3D2FB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
total genus 116
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2fB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2fB04
1YVNA 4BRAA 5FPMA 2F9WA 1MA9B 2V52B 4BRLA 5JLHA 4O5FA 1HKBA 5F0XA 3CJ1A 1V4SA 1LCUA 3GBTA 1NBWA 4ISFA 1C0FA 3CI5A 2DPNA 4FO0A 4KBOA 4H0VB 4WQ4C 3WQTA 1YUWA 5AQXA 1WUAA 2P9UA 2WUSA 3MN7A 5AQOA 5BPMA 1DKGD 3HM8A 4BRIA 1IJJA 4BRDA 1Q18A 5LY3A 1BDGA 4A2BA 1NGGA 5EX5A 3ZX0A 2HMPA 4CBXA 1HKGA 3CQXA 3VETA 3QB0A 3H6EA 2A42A 4BVOA 2P9PA 1XUPO 3EN9A 4EFHA 4BRKA 3W3DA 3BP8A 4QS7A 4FOIA 1ATRA 3F9MA 3FZLA 1T6CA 3UKRA 3HSCA 2ASPA 2A41A 1E4GT 1KAZA 2P9SB 3AAPA 1MDUB 4IJNA 3SJHA 4CBUA 4CZMA 5EVZA 1CZAN 3TPQA 4EIAA 2ZF5O 2E2QA 4EHUA 1J6ZA 1GLLO 4PL7A 5KPZA 2QWPA 2Q0RA 3AY9A 5KPRA 3MDQA 1HLUA 2E8AA 1U6ZA 1GLCG 2GEMA 2Q31A 1NGEA 3QMLA 1T6DA 2Q1NA 4NO7A 3ZEUB 2I7NA 4JHDA 3D2FA 1X9JA 5BN9A 5AQHA 3DXMB 3ATVA 4B1ZA 1C0GA 2ASMA 3L4IA 3A5MC 3D2EA 2YHXA 4NB4A 4BC3A 3L6QA 3VEOA 2D4WA 4JD2B 3WQUA 4A61A 2FSNA 2QWLA 4FWMA 5ADXH 5EOYA 1Z6RA 3AAQA 2P9NB 3C0BA 3KHYA 3EKSA 3H3OB 2ZGZA 1SAZA 3O80A 1NGBA 3RSEA 2VWBA 3EL2A 4CZHA 4GY2B 1YXQA 1NGIA 4JN4A 3IUCA 3SLCA 1NGFA 4BQZA 3WT0A 2P9LB 3A5NC 3EKUA 2E2OA 2J4RA 3IDHA 2A6AA 2E2PA 5BR9A 4H5NA 3HI0A 2QM1A 2A5XA 4FPAA 2HF3A 2P9UB 4PKIA 3LDLA 3O6WA 2ITMA 4PKHA 4H0XB 4QS9A 2QWOA 3LL3A 5BN8A 1GLEG 2NRHA 4CBWA 3S41A 4PKGA 4FSVA 1BWFO 2QWNA 4XH5A 4BR2A 1T44A 1XC3A 3VEWA 3C7NA 3WXKA 2W40A 3UKRB 3QFUA 3BF1A 1QQMA 4FWOA 2IVOA 4I6MA 4H5TA 1Y64A 3U8XA 2E20A 3CERA 2V7ZA 4Z94A 2GWKA 2V7YA 1X3NA 1NGJA 1QQOA 3ENHA 4QS8A 3U9DA 1ATSA 5AQYA 3TU5A 1ESVA 3LDOA 1P8ZA 3BUZB 4IZ9A 3DXKA 1NLVA 1NGDA 2Q2RA 4PL8A 4BC5A 1BO5O 2FSKA 1HPMA 2NZTA 3FZHA 2UYTA 3VEYA 3FGUA 1G99A 4A2AA 4FWPA 