3D4SA

Cholesterol bound form of human beta2 adrenergic receptor.
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title A specific cholesterol binding site is established by the 2.8 A structure of the human beta2-adrenergic receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
total genus 160
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3d4sA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3d4sA01
1HZXA 1LN6A 131LA 1L36A 2OU9A 1OV7A 2NTWA 3NYAA 148LE 1L73A 3HTGA 1QT7A 255LA 3OE8A 1L02A 1C67A 1L09A 3V2YA 2Q9DA 4UHRA 1LYIA 4FBZA 1C8SA 3G3XA 1L77A 1L97A 139LA 5TGZA 1L63A 5B6YA 1L48A 110LA 1C6AA 1P8UA 4I7KA 149LA 252LA 1H68A 3C9MA 141LA 4IAQA 3PXOA 4PXKA 4HYXA 5G53A 1L40A 1B6IA 1DYEA 1CU0A 2LC9A 3PBLA 4EKQA 3HT6A 254LA 2OTZX 2RBPA 2Z6BA 2J4YA 2YCXA 5H2IA 2OE9X 111LA 1L94A 4W56A 2WJKA 3DKEX 191LA 3MBVA 3HH5A 2QB0B 2IGCA 243LA 3VGAA 262LA 4A4MA 1ZYTA 1L31A 5G2CA 1SX2A 1QTHA 1L68A 4ARQA 3CODA 259LA 1OVHA 245LA 1KG8A 2Y00A 4GRVA 1C63A 2YCWA 1CUPA 4ARMA 4YXCA 4WW3A 1C6JA 3C8RA 5ETZA 3K2RA 2YDOA 1L99A 3QBGA 5H2PA 5JJEA 1JGJA 1QTVA 2KSBA 1L01A 180LA 1JTNA 1D2WA 2RBNA 4EJ4A 1Q5IA 1O0AA 1R84A 109LA 3ZEVA 1FBBA 4IB4A 1C6IA 1L47A 130LA 3GUOA 1KMEA 140LA 167LA 1L72A 3DMVA 3DNAA 3HUAA 1C3WA 4XT1A 219LA 4W57A 108LA 1L75A 3EH4B 1UCQA 1C6NA 4LDLA 242LA 1L11A 2I20A 1L74A 2Y04A 3REYA 2X72A 1C6MA 2CUUA 1L59A 4XT3A 2Q9EA 2I21A 1CU3A 3UTVA 1QKOA 3UONA 4W52A 1L69A 2NTGA 1L76A 2QPEB 5G36A 1L30A 3CDRA 251LA 3HH4A 1L15A 2OE7X 122LA 5JJNA 4YXAC 2ZIYA 1QUDA 3X3CA 185LA 5B35A 2B70A 1AP9A 3S3CB 4J4QA 1D2YA 4X1HA 1LYHA 1L13A 1LWGA 3DMXA 1LGWA 2LNLA 1KW5A 5C1MA 2B74A 1L52A 1CVKA 176LA 1L35A 1X0K1 3GUNA 4MBSA 192LA 123LA 1QUHA 1L04A 234LA 2B7XA 4JQ6A 1E0PA 4S0WA 1SWZA 1L08A 1M0MA 1CUQA 241LA 126LA 1PQIA 3JR6A 4G7SB 5B6WA 1KGBA 4I7QA 3QJRB 211LA 2HPYA 4EA3A 1C6PA 3VW7A 1DYFA 4G7QB 4BVNA 4FPDA 5H2MA 4EXMA 1L98A 3GUJA 1T8AA 1LYFA 1PQJA 1QKPA 4N4YB 127LA 1L38A 1ZWNA 4EKSA 2F93A 3DN1A 214LA 3HH3A 4XXJA 247LA 1L24A 3FA0A 4GBRB 1P5CA 1QSBA 129LA 2O7AA 2RB0X 4KNFA 3HT8A 173LA 3HUKA 2RB2X 145LA 1G0GA 2ANXA 2HULA 3QDCA 1JQUA 1L28A 2B6ZA 2B6XA 1GU8A 3FADA 1G0QA 236LA 1L88A 2LZMA 217LA 2HUMA 3AYNA 2O79A 5LWEA 3A7KA 1R2NA 3HARA 166LA 