3CIJA

Crystal structure of a. fulgidus periplasmic binding protein moda/wtpa with bound tungstate
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
VKLKVFHAGSLTEPMKAFKRAFEEKHPNVEVQTEAAGSAATIRKVTELGRKADVIATADYTLIQKMMYPEFANWTIMFAKNQIVLAYRNDSRYADEINSQNWYEILKRPDVRFGFSNPNDDPCGYRSLMAIQLAELYYNDPTIFDELVAKNSNLRFSEDNGSYVLRMPSSERIEINKSKIMIRSMEMELIHLVESGELDYFFIYKSVAKQHGFNFVELPVEIDLSSPDYAELYSKVKVVLANGKEVTGKPIVYGITIPKNAENRELAVEFVKLVISEEGQEILRELGQEPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Archaeoglobus fulgidus
publication title Distorted octahedral coordination of tungstate in a subfamily of specific binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UPF0100 protein AF_0094
total genus 103
structure length 291
sequence length 291
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cijA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cijA02
1B7HA 4BDLA 2DE4A 3M3KA 4GD5A 4G68A 4JXIA 3KN7A 1AMFA 2Z22A 3KJ7A 1H76A 5B70A 1DSNA 4DE8A 1SDXA 3KSXA 4OYVA 1EU8A 5H8HB 4EDPA 4BDQA 4XKQA 1FTJA 3DP4A 3CI8A 1IXGA 2UYFA 3V83A 1HSEA 1HSLA 1FQDA 2Z8EA 3CVGA 4KYSA 2XHDA 3EN3A 1SVXB 3QSLA 5DYHA 3K6UA 3ODBA 4HS7A 2YLNA 4IY6A 4QSCA 3KOTA 2Q89A 5H8HA 1NMUA 2DSFA 2H4IA 1N3WA 1FTOA 1MQGA 2DYXA 2X7QA 2YJPA 1LBCA 5J1DA 4F1VA 4C0RA 2Y7RA 4E0WA 3Q25A 2DXRA 2XXRA 2A5TA 3FATA 1NNFA 3IOTA 2QSXA 4RJZA 3RNNA 4YAHX 4OFOA 3A3CA 4DXCA 3N6TA 2HZKA 1ZBMA 3FJ7A 3IOUA 3MVXA 3OSQA 4ZEFA 1NL5A 3MC2A 4RA1A 2XD3A 1Y3NA 4BDOA 4OESA 4TLLB 1UIUA 5H8SA 1H44A 1MXWA 2OLBA 4O3CA 3E9XA 3IO6A 2KLFA 1Q1KA 2I6EA 4KI0E 1F9BA 4AB6A 3GXAA 4R73A 4THIA 4BDRA 1AH5A 3W9WA 2IEEA 1MM6A 3PPOA 4R75A 2H5YA 3T9XB 3TQWA 3TFLA 1QKBA 3B6QA 2Z8FA 3RTWB 4DIGA 4P0IA 3K1PA 5IAIA 2O1LA 4DCYA 2ZYNA 4IB2A 2X26A 3MP8A 4U1OA 1B9JA 4OVJA 2BJJX 3IB0A 2REJA 3K4UA 2XX7A 3QAXA 5I57B 2O7IA 4FAJA 4NF4B 4GL0A 1FQBA 3MAMA 1IITA 3FGSA 1SI1A 1O7TA 3DM0A 4GLIA 5KCJA 3B6WA 3C9HA 4ESXA 2Z8DA 3E13X 1NH8A 3RT8A 2H98A 3SESA 4ZECA 4O3BA 1XS5A 5I57A 4NF4A 4QSDA 1DOTA 1YPNA 5TU0A 4OEVA 2I58A 