3CH9A

Crystal structure of aspergillus fumigatus chitinase b1 in complex with dimethylguanylurea
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Aspergillus fumigatus
publication title Structure-based dissection of the natural product cyclopentapeptide chitinase inhibitor argifin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
total genus 147
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2008-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3ch9A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ch9A01
3AZTA 3CUJA 3GXFA 1GQJA 1UWQA 3B8SA 2HVMA 3WH9A 4B16A 3HN3A 1ISWA 2ZUWA 1GOIA 4D72A 1UR0A 2WB5A 3WH7A 2DSUA 3KWXA 1CXHA 2XG9A 5A6LA 2BY2A 1D2KA 1VF8A 1JI1A 1V0MA 2VX4A 4C7DA 2D3LA 3WUFA 2WSPA 1MXGA 1W32A 4GI9A 5KZ6A 3FAWA 3GTNA 5FD0A 1SMAA 1RP8A 3EDDA 1V0KA 2EXOA 5JBEA 4OJYA 5C70A 2WK2A 2WC3A 4RL3A 2Q8XA 1WDPA 2D23A 1V3IA 1RP9A 3TONA 1NWRA 2WAGA 1PX8A 1G1YA 1JZ5A 4CU7A 1UH4A 1JZ4A 2XSBA 1AQMA 2DT0A 5AYIA 2W61A 3BAKA 3PZNA 4YPJA 2VZUA 5DFAA 2J8FA 4U31A 1P6WA 3N1AA 1GHSA 5HXMA 4FK9A 1ISXA 1OM0A 2WMFA 3L4WA 1EO7A 2EO7A 1GQLA 1QI2A 4YN5A 4OKDA 2YDQA 2DSWA 3J7HA 5CGTA 2G3JA 2YOCA 1V3KA 1ISZA 2QLYA 1NQ6A 2X0HA 4IISA 1LL4A 2GDVA 3VD5A 4W5UA 1UH3A 2OYKA 1OGBA 1H11A 1RD6A 1V03A 4PTXA 2YDRA 1HP5A 1V3LA 3MO4A 1MW2A 3WENA 3AYSA 3AIQA 1GOOA 4JFTA 1BQCA 3VIMA 4UR9A 2WPGA 5E6YA 2BHYA 1MW1A 1CENA 3VO0A 3ZJKA 1TVNA 3SCVA 3GBDA 2XFFA 2E9BA 4W7WA 4D6DA 4UQ9A 4XZBA 1XSKA 5C71A 3MUAA 3RJXA 3B9DA 1TMQA 4CUCA 3THCA 2YA0A 3U7BA 3VD7A 3N15A 5I0DA 5A8NA 2VNCA 3GXIA 1E5NA 2A3EA 2VMFA 4KMQA 4ACZA 4KRTA 5CPQA 1JGIA 1UA7A 1EXPA 3VX0A 3PZ9A 2GSJA 2YLAA 2FHFA 2ZWZA 3LPFA 3VVGA 1V3HA 2QV4A 1HKIA 2XFRA 3W37A 3VGHA 3AISA 1BYCA 3AZRA 4WJXA 2E8ZA 4IPLA 2GK1A 3PTKA 2XPKA 3PZOA 1XCWA 3AXXA 5A6MA 4HZ7A 1CIUA 2DH2A 4B9ZA 4JFWA 5A6KA 3WELA 4A4AA 2ZUVA 1QNQA 2NT1A 2OYMA 1Q6GA 3L4ZA 3UR7A 4UOJA 3BAIA 2EPNA 4BS0A 3RJYA 3SCRA 4X0NA 1UR1A 2QPUA 5A2CA 1JYNA 5A6JA 2ZXDA 1ZBWA 1J0ZA 2JE8A 4ACYA 