3CHWA

Complex of dictyostelium discoideum actin with profilin and the last poly-pro of human vasp
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
publication title Modulation of actin structure and function by phosphorylation of Tyr-53 and profilin binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major actin
total genus 117
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3chwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3chwA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3chwA03
4WYBA 1MWKA 3IFRA 4DB3A 1EQYA 3H6EA 2AA4A 5JLHA 3A8YA 2A3ZA 2A6AA 2A5XA 2P9IA 2YCHA 5AQLA 4BRCA 2QWPA 4BGAA 3L4IA 2YHYA 2QWQA 2V7ZA 2P9IB 5EXWA 3D2EA 3BP8A 3SJHA 5ADXA 3CHWA 4PKGA 3D2EB 1QHAA 1DGKN 3ENHA 4ISFA 3MN7A 2CGJA 5E84A 2F9TA 4FWKA 4BGBA 3WXIA 3A5NC 3H3OB 1ZXOA 2AP1A 4GY2B 5BREA 2QM1A 3ID8A 3WEEA 3FZLA 4BRGA 3ENOA 5LJVA 4HWIA 3WEEB 1GLCG 1NGFA 2A41A 3WXJA 2V7YA 3VGKA 3FZFA 4PKIA 5AQJA 5AQZA 3I33A 3MCPA 5BRHA 2IVPA 4XH5A 4CD3A 5BPLA 2NZTA 1Z05A 2Q97A 3S41A 4IWVA 4WQ5A 5AQTA 1MA9B 4CZFA 3VEYA 4BC3A 3WXKA 3QBXA 3MN9A 4DQ8A 5AQSA 4EHUA 4BRFA 2P9UA 5BN8A 1ATRA 5KPTA 4BC2A 2P9NA 2ZF5O 1HPMA 3DAWA 5AQYA 3CJ7A 4CZGA 3GL1A 4FO0A 2P9NB 1NGIA 2FLOA 1XUPO 3VERA 1NGEA 1NWKA 1RFQA 2F9WA 2CGKA 3W3DA 5F1XA 3DXKA 1V4SA 2E2PA 2YJFA 3ULEA 4F9OA 3L6QA 3LDOA 3CJ1A 3ULEB 4IO8A 1U2VA 4FWSA 3QBWA 4BR2A 2FSNA 3W0LA 5AZJA 1U2VB 2BUPA 5TKYA 3AAPA 4H0TB 1YVNA 2GUPA 3TU5A 3O4WA 2ASOA 5E26A 3LM9A 4K41A 4RCHA 3U8XA 5BR9A 2V51B 3QDKA 3DJCA 3EKUA 5FPDA 4QS9A 2P9PA 1K8KA 5JICA 4B1ZA 4BC4A 1SZ2A 1GLBG 2P9PB 1ATNA 1K8KB 4BR0A 5BPMA 4H5VA 2YHXA 2I7PA 3WUHA 1Q18A 3VETA 4H0PA 1ZBSA 2D4WA 3H3NO 4L3QA 5EY4A 4MO5A 3HSCA 4I6MA 1BU6O 3WT0A 1GLDG 2Q1NA 3WXLA 3QFPA 5ADXH 2P9KA 3U4LA 2FF3B 2Q31A 3QB0A 4I6MB 4XH4A 5BRDA 1IJJA 1C0FA 2P9KB 3VOVA 3B8AX 4MLHA 4CI6A 1NLVA 3R8EA 2D1KA 4BC5A 2FSKA 2GELA 3M6GA 3VESA 1T44A 2KHOA 3SK3A 2EWSA 2W41A 4J8FA 1Y64A 1NGGA 2CGLA 3JS6A 3ZETA 3LDNA 4DCHA 1HKCA 4FWNA 4IZ9A 3ZETB 3QICA 4EHTA 3L0QA 4M7XA 3SMPA 