3D4SA

Cholesterol bound form of human beta2 adrenergic receptor.
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
publication title A specific cholesterol binding site is established by the 2.8 A structure of the human beta2-adrenergic receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 160
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3d4sA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3d4sA01
3QBLA 3QBIA 1C6MA 1K28A 1LGWA 2ZIYA 3HANA 4JR8A 4LDEA 4AMIA 4W53A 1L58A 1F50A 1L99A 1L90A 145LA 4MQTA 1L73A 2KSBA 1D2YA 248LA 1CVKA 3C80A 3ABWA 1P36A 5B6WA 165LA 2G87A 4HYXA 1QT3A 235LA 2JAFA 2OEAX 1CU2A 1C63A 244LA 227LA 1L02A 3HAPA 3HDEA 1L66A 1L30A 3GUIA 4Y9HA 1L76A 1L36A 1L18A 5JJNA 3GUMA 3DNAA 4DJHA 1L10A 3CDQA 4NC3A 3SB5A 1LYFA 3QBGA 4G72B 3RUNA 4XT3A 5FJGA 1X0SA 4KNFA 4G71B 5H2JA 5B6VA 1P56A 3GUPA 1G0JA 1T8FA 1L82A 3RFMA 1C6QA 3CDVA 2ANXA 4L35A 1QTZA 2LZMA 3OE9A 4BEYA 176LA 1KW7A 1Q5JA 2KSAA 4IAQA 129LA 155LA 1E12A 2BRDA 1LYEA 2KSYA 1PQJA 1SWYA 1KG8A 1L16A 243LA 1JFPA 1QT7A 4BWBA 1QTVA 1L89A 1X0I1 5B6YA 1L26A 1LGUA 206LA 4W57A 3HUAA 2B6WA 1CX7A 3UONA 2Y04A 4FA7B 4YXAC 4ARLA 3GUJA 2HUKA 1L12A 1CUPA 1CX6A 1SX7A 2R4SA 1JV6A 141LA 137LA 2O7AA 3CDTA 2YCXA 1KMEA 158LA 3V2YA 2M3GA 5G28A 1L38A 2OE7X 1L97A 4GP4B 1ZURA 1DYAA 1QTCA 2I1XA 4GBRA 4BVNA 3S8GB 130LA 1IW9A 1NHBA 1T97A 1C69A 231LA 3QDCA 3LZMA 3T45A 1G0LA 1TN5A 5ETZA 3GULA 2O4WA 3HH5A 1L11A 1L07A 2HUMA 3SBBC 1C6LA 254LA 1KS3A 171LA 239LA 2Y03A 102LA 1OWZA 2OU8A 1P64A 1D3JA 1G0KA 191LA 1KGBA 1C60A 1PQMA 2B72A 2J4YA 1L88A 3EH5B 1P3NA 1M0LA 140LA 4IARA 1QTBA 242LA 1LYIA 5A8EA 4OO9A 1QUDA 1L40A 2RBNA 180LA 5LZMA 1L93A 2HPYA 5H2LA 3HU8A 3P0GA 1L50A 3OE6A 3QBKA 4MQSA 4I7LA 5A44A 1C8SA 2CUUA 2B6XA 3L2XA 3NY8A 122LA 3C82A 1KY0A 256LA 2ANVA 2Q9EA 4MD2A 230LA 5B35A 3S8FB 2Q9DA 1D9WA 2HULA 4G7QB 3V2WA 4HYJA 201LA 1L35A 251LA 1C3WA 1PQOA 195LA 3RZEA 170LA 1L68A 4TL3A 1C6GA 2OE4X 186LA 3HTGA 126LA 2JAGA 5H2MA 1P2LA 3C7WA 4WW3A 2O79A 1OYUA 1CV5A 