3CTGA

Crystal structure of reduced glutaredoxin 2
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
VSQETVAHVKDLIGQKEVFVAAKTYCPYCKATLSTLFQELNVPKSKALVLELDEMSNGSEIQDALEEISGQKTVPNVYINGKHIGGNSDLETLKKNGKLAEILKPVFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structural basis for the different activities of yeast Grx1 and Grx2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-2
total genus 40
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2008-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ctgA00
1QQ2A 5J3RA 4PXOA 9GSSA 11GSA 2H0GA 1YZXA 2C0GA 4G2EA 4IVFA 1GUHA 2AV4A 2PMTA 3EWLA 3A2WA 4DVCA 4RUVA 2AJQB 1GSQA 5ELAA 2L4QA 2PUKC 2YZUA 3D21A 5IOWA 2GZZA 1VF3A 5LNKe 4BVXA 2FNOA 1K3LA 2PVOC 2PPTA 2LV3A 4LL1B 2E0QA 1WPIA 2LRNA 2VL3A 3DD3A 1S3CA 3FKFA 5GAPD 1U6TA 4TR0A 1EV9A 1XWCA 3GN3A 3H79A 3LFLA 2DIYA 4MPGA 4ZIJA 4KW6A 4OO5A 3CRTA 3HJPA 4TW5A 2YWOA 3UJ1A 1GSFA 5DJMA 1SK0A 5J4UA 1ILOA 2GQKA 5DCHA 1PKWA 1R4WA 4I6XA 4X0XA 1XWAA 1LU4A 5CAXA 5IIZA 1XIYA 1WP0A 3ZIJA 3M3MA 5AIXA 1Y6EA 2WULA 1B9YC 3TJGA 2PWJA 2CVKA 1PSQA 4IKHA 1XOBA 1ON4A 3LEFA 3C7MA 3KM6A 3FR3A 3SBCA 4L0WA 2OACA 1WRYA 1I9DA 3NOFA 3E9JB 3QD9A 1F2EA 1XVQA 3HVXA 1URMA 2CZ3A 3F4SA 18GSA 3O6TA 4N11A 3HJOA 2JADA 2X8CA 3KXOA 2ZCTA 5IPGA 4FYUA 1SKSB 5H5SA 4WF5A 3WT1A 2GZPA 4POBA 3F4RA 4XCSA 3RPPA 3UIWA 1SD8A 2QSIA 1YF0A 2K6VA 2H1AA 4EUYA 5GSTA 2YJ7A 2LJAA 5B8AA 1NW2A 4EVMA 4HEA2 1WJKA 2O8VB 4O92A 4JR6A 4I2TA 4BWSA 2H75A 1PX7A 1TK5B 4GSSA 2R5GA 2LJRA 2H8LA 3QAGA 4WBRD 4MZBA 1U3IA 2DMMA 5C04A 3TUEA 3KJYA 1PX6A 1BG5A 2DJ2A 2LNSA 4N0VA 2DC5A 1M2DA 3FZ4A 3EINA 4Z7XA 3MSZA 2HSHA 4X43A 2V2GA 3VFIA 4TXOA 3A2VA 2G0FA 5AISA 1OC9B 4ML6A 3TKSE 3FZ9A 2VIMA 3G7IA 1PD21 2G2QA 3A5WA 3EU3A 6GSXA 5HR1A 1HNAA 2L6DA 2X64A 4JEDA 2P31A 2F3MA 4L8EA 1YDKA 2JL4A 19GSA 5ENUA 1OAZA 3HD5A 3GYKA 5G5EA 2K8VA 1ZYQB 2MMNA 2HZEB 1JLVA 2LKUA 1OKTA 1AQXA 2O87A 1KBNA 3EE2A 1JZWA 2VL2C 6GSVA 5F8BA 1ZGNA 1PQNA 2DMLA 5C00A 4I2UA 2DJKA 4LMWA 3QFAC 5HFGA 3GKNA 