3CIJA

Crystal structure of a. fulgidus periplasmic binding protein moda/wtpa with bound tungstate
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
VKLKVFHAGSLTEPMKAFKRAFEEKHPNVEVQTEAAGSAATIRKVTELGRKADVIATADYTLIQKMMYPEFANWTIMFAKNQIVLAYRNDSRYADEINSQNWYEILKRPDVRFGFSNPNDDPCGYRSLMAIQLAELYYNDPTIFDELVAKNSNLRFSEDNGSYVLRMPSSERIEINKSKIMIRSMEMELIHLVESGELDYFFIYKSVAKQHGFNFVELPVEIDLSSPDYAELYSKVKVVLANGKEVTGKPIVYGITIPKNAENRELAVEFVKLVISEEGQEILRELGQEPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distorted octahedral coordination of tungstate in a subfamily of specific binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Archaeoglobus fulgidus
molecule keywords UPF0100 protein AF_0094
total genus 103
structure length 291
sequence length 291
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cijA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cijA02
1MS7A 5FHOA 1SI1A 4JXIA 4ZEKA 4IY6A 4R72A 3PMXA 4TOZA 3U92A 4IO2A 5AA2A 3TUSA 4DXCA 4FAJA 2QPQA 4JWOA 3MUQA 2X26A 5ISUA 5TU0A 2Q9TA 5AE4A 3TDJA 1QUJA 3FV2A 5I2KB 4N13A 3RGYA 2XXPA 3R7XA 1M5FA 3D4GA 2YLNA 1IXCA 4QFNA 2X7QA 4H5GA 1OVTA 3K4UA 1MG1A 3TTLA 4NF8A 3MP8A 2XXYA 3PD9A 1ZMGA 1Q1KA 4FEDA 2VGQA 4OFLA 3M8UA 3KGCA 4UACA 2P2AA 2CZLA 3ZSFA 3VLVA 1UQWA 2DVCA 1QUIA 1B32A 1B3FA 4OVJA 3ZS6A 3KFMA 4OWDA 1IUDA 3S4UA 4X48A 4F1YA 3U8QA 2Q8JA 2XXRA 1FTOA 2QRYA 4U1ZA 3DLNA 1B46A 1MH3A 2W7YA 4IGTA 4FATA 5ICQA 3CSBA 3S9NC 2ZNTA 3EPEA 5CC2A 5ICTA 4FORA 4NF5A 1DOTA 4ZZEA 2H98A 3O6GA 4LONB 3DP4A 3T66A 3TODA 4PFTA 3G3IA 4YKPA 2F34A 1SVXB 3MC2A 1SYHA 2HXWA 1T0KA 4RY1A 3B6WA 3SDFA 1D9YA 3F11A 3K00A 3G3KA 3MAMA 3TFLA 4C1UA 1BP5A 3VVEA 3T9UA 4OZ9A 4DE8A 3OOAA 1GR2A 3MVXA 3QAXA 3QUFA 3QXMA 1B4ZA 3KG2A 3CVGA 3C4MA 4MH5A 4G77A 1NNKA 3TTNA 4R74A 5DVFA 1A54A 2R9JA 2THIA 4ELPA 4DCYA 