1DYDA 185LA 4EKRA 1TLAA 3SBAA 2WJLA 4LZMA 2Y02A 5AX1A 2B6YA 1OWYA 1AT9A 1CV6A 1HZXA 1L87A 181LA 1CUQA 4L6RA 1PXSA 2QB0B 3NYAA 175LA 187LA 1L01A 1BRDA 3SB7A 3EH4B 4G7RB 4GBRB 6LZMA 1JTNA 1L04A 1LYGA 4X1HA 213LA 2Z73A 1P37A 5H2OA 1G07A 1L21A 1L14A 1DYEA 1D3NA 1LYHA 2AT9A 3S3DB 246LA 1LI2A 4BUOA 1L71A 4W54A 139LA 200LA 5B2NA 3UZCA 1XJIA 3VI0A 3CAPA 214LA 1QM8A 2B7XA 3UZAA 3QJSB 3DN6A 1C6CA 1LWGA 1FBBA 1CV4A 112LA 1L80A 1QKOA 5G2DA 1MGYA 3C7ZA 3JR6A 107LA 1L59A 2A4TA 1S54A 1LGXA 2RB0X 3GUKA 4W56A 1L0MA 1QUOA 218LA 221LA 3HT6A 1L74A 1L23A 1L51A 4W58A 4EKSA 2RBPA 3BVDB 1C6NA 1KY1A 1L32A 4PK0A 3DMXA 1LI3A 1L41A 196LA 3HDFA 2QPDB 7LZMA 4GYCA 1L27A 1L15A 2Z6BA 198LA 4UHRA 1L67A 4FBZA 211LA 3HT7A 1LPYA 3HUKA 2X72A 1JV7A 5JJJA 1B6IA 3UTYA 3QJTB 4I7QA 1S8LA 182LA 3HUQA 3SB8A 224LA 148LE 3C81A 3X3CA 3G3WA 3HU9A 1JGJA 1L65A 1L47A 3REYA 3EH3B 258LA 3QJUB 142LA 3PDSA 4A4MA 4DKLA 3AYMA 109LA 4W55A 5JJEA 1QT6A 3C9MA 3K2RA 173LA 1CWQA 161LA 1L96A 1UAZA 3DN8A 188LA 4I7SA 5ITEA 241LA 259LA 2Z55A 5G2AA 3HAQA 3F8VA 4GRVA 1L54A 1F88A 5H2NA 192LA 146LA 4I7MA 1L46A 2KS9A 3COCA 1L60A 1G06A 4QIDA 3C7YA 1EPYA 1L9HA 151LA 3G3VA 1L34A 209LA 1BM1A 4GP8B 3G3XA 3HTDA 5ITCA 2NTGA 174LA 250LA 1IXFA 1S52A 1PQDA 4J4QA 3QAKA 1OV7A 1L25A 2OE9X 2RBSA 1LW9A 1L29A 1L86A 3ODUA 3DDLA 4EPFA 5B0WA 2QPEB 3C8QA 108LA 162LA 261LA 1C62A 4DAJA 3NY9A 1G0MA 183LA 143LA 3S3BB 3S3CB 1VGOA 1C6HA 1L84A 4G7SB 1WTHA 1P46A 3DMZA 240LA 3HT9A 111LA 5F8UA 3ZPQA 4GPOA 2RH1A 120LA 2F2QA 1CV3A 4XXJA 1L95A 1L98A 4EIYA 127LA 1CV0A 2F32A 3QJQB 4I7KA 110LA 3AM6A 252LA 262LA 1X0K1 215LA 3HH4A 4BEZA 4W59A 5H2PA 249LA 1D3FA 1L57A 3NSBA 1C66A 3CDOA 4LDLA 4XTLA 1PY6A 2NTUA 2R4RA 223LA 1E0PA 1QT4A 1H2SA 144LA 1L56A 5TGZA 2IGCA 1C6AA 2RB2X 4MBSA 172LA 1L17A 5G2CA 2YCZA 4I7PA 4XTNA 1L49A 114LA 1L81A 1T8GA 1QT8A 1PQIA 1F4ZA 2B70A 4EKQA 1G0QA 5AHYA 3UTWA 1C6PA 1QTDA 2PEDA 1XJUA 1O0AA 2I35A 4N4YB 156LA 5BR2A 1XJTA 4S0WA 3VW7A 189LA 1QUGA 3DN4A 219LA 2I20A 1L64A 216LA 4PXFA 1L69A 