2B6MA 5HFIA 1ZYEA 1K0DA 3DWVA 4OCEA 3G7YA 3FW2A 5G31A 5CRWA 3BJ5A 3M8NA 5B8BA 5ELGA 2EIQA 4YQUA 1FAAA 1TW9A 1SD9A 2B7JA 2DJ1A 2V41A 2DLXA 4MP4A 2XBIA 5D9TA 2FWGA 1SENA 5H5QA 1CQGA 3C8EA 5CP1A 5IMFA 1BYEA 1M9AA 3ME8A 1EWXA 3RPNA 1K0AA 3LJRA 3TRXA 1OVNA 4LA1A 3QPMA 1TI1A 2EIOA 1J08A 5DAKB 14GSA 2H0HA 4HJ2A 3PR8A 2JZSA 4OD7A 2K9FA 3WD6A 3GL5A 3DVWA 5LCZA 4GWRA 2ALBA 4MF5A 3L9SA 5CREA 2P5RA 4IJIA 1NSWA 2PBJA 4MJEA 2AAWA 4XTSA 2XPDA 4MDCA 1UC7A 4HZ4A 2MMAA 3TJFA 1AC1A 1XZOA 4TN8A 1TK8B 4KB3A 4ZL7A 3GSSA 1AQWA 1BQ7A 2OA7A 2KOKA 5J5NA 1AW9A 5IMVA 3IK9A 4Q5NA 3TKSC 3TJJA 4WXTA 5D96A 1UA5A 3LG6A 4G9HA 1F6MC 2C3TA 4BA7A 1G6YA 1Q98A 3UOMA 1E2YA 3R2QA 1PL1A 3QAWA 1ZL9A 1GTAA 3ZYWA 1Z7PA 4LMVA 4QL9A 5DVBA 4YAPA 2L57A 5IMCA 4WETA 3APOA 1WE0A 7GSSA 5A4UA 2IMFA 2I3YA 1EP8A 2FWHA 3M1GA 1PL2A 3MWHA 2V1MA 2AB6A 3IHQA 3KH9A 5ECSA 2HZEA 1SYRA 3DYRA 3M0FA 3KMNA 4ZL9A 1OE8A 4ZBAA 2FLSA 2JSZA 4EF0A 1M2AA 4MZCA 2GSSA 1EZKA 1X9SB 3VPQA 4XHMA 1SU9A 2WFCA 2DBCA 3CXGA 1XW5A 2JZRA 5FT3A 3D4TA 20GSA 2H73A 4ML1A 3NZNA 1WIKA 3CSHA 2LRTA 1ERWA 4IS0A 4HUAA 3RHBA 1JZRA 3HVSA 3IAM2 2HYXA 5ECHB 1G7OA 4HQSA 1TJDA 5G30A 16GSA 2H1GA 1XCCA 1A0RP 4KDYA 1T7PB 1IYHA 1K3YA 2D2ZA 4F82A 1PGTA 2RUFA 4TXVA 5ABRA 5ECRB 4XRAA 1TRVA 3LORA 1V58A 5B6MA 2IL3A 1GNEA 5DAKA 3WT2A 10GSA 1WWJA 2VD0A 5AGYA 3D5JA 4I5QA 4GSTA 3IAS2 2CVBA 2LS5A 2VD1A 3E0UA 3CMIA 3APQA 3UL3A 2CT6A 3WGDA 2X99A 1X9MB 1T1VA 2GT6A 2GDRA 3MDKA 3KGKA 4KDXA 1T4ZA 2YWMA 3C1SA 5DDLA 1Y25A 1Z9HA 4KUNA 2RUEA 4BVYA 1SJIA 5KN3A 2GGTA 2VCTA 2VCXA 3AY8A 3HCZA 1JHBA 3EU4A 1GSYA 3HZ4A 1EEJA 4PUFC 2GT5A 5JCGA 5G1LA 3UEMA 4I97A 4MK3A 1SK2A 4O7HA 3D22A 2F9SA 3P90A 4MF6A 1U88A 3A3TA 1K0NA 5IM9A 2CX4A 3CSJA 2KP1A 3UAPA 2L5LA 3ZITA 2LTKA 2WZ9A 2CAQA 2NVLA 4K8MA 3CTFA 5F0GA 1G0TA 2A4VA 1AIUA 1M2BA 4AF2A 2PGTA 2VM1A 2O89A 4JE1A 2OBKA 3IXRA 2IMIA 4PGTA 3GKKA 4RI7A 2H19A 4WKWA 4TXOB 4N0ZA 1BX9A 1A0FA 3VI7A 2A2SA 4CW9A 4F0BA 1XVWA 4MJCA 1K0CA 1EOGA 1Z7RA 3NIVA 1ACVA 3UMAA 2VM2A 5ECMB 5IMAA 