3CTFA

Crystal structure of oxidized grx2
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
VSQETVAHVKDLIGQKEVFVAAKTYCPYCKATLSTLFQELNVPKSKALVLELDEMSNGSEIQDALEEISGQKTVPNVYINGKHIGGNSDLETLKKNGKLAEILKPVFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the different activities of yeast Grx1 and Grx2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 36
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2008-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ctfA00
2VCWA 1JFUA 4HZ2A 1SK2A 3LYPA 2VD1A 3BD2A 2YWOA 2DIZA 3TKPA 2LJAA 2GT6A 1GH2A 2JZSA 3LSZA 2I9HA 4K8MA 1A8LA 5DALB 2L5LA 1MD4A 1SL1B 1GSYA 5LCZA 2M80A 2PPTA 5DJMA 4IBPA 2AJQB 3MWHA 1VRSD 4BWQA 2K8SA 3EC3A 3KEBA 1JZWA 1ZCPA 2FNOA 1XBSA 4EKZA 3BCKA 3SWLA 1SD9A 1PL2A 5CREA 5IO0A 2XBQA 2L4CA 3LXTA 4HEA2 1IYIA 3LEFA 4WXTA 1HNAA 1SD8A 2JSYA 5D9VA 12GSA 2X64A 1V57A 3CXGA 1O85A 1EGRA 5CNWA 3EYTA 1XFLA 2DBCA 1N8JA 2LJRA 2WJUA 4KNDA 1QK8A 4MZBA 4ZL7A 2PBJA 4WKWA 3TKSC 5H5QA 3QAVA 4YH2A 3BBYA 1QXHA 2H72A 3E3EA 1TP9A 4NAXA 2BTOT 1HYUA 1FAAA 3TDGA 3FZAA 1TRWA 2VCQA 1W89A 1EEJA 1AW9A 1OAZA 1FOVA 5KEJA 1TJDA 2EIRA 5IMFA 4MK3A 3O76A 4EVMA 1RW1A 2GT5A 2CZ3A 1DBYA 3ISOA 2IIYA 2XBIA 2B7KA 4MH2A 1WMJA 1TW9A 3D4TA 1OC8A 2LJKA 1EP7A 4G2EA 4Q5FA 3ZRDA 1XOAA 1X9SB 4V1Ag 3TJKA 4ML1A 1XWKA 1AUCA 2A2SA 2P0GA 1YKAA 3WGDA 3IK9A 2C8UA 1YDKA 3GFKA 4PNGA 5HFKA 5IMZA 4TVEA 3IAM2 4L0UA 3F8UA 2E0QA 3A2WA 4V2NA 5EVOA 1GSFA 5INYA 2HFDA 4NV5A 5JWOB 4TR4A 2GGTA 1WP0A 3UEMA 1SJZA 2M46A 2PUKC 1SYXA 2R6KA 3A5WA 1J0FA 4WF4A 5A5KA 1ERUA 2B6MA 1TK8B 1T1VA 5F8BA 1Y25A 2P31A 2P5RA 1UVZA 5KN1A 5A4WA 1G6YA 1KBNA 3I9V2 5L71A 3EVIA 1UA5A 1JZOA 4I2UA 5IM9A 1ERVA 1BG5A 4GF0A 1PD21 4AJ7A 1QFNA 4ZL8A 2VL2C 4K2DA 1VGLA 5GAPD 3FZ9A 1PKZA 3FR6A 1UN2A 5ECOB 4PUAA 1B9XC 1HQOA 1CQHA 1TI1A 2MBTA 5AN1A 1B48A 4QL9A 1YZXA 4QQ7A 1EP8A 5ECKB 2AHEA 2L59A 1Z7RA 4KUNA 1Z6NA 2WGRA 2LUSA 2C0DA 2R2JA 4TN8A 1GL8A 4GQCA 4MJEA 1EOGA 3GIXA 2GQMA 1ZOFA 4EXJA 2YANA 2M72A 3OR5A 1QMVA 3TOTA 