4OESA 1JETA 3PPRA 4R2FA 3USDA 1MPDA 3IO6A 1N0TA 4GLIA 5FHNA 4ZECA 1LAGE 4WEPA 4L17A 1XC1A 3TAJA 2OLBA 4R9GA 2HAUA 4R6YA 2RCAA 1MY1A 3RUMA 2Q2AA 1DPPA 2VP1A 3LSFB 1B58A 1N76A 2O7UA 3RQTA 2I3WA 1I69A 3K1NA 2F7CA 1KWHA 3O9PA 5H8QA 3V8XB 2D21A 3DP8A 5H8NB 1B0HA 2G29A 3G7WA 4N07A 3CFZA 4MLVA 1MH4A 2ANJA 3CSGA 1S7YA 3TQWA 4PQJA 3PPQA 2O51A 1SYIA 4E0WA 2OWTA 2Y7KA 3ZKKA 3OO7A 1B7HA 3RN8A 2PMSA 4TLLB 1WODA 3CR9A 1DTZA 3SKPA 1EZ9A 4F19A 4P0GA 4NTLA 3TYHA 3G3JA 4QFKA 4NE4A 5DYHA 3UIFA 1R6ZA 2F78A 2REGA 4C0RA 5CI5A 4EUOA 4IGRA 1MPCA 4P0IA 5AA4A 5KDTB 3IORA 4QF9A 1BIYA 3A3CA 3B6QA 1IXIA 5CRYA 2I4CA 2D3IA 4ZDMA 3HCQA 1OMPA 3TELA 4QFOA 3G3HA 3TMGA 3PMWA 2GRVA 2I0CA 4ZZAA 2REJA 3OENA 1OIBA 5BUUA 2A5TA 5J1DA 3B6TA 4M4GA 2XXUA 4O3BA 5BWJA 2PT2A 2AL5A 1TFAA 1SQYA 1AMFA 3T9HB 3IB2A 1BTJA 5I2NA 4ZE8A 3VLWA 1B4HA 4MBPA 4JWXA 5CMKA 1FCKA 1JW5A 4IO6A 4ELOA 1JW1A 1SW4A 2XXQA 3LUYA 5I56A 4FIMA 5ITOA 3C36A 3VFJA 3SEVA 2NOOA 1S50A 4U4XA 2DQVA 2RC9A 1FQBA 2OJTA 5K2XA 1B5HA 1R9LA 3A09A 4R75A 3N94A 3PUVE 3FXRA 1PB7A 1MY4A 4HCYA 3ECRA 3FV1A 3WAEA 3S9LC 5JTYA 4F1VA 1VE4A 4FECA 5H8FB 4AB6A 3IOWA 4XTCQ 3GBAA 2OZZA 1HSJA 4H5FA 4RK9A 3I3VA 3T22A 1JW4A 1ZBMA 3PU5A 3RPWA 3H6VA 5JEIA 3H03A 1PEBA 4F22A 4ZEFA 3JZJA 5CMMA 3EQ1A 2V3TA 3L6GA 2XXXA 1CB6A 4NF4A 4BDLA 3KBRA 3C31A 4YB5A 2QSXA 2Z8FA 3H4ZA 4LZ8A 2ZYNA 2F97A 4HTGA 2OWSA 2H25A 1MDQA 1B9JA 2HQ0A 4DCXA 4DZ1A 2ONKE 3U93A 4KHZE 2M8CA 3ILUB 2AYSA 3MVZA 3PUZE 4ONYA 5JK4A 4HCWA 4IO4A 2XX7A 3KN8A 4G68B 2WKYA 4OXVA 4Z0IA 1YCJA 3V5AA 2O68A 1Y1MA 3QYTA 3ONMA 1N04A 3IOTA 3PPNA 2Y7IA 5I2KA 1EZOA 3G3GA 2FNCA 2HCAA 1LAXA 3PUWE 2QS2A 4F18A 5L9OA 1Z7NE 2O6AA 3RT8A 3TEPA 1PBPA 3TZAA 1B1HA 2E1SA 1B52A 2O1LA 5EHMA 1A55A 4YAHX 1URGA 3E3KA 1NL5A 3I6VA 3TTKA 1LBCA 5TP9B 3FJGA 4NMYA 1MXVA 5TPAB 2DWAA 2GHAA 