The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
50
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen binding
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
A triply ligated crystal structure of relaxed state human hemoglobin
rcsb |
| total genus |
50
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NXF A; 1J40 A; 2GTL D; 3S1I A; 2D2M D; 2MGA A; 1GJN A; 4H0B A; 1MYF A; 1LUE A; 2DHB B; 4M4B B; 2ZS0 D; 3TM9 A; 3ZJP A; 1QXD A; 5C6Y A; 1JPB A; 2ZSR A; 1RVW A; 1DXV B; 3O89 A; 2HZ1 A; 3WCU B; 1JZM A; 2V1K A; 1X9F A; 1Y5F B; 3OO5 A; 1B86 B; 1BZ0 B; 3HRW B; 4ROM A; 4F68 A; 2EB8 A; 3NFE A; 3OZV A; 2Z6N A; 1FSX B; 2AA1 A; 2HBD B; 1X3K A; 1J7Y A; 1VXE A; 1MYM A; 1WMU B; 1Y5J A; 4MAX A; 1Y0A B; 2PGH B; 2ZSY A; 4HHB A; 1Y7G B; 1J3Z A; 1B0B A; 1RQ3 B; 1IDR A; 3UHI A; 4O2G A; 1ECD A; 1CH9 A; 1XZ5 A; 3DHR A; 5CN7 A; 1G0A A; 1MLK A; 1Z8U B; 1TU9 A; 4L2M A; 1XY0 A; 1LH5 A; 5AZQ A; 1J7W A; 2MHB B; 4YU4 B; 1YHE A; 1DXD A; 1Y4V B; 2YRS B; 1JL6 A; 3GDJ A; 1HDS A; 4F4O A; 1Y83 B; 2MGF A; 2DN1 B; 1A6N A; 3WCV C; 1XYE A; 5E29 A; 2ZS1 D; 1J3Y A; 2VYW A; 3GQR A; 5KDQ B; 3V2Z A; 1FSL A; 5CNF A; 2HCO B; 1O1L A; 3QM7 A; 2W6V A; 3D1K B; 1XZ2 A; 1GBU B; 2QU0 B; 1ECO A; 1YIH B; 1RTX A; 2MYB A; 1UT0 A; 1YOG A; 1HBR A; 1FHJ A; 1HDA A; 2HBS A; 1CH5 A; 1JY7 A; 1YG5 A; 2AUP A; 2DN2 A; 3EOK B; 4MPM A; 3UH3 A; 2MGD A; 1NGK A; 4N7N A; 3WCU D; 3G46 A; 3DHT A; 1CH4 A; 3GLN A; 1Y4Q A; 2MGL A; 3G4U A; 1Y46 A; 1HV4 A; 5CN8 A; 2ZT1 A; 3GKT A; 1BZR A; 1HHO B; 3KMF C; 1MBD A; 1IWH B; 1XXT B; 4X0L B; 4DC7 A; 1YEQ A; 3DUT B; 4N7O A; 2G11 A; 4C44 A; 1GLI B; 4H07 A; 1AJ9 A; 3BJ3 A; 1YGD B; 3K8B B; 2ZSX A; 2Z6S A; 2AUQ A; 3BOM A; 4AVE A; 1L2K A; 3HYU B; 4IT8 A; 2ZSS A; 3M3B A; 5HU6 A; 1DTI A; 1Y7C B; 1XZV B; 2XKI A; 2VLY A; 2LH6 A; 3EDB A; 1FAW B; 1ABW A; 1A6M A; 1HBG A; 2ZLT B; 4MQH B; 1MOA A; 1MOB A; 1A3N A; 2VM0 A; 1MKO B; 1K0Y A; 1CQX A; 2ZFO C; 3BJ1 B; 1V5H A; 3CY5 A; 1Y85 A; 4NXC A; 1MOD A; 1H97 A; 1MLQ A; 2HHE B; 1CG5 A; 1Y22 A; 1IT2 A; 5E6E A; 3UHQ A; 2O5B X; 1DO4 A; 4N7P B; 1CIO A; 5JDO D; 3GQG A; 1YIE B; 2EKU A; 2SPL A; 3OO4 A; 2QSS B; 1CG8 B; 1DXT A; 2R80 A; 2GRH A; 2PEG B; 