4BF7A 3K8LA 2FGLA 3GXDA 3VM7A 3ZT7A 2VZVA 2WHKA 3VOCA 1FH9A 3B9EA 1BG9A 2WZIA 3MUZ1 3UG4A 5M5DA 3WDRA 1VEPA 3SUWA 1J0YA 1TA3A 3QOMA 1HIZA 3FN9A 1YHTA 4WSKA 2BY1A 1IV8A 2VI0A 2NT0A 3WH6A 4TXEA 1ZBVA 4EK7A 2WMHA 3AMCA 4AISA 5BXTA 1G01A 2Y4SA 1PX4A 1XH0A 1XSIA 2A3HA 4Q22A 4OBSA 1JFXA 3AZSA 2WSKA 3VNYA 1JZ6A 1ESWA 3PZMA 4UQCA 5D8ZA 1W9XA 2RGMA 1HL9A 1LWHA 4AD3A 2WMIB 5A6SA 1G0CA 3CUGA 3CTTA 3K46A 1LL7A 3MSGA 3DYPA 1H09A 5A3HA 2PBGA 4PCSA 4ZE4A 1E15A 1GJUA 3WN6A 1V02E 4N0RA 1WDQA 3M46A 4JFSA 2JF6A 1BYAA 3SCNA 1SYTA 1JNDA 4W8LA 3NUKA 1NH6A 1VFOA 5CPSA 4ZXLA 5AY7A 1EA9C 2VCBA 2J7FA 3KL5A 3S6TA 4IUGA 3ZT6A 5CLTA 1M7XA 3CHDA 4YHGA 4Z2KA 1J11A 2CERA 2YL6A 4AEEA 3VPLA 3WF2A 2XVGA 1A47A 3GH4A 4CD7A 1SR0A 2ZX8A 5EBAA 2XWEA 4NF7A 3AS1A 2ESCA 2JALA 4AIEA 1H1NA 1NOUA 1MFVA 4OIFA 4KH2A 1F4HA 2UY3A 2CBJA 4V27A 4CD5A 1XGZA 2WKGA 2VZOA 1EQPA 1AMYA 1EGZA 4B15A 2X05A 1WCGA 2J8GA 1W3JA 1D7FA 4IPNB 5JUVA 4KGJA 1V08A 4EE9A 4P8UA 1GUVA 1E9LA 2J78A 2EPOA 2G3IA 1XYFA 1J0IA 4U2YA 4CKQA 5FL0A 2A3CA 2QMJA 1HL8A 4W8AA 3OZOA 2QMKA 3EMCA 1V6WA 1VFFA 2XTKA 3G6MA 1GVYA 4AD0A 1OCQA 1C3FA 4MAVA 3CZLA 3UESA 3L2LA 4FF5A 4FMVA 5GNZA 4ATDA 3PN8A 4D6HA 5EFFA 3DHUA 1B3VA 2J47A 1C91A 1TR1A 2X09A 4H41A 1ODUA 3WFLA 4DUXA 3RILA 1BFNA 1E6PA 1W1TA 1LG1A 3VD9A 3VIKA 3SUSA 1HKKA 3VIFA 1VJSA 2BY3A 1CGXA 4GI8A 3LMYA 4BQ5A 1OIMA 1NWSA 1WB0A 1FP9A 1UD3A 1QVBA 2BVYA 3RO8A 1KWKA 1GOQA 1RH9A 3ZSSA 1UKSA 2CITA 5JIPA 3BAJA 3PBGA 3W28A 3WNOA 2VZTA 3ARTA 4PYSA 3ZQ9A 3RPMA 5ABHA 3OGVA 6TAAA 3F4VA 1R87A 1CYGA 5A8PA 4MADA 3A6OA 2FHCA 4JL2A 2J7CA 4HOXA 3ARYA 3VDHA 2CPUA 3WEMA 4PMZA 1UWSA 1JF6A 2YBUA 2YL9A 4CU8A 2O9RA 2DSZA 3FAXA 3QHMA 2VTFA 1BGGA 1JNEA 1O6IA 1W1PA 1DWJM 3WH5A 2E3ZA 2VO5A 1KXQA 1QI3A 3O2LA 1XHGA 2J75A 4J3XA 1OD8A 3VIJA 2OSWA 1QHZA 3ZJ7A 3RM8A 1O7AA 1H49A 3PZUA 3K4AA 4HA4A 3U5UA 3AHZA 5JBDA 3SUVA 1OSEA 3TTYA 1EDGA 5AYBA 5M3WA 4R27A 1KXHA 1VEOA 1XH2A 3K1DA 2VC9A 1L8NA 3MSDA 5DO8A 2YLLA 2CNCA 2D0HA 2WVVA 1HN1A 4UQAA 1MXDA 