3CFXA

Crystal structure of m. acetivorans periplasmic binding protein moda/wtpa with bound tungstate
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
GEVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Distorted octahedral coordination of tungstate in a subfamily of specific binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Methanosarcina acetivorans
molecule keywords UPF0100 protein MA_0280
total genus 100
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cfxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cfxA02
5CRYA 1AIVA 1QW0A 3DELB 1MY1A 5H8NB 4LZ7A 4IB2A 4LZ8A 3QUFA 3U93A 5KCJA 3HPIA 4R6YA 4RK2A 3HHGA 1QKBA 4EQ9A 3O6IA 4MF3A 2ZMBA 4MFIA 2OJTA 1MG1A 2ESNA 3OO7A 5CI5A 2XD3A 1MQIA 4KFQA 1H43A 4M4GA 4ZS9A 5JK4A 3WAFA 4EQBA 1MQJA 3KJ7A 1XT8A 4FAJA 4QFPA 5FHNA 4P11A 1POTA 1HSJA 1US5A 3KEIA 5DVJA 1FQDA 3PUXE 1FW0A 4Q5TA 3TYHA 2Y7RA 4LQ5A 4GOTA 5AA1A 1LB9A 1P99A 1MY4A 3FVGA 2HFBA 4K3FA 2XXIA 1J1NA 1MM6A 1D3KA 4YKIA 4N6PA 1O7TA 3TCGA 5F7VA 2A5TB 3MPLA 2RC8A 1UTBA 2HZLA 1SD3A 2IA4A 5CC2A 5ISUA 2NUVA 3U92A 1IQ7A 4FECA 4YMBA 4GXAA 4DCYA 3HSTA 3IJOB 3MVWA 1US4A 3TFLA 3E9XA 1Y3PA 1PB8A 2E1SA 4OVJA 2RCBA 3M8UA 3S4UA 5I57A 2XXRA 2F36A 1B7ZA 2O84X 1JVXA 1MPCA 3K4UA 1S9TA 1SYIA 2PX1A 4NF8A 2DXRA 2DQVA 5DYHA 3MWBA 4OFLA 5TP9A 5ITPA 2ZYMA 4JWOA 4G8HA 4PETA 1ELJA 1D9YA 4YZZA 1Y9UA 1UTHB 2NVUB 3FGSA 2GFEA 2ZNUA 5L8DA 2B3BA 3IO4A 3EHTA 1B7UA 3IO6A 2QJEA 4KR5A 4RYAA 3OO8A 2UVHA 4XKRA 3OSRA 3EPEA 3D4GA 5JTYA 3W9VA 1EZOA 2H9BA 3KSXA 3CVGA 4ZEBA 1F9BA 2XHDA 5CMCA 4ELRA 4NF5B 4FATA 4HS7A 4ZEDA 2O51A 4RA1A 1XC1A 1B5IA 3T9UA 4DCXA 1NFTA 4QFKA 5B7DA 2H5YA 3H06B 3MVXA 3GBBA 3B6TA 2HEUA 4U21A 4XXUA 3SESA 3S9LC 3S9NC 1ZBMA 3KSJA 4G8MA 2H98A 4IO5A 1LLSA 3CG1A 1SI1A 1Y3NA 3O66A 1B3FA 3FJMA 2F7AA 3PUWE 3K6UA 1JQFA 2I48A 2ONSA 2I4CA 4QRZA 1FTMA 2ZYNA 5I56B 4KI0E 3JV9A 2OWSA 1OLCA 3KFMA 4ZE8A 5ICQA 4U22A 4FEDA 4X48A 1I6BA 2F35A 1YPNA 3FASA 4C0RA 4HW8A 