3CT0A

Crystal and cryoem structural studies of a cell wall degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
MVYVSNKYLTMSEMKVNAQYILNYLSSNGWTKQAICGMLGNMQSESTINPGLWQNLDEGNTSLGFGLVQWTPASNYINWANSQGLPYKNMDSELKRIIWEVNNNAQWINLRDMTFKEYIKSTKTPRELAMIFLASYERPANPNQPERGDQAEYWYKNLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacteriophage phi-29
publication title Crystal and cryoEM structural studies of a cell wall degrading enzyme in the bacteriophage phi29 tail.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Morphogenesis protein 1
total genus 61
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18013 Phage_lysozyme2 Phage tail lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ct0A00
1DPXA 4WLYA 2XBSA 4NG8A 3RT5X 1D6QA 4M6DA 4DWXA 1LHIA 1N4FA 1UBZA 3GXKA 1IWYA 3IJUA 4HTQA 1OUCA 3TMUA 5KJ9A 2BQFA 5FSTA 1CKHA 5HNLA 1WQQA 1JTTL 2MEBA 3LZ2A 1LZ5A 4NEBA 3W6CA 4WM2A 1GB0A 2CWIA 1LAAA 4BS7A 4OWBA 4DD9A 1IY3A 1LSNA 5KXMA 4LYMA 1LMTA 1UIDA 3T36A 1OUEA 4H9FA 4GCBA 2EQLA 194LA 1ZVHL 1LZTA 3D3DA 4G49A 2YDGA 4RLMA 1XGUC 2BLXA 1LJIA 4H9EA 4B0DA 4XJFA 3CT5A 4J0LA 4NGYA 3WW5A 3WVYA 1C08C 4ET9A 4G9SA 3TXKA 1QSWA 1GB3A 2EPEA 3OJPA 4I8SA 4J1AA 4N9RA 4CJ2A 4DD2A 4R0FA 4WM4A 3WH1A 1IO5A 1LZAA 1GBZA 5F9XA 5LYTA 1CKFA 1GFKA 1JJ3A 2ZNXY 5JENB 1QUSA 1JWRA 132LA 1YL0X 5J7CA 5M1YA 1IP4A 3TMVA 1BB4A 4HJYA 4HJVA 4OW1A 4NWEA 3AW6A 4RDSA 5DM9A 4H8ZA 6LYZA 2Z2FA 1GAYA 4ETDA 3GXRA 3TXGA 1GE1A 1D0MA 1KXXA 3WPJA 1LMOA 4ZFPA 1LZRA 4BAPA 4BADA 4ZIXA 1CJ6A 1V7TA 5DN4A 2HEEA 4H92A 4IATA 4II8A 4LT0A 1UIFA 1YILA 5E9RA 3WXUA 1YKZX 2ZILA 1DI4A 1JSFA 1C10A 1MLCE 4H93A 1IP6A 1DQJC 1KIQC 1YANA 2MEAA 1GB6A 4WG1A 3KAMA 2YBNA 1GXXA 1LSFA 2DQAA 2Z12A 1B5UA 4NGZA 2HU1A 1KIRC 1BQLY 5KXNA 2N5ZA 2MEEA 4NGOA 5L9JA 1VDSA 3EMSA 4XJHA 1GE2A 1HSXA 1GAZA 3SP3A 1OUDA 2BAAA 1IP3A 5LVJA 1J1PY 1B7PA 1O23A 4HTKA 3CT0A 1KXYA 2MEHA 1INUA 1HFXA 2F30A 4B4IA 1DKJA 4OWCA 1UUZC 4TSCA 3ULRA 2LHMA 1ZVYB 1IC5Y 1LZYA 3A96A 4D9ZA 1UIGA 1LHMA 3CSRA 1LSYA 1GF7A 3W6FA 1OQMA 4KXIA 1LHKA 2IHLA 2Z2EA 2HTXA 1I1ZA 1LSEA 1LKRA 3TXJA 1HNLA 1B5YA 1DI5A 1HMLA 2BQEA 2G4QA 1PZYA 1CKGA 