3CHWA

Complex of dictyostelium discoideum actin with profilin and the last poly-pro of human vasp
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
b'VQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Modulation of actin structure and function by phosphorylation of Tyr-53 and profilin binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major actin
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 117
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3chwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3chwA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3chwA03
3J8AA 2I7NA 4H0XB 3MN9A 3TPQA 5LJWA 2IIRA 3I33A 4CBWA 4BRAA 3CJ7A 2D0PA 4L3QA 4BRPA 4A2AA 1JCGA 4BRQA 2V7ZA 3A8YA 3IMXA 5KPTA 1YXQA 3U4LA 4DQ8A 3BF3A 3VF2A 3CJ9A 3UE5A 2YHYA 3CI5A 3QBWA 2F9WA 1CZAN 1KXPA 1V4SA 1NGEA 2P9PB 4CI6A 1ATNA 3MN7A 3WT0A 4WQ4A 5F0XA 3O08A 3FZMA 1XC3A 4CZEA 4FWLA 4B1ZA 2Q0RA 3VERA 2D4WA 3CIPA 2P9LA 1NGBA 2YJEA 2VCPA 3DXMA 4H5TA 4CBUA 4BR9A 4O5FA 1U6ZA 1U2VB 5F1XA 2KHOA 4Y0WA 4BC2A 3VEWA 2DPNA 3ZETB 2P9NA 3CQXA 2F9TA 5BN8A 4BR0A 4QS7A 2P9SA 4FWPA 4K41A 4LC9B 4WQ4C 3VF4A 1OKJA 3UKRA 2ASOA 3ZX3A 4EHTA 3ZEUA 1JCFA 4H5VA 3A5MC 1NBWA 4B1VA 5AQTA 3GG4A 3SJHA 3HBTA 3H6EA 4H0VB 1GLBG 2VYPA 3W3DA 4B1YB 5KQ8A 4ISEA 5BPMA 3WQTA 1T6CA 1E4GT 1T6DA 5AQLA 3D2FA 5AQZA 2FXUA 4BR7A 4FPBA 5BRHA 3H1QA 1ATRA 3O80A 3WEEA 2A3ZA 3CQYA 3QFUA 1NGHA 3AAPA 3BEXA 5EVZA 3HI0A 5FPNA 3U9ZA 2Q36A 1RGIA 3O5BA 1ESVA 1DGKN 5E84A 2WUSA 4B1UB 1KAXA 2I7PA 3LM2A 1QZ5A 3O8MA 4BRGA 3RSEA 3UKUA 1TUUA 4FPAA 3GDQA 1NLVA 1XQSC 1GLEG 1GLLO 3ID8A 4BRCA 3QB0A 4BREA 1NGCA 1H1VA 3O6WA 4JHDB 4H0OA 2QWNA 4BRKA 4BGBA 1LCUA 1GLJO 2E1YA 1S22A 2P9UB 1HKBA 5AQQA 1MDUB 4H0YB 4FO0A 4CZJA 3FGUA 1TUYA 2V7YA 2CGLA 3H1VX 1SZ2A 3EKUA 3L0QA 4H5RA 5BR9A 4YDUA 5ADXA 1ZBSA 4I6MA 4K25A 3W0LA 2P9KA 2GEMA 5AQPA 4PKHA 4H03B 4FWQA 4XH1A 3VEOA 3VESA 2HOEA 4NB4A 1GLCG 2ZGYA 3TU5A 3DJCA 2QWMA 2EWSA 4K42A 2GTDA 4PKGA 5AQJA 3AY9A 3ATVA 3H3OB 3OHRA 4M63C 2P9IA 3SK3A 5AQFA 1BU6O 5AQSA 5AQOA 