3DC3A

Use of carbonic anhydrase ii, ix active-site mimic, for the purpose of screening inhibitors for possible anti-cancer properties
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Design of a carbonic anhydrase IX active-site mimic to screen inhibitors for possible anticancer properties
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3dc3A00
4Q6EA 3MNAA 1TB0X 3M5SA 1RAYA 4K1QA 3V5GA 5SZ4A 1CNYA 4QSJA 3PO6A 1JD0A 1BN3A 1URTA 4QEFA 5FL6A 5E2MA 1ZSCA 5A6HA 5G01A 3RGEA 1CNCA 2X7UA 5BRWA 4MLTA 5JGSB 1BNMA 1XPZA 3B4FA 4Q87A 4Z1JA 4Q7SA 4Z1EA 3DCSA 5JQTA 4E3HA 3N4BA 1LUGA 2ILIA 5E2KA 1G6VA 1YO2A 5DSOA 1CAZA 1DCAA 3DCWA 2O4ZA 1FLJA 3DA2A 4E4AA 3K7KA 2AX2A 4ZWYA 5J8ZA 3OILA 1I9QA 4YWPA 3R16A 4XIWA 1I90A 1CNKA 4QSAA 1UGEA 4RUZA 3U45X 3V7XA 4FL7A 1RJ6A 5EH8A 5DOGA 2NNSA 3K2FA 5FDIA 3W6IA 4HBAA 5DSRA 4Q7WA 3M40A 4YGLA 3IGPA 5DSIA 4IWZA 4Q9YA 2NMXA 4WL4A 1CAJA 1BNTA 3CYUA 2HD6A 3MZCA 1CNIA 2WD2A 2CBAA 2ABEA 3U7CA 4YVYA 1YDCA 5JESB 1BN4A 3P3HA 1DMXA 4WUQA 3P4VA 1G1DA 3P5AA 3SBIA 1FSRA 4ILXA 4ZAOA 3M14A 1TEQX 1YO0A 5AMLA 5DRSA 4YX4A 3BETA 4COQA 5FL4A 2FNMA 5E5RA 4CA2A 1HCBA 1CVAA 1RZEA 1IF9A 1RJ5A 2OSFA 3IBUA 3T85A 4HT2A 1RZCA 1ZE8A 1ZH9A 1CANA 3DD0A 3M67A 4JSZA 3DBUA 3HKTA 3NI5A 4RUXA 5SZ0A 3IBIA 4Q09A 3IBNA 4N0XB 5DSNA 3ZP9A 3L14A 4N16A 3S75B 4G0CA 4K0TA 4ITOA 4JSSA 4M2RA 4YXIA 1Y7WA 1OQ5A 1CAMA 2GEHA 3S97A 3D92A 4QK3A 3RZ8A 1BNVA 3DC3A 5LMDA 4MO8A 3MNHA 4ITPA 3JXFA 1YDBA 4Q99A 1KOQA 3RYJB 1CRAA 3F7BA 4CNXA 3P5LA 5FL5A 1EOUA 4Q8XA 1CAKA 5SZ2A 1AZMA 3S72B 1CNHA 2Q1QA 3OKVA 4RN4A 4PXXA 5E2NA 3MNJA 3JXHC 1BV3A 1ZGFA 1G0EA 1G45A 3KS3A 3RYXB 1G48A 5BYIA 3EFTA 5E5UA 4KUVA 2QP6A 1CINA 2H4NA 3KLDB 1TTMA 4Q08A 4E3FA 1ZNCA 5SZ1A 5AMGA 1LZVA 2QOAA 5A25A 5DSJA 3M3XA 1HEDA 4KNMA 1HVAA 4CNWA 1H4NA 5E28A 1CA3A 2WEHA 1BICA 1HEBA 5SZ6A 1BNUA 1LGDA 1OKLA 3IBLA 5DSMA 1ZFKA 3T82A 3DC9A 5FNKA 1JCZA 3RZ7A 2EU3A 3HKQA 1BZMA 5JGTB 1RZBA 3LXEA 3OYSA 2FOUA 4KNIA 4E3GA 1CCTA 4KNNA 2NXTA 3UYNA 1FQRA 1FQNA 3MHOA 3PYKA 1FSNA 4QJWA 2X7TA 5BNLA 5C8IA 3FFPX 4Q81A 3CA2A 5EHEA 