1LSDA 4ANRA 4X3BA 1JISA 4B49A 1GFUA 1DZBX 1NHEA 5A3EA 3HBHA 4NIJA 3WL2A 4GN3A 1HFZA 1LOZA 2FBDA 3CB7A 1FLUA 1GB2A 2EKSC 3QY4A 4NY5A 4WM6A 1WQMA 2H9KA 4DT3A 2IFFY 2LYOA 5I4XA 1GD6A 1HSWA 4CGEA 4AXTA 1B2KA 1LMCA 3AW7A 3P66A 4HV2A 2ZNWY 1RCMA 5APCA 1GEVA 3ZEKA 1SQ2L 4LGKA 5LA5A 1XGTC 2I6ZA 1B5XA 1HF4A 1FLYA 1B0DA 1JUGA 1KIPC 2F2NA 1LZ4A 1NKHA 4NGKA 1HERA 1YAPA 1HEQA 4HP0A 1XGQC 2W1MA 4J7VA 4KPMA 1GFTA 3TMWA 3P64A 4MR1A 4G4BA 3A8ZA 5KXPA 4DD1A 4WM5A 4LT1A 1LJJA 5C6LA 1BB5A 2BQAA 1TDYA 4H90A 5K7OA 4HJZA 1TCYA 4B4EA 4CHXA 2CGIA 3AZ7A 1REZA 3FE0A 1LJEA 3AGIA 1LTMA 1C43A 1GBXA 2LZTA 3B6LA 1CNSA 2HEFA 4GCEA 1LSZA 1GF5A 4H9HA 5KKIA 5EBHA 4LYCA 4PGJB 5LXWA 1WQOA 1EQEA 1GF4A 1XGPC 5LA8A 4AGAA 2I26L 4W96A 1B7SA 1LYSA 3IJVA 193LA 2EIZC 2BQCA 1ALCA 3M3UA 1XSFA 1IC4Y 4NWHA 3TXHA 1EQ4A 1GBYA 1LJ4A 1UICA 4WO6A 2W1YA 1VDQA 1DI3A 1JKAA 1YAMA 3QE8A 4LFPA 2ZIJA 3G3BB 1B7NA 1JKCA 1ZMYL 4OWAA 3A92A 5A3ZA 1JITA 2C8PA 1F6SA 1QTEA 207LA 4XN6A 4LYOA 1IY4A 5C6IA 5FELA 3CT1A 1GFJA 4UWUA 3HBDA 1JJ0A 1G7LC 1WVVA 1G7JC 4LZTA 5KXKA 4ETAA 4WL7A 2FYCA 5I53A 4ET8A 4YF2A 5B05A 2X0AA 3TXFA 4HPIA 3HBEX 4GLAA 1YQVY 2DQFC 3D9AC 1WQRA 1BHZA 5B07A 1LSMA 1HEMA 2D4KA 2ZYPA 2D4JA 4DD0A 5I4YA 4B1AA 1CKDA 1WTNA 1CJ9A 2YBIA 3AZ6A 4ETEA 1G7IC 1B5VA 5L3HA 2BQOA 2YSSC 1QTKA 1QDRA 2HEBA 4O34A 1RE2A 3AB6A 1IWVA 3WULA 4GN4A 1B7MA 1JIYA 1LZ9A 2D6BA 1GBWA 1GDWA 1F6RA 3MGWA 4GCFA 4YENA 4KT3A 1QDTA 2Y8PA 3E3DA 1QIOA 1EQ5A 1HEOA 1LZGA 1IWZA 4LYZA 1AM7A 2CJLA 1GE3A 1RJCB 5KXRA 1P2CC 1MELL 1BB3A 2YBMA 8LYZA 3A90A 5FDJA 2BLYA 5LIOA 1HFYA 1BWJA 1NWGA 2D91A 4PJ2C 1BVKC 4WG7A 4WM3A 5KY1A 3TXBA 4XADA 1G7HC 3LZTA 3P65A 4WM1A 5B1GA 1BB6A 3WUMA 1VDTA 1D0KA 1IR9A 1VDPA 4IJ4A 3TMXA 1LMNA 4OWHA 4IASA 3HFMY 2DQGY 1UA6Y 1NDGC 1UIAA 3AGHA 3EO5A 4NGIA 4XJDA 4C3WA 4Z41A 4H8XA 5ILFA 1BVXA 1GEZA 3M18B 2DKVA 5LAFA 4W94A 2BQNA 1NQIA 1YKYX 1OUAA 5F9UA 153LA 2HUBA 1GWDA 1W08A 3WYHA 5IELA 1HMKA 1OUGA 2Z37A 4LT3A 4NHTA 1H6MA 3LYZA 1G7MC 1B7LA 2I25L 3CSQA 2YBLA 1UACY 4WLDA 2ZQ3A 2PC2A 1LJ3A 1TEWA 3F6ZA 5FEKA 4E3UA 2BQLA 2BQIA 4ZEEA 3A91A 4DDBA 1GBOA 3A94A 2HU3A 3W6BA 4A7DA 3RNXA 1XEIA 4Z98A 3WW6A 4MSTA 