1B90A 3ARRA 3AMDA 1GOKA 3WQ6A 1US3A 4OOUA 3A4AA 6A3HA 1UWRA 4H8VA 1KXTA 3SUUA 3VDBA 3ARXA 3AMLA 3WDPP 3A4XA 4WKFA 2G3NA 3LPPA 3MV11 3ZO9A 2DEPA 3AIVA 2BXZA 1IZKA 1KGWA 3WKZA 2A3AA 7TAAA 1DEDA 2NW0A 2OWWA 1W3KA 1JIBA 1UZ4A 4PUEA 5D8WA 1OB0A 1CXIA 3W53A 3OLDA 5HDRA 3IAPA 4HPGA 3BLPX 1ITCA 1OGSA 2CKSA 5I78A 2TAAA 3M6DA 4ZEPA 4E2OA 4RE4A 2O9TA 1GW1A 2YL5A 1FOBA 3L4TA 4UQBA 3KL3A 2XIBA 2JEPA 3NSNA 3VIIA 1GPFA 2W91A 3OLEA 1CNVA 1XD0A 2CKRA 2XVLA 4M81A 3W6LA 1W9PA 3PZGA 4HMDA 4NI3A 1PIGA 4D6CA 5BYWA 2VR4A 2GFTA 4A3YA 1CXLA 3LPGA 1EQCA 3VD4A 3U5YA 4WF7A 4BQ2A 1KR1A 4KGLA 4UFHA 1RPKA 1KR0A 3I3DA 3QHNA 2PBOA 2D20A 3RMEA 2GJXB 5DF0A 3TTOA 4AZBA 3OLGA 1JD9A 3ZM8A 1DP0A 2O9OA 1VENA 5CG0A 1W3LA 5I77A 5DMYA 1XC6A 4W93A 3U57A 4PMRA 2VX6A 3WDQA 3NYDA 1WNOA 4W7VA 1GOMA 5HBFA 1HVQA 1FH7A 4OOZA 4AZ5A 1A3HA 1TZ7A 1TG7A 1UH2A 4UNIA 3L4XA 3L4VA 2Y2WA 5BXPA 4JCLA 3AQUA 3WL0A 3I3EA 4W84A 2WNWA 1UKTA 4H2CA 4UFIA 2WCAA 5CGMA 3ZR6A 1QNPA 3CH9A 4RE2A 3ARVA 2D0GA 2PWDA 2VVSA 1M53A 1VBUA 2J25A 3WEOA 5FIPA 3NSMA 2OSYA 1ECEA 5A94A 3MMDA 3GH7A 4PTWA 3K8MA 4XZWA 4AD4A 4PBGA 3EDEA 1KGXA 2QPSA 2ZWYA 1PBGA 1PZ3A 2WXDM 3SURA 1C92A 3M07A 1NARA 2WHLA 4HOWA 1OT1A 1QBBA 7CGTA 1ZJAA 5ECUA 2J79A 3FW6A 3THDA 3GNOA 1UR9A 1E4IA 4WIWA 1HT6A 4AZ6A 3T2QA 3WBAA 2WVSA 1FH8A 2J7DA 3CO4A 4W8BA 4CCCA 3NJ3A 1US2A 1KGUA 3EMQA 4TVDA 3PZIA 4X0VA 1LF1A 4C7FA 2VRJA 4GKLA 2Y8KA 2EPKX 4FLSA 4DUWA 2DPEA 1BSIA 4J3VA 4U5KA 4AD5A 3NIYA 3GDBA 1E6QM 1TVPA 4HZ8A 3RM9A 4JIEA 1XH1A 3MS8A 2F2HA 3UG5A 3QR3A 1V6UA 5TD4A 3SIMA 2D2OA 2BY0A 4Y7EA 1HJVA 2DIEA 4U2ZA 1B31A 1NP2A 4ZXOA 1MYRA 1KQYA 3MUY1 3BCDA 2ZUSA 4BQ4A 2EEXA 1TCMA 3BAWA 4MB1A 1MFUA 3W6MA 3KL0A 4EKJA 2QF8A 1B0IA 4AZCB 4Z2IA 4QDMA 1J0KA 4GZEA 1UOKA 3WY1A 1CGTA 1J18A 2XWDA 2UWFA 2WMIA 5DEZA 1GQKA 5BROA 4E4PA 1J12A 3WNLA 4MDPA 1UYQA 1U30A 3O6AA 4PMXA 3ARPA 5IDIA 2XGIA 3WF3A 1E0WA 2V5DA 4MJ4A 5HNNA 1E72M 4JFUA 1CEOA 4PTVA 4GZJA 1JF5A 3N11A 4QFUA 1R7AA 3VINA 1QPKA 3CZJA 1BYDA 4S3JA 4ATWA 