1MRPA 4X1DA 5F7VA 2XXHA 3UIFA 3R6UA 1Q35A 3SETA 1JNFA 3PMXA 1A54A 2R6GE 2UYEA 2O69A 1H43A 3FASA 3KGCA 1OLCA 5ICQA 3PUYE 5H8NB 3MVZA 4E0XA 3OEKA 3SEXA 4QF9A 2PT2A 3K1NA 2RCAA 2ALUA 2OWSA 1YCJA 2PYYA 2HAUA 4GVOA 1LFGA 1SW2A 3ILTB 1EZOA 1WDNA 1R9LA 3IX1A 3KBRA 4OXVA 2W7YA 3T22A 3I6VA 1H45A 3DELB 5H8NA 2F7BA 1MY3A 3HCQA 4P0GA 4QFLA 3LBSA 4EXKA 3C36A 1LSTA 1MH4A 2P0SA 1B2HA 2AL4A 3M3FA 5CBSA 3GBAA 3QUJA 2R71A 1YAEA 2OWTA 1IXHA 2ONSA 1VFDA 4YB5A 1A7LA 1VSOA 2H25A 3LC8A 4LA9A 3PD8A 4Q5TA 4ELPA 4PETA 1MXZA 3MZBA 4OERA 4U21A 5AA2B 3H7MA 4RPNA 5TPAB 3OO7A 4HCWA 1T0KA 3H6UA 2I48A 3JV9A 4JDFA 1P1QA 3OO8A 3N5LA 1UTHB 3MZ1A 5I2NB 3RPWA 2DWAA 2FA7A 1O63A 1MS7A 3OMBA 4U1ZA 4LQ5A 3C33A 1B40A 2OJTA 4QFNA 2RF1A 1AOVA 3R26A 1B6HA 1SD3A 5FHNA 3VVDA 2XXVA 1JQFA 1GVCA 4LZ5A 4KYDA 5AA2A 1BTJA 1HSJA 5TPAA 1OLAA 3PUWE 5DEXB 2ZYKA 5I59A 5I2NA 4TQUQ 3DP8A 1P1UA 1Y4CA 1D3KA 2Q2CA 3K6XA 1YTVA 4F1YA 4H5GA 3UGWA 1XT8A 1ZTYA 1QKAA 4ELRA 1B05A 3HHFA 2ZYOA 3U92A 3B7DA 3O6GA 4H6DA 4OEUA 1GTKA 1B3LA 2F7CA 4QSEA 3SEYA 1JEUA 3EQ1A 3QYTA 4NWCA 2F78A 4R74A 5KZTA 4I1DA 1GR2A 3SEVA 2XXQA 2HCAA 3FJGA 3E4RA 1J1NA 1A55A 4U2RA 2CMOA 4UACA 4X9TA 3G3GA 3MPLA 4HW8A 1MQHA 2DXYA 4F19A 3IB1A 4WXJA 2VD2A 1FTMA 3C31A 5DTBA 3KOSA 3DLNA 2ZNTA 4F3GA 3OOAA 4LZ7A 3SKPA 4EF2A 4I8CA 3VLUA 4U4SA 1I6BA 2I0BA 3P7IA 1AL3A 1R1NA 3GZGA 3S4UA 4BDNA 1LCFA 3UK4A 3TTNA 5I84A 3GLBA 3VDFA 3CSGA 2ZMBA 4PP0A 1B1XA 1L5TA 5AA2D 1EH3A 1QUKA 2AYSA 2Y7IA 1MXVA 4G8MA 3L6GA 3C35A 1Y1ZA 1B5JA 2O6AA 4DDDA 1ZKBA 4OETA 3C4MA 3U93A 2A5TB 4MH5A 3JYRA 1JW4A 3H03A 4IY5A 5H8FB 2UVIA 2ABHA 5FHOA 2THIA 2LAOA 5HM4B 5EHSA 3FZVA 4LONB 5JK4A 1UQWA 3LSXA 2AL5A 2Y84A 3OEMA 4FIMA 1XVYA 5CBRA 3H4ZA 1BLFA 4IO3A 4ZEIA 1LAHE 4FEDA 1OMPA 4N07A 4Q30B 2V3UA 5H8FA 4O3AA 4ISUA 1DTGA 1PBPA 4ZE9A 4UA8A 3THIA 4OENA 2B3BA 4OWDA 5JTYB 3HSTA 4OZ9A 4RXLA 4XKRA 2CZLA 2F35A 3FV2A 3KJTA 1MG1A 1RKMA 1S9TA 1TFDA 2DP8A 1MQDA 1POTA 4ND9A 3QK6A 1Y3PA 4JSOA 3PUZE 1AIVA 1I6AA 3H6TA 3FUZA 1ELJA 4EQ9A 2XXXA 3IOVA 3S9EA 5K2YA 3D4CA 1NNKA 