3KZBA 4H0VB 4CZKA 3D2FB 5FPEA 1D4XA 4MO4A 2PBDA 2ZGZA 3MDQA 3I8BA 3ZEUB 4YDUA 4B9QA 4GNIA 4WQ5C 1E4FT 1JCEA 3ATVA 1GLJO 3FZMA 3HTVA 4B1XB 4BR9A 2ZGYA 4IJAA 4BVOA 2YI1A 4FWLA 1RGIA 3O8MA 2Q36A 1S3XA 4BRAA 3AARA 4A2BA 4H5WA 4BQZA 1BWFO 4ISEA 4FOIA 5AQMA 1TUYA 1E4GT 3BF1A 4PL7A 1LOTB 2E8AA 4CBXA 4FWOA 5AQFA 4QS7A 1NGDA 4CZIA 4FL9A 2QWRA 2NRHA 1SAZA 3VEVA 1GLEG 1HUXA 3EL2A 1YXQA 2GTDA 3LDPA 4FSVA 2DPNA 3IDHA 1NGAA 1LCUA 1YAGA 3H45C 2A40A 4CZLA 4O5FA 1ATSA 1QQMA 2Q0UA 4IXCA 3FGUA 3P4IA 2VWBA 1HX1A 4WQ4A 4EFHA 2GEMA 1J6ZA 1XQSC 4AM7A 4H0YB 3HI0A 4BREA 4BRKA 3O1WA 3C7NA 5LY3A 4K43A 3ATUA 3CETA 2E20A 4JNEA 3O5BA 5AFUA 2P9LA 3C7NB 3CI5A 1JCFA 2A42A 3UKRA 4CZJA 2D0OA 2UYTA 2P9LB 3GDQA 4BVPA 1HJOA 3UKRB 4BRQA 3ZX3A 3LDLA 4O8KA 1BOTO 3A5MC 3FR0A 3FE1A 2E1ZA 3A5OC 5AQQA 5KPRA 2ZWHA 1TYQA 3LDQA 3BF3A 3VEWA 2GWJA 4K42A 3EO3A 3SMSA 1NMDA 3FFKB 4DHYA 1TYQB 4BRLA 2ASMA 4FOEA 5AQVA 2IVOA 2E2NA 3VENA 1XC3A 5AQUA 1KAZA 4BRHA 4FWRA 3ZX0A 3HBTA 5AQNA 4MLEA 2H3GX 2NLXA 1P8ZA 1KAXA 1QZ6A 4A62A 2HF4A 4BG8A 5AQHA 1QQNA 1OKJA 2QW9A 1U6ZA 1T6DA 5AQIA 3VEZA 1WOQA 1GLAG 3VEOA 5AQOA 2BTFA 3G25A 2YJEA 4AM6A 5B8HA 1BUPA 4KBOA 3RSEA 1X9JA 3MN6A 3H1QA 3VF4A 4H5RA 2Q2RA 4M63C 4EAHD 3RSEB 3CIPA 2E2OA 4HTLA 2HMPA 3KHYA 1NGCA 3D2FA 1GLFO 4CZHA 1WUAA 5JLFA 1MDUB 4QS8A 3ZEUA 5KQDA 3A0IX 3J8AA 1SQKA 3AY9A 1MWMA 4LC9B 3O80A 4JAXA 1BA1A 4H5NA 2QWLA 1G99A 3C0BA 4NB4A 4BR4A 3VGMA 4BG9A 1KXPA 2P9SA 3CERA 1BDGA 2E2QA 3DXMA 3MN5A 4JHDA 3FZKA 4FWMA 3BEXA 2P9SB 5EVZA 4BRIA 3CJCA 3DXMB 3VF6A 4M7YA 4FWQA 4PKHA 3EZWA 4JHDB 2E1YA 4WQ4C 2J4RA 1X3MA 4H5TA 1HLUA 1GLLO 4K25A 1CZAN 3U9DA 5CE3A 4RWTA 3GOIA 2W40A 4B1YB 4BRDA 3TPQA 3VPZA 3SLCA 3UE5A 2ITMA 3AAQA 3O1BA 5AFUH 5BPNA 4Z94A 3FLCO 4C23A 5KPZA 5BRFA 3UKUA 3CJ9A 1QQOA 5FPMA 3M3ZA 1NM1A 4H0XB 5AZIA 3VF2A 3UKUB 1NGHA 1C0GA 5AZIB 2VYPA 4CJ7A 4EIAA 1T6CA 2IIRA 1RDWX 4RTFD 4BROA 4CZMA 1DEJA 4BR5A 2ASPA 2VCPA 4H03B 1QZ5A 2CH5A 4JD2A 5ELZA 3CQYA 3HZ6A 3QMLA 4JD2B 4BRMA 3UB5A 4FPAA 4CD1A 5I9EB 2GWKA 2QWNA 3A5LC 