3CFXA

Crystal structure of m. acetivorans periplasmic binding protein moda/wtpa with bound tungstate
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
b'GEVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPI'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Distorted octahedral coordination of tungstate in a subfamily of specific binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UPF0100 protein MA_0280
source organism Methanosarcina acetivorans
molecule tags Transport protein
total genus 100
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cfxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cfxA02
5AA4B 5IKBA 2QS1A 4RY1A 1JVXA 3MPLA 1MXYA 1IQ7A 5L9MA 3MPKA 3QSLA 3GBAA 1MXVA 4YZZA 4N13A 3FIRA 2QMWA 1NH7A 1B52A 1Q35A 3Q29A 4F19A 3JYRA 4F3GA 1QW0A 1MM7A 4OTEA 1M5CA 1QUKA 2PYYA 3IAZA 2QRYA 1VR5A 4KFQA 2GH9A 1N04A 4TLMB 2HAVA 2O1MA 1O63A 2DWJA 5DEXA 1B6HA 3ZKKA 1QVSA 4YKJA 4OZ9A 4KI0E 3TTKA 2XXIA 1JQFA 1URDA 3V8XB 3N6TA 2O7IA 4I9DA 5AA2A 3DP8A 2B3FA 1TFAA 2QS4A 5AA2D 3OO8A 3RGYA 1FQFA 3M3KA 3TPAA 4I1DA 4MLQA 4MLVA 1MY0A 1NKXA 3SERA 3H6WA 3G3IA 3V5AA 5DVJA 3LUYA 5B70A 4F1YA 4NF4B 3OXNA 1HSLA 2Z8FA 4LATA 2F8DA 4EQ9A 4F22A 1DTGA 3K0VA 1LAXA 2Z22A 4HCWA 1RYOA 3H6UA 4O3AA 3T9XB 5TPAB 3TELA 5ITPA 1GGGA 3HPIA 1QKAA 1B1XA 4KCCA 1A7LA 1SQYA 4FECA 4OXVA 1NNKA 2XXVA 3D4CA 3UORA 4IO7A 1H43A 3ODBA 1B3EA 3U94A 4IGTA 3MUQA 1UQWA 2IEEA 3T96B 2I4BA 3IO4A 4PQJA 1A55A 3HO7A 3HSTA 3PPRA 5CMBA 3HCQA 1US4A 2QJEA 4HCYA 5CMMA 3LR1A 2HFBA 5FHMA 2Q9TA 1Q1KA 1B46A 1ZLQA 4R9FA 2R71A 3W9VA 1OIBA 1QULA 5I59B 1LAHE 1WVJA 2OCUA 1MH3A 3FASA 3CFZA 1FTOA 2O7UA 1I6QA 4N07A 3HV1A 3U8QA 3A3UA 3N5LA 4NMYA 3G7WA 1TWYA 2HXWA 4I8CA 3KN7A 1Y1MA 4C0RA 2H98A 4Q5TA 3K6VA 3Q25A 3UN6A 