3CIJA

Crystal structure of a. fulgidus periplasmic binding protein moda/wtpa with bound tungstate
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
VKLKVFHAGSLTEPMKAFKRAFEEKHPNVEVQTEAAGSAATIRKVTELGRKADVIATADYTLIQKMMYPEFANWTIMFAKNQIVLAYRNDSRYADEINSQNWYEILKRPDVRFGFSNPNDDPCGYRSLMAIQLAELYYNDPTIFDELVAKNSNLRFSEDNGSYVLRMPSSERIEINKSKIMIRSMEMELIHLVESGELDYFFIYKSVAKQHGFNFVELPVEIDLSSPDYAELYSKVKVVLANGKEVTGKPIVYGITIPKNAENRELAVEFVKLVISEEGQEILRELGQEPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distorted octahedral coordination of tungstate in a subfamily of specific binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UPF0100 protein AF_0094
source organism Archaeoglobus fulgidus
molecule tags Transport protein
total genus 103
structure length 291
sequence length 291
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cijA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cijA02
1LFIA 2V3QA 5EHMA 3O29A 1P99A 3B7DA 1HSJA 4G8MA 1M5CA 1LBCA 4JB7A 2H4IA 1IZ1A 3C35A 1QKBA 4DXCA 2F78A 1PBQA 4R6KA 3GZGA 3FV2A 4JDFA 4ZEKA 1B7UA 3FVOA 5I2NA 1B05A 3CRBA 4RJZA 1AMFA 1URDA 1LAHE 4X1BA 1O64A 4OFJA 1MG1A 1IUDA 3KFMA 2I0CA 4DZ1A 4ELOA 4NTLA 1B5HA 5CBSA 2QPQA 4NE4A 2XX7A 3PUYE 4IY6A 2F7BA 2D5WA 4HCWA 1LAFE 1FTJA 2RC8A 5FHOA 1GR2A 4QSCA 1SW5A 3S9LC 1OIBA 3MZ1A 3E13X 1H45A 2V84A 3FGSA 3T22A 2Q2AA 3M3LA 5EYFA 2O7IA 2G93A 3CFLA 1IIWA 2UYEA 1UTHA 2I48A 1Y9UA 3S2VA 4OWDA 3IB0A 5I58A 4KPTA 1M5EA 4LZ8A 1JEVA 4FATA 2VOZA 1MPBA 4M1VA 3IOTA 1RYXA 3VFJA 1TFDA 3RY3A 2DVCA 4LA9A 2VD2A 4JWYA 5KCJB 3KGCA 2F7CA 2XXRA 5HBCA 4X48A 3FVKA 3Q28A 4UACA 3PUWE 4ZEFA 2W7YA 3JZJA 5B70A 1ZBMA 2YLNA 4DCYA 4U2RA 1Z7NE 2F36A 5I59B 5H8QB 4I62A 4QFNA 4R74A 1MDP1 2OLBA 1Z7ME 4NF6B 4K3FA 3HHFA 5ICQA 1MS7A 3RQTA 2B3FA 3TTKA 2HZKA 2HQ0A 4E0XA 4KFQA 1WODA 4F18A 