3DD3A

Crystal structure of the glutathione transferase pi enzyme in complex with the bifunctional inhibitor, etharapta
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
210
structure length
210
Chain Sequence
b'MPPYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Rational design of an organometallic glutathione transferase inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase P
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 77
structure length 210
sequence length 210
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2008-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3dd3A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3dd3A01
5ECSA 4ECBA 2FA8A 2YZUA 5GZZB 2DJ1A 4EC0A 1GNWA 4LA1A 4MCUA 3UARA 3BBYA 2K8SA 6GSUA 2YP6A 2IMIA 2FGXA 4BL7A 1E2YA 1ZYQB 2RM6A 4OFNA 4GTUA 2PN8A 1SK0A 5J4UA 1YKCA 1SK1A 3HD5A 1XZOA 1X5DA 2KP1A 2LJRA 3IRAA 3DRNA 2B7JA 1THOA 3FR9A 3TKPA 2MBTA 1A2LA 2CVBA 2HYXA 4BVYA 4L0UA 2XPEA 4LMWA 2WCIA 1PX7A 1NM3A 3ZLPA 2H1AA 3FW2A 4QQ7A 2LNSA 4OFTA 4IJIA 2DBCA 4Q5QA 1ERVA 1SYXA 3LORA 5FWGA 2VIMA 2DMMA 2OJLA 2YWOA 2GDRA 4OFMA 5F0GA 4I97A 2F8FA 4IS0A 2VLVA 1WJKA 2H72A 2E7PA 5G5FA 1A2JA 3M3MA 3KCMA 3HKRA 1USBA 2AV4A 5EL8A 1U3IA 2WFCA 3CSHA 3A2WA 5DBQA 3KGKA 2OE3A 1WOUA 2YJ7A 3ISOA 3KEBA 1GLPA 1R7HA 5ECKB 1UA5A 3EC3A 3JCML 2H0IA 4GSTA 3PPUA 1XCCA 3QD9A 4Q5FA 4Q5NA 5DALB 1CQHA 3D4MA 2BMXA 4CHSA 1ERTA 5CNWA 1BEDA 2I4AA 1GLQA 2B3SA 2K18A 1GL8A 2V32A 3MNGA 5J3RA 3LQ7A 3PH9A 5IIZA 3QPMA 5FT3A 2OBKA 5IMVA 4XHMA 2H73A 2FHEA 2GGTA 3APSA 1B9YC 13GSA 2C0GA 4F0BA 4GSSA 4IP1A 8GSSA 1ZL9A 2E0QA 3SWLA 5AISA 2TRXA 3US3A 5A4WA 1GSYA 1H4OA 3HJMA 4ECCA 2FLSA 20GSA 4ZXGA 1XW5A 4JBBA 1SYRA 1GTBA 1GSEA 2HRKB 4BWSA 2PERA 4KH7A 4EE0A 5G1LA 4V1Ag 9GSSA 3CSJA 5A4UA 3WGEA 3KTBA 5JWQB 2GLRA 2VL3A 3D22A 2GQKA 2VCXA 3O6TA 18GSA 3CBUA 4OCEA 2VCZA 1U3AA 1JHBA 1PKZA 3FR6A 2VM2A 2K9FA 1TRVA 4EF0A 1Z7PA 5EVOA 3GSSA 3DEXA 3F3RA 3UOMA 4KA0A 4ILFA 4YAVA 3DVWA 4PXOA 4G2EA 3IXRA 5GSSA 2OE1A 2V6OA 1EWXA 1OC9A 2R2JA 