3D5JA

Structure of yeast grx2-c30s mutant with glutathionyl mixed disulfide
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
b'SHMMVSQETVAHVKDLIGQKEVFVAAKTYCPYSKATLSTLFQELNVPKSKALVLELDEMSNGSEIQDALEEISGQKTVPNVYINGKHIGGNSDLETLKKNGKLAEILKPVFQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural aspects of the distinct biochemical properties of glutaredoxin 1 and glutaredoxin 2 from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-2, mitochondrial
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 41
structure length 112
sequence length 112
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3d5jA00
4HQZA 2FWHA 4L5OA 2G2QA 4TVEA 4XRDA 3F0IA 3EU3A 3FZ9A 4ULXA 5B7CA 2JZRA 2CZ2A 1PN9A 2OBIA 3P7XA 1AIUA 4WF5A 2KP1A 2H70A 4AGSA 2PBJA 2L57A 1T1VA 4HJMA 4GSTA 2F8AA 2DJ3A 5JWOB 8GSSA 2FA4A 2B5YA 3D22A 4ID0A 2RIIA 3QMXA 2KLXA 4QQ7A 2V2GA 2VM1A 2KHPA 4WKWA 3APQA 4K8MA 4DEJA 2IN3A 4JR4A 2YNXA 4KDYA 3LGCA 2H1AA 2YCDA 4TXOA 1ERWA 2WJUA 1AW9A 1FAAA 3RHCA 4EKZA 4HJ2A 3F9UA 2C3NA 18GSA 3IBHA 3QOUA 4EE0A 2NDOA 1BEDA 1TRSA 2H71A 5EPFA 2DJKA 3L78A 3TRPA 3GX0A 2VCQA 4Q5FA 2VLTA 2HRFA 4YAVA 4GF0A 2WULA 4XS1A 3KCMA 1X9SB 4K6XA 1SYXA 5J9BA 2ON5A 4EDYA 3KZQA 5KN0A 1GSDA 1FW1A 5H5QA 1QFNA 4NV2A 3UIWA 1TJDA 4WF4A 1PGTA 1OC3A 2DIYA 4FYUA 1A8YA 3D4MA 3VPTA 4ZB8A 1ERTA 4G9HA 16GSA 3A2WA 4TRXA 3F63A 1EOGA 5CYYA 5ECLB 4ZL8A 5A4VA 2I9HA 3DD3A 1FOVA 4MZWA 5GAND 3L4NA 3F3QA 3G7IA 5DQYA 1AQVA 3NZNA 3F4TA 1GTIA 4GLTA 5ECIB 2B5EA 2C3QA 4O32A 4V1Ag 4MPGA 4TXOB 1JZWA 3IPZA 4XIHA 3HY2A 1CQGA 2OA7A 1DE2A 5E59A 6GSUA 4ZXGA 1TRUA 1MDIA 5DJMA 3CSHA 1SK2A 5D93A 4GRFA 5CO3A 2PMTA 3G9BA 2PU9C 5DBQA 2H75A 1IYIA 1C72A 2MYGA 2YV7A 5LCZA 1ACVA 3GH9A 4LL4B 4WXTA 3FR3A 2DSAA 2H6ZA 1NSWA 1F3AA 5AIVA 2XBQA 4TOPA 2P5RA 5IMZA 3D5JA 4LL1B 4CHSA 3HXSA 2FLSA 1JHBA 1O8XA 1AQWA 4J57E 5CRGA 1W4VA 3KGKA 3ZIVA 2JACA 2GZYA 1OVNA 4RQRA 1DSBA 3LYPA 2K6VA 1TU7A 1XW9A 5HFIA 4GCIA 3Q6OA 2DJ0A 4XS6A 3GH6A 2MMNA 2F9SA 2M80A 5IMCA 1ILOA 4KA0A 4O5RA 3C7MA 3O6TA 