3D2FB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Chaperone
total genus 116
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2fB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2fB04
2KHOA 3DXKB 5ADXH 1ATRA 4M7YA 1GLLO 1HKBA 2AP1A 4H0YB 4FWLA 4K41A 3R8EA 4HWIA 4FOIA 5LJWA 3EO3A 2Q1NA 3DXMA 3C7NA 2A40A 3MN7A 4LC9B 4BQLA 4I6MA 4H0XB 3LDPA 3HZ6A 3A5LC 1RFQA 5AQKA 2CGLA 4RCHA 5AQOA 1GLJO 3DAWA 1TUUA 1ESVA 3KHYA 4JD2B 4K42A 1J6ZA 5JLFA 2VWBA 4BRLA 3JXUA 3H46O 1DEJA 2NLXA 2I7PA 4MLHA 4XH4A 4BRAA 4GY2B 1NGAA 4K43A 4BRHA 1TYQB 3HSCA 3LM9A 2D4WA 1KAYA 4B1ZA 1D4XA 4AM7A 1E4GT 3O5BA 5AQPA 3L6QA 2P9KA 3UE5A 3R6MA 4BC4A 3ZX3A 1R59O 3HBTA 3LDNA 2E2NA 5AZIB 1MWKA 2QM1A 3UKRA 2FXUA 1NGDA 4H5TA 5KQDA 4M7XA 4A2BA 4BRFA 1WUAA 4FWKA 4H0OA 3QMLA 2GEMA 4CZLA 3VERA 1JCGA 1XQSC 5BN8A 4XH1A 4H5VA 5KPRA 3VF4A 3CJ9A 3UKUA 5BPNA 1QHAA 3JS6A 4H0TB 4WQ4C 1HKCA 4FWMA 3QFPA 3VGKA 1DGKN 3ZETA 1KAXA 3MK6A 1K8KA 4C23A 2QWLA 3LDLA 1P8ZA 4BGBA 5AZJA 5BPLA 3FR0A 3VETA 3MMVA 4CZEA 3WEEA 3ENHA 2D0OA 1T44A 4JNEA 4MLEA 3U9ZA 5F1XA 5AQIA 3EKSA 1NGIA 2YI1A 3I8BA 2BUPA 4WQ5A 4BREA 3AAQA 4PKIA 5E84A 1S3XA 2QWOA 1HKGA 2A5XA 3VEWA 3VPZA 2P9KB 3FZMA 5JMVA 2GUPA 2ASPA 2J4RA 5FPDA 3AARA 3O1WA 3BEXA 2Q31A 3VGLA 1X3NA 1YAGA 4FWOA 3L4IA 3QFUA 1QZ6A 4BRNA 1ZXOA 1NGBA 5TKYA 1E4FT 4DCHA 4BC5A 1NGJA 4KBOA 3ID8A 3M3ZA 1ZC6A 4XH5A 2QWPA 3FZKA 1GLDG 1KAZA 3H6EA 5F2RA 3ULEB 3WXLA 4BRDA 4B1YB 4Y0WA 4A2AA 1QQMA 1RDWX 3DWLA 3H1VX 2ASOA 3VEVA 1K8KB 4H5WA 3J8AA 3IMXA 3GG4A 2P9IB 5KQ8A 3SJHA 4DB3A 1NLVA 4QS8A 3WEEB 1BUPA 2QWRA 1NBWA 3A5MC 3VEXA 1SAZA 2E2QA 3IDHA 5EXWA 2QWMA 3O1BA 2P9PB 2W41A 4IXCA 4PL7A 5AQQA 4BR4A 2CH6A 2NZTA 1NMDA 2IVNA 5AR0A 4YDUA 1XUPO 2OANA 1X3MA 2CGKA 4B9QA 3KVGA 2IVOA 3U9DA 4NB4A 3ZX0A 3IUCA 3TPQA 