3D2FB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
b'AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Chaperone
total genus 116
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2fB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2fB04
4BR9A 1MWMA 4BC2A 4MLHA 3MK6A 5B8HA 3ID8A 3ZX0A 4BRLA 3OHRA 3LDLA 2J4RA 3QB0A 4FWOA 3D2EB 4BQZA 1YVNA 4JD2A 4XEIA 3EL2A 5F1XA 1TYQB 1ATNA 3MN9A 3QFUA 5AZIB 3UKUB 3ULEA 1GLFO 1GLCG 1NLVA 1NGAA 5AQZA 2P9IA 3KHYA 4CJ7A 1YUWA 2I7NA 5AQMA 3BF1A 2DPNA 2CH6A 3R8EA 3GL1A 1U6ZA 2E2OA 4BR5A 3LDPA 4BRGA 4H5WA 1RGIA 4CD3A 4IO8A 2AP1A 5TKYA 1LCUA 4H5VA 5EVZA 1G99A 1HUXA 3CQYA 5AFUA 3VEYA 1CZAN 2QWMA 3HZ6A 1QZ5A 3DXMA 4WYBA 3VOVA 2GWKA 5AQHA 4M7XA 3C0BA 4GY2B 1KAYA 3GOIA 4FSVA 3JS6A 3CJAA 3MCPA 3IFRA 3WXKA 2YJFA 1E4GT 4BVPA 3ATUA 3FZFA 3CERA 3ENOA 1HLUA 3EN9A 4Z94A 5AQOA 1Z6RA 3EKUA 4IXCA 4BG8A 4BROA 5KQ8A 2D1KA 5BRDA 3HBTA 2ZF5O 3BF3A 3QMLA 3FLCO 3U4LA 2YHXA 1GLJO 2GWJA 4K41A 3ULEB 3O8MA 1KXPA 5AQRA 1H1VA 1BG3A 2IIRA 1RFQA 1BA0A 2QWOA 4BRDA 3AAPA 3H46O 5BN8A 2P9PA 3L4IA 5AQPA 2ASMA 2YI1A 3FZHA 4A2BA 5AQYA 1BDGA 1HKGA 3BEXA 1XUPO 3M3ZA 2HF3A 4M7YA 4WQ5C 2KHOA 3DJCA 1HJOA 4IZ9A 3DXMB 3F9MA 3M1FA 3A5OC 3D2EA 4E1JA 3VEZA 1C0FA 3CHWA 4Y0WA 1P8ZA 3J8AA 3P4IA 3JXUA 1XC3A 3MDQA 3U8XA 3SMSA 4IJNA 4B1VA 2FF6A 4HWIA 2FXUA 3VF4A 4L3QA 3GDQA 4H5RA 5LJVA 2P9SB 1ZBSA 3O6WA 5AQVA 4YDUC 3DXKA 2WUSA 3FR0A 1GLLO 2GTDA 5EXWA 1T6CA 2E1YA 5KPZA 4CZLA 4H0OA 5ADXA 1KAXA 3FGUA 5BPLA 3CJ1A 1TUUA 2ASOA 3CJCA 4PKHA 2D0PA 2ASPA 4RTFD 1JCEA 1BU6O 4FOEA 4CZJA 4BR2A 3ZETA 4JN4A 4H03B 1IJJA 3SMPA 2P9KB 4AM7A 3FZMA 1YXQA 4CBXA 5KQDA 4H0VB 3A5NC 2CGKA 4BRQA 1ESVA 4DQ8A 2QWQA 5CE3A 3FFKB 3VEOA 3R9PA 4KBOA 4BG9A 3SK3A 4PKIA 3WXIA 1MWKA 2E2NA 1NGBA 5E26A 3HI0A 3RSEB 