3D2FB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Chaperone
total genus 116
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2fB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2fB04
4BRHA 4JHDA 3CJBA 3HI0A 1IJJA 3QBWA 4JN4A 4H0TB 3BF1A 1BOTO 2FSJA 2UYTA 1JCEA 5BRDA 4WQ5C 5BR9A 2I7NA 3I33A 3ENOA 4H5VA 3CJ1A 3VGMA 4BRMA 3HZ6A 4BQLA 4CBXA 3ZEUA 3AY9A 3UKUA 2PAVA 4DCHA 1QQOA 1NGBA 4A62A 3GG4A 5AQUA 3WXLA 3DXMB 4FWRA 2E1ZA 2YCHA 3DJCA 3FR0A 3VEWA 3RSEB 4H5TA 5KQ8A 3DWLA 5AQZA 1TUYA 3UKRA 4CZFA 3CHWA 3VEXA 5EY4A 1QQNA 2QWOA 3AARA 3CETA 2ASMA 2CGJA 2A42A 4L3QA 5E84A 2P9LA 4FWOA 2P9SB 1SZ2A 4EAHD 2IVPA 3LDOA 3ID8A 1TYQB 3VF2A 3ZETA 1SAZA 3QB0A 1HJOA 2IVOA 4H5RA 4CZGA 2E2NA 4BGBA 2VCPA 2ASOA 3QBXA 4B1XB 5E26A 1G99A 5AQJA 5AR0A 2D0PA 3GE1A 2E2OA 4E1JA 3O80A 3GL1A 5BPLA 1NLVA 3CJCA 4PKGA 3JS6A 4BRDA 4DQ8A 4I6MB 3LM2A 1NMDA 4B1VA 1NGIA 2A41A 4FPBA 3H1VX 1R59O 5AZIB 2P9KB 3FGUA 2HMPA 3LDQA 5KQDA 3EO3A 5F0XA 3LL3A 2Q2RA 2P9IB 5TKYA 4LC9B 1GLBG 2P9UB 4QS7A 4B1WB 1LOTB 1ZBSA 1BDGA 4BROA 3FZHA 1GLFO 5AQIA 3KVGA 2E88A 2D4WA 3A5OC 3TU5A 3J8AA 3CJ7A 3EL2A 4CZHA 4H0YB 4CZIA 5AQNA 1BA0A 3ZX3A 3L4IA 3CQYA 1EQYA 3P4IA 3DXMA 3A5MC 2A40A 4ISEA 4B1YB 4BC4A 3VESA 2FF3B 3FLCO 3RSEA 4WQ4A 2QXLA 4BR9A 3EKUA 4IJAA 3O6WA 4FWNA 2ZWHA 3O08A 2ZGYA 1XC3A 3R8EA 3MN5A 2Q0UA 1QZ6A 3VEVA 5FPEA 1Q18A 1S22A 2E8AA 2P9NB 3BUZB 1IG8A 2P9SA 1DKGD 3SJHA 4BC3A 1TYQA 3WUHA 4BRFA 3W3DA 1JCFA 3H46O 4HTLA 1BUPA 3GDQA 3FZKA 2F9TA 5F2RA 1X3NA 5KPRA 5ADXA 1QQMA 3IMXA 5ELZA 4K25A 3WEEB 4M63C 4JAXA 5LY3A 5JLFA 5BN9A 2GEMA 3A5LC 4BR4A 3O1BA 4I6MA 3BP8A 3VERA 4BR0A 5AZIA 3FZMA 2P9KA 2V52B 2I7PA 4FL9A 4M7XA 5ADXH 3R9PA 2P9IA 5AQOA 4ISFA 2D0OA 3I8BA 5JICA 3CERA 2P9UA 2ZGZA 2OANA 2Q0RA 2GWJA 4DHYA 3GBTA 