3FZHA 5KQ8A 4B1UB 1S22A 2Q0RA 1BG3A 3H1VX 1YUWA 2PAVA 1Z6RA 2P9UB 3GE1A 4A2AA 3O6WA 5AQKA 2QWMA 3ZX2A 3F9MA 3VGLA 1HKGA 1V4TA 5AQGA 5EOYA 4B1VA 3M1FA 1DKGD 1HKBA 2QXLA 3GBTA 1BO5O 1R59O 1IG8A 4E1JA 4XH1A 3IMXA 5AQXA 4PL8A 4B1WB 3MMVA 3DXKB 2IVNA 4BR7A 3LL3A 1X3NA 3R9PA 3EN9A 3HM8A 4H0OA 3QFUA 4FWPA 1NGBA 3MK6A 4FPBA 3CJBA 1KAYA 4JN4A 5AZJB 1BA0A 5F0XA 3OHRA 4BRNA 2OANA 5EX5A 4IJNA 3O08A 4YDUC 5AQWA 4ISGA 3JXUA 4A61A 2HF3A 4CZEA 3U9ZA 5JMVA 3CQXA 2D0PA 2FF6A 3KVGA 1H1VA 3R6MA 2FXUA 2WUSA 2HOEA 3CJAA 3GG4A 4NO7A 3H46O 5FPNA 4BRPA 5AQPA 1ESVA 1ZC6A 2QWOA 3D7EO 3LM2A 2CH6A 4XEIA 4BQLA 3WQTA 3IUCA 5AR0A 1TUUA 3DWLA 1NBWA 5F2RA 3VEXA 2YHWA 5AQRA 5LJWA 1NGJA 2FSJA 2I7NA 2E88A 1JCGA 2V52B 3WQUA 3EKSA 4Y0WA 4CBUA 3BUZB 5BN9A 4CBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HPHA 4BY9C 1XNQK 3RWUA 4LFBK 3H6EA 2AA4A 5JLHA 3UIQA 1REVA 2YCHA 4I9LA 2QWPA 2YHYA 3P31A 1QVFM 3J80O 1K8AO 3QIOA 5ADXA 3CHWA 3P39A 3L8BA 1DGKN 1DT9A 1RBUA 4G9ZA 1K6YA 1HRHA 3E1YA 3ZSYA 3A5NC 1IBLK 1ZXOA 2QM1A 1LAVA 3ID8A 5C12A 1Q9YA 4NYFA 3G4SN 4OPJA 3K57A 2A41A 2WONA 1T7PA 1KLMA 5HOOA 3SCXA 5AQJA 5AQZA 3AO3A 3I33A 4JI8K 4O4GA 1GOCA 3NDKA 2NZTA 4CGGA 1Z05A 4CIFA 3SQ2A 5HRSA 4NXMK 1D9DA 4CHQA 3AVBA 4IO9L 4ELTA 4CE9A 4AQYK 4ILHA 1U45A 1NKBA 4E19A 1HPZA 2F4VK 1EWRA 4IG0A 3QLHA 1RT5A 2GBZA 5AQYA 4CZGA 3CJ7A 5LMUK 1VQ6N 4FXDA 3PX6A 1X9WA 4JLHA 1NWKA 1RFQA 3SQ1A 4W5RA 2CGKA 3W3DA 3HL8A 4B9LA 3L6QA 1UWBA 1LV5A 4OJRA 3WNEA 4ILJA 4IO8A 3C6TA 2UUAK 1U2VA 4DR7K 2RN2A 2FSNA 4LSNA 3SPYA 1RDUA 3ZCMA 4RW9A 2BUPA 1EETA 3PSIA 1YVNA 1J53A 1M90O 1YTAA 4K41A 1ASUA 2V51B 2DFHA 3CM6A 3CYMA 1K8KA 1W9HA 1VSHA 5BPMA 3HPOA 4H5VA 2I7PA 2HHSA 3VETA 1RT7A 1Y97A 1WSHA 3H3NO 2VQFK 4V19S 4YFUA 4I6MA 1BL3A 5D3GA 1HQUA 3WT0A 2JWLA 1Q9XA 1FKOA 1GLDG 4IG3A 5ADXH 1RDAA 5BRDA 3QB0A 1FKPA 4YNQA 1RTHA 3RMAA 2HHWA 1NLVA 4C8KA 2FSKA 3V9WA 4FCYA 4Z0UA 1T44A 2W42A 1Y64A 4DV3K 1HYVA 1S5JA 1NJZA 1DTQA 1QQCA 3KK1A 4FWNA 4DV5K 3QO9A 1GOBA 3KZBA 4RW8A 5FPEA 4DTRA 1D4XA 2ZGZA 4AF1A 4WQ5C 