4BQZA 4IO8A 1GLFO 2I7NA 4H03B 1QQOA 4FL9A 2HMPA 2P9UB 2W40A 5AQWA 3QB0A 4FOEA 3WT0A 1ATNA 4BG9A 2HOEA 4ISFA 3D2EB 5AQRA 2WUSA 3MN5A 3O8MA 3H3NO 3GDQA 1Z05A 5B8HA 4RWTA 1KXPA 3FFKB 5AQTA 1DKGD 5CE3A 3FZHA 3U4LA 4WQ5C 3GOIA 4K25A 4CZFA 2NRHA 2FSJA 4MO5A 4FSVA 1BO5O 4O5FA 1GLCG 5BPMA 1X9JA 2Q97A 2P9SB 3M1FA 2IVPA 3SMSA 4BR7A 5AQJA 3VEZA 4MO4A 1ATSA 3D2FA 2ASMA 3EKUA 5E26A 1Z6RA 3AY9A 3DXMB 3C7NB 4EHUA 4EFHA 4DHYA 4I6MB 1SZ2A 3EN9A 2CGJA 4BG8A 2E20A 4BRIA 3HM8A 4FWNA 2P9LA 2FSNA 2EWSA 4EAHD 4BC3A 3FE1A 4IJAA 2PAVA 4FWSA 2V7YA 1JCEA 2ZWHA 4QS7A 3QDKA 3S41A 2H3GX 2CH5A 3F9MA 3WXKA 2BTFA 4BROA 3A8YA 2A42A 3WXJA 1BA0A 5KPTA 4A62A 4BRPA 4B1UB 5LY3A 3MN6A 2UYTA 5EY4A 5BR9A 5AQYA 5AQSA 3QICA 2P9NA 2ITMA 1HJOA 5F0XA 4BR5A 5AQUA 3UKRB 1WOQA 3BUZB 3WQTA 3LM2A 4CZKA 3WXIA 3QBXA 2IIRA 4NO7A 3HTVA 4EIAA 5LJVA 3W3DA 3A5NC 4BVPA 4CD3A 1NGGA 2YJEA 3SMPA 5AQGA 4BRCA 4CD1A 2V7ZA 1MA9B 2QXLA 5EX5A 4BRQA 2GTDA 2VYPA 1GLBG 2GWJA 4PKGA 5BRDA 1TUYA 1BOTO 3CJAA 3UKUB 2Q0RA 3H1QA 1QQNA 1V4SA 2QW9A 3ZETB 3CJ1A 4AM6A 5BRHA 4IWVA 3D7EO 3QBWA 3LDOA 4JD2A 3R9PA 2F9TA 5AZJB 5AQNA 5JLHA 3ATUA 3L0QA 1RGIA 2VCPA 2Q0UA 1BA1A 4BR9A 2E8AA 4CBXA 1TYQA 1C0FA 4ISGA 3UB5A 4FWQA 1BG3A 5AQHA 4FPAA 3H45C 3OHRA 1LOTB 3CQXA 5AQMA 3LL3A 5AZIA 2YJFA 2HF3A 1EQYA 1BDGA 2V52B 3M6GA 4ISEA 4J8FA 1JCFA 3CQYA 4H0PA 2E2OA 4BR0A 5AQLA 2D0PA 1GLEG 2E1ZA 1U2VA 2V51B 2QWNA 3AAPA 4M63C 3CHWA 5BRFA 2FF3B 3VF2A 2HF4A 3GE1A 5BREA 3CJCA 4BGAA 2F9WA 4B1VA 4BRGA 3MCPA 4BVOA 3ZX2A 5FPNA 1T6DA 3VOVA 4H5NA 1BWFO 1MWMA 2FF6A 5EVZA 4CI6A 2A3ZA 4CBWA 4B1XB 4CZGA 3FLCO 3EL2A 3VGMA 3U8XA 1HX1A 2FSKA 3FZFA 1IJJA 3ATVA 5BN9A 4JN4A 3VEOA 4BC2A 4CBUA 1YVNA 1NM1A 3KZBA 1CZAN 4H0VB 4BRKA 4IZ9A 5AFUA 3C0BA 1NGFA 4GNIA 1IG8A 3BF3A 2A41A 3CJ7A 5ADXA 