3D91A

Human renin in complex with remikiren
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
338
structure length
334
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALARH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Renin
publication title Human renin in complex with remikiren
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 334
sequence length 338
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2008-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3d91A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3d91A01
2ASIA 5P7XA 4LXAA 2IGYA 4YOAA 5P6UA 1HVHA 5P75A 5P2VA 4GZFA 4DUSA 1HWRA 4OBGA 4X2LA 4DI2A 3QROA 2Z54A 1AVFA 2JXRA 2FGUA 4ZSMA 5P86A 3UDRA 4Y3RA 5P5VA 1GKTA 1ODYA 1OD1A 5APRE 5OZCA 3K5GA 3GGXA 2PSGA 5EZZA 4Y3NA 2WF2A 5P2XA 5P4CA 3NU5A 1W6HA 5P79A 5P22A 5OYVA 4D88A 3TKGA 1E80E 1B5FA 4B70A 5OYYA 3S2OA 3CICA 5P29A 3RSVA 1FQ6A 2RSPA 2I0DA 4KUPA 3OAGB 3U71A 5P16A 4Y4BA 5P7WA 4DPFA 3QS1A 4QJ2A 5P8NA 5OZPA 1FQXA 5OYTA 5P04A 2ZHRA 5P6OA 8HVPA 5P1LA 4CPWA 1D4JA 3URLA 1FQ7A 4B05A 1NPWA 1ODWA 4GB2A 1AZ5A 5UPJA 2I4QA 1MRWA 3HAWA 3S54A 5KOSA 1BIMA 1ZLFA 4DQCA 5P6NA 3SA4A 5P6GA 4J1EA 3TKWA 1K1UA 1ER8E 3T7XA 2AVMA 5P34A 3D91A 1WBMA 5P26A 3S45A 3HVPA 4CPUA 5P8KA 2NTRA 3VSWA 4K4RA 5DR1A 3IXKA 3EL5A 3LINA 4FE6A 1QBTA 2FS4A 2WEDA 2HM1A 4LC7A 5P3UA 5P2AA 5C9DA 4LHHA 5P18A 5P0UA 1M43A 4RRSA 5P6IA 2P4JA 6FIVA 2HC0A 3SM2A 1LYWB 5P6MA 3VLAA 4B1CA 3DM6A 3C9XA 3UPJA 2PH6A 1GVVA 1BILA 3HVGA 5P7GA 1QBRA 5P77A 4NJTA 1VIKA 2WF0A 1YM4A 4B0QA 2P83A 3VV8A 2QHYA 1AJVA 5DR7A 5P1DA 5P8SA 2V12C 3JVYA 5P8TA 5P56A 5AH6A 3ZKXA 1FQ5A 1K2BA 3DCKA 3ZPSA 4Y38A 5AHAA 5P0GA 4Y4GA 3VYDA 5BWYA 5P8IA 3LPKA 4YD7A 4MC6A 1ZSRA 5OYRA 4GJ8A 4DQGA 3VV7A 4KE0A 2QI3A 3PBDA 3T7QA 5JFPA 1YTJA 4I0ZA 1HVLA 3ZOVA 5DQ2A 5P10A 1FMXA 5P6DA 5P87A 5P3KA 4NKKA 4WY6A 5P2SA 4A4QA 4F73A 4GYEA 1YTIA 1NPAA 4YCYA 2V00A 5P44A 5P4JA 2ZHVA 2PYNA 5P5OA 2A4FA 1SIVA 4TVHA 5P1GA 3MWSA 3NXNA 5P2GA 3SA6A 4GIDA 2HB3A 2Q55A 1B6JA 5P8RA 3MXEA 3UDKA 1HOSA 1B6MA 