3D4SA

Cholesterol bound form of human beta2 adrenergic receptor.
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A specific cholesterol binding site is established by the 2.8 A structure of the human beta2-adrenergic receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 160
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3d4sA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3d4sA01
4W56A 206LA 1L28A 5AHYA 1L99A 1C69A 1OV7A 1G0PA 1L68A 1B6IA 1D3JA 1G06A 1L66A 1PQJA 1L73A 199LA 2A4TA 2O79A 1QHJA 236LA 1L88A 2RBNA 3QBIA 4WW3A 104LA 1LYHA 3ZPRA 2RB1X 168LA 1L30A 3DN8A 1L05A 1QSQA 1L08A 2B6XA 3EH4B 3T45A 3C8QA 3UTXA 1L77A 1CUQA 3HH6A 1KNIA 129LA 1L71A 1PQMA 3GULA 4XTLA 3HWLA 1L95A 3ZEVA 3GUNA 3HTBA 5BR2A 2OE9X 3VVKA 1QTHA 3L64A 4I7KA 198LA 1L16A 196LA 1L43A 167LA 1FBKA 1X0SA 2YCXA 4MQSA 2ZZLA 2ZFEA 1L40A 5ITEA 1P2LA 1XEPA 3VG9A 3HTGA 4BUOA 3WQJA 1L19A 250LA 181LA 216LA 1L67A 122LA 1P6YA 1OVKA 3PBLA 3C7YA 1OVJA 3GUMA 4MQTA 4DKLA 1DYAA 1L53A 2B7XA 4J4QA 1L01A 2HUKA 5G28A 1G07A 1L64A 5B6XA 3DN0A 3HH4A 2YDVA 5ETZA 1P3NA 3OE9A 1CV6A 1QT3A 3HASA 3VW7A 1L80A 107LA 4WAVA 1C6KA 251LA 138LA 3C7WA 1L29A 5B6VA 4QIDA 254LA 1L15A 1L75A 2OTZX 2I20A 1U19A 1L98A 1L65A 2NTGA 166LA 1QKOA 3OAXA 4ARLA 4PXKA 3NS0A 225LA 5LWEA 126LA 139LA 1LI6A 3C80A 3DN4A 4W57A 1PXSA 155LA 1SX7A 3DQBA 233LA 3LZMA 1DYFA 2Z73A 5G36A 1P8IA 3HU8A 3EH3B 1QUGA 221LA 1C6FA 4IAPA 2RBQA 3G3VA 4A4MA 111LA 3S3DB 1HZXA 2RAZX 1LLHA 1SWZA 1QT6A 169LA 1L06A 1WTHA 253LA 2BRDA 3EH5B 238LA 2RBRA 2RH1A 2OTYX 1R84A 110LA 255LA 2I1XA 4Y9HA 184LA 1L03A 5H2HA 3HAOA 2QPDB 1C6AA 1T97A 1L0JA 1L85A 1L09A 4PJZA 3PXOA 261LA 1C66A 3GUOA 5B0WA 145LA 1I6SA 1OYUA 1D9WA 1L13A 1L04A 3EMLA 1P56A 152LA 3QBKA 1L56A 3C81A 2OEAX 1H68A 1L41A 1QS9A 3FI5A 1LYFA 222LA 2Z55A 3P0GA 3FADA 1L17A 1CU5A 3C8RA 2I21A 114LA 1QT4A 1DYDA 1LI3A 3OE0A 4I7OA 1L63A 1ZWNA 1L14A 1CX7A 4EA3A 157LA 5DYSA 182LA 3KJ6A 3VGAA 1LWGA 2B75A 4HWLA 219LA 3UG9A 245LA 1P36A 4G72B 5G54A 2OE7X 