3OO6A 4KCCA 4KCDA 3S9MC 1LAFE 4EF2A 4AQ4A 3DM0A 4GOTA 4HS7A 4H8JA 4RJZA 1N3XA 1H43A 2Z23A 3HHGA 2NVUB 1VFDA 4GL0A 2HFBA 4F29A 4U4SA 5DT6A 1EZPA 2UVHA 1SI0A 3KOTA 3BFTA 3JYRA 2O7IA 3T96B 5L8DA 1MXYA 1A99A 1N3WA 3N6TA 1ATGA 1ZU0A 3ZKLA 3OELA 4EQ7A 1XHYA 3C35A 4KPTA 2I6EA 2I3VA 3OO9A 5I84A 3HHFA 2ZXTA 3V89B 1S9TA 2OK2A 1I6BA 4YZZA 4YKIA 2UVIA 2F35A 3CRBA 3IL1B 5ITPA 3FVNA 3SEUA 3RY3A 3Q26A 2FYIA 5F7VA 2Z22A 4TQUQ 1LFHA 1LGBC 1ZTYA 3QSLA 1NNTA 4K3FA 3AXFA 3FJMA 2QS1A 2DYXA 5I59B 1GTKA 3H6TA 4OHNA 3IO4A 1D3KA 3O6IA 1Y3PA 4ECFA 1FQCA 1H45A 4OFOA 3H6WA 4KI0E 5B7DA 3O2AA 1RYOA 3M3KA 3BFUA 4PFUA 5M2VA 3P7IA 2F8DA 2NWJA 3K6XA 3UORA 1UTHA 4MLQA 3KJTA 1RKMA 3GXAA 2DS9A 1PDAA 4EQ9A 3W15C 3FXQA 1ELJA 4GXSB 1LCFA 5H8NA 4F1UA 4QSCA 2UVJA 4GF8A 2O1MA 4G68C 2H5YA 3EN3A 1M5EA 1LSTA 1URSA 1I6AA 4F3PA 2CMOA 5DEXB 2ZNUA 3MQ9A 3HPIA 4GQOA 3SERA 4JWYA 1TXFA 2F7AA 3GBBA 1YAEA 3OD7A 4ZEBA 2F6PA 4RA1A 4ESWA 3TPAA 4F2QA 4H1XA 2B65A 4NF6A 3R6UA 4KQPA 3FZVA 1MXXA 3IB1A 2XHDA 3K6VA 1TWYA 3T93B 2VD2A 5CBRA 1DSNA 1P1NA 3VLUA 5CMBA 3LSWA 1P1UA 1FQDA 5KDTA 5FHMA 4YKKA 1YPNA 2XX9A 2G93A 4I8CA 3RTWB 4GXAA 1MPBA 1M5CA 5HM4B 1AL3A 3O6HA 4OEVA 4DXUA 1MY0A 1JEVA 4G8HA 1UTBB 3FJ7A 1B7ZA 4MFIA 4HW8A 3DELB 3U1OA 1HSEA 4ISUA 3C32A 3K6WA 3K0VA 4R2BA 2Q88A 2XD3A 3L6HA 3HO7A 3W9VA 2ZYOA 4JB7A 1B2HA 1Y1ZA 1VSOA 1CE2A 5KZTA 3KEIA 1ZLQA 4LUBA 4LZ7A 2AL4A 1MXWA 2XD2A 3VVFA 3TCFA 2DP8A 4F3SA 4EXLA 5AA3A 1L5TA 1UIUA 4KD5A 1SBPA 3WAFA 4OMBA 3HV1A 5H8QB 1YTVA 1B1XA 1MRPA 3MZ1A 5H8HB 4OYVA 1ZIUA 3MW0A 1Y3NA 2H99A 3Q29A 4U2RA 5H8FA 5CMCA 1B3HA 4FJPA 3PPOA 1A8FA 2XXIA 2V93A 2B3FA 2Q2CA 2UXAA 1VFEA 2ONRA 1QKAA 2RC7A 4WEDA 4YMAA 3IOVA 3TTMA 1Y20A 3G3FA 3HN0A 3VVDA 3EHUA 3SETA 1EU8A 2OCUA 2P1SA 3FUZA 1A7LA 3IJXB 4FE8A 1US5A 3MP6A 1FTMA 2RC8A 2QS4A 1MQHA 1LB8A 3K02A 