4ISGA 5I9EB 2J4RA 1DEJA 2AA4A 2EWSA 3MN6A 1NGEA 3OHRA 5BN8A 1ATSA 1YVNA 3MN9A 4BRPA 4BG8A 1LCUA 2NZTA 1WOQA 3ATVA 3DAWA 3EZWA 1GLDG 4EHTA 2WUSA 1MA9B 3QDKA 4BRLA 5AQSA 3AAQA 3TPQA 3D2EB 1GLAG 4EFHA 4BR2A 5AZJB 2W40A 2A5XA 1RDWX 4AM7A 1XUPO 4Y0WA 1BO5O 4EIAA 2IVNA 5JMVA 2FSKA 2P9NA 3HSCA 4BRAA 3VF4A 4FSVA 2QWQA 3LDLA 2CH6A 2Q36A 3H1QA 1GLLO 1NGAA 1Z05A 4BC5A 3SMSA 5AQVA 5FPNA 5AQYA 5AQXA 1HKGA 3CI5A 1MDUB 4EHUA 1HPMA 2E2PA 1E4GT 2GWKA 4H0OA 3WEEA 3GOIA 4BQZA 5AQPA 1KAZA 1YUWA 1T44A 5LJVA 4FWSA 3C7NB 3EKSA 4BR7A 1XQSC 3ZX2A 3VEYA 1NGHA 3L6QA 4F9OA 5AQGA 5B8HA 4A2AA 5EOYA 2CGLA 2IIRA 3CJAA 3H6EA 5AQMA 4JNEA 3A8YA 3L0QA 3FZFA 5KPZA 2VWBA 4MLEA 3U4LA 2E1YA 2QWNA 4JD2B 4B1ZA 4XH1A 5AFUA 2QWRA 3KZBA 5BRHA 1KAXA 2ZF5O 1BA1A 3MCPA 3M1FA 3WQUA 3VENA 2BTFA 5AQRA 1NM1A 1C0FA 3D2EA 3CJ9A 5AFUH 5JLHA 3O1WA 4BREA 2CH5A 3M3ZA 3WQTA 2YHWA 4WYBA 5AZJA 3ATUA 5BREA 1U2VB 1GLEG 5FPDA 3ENHA 4B1UB 3D2FB 2GTDA 5F1XA 2H3GX 3LDNA 3MN7A 5LJWA 3VF6A 2F9WA 4K41A 3R6MA 4CZEA 4XH5A 3HTVA 4IWVA 4M7YA 3SK3A 5EX5A 1NWKA 2ITMA 3A0IX 3IFRA 1HKBA 3HM8A 5BPMA 1QZ5A 2QW9A 2AP1A 4PL7A 2HOEA 3QFPA 1BG3A 3O4WA 3QMLA 3MDQA 3C7NA 1CZAN 3VEOA 1J6ZA 3VGKA 3VOVA 5EVZA 1Z6RA 3JXUA 4O8KA 4WQ4C 4FO0A 2NLXA 2GELA 2V51B 1NBWA 4RCHA 4BVPA 2KHOA 3CIPA 1KXPA 4Z94A 1DGKN 1NGDA 3VETA 3LDPA 4JD2A 4IO8A 1GLCG 1NGJA 3C0BA 4GY2B 4PKHA 2FXUA 4CZKA 5AQHA 1T6CA 4BRIA 4CZLA 4MLHA 4H03B 1RFQA 4FWKA 2P9PB 1QHAA 1K8KB 4CZMA 2V7ZA 4BG9A 4PL8A 2FF6A 3MK6A 5AQWA 2Q97A 5EXWA 5BPNA 3AAPA 4FWLA 3WXJA 2V7YA 4CZJA 2YI1A 3IDHA 3QICA 3VEZA 1U2VA 4IJNA 1OKJA 3D2FA 5AQKA 4BR5A 2D1KA 4YDUA 4FWPA 1X3MA 4FPAA 4QS9A 3KHYA 4H0PA 4RWTA 4DB3A 4XH4A 2PBDA 3IUCA 1BU6O 2VYPA 5AQQA 5KPTA 3S41A 4A61A 1YAGA 2Q31A 3VGLA 4BRCA 4BVOA 1KAYA 3M6GA 4BRQA 