3CCRN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation a2488c. density for anisomycin is visible but not included in the model.
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccrN00
5GADP 2ZJPL 4WFAL 3PIOL 3G4SN 1VQ6N 2ZJQL 1QVGM 3CCRN 1YIJN 5GAHP 1YITN 1VQON 1Q7YO 3CCSN 1K73O 3CCEN 1VQNN 1M90O 1YHQN 3CMAN 1ILYA 4IOAL 1K8AO 5GAGP 5GAEP 2OTJN 1VQ7N 2QEXN 1YJWN 1NJIO 4IO9L 1VQMN 1OVYA 3CD6N 1VQPN 2ZJRL 4U67L 1Q86O 1K9MO 1M1KO 4WFBL 4WCEL 3CCMN 3CCUN 4IOCL 3CCLN 3OW2M 4WF9L 1KC8O 1JJ2M 3CC2N 5DM6L 1VQ4N 1QVFM 5JVGL 3CMEN 5H1SQ 3DLLL 1KD1O 5JVHL 2OTLN 1VQKN 1VQLN 1YJNN 3G71N 3CF5L 3CXCM 3J7ZO 5MLCQ 3CCVN 5DM7L 3G6EN 1S72N 3CC4N 1KQSM 3I55N 1YI2N 5HL7L 1VQ5N 4WFNL 3PIPL 3CCJN 1N8RO 3I56N 2QA4N 4UY8O 3CCQN 1VQ9N 1Q82O 1W2BM 1VQ8N 1YJ9N 3CC7N 3CPWM 1Q81O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AM6A 1NGFA 5CYQA 3G4SN 1VQ6N 4CW7B 5AQXA 4K0KK 3WXIA 4FL9A 4DMNA 3FGUA 3MK6A 3LDSA 4BREA 4FLVA 3VQEA 4X62K 4YOUA 5KGWA 3A5MC 5C15A 3ZETB 1X9MA 1N5YA 1XQSC 4J2EA 4E19A 2YJEA 2IAJA 4Y1DA 3ZSOA 2P5GA 3O1BA 3IUCA 1I39A 2IDOA 3HOSA 4GNIA 3K5MA 3SPYA 2E6LA 1NGCA 3AVCA 1LWCA 3LANA 1JLGA 1NK7A 2KQ2A 2HNYA 1K6YA 4Z0UA 4CJUA 4M41A 4AHVA 4PHTX 2D0OA 2P9IA 2F9TA 3VQ9A 5M1QA 4DV2K 1I3AA 4CJPA 1CLQA 1C0GA 3B6PA 4MO4A 2A3ZA 4KO0A 3LDOA 4AHUA 4JNEA 3VETA 4JEPA 1OH6A 4FWPA 3HM8A 4JK9A 4JI6K 3NDKA 3R6MA 3FFIA 3GG4A 4LFAK 5EX5A 3FFKB 1RDWX 2HF4A 3OJSA 4FWQA 2UXCK 3U3YA 1LWFA 2UU9K 5DM6L 3HK2A 3MWPA 4OJRA 2AJQA 2HHSA 1KRPA 3CG7A 3ZSXA 2UYTA 3ASMA 3SUNA 3P38A 3EO3A 5JVHL 3VMFB 3THYA 1VQLN 4AHTA 2QWPA 4WE1A 2KHOA 3HP9A 4LF8K 3SUPA 1J5OA 3C94A 2Z1IA 3HVRA 3A5LC 5JS2A 3DM2A 1S1VA 3KTQA 4CJ7A 4W5OA 4Z4EA 4GVMA 1IBLK 5HL7L 4C8OA 1JCEA 2W6LA 4Z94A 1FKOA 1HNXK 2ZGZA 4DG1A 4NXMK 4FZYA 4CF0A 3QFUA 4FJKA 3HO1A 1L5UA 3T7ZA 1SKRA 4FJMA 5BPLA 3W0LA 1NGEA 1ZC6A 3L0QA 3VESA 1VSLA 2IVNA 