1NMDA 3ZEUB 3BUZB 2A40A 4F9OA 5F2RA 5F0XA 3DXKB 1ATSA 2ZGYA 3VERA 1D4XA 2VCPA 3S41A 4H0XB 4FO0A 2Q0RA 4B9QA 2HOEA 1QHAA 4NB4A 1BA1A 2Q2RA 4BR4A 3WT0A 2E2QA 1HX1A 1K8KA 2GEMA 1R59O 1NGHA 2AA4A 4BQLA 3LM2A 5AZJA 3ZX3A 5AQXA 4QS7A 4BC5A 2E88A 3ZETB 2FLOA 1C0GA 2QWRA 5AQNA 2IVNA 3DAWA 3LL3A 3IDHA 4EAHD 5AQLA 5BN9A 5EY4A 5JICA 4QS8A 3BP8A 2P9SA 5FPNA 2HF4A 3WQTA 4GNIA 4CZMA 3U9ZA 2CH5A 4J8FA 5LY3A 3VGKA 4PL7A 4BREA 2A6AA 1OKJA 4FWSA 5BPNA 5AFUH 3HM8A 1XQSC 3GBTA 4FOIA 2ZGZA 1QQOA 3SLCA 1BWFO 1NGFA 2A41A 1BO5O 4CZFA 3C7NB 3AARA 2P9KA 3CJ9A 2E2PA 3TU5A 3WUHA 4O5FA 3FE1A 5AQGA 3H1QA 3VGLA 4BR0A 1K8KB 3VENA 2YJEA 4H0PA 2FF3B 5AZJB 3A5LC 1S3XA 2IVPA 2Q31A 3WXLA 2OANA 4BRAA 5AQKA 2Q0UA 5AQFA 4JNEA 3AY9A 2P9LB 1GLBG 3H3OB 3QDKA 4EFHA 4CI6A 1T44A 1GLDG 3RSEA 2V7ZA 4K42A 4H0TB 3O1BA 3LDQA 3VETA 4AM6A 2H3GX 5E84A 3ZEUA 2P9UA 2I7PA 4WQ5A 3O4WA 3VF2A 2F9TA 3VEWA 3CI5A 4CZGA 5FPMA 3LM9A 4BRNA 3MN6A 3QBWA 5JLFA 1NGIA 5FPEA 4DB3A 4B1WB 2QXLA 3O80A 3EO3A 2ITMA 4I6MA 4M63C 4IJAA 2P9NB 3M6GA 2NZTA 2GELA 4FWLA 2YCHA 4BRIA 3D7EO 4FWQA 5EOYA 1GLEG 2GUPA 1QQNA 3I8BA 4YDUA 2QM1A 5AQWA 3HSCA 3VPZA 1DEJA 3WEEB 2D0OA 3WXJA 4CBUA 5BRFA 3H45C 3O08A 3MMVA 2A5XA 3HTVA 3GE1A 4BRFA 3L6QA 3CIPA 3QBXA 3DWLA 2Q97A 1WUAA 4MO5A 3B8AX 4H5NA 4HTLA 2FSJA 2UYTA 4MLEA 3TPQA 4K25A 1WOQA 3UKRB 3LDNA 4A2AA 4ISFA 1NGGA 3L0QA 3MN5A 1SAZA 3O5BA 2CGJA 4H0YB 2P9UB 1NWKA 1Y64A 4XH4A 1NBWA 3VGMA 1GLAG 3A8YA 3C7NA 5AQIA 5BPMA 2YHYA 1SZ2A 2PAVA 4I6MB 2Q1NA 4BRCA 4CZHA 4FWKA 5JMVA 3SJHA 3LDOA 1S22A 4BC4A 3W3DA 3D2FB 4JAXA 3AAQA 4PL8A 2P9LA 3H6EA 3WQUA 3QICA 4FL9A 3EKSA 2V7YA 1X3MA 4DCHA 1T6DA 1V4SA 3VEXA 4CD1A 2QWLA 4B1ZA 1QZ6A 1NM1A 5AQJA 1U2VA 4C23A 3R6MA 4A61A 1ATRA 5KPTA 4CZIA 1MDUB 3CJ7A 4FWPA 1X3NA 3ENHA 2BUPA 4NO7A 3W0LA 