4K43A 3KHYA 1K8KA 4BRDA 2ZF5O 3C0BA 1RDWX 4FOIA 1MA9B 1NGDA 4RCHA 2ZWHA 5JLHA 1QHAA 4YDUC 4EIAA 3MDQA 1HX1A 2IVOA 3ULEB 3D7EO 4E1JA 3SMSA 1WOQA 2H3GX 2YJFA 4B9QA 1X9JA 4IZ9A 4XH5A 3GL1A 4BG9A 4BQLA 1GLAG 4PL8A 3O4WA 1GLDG 1HKCA 4BRMA 1BWFO 2A6AA 3LDPA 5BRDA 5E26A 2YHWA 1BA0A 4MO5A 2AP1A 5EOYA 4H0PA 4BRLA 2J4RA 2A42A 3LDLA 1U2VA 2HF4A 3A5LC 4WYBA 5AQMA 1IG8A 3LDNA 4BC3A 2FF3B 2FF6A 3VEYA 4CD1A 5BREA 1NGFA 1ZC6A 5AFUA 4AM7A 2CGJA 2E88A 4IO8A 2ASPA 3QBXA 3JS6A 3EZWA 3QDKA 3EL2A 3CERA 5AZJB 3VGLA 5I9EB 5TKYA 2Q97A 1EQYA 3O1BA 4XEIA 4FOEA 3WXJA 4DCHA 5AZIA 3VOVA 2Q2RA 2QW9A 5LY3A 3R9PA 2HF3A 4BR4A 2Q1NA 3MN5A 3MMVA 2BUPA 4BRIA 3L4IA 3HZ6A 3F9MA 3LDOA 3UKRB 5B8HA 3WQUA 4ISGA 1DKGD 4IWVA 2V51B 2Q0UA 4B1WB 1NGAA 2VWBA 2QWRA 4A62A 4BQZA 3VENA 3BUZB 3LM9A 3DAWA 1YUWA 3ZX0A 3SMPA 4M7YA 1BO5O 4AM6A 3B8AX 3DXKA 3WEEB 3AAQA 4DHYA 4Z94A 2A5XA 3G25A 2NLXA 3FFKB 4BC4A 4M7XA 3ZX2A 5AQNA 1XUPO 1MWKA 2FSNA 3R6MA 5AQXA 5BPLA 4CZFA 3VETA 1C0FA 5FPDA 3UKUB 3HTVA 2IVNA 1WUAA 4XH4A 4BRHA 3CETA 3BF1A 3VGMA 2E2OA 1Y64A 5JMVA 4JD2A 3KZBA 4IJAA 2NRHA 1BUPA 2P9UA 1KAZA 3D2EA 1HJOA 2IVPA 4FWSA 3C7NA 4GNIA 3A5OC 4EAHD 3WXIA 2W41A 3VEZA 2QWQA 4JN4A 4B1XB 2QM1A 1NM1A 2YI1A 2A40A 1QQNA 3QMLA 1ATSA 4MO4A 5BN9A 5FPMA 2ZGZA 1KAYA 3KVGA 2E2QA 3FZKA 1YVNA 4H5WA 2E2PA 1NWKA 4FWRA 2E20A 4MLEA 4RWTA 5AQWA 4BRNA 4JNEA 1NGGA 3FZHA 3LL3A 4FWKA 5KPZA 2E8AA 3MN6A 1NMDA 1T44A 5AQKA 5ELZA 4BROA 4IJNA 2YHXA 3VEXA 1TYQB 2UYTA 4FWNA 4BR5A 4HTLA 2P9KB 3ENOA 1ZXOA 2AA4A 3EO3A 1NGJA 3QICA 5AQVA 3H45C 1X3NA 1MWMA 1P8ZA 5AQRA 3EN9A 2P9PA 3FZLA 1QQOA 4WQ5A 3IUCA 4CD3A 3EKSA 3ULEA 5FPEA 3IFRA 4PL7A 2A41A 1DEJA 2P9IB 3GBTA 3H3NO 1HUXA 1K8KB 3H46O 3O1WA 4FWMA 1IJJA 1GLFO 3MK6A 2FSKA 4A2BA 5CE3A 5KPRA 1S3XA 3VEVA 2QWLA 4CZMA 3U9DA 2CH6A 3QFPA 3CHWA 3UB5A 3ATUA 4JAXA 2P9LB 3ZETA 2V52B 1BDGA 4CZGA 3DXMB 1BA1A 4QS9A 5JICA 1Z6RA 3FE1A 5AQUA 4FL9A 5ADXH 4ISFA 4WQ5C 4IXCA 2PBDA 2P9NB 2Q31A 3L6QA 5EY4A 4BRFA 2QWOA 5BPNA 4NO7A 3LDQA 5AZJA 1SQKA 2P9SB 4A61A 4RTFD 2W40A 3IDHA 3FR0A 4BVOA 4CZLA 