3CCVL

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2616a
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
150
structure length
145
Chain Sequence
TSKKKRQRGSRTHGGGSHKNRRGAGHRGGRGDAGRDKHEFHNHEPLGKSGFKRPQKVQEEAATIDVREIDENVTLLAADDVAEFRVDVRDVVEEADDADYVKVLGAGQVRHELTLIADDFSEGAREKVEGAGGSVELTDLGEERQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 29
structure length 145
sequence length 150
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
L PF00828 Ribosomal_L27A Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.100.10.10 Alpha Beta Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 3ccvL02
4.10.990.10 Few Secondary Structures Irregular Molecule: Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 1 Molecule: Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 1 3ccvL01
3CCMO 1VQLL 1VQNO 3CC2O 3G4SL 3CCUL 2OTLL 1YHQO 3I55L 1QVFN 3CC4L 1Q81P 1VQ4O 3CCRL 3CMEL 1VQ7L 3CCJO 1VQML 3CC7L 3CMAO 1VQ6L 3G6EL 1VQLO 1W2BK 3I56L 2QEXL 3G4SO 3CCUO 1QVFK 1YJ9O 2OTLO 1M1KM 3I55O 3CCQL 3CC4O 3CXCN 3CCSL 1W2BN 1YI2L 3CCRO 3CMEO 1VQ7O 3CPWN 1NJIP 1VQMO 1NJIM 1QVGN 1K9MP 1KD1P 1YIJO 1S72L 1VQPL 1K9MM 1KD1M 3G71O 1VQ5O 2QEXO 1N8RP 3CXCK 1YITL 1Q7YP 1N8RM 1M1KP 1Q7YM 3CCSO 3OW2N 3CCML 1VQ9L 1VQ5L 3CPWK 1VQOL 1YHQL 2OTJO 1KC8P 1QVGK 3CCVL 1KC8M 3CD6L 3CCEL 2QA4L 3CCLL 3CC7O 1VQ8L 1KQSK 1YJNL 3CCJL 1S72O 1VQPO 1VQKL 1VQ6O 1Q82P 1YJWL 3G6EO 1M90P 1Q82M 3OW2K 3I56O 1K8AP 1KQSN 1M90M 1Q86P 1K8AM 2OTJL 1VQ9O 3CCQO 1YJ9L 1VQOO 1Q86M 1VQNL 3CC2L 1JJ2K 3CCVO 1YI2O 3CD6O 3CCEO 2QA4O 3CCLO 1VQ8O 1YJNO 1Q81M 1VQKO 1YJWO 1JJ2N 1VQ4L 1K73P 1YIJL 3CMAL 1YITO 1K73M 3G71L
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCMO 1VQLL 1VQNO 4WJ0A 3CC2O 3G4SL 3CCUL 5FCLA 2OTLL 5DS6A 1YHQO 3I55L 1QVFN 3CC4L 1Q81P 1VQ4O 3CCRL 3CMEL 1VQ7L 3CCJO 1VQML 3CC7L 5DS5A 3CMAO 1VQ6L 5DLJA 3G6EL 4N06A 5DQZA 1VQLO 1W2BK 3I56L 2QEXL 3GODA 3G4SO 3CCUO 1QVFK 1YJ9O 2OTLO 1M1KM 5DQTA 3I55O 3CCQL 3CC4O 3CXCN 3CCSL 1W2BN 1YI2L 3CCRO 4P6IC 3CMEO 1VQ7O 3NKDA 3CPWN 2YZSA 1VQMO 1NJIP 1NJIM 1QVGN 1K9MP 1KD1P 1YIJO 1S72L 1VQPL 1K9MM 1KD1M 3G71O 1VQ5O 2QEXO 1N8RP 3CXCK 1YITL 1Q7YP 1N8RM 1M1KP 1Q7YM 3CCSO 3OW2N 3CCML 1VQ9L 1VQ5L 3CPWK 1VQOL 4W8KA 1YHQL 2OTJO 1KC8P 1QVGK 3CCVL 1KC8M 3CD6L 3CCEL 2QA4L 3CCLL 3CC7O 1VQ8L 1KQSK 1YJNL 3CCJL 1S72O 1VQPO 1VQKL 1VQ6O 1Q82P 1YJWL 3G6EO 1M90P 1Q82M 3OW2K 3I56O 1K8AP 1KQSN 1M90M 5DS4A 4QDLA 1Q86P 1K8AM 2OTJL 1VQ9O 3CCQO 1YJ9L 1VQOO 1Q86M 1VQNL 3CC2L 1JJ2K 3CCVO 1YI2O 3CD6O 4XTKA 3CCEO 2QA4O 3CCLO 1VQ8O 1YJNO 1Q81M 1VQKO 1YJWO 1JJ2N 1VQ4L 1K73P 1YIJL 3CMAL 1YITO 1K73M 3G71L