3M3ZA 3W0LA 4MLHA 3AARA 3I8BA 4H0TB 1EQYA 3D7EO 5FPEA 1NGAA 3G25A 3QDKA 3UB5A 1TYQA 3VEXA 4B1YB 4CZIA 5CE3A 5I9EB 2FXUA 4BROA 2OANA 3FZFA 4BRQA 3O8MA 3A0IX 4FWQA 4CZEA 5AQWA 4MLEA 1MWMA 2BTFA 1NGHA 2CGKA 5BPNA 3QICA 4H0OA 1BOTO 4FL9A 4H5WA 3A5OC 4WYBA 5TKYA 5AQUA 2VCPA 3LM2A 4F9OA 4CI6A 3UE5A 2GWJA 5LJWA 4DQ8A 4BR5A 4ISEA 3WEEA 1HX1A 2D1KA 3J8AA 1HKCA 3ENOA 4FPBA 4H5VA 4XEIA 1K8KA 1U2VB 1S3XA 2CGLA 3UKUB 2GELA 2ZGYA 4I6MB 4BRPA 3VEZA 3VF6A 2YHYA 3I33A 5FPDA 2AA4A 4XH4A 2FF3B 4CJ7A 3CETA 4IJAA 2IIRA 5KPTA 1TUYA 4A62A 5AQPA 5EXWA 3HZ6A 1SQKA 4K25A 5EY4A 1RDWX 4IXCA 2Q0UA 3BF3A 1XQSC 1DGKN 5AQIA 4FWSA 5JLFA 1TUUA 3GL1A 5F2RA 4BGAA 5BPLA 5AZIA 3QBWA 4BR0A 1HJOA 2GUPA 3EZWA 1ZXOA 1GLJO 3DJCA 4CZLA 2ASOA 5BRFA 1ZBSA 4CZJA 3JS6A 4BGBA 2EWSA 2P9PB 4BVPA 3VF4A 3O1WA 5AQMA 4DCHA 4FWNA 3VF2A 4GNIA 1MWKA 3LDPA 4WQ5C 3B8AX 5F1XA 2A40A 1BA1A 4L3QA 2P9SA 4K42A 2FLOA 3HBTA 3KVGA 3IMXA 1D4XA 1R59O 3VERA 2E1YA 2PAVA 4FWRA 2H3GX 3VGLA 4CZFA 3BEXA 3A8YA 4BR9A 4RTFD 3CJ7A 2FSJA 3GE1A 3MMVA 2Q36A 3M1FA 4HTLA 5AQFA 3ZEUA 3CIPA 3JXUA 1H1VA 3R9PA 4DHYA 3DXMA 4JHDB 4IWVA 3D2FB 2ZWHA 2YHWA 2KHOA 2E88A 4J8FA 2FF6A 4CZKA 5AZJA 3DAWA 4MO4A 4CZGA 3D2EB 1K8KB 4JD2A 3WXJA 2CGJA 2YCHA 1QHAA 3MN9A 4DB3A 4MO5A 4H03B 3LDNA 4H5RA 4JNEA 3HTVA 1NM1A 3WUHA 1NMDA 4BRNA 2P9NA 1JCFA 3ATUA 3FE1A 5AR0A 3O1BA 3WXIA 3O08A 2QWRA 5AQNA 4B1XB 3FLCO 5AQZA 2QWMA 3RSEB 2F9TA 3GOIA 3O4WA 5ADXA 3H1VX 2P9LA 1BUPA 1BU6O 2HOEA 4FWKA 2P9IA 3SMSA 5BRDA 1BA0A 3LDQA 4XH1A 4BRGA 4M63C 2CH5A 3CQYA 4CD3A 5B8HA 3IFRA 2P9KA 2IVNA 3GG4A 1KXPA 4YDUA 1Z05A 4FOEA 5AZIB 3U9ZA 3VEVA 2E1ZA 2I7PA 2D0PA 4BRHA 3FFKB 2HF4A 2YI1A 1OKJA 3ID8A 3CJCA 1KAXA 1X3MA 3P4IA 4RCHA 3VGKA 2QW9A 3LM9A 3ULEA 4BQLA 3ZETA 1SZ2A 1ZC6A 3GDQA 3C7NB 3SMPA 