3CCRN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation a2488c. density for anisomycin is visible but not included in the model.
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
b'ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccrN00
4IOCL 2ZJRL 4U67L 1NJIO 3G6EN 1QVGM 3CPWM 3CCSN 1M90O 1VQKN 5GAHP 5HL7L 3CCVN 4IOAL 3I56N 5DM6L 3CCRN 1Q82O 3CMAN 3CD6N 4WF9L 1QVFM 1Q86O 2QEXN 1YJ9N 5DM7L 4IO9L 1YITN 1Q7YO 3CC7N 1K9MO 3CCJN 1M1KO 2ZJPL 1S72N 3CMEN 5GAEP 1YI2N 1JJ2M 1VQ4N 3DLLL 1VQPN 3CCMN 3I55N 1VQMN 1K73O 1YIJN 1KQSM 3G71N 1ILYA 1KC8O 5GADP 5H1SQ 3CF5L 3CCQN 2QA4N 1VQ7N 1W2BM 4WFBL 2OTJN 3PIOL 1K8AO 5MLCQ 3CCUN 1VQLN 1VQ6N 3CCEN 5GAGP 4WFNL 1OVYA 3CCLN 3CC4N 4WFAL 1VQ5N 2ZJQL 5JVGL 3J7ZO 1Q81O 1VQ8N 3CC2N 1VQNN 1YHQN 1N8RO 1VQ9N 3G4SN 3OW2M 2OTLN 3PIPL 1VQON 3CXCM 5JVHL 1YJNN 4WCEL 4UY8O 1KD1O 1YJWN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CJCA 4FJ8A 3KLGA 1HYZA 4GNIA 3KWIA 3NF8A 2X6NA 2BGGA 4M3YA 4KHUA 4H0PA 1T03A 3AO1A 3VQ4A 1T6DA 4B3OA 1QSLA 1WOQA 1SUQA 1HNXK 1ZBSA 3U9DA 5M1FA 4W5RA 4H4MA 1KLMA 4FOIA 3I0SA 1TK0A 5ELZA 1L3VA 1Z25A 3C6UA 4FW1A 4M63C 2PY5A 1KAZA 4RW9A 4JI5K 1QE1A 1JL1A 4HWIA 2F4VK 3MXJA 3CHWA 4I6MB 4YHHK 2QEXN 3S3OA 4Z4EA 4F3TA 3GL1A 4CE9A 4CEOA 3AV9A 4LFBK 1WSHA 5AQKA 3KK7A 4FJKA 1HJRA 2IVPA 4DQSA 5E41A 2D0BA 2V51B 1BWFO 4DSEA 3TAQA 1HKBA 4IFEA 1RBSA 5GINA 4FLTA 4FWMA 4CESA 5IT9O 3DMJA 1SKWA 3HOSA 3EE8A 3DXMA 4BRDA 3G71N 2O8FB 4DV7K 3MCPA 1RDAA 4DF8A 4W5TA 1HNIA 4AHSA 4MO4A 1IJJA 1VSKA 5EY4A 4DU3A 1VQ7N 1MDUB 4YOUA 4F4KA 3FZFA 2QWQA 4CBXA 4JEPA 4CEBA 4Z94A 3AA4A 2OPPA 4FWLA 1QHTA 3M8QA 2O4IA 1S6PA 4KTQA 1E4FT 4FYDA 2P9PA 1VQLN 2HB5A 4H0XB 4KH4A 3ZSYA 3D45A 3G10A 1XHXA 3SQ0A 2E8AA 2G8HA 3EKSA 3ZEUB 1ASUA 3L2VA 2D0OA 1V4TA 4BRMA 1NBWA 4LY7A 4PWDA 3BZKA 2UXCK 2QKBA 3C94A 3TAEA 3EZ5A 3HL8A 1HPZA 1L5UA 