1D3JA 1QSQA 4BEYA 218LA 4I7TA 1CTWA 5H2LA 3CAPA 2NTHA 4ARLA 4G72B 1MGYA 4W55A 1QT3A 1SSWA 3C83A 162LA 1L80A 1U19A 1C64A 4XTOA 196LA 177LA 3HT7A 3DMZA 2OEAX 3WQJA 1CV1A 3C8SA 178LA 4IAPA 181LA 4BV0A 1L26A 4KLYA 1L06A 5ITCA 1QM8A 233LA 253LA 4EKPA 1KG9A 1G07A 164LA 1QUGA 2RBQA 1C6EA 4EPFA 4AQNA 104LA 3G3WA 3GULA 3UG9A 115LA 4GYCA 1QTBA 3SBBC 2KSYA 187LA 1L83A 3S3DB 142LA 1P2LA 3HU9A 168LA 151LA 4AMJA 2F95A 2RH1A 1L12A 4W54A 1CV4A 1KW7A 1T8GA 1QHJA 1L67A 3UTYA 1G1VA 2F47A 1L79A 3ZPRA 4N6HA 1S51A 1JTMA 3SB7A 2YDVA 5B6XA 1T97A 1C6LA 1DYBA 3AYMA 5B6VA 2A4TA 3PQRA 5G28A 2I35A 1P36A 4LZMA 2OU0X 1L27A 4GPOA 3QJSB 1LW9A 125LA 1C66A 1L60A 4GBRA 1CV3A 1L05A 4HYJA 1X0I1 4EPIA 144LA 4N4WA 3GUKA 3LZMA 1QUOA 4QRYA 2RBSA 1PXRA 206LA 170LA 1M0KA 114LA 3C7YA 3NS0A 1C62A 4GP8B 1G0PA 3DDLA 4QI1A 175LA 1L87A 171LA 1WTHA 143LA 1XMEB 3V2WA 4G7RB 5DHHA 5B34A 1LLHA 1L17A 1C61A 3HAOA 2KSAA 1F88A 1JV7A 1G1WA 4HWLA 4QIDA 1LI2A 1K28A 1L44A 5A44A 226LA 1S53A 1OV5A 7LZMA 1L41A 4I7SA 3GUMA 1QT4A 1QT8A 3DN4A 1BRRA 4X31A 4W53A 201LA 5H2KA 1C6KA 1C6HA 3UTXA 1P56A 2LCBA 4GP5B 155LA 1QTDA 1P3NA 1TN0A 1L0MA 1G0KA 1SWYA 258LA 4YX7C 1C65A 3HT9A 2Y02A 225LA 2PEDA 5BR5A 1TLAA 215LA 2ZZLA 1OVJA 3HTDA 1P2RA 4ARPA 3UZCA 238LA 1L90A 3C7ZA 1L23A 4NC3A 244LA 1H2SA 161LA 2JAGA 5H2OA 1D3NA 1C6CA 1L20A 4AMIA 169LA 2RBRA 4LDOA 159LA 102LA 1L55A 4EKRA 1UAZA 2AT9A 2QPDB 3QJTB 4TL3A 1L22A 3C8QA 212LA 1IXFA 1QTCA 1PQOA 1TN5A 4MD2A 1F50A 1PQKA 4ARQB 209LA 3RFMA 183LA 5AHYA 221LA 1XJTA 261LA 1JV6A 4ARMB 3P0GA 1CU2A 232LA 3AM6A 5H2NA 4BUOA 1DYCA 1QT6A 3HTFA 5AZDA 1L46A 220LA 112LA 138LA 4DKLA 257LA 1L14A 4OV0A 4Y9HA 1VGOA 1QT5A 4ZPUA 1Q5JA 4OO9A 3T45A 3QBLA 4X32A 1DZEA 3RUNA 1CX7A 1L18A 1LGXA 2NTUA 1L03A 186LA 1GUEA 3EH3B 2KS9A 1D3FA 1LI3A 3OE6A 1L0JA 113LA 1X0SA 1L86A 2I1XA 3KJ6A 4E97A 4LDEA 1EPYA 3HASA 3OE0A 1OYUA 4G70B 1PQMA 4I7JA 2G87A 1L84A 3QJQB 1T6HA 1XEPA 5KKHA 4DJHA 1IW6A 1DYDA 3EH5B 3SB6A 4PK0A 120LA 3C80A 1L54A 1C6GA 197LA 1L93A 4W59A 2JAFA 4JKVA 223LA 1L95A 1L07A 1L81A 1G0JA 4BEZA 1LWKA 3ZPQA 3QAPA 4EIYA 230LA 1C69A 2Z55A 4UG2A 5DHGA 1S54A 4BWBA 1L71A 1L00A 1L51A 3G3VA 3HAPA 2RAZX 227LA 1L92A 3SB9A 1L21A 2QARC 3QAKA 5DYSA 3NSBA 1P37A 1C68A 1JFPA 248LA 5A45A 