4HE9A 4RVIA 2PYMA 1FIVA 3OADB 4H3FA 3QI1A 4QJ7A 4H1EA 3GI5A 3GGUA 5P5GA 1HTEA 3OUDA 5P8AA 2AODA 1BVGA 2UPJA 3O9HA 1FMUA 3EKWA 5P4IA 1EPOE 5P0EA 5P4RA 3KMYA 5P85A 4QLHA 5P7PA 2ZGAA 2B7ZA 3IXOA 2R5QA 3OXWA 4Y4TA 4EWOA 3IVHA 5P8BA 1XDHA 4EHCA 1IZIA 3L38A 1D4KA 4RCFA 2UY0A 3TL9A 5OZ1A 2APRA 2FMBA 1HVSA 3PI0A 4J1IA 1T7KA 4HA5A 3HW1A 3FNTA 5E5JA 1IZEA 5SY2A 4ZLSA 5P3OA 2F8GA 5P1FA 4YBFA 2QMDA 1PPKE 3SLZA 5P7DA 4Y3PA 5P5QA 4ACXA 1BDQA 1QS8A 1HPOA 1MT9A 5OZVA 4FM8A 4J0VA 1LEEA 2QI5A 5P53A 5OZZA 4YCTA 2AOGA 3VF5A 5P6WA 3OU1B 4Y41A 5P7LA 1GVXA 5P5HA 3BHEA 5P01A 2BKSA 2SAMA 5P8MA 1MUIA 3UF3A 5AH8A 3ZKMA 1MESA 3SQFA 5P6AA 3T3CA 5OYSA 2O4PA 3FNUA 2XFIA 1G0VA 5P2TA 1BDLA 3PSYA 3UDYA 1C6XA 5HVPA 3NWQA 4DJVA 3RTMA 5P8LA 4Y3ZA 5P5KA 4AZYA 3SA3A 1HVKA 4B77A 4TRYA 5I3YA 5P71A 5EZXA 4CPXA 1APWE 5KR2A 5P1WA 5OZLA 3ZKSA 2FDDA 3S53A 5P2ZA 2ZJLA 5P4GA 1HTGA 3MSKA 4I1CA 5OYQA 4XX3A 4B1DA 4RLDA 1W5XA 1GVTA 4NPUA 1HVIA 3L5BA 1YTGA 5DQ4A 4OBHA 3VG1A 2AVVA 1KJ7A 1BAIA 2NMZA 2IENA 3GW5A 4I8ZA 1AAQA 3K5CA 5P6YA 1YTHA 4IVTA 5P76A 5P0TA 3R1GB 3VYEA 4Y4UA 5P7OA 3ZKGA 5P42A 5ISKA 4ZSRA 5P3XA 5ENKA 2VS2A 1K6VA 4DH6A 2G94A 1T6GA 3Q3TA 3SFCA 5IVTA 5C9BA 2ZJJA 1EPQE 4YD5A 4HDPA 1PSOE 1ZBGA 1B11A 1HXWA 2QI7A 4B72A 5P03A 2O4SA 1BBSA 4RCEA 3PCZA 3BUFA 2G1NA 1Z1RA 2OHUA 2IDWA 5DQ1A 5P4FA 5P0LA 1E5OE 5P8CA 5P41A 2Z4OA 4Y36A 4PPHA 3BRAA 4Y50A 5P55A 2PQZA 2BB9A 3OOZA 2QMFA 3TPPA 2AZ9A 3BXRA 5OZTA 3DOXA 2I4XA 4R5NA 5P51A 5P6FA 4Y4XA 2CEJA 3OQ7A 2FXEA 3PM4A 5AH9A 5P88A 1GVWA 2OHRA 2QI4A 3LIYA 4L1AA 4Y5NA 1T3RA 4FSEA 1MERA 5P7KA 3TPRA 4MC9A 3ZKIA 4MC2A 1QDMA 5SXNA 3QAAA 5OZBA 1DPJA 1M4HA 5P7YA 3R4BA 3EM3A 5P4SA 4QJ8A 4Q1XA 5P1MA 5P3HA 3UDHA 5P4NA 4RROA 1XL2A 2WF4A 1DW6C 5I70A 5P58A 4Y5GA 3MXDA 4Y3SA 1HTFA 5P3SA 4Y43A 2QP8A 1LF2A 3OTYA 5OZUA 5E5KA 5P5XA 5P32A 4OBZB 2P3AA 2XYEA 3PBZA 5P3RA 2OHSA 4GJBA 3EC0A 2H6TA 2VNNA 2RMPA 3ER5E 4Y35A 5P3MA 5OZXA 5P61A 5DGUA 5P8VA 2PC0A 5P3QA 1LF3A 2WF1A 5P81A 2G26A 3O9LA 4ZPEA 3G70A 5F01A 5OZOA 5P59A 4H3JA 3KFRA 5P7SA 3BGCA 