4B1WB 2HSTA 3E9PA 3OS0A 1GOBA 3M5RA 1VK0A 5C24A 5JVHL 4H0YB 3CQXA 1NOYA 2O8BA 5FPEA 4C8NA 3SPZA 4OO1J 4KHWA 4H5VA 4RTFD 3R9PA 1X9JA 2ZJRL 3VEYA 1S1TA 4QAGA 3KK1A 3QEXA 3KK3A 3UE5A 3I8DA 5FPNA 1L3TA 4JI0K 1NGFA 2E2QA 4M45A 3CG7A 4CI6A 5BN8A 2G8UA 4DUZK 1OH6A 3CCVN 1TKTA 4IOAL 3OYEA 4LF6K 4DHYA 3L2UA 3CCRN 4YOXA 3JXUA 4CHQA 1T44A 3O08A 1QZ6A 3BZCA 2HNYA 5M1PA 4DLEA 2E5LK 3O3GA 3RMCA 3CC7N 3CCJN 4X64K 3L0QA 2AJQA 1J5OA 3U8XA 1GOAA 3C6HA 3KIOA 4YNQA 3AVMA 3UKRB 2XHBA 4DUYK 4LH4A 1VQ4N 5KQDA 3VESA 3QEWA 3QINA 4CF9A 3ID6A 5D3GA 3DM2A 2ZM6K 1SL1A 4CJUA 4CHPA 4DU4A 4DSLA 3WUHA 4BC4A 1GLFO 3EO3A 4FM1A 2HHVA 1S1XA 1IG9A 4J2AA 3HM9A 3NH0A 5B8HA 1DLOA 1Y97A 3KLIA 3OBYA 4OPAA 4DF4A 3MMVA 4JKCA 1RTDA 1ASWA 4O5BA 2AA4A 4DWIA 4JD2A 3L3VA 3VQ8A 1I39A 3ZSWA 3CCEN 3KD5E 2ITMA 5C2FA 2VG5A 3CC4N 5EOYA 3LPTA 5JVGL 1UA1A 3J7AP 3TANA 4DTRA 4J2EA 1BA0A 3D2EB 2P9NB 3AVAA 3B8AX 4YFUA 1ASVA 1ATNA 1MA9B 1XWLA 1VQ9N 3SAGA 3LDOA 2R7YA 5BN9A 3LDLA 2OANA 1VSDA 1WBBA 2RPIA 1VAZA 4BGAA 3SUOA 3WNHA 4W5NA 4EZ9A 5AQWA 1RDBA 3WT0A 3RMBA 3VN5A 2ZGYA 1BIZA 1TUUA 1VSLA 3IFRA 5AQSA 1HKGA 4CJVA 4KHNA 3AA3A 4LC9B 5DM6L 1MWMA 3SQ4A 1RDWX 1XUPO 3NE6A 5JLFA 1QVFM 4RWTA 4C8LA 2HBLA 2Q36A 3S41A 5F1XA 2GUPA 4C1NK 4FWNA 1M1KO 1HLUA 5AQUA 4JKBA 2IOCA 3RRGA 3O80A 3UKUB 5AZJA 1OKJA 5FPMA 1HQUA 2O8CA 3H6EA 3H45C 5TKYA 2UUBK 4BRNA 4QS9A 1IV0A 1C0FA 2A6AA 1YIJN 5JLHA 4GKKK 1TKXA 4CFAA 3L3UA 1LCUA 3RWUA 1DKGD 4CEZA 3OHRA 4DFPA 4EIAA 4CF2A 3OS2A 4DV0K 3J7YP 1EWQA 3MK6A 4FOEA 1EETA 4YY3K 1V4SA 1REVA 2PFUA 4B1YB 2FF6A 3ZSZA 4AQYK 3E66A 5CZ1A 4CJ5A 4C8OA 3S3NA 4BRHA 3OTOK 2PBDA 1VQ8N 2IAJA 5HRPA 3QFPA 3O9SA 1JL2A 1N34K 3KTQA 1VQNN 3V9UA 3IS9A 4JKGA 5JS2A 4ZTFA 1JLFA 1RBRA 3G4SN 4KB0A 3E1YA 4QOZB 4XIUA 3QEVA 2FXUA 3DI6A 3SPYA 4K0KK 4ZTJA 1NJIO 5AZIA 4H0TB 3O4WA 4BRKA 4AF1A 2BH1A 3AVJA 1N36K 2W41A 2A3ZA 1VQKN 