3CCSO

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482a
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SKTNPRLSSLIADLKSAARSSGGAVWGDVAERLEKPRRTHAEVNLGRIERYAQEDETVVVPGKVLGSGVLQKDVTVAAVDFSGTAETKIDQVGEAVSLEQAIENNPEGSHVRVIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Ribosome
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 37
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00828 Ribosomal_L27A Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.100.10.10 Alpha Beta Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 3ccsO00
1K9MM 3I56O 1YJNO 1K73M 1VQ8O 1M90P 3G4SL 1N8RM 1VQ5O 1Q82P 1KD1P 3CD6L 1YI2O 3CC4O 1Q86M 1Q81M 1K9MP 2OTJL 1YJ9L 3CCJO 3G6EO 1VQOL 1K73P 1YITL 1M90M 1N8RP 3OW2N 1KD1M 3CMEO 2QA4O 1VQPO 3CC2O 3CCEL 1KC8M 2QEXL 1W2BK 3CXCN 1Q81P 3CMAL 3I56L 1YJNL 3CXCK 1VQKO 1VQNO 1VQ8L 3CCLO 3CCVO 1QVGN 3CCVL 1VQ5L 1YIJO 1YI2L 1YHQO 1KC8P 1S72O 3CC4L 1VQMO 1QVGK 3CCMO 3CCJL 3G6EL 3CC7O 1W2BN 1M1KM 3CPWN 3CMEL 2QA4L 1VQPL 3CC2L 1VQ7O 3CCUO 1VQ6O 1YJWO 3CPWK 1JJ2N 3CCRO 1K8AP 2OTLO 1VQKL 1VQNL 3CCLL 1M1KP 1JJ2K 3CCSO 1YIJL 1YHQL 1S72L 3G71O 1VQML 1VQ4O 3I55O 3CCQO 3CCML 1K8AM 1VQLO 1Q7YM 1VQ9O 3CC7L 1NJIM 3G4SO 1VQ7L 1QVFK 3CCUL 1VQ6L 1YJWL 3CD6O 1Q7YP 3CCRL 1NJIP 2OTLL 1KQSN 2OTJO 1YJ9O 1VQOO 1YITO 3CCSL 1KQSK 3G71L 1VQ4L 1Q82M 3I55L 3CCEO 3CCQL 1Q86P 1VQLL 2QEXO 1VQ9L 3CMAO 3OW2K 1QVFN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DQTA 5DQZA 1K9MM 3I56O 1YJNO 4P6IC 1K73M 1VQ8O 1M90P 3G4SL 1N8RM 1VQ5O 1Q82P 1KD1P 3CD6L 1YI2O 3CC4O 1Q86M 1Q81M 1K9MP 2OTJL 1YJ9L 3CCJO 3G6EO 1VQOL 1K73P 2YZSA 1YITL 1M90M 1N8RP 3NKDA 3OW2N 1KD1M 3CMEO 2QA4O 1VQPO 3CC2O 3CCEL 1KC8M 2QEXL 1W2BK 3CXCN 5DS4A 1Q81P 3CMAL 3I56L 1YJNL 3CXCK 1VQKO 1VQNO 1VQ8L 3CCLO 3CCVO 1QVGN 3CCVL 1VQ5L 1YIJO 1YI2L 1YHQO 1KC8P 1S72O 3CC4L 1VQMO 1QVGK 3CCMO 3CCJL 3G6EL 3CC7O 1W2BN 1M1KM 5FCLA 3CPWN 3CMEL 2QA4L 1VQPL 3CC2L 1VQ7O 4QDLA 5DLJA 3CCUO 1VQ6O 1YJWO 3CPWK 4W8KA 1JJ2N 3CCRO 1K8AP 2OTLO 1VQKL 1VQNL 3CCLL 1M1KP 1JJ2K 3CCSO 1YIJL 1YHQL 1S72L 3G71O 1VQML 1VQ4O 3I55O 3CCQO 3CCML 1K8AM 1VQLO 1Q7YM 1VQ9O 3CC7L 1NJIM 5DS6A 3G4SO 4WJ0A 1VQ7L 1QVFK 3CCUL 1VQ6L 1YJWL 4XTKA 3CD6O 1Q7YP 3GODA 5DS5A 3CCRL 1NJIP 2OTLL 1KQSN 2OTJO 1YJ9O 1VQOO 1YITO 3CCSL 1KQSK 3G71L 1VQ4L 1Q82M 3I55L 4N06A 3CCEO 3CCQL 1Q86P 1VQLL 2QEXO 1VQ9L 3CMAO 3OW2K 1QVFN
chains in the Genus database with same CATH topology