158LA 1C6PA 4G70B 1L00A 4ARQA 1BRXA 1LW9A 3HAQA 4FAAB 4AQNA 1L97A 1BM1A 7LZMA 2F32A 1H2SA 1LYJA 3UTVA 4FPDA 5B34A 2PEDA 2OU8A 3UTWA 5H2JA 1P64A 4LDLA 1XMEB 2ZIYA 1L0MA 3HTFA 1TLAA 3PQRA 1C6DA 1T8AA 2B74A 1BRRA 3CDVA 3AYMA 191LA 1L12A 2L78A 1MGYA 1P8UA 4ARPA 1L31A 1G0KA 127LA 1DZEA 1C68A 1D3NA 4UG2A 2JAGA 131LA 2YCZA 183LA 1L9HA 1UAZA 1C6MA 1L0KA 1LPYA 4MD1A 1L58A 3C82A 2R4RA 3X3BA 1L96A 143LA 1C64A 3VHZA 4G71B 4W52A 4EKSA 2IGCA 3HUQA 1L61A 3SB6A 4ARMB 1L02A 5B35A 260LA 1CVKA 1KGBA 5A44A 185LA 119LA 1C6EA 4I7LA 1XJIA 109LA 1CV0A 2HPYA 1L92A 5G2CA 3CDTA 1C6LA 1JQUA 1SX2A 3GUPA 2RB2X 4BV0A 1C60A 1K28A 239LA 2NTUA 3S8GB 2LC9A 1JTNA 4GBRA 174LA 1QS5A 1JV7A 2J4YA 1OWYA 211LA 120LA 1LGWA 3HDEA 1L52A 2YCYA 4HYXA 164LA 156LA 1G0QA 1IW6A 4LDEA 2RBPA 177LA 1E12A 1CU0A 1GZMA 4X1HA 3RUNA 3QAKA 2G87A 4BEYA 1CU3A 5AX1A 3A7KA 1L25A 2WJLA 3UZCA 256LA 5B6YA 4EKQA 4BEZA 3CDOA 4EKPA 4EPFA 1S8LA 1TN5A 4IARA 189LA 224LA 1S51A 3X3CA 4MD2A 1P7SA 1QUOA 102LA 163LA 3DMXA 3SB8A 2X72A 1LYGA 5JJJA 1S52A 3C9MA 4X31A 1F50A 176LA 3SN6R 4GP4B 4N4WA 2L6XA 1OWZA 230LA 4EIYA 3HDFA 2QARC 1KMEA 1S53A 1X0K1 1KY1A 4OO9A 1C61A 1CU2A 200LA 2LCBA 4I7TA 1E0PA 4W54A 5B6ZA 1L38A 3HAPA 1G0GA 1L70A 4I7MA 115LA 1M0KA 159LA 4W51A 161LA 2RB0X 151LA 1S8JA 2EI4A 5JJEA 4XT1A 141LA 142LA 3SBBC 4DJHA 1OVHA 4OV0A 2OU0X 1CU6A 3JR6A 1M0LA 5H2KA 4BWBA 2B70A 4IAQA 144LA 1L27A 1G0JA 1R2NA 1C6QA 249LA 1C8RA 190LA 1L47A 2ANXA 2Y00A 231LA 1VGOA 4FBZA 5AZDA 4KNFA 1L89A 1C6HA 1PXRA 2VT4A 232LA 5H2MA 1L10A 4W55A 1IXFA 3QJQB 229LA 3FA0A 2Y01A 128LA 1XJUA 246LA 4I7QA 4I7SA 1QM8A 3QJTB 5H2LA 4AMJA 2ANVA 3S3CB 192LA 147LA 1LYIA 3QJSB 3G3XA 1L62A 2O7AA 1L74A 4LZMA 227LA 4YX7C 2HULA 4LDOA 4W53A 1TN0A 2F95A 259LA 178LA 4UHRA 4EPIA 5KKHA 1L55A 3BVDB 1CV5A 3DKEX 1KG9A 3ODUA 1PQKA 1L24A 201LA 3QBGA 3DDLA 1QUHA 234LA 1L72A 3G3WA 3HARA 242LA 4PXFA 3QJUB 4XT3A 3C83A 2RAYX 3V2WA 1D2YA 1QT7A 3REYA 1XIOA 5BR5A 1ZYTA 162LA 3AYNA 180LA 223LA 3DNAA 2F47A 5EN0A 3RFMA 1KG8A 1KS3A 188LA 