The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
119
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structure length |
119
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Chain Sequence |
b'SKQPDKQRKSQRRAPLHERHKQVRATLSADLREEYGQRNVRVNAGDTVEVLRGDFAGEEGEVINVDLDKAVIHVEDVTLEKTDGEEVPRPLDTSNVRVTDLDLEDEKREARLESEDDSA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| molecule tags |
Ribosome
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| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
27
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| structure length |
119
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| sequence length |
119
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| T | PF00467 | KOW | KOW motif |
| T | PF16906 | Ribosomal_L26 | Ribosomal proteins L26 eukaryotic, L24P archaeal |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CXC S; 1K8A C; 1YHQ T; 1M90 U; 3CC2 T; 1VQN T; 1VQ8 T; 2DO3 A; 2LQ8 A; 1YJN A; 3CCM T; 2QEX A; 1VQL A; 3CMA T; 1QVG S; 3CCJ T; 1VQ9 T; 2LCL A; 5HY6 A; 5IAY A; 3OW2 S; 1S72 T; 3CCQ A; 3HKS A; 3P8B B; 2G3R A; 1VQP T; 3I56 T; 3LGF A; 3CME T; 1Q82 U; 3OW2 A; 3CC7 A; 1Q7Y U; 1YBY A; 1W2B A; 3CCR A; 1KQS S; 1JJ2 S; 3CC2 A; 3G71 T; 2E6Z A; 1KC8 U; 3G4S A; 5J26 A; 1VQL T; 3CCS A; 1SSF A; 1VQ6 A; 1M1K C; 3LGL A; 1S72 A; 2JVV A; 1K73 U; 3CCJ A; 5IT9 E; 3CD6 A; 1XTD A; 3I56 A; 3J80 E; 1RL2 A; 5DLQ E; 1NPP A; 1Q7Y C; 1YIJ A; 3CC7 T; 1VQO A; 3CCM A; 1VQK T; 1VQ4 T; 1VQ5 A; 3CCR T; 1EIF A; 3CME A; 3KBG A; 5LL6 S; 3CC4 T; 1YIT A; 1YJN T; 1KD1 U; 3TRE A; 3CCL T; 3G71 A; 1XNI A; 2OTL A; 3I55 A; 2QEX T; 3OYY A; 3CMA A; 2JOY A; 2LVM A; 4YTL A; 1K9M U; 1VQ9 A; 3JAM E; 3CCE T; 3ER0 A; 4CRI A; 3G4S T; 5FLX E; 1VQP A; 1K9M C; 1YJW T; 5DM7 R; 2E70 A; 1YI2 T; 2JUF A; 1VQO T; 3CPW S; 4X34 A; 1N8R U; 1M1G A; 1KD1 C; 1VQ6 T; 2KVQ G; 1BKB A; 4RG2 A; 3PIP A; 3CCV T; 1YIJ T; 1Q86 U; 1QVG A; 4ZN3 A; 1JJ2 A; 4QQD A; 3DB4 A; 1VQ4 A; 1NPR A; 2MI6 A; 2MWO A; 3CCS T; 1KQS A; 3CPF A; 2MWP A; 1W2B S; 3CC4 