3VVDA 4ESWA 3DM0A 1BP5A 3IB1A 4FEBA 3GLBA 4FORA 4BDRA 1FQFA 4EUOA 4WEDA 4F3GA 1HSEA 3DELB 3GBBA 2QSXA 1B0LA 1DMBA 3T96B 1SBPA 3SEVA 2PMSA 1S7YA 5H8HB 1Y1ZA 3FJ7A 1JVXA 2D3IA 2RF1A 4GXAA 3TCHA 1B32A 4ECFA 4O3BA 5CI5A 4EQ7A 3TTNA 1OQHA 1R6ZA 3IJXB 3MP8A 4QFLA 2P1SA 2IEEA 1YTVA 1LGBC 4O3CA 4JSOA 2ONRA 3OELA 2FA7A 3QXMA 4WEPA 1I6AA 4RY1A 4H5FA 1MXXA 2O6AA 3M3FA 1A8FA 1LB8A 2R9JA 1PB7A 3FVGA 4FECA 5F7VA 4R2FA 1RKMA 2Y7WA 1XT8A 3VE1B 1IEJA 1CE2A 2Z8EA 2DS9A 1A99A 5FHNA 3E3KA 3MVXA 3HV1A 3K6WA 3N6TA 3K4UA 1UIUA 2DXYA 1B7HA 3KG2A 3LSWA 4LP2B 2NOOA 1FQEA 1QUIA 2AYSA 4KYSA 1S50A 3QSLA 3B6WA 4PETA 3RGYA 4PFUA 4AQ4A 1VFDA 3M3KA 1JW4A 1N3XA 2ZMBA 3K1NA 4JSDA 3H3GA 2O69A 1P1NA 4DXBA 3IOWA 5I84A 2LAOA 1D9YA 4P0GA 2F6PA 5DVJA 3ILTB 3CSGA 2HEUA 3QYTA 1PB9A 2ONKE 4OEUA 1O63A 4U22A 4JXIA 2FNCA 1I6QA 4PFYA 1JNFA 1LCFA 4PFWA 4KR5A 2FYIA 4I1DA 2QS1A 4NEDA 4XKNA 4EF1A 2XXVA 4YKIA 3H6TA 1EZOA 1OQGA 1IXGA 4KCCA 1MRPA 2B65A 2OK2A 3MBPA 1H43A 4WKMA 2NWJA 1OLCA 5AA4B 5L9OA 1SW1A 4NF5B 4THIA 3MVYA 1FQDA 3OEMA 1II5A 2XXUA 4F2OA 3VLWA 2NUVA 1QUJA 2Z22A 1N7WA 2XXPA 3IR1A 2HCAA 3S4UA 3USDA 1I6BA 3AXFA 5AA1A 2GHBA 1XS5A 3PUZE 1QVSA 4YICA 1P1OA 3LSLA 4HTGA 5H8SA 3G7WA 4RK9A 1PB8A 1NNPA 4QFPA 1Q1KA 3LSFB 3RN8A 2I58A 2I4BA 4GQOA 3TQWA 2RINA 5ITPA 1Y1MA 2I4CA 3QIMA 1MY3A 5KDTB 1ZLQA 1BIYA 4IO2A 4JWXA 4H65A 4NF4A 4XTCQ 2Y7PA 4RPNA 4TOZA 2Z8DA 4U23A 3EN3A 3MQ9A 4JBZA 1P1WA 5A5XB 3KBRA 4ZE9A 2ZNTA 4FIMA 4KHZE 5ICTA 3GBAA 4Q0CA 3IK6B 1B2HA 4H6DA 1MM7A 1XHYA 3LR1A 1OLAA 5EHSA 5K2XA 4IB2A 1N0TA 2B3BA 4RA1A 3JV9A 1B3EA 1B3HA 3U72A 3N5LA 4NWCA 3TODA 4IGTA 3V83A 2HAUA 4EF2A 3ZKKA 1M5BA 3HO7A 3RTFB 1SI1A 4AB6A 2ZYOA 5DTBA 2DSFA 4G68A 1D3KA 1PBPA 1CB6A 1D4NA 1NKXA 3UIFA 4ZDMA 4OFOA 4LVQA 2DE3A 2AIXA 1PC3A 1B40A 4XKRA 4Q30B 4R72A 3FV1A 4Z0IA 4EXKA 1IQ7A 