4PNGA 4HOJA 5ECIB 2FUG2 4HS1A 2DJ3A 2B1KA 1O8WA 2M72A 2H30A 2F8FA 2IPAA 1SL1B 4ZB8A 4MMMA 1GWCA 1THXA 2YWIA 6GSWA 2H6ZA 1AUCA 3QMXA 4MLYA 2AHEA 3IPZA 3ISOA 3ZIVA 4OO4A 1QGVA 1XW9A 3WGXA 2YZHA 4NMUA 5DCGA 3H93A 4YQMA 3ZLPA 3ERGA 3EURA 3VWUA 4AJ8A 4KNDA 4WR4A 4P3YB 5A5KA 1MDKA 3PINA 5DALA 5CRHA 1T3BA 2BTOT 1KEBA 3HDCA 3IBHA 1R26A 4HU7A 3BBYA 2R3XA 2B5EA 4KSOA 4F9ZA 3GV1A 2PN8A 2VCZA 1GRXA 4HI7A 4NAXA 1AXDA 5FHIA 4MABA 2B5XA 1GTBA 2YV9A 2V32A 4N10A 1C72A 4OCFA 4LLRA 2YNXA 3ZVJD 2F8AA 3IC4A 4F2IA 3ZFBA 2QC7A 2GQLA 1GSEA 2H01A 5EY6A 3SWLA 4V1Ap 1GH2A 3GKMA 1GTUA 3DRNA 1S3AA 4PURA 3HVVA 4H86A 2VLUA 3GKXA 1THOA 1B48A 2FA8A 4ID0A 4D73A 1QMVA 1E6BA 2GSQA 2FGXA 3I43A 2RM6A 1AQVA 2HLSA 2A2RA 5J41A 2NDOA 2CZ2A 3DGQA 3Q6OA 1GUMA 3GHAA 3OR5A 3ZL5A 3ZFLA 3BOAA 2MBTA 3KTBA 1X9WB 3GMFA 3UVTA 1W89A 5KN2A 3HZ8A 2QGVA 4G19A 3IR4A 2RIIA 3DXBA 5GZZB 3F8UA 1PMTA 1WMJA 5CRGA 3FEUA 3IE3A 4ISDA 2PERA 4QL7A 3RHCA 1U87A 4DSQA 3H1NA 1VGLA 1TRUA 5KN0A 2PU9C 1GSSA 2HI7A 4GCIA 3I6AA 2YN1A 2C4JA 5A4VA 4CDOA 3CTGA 2LQOA 3P8WA 4IELA 2HZFA 2E2GA 3QFBC 5ECKB 3ZZXA 4MPFA 4K1FA 2H74A 5IQYA 4ULXA 3VWVA 4WEYA 4YH2A 4EC0A 2FHEA 2VO4A 3C71A 3TKPA 4FIWA 3HY2A 2GZYA 3H4KA 3KP9A 3UARA 2ON5A 1S3DA 4K2DA 3S9FA 4XS1A 2JU5A 1F3BA 3PGTA 3ZREA 1DBYA 4YQVA 3KD0A 3GX0A 5LD0A 3TB2A 4IP6A 4OFMA 1TU8A 4PQIA 2IMEA 3F4TA 1W4VA 2L5OA 3DKSA 5DJLA 4PUAA 2H71A 3L78A 1FB6A 3GX8A 3ME7A 2K8SA 4RQRA 2CA8A 3DMLA 1O8XA 1TRWA 2FWEA 3US3A 3IA1A 5E4WA 4TKYA 2O85A 1T8EB 3L9UA 4I8BA 5DQYA 4ZB9A 4IHUA 4L5LA 4OFNA 1ZMAA 3D4MA 3Q18A 2B7KA 1HQOA 4XS4B 4AGSA 4QQ7A 3V1WA 2HSYA 2X8GA 2KUCA 5FWGA 2C80A 4K7NA 3G9BA 4AJ7A 1MD4A 2B5YA 3GSTA 2GQMA 2VAFA 4POLA 4L5OA 4BL7A 2HNLA 1TI3A 1VF1A 3GIXA 5DBQA 2KHPA 2M46A 4KCAA 3EVIA 5IPHA 1QFNA 3L0HA 1RK4A 3M9JA 1R5PA 4NPBA 5ECPB 2CQ9A 2X8HA 3C1RA 5G1KA 2P5QA 2BMXA 2YWNA 2L59A 2MMZA 4IQAA 4XRDA 3KIJA 1K3OA 1T4YA 1XXUA 4X1UA 3FR9A 1JFUA 1X5EA 4ILFA 3W8JA 4K0NA 1RW1A 2J23A 1KNGA 5GSSA 1OKDA 4NHWA 1HNBA 4K7IA 2REMA 3FY7A 3LSZA 4IBPA 1XWBA 5J9BA 3KEBA 2XBQA 3ERWA 4HZ2A 4MF7A 3FK8A 1SL2B 2ES7A 2L6CA 4K7OA 1A24A 2OE0A 1HD2A 4JBBA 3GH6A 4HJMA 3RDWA 2OADA 2LSTA 2OBIA 5IO2A 1NHOA 1O73A 2HXKA 1TXXA 4PQHA 4MH3A 1DE1A 2FY6A 3N9JA 1AAZA 1TU7A 1QK8A 2H1DA 4V2LA 5B6NA 4TR3A 5EPFA 3W8SA 3MNGA 2GVPA 2RLIA 2GSTA 1OYJA 5HR2A 3GH9A 3IRAA 2HE3A 2IWTA 2VL2A 3BCKA 4IP1A 1MDJA 3P7XA 3FZAA 5JWQB 1HYUA 2B3SA 3FRCA 1V98A 1TOFA 2C3QA 3GTUB 2OKAA 3VWXA 2C0DA 2CV4A 1V9WA 3ED3A 3HYPA 4F0CA 1SJZA 3VK9A 2I9HA 1CQHA 2CAIA 2LJKA 4XS4A 4V2MA 2VL9A 1PKZA 2NPBA 4ZBDA 2ON7A 4K9ZA 5DALB 3HXSA 2IIYA 4EE0A 3KZQA 4LL4B 1IYIA 1BEDA 3ZMKA 1OC3A 1R5AA 5AN1A 4DEJA 2AYTA 1G6WA 2H6XA 3O76A 1YQ1A 1PN9A 3P2AA 3LXTA 1MTCA 1FO5A 1SL0B 2FWFA 3J7Yb 3N5OA 3ZRDA 1V2AA 3UBKA 1JZDA 5IMZA 4PQ1A 5J9CA 1SK1A 5G2ZA 1O85A 2F51A 4GQFA 5D9WA 4J2FA 4JU5A 3F9UA 3HKRA 5JCUA 2DSAA 1ERTA 3H8QA 4MZWA 1ERUA 1TRSA 1Q4JA 1EOHA 3K8NA 4D73B 4Q5FA 4NHZA 1J0FA 1YKAA 5E59A 1VF4A 4V1Ag 2V6OA 6GSTA 1XOAA 2HRNA 2N5AA 1ERVA 4MA9A 3IDVA 3UVHA 5ID2A 1MD3A 3VWWA 1MEKA 1M7TA 1TK0B 2GS3A 3F63A 4PNFA 3F6DA 5CO3A 3LXZA 2N5FA 4KCEA 4K0GA 3WGEA 1B4PA 1QUWA 5D9XA 3E3EA 4CHSA 3M9KA 3O3TA 1EEMA 2IFQB 3GNJA 3I9V2 5CNWA 1NM3A 2LNTA 4TR4A 2DJJA 4NXIA 2KLXA 3I69A 4OMVA 8GSSA 2XPEA 2NBSA 2V6KA 1A8YA 2IJYA 2H1BA 2JZTA 4ECCA 2LRCA 3TJBA 5AIVA 2AUVA 3GTUA 2NTOA 1A8LA 4IJ3A 5L71A 2LUSA 2LQQA 1NHYA 1XPVA 3APSA 5JCWA 1LBKA 4ZILA 2HFDA 4TRXA 1SKRB 3TRPA 4BWQA 5CRDA 4J56E 3TOTA 4HDEA 5ECLB 2CVDA 3RAZA 1JZOA 2VCQA 1X5DA 4DSSB 3DEXA 4MCUA 2WCIA 4KE3A 5ECOB 3QCPA 4JR4A 1ABAA 1GSDA 3GUSA 1UN2A 3RBTA 2L4CA 4NV5A 2HT9A 4IGJA 2DIZA 4POMA 2OE3A 1DUGA 4ZB6A 1GULA 1PRXA 2H70A 5KEJA 1GUKA 2FD3A 1TDIA 5HR3A 3D6IA 3J7Yk 5HQPA 1Z3EA 2M80A 2C0FA 5GAND 2OE1A 3IOSA 4TR1B 6GSUA 4HU9A 1R7HA 2YPMA 4ECIA 2VUPA 2C3NA 1V40A 4GLTA 4FYCA 2MMOA 1J9BA 1XWGA 3L4NA 1Z6MA 1BAYA 1GTIA 3JCML 4Q5RA 2JACA 4KSMA 1EGRA 3KCMA 3HHVA 4GSNA 22GSA 3DVXA 3EMXA 3QOUA 4YAVA 1RQMA 3QAVA 2YP6A 3KMOA 2LEGA 1BJXA 3UBLA 2R6KA 2R4VA 1XW6A 2FA4A 3KH7A 1EV4A 1K0BA 3HJMA 