1O64A 3H6WA 2HAVA 5JTYA 3S9MC 4WEDA 2DVCA 1ZMGA 5L8DA 1MXYA 4XXUA 1M5CA 4R6HA 4ZEKA 5EHMA 2WKYA 4N13A 1IZ1A 3EPEA 4G8NA 1IIWA 3ONMA 5AA4B 4QFPA 5F1QA 3FV1A 1N7XA 3IJXB 2XX9A 2ZNSA 1OQGA 4JWYA 1B4ZA 2I49A 1NH7A 3IAZA 2OZZA 3SERA 2XXUA 3ILUB 3K6VA 5KCJB 1SW5A 1Y3QA 3HHGA 3K2DA 4NF6A 3LUYA 1XC1A 3KSJA 3CFXA 2P1SA 3OO9A 4EF1A 3RY3A 4ZEDA 5AA4A 4FATA 1MPDA 4F3BA 2VP1A 3O9PA 2PVUA 4R6KA 4H8JA 5I58B 4U22A 1RYOA 2UVJA 4R2BA 1D9VA 2UXAA 3U72A 4LUBA 4JBZA 4GQOA 1Y9UA 4GXSB 1US5A 1LAFE 1N0TA 4EUOA 3KN3A 1ATGA 1N76A 2RC8A 3VLWA 1QUIA 5I58A 1B7ZA 4GFRA 4POXA 2NWJA 4ECFA 3OD7A 3QIMA 3EF7A 3TMGA 3QXMA 4LP2B 2Q9TA 1KWHA 4G2ZA 1NKXA 2M8CA 5JEIA 4WEPA 4YMBA 1OVBA 1MY1A 1UIVA 3VFJA 3O66A 4K3FA 4FECA 3T66A 5I56B 3H06B 3T9UA 3RQTA 5FTIA 2GH9A 4G4PA 5L9SA 3CR9A 3MZ9A 4FEBA 4NEDA 4F3SA 2OBGA 5FTHA 4Q0CA 3HPIA 1PB8A 2Q8JA 4HTGA 1P1NA 4QRZA 1PBQA 4IO2A 4PFUA 3O6IA 1QVSA 3T9HB 1USYH 4ZS9A 1FQFA 4KR5A 2G93A 3JZJA 4EXLA 5CMMA 1USYE 3K6WA 5I56A 3A3UA 4RK9A 3ZKKA 1MH3A 3MWBA 4FORA 2F8DA 1R9QA 2DS9A 2QS4A 4LATA 4YKIA 2RKMA 5ITPA 3MUQA 4BDMA 3MP1A 4ZEBA 3RGYA 3UORA 1LFHA 5CM6A 4I9DA 3W9VA 2QS3A 5CRYA 2F6PA 5CMCA 3PPQA 5DVJA 3L6HA 4KYEA 1WVJA 1II5A 3FIRA 3CFLA 4NMYA 1B0HA 1SQYA 4YKJA 1N04A 4DLDA 3KEIA 2NVUB 3BFTA 4YB7A 1NFTA 1B3FA 1JW1A 1B3EA 5I59B 4R9FA 1SBPA 1N3XA 3DP6A 4ZZAA 1P1WA 5A5XB 4R9GA 3F11A 1TT1A 3S9NC 4X1BA 3T9VA 3BKIB 5TP9B 1BP5A 5K2XA 2O84X 3BBRA 1B32A 1SW1A 1ZJLA 5FHMA 4G68C 4PQJA 5AA1A 3PPRA 2ZNUA 3T96B 3PGFA 4KPTA 3K01A 3SEUA 2H99A 4ESWA 3TELA 1B5IA 3HO7A 4ZE8A 4NWDA 1D9YA 3G7WA 3FVNA 5A5XA 3UP9A 1QULA 3O2AA 1IXCA 3TCHA 3FXRA 3ZSFA 5TP9A 2HZLA 3K1MA 3MP6A 3CIJA 4YKPA 1BIYA 5ICTA 2QS2A 5CC2A 4U23A 3CG3A 1JEVA 3EHSA 2FNCA 3U94A 2DWHA 3ECRA 5ELVA 3G3JA 2GHBA 4L17A 2Q2AA 2V93A 2VD3A 2HEUA 4JWXA 1B3HA 1NNPA 3S2VA 1TWYA 1FQAA 4F22A 3O29A 4KCCA 2R9JA 4IGTA 1CE2A 2XXPA 3PPPA 1Z7NE 3H3GA 1ANFA 1IUDA 2D3IA 2D21A 1LCTA 4OHNA 3Q28A 3MVWA 3RTFB 3TZAA 1URDA 3Q26A 4DXBA 2I0CA 3TAJA 3LSWA 1I6QA 3FVOA 5AE4A 5CMBA 1GV8A 3B6TA 1MPBA 2F5XA 1SI0A 