3OQKA 3LZSA 5AGZA 3KDBA 4YD4A 1PSNA 5OYXA 2EWYA 5P83A 4EQJA 2QAKA 3CKPA 5P8PA 5OZ0A 2JYSA 5OZMA 5P4TA 2Q15A 5P1JA 4TRZA 4D89A 3APRE 3LZUA 2P8HA 1LYAA 1CPIA 5P78A 4Y5EA 3NDWA 2FIVA 1MVPA 3UTLA 5P35A 3B80A 5OZ7A 5HU0A 3CMSA 1K1TA 4R95A 5OZ2A 3WB5A 5P5TA 3IA9A 4JPEA 5KR1A 5P4MA 2JJIA 5P3GA 1SGZA 2I4DA 4Y4ZA 1IZDA 1EBYA 4FRJA 1QBUA 4MC1A 4AUCA 5DR3A 3RTHA 4J0ZA 3WB4A 2FDEA 3F9QA 5P4HA 1LYBA 1D4IA 3S7LA 1EPME 5P5LA 2IL2A 1ZPAA 3ZPUA 2J9JB 1HIHA 3SO9A 2PSUA 5P27A 4FS4A 3I8WA 5HD0A 5P1OA 2BBBA 5HE7A 4LL3A 4EJ8A 3RU1A 3OHHA 4JP9A 4Y45A 3KM4A 5P5EA 5P43A 4JPCA 4Y4DA 3RVIA 2OHNA 1EBZA 3NU9A 5KQZA 3K5DA 5P5YA 1D4HA 5J25A 3L5FA 5P5SA 4HVPA 4DQFA 3NU6A 3B7VA 1SMRA 2QD8A 5P63A 5I3XA 1DP5A 1IIQA 1LZQA 3SM1A 5P17A 1HVCA 2AOJA 4Y3AA 2ZJIA 1HPSA 2VIYA 4ER1E 4M8YA 2R38A 1IZHA 5OZ6A 2XYFA 3SKFA 4YD6A 1YX9A 1APTE 1F7AA 3EKXA 3GI4A 4Y3JA 4B00A 4EXGA 5P7EA 4BEKA 2A1EA 4WTUA 5P48A 4FL8A 3OU4B 3ST5A 4APRE 4H3GA 2V13A 1SBGA 3FX5A 3ZMGA 1G2KA 5P0FA 5DPZA 4B1EA 2V0ZC 3RSXA 4JECA 2R3WA 3SA9A 4OBFA 3WZ8A 3DV5A 4HDFA 5DQ5A 2BJUA 2F3KA 4Y9WA 5P1QA 3UQXA 4LAPA 5KOQA 4FIVA 1MSMA 2VNMA 2QNPA 1OEXA 2QZLA 4YD3A 3PGIA 2ZJNA 3ZKQA 5KR8A 1PROA 3OUCA 3URJA 5P4XA 5P0OA 2BKTA 4DJPA 5P7ZA 2P3BA 3IAWA 1FKNA 5P46A 3TH9A 1Z8CA 5OYZA 2VKMA 3TNEA 7UPJA 3UDJA 1VIJA 5P8EA 4FAFA 1XL5A 5P7RA 5HDVA 2AZBA 2AZ8A 4J0YA 2BQVA 4BELA 4RVJA 3APPA 2ER6E 3UDNA 1SIPA 1ZPKA 3KT5A 4QJ6A 4FM7A 2FDPA 1SMEA 1TQFA 3EL0A 3O9DA 3KDDA 5TOLA 2V11C 4TVGA 1ZSFA 5P1YA 5P7QA 4OC6A 1UH9A 1EBWA 3O9EA 3NU4A 3OK9A 5P0DA 3S43B 3WZ7A 5P2OA 3DUYA 4GJ5A 3OUAA 2CENA 1CZIE 4Y3GA 3WZ6A 5P2JA 2G1YA 1MSNA 4Q5MA 2HS1A 4Q1YA 1T7IA 3INFA 4OD9A 1C6ZA 1FG6C 2O4NA 3KF0A 3O9BA 2G27A 2VA5A 5P2LA 3SA8A 3BVBA 2G24A 1IDBA 1T6EX 4I12A 5P05A 2I4WA 3MSJA 4R91A 2AQUA 5P3IA 3D1XA 2AOEA 4J1HA 4S1GA 4Q1NA 4APEA 3T7PA 2OAHA 5ER1E 5P4QA 5OZEA 2ZE1A 3LIQA 5DR0A 5HDZA 4EJKA 2V16C 4I0EA 5OZAA 3HZCA 5OZWA 1C6YA 2XFJA 2IQGA 4PZXA 2AOFA 4QGIA 1B5FB 2BPWA 3TOGA 3PVKA 4I0GA 4RYCA 5P5NA 5P36A 2G21A 4N00A 4ZIPA 4XXSA 3O9CA 2HPFA 5P4LA 