3D6IA

Structure of the thioredoxin-like domain of yeast glutaredoxin 3
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
112
structure length
109
Chain Sequence
b'PVIEINDQEQFTYLTTTAAGDKLIVLYFHTSWPCKALKQVFEAISNEPSNSNVSFLSIDADENSEISELFEISAVPYFIIIHKGTILKELSGADPKEYVSLLEDKNSVN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the thioredoxin-like domain of yeast glutaredoxin 3.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Monothiol glutaredoxin-3
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 30
structure length 109
sequence length 112
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3d6iA00
2GSRA 1A0FA 1LBKA 3NZNA 2RUEA 4XRDA 4FYUA 3GNJA 3DEXA 4PGTA 1TTZA 2JZSA 2NVLA 5ECKB 3E3EA 5IMVA 3L4NA 1TKDB 4XS6A 3QCPA 4HQZA 5HR2A 1TJDA 1O6JA 1BAYA 3Q6OA 2K18A 3A2XA 3QAVA 3DKSA 5HR0A 4NHZA 2X8CA 2FUG2 4EVMA 3L9SA 5DALA 1KBNA 1VF2A 3P7XA 5IOWA 1GLQA 1EP7A 3QOUA 4IS0A 4MF6A 1GSSA 3HYPA 3A3TA 3BD2A 2ZUPA 5J4UA 3G9BA 1U88A 4KDYA 4WBJA 16GSA 2AUVA 6GSWA 5ECPB 4YQUA 1PRXA 2JZRA 3WYWA 3FZAA 4NV5A 1SD8A 1OC8A 5G31A 4XCSA 3RPPA 3QD9A 3UAPA 1OKTA 2C80A 5DVBA 2AYTA 2BTOT 1XWCA 2N5BA 1PKZA 5E4WA 4EF0A 4MF7A 1GTBA 1XFLA 4OFMA 3ED3A 1FG4A 3HHVA 1ZGNA 2B5XA 3VK9A 3U5RE 3GTUB 1EWXA 1THXA 4TR0A 1XZOA 4J57E 4PUAA 2YV7A 3M8NA 2YWIA 1K0NA 1GTUA 2FWFA 1MDKA 5JCUA 4D73B 1AIUA 1B8XA 2B5EA 3ZITA 6GSTA 3PGTA 3H8QA 1TI1A 4WR5A 3DRNA 1X5DA 2AV4A 5LD0A 1T3BA 3EMXA 1NHOA 2RUFA 1T4ZA 2CVDA 1HNBA 1M7TA 13GSA 4MJEA 1DSBA 4MP4A 2JACA 4EDYA 5DCHA 4NMUA 1OC9A 3GKKA 5JCGA 4O92A 1DUGA 3WGXA 1QUWA 2LRNA 2E2MA 3ZTLA 5C00A 4MABA 3HDCA 1MDIA 3VWXA 2H6ZA 4HZ4A 2FLSA 1AW9A 1MDJA 3UIWA 1XOAA 4EUYA 3WGEA 1T4YA 4ZXGA 4YQMA 2R2JA 2PBJA 1XVQA 2PVOC 1EGOA 3BCIA 1ZCPA 2EIRA 2B7KA 1R7HA 1TU7A 1S3CA 3VI5A 4PXOA 1GULA 1V40A 4OD7A 2M46A 2GVPA 2R3XA 4PUFC 2PERA 2DC5A 3LQ7A 3WT2A 1TRVA 1UN2A 1X0RA 4Z7XA 5GAPD 2NTOA 5D9VA 4ML6A 3ISOA 1M2DA 3DIEA 3ZRDA 2H74A 1VF3A 1Z9HA 5GSSA 1ST9A 2F9SA 5DAKB 1JLVA 4HU7A 1O8WA 3QAGA 3DVXA 4X1UA 1TW9A 4GSNA 2GQMA 1GSYA 