3SAFA 3P1GA 4K25A 3NE6A 4FJGA 3Q7BA 2OZSA 3U9DA 4K41A 3L8BA 1ZBLA 3ZSQA 3THYB 5HRPA 4E7HA 4YY3K 3ZEUA 3K9KA 1WNSA 5AQFA 5M1FA 1U47A 4J2BA 4FK4A 4YOXA 3BY5A 2O4GA 2D0AA 1LWEA 4JLHA 3OTOK 4DSKA 4E7KA 2WC9A 1GOBA 4DV7K 4HCCA 4IOAL 1X3MA 4JI3K 3EN9A 2E5LK 3HXMA 2HOEA 3AVBA 3ULEA 2Y1JA 3M3ZA 5FLXO 4B9UA 1EETA 5A2QO 5SZTA 4B8CA 1OKJA 1L3VA 2G8WA 4KHYA 2O8FB 4IXCA 5M1OA 4KB1A 1SL0A 1WN7A 5M1PA 3O3GA 2OPPA 3BEXA 1MDUB 3LPUA 4H0XB 4CJKA 4QCLA 2QKBA 4GKKK 1KLMA 4C8LA 1SL1A 4JHDB 3QBWA 4J8FA 4CEZA 2AA4A 3WEEA 3KKRA 1YUWA 1U04A 3AA5X 2I7PA 3T69A 2B5JA 4FZXC 4LF6K 5AQKA 4DFMA 2GV9A 4OVLA 4EP5A 2V7ZA 4K8ZA 1YVUA 3CJ9A 1BDGA 5C2DA 1IO2A 3CQXA 1RDUA 3SQ4A 1S3XA 3QEIA 1KXPA 3VEWA 2Z1JA 4BR0A 1QHAA 4FJ7A 3DXKA 3M5RA 2NNWA 3IKMA 3LDNA 4WFNL 1QQOA 5TKWA 4CZKA 4FPAA 5C25A 1RBTA 3PSIA 4PKHA 2DFHA 3NH1A 1T05A 3AO4A 2P9KB 5LMUK 2P9PB 4H0YB 1Z05A 4O44A 3K57A 3CC7N 2P9UA 3QLHA 4JV5K 5E26A 3KLIA 4KAZA 2PZSA 4RG8A 3OYGA 2DTUA 2O8EA 3H08A 4LD0A 3THWB 3V6DA 1NGAA 1DKGD 4PWDA 3AVLA 3DXKB 4Z4GA 1KVBA 2Q0RA 3VQDA 4DV0K 1U49A 4DQSA 3E1YA 3M1FA 4DLEA 3HYFA 4H0TB 2JWKA 4BRGA 4O8UA 4DTUA 5I42A 3ZT3A 3C6UA 5AQZA 1MWMA 2HHTA 1WAJA 4CK2A 3D2EB 2W40A 4A61A 1BL3A 3VQBA 3WQTA 4BRAA 1B9DA 4BC2A 1T6CA 2YKNA 4GY2B 3AVIA 2HSTA 5GIPA 3AV9A 4DCHA 3LWLA 4JKHA 4JKAA 4WFBL 3QIOA 1XUPO 3DWLA 2UUAK 3CCLN 1Q9XA 4OKJA 1Z26A 4GW6A 4B1WB 5AQSA 1HYVA 3ZCMA 3GE1A 4KH4A 1YF5L 3S3OA 4EHTA 3V9WA 4PA1A 3BUZB 5H1SQ 3ID6A 1KD1O 4ELUA 4IJAA 1B9FA 4MLHA 1C6VA 3RSEA 3CPEA 3SMSA 4FWSA 1N32K 2XY6A 3F73A 5BPNA 5CZ2A 3J81O 3HOTA 3VQ5A 1QSSA 3M6GA 4DR5K 4JI4K 4NB4A 5JMVA 3SCXA 2E2QA 3R8EA 4MFBA 1RDAA 1S72N 2QWLA 5BN9A 4B1UB 1S22A 4GV3A 4PQUA 4A5AA 3KK2A 4K8XA 3TARA 3VERA 4Y1CA 1XNQK 5AQYA 1W2BM 1JKHA 4CESA 1SKSA 4W5TA 5AQRA 4FOEA 1D4XA 4GVEA 4DQIA 1ZXOA 1RT1A 2QI2A 2RKIA 2H3GX 1Q81O 4CERA 4JI2K 2VQFK 4LC9B 4H5TA 1DEJA 3RMCA 1SKWA 2NRWA 