3UE5A 5AQQA 1KAZA 1IG8A 2D4WA 4BR7A 1BOTO 1LOTB 2P9NA 4QS9A 1Z05A 4RWTA 2A3ZA 3QFPA 5AQUA 5KPRA 4FWRA 4XH1A 4BVOA 4JD2B 2HMPA 1NGDA 1JCFA 2A42A 3G25A 2VWBA 2VYPA 1YAGA 4JHDA 4PKGA 3WEEA 3A0IX 3VESA 2FSKA 5AR0A 4O8KA 1DGKN 5AQTA 5AQSA 2P9IB 5I9EB 4B1UB 1NGCA 4BRPA 4FPAA 1DKGD 2V51B 2YHWA 4EIAA 5EX5A 4RCHA 3U9DA 2IVOA 3I33A 2PBDA 3UKRA 4ISGA 1NGEA 4MO4A 2F9WA 2NRHA 4WQ4C 3CQXA 4CZKA 3H3NO 3CJBA 4CZEA 2EWSA 3EZWA 3GG4A 2E1ZA 1JCGA 1SQKA 4EHUA 5LJWA 1BUPA 2V52B 1U2VB 4ISEA 5BR9A 5ELZA 4BC3A 2E20A 5BRHA 3A5MC 3FZLA 1MA9B 3CETA 4LC9B 2W41A 4FWNA 2QWPA 3ATVA 1V4TA 2ZWHA 1EQYA 2E8AA 1Q18A 1TYQA 2NLXA 1J6ZA 3KZBA 4FWMA 5AZIA 3UKUA 1HKBA 2QWNA 5BREA 1ZC6A 3VF6A 1HPMA 4WQ4A 4EHTA 3D2FA 1QQMA 3IUCA 3O1WA 1E4FT 1TUYA 4BGAA 3FZKA 3IMXA 2W40A 3ZX2A 4BRMA 2BTFA 2QW9A 3MN7A 4BGBA 4JHDB 4FPBA 4B1XB 5JLHA 3KVGA 2CGLA 4K43A 5FPDA 4CBWA 4BRHA 1RDWX 3UB5A 2P9PB 3VEVA 4A62A 1ZXOA 4IWVA 5ADXH 4XH5A 1NGJA 2FSNA 1HKCA 4B1YB 4BRKA 2Q36A 1X9JA 3H1VX 4H5TA 4DHYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BR9A 1MWMA 4B9UA 4FJIA 1C1CA 1FH3A 1BCMA 3PSFA 4M41A 4CJSA 3V81A 1REVA 4YOUA 4BQZA 1N8RO 2P51A 4IFYA 3DOLA 3AO3A 4KTQA 3RRGA 3O9SA 3THXB 3D0PA 1K73O 2VWKA 4JKAA 1CZBA 2YC1C 2O8FB 1VRTA 3RMBA 3OYGA 4BR5A 5GINA 3PY8A 3LDPA 4BRGA 3KLIA 4DUZK 4CD3A 3MWPA 5TKWA 3QO9A 4LF7K 4H5VA 5EVZA 1G99A 3CQYA 3S3OA 2Y1IA 3HZ6A 3L56A 1RBVA 3I8DA 1WLJA 2JWLA 2HHIA 1JLBA 4FSVA 3JS6A 3MCPA 3R1XA 3ATUA 3FZFA 4JEPA 4OJRA 4BDPA 3L3UA 4BG8A 2NNWA 4BROA 2UXBK 4GVEA 1NK0A 3NH1A 3SPYA 3QMLA 3U4LA 2YHXA 4PQUA 4K41A 2GWJA 3ULEB 2W42A 3O8MA 4O5BA 1H1VA 2QTDA 4RW6A 3S5TA 1RFQA 3RR7A 4BRDA 4CFDA 4DG1A 1NKCA 5BN8A 3Q7CA 3ZSYA 4YORA 5CYMA 3MEEA 3BEXA 3M3ZA 2KBHA 4CEQA 2PY5A 2KHOA 1G15A 3THYA 1QVGM 4BECA 1IV0A 4IZ9A 3SZ2A 1ZVEA 