chains in the Genus database with same CATH topology
3CCMO 1VQLL 1VQNO 4WJ0A 3CC2O 3G4SL 3CCUL 5FCLA 2OTLL 5DS6A 1YHQO 3I55L 1QVFN 3CC4L 1Q81P 1VQ4O 3CCRL 3CMEL 1VQ7L 3CCJO 1VQML 3CC7L 5DS5A 3CMAO 1VQ6L 5DLJA 3G6EL 4N06A 5DQZA 1VQLO 1W2BK 3I56L 2QEXL 3GODA 3G4SO 3CCUO 1QVFK 1YJ9O 2OTLO 1M1KM 5DQTA 3I55O 3CCQL 3CC4O 3CXCN 3CCSL 1W2BN 1YI2L 3CCRO 4P6IC 3CMEO 1VQ7O 3NKDA 3CPWN 2YZSA 1VQMO 1NJIP 1NJIM 1QVGN 1K9MP 1KD1P 1YIJO 1S72L 1VQPL 1K9MM 1KD1M 3G71O 1VQ5O 2QEXO 1N8RP 3CXCK 1YITL 1Q7YP 1N8RM 1M1KP 1Q7YM 3CCSO 3OW2N 3CCML 1VQ9L 1VQ5L 3CPWK 1VQOL 4W8KA 1YHQL 2OTJO 1KC8P 1QVGK 3CCVL 1KC8M 3CD6L 3CCEL 2QA4L 3CCLL 3CC7O 1VQ8L 1KQSK 1YJNL 3CCJL 1S72O 1VQPO 1VQKL 1VQ6O 1Q82P 1YJWL 3G6EO 1M90P 1Q82M 3OW2K 3I56O 1K8AP 1KQSN 1M90M 5DS4A 4QDLA 1Q86P 1K8AM 2OTJL 1VQ9O 3CCQO 1YJ9L 1VQOO 1Q86M 1VQNL 3CC2L 1JJ2K 3CCVO 1YI2O 3CD6O 4XTKA 3CCEO 2QA4O 3CCLO 1VQ8O 1YJNO 1Q81M 1VQKO 1YJWO 1JJ2N 1VQ4L 1K73P 1YIJL 3CMAL 1YITO 1K73M 3G71L
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CCM O;  1VQL L;  1VQN O;  3CC2 O;  3G4S L;  3CCU L;  2OTL L;  1YHQ O;  3I55 L;  1QVF N;  3CC4 L;  1Q81 P;  1VQ4 O;  3CCR L;  3CME L;  1VQ7 L;  3CCJ O;  1VQM L;  3CC7 L;  3CMA O;  1VQ6 L;  3G6E L;  1VQL O;  1W2B K;  3I56 L;  2QEX L;  3G4S O;  3CCU O;  1QVF K;  1YJ9 O;  2OTL O;  1M1K M;  3I55 O;  3CCQ L;  3CC4 O;  3CXC N;  3CCS L;  1W2B N;  1YI2 L;  3CCR O;  3CME O;  1VQ7 O;  3CPW N;  1NJI P;  1VQM O;  1NJI M;  1QVG N;  1K9M P;  1KD1 P;  1YIJ O;  1S72 L;  1VQP L;  1K9M M;  1KD1 M;  3G71 O;  1VQ5 O;  2QEX O;  1N8R P;  3CXC K;  1YIT L;  1Q7Y P;  1N8R M;  1M1K P;  1Q7Y M;  3CCS O;  3OW2 N;  3CCM L;  1VQ9 L;  1VQ5 L;  3CPW K;  1VQO L;  1YHQ L;  2OTJ O;  1KC8 P;  1QVG K;  3CCV L;  1KC8 M;  3CD6 L;  3CCE L;  2QA4 L;  3CCL L;  3CC7 O;  1VQ8 L;  1KQS K;  1YJN L;  3CCJ L;  1S72 O;  1VQP O;  1VQK L;  1VQ6 O;  1Q82 P;  1YJW L;  3G6E O;  1M90 P;  1Q82 M;  3OW2 K;  3I56 O;  1K8A P;  1KQS N;  1M90 M;  1Q86 P;  1K8A M;  2OTJ L;  1VQ9 O;  3CCQ O;  1YJ9 L;  1VQO O;  1Q86 M;  1VQN L;  3CC2 L;  1JJ2 K;  3CCV O;  1YI2 O;  3CD6 O;  3CCE O;  2QA4 O;  3CCL O;  1VQ8 O;  1YJN O;  1Q81 M;  1VQK O;  1YJW O;  1JJ2 N;  1VQ4 L;  1K73 P;  1YIJ L;  3CMA L;  1YIT O;  1K73 M;  3G71 L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CCM O;  1VQL L;  1VQN O;  4WJ0 A;  3CC2 O;  3G4S L;  3CCU L;  5FCL A;  2OTL L;  5DS6 A;  1YHQ O;  3I55 L;  1QVF N;  3CC4 L;  1Q81 P;  1VQ4 O;  3CCR L;  3CME L;  1VQ7 L;  3CCJ O;  1VQM L;  3CC7 L;  5DS5 A;  3CMA O;  1VQ6 L;  5DLJ A;  3G6E L;  4N06 A;  