3KP9A 3L9UA 4MMMA 4WETA 2PVQA 1TRUA 1TK0B 4K7IA 2GZYA 2IL3A 3EYTA 5INYA 5ECOB 2V2GA 1V58A 3UAPA 3RPNA 4MP4A 2XC2A 4TXOA 3TOTA 2GZZA 5J5NA 1T7PB 2V6KA 2C3NA 2HSMB 4ZIJA 3F3QA 5ECQB 1F6MC 4JR6A 4WKWA 5DALA 4I2UA 1LU4A 3L9SA 2AYTA 3LEFA 3Q19A 4RQRA 2B5YA 3PINA 4QL9A 2H1GA 3GN3A 2L5LA 4WBJA 5CAXA 2L6DA 3CRTA 2LRNA 3TJKA 4ACSA 2YZHA 2XHFA 4I8BA 1AXDA 1DUGA 4EDZA 4POLA 1FW1A 4BPYA 4ECJA 5D8IA 1B4QA 1JLVA 2IIYA 5D9WA 1SJ6A 2H1BA 3GURA 2GTUA 3D5JA 3ME7A 1B8XA 2PGTA 3HYPA 5DAKB 3ZZXA 3HVSA 1FB6A 2HSHA 1M0UA 1A0RP 1GTAA 4LMVA 2LJKA 1NHOA 2WULA 1YF1A 5EY6A 2HQTA 1IYIA 3ZMKA 2AUVA 1FVJA 4EXJA 2I9HA 2LS5A 1U6TA 3HA9A 2AAWA 1NW2A 5B8BA 3QOUA 2WB9A 4MJBA 2MMZA 3UBKA 2RIIA 4JEDA 2FUG2 4G0IA 1UVZA 5D96A 3G7JA 4KSOA 4TVEA 2L4CA 1GSSA 4TR4A 1NSWA 3IDVA 4N10A 5A5KA 2C0EA 4WF4A 4EKZA 4I2TA 4EVMA 4D73A 3H93A 3TJFA 3RBTA 1QUWA 2X8GA 2L6CA 2HZFA 4ZL7A 4IN0A 3UVTA 1YZXA 4PNGA 3AY8A 3BD2A 1T4YA 1KNGA 1AC1A 5E4WA 3CXGA 4FH8A 3L0HA 1MDIA 2CZ3A 2BJXA 1ZCPA 1U87A 1FAAA 3NOFA 3J7Yk 1ZGNA 3TKRA 2HRAA 5HR2A 1GULA 3ZFBA 5ABRA 1V98A 5F8BA 3LJRA 1PA3A 3IK7A 2G2QA 4MJAA 1OE7A 4IKHA 2H6YA 2C1YA 2H19A 2VCTA 2GVPA 5J9CA 1YJ6A 1ZMAA 4TKYA 1OYJA 3DKSA 5IMAA 4YQUA 3EU4A 3K8NA 1A0FA 4MH3A 1TU7A 2DMLA 1K0NA 5IQYA 2FD3A 4ULXA 3F6DA 2HSNB 1BG5A 3F4RA 5D9XA 3F4SA 1XBSA 1TKDB 1WRYA 1O6JA 1XWCA 2FWHA 1K0BA 2CA8A 2DSAA 2PBJA 3O76A 4TOPA 3HVVA 4L8EA 2MMAA 1UC7A 5DCHA 4PURA 2FCHA 4AJ6A 2XBIA 14GSA 3TJGA 1X0RA 1PRXA 2GSRA 2DJ2A 3MAKA 3F4TA 4NHWA 2G0FA 4HQSA 4GRFA 4EDYA 1ABAA 5B8AA 1V2AA 4J56E 2P0GA 1W89A 1SJIA 4F2IA 2YV7A 3EWLA 4ML1A 3TKSA 2JL4A 1M2DA 3E9JB 4PGTA 3HZ4A 4KDXA 1LBKA 2D2ZA 4ZB8A 1WP0A 1AQXA 2XPDA 3QMXA 5GAND 1ILOA 2IWTA 3D6IA 2VCVA 3HZ8A 5ELAA 3C71A 1I9DA 3ZTLA 3LXTA 1PN9A 2V1MA 2X8HA 4V2NA 4NXIA 4NV5A 3KM6A 3KXOA 3G9BA 5B7CA 4G9HA 1TRSA 5IMFA 1HYUA 2MBSA 2RUEA 2PUKC 4LL1B 3KMOA 1WE0A 1MD3A 2B6MA 1TRWA 3VPQA 2LV3A 5JCUA 3ERWA 2DJJA 4GSNA 5ECRB 4O5RA 4MZBA 1ST9A 2VO4A 2VAFA 2REMA 1K0AA 4MK3A 1SD9A 4X1UA 4IP6A 2GT6A 2YV9A 3TRXA 3P90A 5CP1A 1A24A 1VF3A 2ALBA 