4KTZA 1T44A 1B92A 3UE5A 2GWKA 4CHQA 3VQAA 3L6QA 4DS5A 4PL7A 3LP0A 1MU2A 3CCSN 3P4IA 2BH1A 4CFDA 2PBDA 1ILYA 1YT3A 2BE2A 3HBTA 4F2RA 2YJFA 4DF8A 2A42A 1BCMA 1BGXT 3RMBA 4KHPK 2GX9A 3K59A 1A5XA 1GOCA 1XC3A 2VG5A 1T03A 4CGFA 4M7YA 1NJZA 1VQMN 3WT0A 4CJ5A 2KTQA 3NAEA 4E1JA 4CEOA 3VEVA 3DI6A 4RWTA 3KWGA 4CK1A 1E4GT 1EWQA 5F1XA 5E41A 3KLGA 3O80A 3VA0A 4L8RB 4DR6K 3CJAA 3D7EO 3V1OA 3K2PA 3OYMA 3NFAA 4MDAA 2E6MA 2FBVA 4O5FA 3KD5E 1HUXA 4H8KA 1NGBA 2VWBA 4F4KA 4CEDA 4B3RK 3K5OA 2O8DB 4IEIA 5AFUA 4LFBK 2HHHK 3ZSZA 1VRTA 4RCHA 4B1VA 1VQKN 3FZMA 1UAXA 5JLFA 4M7XA 4DSIA 4CECA 3OS0A 4J2DA 2P5OA 1NKEA 1XMQK 1X9WA 3OYNA 4FW1A 5MLCQ 4PKGA 1TK0A 3RWUA 1RTDA 4AHRA 4BRFA 2HF3A 3CFPA 3SJJA 3SMPA 3NGZA 2G8FA 4V19S 2Q31A 4M45A 3J8AA 3V1RA 3ZSVA 4M3TA 2GUPA 4JYAK 2DFEA 3QESA 3AVMA 2AP1A 3BF1A 4AHCA 2F4VK 2G8IA 1RDDA 2QWOA 4CZHA 4J2AA 2RF2A 5CE3A 4DV4K 1TAQA 5GINA 4KBOA 3AAQA 3CPWM 3MECA 1RBUA 3WQUA 3NH2A 4WFAL 1KCFA 3LAKA 4DR7K 2A6AA 2NZTA 3TTFA 4E3SA 3NMUA 2ITGA 2KKZA 1HLUA 4O0IA 4C8NA 4RW9A 3ENBA 4IFYA 3TAGA 3NF7A 4FWMA 2Q1NA 2JGUA 3O4WA 1TL1A 1XI1A 4IDKA 5M1NA 4YOYA 4CHOA 3OYKA 3PV8A 5BRFA 2FF3B 4UQGA 3CMAN 4CJWA 1KAXA 2RPIA 4BACA 3U4LA 3SV4A 4DU3A 3LPTA 3RRHA 2FSJA 1KLNA 4Y0WA 1DT9A 2GELA 1BI4B 2QWMA 2A1SA 5AQIA 2UXBK 3LALA 3VQ4A 5SWMA 2ZJRL 1BCOA 3P39A 2IVPA 4CK3A 4Z4CA 3UB5A 2GEMA 1W0HA 4BRHA 4DV5K 4DSLA 1ATRA 4GV6A 4NCBA 4GKJK 4BRKA 3CCMN 3RR8A 3LDPA 3I0RA 4HTUA 1S6QA 3J7AP 3FE1A 4C8KA 1HYZA 4OPHA 4E7LA 3QIPA 1JJ2M 4BRQA 4EIAA 1VSEA 4CBWA 4BDZA 3U9ZA 1QVFM 4NLCA 3I33A 5JVGL 3L3VA 5HOOA 1SUQA 3LM9A 1TKDA 4BRIA 2YNIA 3OYLA 2XY5A 3SV3A 4CJ3A 4CD3A 4O4GA 5AZJA 4FLTA 3SUOA 1XHXA 2WBNA 5AQGA 4CI6A 1CZAN 3MAQA 4BR7A 3I55N 3CQ8A 5KRTA 2ASMA 4CGHA 1R59O 3UKRB 5HLFA 3BGRA 4BY9C 1VSIA 2HHVA 3C95A 4ZTFA 1H1VA 1E3MA 3ULDA 1WUAA 1N33K 2F9WA 1EXQA 4CZLA 2E2PA 5CZ1A 4CJTA 4CEEA 1VSFA 3DLRA 