3DFPA

Phosphate ions in d33n mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
363
structure length
350
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAANESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
publication title Charge stabilization and entropy reduction of central lysine residues in fructose-bisphosphate aldolase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
total genus 138
structure length 350
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2008-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3dfpA00
1WYIA 2V30A 3NQEA 3QQ1A 2AQWA 1JULA 3DFSA 1YTDA 2A4AA 2A7NA 4BWLC 1UB3A 1B9BA 3VFLA 4AWSA 1OX4B 4OV9A 3TQKA 4Z1CA 4A3UA 1DQWA 1JR1A 4O54A 1G4EA 1H50A 1KFEA 2QAFA 5D05A 3IGUA 1LZOA 3WJZA 4AAJA 1MZHA 3N14A 2YPIA 2G97A 1OFOA 2Y61A 3ABRA 2JKEA 4YCOA 3TKFA 3K30A 4AVFA 1K7EA 4BI7A 1P5BA 3Q58A 1KFBA 3PG8A 4H3DA 2V2CA 3CT7A 4JTGA 1WBHA 4BI6A 4J9JA 3PBYA 3L5MA 4DXVA 1A5AA 3P8IA 3BLIA 1PV8A 3FJLA 3GXPA 2F84A 3BW3A 4AHOA 5D04C 2NV2A 2H90A 4PC8A 3TSDA 2FIQA 3S1UA 2QUTA 1L6SA 3UY7A 4JX6A 4IWWA 2H8ZA 2X1RA 4UMCA 4EOUA 5H91A 2PURA 5DY3A 3MYOA 3OVRA 4UTWA 4CNNA 1W5OA 1B4EA 4FNQA 4HHPA 4NVTA 3M1ZA 3A9IA 5LNRA 2YW4A 4ADTA 4DO6A 2CZEA 4ZMGA 3NQ8A 1DV7A 5E1QA 3LHVA 4XBSA 4GUIA 4O10A 1I2NA 1J2WA 2B0MA 1TJPA 1K3UA 3CPRA 3NQDA 3MMTA 3I7SA 2NUYA 3VCRA 3IVTA 2BTMA 3C3NA 4ZQPA 3YPIA 5LNUA 1P0KA 5TBOA 5BRBA 3M47A 3NPWA 4FIQA 3A5FA 4OWGA 1TPVA 5K9DA 3MI3A 5F2IA 4MFEA 2A2IA 1TPH1 3MYPA 3NPUA 3M6YA 3BLFA 5AYXA 5HQEA 4BR1A 3CQ0A 2G96A 1SU5A 3ZR4A 1C8VA 4NUWA 4DPQA 3FEMA 2CFFA 5I3IA 1KFJA 3PAJA 4K38A 1MSSA 1FCVA 1LRNA 3UWUA 1I4NA 2FQIA 5G5IA 2J24A 2TMDA 2RFGA 2FPVA 1VHCA 3THAA 3G0UA 2GQ9A 4MVAA 3TK7A 4N6FA 1K8YA 3D0CA 1XXXA 1EA0A 1KA9F 1KLZA 1KM4A 3W74A 1TV8A 2YDAA 4CLMA 3NQ6A 2B7OA 3PB0A 2PCQA 3W75A 3TR2A 1AG1O 1TIMA 2YW3A 4GUGA 1O95A 3OVQA 3NDOA 4N9BA 3WJYA 5EA9A 3KVMA 4O14A 3TV8A 3KAOA 1RQHA 1T8XA 2TRSA 2G5WA 3W1TA 1DHPA 4Q33A 3W1MA 4R34A 2Q3RA 4IMFA 2GQAA 4LS2A 4Q4KA 3S5NA 5HINA 3S0CA 2A0NA 4OE7A 3S5ZA 3WK2A 1X8FA 1QPOA 4Y9AA 3H55A 4FX8A 3QQ0A 5SWUA 5LGXA 1A53A 1Z42A 1G67A 4HNNA 4Z1BA 3GDTA 2CZFA 3MUXA 3W7JA 5HR6A 3VE7A 1UASA 4A21A 1JCLA 5CPOA 