1T3PA 1YAQA 1BWIA 2XBRA 3A6CY 2HEAA 4UWNA 1GFVA 2A7FA 2DQHY 4WLTA 1UC0A 4PHIA 2XJWA 5KKJA 4H8YA 1LCNA 2F4AA 1TBYA 1WQNA 4TWSA 3N9EA 5HQ1A 1LYYA 4N0JA 2HEDA 1IX0A 1GF0A 3P4ZA 2H9JA 4NHQA 1HEPA 1KXWA 1OUIA 1LSCA 4H9CA 1NBZC 4WOAA 3WUNA 5KXSA 5AMYA 1IP2A 1XFPL 4GLVA 6LYTA 5HLLA 1V7SA 3B0IA 2FBBA 4N8ZA 3LYOA 4NHSA 3ZVQB 1GF9A 1D6PA 5LVIA 5APEA 1LZ1A 1IR8A 3RW8A 1VEDA 2YVBA 5LINA 1GFHA 1GFGA 1UIHA 3LYTA 154LA 3OK0A 1C46A 4XENA 3A93A 5LAGA 4DD3A 5C6JA 5LYZA 3WUAA 1LZ8A 1C45A 3EXDA 2AUBA 1FBIX 3P68A 2DBTA 4NSIA 1IORA 5HMJA 4MCKA 3W3EA 3W6AA 3WPLA 4CFOA 5ILCA 4XYYA 4YEOA 1I56A 5KXWA 1IP1A 1LSPA 1GFAA 1IEEA 5B59A 1VATA 3FI7A 2W1XA 4ML7A 1RI8B 4PRUA 2MEFA 2BQHA 1GBSA 5HNCA 1T6VL 2W1LA 1B7QA 3AJNA 2YBJA 1AKIA 1IOCA 4NFVA 1GHLA 1LYZA 1W6ZA 2DQCY 1YIKA 4OOOA 5LVKA 4DDAA 2FYDA 4HPEA 3A3RX 4B4JA 4YM8A 5D5CA 3A3QA 4NHIA 3WXTA 4NSJA 1HELA 2Z39A 4RW2A 1IIZA 1LSBA 4NGJA 7LYZA 2CDSA 1YROA 4LT2A 5LVHA 1JKBA 4DDCA 3W6EA 1PS5A 3B0KA 4Z3MA 1LHJA 1FLQA 4YEMA 4KL7A 1OUHA 3J6KA 3RU5A 4TTDA 5E4PA 3AGGG 1LPIA 4FDYA 1REYA 1YL1X 3N9CA 4OWEA 1GF8A 2DQDY 4N1CC 1IOQA 3IWRA 4TX7A 4ETCA 2BQMA 5DL9A 4P2EA 1GXV2 3CQLA 5APFA 4C5FA 2BQKA 1GDXA 1DKKA 3TXDA 1QSAA 4LFXA 3TXIA 1JPOA 5IHGA 5I54A 1GE0A 3LN2A 4NHPA 4RLNA 4N1EI 3WU9A 4RW1A 1NBYC 2LYMA 2DQEY 1LZNA 3WU7A 4NSHA 1JEFA 1WVUA 4ETBA 1JTPL 1OUJA 1WQPA 4I0CA 5KXXA 1ZV5L 3ATNA 4R6CA 1RFPA 1NF5A 3G3AB 1LMPA 1IWUA 5APDA 208LA 4GCDA 1AT6A 4DD7A 1CKCA 1F0WA 3BKHA 1Z55A 3WMKA 4H91A 1B9OA 4H9IA 3CSZA 1H87A 4FJRA 1IP7A 1GB7A 2XTHA 4XJGA 1XGRC 5LYMA 1IWXA 1OUFA 3BKVA 1DXJA 134LA 2MECA 4LYBA 133LA 1D0LA 3N9AA 4DYGA 2RSCA 1BWHA 5FHWA 5IDDA 3RZ4A 1F10A 4H1PA 4Z46A 5T3FA 1LKSA 5F16A 2BQBA 1CJ7A 3A95A 1I20A 2D4IA 1FKQA 135LA 4LYTA 4XJBA 1LZEA 1WTMA 4WO9A 1GFRA 2C8OA 1CJ8A 1FN5A 1AT5A 1B7RA 3A34A 3EBAB 5HMVA 1BGIA 1NMMA 1UIBA 1LHLA 2Z19A 1JKDA 4QGZA 3TXEA 4CFPA 1GB8A 1LZ6A 2H5ZA 3W6DA 5I5QA 1XEKA 4PRQA 1LJFA 1J1OY 4WL6A 1SLYA 4OOTA 4H94A 4U3XB 1QQYA 1AZFA 1A2YC 2Z18A 4UWVA 1IC7Y 3VWOA 3ATOA 1VFBC 4GN5C 1JSEA 4XJIA 1LSGA 2A7DA 3J4GA 4TSBA 1GB9A 1LHHA 1DPWA 3B72A 1LMQA 2BQDA 1REMA 1UIEA 5L3IA 4G4CA 4GCCA 2MEIA 3B0OA 