1V4TA 3A5OC 4BRMA 4CZJA 2E2PA 5ELZA 2YHXA 2E1YA 3B8AX 4L3QA 1SQKA 3HI0A 3O08A 1YXQA 1S22A 3WUHA 4FWPA 2ZF5O 1U2VB 1G99A 5I9EB 4XEIA 4FPBA 3ZEUA 1BU6O 1HLUA 4JHDA 2A6AA 3RSEA 4EHTA 2YCHA 3GBTA 3ULEA 4CZMA 4FWRA 2YHWA 4WYBA 3GL1A 2Q36A 1NWKA 2ZGZA 1HPMA 4BR2A 4CZIA 5KPZA 4CZHA 3CIPA 4F9OA 1C0GA 3O6WA 2P9IA 3BF1A 1Q18A 3SLCA 3FGUA 3VEYA 3WQUA 3P4IA 4PL8A 3FZLA 3O80A 1YUWA 3DXKA 2D1KA 4B1WB 3D2FB 2GWKA 1XC3A 4PKHA 3VF6A 4IJNA 4CJ7A 3IFRA 4YDUC 2P9PA 1GLAG 1T6CA 1MDUB 1U6ZA 3CI5A 1HUXA 3G25A 2E88A 1LCUA 5JICA 1NGHA 3ENOA 2P9LB 3DJCA 4FO0A 5FPEA 4O8KA 4Z94A 2GELA 3MN9A 3EZWA 5AQXA 2DPNA 3H3OB 2ZGYA 5AQVA 4WQ4A 4H5RA 2YHYA 5AQFA 3ZEUB 3I33A 5AQZA 1Y64A 1QZ5A 4JHDB 2P9UA 3RSEB 3BP8A 3VENA 5FPMA 1OKJA 3TU5A 3O4WA 1NGCA 3D2EA 4QS9A 2P9NB 4HTLA 2Q2RA 4DQ8A 2QWQA 3CETA 3SK3A 4E1JA 3A0IX 3VESA 1H1VA 3MDQA 5AFUH 4JAXA 4RTFD 1NGEA 3CERA 4A61A 2AA4A 3CJBA 3W0LA 3LDQA 1ZBSA 2P9SA 5EOYA 2FLOA 2PBDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSIA 4KPYA 1GLLO 5E41A 1XHXA 2AP1A 3DLEA 4H0YB 4HWIA 1UGLA 2QTDA 2HHWA 3AVCA 3EO3A 2UXCK 1IBMK 3C7NA 3ITHA 3HZ6A 2ZJPL 3A5LC 1KQSM 1RFQA 2W6KA 3P83D 4QAGA 3ENBA 3DAWA 3KHYA 3CPEA 4JD2B 1VSJA 2BGGA 1NMNA 4DR7K 1I6FA 3KD1E 2D0AA 3AV9A 1T03A 3L2RA 4J2DA 4MLHA 3S3NA 1YT3A 2NRVA 5EU7A 4CGHA 1RDAA 1EKEA 4GKKK 4CFBA 1X1PA 3UE5A 4PHTX 3ZX3A 2HBMA 4DTJA 3ZT2A 1ZYWA 3UKRA 3B6PA 5KQDA 3SUPA 4A2BA 1WUAA 1ICAA 4CF0A 3VERA 2YV0X 1TAUA 1XQSC 4FXDA 3C6AA 4DTNA 2WFBA 4JV5K 1TK5A 4XH1A 4JKDA 1DT9A 1MR4A 5BPNA 5GIPA 3JS6A 5KI6A 4H0TB 4WQ4C 5LMUK 4FWMA 4IDHA 3QFPA 1TKDA 2HMIA 1DGKN 4K8ZA 1UWBA 1KAXA 1WN7A 1K8KA 2QWLA 3LDLA 1SKSA 1L3TA 1VHXA 3V9WA 2ASCA 3VETA 4JRPA 3PLAA 3OJUA 4G1QA 4CVNE 3WEEA 3ENHA 3AVHA 3DLRA 4JNEA 1RBVA 5AQIA 3OS2A 1L3UA 4BREA 1HJRA 1S3XA 2QWOA 