2B72A 197LA 1CUPA 1G0LA 1PQOA 5AX0A 1C6JA 3CDQA 4E97A 3HUKA 1SSYA 1L45A 4W58A 1L83A 103LA 243LA 3QJRB 1LN6A 1L32A 1L82A 4I7JA 1L18A 4S0WA 108LA 2F2QA 2Y03A 3CAPA 3C8SA 5LZMA 1L23A 1L35A 1F4ZA 1L91A 4G7RB 244LA 149LA 2B6ZA 3GUIA 1L57A 1QTVA 1VJMA 2AT9A 1QSBA 2KSAA 5H2NA 2OE4X 165LA 1QTDA 3UZAA 5DHHA 4I7NA 1L07A 5JJNA 3HU9A 1DYCA 3HH3A 1LGXA 175LA 1L46A 214LA 1L21A 228LA 2NTWA 170LA 2B6TA 1G1WA 2YCWA 4JR8A 3L2XA 4W59A 4G7QB 2KS9A 5AWZA 1P37A 3F8VA 1L84A 1C6TA 1T6HA 3RZEA 1LI2A 3DMZA 1L86A 3GUJA 2QPEB 1L60A 4EXMA 5C1MA 235LA 5A45A 1C8SA 4EJ4A 1FBBA 1L42A 1L20A 1L26A 1L50A 3QDCA 1EPYA 5DHGA 3OE6A 1X0I1 5G2DA 2Q9DA 218LA 4G7SB 4QRYA 1QTZA 3UONA 258LA 1L22A 4GBRB 3HT7A 1XJTA 3QBLA 4X32A 1C65A 1QUDA 3HH5A 5H2PA 1QT8A 1LWKA 1L33A 5ITCA 4BVNA 2R4SA 3QAPA 1AT9A 3NY8A 2JAFA 1L93A 1T8FA 1QT5A 1CWQA 160LA 2M3GA 2Y04A 3C7ZA 123LA 2QB0B 4HYJA 4GRVA 2RBSA 1L54A 226LA 2Z6BA 1S54A 3GUKA 1UCQA 2RBOA 1L94A 6LZMA 3ABWA 1C6IA 1L37A 257LA 3PDSA 1IW9A 1T8GA 3DMVA 3HT9A 3HT8A 1KY0A 4PK0A 1L81A 4K5YA 4YXCA 248LA 262LA 4GPOA 4GP5B 1GU8A 150LA 3C9LA 3CODA 240LA 1JFPA 2CUUA 173LA 215LA 1LYEA 2I35A 2NTHA 186LA 1P46A 3DN2A 3COCA 1L90A 1CTWA 4XTNA 112LA 1Q5IA 4EKRA 1P8HA 3NYAA 4I7RA 5I14A 1G0MA 1OV5A 4IB4A 2LZMA 1C62A 3SB7A 3NSBA 4JQ6A 1QTBA 1P5CA 1Q5JA 1L79A 4L6RA 3D4SA 3DN6A 187LA 5FJGA 1C67A 1C6NA 1L11A 4XXJA 4ARJA 4GYCA 1D3FA 113LA 1JV6A 148LE 3VI0A 1QKPA 4KLYA 1L39A 1SWYA 5B6WA 1C6CA 1L69A 4ZPUA 252LA 2O4WA 3DN1A 1C6GA 4MBSA 3ZPQA 1L34A 125LA 1L76A 2B6WA 4AMIA 3K2RA 1C63A 1C6BA 209LA 3SBAA 3AM6A 4I7PA 1O0AA 5TGZA 237LA 172LA 1KW7A 1L48A 213LA 5J7AA 171LA 4NC3A 3QJVB 1JGJA 1F88A 217LA 4QI1A 5H2IA 2KSBA 2Y02A 4YXAC 3PWHA 3DN3A 4N6HA 4FA7B 146LA 1L49A 3OE8A 3V2YA 195LA 205LA 1PQDA 3S8FB 5A8EA 2B6YA 1P2RA 3F9LA 5H2OA 1LYDA 1DYEA 1ZURA 4L35A 241LA 2HUMA 3SB9A 1L59A 1M0MA 1PQIA 1DYBA 4JKVA 1SSWA 118LA 3HANA 140LA 1NHBA 212LA 4ARQB 3CDRA 3NY9A 1PY6A 2YDOA 1LGUA 3HUAA 1JTMA 2LNLA 4TL3A 2WJKA 4DAJA 1G1VA 4GP8B 1L51A 137LA 1BRDA 247LA 