3UTWA 2B6TA 1CU5A 3HUQA 1LYJA 2Z73A 4I7PA 1L50A 1KS3A 246LA 4MQSA 3VVKA 1L58A 1XJUA 160LA 1L32A 1C6FA 1L89A 174LA 1L57A 1NHBA 4I7OA 2EI4A 3HH6A 146LA 2M3GA 156LA 3X3BA 1L53A 4PJZA 1L96A 1PQDA 2B6YA 213LA 3QBKA 1LPYA 4I7MA 2L6XA 1C6DA 1BRDA 3DN3A 152LA 1IW9A 3ABWA 3DN6A 4ARJA 5I14A 1F4ZA 4I7RA 3VHZA 1C8RA 3SN6R 1CV6A 1KY1A 1G0LA 6LZMA 3SBAA 1VJMA 2OU8A 184LA 260LA 1D3MA 2Y01A 4IARA 3HTBA 3CDOA 222LA 5F8UA 3NY9A 1LI6A 4W51A 3L64A 1L9HA 4XTNA 1L45A 1L43A 3S8FB 235LA 4I7LA 188LA 3VG9A 103LA 249LA 1CWQA 1BM1A 3HU8A 1ZURA 4I7NA 1P8IA 4G71B 1BRXA 5AX1A 3F9LA 4FA7B 4K5YA 165LA 107LA 195LA 1L61A 4PXFA 128LA 1LGUA 1L70A 1S8LA 3QJVB 231LA 239LA 182LA 2HUKA 205LA 1M0LA 3PDSA 3HDEA 5AWZA 5EN0A 1L34A 5B6ZA 2L78A 1QTZA 1OWZA 1L65A 3CDQA 2YCZA 1L49A 1L91A 200LA 3EMLA 157LA 1L62A 5LZMA 1DYAA 2OE4X 5AX0A 1L25A 1P64A 1GZMA 5A8EA 3D4SA 2R4SA 2F2QA 1T8FA 1L29A 198LA 1CX6A 1L10A 2RB1X 2Y03A 189LA 1FBKA 4MD1A 228LA 3NY8A 1E12A 1KNIA 1L39A 1PY6A 3QBIA 5B2NA 1P46A 210LA 2B75A 1L37A 3C7WA 1I6SA 1L33A 1L82A 3HANA 4GP4B 3RZEA 1LYDA 5G2AA 5G54A 1CV5A 3SB5A 5AHZA 5G2DA 1LYEA 118LA 4XTLA 4JR8A 2F32A 3HDFA 199LA 1XJIA 2B73A 1C60A 5B0WA 5H2JA 172LA 3GUIA 3QJUB 1CU6A 3BVDB 2OTYX 3COCA 1OVKA 2O4WA 1QS5A 4FAAB 3VI0A 3CDVA 3OAXA 237LA 3GUPA 3C9LA 3L2XA 147LA 119LA 2ZFEA 1PXSA 5ITEA 1P7SA 1L19A 3C82A 1L16A 3DN2A 3OE9A 2B6WA 1L56A 2RAYX 3DN0A 3SB8A 1SX7A 3ODUA 1G06A 3S3BB 216LA 229LA 2ANVA 4DAJA 5BR2A 2B72A 163LA 1C6BA 1LYGA 1C6TA 240LA 2YCYA 3FI5A 3HWLA 1OWYA 1KY0A 1D9WA 4MQTA 5FJGA 1P8HA 3S8GB 4WAVA 4W58A 1L42A 2R4RA 3DN8A 3F8VA 1AT9A 1XIOA 1L85A 1SSYA 2RBOA 1L0KA 1C6QA 3C81A 2WJLA 190LA 137LA 250LA 3CDTA 5H2HA 1QS9A 1S8JA 1P6YA 224LA 150LA 1S52A 4L6RA 256LA 1CV0A 2VT4A 2BRDA 3UZAA 158LA 1G0MA 1L64A 1EHKB 1L66A 3HAQA 5JJJA 4L35A 1DYGA 5J7AA 3PWHA 3DQBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CJLA 1OV7A 1L73A 1NF5A 5D5FA 3V2YA 4FBZA 1C8SA 1WQPA 1L97A 1FN5A 1L48A 110LA 4DQJA 4IAQA 1DZBX 1GF3A 4HYXA 1C08C 5HQ1A 1C7PA 254LA 1AZFA 1UIEA 4GCFA 1B0DA 1IP6A 1GF9A 4W56A 3DKEX 4WO9A 3K3TA 4NGLA 3MBVA 4NHSA 2QB0B 243LA 1TAYA 2BQLA 3WH1A 1L68A 1OVHA 4GRVA 2EQLA 2ZWBA 4YXCA 5ETZA 3K2RA 3J4GA 1L99A 3QBGA 5H2PA 1JGJA 2RBNA 1JTNA 1O0AA 109LA 4LFXA 