1BEDA 2O87A 3RHCA 1GP1A 5F07A 3CRTA 3BJ5A 3I43A 3ZYWA 4IP6A 2GQKA 4N30A 1B4PA 2R4VA 3HZ8A 3GSSA 4XRAA 4CDOA 4POKA 2MBSA 2DLXA 2YN1A 6GSUA 3HJPA 2H75A 4Q5NA 2YWIA 2IMKA 4PGTA 3HVVA 3ZFLA 1GTUA 1YJ6A 3D4MA 4YQUA 1H75A 2VCZA 4HDEA 2I1UA 1Q98A 2WFCA 1OE8A 3DXBA 3PH9A 5LNKe 2DMLA 5ECRB 4K0NA 3H8QA 4TR0A 3HYPA 3F63A 2ZCTA 3GKXA 5ECQB 5FWGA 1TI3A 3TB2A 2NVLA 1PX7A 4ZL9A 3M1GA 3FEUA 1V2AA 2L57A 2KOKA 5IMVA 5B6MA 1S3AA 3KM6A 1T4ZA 4J57E 3C1RA 4KDXA 2RM6A 1O81A 3G7IA 1MTCA 5GZZB 3FZ5A 2EIOA 2K8VA 2C4JA 2CZ2A 4MMMA 4BVYA 3DRNA 1SL0B 3ZTLA 2YJ7A 4JR4A 4P3YB 1XPVA 20GSA 2LTKA 4ISDA 4AGSA 2JL4A 2C3QA 4KX4A 2HSHA 4TR1A 1KEBA 2WZ9A 2ON7A 3CSHA 3TJFA 2I4AA 3GH6A 3D5JA 1THOA 3I6AA 3APQA 3J7Yb 2ON5A 1OVNA 2VCVA 4E8HA 1OKDA 5J41A 5ECIB 3ZVJA 3H93A 3FR9A 2C3TA 2HYXA 2V6OA 4V2MA 3GX0A 1K0NA 3GL3A 2E7PA 3KMNA 3DYRA 1YF1A 4HU7A 4OD7A 3F6FA 2CAQA 3BCIA 4TR3A 4POMA 1FB6A 2OACA 2VIMA 2H1GA 3D6IA 3F6DA 3EINA 1LJRA 1WJKA 2YV9A 2AB6A 3EURA 4GRFA 1K0CA 3CTGA 1JZRA 2GZPA 4DSQA 4GSNA 3C7MA 5EY6A 2DJ0A 3QCPA 2ZNMA 1X5DA 4F9ZA 4FH8A 3IAS2 2QC7A 2IMIA 4FYBA 1BJXA 2AV4A 1B4QA 2WCIA 1VF4A 3EU4A 4FYUA 1JHBA 1G6WA 2DMMA 2LSTA 1R26A 4YQVA 3HY2A 3KP9A 4WF5A 3W8JA 5AGYA 2J9HA 3HHVA 2YWMA 3L9VA 1X9MB 2HNLA 2OBIA 4YAPA 1K3LA 2HLSA 4D73B 1T4YA 3G7JA 5H5SA 13GSA 2PU9C 11GSA 5HFIA 5D96A 3N9JA 1QGVA 1SKRB 2O8VB 2B7JA 3US3A 1G7EA 3VWVA 4KSOA 3I69A 3C8EA 3TJJA 4FIWA 1EV4A 3ERGA 4OFMA 2R37A 4X0XA 1F9MA 2VCTA 1J08A 4OFTA 3GKNA 3TGZA 3DVXA 5CRWA 4BL7A 5IOWA 1TU7A 6GSYA 3MSZA 4EDZA 2H19A 4I5QA 3UOMA 1K3YA 3AY8A 1T7PB 4IQ1A 3Q19A 5ECNB 1I9DA 5DAKA 1A0FA 2NTOA 1WRYA 5G1LA 2IWTA 3TRPA 3LWAA 3UVHA 2L5OA 3KTBA 4GXZA 1HD2A 1F3BA 4O32A 3TOUA 2FGXA 1AC1A 1AQWA 5D8IA 3F4SA 3CSJA 3IA1A 5DQSA 5ID2B 3UBKA 3P2AA 16GSA 1TDIA 1ERTA 4F82A 2KP2A 3HA9A 1OC9B 1T8EB 4EL1A 2GSSA 2HE3A 4KH7A 2F8FA 2HZEB 3IRAA 2C0EA 4OCEA 2OA7A 4XS4B 2F51A 1GSUA 4GWRA 2FY6A 3TKSA 4KW6A 4OCFA 1H4OA 3EWLA 3IHQA 2TRCP 3IC4A 1R5PA 2LV3A 1IYHA 4YAVA 1FW1A 4O7HA 5ECSA 5HR1A 