5DQTA 5DQZA 1K9MM 3I56O 1YJNO 4P6IC 1K73M 1VQ8O 1M90P 3G4SL 1N8RM 1VQ5O 1Q82P 1KD1P 3CD6L 1YI2O 3CC4O 1Q86M 1Q81M 1K9MP 2OTJL 1YJ9L 3CCJO 3G6EO 1VQOL 1K73P 2YZSA 1YITL 1M90M 1N8RP 3NKDA 3OW2N 1KD1M 3CMEO 2QA4O 1VQPO 3CC2O 3CCEL 1KC8M 2QEXL 1W2BK 3CXCN 5DS4A 1Q81P 3CMAL 3I56L 1YJNL 3CXCK 1VQKO 1VQNO 1VQ8L 3CCLO 3CCVO 1QVGN 3CCVL 1VQ5L 1YIJO 1YI2L 1YHQO 1KC8P 1S72O 3CC4L 1VQMO 1QVGK 3CCMO 3CCJL 3G6EL 3CC7O 1W2BN 1M1KM 5FCLA 3CPWN 3CMEL 2QA4L 1VQPL 3CC2L 1VQ7O 4QDLA 5DLJA 3CCUO 1VQ6O 1YJWO 3CPWK 4W8KA 1JJ2N 3CCRO 1K8AP 2OTLO 1VQKL 1VQNL 3CCLL 1M1KP 1JJ2K 3CCSO 1YIJL 1YHQL 1S72L 3G71O 1VQML 1VQ4O 3I55O 3CCQO 3CCML 1K8AM 1VQLO 1Q7YM 1VQ9O 3CC7L 1NJIM 5DS6A 3G4SO 4WJ0A 1VQ7L 1QVFK 3CCUL 1VQ6L 1YJWL 4XTKA 3CD6O 1Q7YP 3GODA 5DS5A 3CCRL 1NJIP 2OTLL 1KQSN 2OTJO 1YJ9O 1VQOO 1YITO 3CCSL 1KQSK 3G71L 1VQ4L 1Q82M 3I55L 4N06A 3CCEO 3CCQL 1Q86P 1VQLL 2QEXO 1VQ9L 3CMAO 3OW2K 1QVFN
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1K9M M;  3I56 O;  1YJN O;  1K73 M;  1VQ8 O;  1M90 P;  3G4S L;  1N8R M;  1VQ5 O;  1Q82 P;  1KD1 P;  3CD6 L;  1YI2 O;  3CC4 O;  1Q86 M;  1Q81 M;  1K9M P;  2OTJ L;  1YJ9 L;  3CCJ O;  3G6E O;  1VQO L;  1K73 P;  1YIT L;  1M90 M;  1N8R P;  3OW2 N;  1KD1 M;  3CME O;  2QA4 O;  1VQP O;  3CC2 O;  3CCE L;  1KC8 M;  2QEX L;  1W2B K;  3CXC N;  1Q81 P;  3CMA L;  3I56 L;  1YJN L;  3CXC K;  1VQK O;  1VQN O;  1VQ8 L;  3CCL O;  3CCV O;  1QVG N;  3CCV L;  1VQ5 L;  1YIJ O;  1YI2 L;  1YHQ O;  1KC8 P;  1S72 O;  3CC4 L;  1VQM O;  1QVG K;  3CCM O;  3CCJ L;  3G6E L;  3CC7 O;  1W2B N;  1M1K M;  3CPW N;  3CME L;  2QA4 L;  1VQP L;  3CC2 L;  1VQ7 O;  3CCU O;  1VQ6 O;  1YJW O;  3CPW K;  1JJ2 N;  3CCR O;  1K8A P;  2OTL O;  1VQK L;  1VQN L;  3CCL L;  1M1K P;  1JJ2 K;  3CCS O;  1YIJ L;  1YHQ L;  1S72 L;  3G71 O;  1VQM L;  1VQ4 O;  3I55 O;  3CCQ O;  3CCM L;  1K8A M;  1VQL O;  1Q7Y M;  1VQ9 O;  3CC7 L;  1NJI M;  3G4S O;  1VQ7 L;  1QVF K;  3CCU L;  1VQ6 L;  1YJW L;  3CD6 O;  1Q7Y P;  3CCR L;  1NJI P;  2OTL L;  1KQS N;  2OTJ O;  1YJ9 O;  1VQO O;  1YIT O;  3CCS L;  1KQS K;  3G71 L;  1VQ4 L;  1Q82 M;  3I55 L;  3CCE O;  3CCQ L;  1Q86 P;  1VQL L;  2QEX O;  1VQ9 L;  3CMA O;  3OW2 K;  1QVF N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DQT A;  5DQZ A;  1K9M M;  3I56 O;  1YJN O;  4P6I C;  1K73 M;  1VQ8 O;  1M90 P;  3G4S L;  1N8R M;  1VQ5 O;  1Q82 P;  1KD1 P;  3CD6 L;  1YI2 O;  3CC4 O;  1Q86 M;  1Q81 M;  1K9M P;  2OTJ L;  1YJ9 L;  3CCJ O;  3G6E O;  1VQO L;  1K73 P;  2YZS A;  1YIT L;  1M90 M;  1N8R P;  3NKD A;  3OW2 N;  1KD1 M;  3CME O;  2QA4 O;  1VQP O;  3CC2 O;  