3CCUO

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482c
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SKTNPRLSSLIADLKSAARSSGGAVWGDVAERLEKPRRTHAEVNLGRIERYAQEDETVVVPGKVLGSGVLQKDVTVAAVDFSGTAETKIDQVGEAVSLEQAIENNPEGSHVRVIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 32
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00828 Ribosomal_L27A Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.100.10.10 Alpha Beta Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 3ccuO00
3CC2L 3CCLO 3CCVL 3I55L 3CC4O 1K8AM 1YHQO 1VQ9O 3I56L 1YIJL 1YJNL 3CCJL 3CMEO 3CCUL 1YITO 3CCQO 1YJWL 3CCSL 1VQ4O 1K9MP 1Q7YM 1KC8P 1VQ7O 1M1KM 3CC4L 1YHQL 1VQ8O 1VQ9L 1VQLO 1NJIM 1VQNO 1Q86P 1K73M 1KD1P 3G71O 3CMEL 1YITL 3CCQL 1VQ4L 3CPWN 1Q82M 3G6EO 1N8RM 3CCRO 1VQKO 1VQPO 1VQ8L 1VQ5O 1VQLL 3CC7O 3CCLL 2OTJO 3CPWK 1QVFN 3G71L 2OTLO 1M90M 3CMAO 2QA4O 1VQMO 3G6EL 3CD6O 3CCRL 1M90P 1VQKL 1K8AP 1Q81M 1VQPL 1VQ6O 1QVGN 1QVFK 1S72O 3I56O 3CC7L 1YIJO 1YJNO 2OTJL 1JJ2N 3CCEO 1VQ7L 3G4SO 3CCMO 1YJ9O 1K9MM 3CD6L 3CCSO 1Q7YP 2QEXO 1VQNL 1M1KP 1KC8M 1QVGK 1YI2O 1KQSK 1NJIP 1VQOO 1VQ6L 1JJ2K 1Q81P 1S72L 1K73P 1Q86M 1KD1M 3OW2N 3CC2O 3CCEL 1Q82P 3G4SL 3CCVO 1N8RP 3CCML 1YJ9L 1W2BN 1VQ5L 3CXCN 3I55O 1KQSN 2QEXL 1YI2L 2OTLL 1VQOL 3CCJO 3CMAL 2QA4L 3CCUO 3OW2K 1VQML 1YJWO 1W2BK 3CXCK
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CC2L 3CCLO 5DS6A 3CCVL 3I55L 3CC4O 1K8AM 5FCLA 1YHQO 1VQ9O 3I56L 1YIJL 1YJNL 3CCJL 5DS5A 3CMEO 3CCUL 1YITO 3CCQO 1YJWL 5DS4A 3CCSL 1VQ4O 1K9MP 1Q7YM 5DQZA 1KC8P 1VQ7O 1M1KM 3CC4L 1YHQL 1VQ8O 1VQ9L 1VQLO 1NJIM 1VQNO 1Q86P 1K73M 1KD1P 3G71O 3CMEL 1YITL 3CCQL 1VQ4L 3CPWN 1Q82M 3G6EO 1N8RM 3CCRO 1VQKO 1VQPO 1VQ8L 1VQ5O 1VQLL 3CC7O 3CCLL 2OTJO 3CPWK 1QVFN 3G71L 2OTLO 1M90M 3CMAO 2QA4O 1VQMO 4N06A 3G6EL 3CD6O 3CCRL 1M90P 1VQKL 1K8AP 1Q81M 1VQPL 1VQ6O 3NKDA 1QVGN 1QVFK 1S72O 3I56O 3CC7L 1YIJO 1YJNO 3GODA 2OTJL 1JJ2N 3CCEO 1VQ7L 5DQTA 3G4SO 3CCMO 1YJ9O 1K9MM 4P6IC 4XTKA 3CD6L 3CCSO 1Q7YP 2QEXO 1VQNL 1M1KP 1KC8M 1QVGK 1YI2O 5DLJA 1KQSK 1NJIP 1VQOO 1VQ6L 1JJ2K 1Q81P 4WJ0A 4QDLA 1S72L 4W8KA 1K73P 1Q86M 1KD1M 2YZSA 3OW2N 3CC2O 3CCEL 1Q82P 3G4SL 3CCVO 1N8RP 3CCML 1YJ9L 1W2BN 1VQ5L 3CXCN 3I55O 1KQSN 2QEXL 1YI2L 2OTLL 1VQOL 3CCJO 3CMAL 2QA4L 3CCUO 3OW2K 1VQML 1YJWO 1W2BK 3CXCK
chains in the Genus database with same CATH topology