3FXUA 1Z7ME 4PETA 5KCJB 2Y84A 3JV9A 3RNNA 2QMXA 2Z8EA 1BKAA 4THIA 3MPKA 1B40A 2I49A 1OLAA 1POY1 4H8IA 4XKRA 3PGFA 4I1DA 1GGGA 4LVQA 3KN7A 4BDRA 5I2NB 1Y4CA 4EF1A 4G68A 3MZBA 3Q27A 5FTIA 1NNFA 1SD3A 1A8EA 2QS3A 3K2DA 4P11A 2NUVA 1M5DA 1MY2A 3LR1A 1DPEA 3CFXA 4Z7EA 2DE3A 4GRKA 2ALUA 3PUXE 1WDNA 3LSXA 1P1OA 5A5XB 3TCHA 2P0SA 3HSTA 3N6UA 4G8MA 3QK6A 2ONSA 4GWOA 3MVYA 4XKPA 5EHSA 1TT1A 3CG3A 4WXJA 3W9WA 1XOCA 4IY5A 3U72A 4O3AA 1LFGA 1O64A 4ESXA 1JEUA 3U94A 2ZYMA 3E9XA 1EH3A 1NH8A 3MP1A 1B7UA 5CM6A 4DIGA 2GH9A 2XXVA 3MZ9A 1LFIA 4RNSA 3VXCA 5TP9A 3FASA 2B3BA 3KOSA 3H7MA 4POXA 5TPAA 4OFJA 1B0LA 5IKBA 4YB6A 4I9DA 2PBWA 2F6GA 1XVYA 3UA8A 1D4NA 3N26A 1RYXA 3S2VA 1OQGA 1JNFA 1B6HA 2Q89A 2QJEA 3THIA 3ILTB 4Q30B 3H3GA 1QW0A 3FATA 3ODBA 4XXUA 4KYSA 2IA4A 3M3LA 2OBGA 3MJNA 1LBBA 4LZ5A 1B51A 4NWCA 1IEJA 2XX8A 5DVIA 3M3FA 1MQIA 2RKMA 1SDXA 3IR1A 3FVKA 4XKNA 1MQJA 3DP6A 4NEDA 2QMWA 4U21A 1P1QA 5I58B 1SW2A 4H65A 2PT1A 1H44A 4R6KA 2QL3A 1O63A 4QHQA 5I57B 4PFWA 4F2OA 1GV8A 1IXHA 3OMBA 3K6UA 1NFTA 4RPOA 4GL8A 5I59A 4N6PA 2DWJA 1NH7A 3IK6B 4OENA 1MXUA 1H76A 4Q0CA 1XT8A 4XKQA 4RXLA 1FW0A 1PB8A 3OSRA 2R6GE 3LSLA 4LA9A 4YMBA 2PVUA 4U1OA 2GFEA 1ANFA 1XS5A 3FIRA 5AA2B 2H9BA 3PMVA 4YKJA 1AOVA 2O84X 3Q28A 3EHSA 2I58A 4GD5A 3N5LA 2H4IA 4IO7A 4R6HA 2UYFA 1JVYA 4OTEA 4QSEA 4U22A 3EHTA 4RYAA 1XVXA 2XXWA 3KJ7A 4I62A 1FTKA 3UK4A 1H3DA 2I4BA 4DXBA 3SEWA 5DEXA 4EQBA 4NF8B 1IZ1A 3UN6A 3BBRA 3RTFB 5CBSA 1IIWA 4GFRA 1QKBA 3MPLA 3FGSA 1US4A 3K01A 3FVGA 1OQHA 1LAHE 1M5BA 4QRZA 1DTGA 3CFLA 2IEEA 1AH5A 2V84A 2FA7A 3Q25A 3VDFA 2DE2A 4BDQA 3OO8A 5K2YA 1R1NA 1N84A 3IB0A 2BJJX 1LB9A 2ZYKA 1FQAA 1AIVA 4Q8RA 1POTA 1USYH 1UTBA 4RK2A 3KSJA 2XXTA 4NF5B 3O28A 1MY3A 4LQ5A 4LQ2A 1DMBA 1O7TA 1ZJLA 4GVOA 4PP0A 2Z8DA 4KFQA 5L9MA 4POWA 3OSQA 1IXGA 4KYDA 3SEXA 2HAVA 