5AQTA 3H3OB 3DXKB 5AQFA 4BRKA 4BRGA 1V4SA 3FZLA 5AQLA 2YHYA 4BGAA 3ULEB 2HF4A 3CQXA 3B8AX 2Q1NA 2YHXA 1H1VA 4B9QA 4IZ9A 1MWKA 3EN9A 3FFKB 3UE5A 4CD3A 1ATNA 2E2QA 1NGGA 2A3ZA 4MO4A 3A5NC 1S3XA 4H5NA 1NGCA 3FE1A 3QFUA 3U9DA 3ZX0A 1GLJO 1X9JA 1SQKA 1ZC6A 3WT0A 4NB4A 4YDUC 4BRNA 4BC2A 1RGIA 4GNIA 3D7EO 3H3NO 3HBTA 4O5FA 2P9PA 1K8KA 3H45C 2QWMA 4JHDB 4PKIA 1WUAA 3O8MA 1V4TA 3VPZA 4A2BA 3MMVA 1Y64A 4H0XB 4CI6A 2HF3A 2BUPA 1ATRA 2NRHA 4K43A 4MO5A 3U9ZA 2ASPA 1P8ZA 3ZEUB 4FOEA 4CBUA 3WXKA 1JCGA 5FPMA 3UKUB 4H5WA 4FWMA 3SLCA 2FSNA 1E4FT 2YJEA 4H0VB 1HLUA 4QS8A 2QWLA 2QWPA 4WQ5A 2DPNA 3UKRB 1ESVA 3DXKA 1C0GA 2QM1A 3O5BA 2CGKA 2GUPA 2YJFA 4CJ7A 1TUUA 3F9MA 2FLOA 3ULEA 4CBWA 3LM9A 3SMPA 2P9LB 3UB5A 4XEIA 1D4XA 1T6DA 1HKCA 4C23A 4IXCA 4CD1A 4FOIA 1YXQA 3ZETB 1U6ZA 3WXIA 4FWQA 1HX1A 1BWFO 1ZXOA 2E20A 2A6AA 5BRFA 2W41A 3W0LA 4KBOA 1HUXA 4NO7A 3BEXA 4AM6A 3BF3A 4K42A 4RTFD 3G25A 4J8FA 3U8XA 1MWMA 4HWIA 1NGFA 5CE3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N76A 4BRHA 1AYJA 3CJBA 3QBWA 4E0DA 3QIOA 4JKAA 2LJ7A 2ATBA 4CHOA 3CFPA 2FSJA 4FJLA 4WQ5C 4HVJA 3LZJA 4BE2A 4KREA 3HZ6A 4PHTX 1CZBA 3TI0A 3E7RL 3LWMA 2KW4A 3SQ1A 1QQOA 1JLBA 4A62A 3E9OA 3WXLA 4FW1A 3THYB 3M8RA 5AQZA 1I2UA 4CZFA 1GOBA 3QNNA 1Q86O 3P39A 4YOYA 5SWMA 4O0JA 3CETA 3AO5A 4CFCA 1KLMA 1BGXT 3RMBA 1JLAA 4EAHD 1HJOA 1BCOA 3HP9A 2ITGA 2ATQA 1Q9XA 4OX9K 2O8EB 2D0PA 3GE1A 4QOZB 3OS2A 2KSKA 5M1PA 4B9MA 2ETJA 3JS6A 2LJMA 4BRDA 4I6MB 2N69A 1B92A 4B1VA 2A41A 4FPBA 1A5XA 3H1VX 1R59O 5AZIB 2O8CB 3TAPA 3FGUA 2HMPA 3VQ4A 3D0PA 4OO1J 3LPUA 4FW2A 4B1WB 1LOTB 1W0HA 1ZBSA 1C0UA 4BROA 3OBWA 3L2UA 2RHKA 3G71N 1BISA 1D5AA 4JK9A 2E88A 4KH5A 1I3AA 4BE7B 4B3TK 1OH7A 2JWLA 3I0RA 4HUGA 2KTQA 3C65A 3TSUA 4E7IA 5AQNA 3OJSA 1BA0A 3L4IA 