4MDCA 3RHBA 4N11A 2H75A 3ZVJD 1RW1A 1TU8A 4IVFA 5D9TA 5DQSA 5ID2B 1X5CA 2HNLA 3WD6A 3FZAA 4G0KA 5AN1A 2B7KA 1SJZA 1EP8A 3KH7A 2TIRA 4EL1A 3C8EA 2AB6A 5ECMB 1OC8A 5AIVA 2C0FA 5CRWA 4I6XA 5KN0A 1TI3A 2EIQA 3D0ZA 3UVHA 3L78A 2B1KA 1OKTA 1AUCA 4BWQA 1F3BA 3EE2A 1X9MB 3TRPA 5CRGA 1JZDA 3KIJA 3E3EA 3WGXA 3ZREA 2GZPA 1K0CA 4IQ1A 1ML6A 2ZUPA 4V1Ap 5IMCA 1XFLA 2NDOA 2H01A 2C4JA 4GCIA 4RI6A 1XPVA 4G10A 5HQPA 3HHVA 5KN2A 1G7EA 4HU7A 1AW9A 2DIZA 2J23A 4K9ZA 4KCAA 3NIVA 2P5QA 2AJQB 2A2RA 4OD7A 2XBQA 3KTLA 4DEJA 2IFQB 5DCGA 2F9SA 2RUFA 3FKFA 2LEGA 1SKSB 1GUMA 1FG4A 4PX1A 3UL3A 1XW6A 1TXXA 1S3AA 6GSYA 3KD0A 2QKEA 2R37A 1JZRA 5HFIA 3TGZA 1G7OA 2CAQA 4POKA 2PWJA 3DMLA 1FB0A 3DYRA 2M72A 1R26A 3G7IA 1EP7A 4XTSA 3ZYWA 17GSA 2H71A 5LCZA 3TKSE 1JLWA 4KUNA 1LJRA 22GSA 1KEBA 1O7UA 1HQOA 5C04A 3V1WA 3LYPA 2B5XA 4FQUA 4K7NA 5G1KA 4PTSA 3TKQA 2IMFA 1X5EA 1GUHA 3TRQA 3LYKA 5B6NA 1AIUA 1TK5B 3ME8A 2GSTA 3P2AA 3UIWA 3IAS2 5JCWA 1MDKA 5GAPD 5JCGA 3UMAA 1VGLA 5CRDA 1RK4A 1BX9A 4NAXA 1O85A 4FYBA 3VFIA 2FWFA 4K1FA 4XS1A 3BOAA 5ID2A 5F06A 4GQCA 1YQ1A 4XIHA 6GSXA 4POBA 4IJ3A 4J2FA 4DSQA 3IC4A 4GF0A 2H6XA 4OMVA 2V41A 4N0VA 1VF2A 1M7TA 1ERUA 4V2MA 2PU9C 3S9FA 1A23A 1Z5YE 3ZRDA 2QSIA 2OBIA 1PD21 3N9JA 1XVWA 2DLXA 19GSA 4JR4A 3GKKA 3FRCA 1GSQA 4FYUA 2P5RA 1K0DA 3ZVJA 3QAVA 1V9WA 1J08A 2H8LA 3F0IA 4RUVA 1XIYA 2VL2C 4RQXA 3VK9A 2YNXA 1SU9A 1EV4A 6GSTA 3ZMLA 2MMOA 3GTUB 5IM9A 5IPGA 1E6BA 10GSA 5HR1A 5B6MA 1YKAA 1M9BA 1G6YA 5COHA 2H0GA 1IYHA 2NTOA 1EEMA 5G30A 4HEA2 4MABA 1OVNA 4ZB6A 2H76A 5ECNB 1X9WB 4MZCA 3VWXA 2FY6A 1AQVA 1YDKA 4XRDA 2GS3A 4PNFA 3C1RA 2VM1A 2R3XA 2HFDA 4MJCA 3UJ1A 3R3EA 2NBSA 2JZRA 3A2VA 4NHZA 2TRCP 2O7KA 1BQ7A 5HFGA 2OE0A 2JSZA 3W8JA 2YWMA 3FR3A 3GV1A 4HZ4A 3GMFA 1ERWA 3HVXA 4AGSA 1PSQA 2N5BA 2NVLA 4KX4A 2C0DA 1R5AA 3FHKA 1JFUA 3I43A 3VURA 2LQQA 1Q98A 5DQYA 3TDGA 2VLTA 4HQZA 2WGRA 1K3LA 5HR0A 1R4WA 3F63A 1W4VA 2JADA 3DXBA 1ON4A 4GQFA 2WS2A 2IPAA 2O89A 2J9HA 3H1NA 5CO3A 1GP1A 5CRHA 1WMJA 3IR4A 2HRKA 1XWBA 4GWRA 4K0NA 4DSRA 2VLUA 2CV4A 