2IL3A 3FW2A 4L5LA 2O89A 5INYA 1BYEA 3JCML 2JL4A 3TJKA 2QSIA 2N5FA 3DVWA 1EWXA 1Z3EA 1M0UA 3H8QA 2OADA 1Y6EA 4KB3A 4HZ2A 1DUGA 1SK0A 3ERFA 4K7IA 1Y25A 5GZZB 1TW9A 3TJGA 1YEPA 4PQIA 2FWFA 2H01A 4E8EA 2LUSA 2H76A 5L71A 2CX3A 14GSA 3BJ5A 4MZBA 2GS3A 2OE0A 2FHEA 1SKSB 4QL7A 1TK0B 1XFLA 5B8AA 3QCPA 6GSWA 2C8UA 3CXGA 2X8HA 1K3LA 2AHEA 5D96A 5DQSA 4PQHA 2A2SA 2DC5A 2IIYA 1K0MA 3IK9A 2CVKA 2B3SA 3E3EA 2P0GA 3TJJA 4I2TA 3IHQA 1T00A 2VLVA 1PQNA 3A2VA 1G7OA 4FO5A 1AQXA 4XS4A 3QPMA 1O6JA 3TOTA 5KN3A 1M7TA 1G0TA 3HJPA 1KBNA 2NVLA 4ZIJA 4JZQA 3ZFBA 3H4KA 4I8BA 3M8NA 5A4WA 2LRNA 1V57A 4HEA2 5IPHA 1F37A 1BJXA 1PL2A 1ERUA 3GYKA 2O85A 1VGLA 1F3BA 3F6FA 4NWYA 1A2LA 1XIYA 2L4CA 3CTGA 1PKZA 1M9AA 1SK1A 2E7PA 4NAXA 3UBLA 4GSNA 2L5OA 2KUCA 3I43A 3CYNA 1T4ZA 5DCGA 5KN2A 4RQXA 5A5KA 3V1WA 2D2ZA 1MTCA 12GSA 2VLUA 4IHUA 1ZMAA 3M0FA 3GA4A 5EVOA 3ME7A 4YQMA 3K8NA 5GAPD 3WGXA 3EVIA 1XVQA 3L9VA 5F07A 3Q74A 2B7JA 2DLXA 2GTUA 1FVKA 2HT9A 2VO4A 3VWXA 6GSYA 3EWLA 2VCTA 1GLQA 2B7KA 3HVVA 1SKWB 2LNTA 2X64A 3C71A 4WR5A 3W8JA 1B48A 4MJAA 4EF0A 4V2MA 4POLA 3G7JA 4GSSA 5D8IA 4MMMA 3TKPA 2PVQA 4N0ZA 1THXA 3KJYA 3LYKA 3EURA 3RBTA 1J08A 3A5WA 4OCEA 5ELGA 3GL5A 4DSSA 5DALA 5KN1A 2GSQA 1YKAA 2GSTA 3RHBA 1VF2A 1I9DA 2DJJA 1BG5A 3GX8A 5ABRA 1MD3A 1YQ1A 1A2MA 4IW9A 17GSA 2IJYA 1AC1A 3GFKA 3TOUA 1H75A 3I69A 3UMAA 3O3TA 4O7HA 4KGIA 2OKAA 4FYCA 2VUPA 3RAZA 3GNJA 3GN3A 1X9MB 4N11A 1TI1A 5ID2B 2RUFA 4NMUA 5CRWA 4QL9A 4MF6A 3EYTA 1PD21 3TUEA 3QAVA 1K0DA 1QQ2A 2I1UA 3Q18A 3GUSA 5EY6A 1SU9A 5ECKB 2HRNA 2CAIA 1TKDB 1GP1A 1TDIA 1NHYA 1FB6A 2H66A 4DSSB 4GTUA 2MZCA 2AV4A 5DALB 6GSXA 2GLRA 2XHFA 3KXOA 5LD0A 1TU8A 3QR6A 1BX9A 1U6TA 5CRDA 1KNGA 3J7Yb 5JCWA 2HI7A 3N5OA 5DVBA 4WEYA 4F9ZA 1KTEA 3E9JB 3ZIJA 1XWGA 5G30A 2F51A 2MMAA 2L5LA 3FZ5A 2YWIA 4PURA 2JSYA 3W6GA 3AY8A 4F03A 5HFKA 3HJOA 3UBKA 4N0VA 1B4PA 2Z9SA 2A4VA 2B5XA 3O76A 4BA7A 4JU5A 1Z7RA 1YEXA 1QUWA 1GSEA 2K8SA 1YZXA 3ZL5A 3HVSA 2GT5A 4EL1A 1F9MA 22GSA 3C1RA 7GSSA 4POKA 3IA1A 5FWGA 2YZUA 3DRNA 2H6XA 3TCOA 1EGRA 