2HZLA 5HBCA 2REGA 3FGSA 2QS2A 4MH5A 4RK9A 4ZEKA 4JSDA 2I3VA 3M3FA 4F3PA 3U92A 1YPNA 4H8JA 1OQHA 5DEXB 4GD5A 4YMBA 2DWAA 4OFOA 3VXBA 3MZ9A 3O66A 3C33A 1A8EA 1I69A 4UACA 5AA2B 2PX1A 1Z7ME 2F7CA 3EQ1A 1LAGE 2KLFA 3SKPA 2H25A 2I49A 4NTLA 2PT1A 3FJ7A 2Q8JA 1IEJA 1H76A 3OO7A 2ZYNA 3S9EA 1ZTYA 4NEDA 2UVIA 1GTKA 1EH3A 2DWIA 4Z0IA 2ABHA 1A40A 3FD3A 3S9MC 4R6HA 1Y1ZA 5M2VA 4ELPA 2OBGA 5H8NA 1Y9UA 1MXXA 3T22A 5TU0A 2B3BA 3A09A 4ZE9A 5CRYA 5J1DA 2REJA 4LP2B 1MG1A 5I57A 1VE4A 5JTYA 4OEVA 2DXRA 1FW0A 3MVZA 3EF7A 1UIUA 3CG1A 1BTJA 3T9UA 5CMKA 2DOJA 4GOTA 1EZ9A 3VVDA 1JETA 4YU0A 1YCJA 4EDPA 4OMBA 1LFHA 3PUXE 3TODA 5BWJA 2QL3A 5DVIA 3F11A 4G68A 4FAJA 1WODA 2NUVA 1A54A 1B3GA 3N94A 4DDDA 5I58A 3BFTA 4YKIA 2VHAA 4RJZA 1B1HA 1DOTA 4HTGA 3I6VA 3KJ7A 3IO6A 1ANFA 2V84A 1TT1A 2D5WA 2V93A 1B2HA 1QUIA 2HEUA 5HM4B 1LFGA 1MDQA 1PBPA 3FXQA 1XVXA 3KGCA 3K6WA 1MY1A 1PBQA 4LZ7A 1SVXB 4XKQA 3TKDA 4ZDMA 2Y7PA 4QFLA 4FATA 2XD2A 1A99A 2O1LA 3O6IA 4GLIA 3I3VA 4QF9A 4U4SA 4UA8A 2XXTA 5CBRA 1FQCA 3HN0A 4RXLA 4IO5A 3OSQA 1PEBA 2F7AA 1BP5A 4H8IA 1XVYA 1SBPA 3MBPA 1N76A 2YJPA 3W15C 3FJMA 4R74A 1QKBA 1PB9A 4OENA 3H6TA 5H8SA 2I48A 3MAMA 1M5BA 4Q30B 2RCAA 3DP6A 1ZKBA 1LB8A 1N7XA 4H67A 3PPNA 4OFLA 2AYSA 2VOZA 3U93A 3PPPA 1SYIA 2Z8DA 3LC8A 5H8NB 3HHFA 2RC9A 4H65A 4JSOA 4PFYA 4KCDA 4I62A 2UYEA 2WKYA 1UTHA 3IB2A 3KG2A 1LCTA 4JB7A 3OOAA 3U1OA 4F2OA 4R75A 1BKAA 2HZKA 5JTYB 1HSJA 4YB6A 4FE8A 2UVGA 4NF6A 4XXUA 3FV1A 4G8NA 3G3KA 3CFXA 1M5DA 1MH4A 1UIVA 1ZU0A 3QUFA 4ESXA 3CG3A 1Y4TA 2QMXA 5FHOA 3K6XA 3R6UA 1IIWA 2UVHA 2UYFA 1LAFE 4Q0CA 4THIA 1VFEA 1B5JA 1B5HA 4G68B 3T9HB 2XHDA 4OERA 1DMBA 3PPQA 3CIJA 5I58B 3MVXA 4H1XA 1LB9A 1MY2A 4ZE8A 4DXCA 5L8DA 5K2YA 3WAFA 2XXWA 3KZGA 2VD2A 3S9NC 3BBRA 1ELJA 3QYTA 3D4GA 3N6UA 