1ERTA 1M9BA 3ME7A 2AJQB 5EVOA 2GT6A 1K3YA 3BCKA 2FNOA 4L0WA 4BVXA 2A2SA 4TXOA 1A23A 1WPIA 2H30A 2BMXA 1FVKA 4F9ZA 3IDVA 4GF0A 1WMJA 2CA8A 4MZCA 4MH2A 4XS1A 4GSTA 1AQVA 1TK5B 5H5QA 3FK8A 1U3AA 4ECIA 3G7YA 2L5OA 3TKSA 1B4QA 4ECCA 3KH9A 3HA9A 1G6WA 2WJUA 4L0UA 1C72A 4ULXA 2X99A 1GL8A 3Q18A 4ML1A 4IQ1A 2GSSA 1F3BA 4TRXA 1A2MA 1TXXA 2R5GA 4WKWA 1O85A 4ZB6A 5IO2A 2IJYA 2GDRA 4AJ8A 1ZMAA 3F0IA 3GA4A 1GSUA 3ZL5A 3HXSA 4OWYA 4V2LA 5IPGA 1PD21 3LXZA 2R4VA 2GS3A 4KH7A 3KP8A 3TKSE 1J9BA 5IMAA 2DIZA 2CX3A 3TJJA 5ABRA 1FW1A 3JCML 2GZPA 5ECNB 1F37A 22GSA 3M1GA 4YQVA 2B6MA 4HS1A 3HZ8A 2YANA 5J5NA 4ACSA 1R5AA 1K3LA 2O8VB 1AC1A 3ZLPA 5G5EA 3MNGA 2NPBA 4GXZA 3QFAC 4MA9A 4WETA 3RPNA 1TK8B 1A2LA 2FWGA 4IQAA 3LORA 3UOMA 5G30A 2FGXA 5H5RA 2AAWA 4LMWA 3FYGA 2JU5A 5INYA 4WF4A 5L71A 1Z3EA 1Z7RA 2F3MA 1BQ7A 6GSUA 5ECRB 5ENUA 1J0FA 4G9HA 4KSMA 2IMKA 1Y6EA 3KJYA 6GSSA 1YKAA 2LV3A 3F63A 3W8JA 1V57A 3UMAA 3O76A 1ERUA 3VLNA 4OCEA 2A2RA 1K0MA 1SL1B 5G2ZA 1WIKA 1DE2A 2YV9A 4JRRA 3NIVA 1A8YA 2HE3A 1Z5YE 2IWTA 3TKPA 2OACA 3D6IA 5CNWA 1K0AA 4ZB9A 2DJJA 2HZFA 1PA3A 1KTEA 3F3QA 2GTUA 5F0GA 3TJKA 2X8HA 2KOKA 5ELAA 1PL1A 4JU5A 1QQ2A 2FWEA 1DBYA 2V6OA 1O73A 2HFDA 3DVWA 2RLIA 3IA1A 2D2ZA 2LJAA 4FYCA 2LJRA 2QC7A 2H1DA 4L5OA 1ML6A 4MJCA 1XWBA 4TVEA 2DJ2A 1E2YA 1GH2A 4N11A 4PQHA 3UL3A 1OC3A 4F0CA 3ZZXA 4G2EA 1YZXA 2PN8A 1SJ6A 3CYNA 4WXTA 1SK1A 2VLVA 3M9JA 1RW1A 2VD1A 3GL3A 2YOIA 3D4MA 3Q19A 10GSA 3IBHA 5ID2A 4PQ1A 1K0DA 2X64A 4EL1A 1SJIA 2LKUA 5F05A 1TI3A 3J7Yb 5D73A 5D9TA 3ME8A 2C8UA 3FR6A 1WWJA 1BX9A 2H73A 3F4RA 1GUHA 1IYIA 4IHUA 1AQWA 2J9HA 5B8BA 1XOBA 3AY8A 4Q5QA 3IPZA 1GRXA 3OR5A 5GZZB 2HYXA 4TR1B 2ON5A 3TRXA 5HQPA 2DJ0A 4N0VA 2MMNA 3TRQA 1S3DA 3VPTA 1O81A 1TRUA 1FVJA 4NHWA 2B3SA 5ECQB 2V32A 1W89A 4OFNA 2L6CA 3FW2A 3I9V2 1USBA 1F3AA 3UJ1A 3C1RA 5ECMB 5EY6A 1J08A 1BEDA 5JCWA 3LWAA 2A4VA 3UEMA 3PR8A 1XIYA 2OA7A 1X5EA 1EOGA 2MMZA 2GQLA 2GT5A 4Q5NA 3DWVA 5FHIA 2K6VA 1ZYQB 1SKRB 7GSSA 3QMXA 1NHYA 2HRFA 5CRDA 3TOTA 4LL1B 1FB6A 1U3IA 1U87A 3KP9A 5J3RA 