2GWJA 2BTFA 4FWOA 2FSJA 3U8XA 3GE1A 3SLCA 3ZEUB 3FZFA 4DB3A 1G99A 3MCPA 2QWPA 2ITMA 2GUPA 1HPMA 3HM8A 4QS8A 3CJ1A 2D1KA 5AZIB 3DWLA 4EFHA 1X3MA 3D2FB 5AR0A 5AQHA 1QZ6A 4H0TB 1YAGA 2GWKA 4MLHA 4H5NA 4CBXA 1BOTO 3BP8A 4GY2B 4EHUA 3M1FA 4FSVA 5AQIA 4CZHA 3ENHA 3WUHA 1V4TA 4PKIA 1HKGA 1RFQA 1LOTB 2OANA 5JLFA 3M3ZA 2FLOA 3S41A 3A5NC 3VGKA 3I8BA 3RSEB 4CJ7A 3DXKB 3JXUA 5AFUH 1R59O 2HMPA 4JHDA 4BVPA 5EXWA 3FLCO 4BC5A 1BG3A 3WXKA 4CZIA 1SAZA 1JCEA 2NZTA 2D0OA 5AQGA 3R8EA 3A0IX 1HLUA 1D4XA 4F9OA 5LJVA 5BRFA 4J8FA 3P4IA 2PAVA 4HWIA 2CH5A 2QXLA 3HSCA 4KBOA 4C23A 4CZKA 3VPZA 5AQYA 1Z05A 2CGKA 3CJCA 1QQMA 2E2NA 5F2RA 4JD2B 1NGIA 5EX5A 5KQDA 3WXLA 3D2EB 3AARA 3C7NB 1C0GA 3M6GA 1Q18A 2ASMA 3CJBA 3CJAA 1J6ZA 3VF6A 4BG8A 2GELA 4O8KA 4BGAA 4I6MB 1E4FT 2YCHA 4BR2A 3GOIA 2E1ZA 1TYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RILA 2IIRA 3S3MA 1N34K 4CBWA 2D0PA 3DLRA 2EHGA 3RR7A 3NAEA 4JI0K 3JAMO 1T8EA 4BRQA 1BCOA 3A8YA 1O1WA 3IMXA 3OYMA 4E0DA 4LF8K 1NK5A 2E4LA 2FBVA 3VF2A 3PIOL 3CG7A 3CI5A 1S9GA 3QERA 4M42A 1ATNA 1VSMA 3ZSXA 4DS4A 3ZSZA 3O08A 4C1NK 3LWMA 4FJGA 4B1ZA 2D4WA 1QSYA 4CEEA 4Z4FA 2F96A 2VCPA 2O8DA 3DXMA 2QK9A 4CBUA 4DKWA 1TK0A 3KD5E 4JI3K 4C8NA 1TK5A 3ZETB 1WSIA 3N4PA 1D8YA 4C8KA 3Q7BA 1HPZA 3L2VA 5BN8A 5M1NA 4DFPA 4DV1K 3G6EN 1FXXA 4K41A 4CJWA 4KB0A 4EHTA 2VGMA 2ATQA 4FLYA 4G1QA 3A5MC 4O55A 3LAMA 3SNNA 3E9OA 3ZCMA 1QSSA 5C12A 1Q82O 2R7YA 3W3DA 3K2PA 3THWA 2WBNA 3R1XA 5AQLA 3NGYA 4KTZA 5EU7A 2G8VA 3CCLN 3QO9A 5BR8K 4CVNE 4BR7A 4FPBA 2O8BB 3AVAA 3THXA 2HHWA 4IOAL 3SAFA 2A1SA 3SI6A 3KIOA 3NGIA 1VQLN 3KTQA 1BI4A 2Z1GA 2Q36A 4ID1A 1VRTA 1RGIA 1ESVA 4B1UB 4CEQA 2PYJA 1KAXA 3M5RA 3O8MA 3UKUA 1S72N 3EY1A 1I39A 3NDKA 1T7PA 4FPAA 1W7AA 1TL3A 4A5BA 1GLLO 1IV0A 2HBKA 3P83D 4BREA 3O6WA 1K8AO 4H0OA 4CGDA 4BACA 4LH4A 2OZSA 1QS4A 3OBYA 4CHPA 5AJ3K 5CYMA 4H4MA 3JYTA 4KPYA 1MDUB 5J1EA 4CIFA 4CZJA 4FLZA 3SJJA 3MXIA 2RE2A 3K9JA 5H1SQ 4KFBA 2F8TA 3QIOA 4JKAA 4I6MA 3W0LA 2P9KA 2IC3A 3VEOA 1ZBIA 3QNNA 3TU5A 1C0MA 4BDZA 1UA1A 3OYJA 4CECA 2EWSA 4CK2A 