4CK3A 1YAGA 4JRPA 1P90A 3MWTA 2KHOA 3PX0A 5AQYA 1VSJA 4E7KA 2I5JA 4KREA 5IWAK 3HRGA 4CJEA 2VWJA 4X66K 4FLVA 3PO5A 3PX4A 2F7TA 5AQQA 1D5AA 5LY3A 3OYNA 1QZ5A 4CGGA 2CGJA 2VQFK 3TTDA 3CJAA 5AQMA 4H5TA 3VQEA 2Z1GA 5HOOA 3HPHA 1NKEA 4KHPK 4BROA 3SUPA 4E3SA 2GV9A 3B6OA 1JCGA 4O5FA 4NXMK 1XNRK 3KWGA 1RBVA 3FGUA 2IC3A 4HCCA 1SV5A 5E26A 1JCFA 5AQXA 1OVQA 5FPDA 3A8YA 3CCQN 1P8ZA 3ZCMA 4CD3A 1J53A 4CJLA 3SJJA 4EP4A 5DK5A 3LZIA 2IDOA 3ZETA 4KKOA 4A2BA 4DCHA 2Q2RA 2DY4A 2GBZA 3ATUA 1IBLK 4L8RB 3EKUA 4YDUC 1T8EA 4CJRA 3U6FA 2QWRA 4BR7A 4JKFA 1Q81O 3HT3A 4JI4K 1HNWK 4RW8A 1BCMA 5C10A 3EN9A 4KHSA 5A2QO 3IRXA 3HPOA 1FJGK 2OTLN 3LDPA 3UIQA 2WBNA 3OVNA 2I7NA 1Q8IA 4WYBA 3PSIA 3WXJA 4NO7A 4H4OA 1YT3A 5FLXO 2HHUA 2QM1A 2P9KA 4FLXA 5I42A 2KFNA 5AQLA 2O8DB 3PX6A 4CJSA 1VRTA 2VWKA 3ID8A 4IG3A 1EXQA 2FBTA 4Z4IA 3ULEA 3KHYA 4OPKA 3ZSQA 2QI2A 5BR9A 5JMVA 4IKFA 2DTUA 2GUIA 4DU1A 3MEEA 3LPUA 4IDHA 3IMXA 5HL7L 3GOIA 4O8KA 4CJFA 4BRFA 3MEDA 4J2DA 1JLAA 3MN9A 1Q82O 2G8KA 1G15A 1CZBA 4KFBA 4JV5K 5I9EB 1YVUA 4DS5A 3TI0A 2D0PA 5DM7L 4BE2A 1K9MO 3ZT3A 3NH2A 3BF3A 1VSMA 4M7YA 3RMDA 4KI4A 4FWPA 5K14A 2P9IA 3SUQA 2FBXA 5EVZA 1TUYA 2E2PA 1SKRA 1LWFA 3DLRA 2QWLA 4CFBA 4DSKA 3VQ9A 3QDKA 3LWMA 4HHTA 3M8PA 3MN7A 3CQYA 3WXKA 4ICLA 2A1RA 1D9FA 4BRQA 4WE1A 4FJ7A 3E01A 4B9QA 4BQLA 3C6AA 3FZMA 4BR2A 1CXQA 2RHKA 3V1QA 2QK9A 5GIOA 3AARA 4FK4A 2FBYA 4O0JA 4HUEA 2F96A 2OCEA 3U3GA 2YJFA 5C42A 3AO2A 2UU9K 3BP8A 3SLCA 3H08A 3DXKB 1NLVA 3EY1A 4A59A 2FBVA 3TWHA 3HOTA 3V4IA 3OYFA 3WQUA 2DFEA 3GDQA 1ZBFA 3VEWA 3LL3A 4E89A 3BEXA 4M3XA 4CJWA 4U7BA 4MO5A 3O4NA 1U04A 3CC2N 1KVCA 3GE1A 4GVEA 4CGHA 4CHOA 5AQZA 1C6VA 2YHAA 3G25A 3QMLA 4E1JA 4KI6A 3BF1A 1TYQB 3W0LA 2Q31A 4OPHA 1YJNN 3AA2A 1J6ZA 3DLKA 3LALA 4EP5A 5BPNA 2D1KA 4CECA 3C0BA 2JLEA 3AGRA 3ASMA 3FLCO 4BC2A 1L3UA 3ZLJA 4CJ7A 1ZBLA 1NGDA 2ATQA 3CMAN 2HF4A 