2RBQA 1L31A 2NTHA 1L28A 2RB1X 1R84A 5AWZA 1CTWA 210LA 3PWHA 4BV0A 1L42A 2B6ZA 131LA 1CU5A 1L91A 3HASA 1QSBA 169LA 3CDRA 3ZEVA 3UTVA 166LA 1SWZA 3C8SA 2L78A 4X31A 1SX2A 3GUOA 245LA 4YX7C 1L19A 3HH6A 1GUEA 1ZYTA 2RAZX 164LA 1L70A 226LA 1VJMA 2YCYA 184LA 1I6SA 3MBVA 1LYJA 163LA 236LA 167LA 220LA 3HH3A 4I7TA 3KJ6A 255LA 5LWEA 4FPDA 212LA 1CU6A 2B74A 5G36A 1EHKB 4GP5B 3QJRB 2OTZX 3F9LA 3OE0A 5B34A 197LA 1LI6A 1LN6A 1L52A 1L37A 2RBOA 4JKVA 4W51A 3OAXA 5EN0A 1C6BA 238LA 1L94A 4ARMA 1L62A 3AYNA 4FAAB 5H2IA 1C6FA 2I21A 225LA 3WQJA 1DYBA 4I7JA 1L79A 4UG2A 1DZEA 115LA 4OV0A 1LWKA 1L24A 2WJKA 4QI1A 1OVHA 4EPIA 3DN3A 3HTBA 1CU0A 1C64A 257LA 3HTFA 1FBKA 1C67A 1C6KA 3HAOA 1L09A 1QS9A 2B73A 1D3MA 1JQUA 1L44A 1D2WA 3L64A 4ARJA 1XIOA 138LA 1L85A 4MD1A 3A7KA 3CODA 113LA 5BR5A 228LA 4IAPA 3SB6A 160LA 1LLHA 2QARC 3DN2A 3SB9A 2YCWA 5J7AA 5C1MA 4ZPUA 128LA 1L77A 1L0JA 1L48A 5DHGA 123LA 1C6DA 5AHZA 1CU3A 177LA 4N4WA 4G70B 152LA 1C6EA 3C9LA 1LYDA 1G1WA 3X3BA 5AX0A 1P6YA 1L03A 1P2RA 118LA 1L63A 1L08A 1L45A 4I7OA 4XT1A 1AP9A 1C8RA 1QKPA 3GUNA 1M0MA 3HARA 1QTHA 4QRYA 4AQNA 1G1VA 4ARQB 5I14A 5DYSA 125LA 1DYGA 1U19A 2LC9A 1XEPA 3FA0A 1H68A 5G54A 3PQRA 3HWLA 2L6XA 1QUHA 4W52A 3VGAA 4IB4A 1OV5A 3DKEX 4ARMB 4PXKA 4KLYA 1DYCA 1P5CA 253LA 1L06A 104LA 1Q5IA 4X32A 4XTOA 5B6ZA 3SN6R 3QJVB 5A45A 229LA 2OU0X 3C83A 3FADA 1G0GA 4K5YA 4AMJA 4N6HA 5KKHA 150LA 1KG9A 1IW6A 3UG9A 3NS0A 1KNIA 4YXCA 1C65A 178LA 1S8JA 1L83A 3HT8A 4EJ4A 2EI4A 2Y01A 3OE8A 2B6TA 103LA 1L13A 1L55A 1L22A 3VVKA 2NTWA 3EMLA 1GU8A 3DQBA 2F93A 1C6TA 1CV1A 1QT5A 1S53A 4EKPA 4JQ6A 1C68A 5H2HA 1P8UA 2YDOA 3FI5A 1ZWNA 3VHZA 3DN0A 1BRXA 149LA 1L33A 1L05A 2F95A 1T8AA 1L72A 4PJZA 1KW5A 4I7NA 1TN0A 1C6IA 1XMEB 1L75A 2ZFEA 3PXOA 1QSQA 1L39A 1T6HA 4LDOA 1QHJA 5B6XA 2OU9A 237LA 4E97A 260LA 2ZZLA 1L0KA 1PQKA 119LA 2F47A 168LA 5G53A 1G0PA 232LA 4HWLA 5AZDA 234LA 1PXRA 2LCBA 1DYFA 2RAYX 3DMVA 3C8RA 222LA 2OTYX 190LA 2RBRA 2Y00A 233LA 1UCQA 3VG9A 1L20A 217LA 199LA 1OVJA 1S51A 205LA 1QS5A 