1JCGA 3MK6A 3DWLA 4FWLA 5AQRA 5KQ8A 3FZMA 4Y0WA 2BUPA 1KAYA 3ZX2A 4AM7A 1V4TA 1QZ6A 4JAXA 3A5LC 4M7XA 2QWQA 4WQ5A 1IG8A 2Q97A 3H46O 3M6GA 5KQDA 3VGMA 4YDUC 3H3NO 5AQQA 1GLFO 3FZKA 5AFUA 1RFQA 3L0QA 3R6MA 5AZJB 5AQTA 3DXKB 1E4FT 1NWKA 3H45C 4H0YB 4AM6A 1S22A 4BG8A 1WOQA 2CH6A 4RWTA 4B1WB 4BRFA 5AQKA 4K41A 4B1UB 4BG9A 4BR4A 4H0PA 4EAHD 2PBDA 4B1VA 4BC4A 3H1QA 3OHRA 3SK3A 4BRCA 3CJBA 2V51B 4K43A 4O8KA 1QQNA 5LJVA 3U4LA 4ISGA 1RGIA 4BRMA 5AQVA 3WXLA 1YAGA 1TYQB 3ZX3A 3QFPA 2IVPA 2P9IB 2YJEA 5E84A 3O5BA 5AQLA 2P9KB 3FR0A 2NLXA 5BREA 4M7YA 3QBXA 4B9QA 3CJAA 4HWIA 3MN5A 1NGCA 3R8EA 2AP1A 1LOTB 5JICA 3CHWA 2A3ZA 3CJ9A 5AQJA 2GTDA 4E1JA 1QZ5A 4WQ4A 2QXLA 4BREA 1GLBG 3VOVA 4LC9B 3ULEB 5FPNA 3ZETB 3WEEB 3KZBA 2W41A 3MCPA 2D0OA 5AQSA 1GLDG 3VESA 5AQGA 1U2VA 3MN6A 4C23A 1DEJA 2E2NA 5ELZA 3UKUA 3VPZA 4EHTA 1BG3A 1JCEA 4BR7A 5BRHA 4BC2A 5E26A 5AFUH 2YJFA 4CD1A 3VENA 1GLAG 3EO3A 1HUXA 5JMVA 2VYPA 1ATNA 4IO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YVNA 3MECA 1MA9B 2V52B 4BRLA 5JLHA 1RT3A 4FJ8A 3D6RA 3DRRA 1WLJA 3P83D 4DR4K 4H8KA 1N8RO 4CJWA 4DTJA 3CI5A 3TTDA 4FO0A 4KBOA 3KIOA 3G10A 3TSQA 1LWEA 4FVUA 1N6QA 2O8FA 3L2QA 1SL0A 3MN7A 1BIZA 1DKGD 4BRIA 5LY3A 1CN2A 1NGGA 3ZX0A 1RILA 3KHWA 3A2FA 3ASMA 2UUAK 1QSYA 1XUPO 3DRSA 1VQNN 4EFHA 1NK5A 4BRKA 3T69A 3HM9A 4FZYA 1ATRA 2F7TA 3FZLA 3HSCA 3KD5E 1WBBA 3WXMB 4CESA 5KK4A 1NE5A 1KAZA 4CJPA 1SKRA 4DF4A 1QHTA 1CZAN 1KQSM 1KC8O 2ZF5O 2E2QA 2VGMA 1NJXA 4GV3A 4EHUA 2Q0RA 4CHPA 1ZBHA 1I2VA 3ZT4A 3AY9A 5KPRA 3CCQN 1HLUA 4FM1A 1KRPA 2KW4A 1U6ZA 4NO7A 1HNWK 1T6DA 4DU1A 2QKKA 4IKFA 4FJLA 3DLRA 2LY5A 4M3UA 1MR4A 3L4IA 4M3WA 4Y1DA 3SYZA 1T7PA 4EP5A 2FSNA 4N41A 4B3TK 4FJHA 4V19S 4DQPA 4IDHA 1U48A 2KGQA 4DR1K 1YHQN 3KHYA 3EKSA 4OX9K 5FRMA 