3PEL B; 1DXU B; 1NS6 A; 3ZOM A; 1HGA B; 3ZJR A; 1IT3 A; 1R1Y B; 3U3E A; 1XQ5 A; 1BAB B; 1MBN A; 3HXN B; 3W4U B; 3QJB A; 1QXE A; 1COH A; 4NZI A; 1R1X B; 2GDM A; 1S5X B; 1Y7D A; 1G9V A; 2V1F A; 1S6A A; 1QXD B; 1GZX A; 1HGC B; 1YFF B; 2XKG A; 1HLM A; 1Y4F B; 2D5Z A; 3QQR A; 3ECL A; 3V2V A; 5CNC A; 1QSH B; 4ROM B; 2G0V A; 1PMB A; 1AZI A; 3GQP A; 1O1O A; 2ZSQ A; 1NS9 B; 3NFE B; 3FH9 A; 1DUK A; 5CNE A; 2AA1 B; 2QFN A; 1MNI A; 1A6K A; 3MJU A; 3LR7 A; 4HRT A; 1BJE A; 2HHD A; 2KSC A; 1Y01 B; 1Y5J B; 3PI8 A; 1Y0C A; 3AG0 A; 3D7O B; 5HBI A; 2SPO A; 1UFJ A; 2FRK X; 4XS0 B; 1SI4 A; 1UVY A; 1YHU B; 1CP5 A; 3HHB B; 1G0A B; 3ZJI A; 3WCT C; 2Z6T A; 1YEU B; 2HHB A; 1Y5K A; 1LFY A; 1Y4R A; 2AUR A; 2WTH A; 3UHC A; 1Y0D A; 1S5Y A; 5F0B A; 3PT8 B; 1HBA A; 1QPW B; 1YEO B; 3GDJ B; 3PI3 A; 1HDS B; 3ZJL A; 3WR1 A; 1ABY A; 4HSX A; 1GDJ A; 3QM6 A; 3OZW A; 3QJC A; 1V4X A; 1A3O A; 1XYE B; 2G10 A; 5EU2 A; 3LB4 A; 3GQR B; 3ZJM A; 3AQ6 A; 1MOC A; 1PBX B; 3WCV A; 1Y35 A; 3HF4 B; 2HBF A; 4B4Y A; 3RGK A; 2W6V B; 1DLW A; 1YEV A; 4UUR A; 1HAB A; 3ARK A; 3BJ2 A; 1SDL A; 1N9H A; 1Q1F A; 3WFX A; 1A00 B; 3AT6 B; 2ZLU A; 2D2N C; 2MYC A; 1GCV A; 2HBS B; 4MBA A; 1JY7 B; 2DN2 B; 1MWB A; 1O1K A; 1Y8K B; 1OUT A; 2DC3 A; 2EVP A; 4MQK A; 4OF9 A; 1Y4B A; 1Y4Q B; 2W6X A; 3QZZ A; 1HV4 B; 1LFT A; 1UVX A; 1Y45 A; 1IRD A; 1UMO A; 4MQI A; 2NSS A; 4M4A B; 2HBC A; 1DM1 A; 2GTL C; 3K9Z A; 1S0H A; 1YEQ B; 2B7H A; 4N7O B; 3KMF A; 2IN4 A; 2RAO B; 1SWM A; 3IXF A; 2VRY A; 3BOM B; 2BWH A; 4MQC A; 1O1N A; 1YGF A; 4HRR A; 1YHU D; 1CH7 A; 2V1G A; 1LA6 A; 2MGI A; 3K3U A; 3QM9 A; 3VRE A; 1EW6 A; 1Y4P A; 4G51 A; 1XZU B; 3PT7 A; 3NG6 A; 1O1I B; 3S65 A; 4H2L B; 2EVK A; 1EMY A; 2HZ3 A; 2VHB A; 1HJT A; 1K0Y B; 1NIH A; 2MYE A; 5HLU A; 3GKV A; 3ORD A; 1VXH A; 4NK2 A; 5KKK A; 104M A; 3VRF A; 3LQD A; 5SW7 A; 2BKM A; 3P5Q A; 3A0G B; 2ZFO A; 4HSW A; 4MBN A; 5CMV A; 1M9P A; 1YVT A; 1YMA A; 4U8U B; 3GQG B; 1A0Z B; 3ONZ A; 5CND A; 3OO4 B; 1QSI A; 1DXT B; 1LH3 A; 1NS6 B; 4QAU A; 1XZ4 A; 1FN3 B; 1YHR A; 1HSY A; 3HEP A; 1HCO B; 3WFU A; 1NZ4 A; 2G0R A; 1XQ5 B; 1BZP A; 2ZS1 C; 3EU1 B; 1LFV A; 1WVP A; 1COH B; 3RJN B; 1Y7D B; 1C7B A; 1GCW B; 1K1K