2YHYA 3IUCA 5BPLA 4CJVA 4O5BA 5EY4A 5FROA 3J80O 4E7JA 1OKJA 4E1MA 3HPOA 4DTJA 5CZ1A 3SBGA 5SZTA 3TR8A 2V52B 5J2PA 3OBWA 3AA2A 1IG9A 1D9DA 1SV5A 3DWLA 3NBPA 4JK7A 3IMXA 4FWKA 4KTWA 5J2NA 3IFRA 2QWLA 3M8PA 1GLLO 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 4U67 L;  3CCU N;  1VQ5 N;  1K73 O;  4IO9 L;  1M1K O;  3CCJ N;  5GAE P;  4IOC L;  3CPW M;  1YI2 N;  1VQ4 N;  5MLC Q;  3CCR N;  1Q7Y O;  5DM6 L;  5JVH L;  1YJN N;  4WCE L;  3CCM N;  3I55 N;  1KQS M;  3CC7 N;  1VQ9 N;  2ZJQ L;  3CME N;  3CXC M;  1JJ2 M;  1VQN N;  4WFA L;  1YJW N;  3DLL L;  1N8R O;  2QEX N;  1NJI O;  1VQ8 N;  1W2B M;  1Q86 O;  3OW2 M;  3CCL N;  3CCV N;  5GAD P;  3CCQ N;  4IOA L;  1VQO N;  1QVG M;  3PIO L;  1YIT N;  5H1S Q;  3CC4 N;  3PIP L;  1YIJ N;  5GAG P;  3CF5 L;  1KC8 O;  4WFB L;  5GAH P;  5DM7 L;  3J7Z O;  1KD1 O;  2ZJR L;  1YJ9 N;  3G4S N;  1K8A O;  1Q81 O;  2QA4 N;  3CD6 N;  1VQK N;  1ILY A;  3G71 N;  1VQ6 N;  5HL7 L;  1VQL N;  1VQM N;  1VQP N;  3CCS N;  2OTJ N;  1QVF M;  1Q82 O;  3I56 N;  5JVG L;  1S72 N;  4WFN L;  4UY8 O;  3G6E N;  3CMA N;  2ZJP L;  3CC2 N;  2OTL N;  3CCE N;  1K9M O;  1YHQ N;  1OVY A;  1M90 O;  1VQ7 N;  4WF9 L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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