4KB1A 1HMVA 1EQYA 1PTXA 5HRNA 1K9MO 1B7DA 1N4NA 2QXLA 1W7AA 4I7FA 2P1JA 4XJXA 3SBGA 2B4JA 3NGYA 3NAEA 3KD5E 3O08A 3F2KA 3MN5A 3VEVA 5FPEA 1BQNA 2E8AA 1S22A 1TV6A 1ZVGA 4F2SA 1DKGD 5KTQA 3SJHA 1YTUA 5IWAK 1K6YA 1TYQA 2ZE2A 2F9TA 3SF4D 1G15A 1XWLA 5F2RA 1J54A 3TAFA 1FKPA 2HBLA 5JLFA 3O1BA 2MBKA 1XHXA 3QEXA 3G10A 2QA4N 1HQEA 2P9KA 4FJNA 2V52B 5ADXH 4FL9A 4M7XA 2KYQA 3O9QA 3VQ5A 2P9IA 5AQOA 4ISFA 4YHHK 1FK9A 5JICA 4DS5A 3CERA 2P9UA 3RMCA 2ZGZA 3THWB 2OANA 1KLNA 3KK2A 1HNVA 2GWJA 4CF1A 3O9UA 2P5GA 2FBXA 4ISGA 4U67L 1DEJA 3MN6A 2FBTA 2UXCK 4BRPA 4B9LA 2NZTA 4JYAK 4Y1CA 4OVLA 3CCEN 3EZWA 3D6RA 3MWTA 1RCHA 5JVGL 3QDKA 4BRLA 5AQSA 4EFHA 1PE4A 4PWDA 5DM6L 2ZJRL 2F8SA 1RTIA 2A5XA 4FLVA 1XUPO 4Y0WA 3WXMB 4NLCA 2JDQD 1BCMA 1BO5O 4E7JA 2IVNA 1TI5A 5JMVA 2M8BB 2P9NA 3U6FA 2QWQA 3H1QA 2RE2A 1GLLO 3T3FA 4MDAA 4BC5A 1DLOA 3S3OA 2NNWA 1VSDA 5AQVA 4DQSA 5AQYA 3C6AA 3U3YA 1FW6A 2YNGA 3SQ0A 1VNBA 1P90A 1MDUB 4CEOA 4EHUA 1HPMA 4CGDA 2E2PA 2ZD1A 4H0OA 4GVMA 2O8BA 5AQPA 4JI5K 3MXMA 4CJTA 2E0HA 2N2QA 4YOWA 2E6MA 1XRSB 4O4GA 1XQSC 5T7BA 1FJGK 3MEDA 4A2AA 3K9JA 3K5LA 2CGLA 4ILHA 3TWHA 3OTOK 5AQMA 3J7ZO 3EE9A 5KPZA 3AVAA 2OPRA 2QWNA 4BDPA 3P38A 4CECA 5AFUA 3PSFA 2QWRA 3KZBA 2HHVA 2ZF5O 3M1FA 3ZSVA 1JXEA 1JLQA 2DFEA 3NGZA 2BTFA 3NF8A 1NRAA 1C0FA 1LWFA 4CJVA 3SUQA 4JKHA 1FXXA 1ASWA 2YNIA 3KLIA 5AZJA 3AO2A 3SI6A 1SKRA 3CC7N 3KKSA 1PX9A 2N66A 3ASMA 3ENHA 3MXIA 2H3GX 2IDOA 3MN7A 1I39A 1NK9A 4CEBA 2YNHA 4K41A 2BE2A 1KVCA 3LZIA 5C25A 1IKWA 4NCAA 1NJIO 2Z1HA 2FC0A 4BACA 4CK3A 1KC8O 3HTVA 3R2VA 4IWVA 1N36K 4DQPA 2B3CA 1S9EA 2W00A 1HKBA 3ZLJA 1B3CA 2QW9A 1QZ5A 2AP1A 4PL7A 1BG3A 3Q7BA 4J2BA 2I61A 3C7NA 3VGKA 2O8DB 3QNOA 4DKWA 4ZTFA 1Z6RA 4JKBA 1VQKN 1JKZA 3JXUA 5JENA 4WQ4C 4FO0A 2LR3A 2NRTA 1NBWA 