2VM1A 1PX6A 4TR1B 1A0RP 3ZREA 2HXKA 1ZYQB 3CRUA 2DJ3A 3E0UA 4HJ2A 4O5RA 3WT1A 1GLPA 2HT9A 1EEMA 1MD3A 1X0RA 2I3YA 2O85A 4L0WA 3GHAA 3RPNA 1FHEA 1NM3A 2ES7A 3L9UA 1OKTA 3LORA 3E9JB 6GSSA 3EU3A 5IIZA 1A2LA 3K8NA 4IKHA 1K0DA 1QUWA 3LFLA 3R2QA 3KXOA 1U6TA 1NW2A 1NHOA 1GSSA 1EWXA 1GTBA 4OFNA 4L8EA 4MA9A 3U5RE 3WT2A 3KMOA 1ACVA 2H76A 1RK4A 2CX3A 4YQMA 1QQ2A 2RIIA 4AF2A 1TTZA 4N10A 4K1FA 1PGTA 2OADA 4MPFA 2H66A 4J56E 1M9AA 4OWYA 4GLTA 4HJMA 3D0ZA 2EC4A 1A2MA 1ZYEA 2VL3A 2AUVA 1AXDA 2IMEA 3UL3A 2DIYA 2DSAA 5DQYA 5ENUA 3Q74A 1GWCA 4IELA 2H70A 3GL5A 1JLWA 4KDUA 3VI7A 4IGJA 3LGCA 1EZKA 2LKUA 5F05A 1B8XA 1YKCA 4F0BA 2CAIA 3KH7A 3VLNA 2VL2A 5JCGA 3VPTA 4XS1A 2X8CA 2I81A 2H73A 5HR0A 4ZIJA 1XVQA 3EMXA 3KD0A 2B3SA 2GSQA 1Z3EA 2A4VA 3GKKA 2REMA 2NPBA 4TXOA 3WD6A 3D22A 1W4VA 19GSA 1YQ1A 3ZFBA 1SK0A 2C3NA 3QDNA 2H71A 3HD5A 1MDKA 3MDKA 3GURA 2O7KA 2OJLA 3VI5A 3C1SA 1K0OA 4DSSA 3QR6A 1AQVA 3GKMA 1EGOA 2G2QA 4IJ3A 3S9FA 5D9TA 1VF3A 2V1MA 1O73A 2KP1A 1K0MA 2GTUA 2C80A 2YV7A 2IFQB 4G10A 3WYWA 2LNTA 2C0GA 3F4RA 5F06A 5EL8A 1UC7A 1C72A 2GDRA 2TIRA 5DAKB 3M0FA 5CO3A 5KN3A 1K3OA 5J9CA 4PURA 5D9WA 4JE1A 1F37A 2NBSA 3GNJA 1WIKA 1XVWA 1OE7A 4HZ4A 4HUAA 1JZDA 3UARA 4BWSA 4KE3A 1U3IA 1Z9HA 2HRNA 4LMVA 4WEYA 2R3XA 4IHUA 2GLRA 5JCWA 3HXSA 3NOFA 3FYGA 5D93A 1XWAA 1LBKA 4QL7A 3PR8A 2XC2A 3LG6A 1R5AA 2VOCA 4RUVA 4IW9A 2FWFA 2L6DA 5B7CA 2PVOC 3IE3A 3H79A 1GULA 3DVWA 3G7YA 5ECMB 4ECJA 4MZCA 4DEJA 5E59A 2PGTA 4K7OA 1ZZYA 3W8SA 2LQOA 1XWGA 2FLSA 4Q5RA 3VPQA 4XS6A 2GQLA 4WR4A 3A2VA 4XCSA 1ZL9A 1USBA 1X9WB 1TOFA 3RAZA 1XZOA 2H0HA 4K6XA 3N5OA 3UMAA 1YF0A 3KH9A 1F6MC 4LA1A 3QFBC 2JACA 4BVXA 5J4UA 10GSA 1BX9A 2H6ZA 3TRQA 5JWQB 1ZGNA 2R5GA 2LRTA 5DALA 3APOA 3H1NA 5C00A 1S3CA 1FVKA 4WR5A 2GS3A 2YOIA 1GSDA 3CSIA 4GTUA 2H6XA 5G31A 2LQQA 2GSRA 4FYCA 2DJJA 2V41A 4XRDA 2RUEA 3M8NA 4ID0A 5AISA 2OBKA 1WWJA 3GSTA 3CMIA 4ACSA 4JU5A 1XW9A 4ZBAA 4ZB9A 4HS1A 3IV4A 3RPPA 3LQ7A 2CQ9A 3IR4A 22GSA 2V32A 3ZIVA 2RUFA 5G2ZA 4IP1A 4KCEA 4MABA 