3AVLA 3VQAA 1LV5A 3D2EA 3CHWA 4FLUA 3VQ5A 1T7PA 2YKMA 3U8XA 1WSEA 4B1VA 4CJ5A 3PIOL 1U48A 2QXFA 4LFAK 1BQNA 2PYLA 4F3OA 2OCEA 4CEDA 1VSEA 4G1QA 2ZD1A 1GLLO 1SKWA 5GAHP 1T6CA 3QERA 5KPZA 2B6AA 2D0AA 1KCFA 1TUUA 2G2KA 2YKNA 3T1HK 4AB0A 3K0SA 1ZVGA 4GW6A 3HL8A 3CCEN 1BI4A 4KFBA 2ASPA 2MN5A 1YTUA 4CK2A 1BU6O 4CZJA 4JN4A 3ZSOA 4JI1K 3G71N 4DSFA 2O4IA 1NOZA 3EE8A 2X74A 4BRQA 1ZFUA 2HW3A 4DLEA 5CE3A 3DLKA 3FFKB 3Q7BA 1HR0K 3DI6A 3L8BA 1RT6A 2N66A 3AO2A 1B92A 4PKIA 4WCEL 1MWKA 4BACA 5DM7L 1Z25A 4LF4K 3J7YP 4DV7K 3V6DA 3KTQA 1NMDA 2GMOA 1VRUA 4F9OA 1SUQA 1ATSA 3KOZA 1DTQA 4M42A 3CMAN 4OPJA 2HOEA 2ZQBA 4NB4A 3T69A 4DR1K 3G6EN 2E0HA 2Q2RA 4IDHA 3OS1A 3VTIA 1ASUA 4CJTA 2LT8A 4ELTA 4BDYA 4CGJA 4W5TA 1R59O 4UADE 2IDOA 3KOYA 1A5XA 4OPKA 1NJZA 1ZBUA 3ZETB 1U04A 1NPIA 4FJHA 3NGZA 5AQNA 1ZYVA 4DSJA 1YITN 4N47A 4KI6A 5EY4A 1L3UA 3NF9A 4FLYA 4YOTA 1IKYA 1YIJN 3OJUA 1RDCA 4CZMA 4ID1A 5J2NA 4LD0A 5KGXA 1BQMA 2HNYA 4DV6K 2CH5A 5CY0A 1ZYQA 4RG8A 4JI5K 3ZSRA 4PL7A 3DLBA 3DMJA 4X62K 2N2RA 2A6AA 5IT9O 3OYIA 4CW7B 3HM8A 1RT7A 1DTTA 4CJKA 3SV4A 3SV3A 2G8IA 4DF8A 4DSLA 2O8CB 3TU5A 1ZBLA 5MLCQ 4JKGA 2ZJRL 5AQGA 3MXMA 4NCBA 1LW0A 1WNSA 4CIEA 2YJEA 3K5NA 5AZJB 2VGNA 4CERA 2QI2A 4OKJA 3TARA 5K14A 1IKXA 5AQFA 4ILHA 4JNEA 4CGDA 4O4GA 3AY9A 4DSIA 3VTHA 3H3OB 4KKOA 3QDKA 3K5OA 4CI6A 1T44A 1GLDG 4FJ5A 4K42A 3LDQA 2VY6A 2H3GX 4DTMA 4B3TK 5HROA 2I7PA 1TI5A 4UAFE 4CQKA 3O4WA 3VF2A 3V9WA 4JKHA 3LM9A 3T1YK 4AHRA 3BZCA 4HCCA 3MN6A 4IOXA 2WC9A 1TVRA 1GPTA 4CF2A 3EO3A 1YJWN 4I6MA 3O3HA 3OYMA 2NZTA 4LF8K 2W6KA 1ZYWA 4FWLA 4ZTJA 5H1SQ 4U7BA 4W5NA 3CFRA 3DLLL 4HE7A 2GUPA 3LANA 1TV6A 2QM1A 4FJ9A 4DR4K 3KP0A 2YBRC 3RMAA 3KLHA 1NK7A 3CCSN 4CBUA 1HRHA 2A5XA 4CESA 3GE1A 1SKRA 2M8BB 4AF1A 1U47A 3QBXA 4WE1A 4HTLA 3TTDA 4ISFA 