4DTXA 1SAZA 1NGBA 4YOWA 3RSEA 2VWBA 1OZZA 4CZHA 4FM2A 1TK0A 2C1IA 4JN4A 3SLCA 3Q7BA 2XY5A 4BDYA 2P9LB 4OLBA 2LJMA 2E2FA 3IDHA 3CCMN 2A5XA 4FPAA 2HF3A 3DMJA 1OMYA 4PKIA 1LAWA 3RR7A 2ITMA 3E7RL 3E66A 4O44A 2MN5A 3GKUA 5MLCQ 1B7DA 1ZBFA 2RF2A 1VQ9N 3LZJA 2QWNA 2HHHK 4M42A 4BR2A 2ITGA 3CM6A 2HSTA 3V1RA 2RN2A 2HHSA 4CGDA 4OPHA 3KOXA 3P5JA 3VQQA 3TTFA 2HHWA 3CG7A 2E20A 2W6LA 1OH7A 1NGJA 2YNFA 4NXNK 3VQ5A 4G1QA 1ESVA 3BUZB 4F2SA 4F4KA 1PX9A 1R0AA 1NKCA 1IKVA 1HPMA 2NZTA 4LH4A 2BH1A 5FROA 4KREA 4IG0A 2VGNA 4CJTA 3HOSA 3M3ZA 1C6VA 3NE6A 3I8BA 4H0TB 3P38A 5HRRA 3CCRN 4FZXC 1NJWA 1NGAA 1NK0A 3QDKA 2KBHA 4E89A 2P51A 4CHZA 4E7KA 4CZIA 3CCUN 2OANA 4NCAA 2LY6A 1ZYVA 2KFNA 4CF0A 5AQWA 4X65K 4KB0A 3ZSXA 5BPNA 4LY7A 2GV9A 1BOTO 4FL9A 3A5OC 3QLHA 4WYBA 2SN3A 5AQUA 3MWPA 4N5SA 2KZZA 1TAUA 3K59A 1VSEA 1IBMK 3CCEN 5T7BA 3NF9A 4BR5A 4DQ8A 4O55A 1W2BM 1RBTA 4R79A 1B3CA 3J8AA 3VQEA 1HKCA 5KTQA 3SCXA 1C0MA 4NCGA 4Z4IA 4FJMA 4CHNA 2YC1C 4XJXA 3AO3A 4UAFE 2GELA 3S3NA 2UXBK 3NH2A 2ZGYA 3VQ7A 4F3TA 4ILJA 3O3HA 3WNGA 3I33A 4AHRA 4I2PA 3KD1E 2WC9A 2YX6A 5FPDA 4DTPA 2AA4A 4CHYA 2KTQA 2QK9A 3CETA 3EYZA 2JWLA 4U7BA 5LL6Z 4W5NA 4JKDA 3CQ8A 4IXCA 5GAHP 2HHUA 3BF3A 5CHIA 5AQIA 3N4PA 2HMIA 1JKHA 3RRGA 5F2RA 3N4QA 3NH1A 5BPLA 4DFMA 2GUPA 1BISA 1VQ7N 1NK7A 1BCOA 1JLCA 3ZSQA 4IFEA 1L3UA 3EEQA 1D5AA 4DV4K 1ZBSA 4CZJA 3JS6A 1VSMA 3QEVA 3VF2A 4GNIA 1JL2A 3B8AX 1NKBA 4L3QA 4FLVA 1S9GA 3JAMO 4FJXA 2P9SA 3KVGA 1D4XA 1R59O 4ELUA 2HBLA 2YKNA 2FC0A 3T1HK 4MDAA 1HYSA 1QVGM 4IDKA 3MMVA 1LAVA 3J80O 2OA8A 3BDPA 2Q36A 4C8OA 4AAZA 3I8DA 4HTLA 3ZEUA 2G8FA 1H1VA 1CLQA 3SV3A 3VQ9A 1ZFUA 3SNNA 2FF6A 5AZJA 3DAWA 3ULDA 2ETJA 4KI6A 3E01A 1TVRA 1QHAA 4DR7K 4MO5A 3OS2A 2VY6A 3V9UA 4N76A 4BRNA 3LAMA 1HR0K 3NF8A 1ZBIA 