4IB4A 1B5WA 4G4BA 5DN4A 1UICA 1L72A 3HUAA 4LYBA 2AUBA 1IWWA 4HJVA 4W57A 1F6RA 2BQGA 2BQIA 2BQFA 2D91A 4EOFA 242LA 2I20A 2CUUA 4UWUA 4W52A 4NHIA 2YBHA 1TCYA 1B5UA 5KXOA 5JJNA 2ZIYA 1QUDA 4W96A 3LYTA 2XBSA 4X1HA 1JTOL 1GFUA 1IC5Y 3LZ2A 5KXNA 134LA 3A34A 1NDGC 2B74A 1IC4Y 1IOCA 3GUNA 1LKSA 192LA 1XEKA 2B7XA 3W6AA 1HEPA 2LYOA 1JUGA 4S0WA 3TMVA 3T36A 1KGBA 2XTHA 4A7DA 3AJNA 4I7QA 211LA 3P4ZA 1DYFA 3W6CA 1L98A 4MCKA 1T8AA 1PQJA 3A94A 2C8PA 4QDNA 1WQQA 4NSJA 1LZNA 1P5CA 1QSBA 129LA 2RB0X 3HT8A 2BAAA 4N5RA 208LA 3ZEKA 1JQUA 4NGVA 2B6ZA 2Z12A 3TXDA 5F14A 2HEDA 1L88A 2LZMA 4TTDA 1B7LA 3W3EA 2HUMA 166LA 1D3JA 1JSFA 1OUJA 4WLXA 3AZ4A 1MGYA 1QT3A 1SSWA 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 3RUN A;  1CX7 A;  1L18 A;  1LGX A;  2NTU A;  1L03 A;  186L A;  1GUE A;  3EH3 B;  2KS9 A;  1D3F A;  1LI3 A;  3OE6 A;  1L0J A;  113L A;  1X0S A;  1L86 A;  2I1X A;  3KJ6 A;  4E97 A;  4LDE A;  1EPY A;  3HAS A;  3OE0 A;  1OYU A;  4G70 B;  1PQM A;  4I7J A;  2G87 A;  1L84 A;  3QJQ B;  1T6H A;  1XEP A;  5KKH A;  4DJH A;  1IW6 A;  1DYD A;  3EH5 B;  3SB6 A;  4PK0 A;  120L A;  3C80 A;  1L54 A;  1C6G A;  197L A;  1L93 A;  4W59 A;  2JAF A;  4JKV A;  223L A;  1L95 A;  1L07 A;  1L81 A;  1G0J A;  4BEZ A;  1LWK A;  3ZPQ A;  3QAP A;  4EIY A;  230L A;  1C69 A;  2Z55 A;  4UG2 A;  5DHG A;  1S54 A;  4BWB A;  1L71 A;  1L00 A;  1L51 A;  3G3V A;  3HAP A;  2RAZ X;  227L A;  1L92 A;  3SB9 A;  1L21 A;  2QAR C;  3QAK A;  5DYS A;  3NSB A;  1P37 A;  1C68 A;  1JFP A;  248L A;  5A45 A;  3UTW A;  2B6T A;  1CU5 A;  3HUQ A;  1LYJ A;  2Z73 A;  4I7P A;  1L50 A;  1KS3 A;  246L A;  4MQS A;  3VVK A;  1L58 A;  1XJU A;  160L A;  1L32 A;  1C6F A;  1L89 A;  174L A;  1L57 A;  1NHB A;  4I7O A;  2EI4 A;  3HH6 A;  146L A;  2M3G A;  156L A; 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 2F2Q A;  1T8F A;  1L29 A;  198L A;  1CX6 A;  1L10 A;  2RB1 X;  2Y03 A;  189L A;  1FBK A;  4MD1 A;  228L A;  3NY8 A;  1E12 A;  1KNI A;  1L39 A;  1PY6 A;  3QBI A;  5B2N A;  1P46 A;  210L A;  2B75 A;  1L37 A;  3C7W A;  1I6S A;  1L33 A;  1L82 A;  3HAN A;  4GP4 B;  3RZE A;  1LYD A;  5G2A A;  5G54 A;  1CV5 A;  3SB5 A;  5AHZ A;  5G2D A;  1LYE A;  118L A;  4XTL A;  4JR8 A;  2F32 A;  3HDF