3ZT1A 5E84A 4JKGB 3K5LA 4RW7A 4DUZK 4CIEA 3OVNA 3SUQA 1YIJN 1IBKK 4Z4IA 3QEXA 2XHBA 1QSYA 1QE1A 3WNHA 5LJWA 3CIPA 5AQUA 4JN4A 5C42A 1FXXA 1S1XA 3L3UA 5C2FA 1IH7A 3T1YK 3AGKA 3HP6A 2KW4A 3TPQA 3OS2A 1VSKA 5AR0A 1SV5A 1ZBIA 1GLLO 3SI6A 1EKEA 3K5NA 1ASVA 5KPTA 1S1WA 1F21A 4KB0A 3D45A 4FPBA 1NGHA 1TYQB 3DJCA 3W3DA 1RDCA 3TR8A 3RMDA 1NJIO 1D9FA 4BWJA 3KIOA 4BRLA 3AO5A 3LL3A 2P9NA 2Q36A 1N36K 2OPSA 2QWNA 1ITGA 1SS6A 3KVGA 3VGMA 1NOZA 1UA0A 5AQQA 2HW3A 4HUEA 1U6ZA 2OCEA 4OLAA 4DTRA 1KC8O 1NJXA 5DK5A 4E89A 3M8RA 3OBYA 2O8CA 2WONA 5FRNA 2ETJA 5TKYA 2QKKA 4JD2B 4XEIA 3NH0A 4H0VB 3PY8A 1LV5A 4BR2A 3DYAA 4YHHK 3RR7A 1QSLA 3ZT0A 3F9KA 3VQPA 3RRGA 3VEZA 3SJHA 4B9LA 5AQJA 2A1RA 3AA4A 3H45C 1EQYA 3SAHA 2YHAA 3CCQN 4ISEA 4KKOA 1QS4A 3A0IX 4F3TA 1TV6A 4ELVA 4ILGB 3VQ7A 1NK0A 1X3NA 1BUPA 2P9IB 1JLFA 3CJ1A 4YOVA 4DKWA 1S6PA 1SQKA 5HRSA 3KK3A 3TAEA 3NGIA 3NVMA 3HTVA 1WSGA 3I8BA 4CF2A 1IG9A 4NYNA 3QEPA 3TTCA 3OJUA 4ID1A 2QTDA 4ISGA 1NGDA 4DV6K 1HKCA 3KK1A 4DV1K 3VEXA 1GLJO 2DFFA 3JAMO 4I6MA 5KRSA 3TWHA 3DRPA 1G15A 1UWBA 4IOXA 4TSXA 4DQ8A 3J7YP 3H1QA 5AQPA 2YNFA 4ICLA 4DQRA 3VEYA 3V9XA 5LJVA 3CHWA 3SBGA 1WSHA 4RW8A 3NCIA 1QZ5A 2EHGA 2HBLA 4K43A 3PO4A 3O9QA 4H5WA 2G8UA 4FJXA 1HPMA 2YNGA 4M3RA 5KQDA 4FOIA 4ISFA 4KPYA 3M8SA 1WSEA 4CJRA 4ILJA 1GLFO 3KLFA 3EE9A 4B8AB 4M63C 3IFRA 4DSJA 4FJ5A 2ZM6K 2HB5A 2OTLN 4E1NA 1HNWK 2NRVA 3F2KA 3G71N 5BPMA 4Z4HA 4I9QA 3OYHA 4JI1K 1WSJA 3B6OA 3K9JA 3LP2A 2PYJA 5DM7L 3BZKA 2X78A 2YHYA 4QS9A 1Y97A 3CC4N 3J80O 4JK7A 3ZEUB 1T3VA 5DMRA 3MXJA 2E1ZA 4IDHA 4B1ZA 3HSCA 1UOCA 3ZX0A 3F9MA 3I8DA 1NKBA 1FW6A 2BTFA 5EXWA 4DTMA 1VQ9N 3D6RA 1HMVA 1TGOA 4PY5A 3HM9A 2DPNA 1O1WA 4LH4A 1JLEA 4OGCA 2JLEA 2P9SA 3BP8A 2GBZA 3OYBA 3SQ0A 3ULEB 3S3NA 3F5TA 2OZMA 3C6AA 4PL8A 3PSFA 4MO5A 2D0CA 3U6FA 1BHLA 5I3UA 1VQON 3EZ5A 1Z6RA 4H03B 4G9ZA 2B4JA 1HR0K 4Q0BA 4BGAA 5J2PA 2E4LA 5BRHA 