3L0QA 3MN5A 3ZCMA 3O5BA 3QNNA 4H0YB 1RBTA 1UA1A 3VQCA 1QVFM 4XH4A 3MAQA 2E6LA 4JK8A 2G8WA 1HNXK 1T7EA 1GLAG 3C7NA 5AQIA 3V1QA 5BPMA 5CHIA 1HMVA 1VQ9N 3DYAA 2Q1NA 4FWKA 3NGIA 1QE1A 1VQ8N 3VQEA 3O9UA 3MECA 3THVA 3SBGA 1LAWA 4MDAA 2UXDK 2KFNA 3EKSA 1T6DA 1XHZA 1NMNA 3VA0A 4CD1A 2QWLA 3U3GA 4B1ZA 1JZAA 3CC7N 1DQ7A 1SEGA 4CZIA 2R7YA 4LFCK 3OYNA 1VSJA 1SN4A 3W0LA 4JS5A 3O3GA 2D4WA 1KAZA 2OPSA 4E7IA 3DLHA 3V4IA 4A5AA 4JI6K 1N36K 1YVUA 4TSXA 1RCHA 1Q9YA 1JCFA 5GIOA 2E2FA 4JHDA 4PKGA 4OKEA 3VESA 4JI0K 1TK0A 5AQSA 3L2QA 1DKGD 4JV5K 4YFUA 2WBNA 2GV9A 2HHXA 4DTNA 3N4PA 3UKRA 4ISGA 2HMIA 3NVKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4BR9 A;  1MWM A;  4B9U A;  4FJI A;  1C1C A;  1FH3 A;  1BCM A;  3PSF A;  4M41 A;  4CJS A;  3V81 A;  1REV A;  4YOU A;  4BQZ A;  1N8R O;  2P51 A;  4IFY A;  3DOL A;  3AO3 A;  4KTQ A;  3RRG A;  3O9S A;  3THX B;  3D0P A;  1K73 O;  2VWK A;  4JKA A;  1CZB A;  2YC1 C;  2O8F B;  1VRT A;  3RMB A;  3OYG A;  4BR5 A;  5GIN A;  3PY8 A;  3LDP A;  4BRG A;  3KLI A;  4DUZ K;  4CD3 A;  3MWP A;  5TKW A;  3QO9 A;  4LF7 K;  4H5V A;  5EVZ A;  1G99 A;  3CQY A;  3S3O A;  2Y1I A;  3HZ6 A;  3L56 A;  1RBV A;  3I8D A;  1WLJ A;  2JWL A;  2HHI A;  1JLB A;  4FSV A;  3JS6 A;  3MCP A;  3R1X A;  3ATU A;  3FZF A;  4JEP A;  4OJR A;  4BDP A;  3L3U A;  4BG8 A;  2NNW A;  4BRO A;  2UXB K;  4GVE A;  1NK0 A;  3NH1 A;  3SPY A;  3QML A;  3U4L A;  2YHX A;  4PQU A;  4K41 A;  2GWJ A;  3ULE B;  2W42 A;  3O8M A;  4O5B A;  1H1V A;  2QTD A;  4RW6 A;  3S5T A;  1RFQ A;  3RR7 A;  4BRD A;  4CFD A;  4DG1 A;  1NKC A;  5BN8 A;  3Q7C A;  3ZSY A;  4YOR A;  5CYM A;  3MEE A;  3BEX A;  3M3Z A;  2KBH A;  4CEQ A;  2PY5 A;  2KHO A;  1G15 A;  3THY A;  1QVG M; 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