2VT4A 3UTXA 1OVKA 4ARQA 4WAVA 1BRRA 159LA 1L61A 4I7RA 1C6JA 3D4SA 1L53A 1C61A 3ZPRA 1P7SA 2LNLA 5H2KA 1SSWA 4EXMA 1M0KA 4ARPA 2YDVA 3PBLA 1R2NA 3DN1A 2B75A 3QAPA 147LA 1SSYA 157LA 1L00A 1GZMA 5DHHA 1P8IA 1JTMA 1L92A 247LA 1L43A 1P8HA 4EA3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FLYA 3K3TA 1K28A 4LDEA 1L58A 2BQLA 1L99A 1CVKA 1GB8A 3C80A 5B6WA 1IWTA 2JAFA 5LYTA 1GHLA 244LA 3HAPA 1YIKA 1HMLA 4Y9HA 1XSFA 1L36A 1L18A 3DNAA 3CDQA 4NC3A 1GFVA 5L3HA 2D91A 2FYCA 3SB5A 5FJGA 4G72B 4J1BA 3RUNA 4XT3A 4DQJA 1YAOA 3WW5A 3RFMA 3AZ6A 3OE9A 176LA 2KSAA 4IAQA 2EPEA 4HJVA 3M3UA 2ZWBA 1LYEA 1OUJA 1PQJA 1SWYA 4BWBA 1L16A 5ILFA 1QTVA 1IR8A 1L26A 1ZMYL 1CX7A 1LKSA 2Y04A 4ARLA 1SLYA 2HUKA 2R4SA 1DPXA 1LSNA 141LA 2F2NA 158LA 3W6CA 1GBYA 3S8GB 4BVNA 1NHBA 3QDCA 3T45A 1B7PA 3GULA 1L11A 2D4KA 1L07A 1C6LA 1IC5Y 254LA 1IWZA 239LA 3KAMA 1OWZA 2DQHY 1P64A 1C08C 4WG7A 4ANRA 4B0DA 191LA 1C60A 1RJCB 3EH5B 2XBRA 4EOFA 1M0LA 140LA 5F16A 5F9UA 5LZMA 1L93A 1LZTA 3HU8A 4TTDA 3QBKA 1IORA 3RW8A 1UIHA 3A6CY 1NQIA 8LYZA 230LA 2HULA 4OWAA 1L35A 1C3WA 1C6GA 5H2MA 3WYHA 4WW3A 1VDQA 1JKCA 4LZMA 2WJLA 3TXGA 2HECA 1AT9A 1CV6A 2NWDX 3WU8A 3NYAA 175LA 4GN5C 3P64A 4AXTA 2HU3A 4GBRB 1P37A 5I54A 1LZAA 3S3DB 4OOOA 2Q0MX 1IWUA 1LJJA 1LZGA 3VI0A 2B7XA 3W3EA 4R6CA 1H87A 1LWGA 1UIFA 3C7ZA 4ETDA 1L59A 1LGXA 3GUKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 156L A;  5BR2 A;  1XJT A;  4S0W A;  3VW7 A;  189L A;  1QUG A;  3DN4 A;  219L A;  2I20 A;  1L64 A;  216L A;  4PXF A;  1L69 A;  2RBQ A;  1L31 A;  2NTH A;  1L28 A;  2RB1 X;  1R84 A;  5AWZ A;  1CTW A;  210L A;  3PWH A;  4BV0 A;  1L42 A;  2B6Z A;  131L A;  1CU5 A;  1L91 A;  3HAS A;  1QSB A;  169L A;  3CDR A;  3ZEV A;  3UTV A;  166L A;  1SWZ A;  3C8S A;  2L78 A;  4X31 A;  1SX2 A;  3GUO A;  245L A;  4YX7 C;  1L19 A;  3HH6 A;  1GUE A;  1ZYT A;  2RAZ X;  164L A;  1L70 A;  226L A;  1VJM A;  2YCY A;  184L A;  1I6S A;  3MBV A;  1LYJ A;  163L A;  236L A;  167L A;  220L A;  3HH3 A;  4I7T A;  3KJ6 A;  255L