4QJPA 1LG5A 3HFPA 3M1WA 3VBDA 3DCCA 2ZNCA 5FNGA 4K13A 4HF3A 1CVBA 5EHWA 3KOKA 3KONA 1G53A 1ZSAA 1FR7A 2FMZA 4CACA 4E3DA 5G0BA 1CAHA 1UGGA 3P3JA 5E2SA 3S9TA 3M2XA 1CVFA 3V2JA 5EHVA 1UGDA 5CA2A 3MHIA 3DV7A 5EH5A 4M2VA 2HNCA 9CA2A 2CA2A 1I9OA 1IF4A 3RYVB 3M2YA 5FLOA 1HEAA 2NNOA 4QTLA 1CVEA 5HPJA 1CNJA 3RLDA 1CAIA 3OKUA 3PJJA 4QK2A 4JSAA 3M98A 1FSQA 4XZ5A 2OSMA 3HS4A 3M04A 4ZWZA 3T5UA 2VVAX 3NJ9A 4Q49A 3RZ5A 4JS6A 1BCDA 3CZVA 3MWOA 1TE3X 4KUYA 5AMDA 3HKUA 3D9ZA 2Q1BA 2VVBX 2FMGA 4L5VA 5FNIA 3DD8A 4K0SA 5EKHA 4FPTA 3V3HB 1CAYA 3MHMA 3OY0A 4RIUA 3RYZA 3S74B 1CNGA 1HECA 2W2JA 2POVA 4R5BA 4KAPA 1CVCA 5FNJA 4Q07A 1RAZA 3SAXA 4XFWA 1BNWA 1LG6A 4KUWA 1CVDA 5DSLA 3RZ1B 4M2WA 3ML2A 4CNRA 3W6HA 1HCAA 4RH2A 5DSPA 2WEGA 4E49A 4ZX1A 4X5SA 1V9IC 1CILA 1I9MA 4RFCA 1MUAA 2CABA 1FQLA 4L5UA 1TBTX 5JG5B 3MYQA 1ZGEA 5FDCA 1UGBA 1UGAA 5FNLA 3U47A 3V3GB 2NN1A 3ML5A 3MMFA 3M2ZA 4QSBA 3RG4A 3RG3A 3RZ0B 5SZ5A 5FNMA 2IT4A 2CBBA 1IF8A 2NN7A 5SZ7A 1HUHA 4R59A 4ZWIA 2NWYA 3V3FA 5EIJA 2WEJA 2WEOA 3M1QA 3MDZA 3OIMA 1CVHA 1OKMA 3R17B 3NB5A 1Z9YA 1CA2A 3DVBA 1G4JA 4L5WA 1RZAA 4C3TA 3JXGA 2NXSA 4KV0A 5SZ3A 4KNJA 6CA2A 1RZDA 4TWMA 4WUPA 3C7PA 4CQ0A 2NNVA 1YDAA 2F14A 2POUA 3MNIA 3T5ZA 1CALA 2EZ7A 3D0NA 3T83A 2H15A 4Q83A 4QJMA 4ZX0A 4HEWA 1BNNA 1H9NA 5CLUA 1G4OA 4JSWA 4MDLA 4Q8YA 1G0FA 3RJ7A 1I91A 1A42A 5JDVB 3V3JA 1IF7A 4M2UA 4YHAA 4YGFA 7CA2A 3F8EA 2FOYA 3M96A 4LU3A 4Z0QA 3TVOX 4YXUA 4PQ7A 4QJXA 8CA2A 5CACA 1KEQA 3TMJA 2HKKA 4QJOA 2NWOA 2HOCA 1UGFA 4HEZA 3N3JA 5CJFA 1AM6A 5G03A 3KOIA 1XEVA 5EZTX 4YGJA 3M1JA 1FR4A 1G52A 1CNXA 1ZFQA 4MTYA 1KWRA 4R5AA 1CAOA 2CBEA 3D8WA 3MNUA 4HT0A 4G7AA 4PYYA 2HFWA 3BL0A 4Q90A 4TWLA 5FNHA 3S73B 4BF1A 4Z1KA 3DVCA 1CRMA 1V9EA 4WW6A 3T84A 4RIVA 2FOSA 2NWPA 3FE4A 5L6KA 1I9LA 1Z93A 1CCUA 1G46A 4QK1A 4KP5A 3Q31A 3KIGA 1CIMA 3IEOA 3BL1A 3F4XA 5IPZA 4RUYA 3V2MA 5G0CA 4FIKA 4FVNA 3CAJA 1J9WA 4Q06A 4UOVA 4QIZA 1OKNA 4Z1NA 4ETQC 3UYQA 1IF6A 1UGCA 1Z97A 5FLTA 3M5TA 3GZ0A 3M5EA 3N2PA 4PZHA 3SBHA 1XQ0A 2NNGA 3HKNA 4Q7PA 1BNQA 5FLQA 3P58A 5JEPB 5JEGB 3KWAA 4QSIA 