1VSOA 4P0IA 3O29A 4QFPA 1ZBMA 3TAJA 3C31A 3SEUA 3TTNA 2XX7A 4R2FA 1BLFA 1US5A 1UTBB 1HSEA 1URSA 4OWDA 1S9TA 3E9XA 5A5XA 3O6GA 3C34A 1YAEA 1B9JA 1OMPA 2F35A 2R9JA 2E1SA 3UP9A 5KDTA 4TQUQ 4GXAA 1F9BA 2M8CA 1FTJA 4LQ5A 4U1OA 1JW5A 3R7XA 3GZGA 2ZNSA 3PGFA 3ILUB 3OEKA 4JBZA 5H8QA 3B6WA 4GWOA 4HS7A 3LSXA 3KSXA 4OYVA 1P1QA 2O6AA 2ONSA 2H9BA 4JWYA 3CVGA 4YAHX 3PU5A 1Y3QA 5L9SA 3RLFE 1FTLA 1P1NA 1SW4A 1B3HA 2XXHA 4L17A 4DXUA 1B05A 1N84A 2O51A 3C35A 3OENA 2DE3A 3USDA 4N6PA 4KQPA 4BDNA 4YMAA 1MQIA 2RINA 4DCXA 2OLBA 2A5SA 3QK6A 4R9GA 1D9YA 3MVWA 1VFDA 4WEPA 1SW2A 1UTHB 4U21A 1FQBA 1MPDA 1JNFA 4NF8A 2ZYOA 3K6UA 2DQVA 2RKMA 2Z8EA 1WDNA 3VDFA 4YICA 1B5IA 4NF6B 3ILTB 5FTHA 1MPBA 3SEWA 1DPPA 3EHSA 4F3SA 2DVCA 1Y3PA 5I2NA 4XKPA 2YLNA 3TTMA 3T66A 4KYSA 1QUJA 1SW1A 3BFUA 2DYXA 3TMGA 2YPNA 1B3FA 4EF2A 2VGQA 1NL5A 2F36A 5FHNA 4PFWA 4MBPA 3TTLA 1JEVA 3H3GA 1J1NA 4F31B 2DWHA 4NF5A 4XIGQ 1MXUA 2H5YA 4G68C 2OWTA 1SDXA 2F6PA 4G4PA 4OVJA 1B7ZA 5A5XB 1EZOA 2A5TA 1AOVA 1B58A 4POXA 5KDTB 4LA9A 4HW8A 3K01A 2RC8A 3G3FA 4IO6A 4IO3A 2X7PA 3PD8A 5EHSA 3C9HA 1LCFA 5H8QB 1GR2A 1GVCA 1OQGA 1SYHA 2XXRA 3AXFA 5JEIA 2G93A 2IA4A 4YB7A 4QFOA 5ITOA 3OD7A 3PMVA 1POTA 4ISUA 4TLLB 3B7DA 1OLAA 1B3LA 4OEUA 4R72A 4X9TA 4X1DA 3W9WA 2QPQA 5TP9A 4QFKA 4F1VA 4NF8B 4BDRA 2F34A 3IR1A 4BDMA 1D4NA 1P1OA 4OQOA 3G3GA 3KN8A 1TXFA 3FVNA 3VVEA 5DVFA 2CZLA 4LVQA 4EQBA 4QSCA 1IXGA 1B51A 5ICQA 1H3DA 2ZNTA 5I2NB 4GXSB 3IOUA 2I4CA 1R9LA 4EQ7A 4PFTA 4EUOA 3OO6A 3QUJA 3VLVA 3THIA 3S9LC 4YKPA 2OJTA 4F18A 4FORA 3PD9A 4KPTA 5K2XA 3GXAA 1FQAA 2BJJX 1PB7A 1P99A 3LSLA 2H99A 2CMOA 4BLAA 3VVFA 3B6TA 4ZEDA 2XX8A 1B0LA 3O9PA 4IY5A 1AMFA 1ZIUA 4NF5B 2Y7RA 1POY1 1FQEA 4C1TA 4ELOA 1OLCA 3SEXA 3FV2A 2FYIA 3EHUA 1NMUA 1LSTA 2A5TB 3DELB 3K1PA 