1Z6MA 1M0UA 2FD3A 6GSXA 4I97A 3KMNA 1JHBA 2WB9A 1AAZA 2KLXA 5B6MA 1F2EA 2LQQA 1EV4A 1M2AA 2WDUA 2IFQB 5IQYA 4POLA 4KAEA 3ERGA 1YY7A 5FWGA 4K0GA 3FRCA 4H86A 1SENA 2MYGA 2V1MA 2VOCA 1UC7A 4ZL7A 1MTCA 4XS4B 1Z6NA 2JZTA 2GZYA 4KDXA 4KDUA 1Q4JA 4PURA 2HZEA 3SWLA 3BOAA 3I43A 4KUNA 5IMDA 2QGVA 4KSOA 5IPHA 4POKA 4HUAA 3L9UA 1EZKA 1GP1A 2VCXA 3QDNA 4GTUA 1K0CA 2P31A 2TRCP 3VWVA 17GSA 3N5OA 1YF0A 4MPGA 5D9XA 4FYBA 2CQ9A 3IOSA 2OE0A 2C3NA 1B9YC 4ZIJA 4JR6A 5CO3A 1A0RP 5DBQA 3MSZA 1HNAA 2OKAA 4FIWA 2YJHA 5D9WA 3CMIA 5CREA 3IK7A 1YKCA 1BJXA 2OJLA 2VIMA 2GSTA 1A8LA 2VLTA 3DGQA 2XPEA 3FR9A 3KZQA 2L4QA 2HNLA 2C1YA 1PX7A 4K8MA 3APSA 3P8WA 1FHEA 3EE2A 4HU9A 4ZBDA 3D22A 3GL5A 1F6MC 2WZ9A 2FWHA 2K9FA 4RQRA 3RHBA 5B8AA 3LEFA 2LNTA 1XW9A 2V41A 3LXTA 3ZFLA 3GSTA 1GSEA 4ISDA 2RIIA 5KN2A 1BYEA 4I6XA 3ZREA 3WGDA 3GFKA 3EVIA 3D21A 5ECSA 3BBYA 2MBTA 5G1LA 3A5WA 4O5RA 5EPFA 1V2AA 1RQMA 2PU9C 3EWLA 2AHEA 3O3TA 1PKWA 2GLRA 2L59A 4AF2A 3D5JA 2M72A 2LJKA 5A5KA 5AGYA 1YF1A 5B7CA 5EL8A 1EP8A 4Q5RA 3GKXA 1V58A 1ERVA 5LNKe 4HDEA 1CQHA 2CV4A 2FA4A 3KMOA 2IMDA 1V98A 4X43A 3TKQA 1NM3A 2X8GA 4K7IA 3F6DA 4MPFA 1M9AA 1R5PA 3VFIA 1EEMA 3HKRA 1UVZA 3EU3A 3ERFA 2CAQA 1JZDA 2VL3A 1VRSD 2I81A 3F6FA 3C71A 2I9HA 4XIHA 1X9MB 4BPYA 4TOPA 1PX6A 1TRWA 2DMLA 4I2TA 4GWRA 4AJ7A 2P5RA 1Z7PA 2R6KA 3KM6A 3ZIJA 2DIYA 4BWQA 3APOA 3RAZA 1WOUA 4IP1A 2WULA 5DALB 2WFCA 1M2BA 4HQSA 2K8VA 1K0OA 4MJAA 2H66A 5IM9A 1CQGA 4I5QA 2HI7A 2H75A 2I4AA 4J2FA 5HR1A 2B7JA 3CTGA 5ECOB 1ZL9A 4HJMA 2PVQA 2H72A 2JSZA 2F8FA 2PUKC 3KTLA 1TK0B 1JFUA 1WP0A 2CZ3A 2O89A 4ZL9A 5G1KA 3C1SA 4N0ZA 4POBA 4K1FA 5KN1A 3HJPA 2H1GA 2VD0A 4O7HA 4G19A 1I9DA 2EC4A 1K0BA 4CDOA 2OBKA 4TN8A 1UA5A 1GSDA 3VURA 5H5SA 2VCZA 1ZYEA 2H8LA 3EU4A 1GUKA 3MWHA 3VWUA 3G7IA 4KGIA 3GH9A 1R26A 4DVCA 3FZ9A 1SL2B 3QPMA 5J9BA 2KP2A 4Q5FA 3BJ5A 4IW9A 3RDWA 5A4VA 3LG6A 4ZBAA 1SD9A 2YWOA 1GUMA 2LNSA 1LJRA 3CXGA 3KXOA 3IAS2 3HVSA 4GQFA 2V2GA 3C8EA 4K7OA 14GSA 3MDKA 3TKRA 5CRGA 3L9VA 2O87A 1AQXA 3TUEA 5IMZA 1URMA 5F07A 1OC9B 3WT1A 