3C33A 5I58A 1IXCA 2XXXA 3CR9A 3U1OA 2F78A 2X26A 3ONMA 2O7IA 2Q8JA 1MY0A 2P1SA 1IUDA 4M1VA 3FXRA 4JSOA 2O68A 2YLNA 1ZIUA 1FQEA 1PBPA 3PD9A 2Y7WA 3B7DA 4X1BA 2NWJA 3ZKKA 3A3UA 2OCUA 2Z23A 3U72A 5ICTA 2KLFA 3RY3A 1BLFA 2QL3A 3H6TA 5IKBA 1OVTA 4Q30B 3K02A 2R71A 3S9EA 5H8HA 1FTOA 3VXBA 5AA4A 4ISUA 3SEUA 3H6VA 4NWCA 1NL5A 5AA2B 4OWDA 2X7QA 1HSLA 1B4HA 3TQLA 1PB9A 3TPAA 3DP8A 4H8IA 3IL1B 2D3IA 3H03A 3SEYA 3SKPA 4C1UA 1PBQA 3MQ9A 1IZ1A 2H25A 4U1ZA 1A8FA 1R9QA 4OETA 4YKPA 4C1TA 2O7UA 2I58A 1JEVA 4F29A 5A5XA 1P1QA 5LOMA 2Y7IA 5I84A 1FQBA 1AH5A 3O97A 1A55A 1O63A 2F97A 4BLAA 3MP1A 2QSXA 5KCJB 4RPOA 4XTCQ 2ZYKA 1H44A 1M5DA 4OFJA 1UIUA 4GLIA 1AOVA 1BP5A 3UIFA 3IAZA 1VFDA 5ELVA 5H8FA 4KYEA 3IK6B 2DE3A 4NF4A 1MXXA 1SBPA 3FJGA 4IO3A 1EH3A 3VVFA 3T93B 1B0LA 2V3UA 4F3BA 4O3BA 3N26A 1N76A 2PVUA 3AXFA 4WEDA 2F7CA 2OWTA 3K1NA 3E13X 3IOVA 4NEDA 1MXZA 5EHSA 3S2VA 3C34A 4XKPA 4OZ9A 5JEIA 3U94A 3QXMA 4EXKA 4O3AA 4H8JA 3OO9A 2O6AA 3IORA 3PD8A 4PFWA 1P1WA 3RGYA 4DXUA 3Q28A 3RQTA 1B7HA 4LQ2A 2D5WA 3FVNA 4HTGA 4TQUQ 1UTBB 4R2FA 4ZEKA 2H4IA 1ZMGA 4U4SA 3FUZA 3DP4A 2VP1A 4R73A 1ZJLA 1FQCA 4IY5A 4ZECA 1A8EA 4DXBA 1R6ZA 1OLAA 4MBPA 3PPPA 4XKQA 2ZNSA 3MVYA 4G8NA 4TLLB 5I57B 4F2OA 4F1YA 1B3LA 4IGRA 2YJPA 3TTKA 3FJ7A 4NF8B 3MC2A 5TP9B 1LBBA 2H99A 3G7WA 3CSGA 4RXLA 5L9MA 1IEJA 1POY1 3RNNA 3VLWA 4OXVA 3SETA 3LC8A 3MPKA 1WODA 4F3SA 1B52A 3R7XA 4GXSB 3TTLA 2UVGA 1P1NA 4TOZA 2XXVA 2HAVA 2DE4A 2FA7A 4F39A 2YPNA 3KBRA 4WEPA 1OMPA 5JTYB 5CM6A 4G4PA 4RPNA 3OXNA 2LAOA 1JW5A 2I3VA 2RKMA 5HBCA 1B32A 2X7PA 4LP2B 4PFTA 1FQFA 2QS2A 1TFAA 3C32A 5AA2D 4E0XA 1QVSA 1RKMA 2NOOA 1OIBA 1N3XA 4NWDA 1MQDA 1IITA 3CFXA 2HCAA 1USYH 5CMBA 3L6HA 1QKAA 1PC3A 2QRYA 4NF6A 3QIMA 2V84A 3TELA 2Q2CA 4IY6A 4U2RA 3PMWA 4R6KA 1Z7ME 4F31B 1IIWA 2XXHA 1BKAA 4THIA 4LA9A 4JSDA 3A09A 1VR5A 4N13A 2CMOA 1JW1A 2E0SA 4AQ4A 3IJXB 4OFOA 4G2ZA 5H8QA 1QUKA 5CBSA 5I59A 2VD2A 1B1HA 4IO7A 1ATGA 3G3IA 1XVYA 5I58B 4XIGQ 3CG3A 1B5HA 4QFLA 