3TTRA 4U4XA 4P11A 3FZVA 4K3FA 4GVOA 2DP8A 3CR9A 1XOCA 3RUMA 2F6GA 2VD3A 4XKNA 4GIZA 3UA8A 1ATGA 2O68A 2O84X 4DZ1A 1P1UA 2I0CA 3MWBA 4ND9A 3G3HA 3O97A 1PC3A 4DXBA 3HHGA 3RT6B 1N0TA 1LFIA 2Y7KA 1D3KA 4WEDA 4RA1A 4IO2A 3DP4A 1I6AA 5CI5A 1FCKA 4PE5B 4IY6A 4JWOA 3IOVA 2RF1A 3CRBA 3MVYA 3DLNA 3GLBA 3E3KA 4RK2A 5I2KA 1Y3NA 3IOTA 4FEBA 2P0SA 3JZJA 2DSFA 2V3TA 3IJXB 4ELRA 2UVJA 1MPCA 3UIFA 1N3XA 3TCHA 3G3JA 5TP9B 3EHTA 2W7YA 2Q89A 4E0XA 2DE4A 5AE4A 1FQDA 3IOWA 2I6EA 4RNSA 5I57B 1B0HA 2ESNA 3A3CA 1URGA 2XXXA 3PUVE 4ESWA 2Y84A 3U72A 1MQHA 5JK4A 4OESA 2X7QA 3MP8A 1O64A 4C1UA 3RPWA 2ZMBA 2OWSA 4X48A 1P1WA 5KZTA 4ECFA 2NXOA 3RT8A 3VLUA 3V89B 2P2AA 1AIVA 3QXMA 3TQLA 2XX9A 1R1NA 4LQ2A 2VP1A 2FA7A 2LAOA 3FJGA 4IB2A 4Q8RA 2H4IA 5DT6A 3K00A 3K1MA 3K02A 2THIA 1MS7A 3TCGA 4ZECA 1QJMA 2D21A 4U2RA 3SETA 3OSRA 4NE4A 3RY3A 2Q88A 3Q26A 2V25A 1MXZA 1MQDA 1XC1A 1XHYA 4YKKA 1S7YA 3CSGA 2XXPA 4ZEBA 1JVYA 4OETA 2Q2AA 2F7BA 1SW5A 3V83A 2AL4A 1Y4CA 4PFUA 1JW1A 4GQOA 4H6DA 3KN3A 3R26A 1IZ1A 3O28A 1MXWA 5DYHA 3MP6A 3RNNA 2V3UA 4U23A 4ZZEA 1JW4A 2XXQA 5I56A 5AA1A 2ONRA 1DSNA 3EN3A 3VLWA 1LBCA 4Z7EA 4DIGA 3MZ1A 3I5OA 4XTCQ 4ZEIA 3FUZA 5I2KB 3H6VA 1NNFA 2AL5A 4P0GA 3MP1A 3MJNA 1ZMGA 1M5FA 4AB6A 3E13X 5CMCA 4DCYA 5B7DA 4IO4A 3H03A 4M1VA 2B65A 3MQ9A 1XT8A 5F7VA 1MQJA 1NFTA 1NNTA 3TZAA 4U22A 1OVTA 3H4ZA 5ICTA 1NNPA 3O6HA 1A8FA 2NVUB 4BDLA 4E0WA 4G8HA 1USYH 1S50A 2Z23A 3IB0A 2O69A 4DE8A 3MZBA 1AH5A 4YB5A 4KHZE 2PBWA 4F2QA 4GF8A 1IITA 4OHNA 3K1NA 3B6QA 4M4GA 4AB5A 1SI1A 4GFRA 2GFEA 3IB1A 4TOZA 4F29A 3LBSA 2UXAA 4KYEA 1IUDA 1KWHA 3KOTA 3OO9A 1SI0A 3K4UA 3PV0E 3LSFB 5CBSA 3FVKA 1IXCA 1II5A 1LGBC 2NWJA 5L9OA 1T0KA 3C4MA 3E4RA 2QSXA 1MM6A 1N3WA 1PDAA 4BDQA 3C36A 3PMXA 3CI8A 5EHMA 3ZSFA 4RPNA 3QAXA 