1M99A 1SYRA 2C4JA 3FHKA 4PNFA 3IAM2 4GQCA 5IIZA 1QXHA 5AIVA 2C3TA 2H76A 3P2AA 1W4VA 3FR3A 2B5YA 4KA0A 1SKWB 1SL0B 3TJBA 2MMOA 3TGZA 5F06A 4HI7A 2H19A 5ECIB 4ILFA 4WBRD 2IL3A 1OAZA 2QSIA 2N5AA 4I8BA 5DDLA 3S9FA 4MZBA 3FZ5A 2B1LA 5IMFA 1PQNA 5IO0A 3E0UA 2XC2A 3GHAA 4TW5A 4XHMA 2LRCA 4EE0A 4JR4A 2WGRA 2VL9A 3QFBC 4KNDA 2YWMA 3TJGA 2HLSA 2H0HA 5C04A 2CVKA 3KIJA 3GIXA 4PQIA 2ZNMA 1MD3A 1JZOA 1WE0A 4K0NA 5E59A 3TOUA 2H1AA 9GSSA 2REMA 1F9MA 2HT9A 1X5CA 3UARA 1OE7A 3F8UA 4LLRA 4HZ2A 3F3RA 3KH7A 4OMVA 4IJ3A 2G2QA 3GTUA 2G0FA 1ZZYA 1XXUA 1FAAA 3D0ZA 5A4UA 4TXOB 2F8AA 1JLWA 4NWYA 2QKEA 4QL9A 4JZQA 2VM1A 4D73A 4BL7A 2BJXA 3QAWA 2VCQA 4MH3A 4QL7A 3HCZA 2O7KA 3IC4A 4EXJA 5DCGA 1XWKA 1GWCA 2CX4A 1ACVA 1GSQA 3L0HA 2VLUA 2PGTA 1HYUA 4N30A 2LSTA 5DQSA 4DSQA 1RK4A 3CRUA 4EKZA 5DJLA 4MF5A 5CRWA 3M3MA 4GCIA 1WJKA 1KEBA 3UBKA 4MZWA 3I69A 5CAXA 2ON7A 2CT6A 3HY2A 3TDGA 2V6KA 3IHQA 2Z9SA 4LMVA 1QFNA 4OO4A 5KN3A 2OE3A 2H0IA 1TP9A 2GQKA 5JWOB 2VUPA 5DJMA 4L8EA 3N9JA 1T00A 3IR4A 2VL2A 3HVXA 1I5GA 2YN1A 4NPBA 4YAPA 1S3AA 4MDCA 4XTSA 1O7UA 2HSHA 2VCTA 1A2JA 3J7Yk 3UBLA 4XRAA 3H79A 1VGLA 5HR3A 4CW9A 4KCAA 1G6YA 2DBCA 4IGJA 4OFTA 3ZYWA 2OADA 3W6GA 2PPTA 5DAKA 1XWGA 20GSA 1EOHA 11GSA 2L57A 1PL2A 4DSSB 4DSRA 3GURA 4TXVA 5KEJA 1B4PA 3H1NA 3US3A 4EDZA 5GAND 3KGKA 4E8HA 1T8EB 1THOA 5AISA 3LYKA 1VF1A 5D96A 3TKSC 4IBPA 2GGTA 1YJ6A 2O85A 2C0FA 3CBUA 2WS2A 4DEJA 1MEKA 4AGSA 1U6TA 3KCMA 5GSTA 1G0TA 4GRFA 2YNXA 1SKSB 3KEBA 1GTIA 2YZHA 2YZUA 5D8IA 1A24A 1G7EA 3CRTA 1N2AA 3LFLA 1Y25A 3WD6A 1YDKA 3R2QA 3SBCA 2C0EA 1PSQA 3LGCA 2KUCA 3EURA 3ZFBA 3TRPA 2M80A 6GSYA 3I6AA 4KE3A 3VPQA 1LU4A 2OBIA 2N5FA 4F0BA 5B6NA 1AXDA 5A4WA 4IJIA 3GRXA 3C73A 1SK0A 1YQ1A 2B1KA 5D93A 5IOXA 1AUCA 3IV4A 1B9XC 3VWWA 3GMFA 3FKFA 2I3YA 4WEYA 1BG5A 1TRSA 4KW6A 2MMAA 5ECHB 3EC3A 1XPVA 2H71A 5ID2B 4JBBA 2H01A 2J23A 3FEUA 5HFKA 2FCHA 4X0XA 4ZB8A 2H1BA 4MLYA 1O8XA 2E2GA 2DJKA 1H75A 4NV2A 3GH6A 2H6XA 2L4CA 4RI6A 2GSQA 2FA8A 4TKYA 1TDIA 1DE1A 2P0GA 3HZ4A 4EO3A 1MD4A 1OE8A 2DSAA 2TIRA 