4F1UA 4KHZE 4IO6A 2DVCA 3QAXA 4QSCA 3MVZA 3UGWA 3CIJA 3M3FA 2ONKE 1LBCA 5KDTA 4GD5A 4YAHX 1QUIA 2DXYA 3Q27A 1B5JA 1TT1A 4H6DA 1MDQA 1MQGA 4OQOA 4GFRA 2GH9A 4JXIA 1CE2A 5FTIA 4AB5A 5AA3A 3B6WA 3FD3A 1JNFA 5CBRA 2V25A 2XD2A 4OHNA 4I1DA 3RLFE 1URDA 3RUMA 2DP8A 5B70A 1TWYA 4BDOA 5H8HB 3GXAA 4OTEA 3UK4A 2V93A 5AA4B 1CB6A 5FTHA 1EZ9A 4R9FA 2FNCA 4DDDA 4LVQA 4EQ7A 4H0WA 1MRPA 2AIXA 3TKDA 4PFYA 1Q1KA 3TUSA 4X1DA 2G29A 4NE4A 1Y4CA 4ZZAA 1FCKA 4DLDA 1B2HA 3D4CA 4Q8RA 3EHSA 1LAHE 3CFZA 5K2XA 4WKMA 5HPQA 2PT1A 3PPQA 3T96B 2XX8A 3GZGA 1TFDA 4FE8A 2XXTA 3USDA 1NNFA 2P2AA 4PP0A 4OESA 3C35A 2Y7KA 4GQOA 1B3EA 3N5LA 1NNTA 2DWAA 5A5XB 4OYVA 1DTZA 2F6PA 1MH4A 3H3GA 2B3FA 3DP6A 1LFHA 4QHQA 5I2NA 3QUJA 4BDQA 3C9HA 3THIA 1B51A 5H8FB 1N7WA 3R6UA 2Y84A 4NF4B 3Q25A 1B46A 3ZS6A 3HO7A 3QYTA 1Z7NE 2DWIA 3FATA 4F19A 1VSOA 4POXA 4O3CA 5I2KA 3RT8A 3IOWA 1OQHA 3LSFB 3TEPA 3K6WA 5H8SA 5L9SA 3C31A 2DOJA 2Z8DA 1LAGE 1FTLA 4LATA 3FV2A 2DYXA 3N6UA 3TCHA 3OMBA 2QS3A 2GHBA 2PBWA 3PV0E 1MM7A 2Q88A 4FORA 3HN0A 4F3GA 3IR1A 3W9WA 4H67A 3P7IA 3MJNA 1LFIA 1Q35A 4ZE9A 2XXYA 3V83A 3QSLA 2O1LA 3IX1A 4R75A 1QULA 1SW2A 4EDPA 3H7MA 3O29A 3Q29A 3G3FA 4GWOA 3H6WA 4IO4A 4ZEIA 2XXPA 1VE4A 2ALUA 4U23A 1EZPA 5FHOA 3V5AA 1YAEA 3EF7A 1XOCA 3K6XA 4QSDA 4RJZA 1WVJA 2RINA 2I49A 2THIA 3EHUA 1NMUA 2D21A 1N3WA 1SQYA 1B6HA 4G68A 3VDFA 3VXCA 1MY3A 1SYHA 3KN3A 3RTFB 1XHYA 1YTVA 4G68C 1FTKA 1LCFA 1UIVA 4JBZA 4U4XA 4ELQA 1I6QA 1PDAA 2AL4A 3M3LA 3UA8A 1NNPA 1LAXA 1SW1A 4ND9A 2IEEA 4MH5A 2Z8EA 4KPTA 3A3CA 4ELPA 3K6VA 1A40A 3O6GA 5L9OA 4QFNA 2UVIA 4KCCA 3OO6A 1S50A 1OVBA 3RT6B 1N84A 2AL5A 4BDNA 3VVEA 5J1DA 1GGGA 1SVXB 1LSTA 3CI8A 3OEKA 4DE8A 2HXWA 2QS4A 5KZTA 3LBSA 1MXVA 1JETA 3IB0A 4NF6B 3EQ1A 1AL3A 3IB1A 5TPAA 3K1PA 4I8CA 4FIMA 3O6HA 3UORA 1Y20A 4E0WA 1DSNA 5M2VA 2GRVA 4YKJA 3FZVA 1UQWA 4POWA 5H8QB 3TTRA 1PEBA 3TDJA 4I9DA 3IOUA 5I59B 3FVKA 3RN8A 3K01A 2HZKA 1IXHA 2DWHA 3IB2A 3ILTB 3PUVE 4ESXA 4KCDA 3KN7A 4N07A 3I6VA 