5KCJA 1B4ZA 3KSJA 5H8FA 4LZ5A 2PT2A 4PP0A 5AA3A 3L6HA 1LBBA 4QRZA 4RYAA 1O7TA 3IJOB 5CM6A 3RTWB 5I56B 4R6YA 3LSWA 4LUBA 4H5GA 3PPOA 4AQ4A 3TQWA 4QHQA 3FVOA 4EXLA 2DE2A 2ZNUA 3M3LA 1PB8A 2PMSA 1D9VA 3SEVA 2ZYKA 1AL3A 1M5EA 4JWXA 5H8HA 3PUZE 3OELA 2V3QA 1L5TA 5I84A 1XS5A 3IK6B 3ONMA 4GL8A 3KEIA 2FNCA 3PMWA 3TDJA 3L6GA 3UK4A 1N7WA 4FIMA 3Q27A 3IORA 3MC2A 3ZKLA 4U1ZA 2DS9A 4KD5A 5BUUA 3N26A 2OZZA 5LOMA 5ISUA 1Z7NE 3T93B 1LLSA 3QIMA 1R6ZA 4KYDA 4X1BA 4PETA 2E0SA 3P7IA 2G29A 1ZJLA 2ZXTA 3WAEA 3T9VA 4NWCA 4BDOA 1IXIA 3O2AA 4FEDA 2ALUA 5HPQA 3K2DA 3H7MA 2GRVA 1MQGA 1SD3A 3TUSA 3VXCA 1GV8A 2OK2A 3BKIB 1NH8A 2ANJA 4MFIA 4R6KA 4GRKA 2RC7A 5IAIA 3TFLA 4F1UA 4OFJA 2XXYA 4NWDA 4ELQA 1MY3A 2GHBA 2Y7WA 4EF1A 1CE2A 3SESA 4ONYA 4F3BA 5AA4A 4KR5A 3IL1B 3S4UA 3EPEA 2ZYMA 2QS3A 3FXRA 4R73A 1USYE 3TEPA 3CFLA 2I58A 4ZZAA 1YTVA 1B40A 3ECRA 1R9QA 2DVZA 4FJPA 4IGRA 2AIXA 2RCBA 2X26A 1B7UA 4O3BA 3PUYE 3DM0A 4QFNA 1EZPA 4WXJA 3KOSA 4H0WA 5KCJB 4F39A 4O3CA 5H8FB 1OVBA 1UTBA 4DLDA 1BIYA 1DTZA 3RTFB 4ZS9A 5F1QA 3TYHA 3KBRA 4G77A 2D3IA 2P1SA 4MF3A 4JDFA 3CSBA 3M8UA 4POWA 4QSDA 2HQ0A 2Y7IA 1IXHA 5FTIA 5ELVA 4R2BA 3JV9A 2NOOA 3Q28A 3H06B 3RQTA 3FVGA 1MRPA 2Q2CA 2F78A 4ZEFA 2ONKE 1RYXA 1JEUA 2F5XA 2XD3A 1DPEA 3VFJA 5DTBA 5H8HB 3SEYA 2GHAA 3VV5A 1I6BA 3S2VA 4G8MA 4LZ8A 3MW0A 4NF4A 4EXKA 3FXUA 1H44A 1B7HA 4QSEA 3VE1B 5CC2A 1Y20A 1FTKA 3SDFA 2HAUA 4GL0A 4LONB 2DXYA 5TPAA 3C32A 3KJTA 1MY4A 1MDP1 2R6GE 2I0BA 3OMBA 4XKRA 1H45A 3FATA 3TCFA 2HCAA 1CB6A 2XXUA 3KFMA 2F97A 4G2ZA 2I3WA 1TFDA 1FTMA 4JXIA 5EYFA 1B4HA 1B32A 3OEMA 3UGWA 4H5FA 3IX1A 2PVUA 3RN8A 1EU8A 3ZS6A 4WKMA 3PUWE 4RPOA 5I59A 1RKMA 3GBBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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