A;  199L A;  1XJI A;  2B73 A;  1C60 A;  5B0W A;  5H2J A;  172L A;  3GUI A;  3QJU B;  1CU6 A;  3BVD B;  2OTY X;  3COC A;  1OVK A;  2O4W A;  1QS5 A;  4FAA B;  3VI0 A;  3CDV A;  3OAX A;  237L A;  3GUP A;  3C9L A;  3L2X A;  147L A;  119L A;  2ZFE A;  1PXS A;  5ITE A;  1P7S A;  1L19 A;  3C82 A;  1L16 A;  3DN2 A;  3OE9 A;  2B6W A;  1L56 A;  2RAY X;  3DN0 A;  3SB8 A;  1SX7 A;  3ODU A;  1G06 A;  3S3B B;  216L A;  229L A;  2ANV A;  4DAJ A;  5BR2 A;  2B72 A;  163L A;  1C6B A;  1LYG A;  1C6T A;  240L A;  2YCY A;  3FI5 A;  3HWL A;  1OWY A;  1KY0 A;  1D9W A;  4MQT A;  5FJG A;  1P8H A;  3S8G B;  4WAV A;  4W58 A;  1L42 A;  2R4R A;  3DN8 A;  3F8V A;  1AT9 A;  1XIO A;  1L85 A;  1SSY A;  2RBO A;  1L0K A;  1C6Q A;  3C81 A;  2WJL A;  190L A;  137L A;  250L A;  3CDT A;  5H2H A;  1QS9 A;  1S8J A;  1P6Y A;  224L A;  150L A;  1S52 A;  4L6R A;  256L A;  1CV0 A;  2VT4 A;  2BRD A;  3UZA A;  158L A;  1G0M A;  1L64 A;  1EHK B;  1L66 A;  3HAQ A;  5JJJ A;  4L35 A;  1DYG A;  5J7A A;  3PWH A;  3DQB A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3SB6 A;  4OOT A;  3C80 A;  1XFP L;  1IIZ A;  1LZD A;  1IR9 A;  5K7O A;  2W1X A;  1UA6 Y;  1LWK A;  4N1E I;  2Z55 A;  4P2E A;  4XJH A;  1XSF A;  1LYY A;  1L51 A;  2RAZ X;  1RFP A;  1IWY A;  227L A;  4LYC A;  2QAR C;  2YBI A;  3SB9 A;  4H9A A;  5LYM A;  5DYS A;  2B6T A;  1LYJ A;  2Z73 A;  4I7P A;  4B49 A;  1KS3 A;  4MQS A;  3VVK A;  2G4P A;  1L89 A;  5KXX A;  1NHB A;  174L A;  3HH6 A;  2M3G A;  4PGJ B;  1OUG A;  1PQD A;  2B6Y A;  3QBK A;  1LPY A;  2W1M A;  3DN3 A;  1RCM A;  152L A;  1LZG A;  2CDS A;  4LYT A;  3QE8 A;  3VHZ A;  1G0L A;  5KXL A;  1IC7 Y;  184L A;  1D3M A;  5B59 A;  3CDO A;  1LI6 A;  4W51 A;  3A93 A;  1NQI A;  3S8F B;  235L A;  3ATO A;  4I7L A;  4AXT A;  3VG9 A;  3HU8 A;  1NMM A;  4G71 B;  5IDD A;  1OUF A;  1DPX A;  1NBY C;  165L A;  1H87 A;  1GF7 A;  128L A;  2HUB A;  231L A;  239L A;  1M0L A;  205L A;  5C6L A;  3HDE A;  2L78 A;  1YIK A;  1OWZ A;  2YCZ A;  1L49 A;  1L91 A;  3EML A;  157L A;  3ZVQ A;  4HJZ A;  1W08 A;  1L25 A;  5A8E A;  1WQN A;  2F2Q A;  1RE2 A;  1T8F A;  1CX6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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