4HQSA 4IQ1A 1Z6MA 1PA3A 3LJRA 2X99A 4DVCA 3M9KA 3ME8A 1M9BA 4XRAA 2ON7A 2GGTA 1QGVA 1E6BA 2GQKA 2CQ9A 1WIKA 1CQHA 2N5BA 3LG6A 4JEDA 3HZ4A 5CP1A 4KSMA 5IO0A 4D73A 2C4JA 1WE0A 1A0FA 3S9FA 1GUHA 1X5DA 4GWRA 1GTBA 3UAPA 2RUEA 1T4YA 3TKSE 3VK9A 1O7UA 3APSA 4ECIA 2H1GA 4IGJA 2VL3A 2IWTA 5C04A 3DVXA 2L4QA 4Q5RA 4F82A 1TXXA 4OFMA 1XVWA 1GSFA 4EXJA 3HYPA 4IQAA 3IR4A 3KP8A 1SKRB 2GVPA 5GSTA 5AISA 4EVMA 2HSHA 2XPDA 4KE3A 5HR0A 5DDLA 3FYGA 3D4TA 3D0ZA 4NHZA 1U3AA 4MJEA 1Z9HA 4YAPA 1XOBA 4ISDA 4PQ1A 2G0FA 2WFCA 5J3RA 4KX4A 4JR6A 2H72A 5HR3A 3VWWA 4IELA 3GIXA 4EUYA 4POBA 1T7PB 1R26A 2M46A 3QFAC 4RI7A 2HE3A 4IJ3A 2VCZA 4I97A 4MLYA 4D73B 1JFUA 1OE7A 3G7YA 4NHWA 5D9VA 2VOCA 1ST9A 1UVZA 4MDCA 3BD2A 3EINA 3DGQA 2DBCA 4PUAA 2CVBA 1FO5A 4CDOA 3IXRA 1A8LA 3FZ4A 1YY7A 3DKSA 5HQPA 2FY6A 3ZLPA 1K0AA 3EE2A 2EIRA 4DSQA 5IQYA 1K0NA 2K18A 2DIZA 4F0CA 4L0UA 5AGYA 1ZL9A 3GKKA 4G2EA 3PGTA 3QAWA 2R5GA 1YJ6A 2IMEA 1JZRA 1SJ6A 1SL1B 3WGDA 2QC7A 4GQFA 5F05A 2AYTA 1EEMA 4XHMA 3ZZXA 1PX6A 2C3TA 4J2FA 4P3YB 1THOA 1GNEA 2V6KA 1M2DA 1UC7A 2ES7A 3KMNA 2YWNA 4K0NA 4MCUA 2A2RA 4LMWA 2JSZA 3F4RA 4JRRA 1PSQA 1BAYA 1GUMA 3HA9A 4MABA 5IMAA 2C1YA 2YPMA 3HDCA 4KH7A 5DAKA 3VPQA 5CNWA 2IPAA 4HDEA 2PGTA 5IMFA 1EP8A 2HZEA 2C0FA 6GSVA 1NM3A 5J4UA 4IP1A 1XPVA 2BTOT 2JADA 3LSZA 1X9WB 1GULA 2WS2A 3EMXA 1MEKA 5ELAA 1U3IA 2AAWA 4POMA 1WMJA 2HLSA 4F0BA 2OBKA 4V2NA 3EMPA 1K0BA 2VCXA 2DJ1A 3KH9A 1PMTA 5H5SA 2DMLA 1K0OA 2OACA 1LJRA 2BJXA 5ECHB 3WYWA 2LJRA 3R2QA 4KDXA 1ERVA 4OMVA 4HU9A 1XWCA 1A0RP 1RW1A 3IK7A 5LNKe 3FY7A 1JZOA 3DMLA 5IO2A 1OE8A 5A4UA 1VRSD 2VM2A 2IMKA 2YN1A 3VWVA 2H6YA 2RLIA 4AF2A 5HR2A 3VLNA 2GQMA 2WZ9A 2H30A 1MDKA 1GLPA 2WGRA 3GSSA 1XWKA 3PR8A 3VI5A 2LV3A 3CMIA 3GV1A 5COHA 5G1LA 1R7HA 5DAKB 3VWUA 3I6AA 3LXZA 2H8LA 1UA5A 3N9JA 5IOWA 2HZEB 2YJ7A 3BOAA 2JZSA 5ECNB 4EDZA 2HZFA 1Q4JA 4MH3A 5G5FA 1EEJA 2H1DA 3IC4A 2VCWA 3UOMA 4XS4B 1ZZYA 4OFTA 2WDUA 4MH2A 1NW2A 3TKSC 1TK5B 4WBRD 2NBSA 1TI3A 3GKMA 4KCAA 5J9CA 4MJCA 2JZTA 2FNOA 2C0GA 1YF0A 1XOAA 3SWLA 4FH8A 