1AP9A 1GUEA 1D2WA 1CV1A 3SB5A 5AHZA 1DYGA 1L36A 1QTCA 4N4YB 5G2AA 5G53A 1L87A 2B73A 210LA 3MBVA 3S3BB 1C3WA 1CV3A 1L44A 4ARMA 1KW5A 3HTDA 5F8UA 1CX6A 2OU9A 4XTOA 3UTYA 220LA 3HT6A 2Q9EA 1EHKB 5B2NA 130LA 1CV4A 2KSYA 2F93A 1D3MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TXJA 206LA 3FI7A 1G0PA 1L68A 1G06A 1D3JA 1LOZA 1PQJA 3GXRA 1L73A 2O79A 1VEDA 1L88A 5LVKA 1LJHA 2RB1X 2ZQ3A 1GB0A 2FYDA 1IC5Y 2Q0MX 3SP3A 3C8QA 1L77A 4H94A 1PQMA 129LA 1L95A 3HTBA 3RT5X 3VVKA 1X0SA 1KIPC 2ZFEA 3VG9A 3WQJA 1C45A 1L67A 3B6LA 4XADA 5B1FA 3C7YA 2B7XA 4J4QA 1CJ7A 2ZWBA 1G07A 1JJ3A 4RDSA 3A6BY 4QY9A 1P3NA 3OE9A 1QT3A 2F2NA 2BQDA 2Y8PA 4GLAA 1VDQA 2H5ZA 4N9RA 251LA 1WTNA 3QE8A 1L29A 1LJ3A 3TXGA 3OJPA 1L15A 1WQOA 1L98A 4J0LA 1L65A 1LMAA 4DT3A 5LWEA 139LA 1IWXA 4OWAA 1PXSA 155LA 4ET8A 1B5UA 3CT1A 5G36A 3F6ZA 1BB5A 2FBBA 1QT6A 253LA 4N0JA 1YIKA 1C7PA 110LA 3T6UA 2I1XA 4Y9HA 3HAOA 1T97A 4U3XB 1L0JA 5KXZA 1L09A 3AB6A 5B0WA 1OYUA 4LYZA 5DN5A 1LMQA 1L56A 3C81A 1RJCB 4YOPA 1L41A 1QS9A 2DKVA 2BLYA 1L17A 4J1BA 1QT4A 4I7OA 5KXMA 4UWVA 1CX7A 1LZ6A 182LA 3VGAA 4NHQA 3UG9A 1LZAA 2OE7X 158LA 1C6PA 2ZQ4A 1IR9A 1BM1A 7LZMA 4NEBA 3UTVA 2BQNA 4TSBA 2OU8A 1XMEB 4NGLA 1B7QA 1ZMYL 4NY5A 2HEBA 127LA 1D3NA 1QTEA 4H8ZA 1HELA 3RU5A 4MD1A 1L96A 4G71B 2MEBA 1FKVA 1L61A 3SB6A 1L02A 4GN5C 1UIEA 1LMNA 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 1QT7 A;  3REY A;  1XIO A;  5BR5 A;  1ZYT A;  162L A;  3AYN A;  180L A;  223L A;  3DNA A;  2F47 A;  5EN0 A;  3RFM A;  1KG8 A;  1KS3 A;  188L A;  2B72 A;  197L A;  1CUP A;  1G0L A;  1PQO A;  5AX0 A;  1C6J A;  3CDQ A;  4E97 A;  3HUK A;  1SSY A;  1L45 A;  4W58 A;  1L83 A;  103L A;  243L A;  3QJR B;  1LN6 A;  1L32 A;  1L82 A;  4I7J A;  1L18 A;  4S0W A;  108L A;  2F2Q A;  2Y03 A;  3CAP A;  3C8S A;  5LZM A;  1L23 A;  1L35 A;  1F4Z A;  1L91 A;  4G7R B;  244L A;  149L A;  2B6Z A;  3GUI A;  1L57 A;  1QTV A;  1VJM A;  2AT9 A;  1QSB A;  2KSA A;  5H2N A;  2OE4 X;  165L A;  1QTD A;  3UZA A;  5DHH A;  4I7N A;  