3CC2L 3CCLO 5DS6A 3CCVL 3I55L 3CC4O 1K8AM 5FCLA 1YHQO 1VQ9O 3I56L 1YIJL 1YJNL 3CCJL 5DS5A 3CMEO 3CCUL 1YITO 3CCQO 1YJWL 5DS4A 3CCSL 1VQ4O 1K9MP 1Q7YM 5DQZA 1KC8P 1VQ7O 1M1KM 3CC4L 1YHQL 1VQ8O 1VQ9L 1VQLO 1NJIM 1VQNO 1Q86P 1K73M 1KD1P 3G71O 3CMEL 1YITL 3CCQL 1VQ4L 3CPWN 1Q82M 3G6EO 1N8RM 3CCRO 1VQKO 1VQPO 1VQ8L 1VQ5O 1VQLL 3CC7O 3CCLL 2OTJO 3CPWK 1QVFN 3G71L 2OTLO 1M90M 3CMAO 2QA4O 1VQMO 4N06A 3G6EL 3CD6O 3CCRL 1M90P 1VQKL 1K8AP 1Q81M 1VQPL 1VQ6O 3NKDA 1QVGN 1QVFK 1S72O 3I56O 3CC7L 1YIJO 1YJNO 3GODA 2OTJL 1JJ2N 3CCEO 1VQ7L 5DQTA 3G4SO 3CCMO 1YJ9O 1K9MM 4P6IC 4XTKA 3CD6L 3CCSO 1Q7YP 2QEXO 1VQNL 1M1KP 1KC8M 1QVGK 1YI2O 5DLJA 1KQSK 1NJIP 1VQOO 1VQ6L 1JJ2K 1Q81P 4WJ0A 4QDLA 1S72L 4W8KA 1K73P 1Q86M 1KD1M 2YZSA 3OW2N 3CC2O 3CCEL 1Q82P 3G4SL 3CCVO 1N8RP 3CCML 1YJ9L 1W2BN 1VQ5L 3CXCN 3I55O 1KQSN 2QEXL 1YI2L 2OTLL 1VQOL 3CCJO 3CMAL 2QA4L 3CCUO 3OW2K 1VQML 1YJWO 1W2BK 3CXCK
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CC2 L;  3CCL O;  3CCV L;  3I55 L;  3CC4 O;  1K8A M;  1YHQ O;  1VQ9 O;  3I56 L;  1YIJ L;  1YJN L;  3CCJ L;  3CME O;  3CCU L;  1YIT O;  3CCQ O;  1YJW L;  3CCS L;  1VQ4 O;  1K9M P;  1Q7Y M;  1KC8 P;  1VQ7 O;  1M1K M;  3CC4 L;  1YHQ L;  1VQ8 O;  1VQ9 L;  1VQL O;  1NJI M;  1VQN O;  1Q86 P;  1K73 M;  1KD1 P;  3G71 O;  3CME L;  1YIT L;  3CCQ L;  1VQ4 L;  3CPW N;  1Q82 M;  3G6E O;  1N8R M;  3CCR O;  1VQK O;  1VQP O;  1VQ8 L;  1VQ5 O;  1VQL L;  3CC7 O;  3CCL L;  2OTJ O;  3CPW K;  1QVF N;  3G71 L;  2OTL O;  1M90 M;  3CMA O;  2QA4 O;  1VQM O;  3G6E L;  3CD6 O;  3CCR L;  1M90 P;  1VQK L;  1K8A P;  1Q81 M;  1VQP L;  1VQ6 O;  1QVG N;  1QVF K;  1S72 O;  3I56 O;  3CC7 L;  1YIJ O;  1YJN O;  2OTJ L;  1JJ2 N;  3CCE O;  1VQ7 L;  3G4S O;  3CCM O;  1YJ9 O;  1K9M M;  3CD6 L;  3CCS O;  1Q7Y P;  2QEX O;  1VQN L;  1M1K P;  1KC8 M;  1QVG K;  1YI2 O;  1KQS K;  1NJI P;  1VQO O;  1VQ6 L;  1JJ2 K;  1Q81 P;  1S72 L;  1K73 P;  1Q86 M;  1KD1 M;  3OW2 N;  3CC2 O;  3CCE L;  1Q82 P;  3G4S L;  3CCV O;  1N8R P;  3CCM L;  1YJ9 L;  1W2B N;  1VQ5 L;  3CXC N;  3I55 O;  1KQS N;  2QEX L;  1YI2 L;  2OTL L;  1VQO L;  3CCJ O;  3CMA L;  2QA4 L;  3CCU O;  3OW2 K;  1VQM L;  1YJW O;  1W2B K;  3CXC K; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CC2 L;  3CCL O;  5DS6 A;  3CCV L;  3I55 L;  3CC4 O;  1K8A M;  5FCL A;  1YHQ O;  1VQ9 O;  3I56 L;  1YIJ L;  1YJN L;  3CCJ L;  5DS5 A;  3CME O;  3CCU L;  1YIT O;  3CCQ O;  1YJW L;  5DS4 A;  3CCS L;  1VQ4 O;  1K9M P;  1Q7Y M;  5DQZ A;  1KC8 P;  1VQ7 O;  1M1K M;  3CC4 L;  1YHQ L;  1VQ8 O;  1VQ9 L;  1VQL O;  1NJI M;  1VQN O;  1Q86 P;  1K73 M;  1KD1 P;  