4EO3A 2B1KA 1FB0A 5AIVA 3G9BA 2PVQA 2XPEA 2BJXA 1WE0A 4JBBA 2B5XA 3HKRA 1CQGA 1TK0B 5G5FA 4EUYA 4CW9A 1VF2A 5D9XA 1U3AA 1YEPA 4AJ8A 1Z5YE 4ZILA 3D21A 3QOUA 3ME7A 3TRXA 4MCUA 4DSSB 4DSRA 2L4QA 1GSEA 3A3TA 2RLIA 4IQAA 3IOSA 3MAKA 5E4WA 2HZFA 2B5YA 1SJIA 3L0HA 3JCML 4HOJA 4MDCA 2H74A 2LNSA 2X8HA 2MYGA 2G0FA 3TJGA 3FHKA 3HVXA 2H1DA 1AQXA 1FVJA 3SBCA 2VLUA 4ULXA 1LU4A 3FY7A 2E2MA 3KIJA 2K18A 2K6VA 1XWCA 2C1YA 4NHZA 1ILOA 1MDJA 9GSSA 4X43A 3GA4A 1T3BA 2XPDA 1EOHA 1M99A 3TKQA 1HNBA 1N2AA 3A2XA 1JLVA 2L6CA 1TXXA 2IJYA 4K0GA 5LD0A 2TRXA 4ZBBA 4TKYA 3ZIJA 1X5EA 4NV2A 2VUPA 3ZMLA 4I8BA 18GSA 1MDIA 3TKRA 3P8WA 2WDUA 1PA3A 3C73A 1ZMAA 1BAYA 3ZITA 1V9WA 1A8YA 1O8WA 5IPGA 2NDOA 4IN0A 2X99A 1DE1A 5IOXA 6GSXA 4PQHA 4I6XA 4OMVA 4BA7A 3QD9A 4OO5A 3Q18A 3RDWA 4MJBA 3FR3A 4KSMA 1KNGA 5FT3A 3DD3A 3VK9A 4POBA 1M2DA 2VO4A 1S3DA 2DJ1A 2MMZA 1URMA 3FRCA 2LRNA 2FA8A 2WULA 4KB3A 1SL2B 3TJBA 3FW2A 4V1Ap 2YPMA 3DEXA 1OYJA 2OKAA 2RM5A 1DSBA 2YNXA 4GQFA 3FZ4A 2MZCA 3FKFA 2MMAA 2V2GA 3GRXA 2IMDA 5HR2A 5KN0A 2IN3A 3DMLA 3QAWA 4TOPA 3TCOA 3F3QA 1ABAA 1PSQA 5GSTA 4NHWA 4GCIA 1BYEA 1TU8A 1ML6A 1KTEA 2GZYA 1I5GA 2H6YA 5J9BA 1GUKA 4MP4A 3QFAC 1PN9A 4RQRA 7GSSA 2GZZA 1TKDB 2KHPA 2FCHA 1SYRA 5DCGA 3GUSA 4HQSA 1SENA 17GSA 2H30A 4PNFA 2FWGA 5KN2A 1U88A 2CVDA 1G0TA 3GV1A 3LYKA 2MMOA 1FO5A 1XWBA 2A2RA 2LRCA 3VURA 2IL3A 3UVTA 3LJRA 3U6VA 1AIUA 1M2BA 3WGXA 1O7UA 3RBTA 4IS0A 2K9FA 4JEDA 2VL9A 1XW5A 3KJYA 2PN8A 4ILFA 3PGTA 5ECHB 1AAZA 1GNWA 2KLXA 1SU9A 2FA4A 5CYYA 3HJOA 2YWNA 3UJ1A 2O89A 3H4KA 1OC3A 4N0VA 3W6GA 2JU5A 5IQYA 3MNGA 3J7Yk 2ALBA 4LLRA 4K7IA 2AYTA 2YZUA 5CRGA 5F0GA 2JADA 5HFGA 4RI6A 2VLVA 1GSQA 3L4NA 3NZNA 2X8GA 3DIEA 2Z9SA 3GTUA 6GSWA 3ZL5A 1K0BA 4K7NA 4DVCA 4MF5A 4XTSA 3IBHA 5EPFA 2CX4A 4MH3A 3APSA 1V40A 5CRHA 2QKEA 2WS2A 4H86A 3GN3A 4OO4A 3ZMKA 5B6NA 3TUEA 4TXVA 4IJIA 8GSSA 4IVFA 5ECLB 4PQ1A 4K9ZA 2FUG2 4X1UA 4NXIA 4WETA 2HSYA 1XIYA 4L5LA 2H0GA 2KUCA 4MF6A 4D73A 2DJKA 2YCDA 4WBRD 2JZRA 2CV4A 1ST9A 5A4UA 1TRVA 