4DTNA 4KI4A 4QOZB 2G8HA 4YNQA 1T8EA 2FLOA 4CEAA 1OH7A 3WEEB 3MN9A 2VWKA 3U8XA 4CZMA 1JLQA 3LAMA 4NCGA 4HHTA 1OH5A 4WYBA 2QEXN 3AAPA 1XMOK 4FVMA 1OVYA 3O3FA 2P9SB 2B6AA 4CIFA 3DRSA 1Q86O 3L2VA 3C65A 2HHUA 3BF3A 3WXMB 3CCUN 1EP4A 4FJJA 1TUYA 1RT3A 3FZHA 4JKBA 4ELTA 1MA9B 4FJNA 1ZYQA 3V4IA 1YTUA 5AJ3K 4KTWA 4NXNK 1ZBHA 2A5XA 5BN8A 1DLOA 2P9UB 3VN5A 1HNIA 4CHZA 3CF5L 1BG3A 3L4IA 4JKEA 5D3GA 4CJLA 3C6HA 1W9HA 3KJVA 2O8EB 3CYMA 4W5NA 1LW0A 1C0UA 3PIPL 4DS4A 2JWLA 4OKKA 4KHSA 4CEBA 2X74A 3NF8A 4E0DA 1JCGA 4KH5A 2P1JA 2YV0X 1GLDG 2QK9A 4DUYK 3MMVA 3PIOL 1HYSA 4YDUA 3ZT4A 3C6TA 1RDBA 1RBRA 2RN2A 3MWTA 3OY9A 3S9HA 1WBDA 4FLYA 2VYPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4AM6 A;  1NGF A;  5CYQ A;  3G4S N;  1VQ6 N;  4CW7 B;  5AQX A;  4K0K K;  3WXI A;  4FL9 A;  4DMN A;  3FGU A;  3MK6 A;  3LDS A;  4BRE A;  4FLV A;  3VQE A;  4X62 K;  4YOU A;  5KGW A;  3A5M C;  5C15 A;  3ZET B;  1X9M A;  1N5Y A;  1XQS C;  4J2E A;  4E19 A;  2YJE A;  2IAJ A;  4Y1D A;  3ZSO A;  2P5G A;  3O1B A;  3IUC A;  1I39 A;  2IDO A;  3HOS A;  4GNI A;  3K5M A;  3SPY A;  2E6L A;  1NGC A;  3AVC A;  1LWC A;  3LAN A;  1JLG A;  1NK7 A;  2KQ2 A;  2HNY A;  1K6Y A;  4Z0U A;  4CJU A;  4M41 A;  4AHV A;  4PHT X;  2D0O A;  2P9I A;  2F9T A;  3VQ9 A;  5M1Q A;  4DV2 K;  1I3A A;  4CJP A;  1CLQ A;  1C0G A;  3B6P A;  4MO4 A;  2A3Z A;  4KO0 A;  3LDO A;  4AHU A;  4JNE A;  3VET A;  4JEP A;  1OH6 A;  4FWP A;  3HM8 A;  4JK9 A;  4JI6 K;  3NDK A;  3R6M A;  3FFI A;  3GG4 A;  4LFA K;  5EX5 A;  3FFK B;  1RDW X;  2HF4 A;  3OJS A;  4FWQ A;  2UXC K;  3U3Y A;  1LWF A;  2UU9 K;  5DM6 L;  3HK2 A;  3MWP A;  4OJR A;  2AJQ A;  2HHS A;  1KRP A;  3CG7 A;  3ZSX A;  2UYT A;  3ASM A;  3SUN A;  3P38 A;  3EO3 A;  5JVH L;  3VMF B;  3THY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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