2CETA 1BTCA 3ARQA 1CXKA 2YA1A 2PC8A 1E5JA 1W9BM 2PWEA 2VQUA 5IFTA 4V28A 1CGYA 1NWTA 2Z1KA 3ZJ8A 4NSBA 1W1YA 3D5HA 3WUEA 1E40A 4A3HA 1LLOA 1E6SM 1NWUA 1MQPA 4JKLA 1CGUA 4HA3A 2WCSA 1V0LA 3ALGA 4P8VA 4B9YA 5DT5A 3ARUA 2F61A 1GNXA 4YHEA 3EDFA 4AZGA 5A2BA 4FLOA 2BS9A 2XHYA 1UG6A 1HX0A 2E0PA 4QCFA 4S3KA 1V3JA 2J7BA 2DT3A 4AC1X 3SCUA 1CZ1A 3WD3A 3VIHA 7A3HA 4XB3A 4MTVA 4WLCA 1FFQA 4JFVA 2VZSA 1BF2A 4ZE5A 1AVAA 4F8XA 2BNJA 3AJ7A 1DWFM 3S2CA 3WD4A 1M04A 1FP8A 3UR8A 1WP6A 4MB5A 3VGEA 2WWCA 1JG9A 5EB8A 2WC7A 3WMSA 3SCPA 1VBRA 1BAGA 4PRWA 2CESA 1WPCA 3WDJA 2DDXA 1EOMA 3VILA 1DWAM 4CVUA 3FHAA 1HJQA 4MDOA 5M17A 2DSVA 1UD6A 5IFPA 1QW9A 4GXPA 2PB1A 3DC0A 4PSRA 4W85A 3CGTA 3VMOA 2X1IA 3CUIA 2WMGA 1WZLA 2GJRA 1MWOA 2AMGA 3MV01 1ZJBA 1VB9A 1NM9A 4AIUA 4TX6A 2YIHA 2JFEX 2ZUTA 1G9HA 3ZMRA 1H2JA 5BRPA 2WZHA 1X6LA 4LGXA 4UQEA 1KWGA 1LL6A 4AW7A 2E9MA 3WD0A 2OSXA 1LQ0A 3BH4A 3AROA 4MB3A 3FNDA 5LA2A 3ZOAA 2DIJA 1DHKA 3BSHA 3OA5A 5EMYA 2BVDA 5D9NA 3W24A 4DUVA 1H0GA 1UR8A 1J10A 3WBEA 3MANA 3W29A 1G94A 3VGDA 1EHNA 4TUFA 3WH8A 1UKPA 1QHPA 5E6ZA 2HISA 4DWSB 1Q4NX 4TTUA 3RM4A 1UWIA 4D6FA 1JYXA 2ZX6A 1W3HA 3MU7A 1VFUA 2FGZA 4UCFA 5LYRA 3AHTA 4PMUA 1E6ZA 1GZJA 2W5FA 3WDHA 3W38A 1ZU8A 4GINA 1WO2A 1VFMA 2YKKA 3DYMA 5CLWA 1CBGA 2BXYA 4LQ1A 1ZB5A 3WQ4A 5A6AA 5IXEA 2OLHA 1JYVA 4KRUA 4CU6A 2V3EA 1C90A 1EHAA 1J9YA 2YJQA 2D0FA 3IAQA 4NZCA 2G41A 2XM2A 4MNJA 2JIEA 2GVYA 4AZIA 1C93A 2XVPA 3VIOA 1K9TA 2ZXBA 5CXPA 1E0XA 1ZL1A 1VRXA 2FDMA 1U33A 5I5RA 1DTUA 1XV8A 2ZX9A 4AEFA 3CUFA 4AMCA 1Q6CA 4CCEA 4BCEA 2EBNA 2WLYA 3QOKA 4M82A 5FKYA 1M01A 2VUYA 2E4TA 3T0DA 3KE0A 1R8LA 2VL4A 1IT0A 3AS0A 1QNSA 1XYZA 3VDAA 1H5VA 4HMCA 1HXJA 4R5EA 4W87A 1GCYA 4J3TA 1KFWA 1E4MM 2WBGA 3CLWA 4H7VA 3EDKA 4J3UA 4AYSA 1Q6DA 1SFSA 5JBFA 3BLKA 4V2XA 5HPOA 1F4AA 3WL1A 2IXUA 2VX5A 2VR5A 4J28A 1E6RA 2VCCA 1HP4A 2WC4A 2DT1A 3POHA 3WMCA 5LA1A 4XV0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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