5DQZ A;  1VQL O;  1W2B K;  3I56 L;  2QEX L;  3GOD A;  3G4S O;  3CCU O;  1QVF K;  1YJ9 O;  2OTL O;  1M1K M;  5DQT A;  3I55 O;  3CCQ L;  3CC4 O;  3CXC N;  3CCS L;  1W2B N;  1YI2 L;  3CCR O;  4P6I C;  3CME O;  1VQ7 O;  3NKD A;  3CPW N;  2YZS A;  1VQM O;  1NJI P;  1NJI M;  1QVG N;  1K9M P;  1KD1 P;  1YIJ O;  1S72 L;  1VQP L;  1K9M M;  1KD1 M;  3G71 O;  1VQ5 O;  2QEX O;  1N8R P;  3CXC K;  1YIT L;  1Q7Y P;  1N8R M;  1M1K P;  1Q7Y M;  3CCS O;  3OW2 N;  3CCM L;  1VQ9 L;  1VQ5 L;  3CPW K;  1VQO L;  4W8K A;  1YHQ L;  2OTJ O;  1KC8 P;  1QVG K;  3CCV L;  1KC8 M;  3CD6 L;  3CCE L;  2QA4 L;  3CCL L;  3CC7 O;  1VQ8 L;  1KQS K;  1YJN L;  3CCJ L;  1S72 O;  1VQP O;  1VQK L;  1VQ6 O;  1Q82 P;  1YJW L;  3G6E O;  1M90 P;  1Q82 M;  3OW2 K;  3I56 O;  1K8A P;  1KQS N;  1M90 M;  5DS4 A;  4QDL A;  1Q86 P;  1K8A M;  2OTJ L;  1VQ9 O;  3CCQ O;  1YJ9 L;  1VQO O;  1Q86 M;  1VQN L;  3CC2 L;  1JJ2 K;  3CCV O;  1YI2 O;  3CD6 O;  4XTK A;  3CCE O;  2QA4 O;  3CCL O;  1VQ8 O;  1YJN O;  1Q81 M;  1VQK O;  1YJW O;  1JJ2 N;  1VQ4 L;  1K73 P;  1YIJ L;  3CMA L;  1YIT O;  1K73 M;  3G71 L; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 3CCM O;  1VQL L;  1VQN O;  4WJ0 A;  3CC2 O;  3G4S L;  3CCU L;  5FCL A;  2OTL L;  5DS6 A;  1YHQ O;  3I55 L;  1QVF N;  3CC4 L;  1Q81 P;  1VQ4 O;  3CCR L;  3CME L;  1VQ7 L;  3CCJ O;  1VQM L;  3CC7 L;  5DS5 A;  3CMA O;  1VQ6 L;  5DLJ A;  3G6E L;  4N06 A;  5DQZ A;  1VQL O;  1W2B K;  3I56 L;  2QEX L;  3GOD A;  3G4S O;  3CCU O;  1QVF K;  1YJ9 O;  2OTL O;  1M1K M;  5DQT A;  3I55 O;  3CCQ L;  3CC4 O;  3CXC N;  3CCS L;  1W2B N;  1YI2 L;  3CCR O;  4P6I C;  3CME O;  1VQ7 O;  3NKD A;  3CPW N;  2YZS A;  1VQM O;  1NJI P;  1NJI M;  1QVG N;  1K9M P;  1KD1 P;  1YIJ O;  1S72 L;  1VQP L;  1K9M M;  1KD1 M;  3G71 O;  1VQ5 O;  2QEX O;  1N8R P;  3CXC K;  1YIT L;  1Q7Y P;  1N8R M;  1M1K P;  1Q7Y M;  3CCS O;  3OW2 N;  3CCM L;  1VQ9 L;  1VQ5 L;  3CPW K;  1VQO L;  4W8K A;  1YHQ L;  2OTJ O;  1KC8 P;  1QVG K;  3CCV L;  1KC8 M;  3CD6 L;  3CCE L;  2QA4 L;  3CCL L;  3CC7 O;  1VQ8 L;  1KQS K;  1YJN L;  3CCJ L;  1S72 O;  1VQP O;  1VQK L;  1VQ6 O;  1Q82 P;  1YJW L;  3G6E O;  1M90 P;  1Q82 M;  3OW2 K;  3I56 O;  1K8A P;  1KQS N;  1M90 M;  5DS4 A;  4QDL A;  1Q86 P;  1K8A M;  2OTJ L;  1VQ9 O;  3CCQ O;  1YJ9 L;  1VQO O;  1Q86 M;  1VQN L;  3CC2 L;  1JJ2 K;  3CCV O;  1YI2 O;  3CD6 O;  4XTK A;  3CCE O;  2QA4 O;  3CCL O;  1VQ8 O;  1YJN O;  1Q81 M;  1VQK O;  1YJW O;  1JJ2 N;  1VQ4 L;  1K73 P;  1YIJ L;  3CMA L;  1YIT O;  1K73 M;  3G71 L; 
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