1BQ7A 3KZQA 4V2LA 4BPYA 4KGIA 4MPGA 5JWRB 5G30A 3FK8A 3EE2A 1Z6MA 4MF7A 2YJHA 1XOBA 1A24A 1FG4A 1XXUA 4NWYA 3ERFA 3PINA 3QPMA 4POLA 3BOAA 5IO2A 4F03A 1V98A 4EC0A 4F2IA 5DCHA 1E2YA 2VM2A 1MEKA 1ERWA 2CA8A 2OE0A 2DC5A 4ZBDA 2PMTA 4KA0A 4LL4B 2VAFA 5GAND 4RQXA 2JSZA 4ZB8A 2QSIA 5A4VA 2V6KA 4I97A 4TW5A 1A2JA 3DWVA 3IDVA 3TKSE 4JR6A 4EE0A 3F4TA 1T00A 1YY7A 4Z7XA 4HQZA 2YP6A 5AIXA 4MZWA 3GMFA 5ID2A 3QAGA 3L78A 3VFIA 2OE1A 2FWHA 3M9JA 4GSTA 2DJ2A 2H1BA 4N11A 3ZVJD 1PRXA 4CHSA 14GSA 1GTAA 1OC9A 1SKWB 2P5QA 2HZEA 5CRDA 4XS4A 4G9HA 1HNCA 3KCMA 1TRSA 3HZ4A 3ME8A 4FO5A 5ECPB 3IXRA 3IK7A 4JRRA 5ELGA 2H0IA 4MLYA 3M3MA 5J3RA 3F3RA 5CP1A 5IMAA 3O3TA 1NSWA 2CT6A 3HCZA 4G19A 5JCUA 6GSTA 3ZLPA 3L9SA 5C04A 2H1AA 1EV9A 4LMWA 2LS5A 5DVBA 3KTLA 5B8AA 3M9KA 2GSTA 1DE2A 3HJMA 2QGVA 1Y6EA 3VWUA 4ECCA 3VWXA 3F9UA 4NMUA 4PXOA 2B5EA 2VLTA 4O92A 5IPHA 4HI7A 1SJ6A 4TRXA 2HRFA 4ECBA 2F3MA 1WOUA 5FHIA 2D2ZA 1V58A 2VD0A 1U87A 4WBJA 4EDYA 4EF0A 1TRUA 5B8BA 1DUGA 2FHEA 1M2AA 5ABRA 4J2FA 3KP8A 3ZZXA 5G1KA 4RI7A 4TXOB 5DJLA 1GUHA 1F2EA 1A23A 4L5OA 3LXZA 4ZB6A 2N5FA 2F8AA 2IMFA 1PMTA 1M7TA 3RHBA 1XW6A 1G7OA 5H5RA 2H01A 2B1LA 1Z7PA 1K0AA 3GTUB 3Q6OA 3O6TA 1PL1A 4LL1B 1O6JA 4HU9A 3GX8A 2XHFA 2VCXA 1O8XA 4XHMA 3HDCA 2FD3A 4ZXGA 4GSSA 3V1WA 4XIHA 3ED3A 2H8LA 1THXA 1R7HA 2ZUPA 1M0UA 3UIWA 2N5AA 4NPBA 3UAPA 1PQNA 5DDLA 1YEXA 3P7XA 2YZHA 1ON4A 2PERA 2PWJA 5D73A 2MMNA 1GTIA 1GNEA 1VF1A 2C0FA 3ERWA 1R4WA 4PUFC 1SK1A 3DKSA 4PX1A 1Q4JA 2AAWA 2F9SA 1RQMA 1SKSB 2CVBA 3EMPA 4N0ZA 2E2GA 3CBUA 5G5EA 5GSSA 5HR3A 5DBQA 1GLQA 4Q5QA 2BMXA 2WRTA 5IMCA 5HQPA 2LEGA 5ELAA 3GH9A 1WPIA 3HVSA 3DGQA 2OE3A 1E6BA 2JZTA 4KCAA 1M9BA 5COHA 4PQIA 3CYNA 1TK5B 3KGKA 1PKWA 1XCCA 3GYKA 1F3AA 2IFQA 4AJ6A 3IPZA 4JZQA 4ML6A 2GVPA 4MJAA 1B9YC 2IPAA 4KDYA 4I2TA 3F0IA 6GSVA 4F0CA 1GUMA 3C71A 1NHYA 1J9BA 2J23A 2WB9A 3UBLA 2EIQA 3WGEA 5CAXA 3CTFA 2FWEA 2CVKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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