1JCEA 1IKVA 4B1XB 1HQEA 3FZMA 5DM7L 4BVOA 3AARA 3L3UA 4BQZA 4FLZA 3L3VA 4ISEA 4WFBL 4DQSA 4PL7A 1LOTB 5HP1A 4B3SK 1HNXK 2E8AA 4CZIA 2RHKA 1VQMN 4JI6K 3SZ2A 1HUXA 1SS6A 5KTQA 3NAEA 1SL2A 1YAGA 3OVNA 2YKNA 4YY3K 3DLLL 4CGJA 4DTOA 4CEZA 3FGUA 3F9KA 2VWBA 3D6RA 4WQ4A 2GEMA 1J6ZA 4H0YB 3I0SA 2QTDA 3ZT0A 4BREA 4O55A 3AO2A 4BRKA 4NCBA 5LY3A 4K43A 4CEOA 3ATUA 2E20A 1NK4A 3THXB 3CCRN 3SJJA 1JCFA 3UKRA 2D0OA 1YVUA 2UYTA 2P9LB 3A2FA 3GDQA 3MXJA 4AHTA 4BVPA 3LZIA 3THWB 3E9OA 1BOTO 3FR0A 3OYNA 1T05A 3NGYA 4DV1K 3OJUA 4CFCA 1TYQA 3LDQA 2G8VA 1WSGA 3EO3A 1TAQA 1NMDA 4K42A 3PX4A 3CF5L 4B9TA 2X74A 1EX4A 5AQVA 2IVOA 1C0MA 1NNEA 2E2NA 3O3HA 4FZXC 2O8BA 4FK4A 2GUIA 1KAZA 4BRHA 4FWRA 4DUZK 1NK0A 4E7LA 3VQPA 1VQ8N 1WB9A 3CFOA 1IKYA 4H8KA 2NLXA 1P8ZA 1SV5A 2UXBK 1QQNA 1ZYQA 2W6KA 3QNNA 2HHQA 5AQIA 3VEOA 4L8RB 1WSEA 4WFNL 3CCVN 5B8HA 4KBOA 3RSEA 3SV4A 3VF4A 4KHWA 3LDSA 4CJ5A 1U49A 3J81O 4W5NA 1OH6A 4NXNK 4HTLA 1TK5A 3PV8A 4W5QA 4WCEL 3SUNA 3DRPA 4C8OA 4BDPA 4CZHA 4JS5A 5JLFA 2HVIA 4I2QA 3D45A 4CHYA 3ZEUA 5KQDA 3J8AA 3Q7CA 4NLBA 4CJUA 3KTQA 3ZLJA 2FBYA 4KH6A 4CEQA 1BA1A 1R0AA 4KB1A 1RTDA 3KJVA 3KK2A 4BWJA 2A1RA 1X1PA 3BEXA 2P9SB 3CJCA 3DXMB 4UQGA 3RMBA 3LWMA 4WE1A 5FRMA 4KHQA 3T7ZA 4B1YB 4BRDA 2R7YA 3VPZA 4OPAA 3AAQA 3PLAA 5BPNA 3O4QA 4JRPA 4KH5A 3FLCO 3UKUA 3M3ZA 1L3VA 1NM1A 5AZIA 2D5RA 4IFEA 1CZBA 1C0GA 3V9XA 3MX2A 3S3OA 1WLJA 1TKZA 2IIRA 1RT2A 4CK3A 2A1SA 4FVUA 2VCPA 1JLCA 1OH8A 3K5OA 5ELZA 4QOZB 4E7HA 1C0UA 5IWAK 5I9EB 1SKRA 3OW2M 2GWKA 3FZHA 1JKHA 3BGRA 2F8SA 4DQIA 2JLEA 2G8IA 4RG8A 1LW0A 1BG3A 4JKHA 1QS4A 3NVKA 1NJYA 1VQ7N 1L3SA 3DYAA 3O6WA 2QWMA 3ZX2A 1WNSA 3F9MA 1XHXA 4B1VA 1NJWA 3GBTA 2BDPA 4F2SA 3D0PA 3SPZA 1IG8A 4E1JA 1U4BA 2HVHA 4CECA 4B1WB 1X9SA 4JKCA 1NMNA 4JI0K 3EN9A 3HM8A 4H0OA 3QFUA 2HBJA 2VGNA 4X64K 3WXMB 1EXQA 2HSTA 4E72A 4FJ8A 4JN4A 4J2EA 1BQNA 2OANA 4DTJA 3S3NA 3DOKA 4ISGA 4GW6A 5J1EA 3TAPA 3B6PA 3CCMN 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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