1L07 A;  5JJN A;  3HU9 A;  1DYC A;  3HH3 A;  1LGX A;  175L A;  1L46 A;  214L A;  1L21 A;  228L A;  2NTW A;  170L A;  2B6T A;  1G1W A;  2YCW A;  4JR8 A;  3L2X A;  4W59 A;  4G7Q B;  2KS9 A;  5AWZ A;  1P37 A;  3F8V A;  1L84 A;  1C6T A;  1T6H A;  3RZE A;  1LI2 A;  3DMZ A;  1L86 A;  3GUJ A;  2QPE B;  1L60 A;  4EXM A;  5C1M A;  235L A;  5A45 A;  1C8S A;  4EJ4 A;  1FBB A;  1L42 A;  1L20 A;  1L26 A;  1L50 A; 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 4L6R A;  3D4S A;  3DN6 A;  187L A;  5FJG A;  1C67 A;  1C6N A;  1L11 A;  4XXJ A;  4ARJ A;  4GYC A;  1D3F A;  113L A;  1JV6 A;  148L E;  3VI0 A;  1QKP A;  4KLY A;  1L39 A;  1SWY A;  5B6W A;  1C6C A;  1L69 A;  4ZPU A;  252L A;  2O4W A;  3DN1 A;  1C6G A;  4MBS A;  3ZPQ A;  1L34 A;  125L A;  1L76 A;  2B6W A;  4AMI A;  3K2R A;  1C63 A;  1C6B A;  209L A;  3SBA A;  3AM6 A;  4I7P A;  1O0A A;  5TGZ A;  237L A;  172L A;  1KW7 A;  1L48 A;  213L A;  5J7A A;  171L A;  4NC3 A;  3QJV B;  1JGJ A;  1F88 A;  217L A;  4QI1 A;  5H2I A;  2KSB A;  2Y02 A;  4YXA C;  3PWH A;  3DN3 A;  4N6H A;  4FA7 B;  146L A;  1L49 A;  3OE8 A;  3V2Y A;  195L A;  205L A;  1PQD A;  3S8F B;  5A8E A;  2B6Y A;  1P2R A;  3F9L A;  5H2O A;  1LYD A;  1DYE A;  1ZUR A;  4L35 A;  241L A;  2HUM A;  3SB9 A;  1L59 A;  1M0M A;  1PQI A;  1DYB A;  4JKV A;  1SSW A;  118L A;  3HAN A;  140L A;  1NHB A;  212L A;  4ARQ B;  3CDR A;  3NY9 A;  1PY6 A;  2YDO A;  1LGU A;  3HUA A;  1JTM A;  2LNL A;  4TL3 A;  2WJK A;  4DAJ A;  1G1V A;  4GP8 B;  1L51 A;  137L A;  1BRD A;  247L A;  1AP9 A;  1GUE A;  1D2W A;  1CV1 A;  3SB5 A;  5AHZ A;  1DYG A;  1L36 A;  1QTC A;  4N4Y B;  5G2A A;  5G53 A;  1L87 A;  2B73 A;  210L A;  3MBV A;  3S3B B;  1C3W A;  1CV3 A;  1L44 A;  4ARM A;  1KW5 A;  3HTD A;  5F8U A;  1CX6 A;  2OU9 A;  4XTO A;  3UTY A;  220L A;  3HT6 A;  2Q9E A;  1EHK B;  5B2N A;  130L A;  1CV4 A;  2KSY A;  2F93 A;  1D3M A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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