1XOBA 1QMVA 12GSA 3P7XA 4LLRA 3GKNA 1K3OA 4XS4B 1K0MA 2YN1A 3LXZA 2PMTA 1YF0A 5FHIA 4KNDA 1XOAA 1QQ2A 2R5GA 4BVXB 4BA7A 4MZWA 4YH2A 1QFNA 1A8LA 3GL5A 1SL0B 1T1VA 1VRSD 4IHUA 4PQIA 4TR3A 2CVKA 1PL1A 4KE3A 3FY7A 4ECIA 4HJMA 2GQMA 3H8QA 2WDUA 5ECLB 3H4KA 2AHEA 2ON5A 4MF7A 4EUYA 1PL2A 4FIWA 1WIKA 4P3YB 2X8CA 2DC5A 3EVIA 2KP2A 2L4QA 1T4ZA 2YWNA 4O32A 3GX0A 2B5EA 1EGRA 3DWVA 4F82A 1XWAA 1GTUA 4TRXA 2FNOA 1SD8A 4BL7B 3KJYA 4FO5A 5ECHB 3CMIA 3FEUA 1BYEA 1GSUA 3Q18A 5KN3A 2HT9A 2CAIA 2HSMA 1HD2A 3GYKA 3NZNA 1Y6EA 3W8SA 1O8XA 3TKSC 3ZIVA 2OA7A 2C8UA 2L57A 4X43A 3TCOA 4L0WA 4KDUA 3HXSA 2VL9A 2PVOC 2WJUA 3QR6A 3RAZA 3IPZA 4NPBA 4N30A 4O92A 4ML6A 3IAM2 4OCFA 4MLYA 1WWJA 3BJ5A 2CX4A 2JZTA 2VCWA 1I5GA 2C80A 3TUEA 6GSVA 4HZ2A 3EMPA 1FOVA 5C00A 2ES7A 4ZL8A 1Q4JA 3E0UA 3OR5A 1B4PA 4MPFA 2IMDA 3G7YA 3EU3A 1Z3EA 5DAKA 2KOKA 2O87A 1V40A 3CRUA 4IW9A 4WF5A 1PGTA 1VF4A 3H79A 1QK8A 3HJPA 3I6AA 2MMNA 1MD4A 2H6ZA 2EC4A 2K6VA 2VD0A 1ZZYA 6GSSA 1A8YA 2H1DA 2O8VB 1Z6NA 4DVCA 1F3AA 1OE8A 2K8VA 3APOA 4MF5A 2X99A 4KF9A 3IA1A 3HDCA 3BCKA 4JE1A 3A3TA 5CREA 3GL3A 1TTZA 5KN1A 2LSTA 1M2AA 2IMEA 2IN3A 5F05A 1KBNA 3VLNA 5GSTA 4TW5A 5IPHA 3FZ9A 5IO0A 1GRXA 2VCQA 2HXKA 4HUAA 3I9V2 2EIRA 4F0CA 3P8WA 1J9BA 1TOFA 5F07A 3M0FA 1T8EB 5ELGA 3RHCA 3ZFLA 5L71A 1ZYEA 2JZSA 4AJ8A 3CSIA 2LTKA 4JZQA 2P31A 2FWEA 4ZL9A 4OWYA 3M9KA 4PQHA 3A2XA 1TI1A 3APQA 4TN8A 3IC8A 3GA4A 1M9AA 4WBRD 4WR4A 3U6VA 1YEPA 3DD3A 1SENA 1K3YA 4ID0A 3F6FA 2ZNMA 3LG6A 2E2MA 4PUFC 4AJ7A 4K8MA 3FZ4A 3KP8A 3IBHA 1DSBA 4L5LA 1FO5A 1EV9A 3RDWA 3Q6OA 3VI7A 4E8HA 2F3MA 4KCEA 3Q74A 2HE3A 1Z9HA 2ON7A 1U88A 1URMA 3UEMA 4NWYA 3L4NA 4MJEA 1KTEA 2LQOA 3M9JA 4OO4A 2WRTA 1OC9B 1C72A 2DJ3A 4ZBDA 3KH9A 3TB2A 4LL4B 3LFLA 1XWGA 3KZQA 3MDKA 5H5QA 1ZOFA 4KW6A 4ZBBA 2B1LA 3R2QA 4USSA 4ZB9A 4TXOB 2DJ0A 2CVDA 3DGQA 4MH2A 4G0LA 3IOSA 1B9XC 1N2AA 2KHPA 1TJDA 2JU5A 3ZITA 1X9SB 4WEYA 3GX8A 4Z7XA 2LJAA 2C3TA 1WPIA 2RLIA 2H30A 1BAYA 3CTGA 1GNEA 4NMUA 4HI7A 3QCPA 3QFAC 4XCSA 11GSA 2YJHA 1DBYA 4OO5A 2VD1A 2R4VA 2FA4A 5AIXA 4HDEA 