1DTQA 3ZSOA 2UUAK 1U4BA 5JMVA 2GUPA 2ASPA 4J2AA 2OTJN 1X9SA 2J4RA 4BECA 4YOUA 4FYDA 3O1WA 1NU0A 3BEXA 1KD1O 1YAGA 4CGIA 2QXFA 3ZSQA 1NJIO 4X66K 3QFUA 4M42A 1QZ6A 4BRNA 1ZXOA 3KJVA 3QEVA 4CQKA 2KJAA 2XO7A 1E4FT 2YNHA 4DCHA 4KBOA 1XWLA 1I39A 4GV6A 1IBLK 4LF9K 3M3ZA 4CFAA 3J7AP 4OPJA 1GLDG 1I6GA 2G8KA 4BRDA 3OYCA 4B1YB 1S9GA 3NFAA 4CK1A 4JS5A 2F8SA 2O8EB 1UAXA 3VEVA 2ASOA 3SAFA 2HVHA 1GPSA 5SZTA 1NJWA 4OGEA 4DTPA 1I2UA 2QWRA 4LY7A 3BDPA 4FJ5A 2HBKA 3IDHA 4CHPA 4BEBA 5JVHL 1AHOA 3HL8A 4FJGA 2P9PB 4IXCA 4PL7A 5A2QO 4BR4A 5GAEP 4NCGA 4F4KA 2CH6A 4E0DA 4PWDA 2IVNA 4DKWA 5AR0A 5JS2A 4JKCA 4B9QA 4LD0A 4M3UA 4NB4A 3PO4A 3AVAA 4FL9A 2HMPA 4OO1J 1TAQA 2HOEA 1N34K 3VQ7A 5GINA 5B8HA 1SKRA 1DKGD 3DLHA 3TSQA 4WQ5C 4JRQA 4KV8A 2HB5A 2XY7A 2FSJA 1XMOK 4ELTA 3TAPA 3DRSA 1KFSA 1X9JA 2Q97A 1BGXT 2IVPA 3E9OA 3SMSA 4DU4A 2OZMA 4Z4CA 2A1RA 1KFDA 5E26A 3DLKA 4A5BA 3C7NB 2VWJA 3L2VA 4DHYA 2LR3A 4BG8A 3MEGA 3SQ4A 3DYAA 4FWNA 1Y97A 4EAHD 3OYIA 4IJAA 1HYSA 4FWSA 3AA5X 1VQ8N 4OKKA 4IFEA 4QS7A 1PE4A 3S41A 4CEEA 1S1TA 3F9MA 2RHKA 4K8XA 3RMDA 5JENA 3A8YA 1P0AA 3CCEN 3WXJA 2F96A 3TAEA 4FLYA 3AA4A 3MN6A 4CJLA 2UYTA 2RN2A 5EY4A 3IRXA 5AQYA 2XY5A 2VGMA 3QICA 3PIPL 1LV5A 3CG7A 1HJOA 1SV5A 1C55A 1C0UA 5AQUA 3UKRB 1WOQA 3BUZB 3WQTA 3H08A 4E7KA 3QBXA 4IG3A 3O3FA 4BDPA 3BK3C 1RILA 2HHUA 4O0IA 3L2WA 1NK7A 4ID1A 3SMPA 4CD1A 2V7ZA 4DTMA 4I9LA 5EX5A 1RTJA 1GLBG 4KH4A 3MECA 5BRDA 5M1KA 5FLXO 3P1GA 3LAKA 3AO2A 1V4SA 3BGRA 5KRTA 3P38A 4V1DC 3R9PA 3KLHA 5DM7L 5AQNA 4KHPK 1ZFUA 3AVFA 2PFUA 1QS4A 1RGIA 1WSGA 3L0QA 4DFKA 3KTQA 2F7TA 4NXNK 4JLHA 3TSPA 2E8AA 1OH6A 4FWQA 4JI1K 4CGFA 5AQHA 2JGUA 3H45C 3OY9A 1L4VA 3VQ8A 3N4QA 3PSMA 1CHZA 2HF3A 1ZBLA 1I3AA 3CYGA 1JCFA 4JKAA 4I2QA 2QA4N 1D5AA 1RTHA 4HUGA 1S1WA 3LZJA 1LW2A 1HQUA 