A; 3G6E T; 1K73 C; 1NJI U; 3I55 T; 2EIF A; 3CPW A; 1M1K U; 1VQK A; 3CD6 T; 1YJ9 T; 3CCU T; 1YIT T; 3CCL A; 1VQM T; 1Q81 C; 1KC8 C; 3PIO A; 2OTL T; 1VQ5 T; 2OTJ T; 3DLL A; 1YJW A; 2QA4 T; 1VQ8 A; 2CKK A; 3A5Z B; 3CCE A; 1Q82 C; 3CXC A; 2XHC A; 1VQ7 T; 4ZN1 A; 5A2Q E; 1IZ6 A; 1UEB A; 1YHQ A; 2KDS A; 3G6E A; 1NZ9 A; 1YI2 A; 3J7A F; 3CCV A; 3LH0 A; 1Q81 U; 2JNG A; 2L3R A; 2OTJ A; 1VQN A; 3CCU A; 1M90 C; 2QA4 A; 1QVF S; 1K8A U; 1VQM A; 1QVF A; 1NJI C; 3CCQ T; 1KHI A; 3J81 E; 1YJ9 A; 1VQ7 A; 1Q86 C; 1N8R C; 1X6O A; 2IG0 A; 3DB3 A; 5J3B A; 4TVR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAO m; 5I21 A; 2KK4 A; 3E9G A; 3CXC S; 4LDU A; 2QK0 A; 2LCC A; 5C0M A; 3M57 A; 1HK9 A; 1KIK A; 3MP1 A; 1VQL A; 4M77 A; 3I5R A; 4F7U F; 2LCL A; 1JQQ A; 5IAY A; 5FRO A; 1SEM A; 1M27 C; 1ZSZ B; 1Q82 U; 2CUD A; 1NG2 A; 2LTO A; 2XDB A; 1G83 A; 4J83 A; 1JU5 C; 1KQS S; 3FLG A; 4F7U E; 3BFM A; 3L2Z A; 3G4S A; 3FJ5 A; 5J26 A; 2A36 A; 1N9S A; 3M4G A; 3OYK A; 1KHC A; 2H3E B; 5DLQ E; 4DA4 A; 7AT1 B; 1KQ1 A; 1NBE B; 4E47 A; 2LC4 A; 4E2F B; 4RTW A; 4XK8 E; 1AWW A; 4RCB A; 2HMA A; 3CCE T; 3HRS A; 4AFQ C; 1PCX A; 2EQU A; 4M78 B; 1QCF A; 1HJD A; 2JUF A; 3L2W A; 4X34 A; 2F1L A; 4PK4 A; 3OYF A; 4J7F A; 3MPU B; 4ZN3 A; 1Y7X A; 4M78 E; 3HRU A; 2HL3 A; 1LCK A; 4M75 C; 3JCM c; 2RD1 A; 2YWW A; 1Q81 C; 3GPL A; 2K3Y A; 2O01 E; 3UPU A; 1SKU B; 2Y4Y A; 2EGC A; 1PD0 A; 4AG2 C; 4B9W A; 1ARK A; 4M7D C; 1K0X A; 3OYH A; 5LJ3 h; 1D1C A; 4LNP A; 5L23 A; 1AD5 A; 1N9R A; 3KXT A; 5A2Q E; 3M58 A; 2RM4 A; 1RAD B; 2V8K A; 2KQW A; 3OYE A; 1YI2 A; 3PVL A; 2RQR A; 4BY6 B; 1M90 C; 3JSC A; 3OS2 A; 1VQ5 Q; 2EJ9 A; 2CP6 A; 1BI3 A; 2GGR A; 1MNE A; 3C94 A; 4C8Q E; 5GAN j; 1X6O A; 1UGR B; 1D0X A; 1W70 A; 4PJN A; 4E7K A; 5CQX A; 4FCY A; 4PKC C; 4O5V A; 1YHQ T; 1U5S A; 2VXE A; 2QTX A; 4M7A B; 2CUB A; 3TEE A; 4GLK A; 2J7I A; 4Y91 A; 4XU3 A; 2PUK B; 1LOJ A; 1WDX A; 2DZ9 A; 4RUG A; 1Q7Y U; 3L1A A; 4A4F A; 2VAS A; 2O88 A; 1M1F A; 1AWO A; 1OU9 A; 5LJ3 g; 1VQ4 Q; 1RAE B; 4M77 D; 8AT1 B; 3MEA A; 5I11 A; 3BE3 A; 2DL3 