B; 2W72 B; 1GZX B; 1DO3 A; 3GOU A; 5EE4 D; 3H57 A; 4IRO A; 1RQ4 A; 4NI1 A; 1UX8 A; 103M A; 1JEB A; 1X46 A; 1MBO A; 1AJH A; 2MB5 A; 1YDZ A; 3A59 A; 5CNB A; 1HBH A; 3GQP B; 1O1O B; 1SHR B; 112M A; 4YU3 A; 3UH7 A; 3PI9 A; 2NRL A; 3WHM A; 3ZJJ A; 1YOI A; 5ILE A; 3WCU C; 101M A; 3ECZ A; 3LR9 A; 1MWD A; 4UZV A; 1BIN A; 3G53 A; 2LH7 A; 4O35 A; 2Z8A A; 4N8T B; 2NSR A; 4ILZ A; 1HGB B; 2V1J A; 1A01 A; 1V75 A; 5E83 B; 5F2A A; 2H35 A; 1SI4 B; 3SZK A; 1GBV A; 2O5M X; 3A5G A; 1JL7 A; 1VXF A; 5CHQ A; 1V4W A; 2LH3 A; 1YEN A; 1LFY B; 1KFR A; 1KD2 A; 1Y0D B; 3S66 A; 2R4X A; 1NEJ B; 3A5A A; 3WCT A; 2ZLX A; 1ABY B; 4ZVB A; 4KMW A; 3GYS A; 2M6Z B; 1V4X B; 3HC9 A; 3FS4 A; 4U8U D; 4L7Y A; 3UHB A; 2QMB A; 3QJE B; 5EV5 A; 1ASH A; 1MYZ A; 1YZI A; 2HBF B; 5EOH A; 1O1M A; 1EBT A; 2MGK A; 2MGM A; 1Y09 A; 1U7R A; 1Y2Z A; 1N9X A; 1LFL A; 3D1A A; 1IBE B; 1HAB B; 2GNW A; 3G4V A; 4MQG A; 4FC3 A; 5KER A; 4KMV A; 1HAC B; 4HBI A; 4MU5 A; 5EUI A; 3MKB B; 2FRI X; 1A0U A; 2XKH A; 3E4N A; 1HDB B; 5JDO C; 4ODC A; 5EET A; 2BLJ M; 2GRF A; 1QI8 A; 1YCA A; 2ZLW A; 1MWC A; 1VXA A; 3UHK A; 5AZR A; 1IRD B; 1GDK A; 3D17 A; 2OLP A; 2D5X A; 3WTG B; 1MLU A; 1T1N A; 4F6D A; 1S0H B; 2B7H B; 1MTK A; 2ZLV B; 2R1H A; 2V1H A; 1HBB A; 4ESA A; 1J52 A; 1NPG A; 3IC0 B; 5D5R A; 2MGG A; 1G0B B; 1J41 A; 1VXD A; 2GTL A; 1DTM A; 2QSP B; 4MQC B; 1MYI A; 1O1N B; 2VLZ A; 1HBS A; 1G08 B; 1SPG A; 2FRF A; 3MOU A; 3S1J A; 2D60 B; 3ZJN A; 3VRG A; 3VRE B; 1Y4P B; 4G51 B; 1FDH A; 1YVQ A; 3ARL A; 1N9I A; 5HLQ A; 3S65 B; 1Y8H A; 1BIJ B; 2AUO A; 2EB9 A; 1BUW A; 1M6C A; 3D4X A; 2V1I A; 4KJT A; 2JHO A; 3GKV B; 1NQP B; 1HRM A; 2LHB A; 3MJP B; 1A4F B; 1MYG A; 2MYD A; 2DXM A; 5SW7 B; 1O1P A; 111M A; 1NAZ A; 3DR9 A; 3WCW B; 3QZX A; 1DKE B; 1DWR A; 1MBA A; 1CO9 A; 1QSI B; 5CN6 A; 3NL7 A; 3R0G A; 5ILR A; 3NMM A; 1XZ4 B; 2H8F A; 1Y4G A; 4DC8 A; 1C40 A; 1YCB A; 3BCQ A; 2BNL A; 3WCP A; 1LFV B; 1J40 B; 1CMY A; 3CIU A; 1O1J A; 4GZG A; 1C7B B; 1J7S A; 2ZS1 A; 1OUU A; 1YMC A; 1LFQ A; 3E5O A; 1ECA A; 3G52 A; 4IRO B; 1RQ4 B; 1NPF A; 3UHR A; 1RQA A; 5B84 A; 3ED9 A; 3OVU C; 3ZH0 A; 5M3S A; 1Y7Z A; 3OJ1 A; 1XZ7 A; 1VWT A; 3A59 B; 1RVW B; 3PI1 A; 1G09 A; 1HBH