2Q9TA 3RTWB 3PPOA 3PPNA 5TU0A 4GVOA 1B0HA 4LONB 3VE1B 5CMMA 3ODBA 4YU0A 3TAJA 2Q89A 5KDTB 3O9PA 2PYYA 2ANJA 4RY1A 1LB8A 4NTLA 3MAMA 3SEXA 4EXLA 3ZKLA 4AB6A 1ZTYA 1URSA 4OENA 2VD3A 2O1MA 3SDFA 3VVDA 3TQWA 1D9VA 1Y1ZA 5HM4B 1I6AA 3CFLA 1GR2A 1IXIA 1B40A 1A54A 2RCAA 3QK6A 1B3GA 3WAEA 3V89B 3K0VA 3O2AA 3LSLA 1URGA 2R6GE 2HQ0A 2DS9A 3LSXA 3K2DA 3BBRA 3G3JA 2F5XA 3B6QA 1D4NA 2QMWA 3CSBA 2GHAA 3SEWA 1M5CA 3BFUA 3UN6A 4RK9A 2QMXA 4UA8A 2VGQA 4X9TA 2P0SA 2V3TA 3HCQA 4Q0CA 2XX9A 3JZJA 3PU5A 3MBPA 1USYE 5FHMA 3TTMA 3K1MA 3FVOA 5DEXA 2ONRA 4BDRA 1VFEA 3ILUB 3PPRA 1H45A 4YICA 4YB6A 3ZSFA 2WKYA 3VLVA 1RYXA 1MH3A 3I5OA 3C36A 1FQAA 4GL0A 1Y1MA 4IO2A 1T0KA 3I3VA 5I2NB 2O69A 1HSEA 4H1XA 4RNSA 1N7XA 1A99A 2DWJA 4MLQA 4ZDMA 2Z22A 1S7YA 2RC9A 4ECFA 2CZLA 1RYOA 3TODA 3S9MC 2I3WA 4ONYA 5I2KB 4F2QA 1B58A 4ELOA 4YB5A 5H8NA 4GIZA 3V8XB 1NNKA 3TTNA 2FYIA 3KG2A 1LFGA 1JEUA 3FIRA 3C4MA 4PFUA 4L17A 1I69A 1DPPA 4HCWA 1MY2A 1DOTA 4KYSA 3W15C 4F1VA 4DZ1A 3U8QA 3MW0A 3LSWA 2RC7A 3MP6A 1MS7A 3G3GA 1NH8A 4BDLA 4H65A 4ESWA 5DT6A 4QF9A 1B1XA 2ZYOA 1AMFA 1LGBC 1XVXA 2PMSA 2I0BA 1FTJA 3TCFA 3O28A 2VHAA 2F8DA 1P1UA 3GBAA 4R72A 1Y4TA 1DMBA 3DLNA 1GV8A 2R9JA 4YB7A 2ABHA 1A7LA 4EF2A 4LZ5A 2OZZA 2XX7A 3MZ1A 1B05A 1JW4A 1XS5A 2F7BA 4EUOA 4YKKA 1M5EA 3K00A 5K2YA 5CMKA 3N6TA 2QS1A 2F6GA 2A5TA 4R6HA 5DVIA 2Z8FA 1MPBA 3RPWA 3EN3A 3VFJA 1M5BA 4GF8A 1ZLQA 3T9HB 3OENA 3OOAA 4G68B 4GL8A 2B65A 3MUQA 4BDMA 3E3KA 3PGFA 5DTBA 3JYRA 2OK2A 4KQPA 3KGCA 4UACA 3F11A 3E4RA 4G77A 3N94A 2OLBA 4U1OA 5AE4A 4DIGA 4Z7EA 2AYSA 4QSEA 1JVYA 1UTHA 4FJPA 1H76A 1Y3QA 3HHFA 3PMXA 3GLBA 5EYFA 1L5TA 4IGTA 1KWHA 4FEBA 3FXUA 3LUYA 4OEVA 4F18A 2UXAA 4P0IA 3L6GA 3FXQA 4OERA 3T9VA 3M3KA 3H6UA 2UYEA 5TPAB 2XXWA 2F34A 2RF1A 4ZEFA 2Y7PA 3VV5A 4PQJA 3PUYE 4GRKA 4NF5A 3T9XB 1GTKA 4I62A 3ECRA 4YMAA 1SW5A 2PT2A 3SERA 1P1OA 1B3HA 1B4ZA 3G3HA 3OELA 2BJJX 4KYDA 1ANFA 3HV1A 5F1QA 5IAIA 4HCYA 1O64A 3OSQA 3OEMA 4LUBA 1DPEA 1MQHA 2Q2AA 2I4BA 