3CCE L;  1KC8 M;  2QEX L;  1W2B K;  3CXC N;  5DS4 A;  1Q81 P;  3CMA L;  3I56 L;  1YJN L;  3CXC K;  1VQK O;  1VQN O;  1VQ8 L;  3CCL O;  3CCV O;  1QVG N;  3CCV L;  1VQ5 L;  1YIJ O;  1YI2 L;  1YHQ O;  1KC8 P;  1S72 O;  3CC4 L;  1VQM O;  1QVG K;  3CCM O;  3CCJ L;  3G6E L;  3CC7 O;  1W2B N;  1M1K M;  5FCL A;  3CPW N;  3CME L;  2QA4 L;  1VQP L;  3CC2 L;  1VQ7 O;  4QDL A;  5DLJ A;  3CCU O;  1VQ6 O;  1YJW O;  3CPW K;  4W8K A;  1JJ2 N;  3CCR O;  1K8A P;  2OTL O;  1VQK L;  1VQN L;  3CCL L;  1M1K P;  1JJ2 K;  3CCS O;  1YIJ L;  1YHQ L;  1S72 L;  3G71 O;  1VQM L;  1VQ4 O;  3I55 O;  3CCQ O;  3CCM L;  1K8A M;  1VQL O;  1Q7Y M;  1VQ9 O;  3CC7 L;  1NJI M;  5DS6 A;  3G4S O;  4WJ0 A;  1VQ7 L;  1QVF K;  3CCU L;  1VQ6 L;  1YJW L;  4XTK A;  3CD6 O;  1Q7Y P;  3GOD A;  5DS5 A;  3CCR L;  1NJI P;  2OTL L;  1KQS N;  2OTJ O;  1YJ9 O;  1VQO O;  1YIT O;  3CCS L;  1KQS K;  3G71 L;  1VQ4 L;  1Q82 M;  3I55 L;  4N06 A;  3CCE O;  3CCQ L;  1Q86 P;  1VQL L;  2QEX O;  1VQ9 L;  3CMA O;  3OW2 K;  1QVF N; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 5DQT A;  5DQZ A;  1K9M M;  3I56 O;  1YJN O;  4P6I C;  1K73 M;  1VQ8 O;  1M90 P;  3G4S L;  1N8R M;  1VQ5 O;  1Q82 P;  1KD1 P;  3CD6 L;  1YI2 O;  3CC4 O;  1Q86 M;  1Q81 M;  1K9M P;  2OTJ L;  1YJ9 L;  3CCJ O;  3G6E O;  1VQO L;  1K73 P;  2YZS A;  1YIT L;  1M90 M;  1N8R P;  3NKD A;  3OW2 N;  1KD1 M;  3CME O;  2QA4 O;  1VQP O;  3CC2 O;  3CCE L;  1KC8 M;  2QEX L;  1W2B K;  3CXC N;  5DS4 A;  1Q81 P;  3CMA L;  3I56 L;  1YJN L;  3CXC K;  1VQK O;  1VQN O;  1VQ8 L;  3CCL O;  3CCV O;  1QVG N;  3CCV L;  1VQ5 L;  1YIJ O;  1YI2 L;  1YHQ O;  1KC8 P;  1S72 O;  3CC4 L;  1VQM O;  1QVG K;  3CCM O;  3CCJ L;  3G6E L;  3CC7 O;  1W2B N;  1M1K M;  5FCL A;  3CPW N;  3CME L;  2QA4 L;  1VQP L;  3CC2 L;  1VQ7 O;  4QDL A;  5DLJ A;  3CCU O;  1VQ6 O;  1YJW O;  3CPW K;  4W8K A;  1JJ2 N;  3CCR O;  1K8A P;  2OTL O;  1VQK L;  1VQN L;  3CCL L;  1M1K P;  1JJ2 K;  3CCS O;  1YIJ L;  1YHQ L;  1S72 L;  3G71 O;  1VQM L;  1VQ4 O;  3I55 O;  3CCQ O;  3CCM L;  1K8A M;  1VQL O;  1Q7Y M;  1VQ9 O;  3CC7 L;  1NJI M;  5DS6 A;  3G4S O;  4WJ0 A;  1VQ7 L;  1QVF K;  3CCU L;  1VQ6 L;  1YJW L;  4XTK A;  3CD6 O;  1Q7Y P;  3GOD A;  5DS5 A;  3CCR L;  1NJI P;  2OTL L;  1KQS N;  2OTJ O;  1YJ9 O;  1VQO O;  1YIT O;  3CCS L;  1KQS K;  3G71 L;  1VQ4 L;  1Q82 M;  3I55 L;  4N06 A;  3CCE O;  3CCQ L;  1Q86 P;  1VQL L;  2QEX O;  1VQ9 L;  3CMA O;  3OW2 K;  1QVF N; 
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