4GF0A 4XIHA 1TKDB 3U6VA 3GRXA 4FYBA 2IFQA 3LYKA 3TKQA 2YOIA 3EMPA 1YEXA 2R2JA 5F05A 5ECQB 1UVZA 1GLPA 3CBUA 3QDNA 1VF2A 2VLVA 1FVKA 5A4WA 3EC3A 1LJRA 3WYWA 3KTLA 2YANA 3GFKA 4FH8A 1TTZA 1YEPA 4ECBA 1ZOFA 2E2MA 1A23A 2O7KA 4EXJA 3Q74A 3CSIA 3IV4A 3KP8A 4ZBBA 4E8EA 4O5RA 4MH2A 2C1YA 1GP1A 4GQCA 3L9VA 4IN0A 3ZTLA 1I5GA 3ZMLA 4F03A 4TVEA 3LQ7A 2WS2A 1YKCA 5JWRB 5HR0A 2XHFA 4DSSA 2VLTA 5G5FA 1YF1A 2MBSA 4MJAA 2EC4A 2OJLA 1JLWA 1G7EA 2VCWA 3F6FA 2FCHA 5COHA 3TCOA 1N8JA 1OE7A 2GSRA 4RI6A 1FW1A 5F07A 3F3QA 3D0ZA 2QKEA 1M99A 1F3AA 1FG4A 5CYYA 5KN1A 2C8UA 3BCIA 1EGOA 3W6GA 1SYXA 1X0RA 1A2MA 4XS6A 2TRCP 2Z9SA 3FHKA 4KDUA 1FHEA 4PX1A 1H75A 2B1LA 4TR1A 12GSA 3Q19A 1SKWB 1O7UA 4GXZA 4AJ6A 1F9MA 4KX4A 2WRTA 1FVJA 1PA3A 4OFTA 2I81A 1B9XC 5ECNB 4MJBA 4G10A 1QXHA 2IMKA 3FZ5A 2H6YA 2H0IA 2I4AA 1MDIA 2GTUA 4NV2A 3CRUA 3LYPA 1YJ6A 4RQXA 4DSRA 3VI5A 1ML6A 2ZUPA 2P0GA 2TIRA 4IW9A 1SJ6A 2WJUA 1FB0A 5JWOB 2IN3A 2CX3A 1U3AA 5D93A 3DIEA 1KTEA 4ACSA 3HA9A 3BD2A 1Z6NA 2I1UA 1OC9A 3GL3A 1EP7A 1WOUA 3C73A 4KA0A 5EL8A 3VURA 4K6XA 3A2XA 5ID2B 5INYA 1VRSD 1X5CA 6GSYA 3TDGA 3LGCA 5H5RA 1Z5YE 2WB9A 2DJ0A 2XC2A 4N30A 2ZNMA 1H4OA 2GLRA 4HQZA 1FOVA 2R37A 3TKRA 1F37A 2WGRA 2H72A 4EDYA 4E8HA 3TRQA 4GRFA 3QR6A 17GSA 4IQ1A 4KGIA 1ZZYA 4EDZA 4POKA 4EKZA 3TJKA 4O32A 3GA4A 1DE2A 5IO0A 2YCDA 2EIRA 3FR6A 5DQSA 1GSUA 1M0UA 6GSSA 1TP9A 1K0MA 3G7JA 2E7PA 1N2AA 3U5RE 4FO5A 3EYTA 2WDUA 1XBSA 2PVQA 1K0OA 5D73A 1GLQA 4JZQA 1O81A 3LWAA 1ST9A 5F06A 4BPYA 3FYGA 1B4QA 3ERFA 4ECJA 1DSBA 4J57E 1YY7A 2VOCA 1USBA 2RM5A 1GNWA 4JRRA 2YJHA 4KH7A 4L0UA 2N5BA 1A2LA 3TGZA 4ZL8A 4GTUA 2BJXA 2TRXA 5HFKA 2VCVA 1ZCPA 5IOXA 4NWYA 3F0IA 3IK7A 2IMDA 3GURA 2MZCA 1GL8A 3MAKA 4TOPA 2J9HA 1T00A 3F3RA 5D8IA 4WF4A 3ZVJA 3PH9A 2JSYA 4ZXGA 2K18A 1V57A 3VPTA 3CYNA 3TOUA 1M9BA 5D9VA 5EVOA 4KAEA 5B7CA 1XWKA 13GSA 4V2NA 2KP2A 4OWYA 2HRFA 1HNCA 4Q5QA 3VLNA 1B8XA 2H66A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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