4WXJA 4MLVA 2M8CA 3BKIB 1NH7A 3H4ZA 5EHMA 1GVCA 5I56A 1N04A 1SDXA 1M5FA 4JWYA 1ZU0A 3KJTA 4DXCA 2REGA 1BTJA 3TZAA 4NMYA 1MXYA 3MZ9A 1YCJA 4OMBA 5DVFA 2A5SA 1MXUA 2I6EA 1QUJA 3DM0A 2G93A 4JB7A 1SW4A 2REJA 1PB7A 4R2BA 3T66A 2DVZA 3T22A 2UYFA 4JWXA 4F3PA 3UP9A 1LCTA 3OD7A 2VOZA 5ITOA 3CRBA 2HAUA 1H3DA 4JDFA 1MPDA 2ZXTA 1ZKBA 5BUUA 3MP8A 5BWJA 2DSFA 1TXFA 1II5A 3FV1A 3R26A 4PE5B 1OQGA 1DTGA 3MZBA 1BIYA 4QFOA 3PUZE 5DEXB 4Z0IA 3LR1A 3Q26A 3PMVA 4TLMB 1R1NA 1LAFE 4P0GA 4R74A 2I0CA 2UVJA 4KD5A 2QPQA 2XXUA 4OEUA 1SI0A 5AA2A 1N0TA 1NKXA 4EF1A 3KN8A 1B9JA 1R9LA 2ZNTA 1WDNA 3KOSA 4H5GA 1QJMA 2W7YA 2OBGA 4H5FA 4F22A 3G3KA 3SEVA 3TMGA 4ZZEA 4R9GA 2V3QA 3BFTA 2XXQA 3KZGA 1MXWA 1MDP1 1EU8A 3IOTA 3KOTA 2NXOA 3VLUA 2DE2A 1IXGA 4XKNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CRYA 1AIVA 1QW0A 3DELB 1MY1A 5H8NB 4LZ7A 4IB2A 4LZ8A 3QUFA 1AWBA 3U93A 5KCJA 3HPIA 4R6YA 4RK2A 3HHGA 4G61A 1QKBA 4EQ9A 3O6IA 4MF3A 2ZMBA 4MFIA 2OJTA 1MG1A 4H46A 2ESNA 2L5VA 3OO7A 1NV4A 5CI5A 2XD3A 1MQIA 4GWUA 2VPOA 1FPKA 4KFQA 1H43A 4M4GA 4ZS9A 5JK4A 3WAFA 4EQBA 5ET7A 1MQJA 1LBYA 2DDKA 5I7IA 3KJ7A 1FPJA 1XT8A 4FAJA 4QFPA 1RDZA 5FHNA 4P11A 1POTA 1HSJA 1US5A 4MNCA 3KEIA 5DVJA 1K9ZA 1FQDA 3PUXE 1FW0A 4Q5TA 3TYHA 2Y7RA 4LQ5A 4P1EA 4GOTA 5AA1A 1LB9A 1P99A 1MY4A 3FVGA 2HFBA 4UABA 4K3FA 2XXIA 1J1NA 1MM6A 1D3KA 1FBDA 4YKIA 4N6PA 1FSAA 1O7TA 3TCGA 2QVRA 5F7VA 4NX1A 2A5TB 3MPLA 2RC8A 1UTBA 2HZLA 1SD3A 2IA4A 5CC2A 1FJ6A 5ISUA 2NUVA 3U92A 1IQ7A 4FECA 4YMBA 4GXAA 4DCYA 3HSTA 3IJOB 1FBGA 3MVWA 1US4A 3TFLA 3E9XA 1Y3PA 1PB8A 2E1SA 4OVJA 2RCBA 3M8UA 3S4UA 5I57A 2XXRA 2F36A 1B7ZA 2O84X 1JVXA 1MPCA 3K4UA 1S9TA 1SYIA 2PX1A 4NF8A 2DXRA 2DQVA 5DYHA 3MWBA 4OFLA 5TP9A 5ITPA 4P8BA 2ZYMA 4JWOA 4G8HA 4PETA 1ELJA 1D9YA 4YZZA 1Y9UA 1UTHB 2NVUB 3FGSA 4DI3D 5IM2A 2GFEA 2ZNUA 5L8DA 2B3BA 3IO4A 3EHTA 1B7UA 1FBCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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