1CZ9A 1SS6A 3VERA 3CD6N 4CK1A 1DTTA 1JLCA 2CGLA 2HMPA 3V9WA 1X9WA 5CR4A 3TSUA 1EX4A 2YV0X 2RN2A 3CJBA 4BACA 2GWKA 1S72N 3FE1A 1WUAA 4Z0UA 2IVOA 3U3YA 2HHTA 4JN4A 4FPAA 4H8KA 5BPMA 4B3MK 5KRSA 1LW2A 2JWKA 4F2RA 3PV8A 1R0AA 3OYGA 1BI4A 2E4LA 3WQTA 4PL7A 1BO5O 4FL9A 5AQTA 4DTOA 5GADP 3NF6A 1HNZK 4DB3A 3OYIA 2UXDK 4RG8A 2VGMA 3LP2A 4B9UA 2QWOA 2W6LA 4B9MA 3SQ2A 4FM2A 4LFCK 2UXBK 4KH6A 3VTHA 3F9KA 3QESA 1O1WA 2BUPA 3VQBA 3VEOA 1JLQA 3NCIA 3H1VX 4CZMA 4AH9A 4CD1A 4WFNL 3Q7BA 3THYA 2KZZA 4B3RK 3IDHA 3ALYA 1DGKN 1S1WA 4Q0BA 1KCFA 4K42A 1XC3A 4M3WA 4FLWA 1NOZA 3K9JA 1U6ZA 3JAMO 4LF5K 4FJHA 4Z4CA 3CI5A 1I94K 3HSCA 2E20A 3O8MA 5T7BA 2NRVA 4JS5A 4NCBA 2CH5A 3PIPL 4CHZA 3KKRA 3IAYA 4NCGA 3DYAA 3TSQA 4DR7K 5BRHA 4PUOA 1IO2A 1NGGA 1RT7A 2YHBA 3AVLA 3CFOA 3FZKA 5J1EA 3SV3A 1BUPA 5AQGA 2VG7A 3CPWM 4K8ZA 1NGCA 4NLBA 4IDKA 1XNQK 4JI7K 1U2VB 4BG8A 4BWJA 3DLGA 4A2AA 4YOVA 5AFUA 5J2MA 3T7ZA 3QBWA 4WF9L 1OH8A 2WFBA 3CERA 4RW6A 1NGIA 2O8EB 2FC0A 1JLGA 3O6WA 4DG1A 4KBOA 3CM5A 2E6MA 4J8FA 2Z1JA 3AVFA 3LP3A 3SCXA 3S3MA 3AGKA 1KVBA 2G8WA 3P38A 1C1AA 4BR0A 5FRMA 2ZGZA 4LF9K 4Z4HA 1QSYA 3LWLA 3CQ8A 3TAFA 4V19S 2P9UA 3CCMN 2H3GX 1NMNA 4BRLA 4DQIA 1C0MA 2OPSA 3KVGA 4BR4A 1SKSA 2P5OA 3FR0A 2ZF5O 4AM7A 3QEPA 4DR1K 4FXDA 4IBNA 2YHXA 1SQKA 3CF5L 2D0CA 1J5EK 3WXIA 4XH5A 1NJZA 2OZSA 2ASPA 1HJOA 3O3HA 2OTJN 4OPJA 3QNNA 3HPGA 1BIUA 2EWSA 2YNIA 3MN6A 2BTFA 3A5LC 3V1OA 3H3NO 3ZYYX 3OBWA 4KHQA 2NRTA 2PAVA 3SYZA 1C0TA 1RT5A 3NAEA 4DLGA 2E6LA 3J7ZO 1IH7A 3LDSA 1JLBA 1ITGA 1U48A 1QSSA 4DR2K 3F73A 2KKZA 3CJ1A 3NH1A 4DSJA 4FM0A 4CZEA 3PO4A 1VQON 4LF4K 4DQPA 4WCEL 1QQOA 2P9LB 4R79A 1WLJA 2A40A 1BOTO 1ZBUA 4RW7A 1XMOK 1TV6A 3NVMA 3ZT2A 4M41A 3H1QA 4HCBA 2Z1IA 4CEDA 3VENA 1HYSA 3O9RA 3RRHA 4JKEA 3RSEA 4GMJB 4FJNA 3AO4A 5M1OA 1N32K 3TR8A 2FLOA 4IOXA 5LJVA 4CZLA 5KQ8A 3T1AA 3HXMA 2F9WA 3ISNC 