1QULA 2UYEA 4ZEIA 3SESA 2VHAA 2DE4A 3KZGA 1B3EA 2ABHA 2DSFA 3UGWA 3IOUA 1UTHB 1P99A 3V83A 4QFLA 2YJPA 3KSXA 2HZLA 2HEUA 4BDNA 1IQ7A 2F36A 1BLFA 1SW5A 4YU0A 3MVWA 1A40A 3I5OA 5H8HA 4NWDA 3D4CA 1JVXA 5ELVA 3MWBA 2PX1A 3K1PA 2VD3A 4QFPA 4PFYA 2D5WA 2V25A 4OETA 1VR5A 1MQGA 1WVJA 4EXKA 4IO5A 4R73A 3T9VA 3C34A 3E13X 5F1QA 1Y4TA 3VXBA 1P1WA 4NF6B 4XIGQ 1NKXA 4YB7A 1N7WA 4QSDA 3FVOA 4EDPA 4H67A 1OVBA 4KYEA 4TLMB 2A5SA 1QUKA 1D9VA 1FTJA 5AA2D 2X7PA 3C9HA 4AB5A 3UP9A 1MM6A 3OEMA 3LC8A 4LATA 2HZKA 1I6QA 3MBPA 4DLDA 1FQEA 5LOMA 1JQFA 1LLSA 4IB2A 3S9EA 3R26A 3LBSA 3C33A 4RPNA 4ZS9A 2YPNA 5KCJA 5EYFA 3T9XB 4G4PA 4JSOA 1N7XA 3KN3A 1PB9A 3H6UA 3OEKA 5FTHA 3PV0E 2XXHA 3TCGA 2Y7RA 1Y9UA 4BDMA 3VV5A 3CI8A 1TFDA 5L9SA 3PPPA 2PYYA 1QVSA 3O29A 2Y7WA 4X1DA 1FQFA 3O97A 3FD3A 2AIXA 5AA4B 2F5XA 1PC3A 4JDFA 2O69A 4OQOA 1ZKBA 2E0SA 1UIVA 4FEBA 5A5XA 5B70A 2VOZA 4G8NA 1NNPA 2A5TB 2RF1A 2V3QA 2ZMBA 3EF7A 4GIZA 4ND9A 5DTBA 1IITA 4X9TA 4ELQA 3TKDA 2KLFA 3GZGA 2UVGA 4ZE9A 1J1NA 4H6DA 2LAOA 3TQLA 4M1VA 4OERA 2DXRA 2DWHA 1LCTA 5HPQA 4C1TA 3QUJA 2R71A 5I56B 1PBQA 1Y3QA 1B3GA 3IAZA 1B05A 3PUYE 3E4RA 1B5JA 4LP2B 4UA8A 4IO3A 4BDOA 4MF3A 4ELRA 3CIJA 2RINA 1MXZA 4F39A 1F9BA 3A3UA 3BKIB 3PD8A 2Y7PA 2V3UA 1OLCA 3RT6B 1II5A 5JTYB 4U23A 4KR5A 1QJMA 2ZNSA 2GHBA 3IJOB 3IX1A 1B3LA 3SEYA 4ZEDA 5IAIA 1B5IA 4WKMA 3TTRA 5HBCA 4H0WA 4F3GA 1FTLA 2RCBA 4PE5B 3RLFE 1GVCA 1SW1A 5AA1A 4R9FA 4G2ZA 1USYE 1NMUA 3O66A 1HSLA 4JBZA 3GLBA 2ESNA 5I58A 1URDA 2NXOA 4O3CA 4YICA 3QIMA 5I57A 3B7DA 2F7BA 5DVJA 2DWIA 3VE1B 3CG1A 4NF4B 1MM7A 1MQDA 3K1MA 1MDP1 1R9QA 4OEUA 4E0XA 5H8SA 4F3BA 4BLAA 1Q35A 4Q5TA 2I48A 2DVZA 4JSDA 4F31B 2I0BA 3H06B 4DDDA 2DOJA 2DXYA 3OXNA 4X1BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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