1LSAA 1GF3A 4EOFA 1OUBA 1GF6A 5B06A 1LYOA 4QY9A 1YAOA 3QNGA 3WU8A 1GPQC 1XEJA 2DQJY 1B7OA 2LZ2A 4HTNA 4NG1A 5DN5A 2NWDX 2Z38A 1LJNA 1EL1A 1OP9B 1YKXX 3LHMA 1LZCA 1JTOL 1BB7A 2G4PA 4HV1A 2WARA 4DC4A 1JJ1A 4NGWA 2VB1A 4N5RA 1B5ZA 1HC0A 2ZQ4A 3WVXA 1GE4A 4HSFA 4WLXA 5D5FA 1IWTA 1D9UA 1FLWA 3AZ5A 4NSGA 5F81A 2ZWBA 2LYZA 1QUTA 1IOSA 4M4OA 1LMAA 1UCOA 3AZ4A 1A4VA 2F4GA 1GFEA 2ZYCA 1HHLA 4QDNA 1LJHA 1IR7A 2Q0MX 5I4WA 2ZIKA 2G4NA 1LJKA 3A67Y 1IVMA 4WMGA 3T6UA 3K3TA 5F14A 1TAYA 2HECA 2DQIY 9LYZA 1B5WA 2BQJA 3LYMA 2BQGA 1LZDA 5KXZA 5FCPA 1HENA 1HEWA 5KXYA 1REXA 1J1XY 2BPUA 3WPKA 2B5ZA 4H9BA 1FDLY 4NGVA 5KXOA 4PPOA 4J1BA 3AYQA 3ZVQA 4BAFA 1FKVA 1LJGA 5II3A 5DLAA 2YBHA 3A6BY 1IWWA 1E8LA 4QEQA 1C7PA 1GB5A 4EMNA 5KXTA 1LZBA 4YOPA 1JHLA 2GV0A 1IOTA 1IP5A 1NDMC 4L41A 2MEDA 4NGLA 5LVGA 5B1FA 2MEGA 5KXLA 4H9AA 4G4HA 1VAUA 1LZSA 4TUNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
253LA 2XBSA 4NG8A 3GXKA 244LA 1IWYA 188LA 164LA 5FSTA 190LA 1LZ5A 4WM2A 166LA 1GB0A 1OV7A 4BS7A 3T36A 1OUEA 3D4SA 4G49A 1XGUC 2BLXA 3HTGA 1D9WA 1L42A 4N9RA 4CJ2A 4R0FA 4WM4A 3WH1A 5LYTA 2ZNXY 168LA 1CV4A 132LA 1IP4A 2HUMA 4I7MA 3AW6A 4RDSA 3CDOA 159LA 1GAYA 4W52A 3GXRA 3WPJA 1LMOA 1LZRA 4BAPA 3DN6A 4IATA 1L36A 4LT0A 1YILA 156LA 1YANA 1SWZA 2YBNA 1GXXA 2N5ZA 1VDSA 3EMSA 2BAAA 1J1PY 1B7PA 4HTKA 3CT0A 2MEHA 2F30A 3ULRA 1C6GA 1GF7A 3W6FA 1C6DA 2IHLA 2Z2EA 2RAYX 1LSEA 231LA 2BQEA 3SN6R 1HMLA 2G4QA 4EKSA 218LA 1DZBX 3WL2A 1LGUA 2FBDA 3QY4A 137LA 1HSWA 1KY0A 1LMCA 1L79A 1RCMA 1CVKA 2F32A 4GRVA 1B5XA 1HF4A 2LZMA 2Z6BA 236LA 3SBAA 2F2NA 1NKHA 1QT4A 4KPMA 109LA 1GFTA 3SB8A 238LA 3P64A 4DD1A 4LT1A 4H90A 1TDYA 2ANVA 4HJZA 2CGIA 1REZA 3AGIA 3C8QA 4GCEA 1LSZA 5EBHA 1WQOA 3DMXA 5LA8A 1G06A 4W96A 1ALCA 2RB1X 2OE9X 1IC4Y 1L99A 1UICA 175LA 2O4WA 1L27A 1JITA 1F6SA 1QTEA 4LYOA 1P2RA 1GFJA 222LA 4UWUA 1G7JC 5KXKA 4ETAA 1CU5A 2X0AA 1HEMA 2D4JA 1CKDA 3AZ6A 1L61A 3LZMA 2BQOA 4W57A 1QTKA 4GN4A 1L77A 1B7MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1DPX A;  4WLY A;  2XBS A;  4NG8 A;  3RT5 X;  1D6Q A;  4M6D A;  4DWX A;  1LHI A;  1N4F A;  1UBZ A;  3GXK A;  1IWY A;  3IJU