3OU3A 4YDGA 5HE5A 4FCOA 4J17A 1IBQA 5P60A 2ZJHA 3IVIA 1GNMA 5IS4A 2RKGA 2RKFA 3KFPA 3PMUA 2AZCA 4GJ7A 3QBHA 4OBZA 4DJXA 2PH8A 1LS5A 1APUE 5P4KA 3GGAA 3HDKA 5DR4A 3NR6A 5OYWA 4FSLA 1SH9A 5P2HA 2WF3A 3OTSA 4Y5LA 4CPQA 3CYWA 3INHA 3G6ZA 1U8GA 3ZL7A 1CMSA 2UXZA 5P6RA 3EKTA 3PLDA 4Q1WA 3KA2A 5P07A 3PWMA 5P1CA 4Y58A 4Y3WA 1MT8A 4UPJA 3IXJA 5P4WA 1FQ8A 2I0AA 2WJOA 3BXSA 1EC0A 5HDXA 5P7NA 1B6PA 4Y3YA 1HRNA 5P24A 5P39A 5P5CA 5P7AA 5P74A 5P1PA 2O4KA 5OZIA 1FQ4A 3CKTA 4Y3MA 4CPRA 5P7MA 3UDQA 3SA5A 5P3PA 2OHLA 1GNNA 5P0CA 3LZYA 4AA9A 1W50A 5CLMA 3NUJA 2ER7E 5P0AA 5P2KA 4R93A 2PWRA 5P6JA 3OXVA 2BPZA 3ZPTA 1RV7A 2FLEA 3O9IA 1RL8A 5ER2E 5P45A 5P62A 3VEUA 3PHVA 1HSGA 3IN3A 2NPHA 4WY1A 3EMYA 3TPLA 5P08A 5P57A 5P3AA 4Z50A 3LPJA 1YM2A 1T7JA 5P0PA 3FIVA 5P15A 1SDUA 3QP0A 4YBIA 5PEPA 5P6TA 1MTBA 4PYVA 5P47A 2F3FA 2OHQA 5P6QA 1HTRB 1HEFE 3OGQA 5I3VA 4CMSA 3GGVA 3A2OA 4J1CA 2J9KA 5HTZA 4TRWA 4NJSA 3S7MA 4DJQA 4QJAA 2AOIA 3OAGA 4U7QA 4ER4E 5P82A 4LBTA 4Z22A 1TSUA 3Q6YA 1D4YA 5P1VA 2G1OA 3K1WA 3QPJA 3SA7A 3LZVA 4LP9A 2G1SA 5OZQA 2I1AA 3L3AA 5P09A 5P06A 5ENMA 2QHCA 1KJFA 2VIEA 3PMYA 1MT7A 5OZSA 1QRPE 1A9MA 4I11A 5P89A 1AJXA 3I7EA 3PB5A 1HHPA 2ZJMA 5P7JA 4FRIA 4M8XA 4Y53A 5P1RA 4ZEAA 3DK1A 2WEAA 4Y51A 3PCWA 3NDTA 5HU1A 4DJRA 3GI0A 5P38A 3OUDB 4AMTA 5P23A 4Z2ZA 3KFNA 2XFKA 3PSUA 2PWCA 3VF3A 2I4VA 1YT9A 2AOHA 4Y3QA 2HS2A 3T11A 4F75A 1AIDA 3SAAA 1MIQA 1A8KA 3TPJA 3NYGA 5P1KA 1PPME 3VV6A 1LYWA 1AM5A 4Y5CA 4FLGA 2FNSA 2IEOA 3UFLA 4F76A 5P49A 2BPVA 4ZPGA 5P3TA 4DQEA 1C70A 1IVPA 2ZDZA 5P28A 5P2IA 3LIZA 3I2LA 4U7VA 4L7HA 5P4VA 2Q54A 5CONA 1A30A 4GJDA 3BUGA 3H5BA 4GJCA 4PEPA 2IKOA 2NNPA 3SPKA 2VA7A 1SDTA 4NPTA 4J55A 2AIDA 1IDAA 1G35A 5P25A 1KZKA 4DJWA 5IVRA 4J0PA 1UH8A 5P0RA 3Q4BA 1TCXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ASI A;  5P7X A;  4LXA A;  2IGY A;  4YOA A;  5P6U A;  1HVH A;  5P75 A;  5P2V A;  4GZF A;  4DUS A;  1HWR A;  4OBG A;  4X2L A;  4DI2 A;  3QRO A;  2Z54 A;  1AVF A;  2JXR A;  2FGU A;  4ZSM A;  5P86 A;  3UDR A;  4Y3R A;  5P5V