3W15C 4FE8A 2NUVA 4H0WA 1D4NA 4IO7A 2I4CA 3M8UA 3CG1A 2P2AA 1JW5A 1DPEA 2DE2A 5CI5A 3VXBA 1URSA 1MPCA 4ELQA 4U4XA 1QW0A 5IKBA 5AA3A 4MBPA 3RN8A 1MXUA 3CRBA 3EHUA 1PDAA 3RT6B 1SYHA 3IORA 4XTCQ 1URGA 2DWJA 2O51A 2QMWA 1UTBB 2HQ0A 3TUSA 1M5DA 3TCFA 4H5FA 1PEBA 2O1MA 2Y7KA 4XIGQ 2RINA 1M5FA 1FTKA 1Y1MA 4YZZA 2RC7A 2NXOA 3N94A 4FJPA 2Y7PA 3O97A 4MF3A 5HBCA 2QRYA 4Q8RA 4WKMA 1SW4A 1JVXA 2V3QA 3SEWA 3IO4A 4R72A 4KQPA 1IQ7A 3PUVE 3PV0E 4OTEA 1UTBA 1R6ZA 1B46A 3D4GA 3WAFA 3FVGA 2YPNA 3O6HA 2B3FA 2ZXTA 4H1XA 3ZKLA 1ZIUA 3FJMA 3PUXE 2QS1A 3I3VA 3PD9A 3TCGA 1NNTA 1LLSA 3FXUA 2Y7WA 4YB6A 5DVFA 3OENA 4KCDA 3I5OA 5BWJA 1LFIA 2G29A 4F18A 3U8QA 1B51A 5LOMA 3G3HA 1SYIA 3K02A 4NE4A 5DT6A 4NF6B 4OFLA 1XVXA 4PFWA 5ISUA 4ELOA 3IR1A 4POWA 4F2OA 3HN0A 3N26A 2DVZA 5H8QB 1EZ9A 1CB6A 3H6VA 2QPQA 3SDFA 3RLFE 4I62A 4M4GA 4TLMB 4QHQA 3MQ9A 2OK2A 1FCKA 1LGBC 2XXIA 3TDJA 3PPNA 1BKAA 3G3KA 1PB7A 1PB9A 2DOJA 1B0LA 4EQBA 3LSFB 2HXWA 2XXWA 3AXFA 4GWOA 5H8QA 3TTLA 4KFQA 1FQCA 4Z0IA 1A8EA 2RC9A 3PU5A 3WAEA 2V25A 4XKNA 3MBPA 2DQVA 3TYHA 2GHAA 5EYFA 3V5AA 4OQOA 1DTZA 4NF5B 3HV1A 4F3PA 4GOTA 4GRKA 1IEJA 1A8FA 3O28A 3USDA 4AB5A 2QL3A 4F2QA 2VGQA 2XXTA 4PFYA 3KFMA 1PC3A 3FXQA 3VVFA 3TPAA 1TXFA 3EHTA 4MFIA 1VE4A 4RK2A 3TTKA 1H3DA 2REGA 3MVYA 4IGRA 3E3KA 2OCUA 3ZS6A 5L9MA 2NOOA 4NF5A 2V84A 1XOCA 3TQLA 3LR1A 3T93B 1JVYA 4DZ1A 1QJMA 2QMXA 2IA4A 1P99A 3MW0A 4RYAA 1Z7ME 1I69A 2F7AA 4AQ4A 4QFKA 5I2KB 4ZDMA 4GL8A 1MQIA 4X48A 4IO6A 2H9BA 4YKKA 3V8XB 5CMKA 1LB8A 2XX8A 5DVIA 3IOWA 1POY1 3R7XA 1TFAA 4KD5A 3OXNA 2VOZA 1B52A 4G8HA 3K0VA 3Q27A 3TKDA 3CFZA 3M3LA 1B1HA 3Q29A 4KHZE 5I2KA 3KN8A 3KZGA 1S50A 3LSLA 1B7UA 1LAXA 4RY1A 2E0SA 4BLAA 4LVQA 1P1OA 4GIZA 1EZPA 3IL1B 1MM7A 4DXUA 1VFEA 4RNSA 1DPPA 2AIXA 1VR5A 2F34A 4H67A 1M5BA 2DWIA 1M5EA 3VXCA 2Q88A 3TTMA 2D5WA 2UVHA 2X7PA 5KDTB 3S9LC 1OIBA 3OO6A 5ITOA 1ZU0A 2VHAA 2XD2A 5L9OA 2F97A 4F29A 1OQHA 1LB9A 4EQ7A 3VVEA 4F39A 2PBWA 3K00A 4XKPA 5M2VA 3OELA 2GRVA 3TTRA 1Y20A 1FTLA 3A09A 1MY2A 2ZYMA 3G3FA 2F6GA 2O68A 1A40A 