A;  4HTQ A;  1OUC A;  3TMU A;  5KJ9 A;  2BQF A;  5FST A;  1CKH A;  5HNL A;  1WQQ A;  1JTT L;  2MEB A;  3LZ2 A;  1LZ5 A;  4NEB A;  3W6C A;  4WM2 A;  1GB0 A;  2CWI A;  1LAA A;  4BS7 A;  4OWB A;  4DD9 A;  1IY3 A;  1LSN A;  5KXM A;  4LYM A;  1LMT A;  1UID A;  3T36 A;  1OUE A;  4H9F A;  4GCB A;  2EQL A;  194L A;  1ZVH L;  1LZT A;  3D3D A;  4G49 A;  2YDG A;  4RLM A;  1XGU C;  2BLX A;  1LJI A;  4H9E A;  4B0D A;  4XJF A;  3CT5 A;  4J0L A;  4NGY A;  3WW5 A;  3WVY A;  1C08 C;  4ET9 A;  4G9S A;  3TXK A;  1QSW A;  1GB3 A;  2EPE A;  3OJP A;  4I8S A;  4J1A A;  4N9R A;  4CJ2 A;  4DD2 A;  4R0F A;  4WM4 A;  3WH1 A;  1IO5 A;  1LZA A;  1GBZ A;  5F9X A;  5LYT A;  1CKF A;  1GFK A;  1JJ3 A;  2ZNX Y;  5JEN B;  1QUS A;  1JWR A;  132L A;  1YL0 X;  5J7C A;  5M1Y A;  1IP4 A;  3TMV A;  1BB4 A;  4HJY A;  4HJV A;  4OW1 A;  4NWE A;  3AW6 A;  4RDS A;  5DM9 A;  4H8Z A;  6LYZ A;  2Z2F A;  1GAY A;  4ETD A; 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 3B72 A;  1LMQ A;  2BQD A;  1REM A;  1UIE A;  5L3I A;  4G4C A;  4GCC A;  2MEI A;  3B0O A;  1LSA A;  1GF3 A;  4EOF A;  1OUB A;  1GF6 A;  5B06 A;  1LYO A;  4QY9 A;  1YAO A;  3QNG A;  3WU8 A;  1GPQ C;  1XEJ A;  2DQJ Y;  1B7O A;  2LZ2 A;  4HTN A;  4NG1 A;  5DN5 A;  2NWD X;  2Z38 A;  1LJN A;  1EL1 A;  1OP9 B;  1YKX X;  3LHM A;  1LZC A;  1JTO L;  1BB7 A;  2G4P A;  4HV1 A;  2WAR A;  4DC4 A;  1JJ1 A;  4NGW A;  2VB1 A;  4N5R A;  1B5Z A;  1HC0 A;  2ZQ4 A;  3WVX A;  1GE4 A;  4HSF A;  4WLX A;  5D5F A;  1IWT A;  1D9U A;  1FLW A;  3AZ5 A;  4NSG A;  5F81 A;  2ZWB A;  2LYZ A;  1QUT A;  1IOS A;  4M4O A;  1LMA A;  1UCO A;  3AZ4 A;  1A4V A;  2F4G A;  1GFE A;  2ZYC A;  1HHL A;  4QDN A;  1LJH A;  1IR7 A;  2Q0M X;  5I4W A;  2ZIK A;  2G4N A;  1LJK A;  3A67 Y;  1IVM A;  4WMG A;  3T6U A;  3K3T A;  5F14 A;  1TAY A;  2HEC A;  2DQI Y;  9LYZ A;  1B5W A;  2BQJ A;  3LYM A;  2BQG A;  1LZD A;  5KXZ A;  5FCP A;  1HEN A;  1HEW A;  5KXY A;  1REX A;  1J1X Y;  2BPU A;  3WPK A;  2B5Z A;  4H9B A;  1FDL Y;  4NGV A;  5KXO A;  4PPO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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