3O1BA 1RT4A 3QIOA 1WAJA 4B1XB 3FLCO 1ZYQA 4UJ0A 2QWMA 1JLFA 3O4WA 3PX0A 5KRSA 1BUPA 1HQEA 5M1OA 1EWQA 2NRVA 1NMNA 3I56N 1RT7A 2FBXA 3LDQA 3SJJA 4XH1A 4OO1J 4M63C 1ITGA 1VAZA 3GG4A 3OYIA 4KHNA 1S6PA 4FOEA 4YDUA 3VEVA 2E1ZA 5C42A 1WNSA 3ITHA 4LF5K 1NRAA 2YI1A 3LPUA 1X9WA 1RT1A 1NPIA 3CJCA 4RCHA 3O9UA 2QW9A 2DFEA 4OGCA 3PSFA 4BQLA 1ZC6A 1YF5L 3C7NB 3TR8A 1KFDA 3ALYA 1U49A 5JS1A 4FWLA 5AQRA 4PQUA 2F8TA 1SKWA 3OYJA 3T7ZA 4E19A 4JAXA 2NNWA 4WQ5A 4AHCA 1K9MO 1IG8A 3SF4D 2Q97A 1Q9XA 1AHOA 3LANA 1NOZA 1OVQA 1C1AA 4I2QA 5AZJB 4CJEA 3DXKB 1NWKA 3H45C 4H0YB 3T19A 4O5BA 3KLEA 4JI7K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YVN A;  3MEC A;  1MA9 B;  2V52 B;  4BRL A;  5JLH A;  1RT3 A;  4FJ8 A;  3D6R A;  3DRR A;  1WLJ A;  3P83 D;  4DR4 K;  4H8K A;  1N8R O;  4CJW A;  4DTJ A;  3CI5 A;  3TTD A;  4FO0 A;  4KBO A;  3KIO A;  3G10 A;  3TSQ A;  1LWE A;  4FVU A;  1N6Q A;  2O8F A;  3L2Q A;  1SL0 A;  3MN7 A;  1BIZ A;  1DKG D;  4BRI A;  5LY3 A;  1CN2 A;  1NGG A;  3ZX0 A;  1RIL A;  3KHW A;  3A2F A;  3ASM A;  2UUA K;  1QSY A;  1XUP O;  3DRS A;  1VQN N;  4EFH A;  1NK5 A;  4BRK A;  3T69 A;  3HM9 A;  4FZY A;  1ATR A;  2F7T A;  3FZL A;  3HSC A;  3KD5 E;  1WBB A;  3WXM B;  4CES A;  5KK4 A;  1NE5 A;  1KAZ A;  4CJP A;  1SKR A;  4DF4 A;  1QHT A;  1CZA N;  1KQS M;  1KC8 O;  2ZF5 O;  2E2Q A;  2VGM A;  1NJX A;  4GV3 A;  4EHU A;  2Q0R A;  4CHP A;  1ZBH A;  1I2V A;  3ZT4 A;  3AY9 A;  5KPR A;  3CCQ N;  1HLU A;  4FM1 A;  1KRP A;  2KW4 A;  1U6Z A;  4NO7 A;  1HNW K;  1T6D A;  4DU1 A;  2QKK A;  4IKF A;  4FJL A;  3DLR A;  2LY5 A;  4M3U A;  1MR4 A;  3L4I A;  4M3W A;  4Y1D A;  3SYZ A;  1T7P A;  4EP5 A;  2FSN A;  4N41 A;  4B3T K;  4FJH A;  4V19 S; 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