2WKYA 1MXVA 3VVEA 3IJOB 2DYXA 1LFGA 5TPAA 1BTJA 5I56B 3FZVA 1B3LA 2THIA 1JEUA 5HPQA 4ZS9A 2XD3A 3THIA 3UGWA 1R9QA 5AE4A 2REJA 3O66A 1B1HA 3SKPA 4ZZEA 4DLDA 4ZZAA 2A5TA 3L6HA 4GIZA 4Q5TA 4RK2A 4QRZA 1MDQA 2QJEA 4R2BA 4HCYA 3G3JA 3LUYA 3LSXA 4IGRA 3SEXA 1SYHA 5I2NB 3A09A 2ZNUA 4OTEA 4H0WA 4GL0A 2Q9TA 3PU5A 1FCKA 1DSNA 5H8NB 3H4ZA 4ZECA 4FAJA 1YPNA 4YU0A 5JK4A 2OBGA 3CG3A 4MLVA 4G8HA 3CSBA 2I3VA 3FASA 4I9DA 1M5DA 1ATGA 1MH3A 3K1PA 3H6WA 4POXA 1B7ZA 4ZE8A 2P0SA 3BFTA 3LC8A 4RPOA 1B46A 2ZYNA 3ZKLA 2PX1A 1UTHB 4BDOA 2F5XA 4GF8A 4H8JA 3VVFA 4ELPA 4G68C 5I58B 4NF8A 3PV0E 4HS7A 3QUFA 1HSLA 3U93A 4F2QA 1ELJA 2ONSA 1B4ZA 1F9BA 1MM6A 3ODBA 4KI0E 5DEXA 2HFBA 3K2DA 4IY5A 4IO4A 3MZ9A 5CMBA 2QMWA 2X26A 1Y3QA 2XXYA 4EQBA 3FXQA 1LAXA 2DXRA 3KSJA 3TZAA 1NMUA 5CM6A 4QHQA 3VXBA 4U4XA 1VFEA 3IAZA 3OEKA 3OXNA 1P1QA 1FTLA 3Q29A 3PMXA 4ESXA 3DP4A 4YKKA 1MQIA 1P1UA 2VGQA 3KOTA 1B5JA 3G3FA 4JWOA 3PGFA 5KZTA 2X7QA 1S9TA 5I2KA 4L17A 3VXCA 3KEIA 1VR5A 4LQ5A 3TUSA 4U4SA 3TDJA 3VLVA 1SI0A 5CC2A 3ILUB 4C0RA 3MZBA 2H99A 3OO8A 3TELA 3K1MA 2QL3A 5HM4B 4RYAA 2I0BA 3EHUA 3G3GA 3TCFA 2UVIA 2O84X 1VSOA 1MPCA 1TXFA 1GTKA 3OSRA 1QUKA 4RNSA 4LZ7A 4XXUA 5JTYA 1ZMGA 4Q8RA 1MXZA 1UTBA 1XVXA 5AA2A 2ZYMA 4MFIA 4N13A 1DPPA 3PUVE 1EZPA 5J1DA 1B3GA 2Q8JA 1B9JA 2XXTA 3C33A 3TTLA 5DYHA 3EPEA 3QAXA 5ITOA 3TFLA 2R6GE 4U21A 3ONMA 1NH8A 4P0IA 1LB9A 4OERA 1A55A 3OOAA 3SEYA 3RT8A 1OVBA 5TP9A 3K6UA 2V3UA 4N07A 5L8DA 4OENA 4FJPA 3MPLA 1Y3PA 3C32A 5I57A 2UVHA 4R6HA 1QW0A 3UORA 1A7LA 2O7UA 3DP6A 3DLNA 4YB5A 1A8EA 4EQ9A 2XX8A 3O6GA 2ESNA 2QS4A 3IO6A 3TTMA 3IO4A 3JYRA 3ZS6A 4H67A 2UVJA 1DTGA 3OO6A 1Q35A 3BKIB 2XD2A 3R26A 2Q2CA 4YMBA 1FTKA 5FHMA 1ZIUA 2KLFA 5IAIA 4H1XA 1URSA 1US5A 4DE8A 5FTIA 1N04A 4BDLA 1XOCA 5AA2D 2DWIA 5CRYA 4KYDA 5L9MA 2ABHA 1O7TA 1SD3A 3R7XA 2G29A 3O6IA 