A; 3QYH B; 4KH0 B; 4C92 D; 1YJ9 Q; 2HNI A; 3KBG A; 2CZ7 B; 2DTI A; 1YN8 A; 3QPH A; 4EMK C; 1KD1 R; 2J6O A; 2HD0 A; 2X9H A; 5KYU A; 5GAN 6; 2E4H A; 5CKE A; 2E3H A; 4C0G A; 3VUZ A; 5J39 A; 2LNV A; 2R57 A; 2E70 A; 2ZPF B; 2FZK B; 2P4R A; 1ZQ1 A; 2IIM A; 5GAO n; 3NTH A; 1J3T A; 4X1V A; 3CCE Q; 2KVQ G; 4RCC A; 4RG2 A; 1I07 A; 1JJ2 A; 1OPL A; 3UT1 A; 2M0O A; 3CC4 A; 3EHR A; 1NJI U; 2B8A A; 2LQK A; 2RH2 A; 3CD6 T; 1VQM T; 2DX1 A; 1VQ5 T; 2KYB A; 3EG3 A; 4OML A; 1K73 R; 4JRK A; 2D8J A; 2VV5 A; 1Y0M A; 3UA6 A; 1WYX A; 3WVE B; 1H3H A; 1AHJ B; 4BE2 A; 1M3C A; 1MGQ A; 1UJ0 A; 1YHQ A; 4EIK A; 3CCS Q; 3R6N A; 2OTJ A; 4A54 A; 4CC2 A; 1QVF P; 1QVF A; 2NLU A; 1ZSZ A; 3VU3 C; 3VS3 A; 3L2V A; 4QT7 A; 4M77 C; 1QLY A; 4OB3 B; 2LT1 A; 5GMK m; 1K8A C; 2LQW A; 1WXT A; 4XU1 A; 1LVK A; 3QII A; 1MMA A; 2LRQ A; 1M2V A; 2AZV A; 2CH4 W; 2G3R A; 1G5V A; 2W0Z A; 1MMG A; 3LLR A; 1CKA A; 3CCR A; 1T0H A; 4M7A F; 3CC4 Q; 2X35 A; 3CCV Q; 1W6X A; 1S72 A; 1KG1 A; 1QWE A; 2KAF A; 3SD4 A; 1NEG A; 2O4X B; 2EFI A; 3EFO A; 3CCR T; 1EIF A; 3CME A; 3MCA B; 1YJN T; 2M02 A; 1MND A; 2L3S A; 1D09 B; 2OTL A; 5KCH A; 1Q95 G; 1YCY A; 2J6K A; 2R58 A; 1OI1 A; 4C8Q A; 2CZ1 B; 5HK0 A; 4BI4 A; 1X6B A; 3HP9 A; 2LNH B; 4C0Z A; 1VQ4 A; 1NPR A; 2DYI A; 2HDA A; 3G6E T; 4HVU A; 3SB2 A; 2J6F A; 3V8L A; 5GAM e; 4OMN A; 2QG9 B; 5CKF A; 2ZGW A; 1R8O B; 1SHF A; 2GFU A; 2DMO A; 5A0G A; 5GAN e; 2WAC A; 3CCQ Q; 1VQ8 A; 2CKK A; 2E12 A; 1SPK A; 2ABL A; 2PU9 B; 2HQH A; 2DNU A; 2JJ9 A; 3NFC A; 4Q5W A; 2V8I A; 2HSP A; 4E7J A; 1OYX A; 5D6W A; 1NZ9 A; 3JV3 A; 4HXJ A; 3HFO A; 2DEU A; 2DLP A; 1IGQ A; 1WIE A; 1WQ7 A; 2QAZ A; 4UC4 A; 3AT1 B; 3EGD A; 2FL7 A; 2D0N A; 3OY9 A; 3SWN B; 3G6E Q; 2RI3 A; 2J05 A; 3CC2 T; 2XDD A; 2OAU A; 5FRM A; 1NJI R; 2DEQ A; 2D1X A; 3VYH B; 3HKS A; 1MMD A; 2DPP B; 1VQP T; 2RMO A; 2LMJ A; 1B07 A; 2DA9 A; 2WSC E; 2QAS A; 4MDX A; 3SWN C; 2E6Z A; 2KE9 A; 2C06 A; 3E9F A; 3SDZ A; 1VQ6 A; 2LX7 A; 3LGL A; 3I56 Q; 4RTX A; 4EMG A; 5CVI A; 1XTD A; 2JMA A; 1CSK A; 2R5M A; 3CCM A; 2MCN A; 1YIT A; 1IRX A; 3FJP A; 