1KV0A 1U2VA 3OYLA 2V51B 3KLIA 4FJ8A 2OCEA 5JVGL 4Z4GA 2PYJA 4BGAA 1WWNA 4YHHK 4B1VA 4BVOA 4CEZA 3E7UX 1NK4A 3L56A 2D0BA 1T6DA 2FBXA 2VG6A 4B8AB 4X65K 4FJKA 2A3ZA 3QEWA 4CZGA 3LP1A 4GMJB 1HX1A 4CJ3A 3AO1A 1RBUA 1YVNA 4Q5VA 4B3RK 4FJ7A 5AFUA 3C0BA 3VQEA 2OPSA 4FJLA 1NGFA 4JKGA 4KO0A 3OYGA 1A5WA 3BF3A 4JI0K 1LAVA 2IOCA 3CJ7A 4BE7B 4BRMA 3G0ZA 5H1SQ 3NGYA 5AJ3K 1NPIA 3V81A 3RR8A 2YHXA 3LP2A 1ASVA 3Q7CA 2E1YA 3B8AX 4L3QA 4B3SK 3I55N 1NOYA 1S22A 4FWPA 3QI7A 1KC8O 5LMNK 2KZZA 4XJXA 3C6HA 1XNQK 4W5OA 1KTQA 1TK0A 4I2PA 4CK3A 3RSEA 3AVJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VSI A;  4KPY A;  1GLL O;  5E41 A;  1XHX A;  2AP1 A;  3DLE A;  4H0Y B;  4HWI A;  1UGL A;  2QTD A;  2HHW A;  3AVC A;  3EO3 A;  2UXC K;  1IBM K;  3C7N A;  3ITH A;  3HZ6 A;  2ZJP L;  3A5L C;  1KQS M;  1RFQ A;  2W6K A;  3P83 D;  4QAG A;  3ENB A;  3DAW A;  3KHY A;  3CPE A;  4JD2 B;  1VSJ A;  2BGG A;  1NMN A;  4DR7 K;  1I6F A;  3KD1 E;  2D0A A;  3AV9 A;  1T03 A;  3L2R A;  4J2D A;  4MLH A;  3S3N A;  1YT3 A;  2NRV A;  5EU7 A;  4CGH A;  1RDA A;  1EKE A;  4GKK K;  4CFB A;  1X1P A;  3UE5 A;  4PHT X;  3ZX3 A;  2HBM A;  4DTJ A;  3ZT2 A;  1ZYW A;  3UKR A;  3B6P A;  5KQD A;  3SUP A;  4A2B A;  1WUA A;  1ICA A;  4CF0 A;  3VER A;  2YV0 X;  1TAU A;  1XQS C;  4FXD A;  3C6A A;  4DTN A;  2WFB A;  4JV5 K;  1TK5 A;  4XH1 A;  4JKD A;  1DT9 A;  1MR4 A;  5BPN A;  5GIP A;  3JS6 A;  5KI6 A;  4H0T B;  4WQ4 C;  5LMU K;  4FWM A;  4IDH A;  3QFP A;  1TKD A;  2HMI A;  1DGK N;  4K8Z A;  1UWB A;  1KAX A;  1WN7 A;  1K8K A;  2QWL A;  3LDL A;  1SKS A;  1L3T A;  1VHX A;  3V9W A;  2ASC A;  3VET A;  4JRP A;  3PLA A;  3OJU A;  4G1Q A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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