4LQ2A 5KDTA 2I3WA 4M1VA 4YU0A 3UA8A 4R6YA 1MDP1 1B4HA 1N7WA 1B58A 1IXIA 3UN6A 4YICA 1GGGA 3TODA 4G77A 3KG2A 1QUJA 2B65A 3MPKA 3C34A 3N6UA 4H8IA 4N6PA 3IK6B 1MY0A 2PT1A 3FD3A 3VLVA 3V89B 3MJNA 2PX1A 4P11A 1RYXA 4OFJA 4PE5B 4OMBA 3RUMA 4NF8B 2ESNA 3PMWA 1FQEA 4MLQA 1MY4A 3OSRA 4C1UA 5HPQA 4R2FA 4GXAA 4ONYA 4C1TA 1UTHA 4Z7EA 2V3TA 1N84A 3U1OA 1A99A 3VE1B 1S7YA 2ONKE 3PMVA 2F36A 4F31B 1MXXA 2XXYA 3VV5A 3FVKA 1MQJA 1US4A 4HCYA 3CSBA 4JWOA 2DE3A 1MDQA 2E1SA 1ZLQA 3TEPA 4IO4A 1XHYA 4NF8A 3QUFA 1DMBA 4MLVA 2Z23A 2I4BA 2A5SA 3GBBA 2GFEA 1OVTA 4GF8A 5B7DA 3IB2A 4LZ8A 5DEXA 2PMSA 2O7UA 4NTLA 3C32A 4F1UA 2HFBA 1B5HA 1LBBA 1FW0A 4JB7A 2RCBA 4PFTA 1JETA 2ANJA 2I3VA 1B3GA 4G68B 1WODA 2ONRA 2UVGA 4DCXA 3IJOB 2FYIA 1Y4TA 3BFUA 1LAGE 4YMAA 3G3IA 2QJEA 4IO5A 4TOZA 4QFOA 4ZZEA 5BUUA 4RPOA 4H65A 4JSDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B7HA 4BDLA 2DE4A 3M3KA 4GD5A 4GWSA 4G68A 4JXIA 3KN7A 1AMFA 2Z22A 3KJ7A 1H76A 5B70A 1DSNA 1FPFA 4DE8A 1SDXA 3KSXA 2QVRA 4OYVA 1EU8A 5IGAA 5H8HB 4EDPA 4BDQA 4XKQA 1FTJA 3DP4A 3CI8A 1IXGA 2UYFA 3V83A 1HSEA 1HSLA 1FQDA 2Z8EA 3CVGA 4KYSA 2XHDA 1NV7A 3EN3A 1SVXB 3QSLA 5DYHA 3K6UA 4JVIA 3ODBA 4HS7A 4IY6A 2YLNA 4QSCA 2VT5A 3KOTA 2Q89A 5H8HA 1NMUA 2DSFA 2H4IA 1N3WA 1FTOA 1MQGA 4N81A 2DYXA 2QFLA 1FPBA 2X7QA 2YJPA 3NOHA 1LBCA 5J1DA 2CZIA 4F1VA 4C0RA 2Y7RA 4E0WA 3Q25A 2DXRA 2XXRA 2A5TA 3FATA 1NNFA 3IOTA 2QSXA 4RJZA 3RNNA 4YAHX 4OFOA 1G0IA 3A3CA 2CZKA 4DXCA 3N6TA 2HZKA 1ZBMA 3FJ7A 2XWIA 3IOUA 3MVXA 2VPOA 3OSQA 4ZEFA 1NL5A 3MC2A 4RA1A 2XD3A 1Y3NA 3FXBA 4BDOA 1K9YA 2PCRA 4OESA 5I3SA 4TLLB 1UIUA 5H8SA 1H44A 1MXWA 2OLBA 4O3CA 3E9XA 3IO6A 1FPKA 2KLFA 1Q1KA 3GYYA 2P3VA 2I6EA 1RDXA 4KI0E 1F9BA 4AB6A 3GXAA 4R73A 3CHGA 4THIA 2Y5KA 4BDRA 1AH5A 3W9WA 2IEEA 1MM6A 3PPOA 4GX4A 4R75A 2H5YA 3T9XB 1FPIA 3TQWA 3TFLA 1QKBA 3B6QA 3D1RA 2Z8FA 3RTWB 4DIGA 4P0IA 3K1PA 5IAIA 1EYJA 2O1LA 5EQAA 4DCYA 2ZYNA 4IB2A 2X26A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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