B; 4MQJ A; 1X9F B; 3OO5 B; 5B85 A; 1BVD A; 1Y8W A; 2DHB A; 2R50 A; 2Z6N B; 4M4B A; 1Y31 A; 1YOH A; 1LH6 A; 3UHN A; 3M39 A; 1J7Y B; 5CN5 A; 1OBM A; 1ECN A; 2VEB A; 1LTW A; 1DXV A; 2O5L X; 2GLN A; 1B86 A; 3HRW A; 1A01 B; 1JF3 A; 1V75 B; 3PI2 A; 3KUO A; 1CH2 A; 1MTJ A; 4PNJ A; 4HHB B; 1J3Z B; 1F63 A; 2OH9 A; 1FSX A; 3ZHW A; 2HBD A; 1DWT A; 2BLI A; 1XZ5 B; 3DHR B; 3MYM A; 1MLS A; 1XY0 B; 3S66 B; 1MLN A; 4FWZ A; 2ZLX B; 4O1T A; 1J7W B; 1YHE B; 1Y0A A; 4FH7 A; 1YHU C; 3WCW D; 2G0Z A; 1SDK A; 1DWS A; 4F4O B; 2IG3 A; 3FS4 B; 3NML A; 4L7Y B; 1RQ3 A; 1Y0T A; 4PQC A; 2W6Y A; 5E29 B; 3QM5 A; 1J3Y B; 1VXB A; 1JP8 A; 1EWA A; 1JP6 A; 1Y09 B; 3O7N A; 1JWN A; 3KUN A; 2W6W A; 1O1L B; 2MHB A; 3AT5 A; 2YRS A; 1Y4V A; 1MLL A; 4FC3 B; 1Y83 A; 1XZ2 B; 1YE0 A; 4DWU A; 4C0N A; 2AV3 A; 2DN1 A; 2ZFB A; 5KDQ A; 1U7S A; 3ODQ A; 1HBR B; 1FHJ B; 1HDA B; 5EQM A; 1A0U B; 1VRE A; 3LHB A; 1YG5 B; 4WJG A; 4N7N B; 1X9F D; 3D1K A; 3DHT B; 2AV0 A; 1S56 A; 1GBU A; 3MBA A; 1V07 A; 1V4U A; 1Y46 B; 1YIH A; 1LHT A; 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3FH9 B; 1EBC A; 1S5X A; 3HEN A; 1Y31 B; 2G12 A; 1S61 A; 4WCH D; 3MJU B; 4UIQ A; 3UHS A; 1HGC A; 1YFF A; 5CNG A; 2LH5 A; 1UX9 A; 1Y4F A; 1IOP A; 4HRT B; 2MGJ A; 2HHD B; 1DO7 A; 3M38 A; 1QSH A; 2R4Z A; 1F65 A; 1YH9 A; 1LH1 A; 3PI8 B; 3UHY A; 1CLS A; 1Y0C B; 1NS9 A; 1MLR A; 2OIF A; 4TWU A; 1VXG A; 4ROL A; 5HLX A; 2FRJ X; 2ZT3 A; 1MYJ A; 2HHB B; 3S48 C; 3AQ9 A; 3QJD A; 1Y5K B; 2ZT0 A; 5JDO F; 1Y4R B; 1S5Y B; 1M6M A; 1HBA B; 2LH2 A; 1SDK B; 3WR1 B; 1C7D A; 3D7O A; 3IC2 A; 1Y0T B; 3QJC B; 1OFK A; 4XS0 A; 1A3O B; 1GVH A; 1YHU A; 2FAM A; 3HHB A; 3UHV A; 4F6I A; 1MYH A; 1YEU A; 2NRM A; 3WCV B; 1Y35 B; 3ECX A; 5MBA A; 3AT5 B; 1C7C A; 2VYZ A; 3PT8 A; 1SPE A; 1QPW A; 1YEO A; 1YEV B; 2MGH A; 1YE0 B; 3BJ2 B; 1OJ6 A; 1SDL B; 2OHA A; 4SDH A; 2SPM A; 2ZT4 A; 3UI0 A; 2ZFB B; 2MBW A; 3ODQ B; 2ZLU B; 3HEO A; 6HBW A; 1PBX A; 1CBM A; 2V1E A; 3QMA A; 3HF4 A; 1GCV B; 1CP0 A; 1OFJ A; 1MCY A; 1O1K B; 2DN3 A; 2D2N A; 1OUT B; 2O5T X; 4MQK B; 1Y4B B; 1F5P A; 1BZ1 A; 3UHU A; 1V4U B; 1URY A; 1LFT B; 1Y45 B; 3R5I B; 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