A;  1GKT A;  1ODY A;  1OD1 A;  5APR E;  5OZC A;  3K5G A;  3GGX A;  2PSG A;  5EZZ A;  4Y3N A;  2WF2 A;  5P2X A;  5P4C A;  3NU5 A;  1W6H A;  5P79 A;  5P22 A;  5OYV A;  4D88 A;  3TKG A;  1E80 E;  1B5F A;  4B70 A;  5OYY A;  3S2O A;  3CIC A;  5P29 A;  3RSV A;  1FQ6 A;  2RSP A;  2I0D A;  4KUP A;  3OAG B;  3U71 A;  5P16 A;  4Y4B A;  5P7W A;  4DPF A;  3QS1 A;  4QJ2 A;  5P8N A;  5OZP A;  1FQX A;  5OYT A;  5P04 A;  2ZHR A;  5P6O A;  8HVP A;  5P1L A;  4CPW A;  1D4J A;  3URL A;  1FQ7 A;  4B05 A;  1NPW A;  1ODW A;  4GB2 A;  1AZ5 A;  5UPJ A;  2I4Q A;  1MRW A;  3HAW A;  3S54 A;  5KOS A;  1BIM A;  1ZLF A;  4DQC A;  5P6N A;  3SA4 A;  5P6G A;  4J1E A;  3TKW A;  1K1U A;  1ER8 E;  3T7X A;  2AVM A;  5P34 A;  3D91 A;  1WBM A;  5P26 A;  3S45 A;  3HVP A;  4CPU A;  5P8K A;  2NTR A;  3VSW A;  4K4R A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5IVS A;  3R0Y A;  4ACU A;  5P7I A;  4LXK A;  2IRZ A;  2WEC A;  1PSA A;  4D83 A;  2QHZ A;  4RCD A;  4FM6 A;  5OZ5 A;  3QRV A;  4FGX A;  2WKZ A;  5P6H A;  4ER2 E;  2V10 C;  1FGC C;  3L58 A;  2WEB A;  3SAC A;  5P7B A;  2QD7 A;  2NMY A;  1RPI A;  1HIV A;  3Q5H A;  5P7H A;  3OAD A;  3UHL A;  3TOH A;  4Y6M A;  5B18 A;  3UFN A;  5DR8 A;  1DMP A;  5P1E A;  5P5R A;  5P2W A;  5P3C A;  4XX4 A;  3LIV A;  1ENT E;  5P6X A;  2VJ9 A;  5OZN A;  4YHQ A;  3UQW A;  3HBO A;  3MSL A;  3UQR A;  1NPV A;  4PHV A;  3KT2 A;  1ZP8 A;  5P5A A;  1MTR A;  1HEG E;  3NDX A;  1HBV A;  5OZG A;  5P14 A;  3CYX A;  1HSI A;  5P2N A;  3NDU A;  5P0K A;  5JOD A;  4DJY A;  1SDV A;  3OGP A;  3KDC A;  1SGU A;  2QZK A;  3LHG A;  2FXD A;  5P2Y A;  3VF7 A;  1EC3 A;  4HDB A;  4GJ9 A;  2QMP A;  4F74 A;  3LIX A;  5COP A;  4RYG A;  2ZHU A;  3OOT A;  4BFB A;  4HZT A;  1BWB A;  5P37 A;  2F81 A;  2PK6 A;  3N4L A;  9HVP A;  5P0M A;  2O40 A;  3T6I A;  5P5Z A;  2HAH A;  4FAE A;  5P5D A;  4RGH A;  3UDM A;  5P3L A;  3S56 A;  4K9H A;  5COO A;  5P54 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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