4ACSA 1G7EA 3EC3A 4N30A 4ZB6A 2P5QA 3RDWA 3MDKA 2XPEA 3TKRA 2TRXA 2EIOA 1H4OA 2HSYA 1O81A 4PNFA 4JBBA 2YOIA 1DE1A 1KEBA 5IPGA 2IMFA 1X0RA 4WBJA 3TRQA 1SD9A 3FKFA 1GRXA 3TRXA 2FA8A 1RK4A 3TJFA 2QKEA 1GSQA 2DMMA 3F6DA 1Q98A 5AIXA 3QDNA 4OWYA 3D6IA 4TR1A 2LJKA 2HNLA 3GURA 1GWCA 1V58A 4ECCA 1A23A 3MNGA 4TR0A 4ECJA 1X5EA 2TRCP 4MJBA 1VF4A 5G2ZA 2ZUPA 4PNGA 2CX4A 4OO5A 1T8EB 1EP7A 1QMVA 4OCFA 1K3OA 2P31A 5G5EA 1M99A 2HFDA 5IMDA 3FR6A 4ZL7A 4Q5NA 3CRUA 5EL8A 1F2EA 2VL9A 1XWAA 4MP4A 3RPNA 2M72A 3UVTA 5JCUA 2FWGA 4RUVA 1T3BA 4YQUA 4X43A 4G10A 1K0CA 1HD2A 1TP9A 4V1Ap 2WRTA 2V41A 2GSSA 2IMIA 1HYUA 5G31A 2RM6A 4YH2A 1LU4A 1GSUA 2CAQA 3C8EA 3MWHA 2MMZA 2AB6A 3MAKA 4TXVA 4IP6A 1TRVA 3UARA 3VI7A 4PX1A 3EU4A 1EZKA 2OE1A 4Q5QA 3H1NA 1EV9A 2VIMA 1SL2B 5F0GA 2LQQA 1N8JA 1SJZA 5KEJA 2K9FA 4AJ7A 3MSZA 1JZDA 1JLWA 2L59A 2QGVA 4K7OA 2PUKC 5C00A 4MF7A 3TGZA 1TRWA 4I6XA 4L0WA 2I3YA 6GSTA 3IAS2 2GDRA 1XW6A 3IV4A 4MA9A 3ERWA 1FVJA 4HOJA 3W8SA 1U88A 2YJHA 3GKXA 1B9YC 2H0GA 5IMVA 2CV4A 4H86A 3F3RA 1R4WA 3HCZA 4IVFA 2CVDA 1PX7A 2EIQA 1TTZA 4DSRA 3DYRA 1AAZA 2AJQB 1XBSA 3UVHA 5D9XA 2EC4A 2PN8A 5JWRB 5FHIA 1TOFA 1Z5YE 2WCIA 3L0HA 2H19A 1WOUA 1EOHA 3LORA 5AN1A 4AJ6A 4IN0A 2FUG2 4IJIA 5DCHA 4PGTA 1S3DA 4IBPA 3UJ1A 4PXOA 1YKCA 4F2IA 5HFGA 2E0QA 4EO3A 1A24A 1GSSA 5D73A 1GSYA 4ILFA 4KSOA 4PUFC 5B8BA 20GSA 3GHAA 1O73A 3CRTA 1OC9A 3KIJA 5ENUA 2YWOA 6GSSA 2JU5A 2CT6A 1ZCPA 3CSIA 2LRTA 4KCEA 1J0FA 2LJAA 4ML1A 5ECQB 2V32A 1ZYQB 3HVXA 3GMFA 1HNBA 1PKWA 4X1UA 1GUKA 3NIVA 3WD6A 2LTKA 4HU7A 1HNAA 1V98A 5CREA 3TKQA 1XCCA 2OJLA 4I2UA 3UL3A 2H0HA 2L6CA 4GQCA 2PWJA 2HXKA 3F4SA 2F8FA 2XC2A 5F8BA 2O7KA 4K7NA 2FCHA 1VF1A 2O8VB 3GL3A 1B8XA 2DJ2A 4KAEA 5B6NA 1Z6NA 3QAGA 3WT2A 4RI6A 19GSA 5E4WA 3ZTLA 1Z7PA 3LWAA 3LQ7A 2MBTA 2VCVA 3US3A 4G19A 3IAM2 5D9WA 4LMVA 2GT6A 3P2AA 5J41A 2KOKA 4X0XA 4MK3A 2V1MA 1ABAA 4BPYA 3LFLA 2BMXA 2MBSA 2B1KA 3U5RE 4ZL9A 4K2DA 2R37A 4TN8A 1OC9B 2F3MA 1XXUA 2LNSA 3J7Yk 3TB2A 3BBYA 5D9TA 4FIWA 4MZCA 4XTSA 1EGOA 5J5NA 4IS0A 4ML6A 4BVXA 