3G71 O;  3CME L;  1YIT L;  3CCQ L;  1VQ4 L;  3CPW N;  1Q82 M;  3G6E O;  1N8R M;  3CCR O;  1VQK O;  1VQP O;  1VQ8 L;  1VQ5 O;  1VQL L;  3CC7 O;  3CCL L;  2OTJ O;  3CPW K;  1QVF N;  3G71 L;  2OTL O;  1M90 M;  3CMA O;  2QA4 O;  1VQM O;  4N06 A;  3G6E L;  3CD6 O;  3CCR L;  1M90 P;  1VQK L;  1K8A P;  1Q81 M;  1VQP L;  1VQ6 O;  3NKD A;  1QVG N;  1QVF K;  1S72 O;  3I56 O;  3CC7 L;  1YIJ O;  1YJN O;  3GOD A;  2OTJ L;  1JJ2 N;  3CCE O;  1VQ7 L;  5DQT A;  3G4S O;  3CCM O;  1YJ9 O;  1K9M M;  4P6I C;  4XTK A;  3CD6 L;  3CCS O;  1Q7Y P;  2QEX O;  1VQN L;  1M1K P;  1KC8 M;  1QVG K;  1YI2 O;  5DLJ A;  1KQS K;  1NJI P;  1VQO O;  1VQ6 L;  1JJ2 K;  1Q81 P;  4WJ0 A;  4QDL A;  1S72 L;  4W8K A;  1K73 P;  1Q86 M;  1KD1 M;  2YZS A;  3OW2 N;  3CC2 O;  3CCE L;  1Q82 P;  3G4S L;  3CCV O;  1N8R P;  3CCM L;  1YJ9 L;  1W2B N;  1VQ5 L;  3CXC N;  3I55 O;  1KQS N;  2QEX L;  1YI2 L;  2OTL L;  1VQO L;  3CCJ O;  3CMA L;  2QA4 L;  3CCU O;  3OW2 K;  1VQM L;  1YJW O;  1W2B K;  3CXC K; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 3CC2 L;  3CCL O;  5DS6 A;  3CCV L;  3I55 L;  3CC4 O;  1K8A M;  5FCL A;  1YHQ O;  1VQ9 O;  3I56 L;  1YIJ L;  1YJN L;  3CCJ L;  5DS5 A;  3CME O;  3CCU L;  1YIT O;  3CCQ O;  1YJW L;  5DS4 A;  3CCS L;  1VQ4 O;  1K9M P;  1Q7Y M;  5DQZ A;  1KC8 P;  1VQ7 O;  1M1K M;  3CC4 L;  1YHQ L;  1VQ8 O;  1VQ9 L;  1VQL O;  1NJI M;  1VQN O;  1Q86 P;  1K73 M;  1KD1 P;  3G71 O;  3CME L;  1YIT L;  3CCQ L;  1VQ4 L;  3CPW N;  1Q82 M;  3G6E O;  1N8R M;  3CCR O;  1VQK O;  1VQP O;  1VQ8 L;  1VQ5 O;  1VQL L;  3CC7 O;  3CCL L;  2OTJ O;  3CPW K;  1QVF N;  3G71 L;  2OTL O;  1M90 M;  3CMA O;  2QA4 O;  1VQM O;  4N06 A;  3G6E L;  3CD6 O;  3CCR L;  1M90 P;  1VQK L;  1K8A P;  1Q81 M;  1VQP L;  1VQ6 O;  3NKD A;  1QVG N;  1QVF K;  1S72 O;  3I56 O;  3CC7 L;  1YIJ O;  1YJN O;  3GOD A;  2OTJ L;  1JJ2 N;  3CCE O;  1VQ7 L;  5DQT A;  3G4S O;  3CCM O;  1YJ9 O;  1K9M M;  4P6I C;  4XTK A;  3CD6 L;  3CCS O;  1Q7Y P;  2QEX O;  1VQN L;  1M1K P;  1KC8 M;  1QVG K;  1YI2 O;  5DLJ A;  1KQS K;  1NJI P;  1VQO O;  1VQ6 L;  1JJ2 K;  1Q81 P;  4WJ0 A;  4QDL A;  1S72 L;  4W8K A;  1K73 P;  1Q86 M;  1KD1 M;  2YZS A;  3OW2 N;  3CC2 O;  3CCE L;  1Q82 P;  3G4S L;  3CCV O;  1N8R P;  3CCM L;  1YJ9 L;  1W2B N;  1VQ5 L;  3CXC N;  3I55 O;  1KQS N;  2QEX L;  1YI2 L;  2OTL L;  1VQO L;  3CCJ O;  3CMA L;  2QA4 L;  3CCU O;  3OW2 K;  1VQM L;  1YJW O;  1W2B K;  3CXC K; 
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