3K01A 1B4HA 3MPKA 4C1TA 2ZXTA 2GFEA 1TFAA 3D4GA 2REGA 4BLAA 2RCAA 5H8FA 1A40A 4OMBA 1AL3A 4LQ2A 4F39A 3S9MC 4U1OA 1DOTA 3N94A 3SEUA 4NMYA 4BDMA 3VV5A 3FXUA 2VD3A 2D21A 1MXUA 1AIVA 5BUUA 3PPOA 4IO7A 1A54A 1XVYA 4OZ9A 3V5AA 3BBRA 2DOJA 2RC7A 1YCJA 3U8QA 5L9SA 4PE5B 4MLQA 1POY1 4YB6A 2F6GA 2YPNA 3H6VA 1B5IA 3B6QA 4PP0A 1NNFA 1N7XA 2E1SA 4TLLB 5DVFA 1USYE 1J1NA 3RLFE 3U1OA 3P7IA 4KCDA 4OQOA 2AL5A 4FE8A 3CI8A 4G77A 4F1YA 3KSXA 1FTMA 4QFOA 4ELRA 3GXAA 2O51A 2Y7RA 3M8UA 1WVJA 3HSTA 3W9WA 3PMWA 5F1QA 4R9GA 3FJGA 2O68A 2P2AA 1NFTA 1NNKA 2Y84A 2RKMA 4O3AA 4ZEDA 3OMBA 3K0VA 1H76A 4G2ZA 1EH3A 4NF4B 4C1UA 3MUQA 2V93A 1GV8A 5IKBA 4BDNA 1LCTA 3EQ1A 3OD7A 4H8IA 3Q27A 2VP1A 3O28A 3K02A 3FD3A 4AB5A 4GRKA 3HPIA 3H06B 2PYYA 4LATA 4GVOA 4LZ5A 1B52A 1NL5A 4E0WA 2HZLA 2UVGA 4PQJA 4POWA 1QULA 3UN6A 1T0KA 3C31A 3D4CA 2F97A 3C34A 1SVXB 4HW8A 2F35A 3VLUA 4OVJA 2CZLA 5FTHA 3CR9A 3IORA 1JW1A 3EHTA 1MPDA 3V8XB 3RT6B 5H8NA 3PUXE 3C4MA 2ANJA 1TT1A 4G4PA 3HCQA 3TCGA 5KCJA 4G68B 4RXLA 4MH5A 2PVUA 2OZZA 1MQHA 4U1ZA 3MP1A 4ISUA 4GL8A 4ZEBA 2H9BA 1LSTA 2I3WA 5DT6A 3RTWB 2DWAA 5K2YA 1Y3NA 3FVNA 1ZTYA 4OFLA 3RUMA 1Y4CA 2DWHA 3O2AA 1POTA 3SETA 3T9UA 4GXSB 4KD5A 4XKQA 2PT2A 5TPAB 1GGGA 5I59A 3TMGA 3EF7A 3N6UA 5H8QA 4KYEA 1N76A 4EDPA 3A3CA 2OWSA 1ZKBA 4NF6A 2F8DA 3G3IA 3FXRA 2IA4A 3KZGA 5CMKA 4ELQA 3KN3A 1NNTA 3SDFA 3RNNA 1B6HA 1FQBA 3E4RA 2RCBA 1I69A 2XXXA 3FATA 4OYVA 3MC2A 1B0HA 2A5TB 1WDNA 4GD5A 2DE2A 2ALUA 4YKPA 3Q26A 3IL1B 4F29A 4F19A 4UA8A 4R9FA 4WXJA 2UXAA 1AH5A 3CFXA 2Y7KA 4IO3A 4YAHX 4ZEIA 1NH7A 1LAGE 1SDXA 5H8HA 1GVCA 1SW4A 4X1DA 1M5FA 3TAJA 5ISUA 3PPPA 1IXCA 4F3SA 1SW2A 3BFUA 2YJPA 2ZYKA 1N3WA 4OETA 4GWOA 1JVYA 4OEVA 3TKDA 4YKJA 3MVZA 4X9TA 5B7DA 4QFKA 4OHNA 4G8NA 5DVIA 3DP8A 1IITA 3PPNA 4DDDA 3PD8A 3H03A 1KWHA 1N84A 1QJMA 2CMOA 3MW0A 5CMMA 