1O85A 3FEUA 2R4VA 3U6VA 3ZVJA 3D21A 1G6YA 2GZZA 1XZOA 4ECBA 1SL0B 4MF5A 4KDUA 1E2YA 1UN2A 1V40A 5ECPB 4N10A 3TDGA 1ML6A 3KTBA 3VFIA 1R5PA 2OE3A 1K3YA 2N5AA 2IFQA 4FYBA 3ZITA 3FHKA 1M2BA 2LEGA 3P8WA 3ZREA 4NXIA 1PRXA 2YWMA 1HQOA 1VF3A 3ISOA 1GNWA 4K1FA 1X5CA 2PERA 4IKHA 3GSTA 3I9V2 2K8VA 2ZNMA 4ZB9A 3FK8A 4TKYA 4KUNA 1F6MC 3KH7A 1PL1A 2PVOC 2LRCA 4XCSA 3IOSA 3CBUA 2C80A 3KM6A 2B1LA 3QD9A 5IM9A 3RPPA 3CTFA 3TKSA 13GSA 3Q19A 1URMA 4WETA 3ZRDA 4HUAA 1J9BA 2H1BA 4BWSA 1BQ7A 4HS1A 2R3XA 3UEMA 3HHVA 1B4QA 3WT1A 1FHEA 2X8GA 2E2MA 5CRHA 3ZYWA 2I4AA 4ZBAA 4V2LA 2H0IA 1SJIA 2R2JA 2X8CA 2VD1A 2PPTA 4GXZA 3VURA 1WWJA 3HD5A 1AUCA 1S3AA 4NPBA 1WP0A 3DIEA 3E0UA 2ZCTA 2FGXA 1NHOA 1U87A 3KMOA 3KTLA 4TW5A 5ECOB 5HR1A 3GRXA 2KP2A 5JWQB 4K9ZA 4YQVA 10GSA 4TR4A 1XW5A 2IFQB 1MD4A 1QXHA 2CA8A 2TIRA 1OYJA 3TJBA 3PH9A 1HNCA 3ZMKA 4ZBDA 1XWBA 5GSSA 3BCIA 2LQOA 4HZ4A 3ZFLA 1OAZA 1JLVA 5FT3A 1LBKA 4TR3A 4ZBBA 2I81A 3FR9A 1SENA 2YV9A 3HKRA 4E8HA 1OC8A 1WJKA 1EV4A 1IYHA 4EC0A 5ECSA 5ECRB 1ZYEA 2YANA 2GSRA 2LS5A 2O87A 2C0DA 2H74A 4OFNA 1S3CA 5IIZA 1DBYA 3ERGA 2GQLA 2J23A 1B9XC 2REMA 1USBA 3GTUA 3A2XA 4NV5A 1W89A 4J56E 1SYRA 1GH2A 1YDKA 3ZMLA 2V6OA 2CZ3A 1N2AA 3PINA 1YF1A 11GSA 3ZVJD 2FD3A 3OR5A 1G6WA 2FWEA 2XBIA 2LKUA 3KP9A 4AJ8A 3LXTA 4LA1A 2IMDA 1FB0A 2VL2A 1ZGNA 3CSJA 3GKNA 5ECMB 3L9SA 9GSSA 4WR4A 5ID2A 3QFBC 1TK8B 1V9WA 2NPBA 1GTUA 5G1KA 1I5GA 5IOXA 4Z7XA 5F06A 5B6MA 1RQMA 2VD0A 3IRAA 5JCGA 2MMOA 3HJMA 3NOFA 1WRYA 3H93A 1O8WA 3FZAA 4K0GA 3ED3A 2AUVA 5CAXA 2B6MA 4HI7A 3DEXA 3H79A 2ALBA 1FG4A 3F8UA 3DWVA 3DXBA 3L9UA 2YP6A 2J9HA 2H73A 4JE1A 3C73A 4OO4A 3P90A 5H5RA 2E2GA 4L8EA 3GTUB 2VAFA 3LEFA 1V2AA 1GTAA 1ZOFA 2GZPA 2HYXA 1AXDA 1GL8A 3M9JA 2C0EA 1A2JA 3KD0A 2YZHA 4LLRA 3M1GA 3KEBA 2NTOA 3WGEA 4MPFA 4KNDA 2RM5A 4BVYA 1MDJA 2R6KA 3APOA 1WPIA 3C1SA 3IE3A 3M3MA 1ON4A 2WB9A 4CW9A 1OKDA 4KW6A 4ZILA 4BWQA 3BCKA 2VL2C 3IDVA 1R5AA 4BL7A 1QK8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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