4O44A 3VMFB 5AQHA 3DXMB 1C0GA 3P5JA 4BR9A 4DV6K 4M3TA 2IIRA 4NLCA 4B1ZA 1S6QA 4DTUA 3M3ZA 3P1GA 3OYKA 5LMUK 3K59A 1VQPN 1VQMN 4JI2K 4EFHA 4IEIA 3SMPA 3NGZA 3VEVA 4CJQA 3MN5A 2VGNA 3J8AA 2P9PB 1ZXOA 1S9GA 4K25A 4KB1A 2XRIA 5AR0A 1A5XA 1HNVA 2XY7A 1D9DA 1K6YA 3ZX2A 3LM2A 4JHDA 1TKDA 3QEIA 5C2DA 1NNEA 4AHCA 5BRFA 1W9HA 3DRRA 3JS6A 4EHUA 4I9QA 4DTXA 2QWNA 1RT6A 1Q18A 2NUBA 4BRPA 3VTIA 3SAHA 3EYZA 3O1BA 3VGLA 1HX1A 5BPLA 1ZYQA 5EXWA 3NFAA 2UUCK 2IVNA 2ZJQL 1K8KA 2O8BB 4L3QA 5SWMA 3VA3A 1Z05A 4BRCA 3IG1A 3ULDA 3AVBA 1RDDA 4HTUA 5M1QA 1RFQA 3ENBA 3SNNA 3F9MA 4W5OA 1T05A 4JNEA 4DR5K 4E7JA 1KSPA 4TSXA 3CIPA 4F9OA 3OJUA 4ID5A 1YJWN 1UWBA 4DTNA 3AVKA 1Z26A 4CHYA 2KFZA 3P31A 1S5JA 3KKSA 4FJ5A 3LP0A 2RKIA 4BWMA 2KLAA 2B5JA 4N5SA 2FSNA 2IGIA 4MQ3A 3CCSN 1M90O 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4X65 K;  4IO9 L;  4YOR A;  4BRE A;  1BU6 O;  3JYT A;  3NF9 A;  1CZA N;  4O55 A;  4WQ4 C;  1TKZ A;  2D0A A;  4B3S K;  1J9A A;  3MEG A;  1U47 A;  1QQN A;  3AO3 A;  2O8E A;  4FZX C;  4FW2 A;  1YF5 L;  3OA9 A;  3VQ5 A;  3WEE B;  1NGJ A;  4AHT A;  4BVO A;  4DTJ A;  3L8B A;  2BDP A;  4M7X A;  2QW9 A;  1XI1 A;  3HST B;  1RIL A;  3CET A;  1WSI A;  5H1S Q;  2HBM A;  2NRZ A;  1ZBI A;  1VSF A;  2DFF A;  2Q0R A;  3PUF A;  3Q7C A;  4JK7 A;  4JYA K;  3NGI A;  4CGJ A;  2X78 A;  4CGF A;  2YHW A;  3K5M A;  4CIE A;  2GTD A;  4DTM A;  3PSF A;  3MXI A;  4ELT A;  2HBK A;  4H5R A;  5CHI A;  3TTF A;  4BRG A;  4BDY A;  4AM6 A;  1HRH A;  5E84 A;  3FZL A;  3TSP A;  1WSJ A;  4CJ3 A;  4K41 A;  3AY9 A;  1BL3 A;  4IEE A;  2W40 A;  4FK0 A;  4B9N A;  3VF2 A;  4CJK A;  4DR4 K;  4CZF A;  3LAM A;  3LDN A;  3ATV A;  3OW2 M;  4MLH A;  3U9Z A;  3V9X A;  5HLF A;  3M8S A;  4BY9 C;  3NVK A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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