1VF1A 3RPPA 5G5EA 4DSSB 2JACA 2YANA 1THXA 4NV2A 5HFKA 2HLSA 3C73A 2PPTA 1SL2B 1DE1A 5EPFA 1TW9A 1M2BA 1EOHA 3L9VA 5HR3A 2MYGA 1JZWA 2A2SA 3ZIJA 1SKRB 1GSDA 3ED3A 2H0HA 4K6XA 1ACVA 1EEJA 4Q5RA 2IJYA 2YOIA 1J0FA 3UBLA 1MDJA 4MF6A 2OKAA 3VI5A 1SKWB 3QAGA 4RI7A 5LNKe 1K0OA 2DJKA 1O81A 3M8NA 5DDLA 4WR5A 1AQWA 2F51A 4XS6A 1YY7A 4MA9A 3TJJA 3PGTA 4QL7A 2E2GA 1SK2A 3LGCA 5ENUA 3GRXA 2F8AA 2FWGA 1Z6MA 3HCZA 1QXHA 2M80A 4AF2A 3D21A 2LRTA 1TP9A 2Z9SA 4HU9A 3ZL5A 2H70A 4O7HA 4TR1B 3LWAA 1XWKA 5A4VA 5D73A 4D73B 1T3BA 2LRCA 3F8UA 4WXTA 3TJBA 2N5FA 1GUKA 5JWRB 1FHEA 2QC7A 3FK8A 1Y25A 1SL1B 1A2MA 2IFQA 2H74A 3HY2A 2NPBA 1O8WA 3C1SA 1FVKA 1GWCA 4KSMA 5IMDA 5IOWA 1R5PA 1F2EA 4YAPA 3EURA 3IV4A 3WT2A 1OKDA 3GHAA 3GKXA 5ECPB 5DJLA 2LKUA 4PUAA 3GKMA 1EZKA 4IELA 1XW9A 4YQMA 3FZ5A 4KDYA 2YWIA 2X64A 4IGJA 5J9BA 4EO3A 5LD0A 1GSFA 3GH6A 3QAWA 2VL2A 1PX6A 3VPTA 4DSSA 1S3CA 2UZ8A 1UN2A 4K7OA 3EINA 2BTOT 2KUCA 2EIOA 4FYCA 4K2DA 5AGYA 2CT6A 2GSQA 2IMKA 3A5WA 5H5SA 1CQGA 2OACA 1HNAA 3WYWA 2JSYA 3EMXA 3HJOA 6GSWA 1XVQA 5J41A 1M99A 3MWHA 4IQAA 1BJXA 4XRAA 1PKWA 3CTFA 2CQ9A 4F03A 4V2LA 3M1GA 1NHYA 3TOUA 4JRRA 1F9MA 3GFKA 1OC3A 3IK9A 2CX3A 3GUSA 4HJ2A 1TDIA 3VWUA 1G6WA 2HZEB 4E8EA 4K0GA 2MZCA 1TK8B 5H5RA 3MSZA 1DE2A 3DVXA 2I3YA 1PMTA 4I5QA 3WGDA 2VUPA 2DIYA 7GSSA 3F9UA 3GIXA 1GH2A 2HRNA 5G31A 4ZILA 3J7Yb 2RM5A 4TR1A 4HS1A 5KEJA 1XXUA 3W6GA 3I69A 3DIEA 4ISDA 4X0XA 5ECIB 5D93A 3ERFA 3VWWA 4CW9A 2M46A 3GTUA 2I81A 1JZOA 4TXVA 4KGIA 3VWVA 4CDOA 4G19A 5IO2A 1Z7RA 3SBCA 1EOGA 3GH9A 1S3DA 2YPMA 2ZCTA 3U5RE 16GSA 3IE3A 2L5OA 2KLXA 1YEXA 4BVYB 1PQNA 1MEKA 2WZ9A 2C3QA 4YQVA 4N0ZA 5D9VA 2GSSA 3GSTA 4KB3A 2LUSA 1GTIA 3CYNA 1T00A 1OAZA 3BCIA 2HI7A 5IMZA 4JU5A 2VOCA 2L59A 1N8JA 2GT5A 3IHQA 5IOXA 5JWOB 3PR8A 3FYGA 1HNCA 4MPGA 5G2ZA 3C7MA 2CZ2A 2YCDA 2HSYA 5BMUA 3LSZA 1QGVA 2QGVA 3ERGA 2I1UA 4IBPA 2H66A 3KMNA 1EGOA 1V57A 4J57E 1B48A 1RQMA 3WT1A 4F9ZA 5DVBA 2OADA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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