4YGKA 4DZ7A 3TVNX 3SAPA 5DSKA 4FVOA 3KKXA 4Q6DA 1TG3A 2FNNA 1THKA 3MHLA 5BRVA 5EKMA 4YYTA 2FOQA 4FU5A 4QY3A 1G54A 1CZMA 2EU2A 4HEYA 4ZWXA 2CBCA 4LP6A 1YO1A 2POWA 3FW3A 5E2RA 2FNKA 1ZSBA 4XIXA 4E5QA 5JEHB 1XEGA 1AVNA 4CNVA 5EH7A 1YDDA 2NWZA 5FLRA 4Y0JA 3MHCA 4QJ0A 5BRUA 3M1KA 4Q7VA 3IAIA 2WD3A 2Q38A 4MDGA 3KNEA 4BF6A 1DCBA 5DVXA 1KWQA 4Q8ZA 3OYQA 3ZNCA 2FOVA 4BCWA 5DSQA 1FQMA 1BN1A 2QO8A 2AW1A 2X7SA 4K0ZA 4WR7A 5JQ0A 1CNWA 3RYYA 4YXOA 4Q78A 2HL4A 3P55A 12CAA 3M2NA 4QIYA 5DOHA 3DVDA 3S77B 4KP8A 1H9QA 4LHIA 1I8ZA 2CBDA 4HU1A 4IDRX 4MLXA 3MNKA 3F7UA 1TG9A 4PYXA 1TEUX 3S78B 1TH9A 1F2WA 4FRCA 5EKJA 3B1BA 4Q0LA 1HUGA 3P44A 1I9PA 1IF5A 3OIKA 4GL1X 4WW8A 4E9OX 4YGNA 1G3ZA 1I9NA 3D93A 3V3IB 3N0NA 4MDMA 5FLPA 4XE1A 3K34A 1CNBA 1MOOA 1T9NA 5EOIA 5JG3B 3EFIA 3S71B 3U3AX 2FW4A 3S8XA 1JV0A 4RFDA 2GD8A 3DAZA 4DZ9A 3S76A 1KOPA 1DMYA 5FLSA 2NXRA 5L3OA 1CCSA 3QYKA 3HLJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q6E A;  3MNA A;  1TB0 X;  3M5S A;  1RAY A;  4K1Q A;  3V5G A;  5SZ4 A;  1CNY A;  4QSJ A;  3PO6 A;  1JD0 A;  1BN3 A;  1URT A;  4QEF A;  5FL6 A;  5E2M A;  1ZSC A;  5A6H A;  5G01 A;  3RGE A;  1CNC A;  2X7U A;  5BRW A;  4MLT A;  5JGS B;  1BNM A;  1XPZ A;  3B4F A;  4Q87 A;  4Z1J A;  4Q7S A;  4Z1E A;  3DCS A;  5JQT A;  4E3H A;  3N4B A;  1LUG A;  2ILI A;  5E2K A;  1G6V A;  1YO2 A;  5DSO A;  1CAZ A;  1DCA A;  3DCW A;  2O4Z A;  1FLJ A;  3DA2 A;  4E4A A;  3K7K A;  2AX2 A;  4ZWY A;  5J8Z A;  3OIL A;  1I9Q A;  4YWP A;  3R16 A;  4XIW A;  1I90 A;  1CNK A;  4QSA A;  1UGE A;  4RUZ A;  3U45 X;  3V7X A;  4FL7 A;  1RJ6 A;  5EH8 A;  5DOG A;  2NNS A;  3K2F A;  5FDI A;  3W6I A;  4HBA A;  5DSR A;  4Q7W A;  3M40 A;  4YGL A;  3IGP A;  5DSI A;  4IWZ A;  4Q9Y A;  2NMX A;  4WL4 A;  1CAJ A;  1BNT A;  3CYU A;  2HD6 A;  3MZC A;  1CNI A;  2WD2 A;  2CBA A;  2ABE A;  3U7C A;  4YVY A;  1YDC A;  5JES B;  1BN4 A;  3P3H A;  1DMX A;  4WUQ A;  3P4V A;  1G1D A;  3P5A A;  3SBI A;  1FSR A;  4ILX A;  4ZAO A;  3M14 A;  1TEQ X;  1YO0 A; 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