1N8JA 4RI7A 1WRYA 2OE1A 4E8EA 2NDOA 1ABAA 2IMIA 1PGTA 4GSSA 4K9ZA 2E0QA 3VI7A 1QGVA 3LJRA 4OCFA 2EIOA 3FZ4A 4N10A 2MBSA 4MJBA 4K2DA 1K3OA 4YH2A 4HOJA 4BVYA 3CSIA 3RHCA 2VCVA 3GSSA 1QK8A 2DMMA 3HJOA 1OVNA 3U6VA 5HFIA 3A2VA 4HJ2A 4L5LA 4IKHA 5DQYA 3ZVJA 4CHSA 5KN0A 3DD3A 3E9JB 4V1Ap 3LSZA 2WCIA 4HEA2 1QMVA 3GX0A 5AN1A 2DLXA 1XVWA 3CSHA 3H4KA 3DYRA 4IVFA 4ZBBA 2FY6A 2JL4A 4EC0A 4GLTA 3F4SA 3IXRA 1PMTA 1SU9A 4BWSA 4BA7A 4LA1A 2CVBA 2C3QA 3F4TA 4O32A 5LCZA 2ALBA 3ZMKA 3HVVA 5FT3A 3TCOA 3NOFA 2LEGA 1X9SB 2VCWA 2XHFA 1EV9A 2NBSA 4YAVA 2HXKA 4PNGA 2R37A 4ZILA 3TB2A 4IN0A 3F9UA 4I2UA 2HZEB 5AIXA 2YCDA 5J9CA 3TJFA 2GZZA 4ZL8A 1B48A 1TU8A 4FO5A 3UVHA 5F8BA 3ERWA 1XW5A 4TR1A 3M0FA 4ID0A 2CAIA 3ZIVA 2IIYA 2F51A 1H4OA 3RBTA 2VL2C 2DJ3A 1GTAA 4IELA 3QR6A 2WRTA 4KX4A 2IPAA 5COHA 3K8NA 4ECJA 3HD5A 1XWAA 1GLPA 4JEDA 5JWQB 2RM6A 1ON4A 4V2MA 3CSJA 5HFGA 2IN3A 2DJ1A 3UVTA 19GSA 2CZ2A 2K8SA 5IMCA 2IMEA 4WF5A 3GUSA 2VAFA 4RUVA 4V1Ag 4LL4B 2MZCA 5CYYA 3ZVJD 3V1WA 2C0DA 4KCEA 2PMTA 2IMFA 4DSSA 3C7MA 3G7JA 4PX1A 3EMPA 2JSYA 3MAKA 2EIQA 1V9WA 1FO5A 2LRTA 3P90A 1ERWA 2IFQA 1ZOFA 4TR4A 2YP6A 4V2NA 4K6XA 3GKNA 3ZMLA 4TR3A 2LS5A 2HSYA 4FH8A 3IRAA 2VM2A 4ECBA 1GSFA 4XS4A 2KHPA 2XPDA 1NSWA 2I1UA 2LUSA 4G10A 1YEPA 1T7PB 2RM5A 1EGRA 3M9KA 2YWNA 3O6TA 1JZWA 2PWJA 1YEXA 4MK3A 1JZRA 3DMLA 4OO5A 1G7OA 1GNWA 12GSA 3A2WA 3KD0A 2XBQA 3GV1A 4POMA 5G5FA 4AJ6A 1SJZA 4F82A 1XBSA 2YPMA 3IE3A 3H93A 1PN9A 2L5LA 2H70A 4F2IA 3GKMA 5JWRB 2YJ7A 1IYHA 2P5QA 2HRNA 4RQXA 3PH9A 2LTKA 2H6YA 1SYXA 1FOVA 1EEJA 2ZCTA 1X9WB 3FY7A 4MMMA 3IK9A 1HQOA 4KB3A 1HD2A 1Q98A 1HNCA 3LYPA 1XCCA 2KP1A 3GX8A 1E6BA 4IP6A 4K7NA 4NAXA 18GSA 2L6DA 3W8SA 1OKDA 3KTBA 3Q74A 3PINA 3L78A 5ECLB 1VF4A 1XW6A 3EINA 2LQOA 4JE1A 2AB6A 8GSSA 3APQA 1KNGA 2TRXA 1SK2A 2XBIA 3EYTA 3GYKA 3CTFA 4J56E 1NW2A 1TOFA 4NXIA 5J41A 2E7PA 6GSVA 4F03A 2C0GA 4WR4A 2ES7A 2VO4A 3D4TA 1R4WA 5CRHA 4MCUA 4P3YB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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