2OWTA 1XC1A 3IX1A 3OENA 3LBSA 3UP9A 1MY4A 4XIGQ 2NVUB 3UA8A 2QS3A 3U94A 1Y20A 4IO5A 3IB2A 2H25A 3E9XA 4MBPA 4NF8B 2I49A 3CG1A 2PT1A 4OXVA 3OO9A 4YB7A 3C9HA 3I3VA 5DEXB 3A3UA 3IOVA 4IO6A 4ND9A 2DP8A 2OJTA 1YAEA 3S9EA 3G3KA 4M4GA 5ELVA 2Z8FA 1DPEA 2H98A 2Y7IA 1D9VA 4I8CA 4QF9A 3K6XA 1B1XA 3PPRA 2PBWA 4F3PA 1SQYA 3MP6A 5I2KB 1ZU0A 2Q89A 2VHAA 1EU8A 2NXOA 3PD9A 3R6UA 3G3HA 3S9NC 1BKAA 3WAFA 3V89B 2HXWA 3N26A 3TQLA 3EHSA 2DWJA 1LLSA 2GH9A 3K00A 3HN0A 2O1MA 2XX9A 2F7AA 4R73A 3O97A 5M2VA 1LFHA 2A5SA 4GOTA 1MH4A 3KOSA 3RPWA 5AA4A 1MY2A 3T9VA 1B3FA 4NF5A 1B51A 3CIJA 3MJNA 2XXWA 1US4A 3MAMA 1Y4TA 4TQUQ 4YMAA 5JTYB 2UYFA 4DCXA 1MY0A 3O6HA 1UTBB 3IOUA 3I5OA 2GHAA 1PEBA 5AA2B 1AOVA 5CBRA 3FIRA 1URGA 2V3TA 1L5TA 5TU0A 4BDQA 3K6VA 4H5GA 1MY1A 4XKPA 5CMCA 3OO7A 2XXHA 4QSEA 1FW0A 3PPQA 1LBBA 4R75A 4F3BA 2DQVA 1TWYA 1EZ9A 2XXQA 4TLMB 2V25A 2I6EA 4ONYA 1MXWA 1R1NA 4LUBA 3KN7A 1BLFA 1FQCA 2BJJX 1MQDA 4YZZA 3SEWA 1PDAA 5TP9B 3QUJA 1SYIA 4EXLA 3TTRA 1B58A 2RC9A 1QKAA 5KDTA 1FTOA 2DE4A 4P11A 2Z23A 5I57B 1MXYA 2OCUA 3CFZA 3ECRA 1H44A 3KJTA 3B6TA 3VDFA 4GLIA 4MF3A 4F1UA 1UIVA 4FEDA 2QMXA 1OMPA 3U92A 4F22A 2R71A 4F1VA 2ZNSA 4PFTA 4F31B 1ZJLA 1DTZA 4N6PA 5A5XA 3FUZA 4NWDA 3L6GA 3OSQA 4DIGA 1MQGA 3T9XB 3SERA 2F34A 3KN8A 3TPAA 3HHGA 1UQWA 3PMVA 1FQAA 2E0SA 4LONB 2DVZA 3TEPA 1ANFA 4GFRA 1JETA 5BWJA 3F11A 4QSDA 2X7PA 3T66A 3H6UA 5LOMA 1MQJA 3T9HB 5H8FB 4Z7EA 3W15C 2QS2A 2GRVA 2H5YA 1OVTA 3CVGA 2QRYA 3T93B 1R9LA 4R6YA 3O9PA 3ZSFA 1JQFA 3FJMA 2O1LA 3H7MA 1JW5A 3C36A 3W9VA 1USYH 3UK4A 3KJ7A 4OESA 4KQPA 2XHDA 3MWBA 4DXUA 2XXIA 3WAEA 2HAVA 3I6VA 2M8CA 1VE4A 5AA3A 5I56A 1IXIA 3SESA 1H3DA 3TYHA 1RYOA 3MVWA 2Q88A 3Q25A 2AL4A 1IXHA 5JEIA 3QK6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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