A;  5LWE A;  4FPD A;  212L A;  1CU6 A;  2B74 A;  5G36 A;  1EHK B;  4GP5 B;  3QJR B;  2OTZ X;  3F9L A;  3OE0 A;  5B34 A;  197L A;  1LI6 A;  1LN6 A;  1L52 A;  1L37 A;  2RBO A;  4JKV A;  4W51 A;  3OAX A;  5EN0 A;  1C6B A;  238L A;  1L94 A;  4ARM A;  1L62 A;  3AYN A;  4FAA B;  5H2I A;  1C6F A;  2I21 A;  225L A;  3WQJ A;  1DYB A;  4I7J A;  1L79 A;  4UG2 A;  1DZE A;  115L A;  4OV0 A;  1LWK A;  1L24 A;  2WJK A; 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 3SN6 R;  3QJV B;  5A45 A;  229L A;  2OU0 X;  3C83 A;  3FAD A;  1G0G A;  4K5Y A;  4AMJ A;  4N6H A;  5KKH A;  150L A;  1KG9 A;  1IW6 A;  3UG9 A;  3NS0 A;  1KNI A;  4YXC A;  1C65 A;  178L A;  1S8J A;  1L83 A;  3HT8 A;  4EJ4 A;  2EI4 A;  2Y01 A;  3OE8 A;  2B6T A;  103L A;  1L13 A;  1L55 A;  1L22 A;  3VVK A;  2NTW A;  3EML A;  1GU8 A;  3DQB A;  2F93 A;  1C6T A;  1CV1 A;  1QT5 A;  1S53 A;  4EKP A;  4JQ6 A;  1C68 A;  5H2H A;  1P8U A;  2YDO A;  3FI5 A;  1ZWN A;  3VHZ A;  3DN0 A;  1BRX A;  149L A;  1L33 A;  1L05 A;  2F95 A;  1T8A A;  1L72 A;  4PJZ A;  1KW5 A;  4I7N A;  1TN0 A;  1C6I A;  1XME B;  1L75 A;  2ZFE A;  3PXO A;  1QSQ A;  1L39 A;  1T6H A;  4LDO A;  1QHJ A;  5B6X A;  2OU9 A;  237L A;  4E97 A;  260L A;  2ZZL A;  1L0K A;  1PQK A;  119L A;  2F47 A;  168L A;  5G53 A;  1G0P A;  232L A;  4HWL A;  5AZD A;  234L A;  1PXR A;  2LCB A;  1DYF A;  2RAY X;  3DMV A;  3C8R A;  222L A;  2OTY X;  190L A;  2RBR A;  2Y00 A;  233L A;  1UCQ A;  3VG9 A;  1L20 A;  217L A;  199L A;  1OVJ A;  1S51 A;  205L A;  1QS5 A;  2VT4 A;  3UTX A;  1OVK A;  4ARQ A;  4WAV A;  1BRR A;  159L A;  1L61 A;  4I7R A;  1C6J A;  3D4S A;  1L53 A;  1C61 A;  3ZPR A;  1P7S A;  2LNL A;  5H2K A;  1SSW A;  4EXM A;  1M0K A;  4ARP A;  2YDV A;  3PBL A;  1R2N A;  3DN1 A;  2B75 A;  3QAP A;  147L A;  1SSY A;  157L A;  1L00 A;  1GZM A;  5DHH A;  1P8I A;  1JTM A;  1L92 A;  247L A;  1L43 A;  1P8H A;  4EA3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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