4K42A 1KSPA 2GTDA 1CLQA 1SS6A 3J7ZO 1S1XA 4IBNA 3CPEA 3OHRA 4OKKA 3C95A 2HBJA 1VQ8N 1RTHA 1X9SA 1BU6O 3CCRN 1T03A 4K43A 4GKKK 5GAGP 3AVNA 4O4GA 1CXQA 4JI2K 4NCAA 4YDUC 4EIAA 3MDQA 1HX1A 3ULEB 3EE9A 2H3GX 2G8FA 1YF5L 4XH5A 3GL1A 4BQLA 4ELVA 5JS2A 4BRMA 2O8EA 3KK2A 1XHXA 4MFBA 3QEPA 3CFPA 4XJXA 4LD0A 4BRLA 3NHGA 1A5WA 1U2VA 4OKEA 4AHCA 3OYLA 5AQMA 4WFAL 3LDNA 2FF3B 4I9LA 1NJWA 4CD1A 1Q81O 1NGFA 3SBTA 1ZC6A 2YHAA 3QBXA 3AVJA 3EZWA 3QDKA 1OH6A 3CERA 3I0SA 5AZJB 4B9SA 3TSQA 1RBUA 3LANA 4FOEA 4DCHA 3VOVA 1VRUA 3R9PA 4BR4A 5GIOA 3SZ2A 3MMVA 3MEDA 1JL1A 2QA4N 3LP2A 1S1UA 1DKGD 1JLFA 1KFSA 3P39A 3VQ5A 4YOXA 3V9UA 2VWBA 2QWRA 3NF6A 3HM9A 4EZ6A 1WSEA 3N4QA 2BANA 4FJNA 1NK6A 3HPGA 3EE8A 3QEWA 4AQYK 2HHTA 3CMAN 2DFEA 1N36K 3KLHA 2KTQA 2NLXA 1NK4A 4CJ5A 3QLHA 3HVRA 3LPUA 1IBKK 5CYQA 4V19S 3AV9A 5AQXA 1J9AA 4CZFA 3EYZA 4HHTA 1WUAA 3THYA 2O8FB 2KKZA 3BF1A 3ZT0A 1O13A 2HHQA 3L3UA 1G15A 2NRHA 2P9UA 3U3YA 1RTDA 3K58A 1KAZA 2IOCA 4FWSA 1BIZA 5FROA 2P1JA 3HPHA 4IFYA 1NM1A 2A40A 2FBXA 5BN9A 2VWKA 4MO4A 4PY5A 1OVQA 2E2QA 1YVNA 5KI6A 3VQDA 2XO7A 1JLBA 2E2PA 4FWRA 4RWTA 5AQWA 4BRNA 2HBLA 4JNEA 3LL3A 5KPZA 4KV8A 2E6MA 1NMDA 1T44A 3NH0A 1JLQA 5ELZA 2OPQA 3S3OA 2YHXA 1TYQB 4GV3A 3O9TA 4HTLA 1XC9A 1ZXOA 4X65K 2X78A 2IAJA 4F8RA 5AQVA 4B9VA 2RN2A 2P9PA 2VG5A 1NK9A 3IUCA 1F21A 4IFEA 3RMAA 2B6AA 4YOUA 3H3NO 1HUXA 1K8KB 4C8LA 4DQPA 3O9QA 4FWMA 1IKXA 3OYDA 2QWLA 2CH6A 1WSHA 2P9LB 1VQPN 1ZBFA 4KTWA 4LSNA 1WB9A 3VQ6A 4PQUA 1BISA 5AQUA 4FL9A 1TKDA 4DTJA 3TAQA 4NCBA 4IXCA 3KLFA 4JEPA 2P9NB 4DV6K 5EY4A 3OJUA 4BRFA 2QWOA 5BPNA 1Q8IA 3P31A 4KB1A 4CZLA 3CPWM 2BTFA 3DRSA 4FWOA 4BE1A 1VQKN 3VA0A 1G99A 1RT5A 3MCPA 3TAFA 2ITMA 2GUPA 1KLMA 3OYIA 3CJ1A 4UQGA 1UAXA 4DV4K 3ZT3A 1HNIA 3D2FB 1I94K 3J7YP 2XHBA 4M3UA 5DMRA 5AQHA 1BGXT 2RHKA 4FCYA 3RMBA 3BP8A 1VK0A 4EHUA 5AQIA 4CIEA 5HL7L 4CFDA 3C6AA 2X6SA 2ZJPL 4C8OA 2JLEA 2OANA 3S41A 2FLOA 4EP5A 3RRHA 3RSEB 5HOOA 1HNZK 3HPOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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