2SN3A 2N2RA 1KXPA 4Z94A 3VA0A 1NGDA 4JD2A 1NJWA 1NGJA 3K57A 3HOTA 3NE6A 3KOYA 1T6CA 4CZKA 4CZLA 4L8RB 2P9PB 4AHVA 4CFAA 4BG9A 4E7KA 4PL8A 1XNRK 4DV2K 1NJYA 3S3MA 4O55A 2Q97A 1L3UA 2VG6A 3OYKA 4AILC 3EY1A 4CZJA 1N5YA 3QICA 3VQ7A 2EX3A 1U2VA 4IJNA 2YKNA 3D2FA 4DF4A 3V9XA 2DY4A 1EKEA 4BR5A 2D1KA 4YDUA 4C8MA 4DU1A 4FWPA 4FPAA 3KHYA 4RWTA 2WONA 4UQGA 1UA0A 4WFBL 3G6EN 4W5NA 3T1AA 3OA9A 3LP2A 5AQQA 4BVOA 1KAYA 2GUIA 3M6GA 3H3OB 2KPYA 5AQFA 4ZHRA 1V4SA 1HNIA 3DLEA 1TL3A 4BGAA 1BK8A 3TTCA 1HRHA 4CJ3A 4LD0A 1LV5A 4PA1A 4DFKA 4YOTA 1S1XA 2ZM6K 4FK2A 3UE5A 1RDCA 3QLHA 1NGGA 2A3ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4N76 A;  4BRH A;  1AYJ A;  3CJB A;  3QBW A;  4E0D A;  3QIO A;  4JKA A;  2LJ7 A;  2ATB A;  4CHO A;  3CFP A;  2FSJ A;  4FJL A;  4WQ5 C;  4HVJ A;  3LZJ A;  4BE2 A;  4KRE A;  3HZ6 A;  4PHT X;  1CZB A;  3TI0 A;  3E7R L;  3LWM A;  2KW4 A;  3SQ1 A;  1QQO A;  1JLB A;  4A62 A;  3E9O A;  3WXL A;  4FW1 A;  3THY B;  3M8R A;  5AQZ A;  1I2U A;  4CZF A;  1GOB A;  3QNN A;  1Q86 O;  3P39 A;  4YOY A;  5SWM A;  4O0J A;  3CET A;  3AO5 A;  4CFC A;  1KLM A;  1BGX T;  3RMB A;  1JLA A;  4EAH D;  1HJO A;  1BCO A;  3HP9 A;  2ITG A;  2ATQ A;  1Q9X A;  4OX9 K;  2O8E B;  2D0P A;  3GE1 A;  4QOZ B;  3OS2 A;  2KSK A;  5M1P A;  4B9M A;  2ETJ A;  3JS6 A;  2LJM A;  4BRD A;  4I6M B;  2N69 A;  1B92 A;  4B1V A;  2A41 A;  4FPB A;  1A5X A;  3H1V X;  1R59 O;  5AZI B;  2O8C B;  3TAP A;  3FGU A;  2HMP A;  3VQ4 A;  3D0P A;  4OO1 J;  3LPU A;  4FW2 A;  4B1W B;  1LOT B;  1W0H A;  1ZBS A;  1C0U A;  4BRO A;  3OBW A;  3L2U A;  2RHK A;  3G71 N;  1BIS A;  1D5A A;  4JK9 A;  2E88 A;  4KH5 A;  1I3A A;  4BE7 B;  4B3T K;  1OH7 A;  2JWL A;  3I0R A; 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