2KMT A; 4L59 A; 2DYB A; 3VS1 A; 1TS9 A; 3EG9 B; 5CKB A; 2YDL A; 1GFD A; 1R0C B; 5FU7 C; 3PIP A; 4J6X A; 1KK7 A; 2DRM A; 3DB4 A; 3HPW A; 1W2B S; 1IB8 A; 1GL5 A; 2LZ6 B; 1I4K 1; 1IRE B; 2JTF A; 2K5F A; 3ZBD A; 1MV0 B; 3QXE B; 4QVZ A; 1LPL A; 4GY5 A; 2FHD A; 1IHW A; 1VQ9 Q; 3X20 B; 3A8L B; 5CK9 A; 3OYD A; 4DOW A; 1G2B A; 3SFM A; 1VQL Q; 1B7T A; 1ZX6 A; 3CCU Q; 1Q81 R; 2XD0 A; 4M7A G; 3TVT A; 1BI1 A; 3ME9 A; 3I9Q A; 5IXB A; 3A8G B; 4C5E A; 2L3R A; 5IHK A; 3BDL A; 4KGZ B; 1WA7 A; 4M75 D; 4BE0 A; 3C0C A; 4JZ4 A; 4HCK A; 3H0F A; 3M54 A; 2XID A; 4M78 D; 4K11 A; 3J81 E; 1VQM Q; 5FU6 B; 1Y96 A; 2MYS A; 2DET A; 3HFN A; 2YHT A; 2XK0 A; 4N4I A; 4D8D A; 2IG0 A; 2JM8 A; 4HCC A; 1WPY A; 1YJN A; 5GAM j; 4ZGD B; 4M7D E; 4LE9 A; 3C95 A; 3CQT A; 4F04 B; 1V29 B; 2EQI A; 2BE7 D; 2KBT A; 2DTH A; 5AYF A; 1YBY A; 3RER A; 2CRE A; 1K4U S; 3OB9 A; 1Q82 R; 1ZSG A; 2NUT B; 2FEI A; 4RTT A; 5GAN f; 1D0Z A; 2RK1 A; 3EGX B; 2K9G A; 5GJV B; 1UUE A; 3JB9 G; 2EQM A; 3QBY A; 2F2V A; 1O9S A; 3J80 E; 3P8H A; 2L0A A; 1RAB B; 2MMP A; 2E5K A; 3CC2 Q; 1TH7 A; 1JRI A; 3JCM f; 3FC3 A; 4CI0 C; 3F70 A; 4KUD K; 1YI2 Q; 3O5Z A; 1HYO A; 1ZA1 B; 2CP3 A; 2JM9 A; 4JUV A; 4JRI A; 3OYJ A; 3VRZ A; 2K5L A; 1I5L A; 3OBY A; 4ZNX A; 3OS5 A; 2DRK A; 2WSE E; 3CCS T; 3CPW A; 3CCR Q; 2M9U A; 1VQ7 Q; 3I35 A; 1UGV A; 1EX4 A; 2G6F X; 4C92 E; 1KJW A; 1UJY A; 3CCU T; 2A37 A; 4XTU A; 3M0R A; 2EQK A; 2OTL T; 3DLL A; 1I1J A; 4FYW B; 4RTV A; 4C0D B; 2KSS A; 3QUI A; 2SEM A; 1YWP A; 4M77 E; 1X43 A; 5IH2 A; 2EJF A; 5C6S A; 3U23 A; 4PJO F; 1VYV A; 2XIC A; 1RAH B; 2EKH A; 1M30 A; 2K57 A; 1XQH A; 2JNG A; 2QQB A; 1U06 A; 3O8V A; 2BKD N; 2QA4 Q; 1TUG B; 4OP0 A; 1YJ9 A; 1U1S A; 1I0C A; 3X26 B; 1X69 A; 2DL8 A; 1WHK A; 1Z9Z A; 3EFS A; 5J3B A; 5FWB A; 4TVR A; 4D6W A; 3VUB A; 1VQ8 T; 2E6N A; 4X9D A; 1BB9 A; 2VXF A; 1IO6 A; 4LN2 A; 5GAN 2; 2RJC A; 3P8B B; 1ABO A; 2D0Q B; 4KT0 E; 3OW2 A; 3M55 A; 3ULR B; 3E1S A; 3PVQ A; 3G71 Q; 2FRW A; 2GCX A; 1PG5 B; 1YJN Q; 1O75 A; 1WHJ A; 3RKY A; 3PTA A; 3OA6 A; 4J9I A; 1TU0 B; 1GBR A; 1G3W A; 3CCJ A; 3QJY A; 3UWN A; 4J8O A; 1PM3 A; 2AKK A; 4F17 A; 2KXD A; 2DAQ A; 1V1C A; 2HEQ A; 4RTY A; 3ER0 A; 5IXF A; 3GIB A; 4DBF A; 1VQP A; 4PJO C; 3OYG A; 5DM7 R; 3UAT A; 2X4X A; 2RK2 A; 4HVW A; 2BIV A; 3CPW S; 5LJ3 j; 2JMC A; 5GAO r; 4JJB A; 1VQ6 T; 1Q86 U; 4Y92 A; 3EG2 A; 4LD6 A; 2DXB A; 3PT9 A; 1X2Q A; 1UHC A; 2EIF A; 5GAN 7; 5CO7 A; 1YIT T; 2X4W A; 5I22 A; 3X25 B; 2OTJ T; 1G3T A; 4BDY A; 2F5T X; 1H64 1; 4M75 F; 5GAN 3; 2DL7 A; 3CMA Q; 2XKO C; 4FM4 B; 1VOM A; 2COW A; 2AT1 B; 2ESW A; 4EMK B; 4AG1 C; 4PJL A; 5I2S A; 2DIG A; 3QZ9 B; 2RJD A; 2JT4 A; 1Y71 A; 1AOJ A; 1PRM C; 1JEG A; 3G1J A; 2BUD A; 2KRS A; 1N27 A; 4HCB A; 3LH5 A; 3GF5 A; 1FMV A; 2EVR A; 2YUP A; 2ZPH B; 2CZ6 B; 5IN1 A; 4QVD A; 1E6G A; 2YT6 A; 3DLM A; 4OB1 B; 3GBQ A; 5CKD A; 4LDX A; 3UF4 A; 2RHZ A; 4CC4 B; 1MV3 A; 4FT2 A; 3SHW A; 1U8R A; 1VQ9 T; 1VYT A; 1KFZ A; 4F14 A; 4PJO E; 2RQW A; 4ELZ C; 5LJ3 e; 2E64 A; 3QG1 A; 2NUP B; 1ZA2 B; 2ZZD A; 2WSF E; 3JCM V; 3L2Q A; 3G7Z A; 2P0Q A; 4D8K A; 1SG5 A; 3QWY A; 1M1K C; 1K73 U; 4J9C A; 2K7A A; 1G8X A; 2DL5 A; 5IHN A; 1NPP A; 3VS4 A; 8ATC B; 1R77 A; 1V76 A; 1VQO A; 2Z0W A; 1WJQ A; 4M78 A; 2Y4X A; 3VJP A; 1ZHI A; 4YTL A; 5GAM d; 4QQ6 A; 1SSH A; 3CC7 Q; 2KYM A; 5GAM g; 4MZP A; 2EYX A; 5GAN d; 1M1G A; 2RQT A; 3PMT A; 3H0H A; 3JB9 J; 2MI6 A; 3CBM A; 3ZEH A; 1K73 C; 1X2K A; 3EH1 A; 2DBM A; 4BAC A; 2DFU A; 3A8M B; 2HL5 C; 1YJW A; 4A63 B; 3L2U A; 2OTL Q; 2GFA A; 2E10 A; 1FXX A; 1IXD A; 1UG1 A; 1JXO A; 1TG0 A; 1A0N B; 3PFS A; 2A08 A; 5GMK j; 2DXT A; 2EAY A; 2EPD A; 3PE0 A; 5A0D A; 2HCK A; 2DM1 A; 1NJI C; 2CP5 A; 4JRP A; 1M5Q 1; 2E5Q A; 2QEX Q; 5CR2 A; 4EDU A; 2MF2 A; 1X01 A; 3M56 A; 2V1R A; 3OYN A; 1PKT A; 3CCQ A; 2X3X D; 3LGF A; 4M75 E; 5LJ5 f; 3CC7 A; 2KRN A; 1W2B P; 3CC2 A; 4E7Z A; 1KC8 U; 5GMK i; 2FPF A; 2DXC A; 2C0I A; 5GMK l; 1ABQ A; 5FRN A; 3MO8 A; 1VQO Q; 4LUE A; 3CD6 A; 4OMQ A; 1F1B B; 2JN0 A; 4ZGJ B; 3CC7 T; 2RB6 A; 4EMH A; 1TUC A; 3BDU A; 5LL6 S; 4J9F A; 2C0O A; 4IKF A; 2F69 A; 4OMM A; 1SRL A; 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