5G2WA 4GUHA 3LCWA 3W23A 1CX9A 2YGYA 3TC6A 1ME7A 3SECA 3NL2A 3FYOA 3QFEA 1Q6RA 4KKXA 4BF9A 2X16A 4QISA 3IIZA 5IBXA 4AWUA 2NXGA 3HB9A 1VCFA 5EPDA 1CI1A 3M5VA 4K6AA 1KTCA 5D03A 3U8GA 3M16A 1NAL1 3TFCA 4Y90A 5K9XA 1W3IA 3TXZA 1TPB1 5D30A 2PC4A 2XN2A 1EIXA 1O94A 4Y96A 2V5BA 1H7WA 2QCDB 3G0SA 2A1YA 4LVBA 3VE9A 3TJLA 3RLUA 1FWRA 2FLIA 3PC0A 2B7NA 4HIBA 1SUXA 3TSMA 3GR8A 1XFBA 1JUBA 2CWNA 3L5AA 2CW6A 1H1YA 1ZY9A 1FDJA 3Q94A 4RZ4A 1H61A 3BO9A 3GDRA 2YYTA 4G1KA 5U4NA 4A2SA 5AC6A 3OVPA 1KM3A 5D32A 1UUMA 3TMLA 5F4WA 3EB2A 4PEKA 2NX1A 1ME8A 5BMWA 2QUVA 4Y8FA 5AYYA 4LNYA 3ZS4A 4O1BA 2QCEA 2QCHA 3TQVA 1R46A 1SZGA 6ALDA 1B4KA 4NNAA 3TJXA 4XUGA 1AW5A 2HTMA 2VKZG 4Z0SA 5KZEA 2WSYA 3L2IA 3EXTA 4XKYB 4JTLA 1Q45A 5D2TA 4CQAA 5E93A 1ZAJA 3TC7A 4MOZA 1SO6A 4LTSA 3O6DA 4RV8A 3MWAA 4HKPA 4LC8A 1VJIA 2EF9A 5K4ZA 1FUYA 1G7VA 2Z6IA 3LTPA 4MY9A 3CLMA 3TE9A 3MBDA 4WX2A 1G7UA 1VLWA 3JRKA 3NZ1A 2FDSA 4RXGA 4HNVA 1ZCOA 3EEGA 3TSBA 6TIMA 4MZ8A 1HL2A 1QFEA 2A5HA 2ZTJA 3FJ6A 3LCGA 3L0NA 3LHYA 3OG3A 5D09A 4JDYA 2NV1A 5C2XA 5J5DA 1SO5A 5GVJA 2YFOA 4WZHA 5G2IA 3ABSA 1A5BA 3LI1A 4AH7A 4LRSA 1TTPA 3W71A 3B03A 3DFNA 4AF0B 3HPSA 3LTSA 2OT1A 2E6YA 3WJSA 4C1LA 3O15A 3F1QA 2P10A 4CCCA 1QWGA 3PUOA 3EWUA 3MW7A 3DI0A 3UWZA 3R5EA 1TO3A 1TSIA 5FEXA 4Z1AA 4GUFA 1K8ZA 2ZRYA 4O8RA 4MJMA 2QJGA 4K8EA 3S42A 4JS3A 4FF7A 4Q32A 2X1TA 2XN1A 3G3DA 1YDOA 3P8JA 4LW7A 1RV8A 3HMJG 3M44A 5EBUA 2V2HA 5DELA 4OU1A 3DFQA 1GVFA 2YSWA 1VGAA 3BG5A 5CSSA 3HG4A 2E5DA 3W9ZA 3P61A 1QOPA 1SW0A 4L4MA 1ML1A 1EUNA 2VC6A 1FBAA 3LXBA 3QM3A 2X1UA 3G1FA 4NNBA 2BLEA 4ORMA 2ZBTA 1PHQA 1PCKA 2TPSA 5A8GA 1ADOA 2CZDA 4IGHA 3C2VA 3LHWA 3DXIA 2A85A 1ZJIA 3KRUA 3W83A 5TIMA 2OZ0A 3A23A 3RNDA 2DZTA 1A5CA 4POCA 2KZHA 3DI1A 4O0ZA 3C2EA 4TU1A 3GAKA 3TAOA 3E02A 3CHVA 3EX3A 3B04A 4JTEA 3LCIA 1OHLA 4BI5A 3BK0A 4N9EA 3B0UX 3NXFA 4UTIA 4RZ5A 3I65A 5EYWA 3T55A 5J5RA 1X1ZA 1W5NA 3GXNA 1SSDA 3CTLA 3ELFA 4E2DA 1TV5A 1DJNA 1QPRA 4GNJA 3TIMA 4JDBA 4FHAA 1JJKA 1UJPA 1W5PA 4FXSA 1H7NA 1TQJA 4GWEA 5I3HA 3W87A 3NQGA 1PS9A 1GTEA 4MJZA 5DCBA 2WNZA 1EUAA 1LYXA 5FI8A 3JR2A 2RDTA 3VI2A 2QCMA 2WV8A 3OHIA 1YYAA 5FF4A 1V5XA 3N19B 2ABAA 3TAKA 4AMAA 3P7YA 2OT0A 2GVJA 2QDHA 4N4QA 2NUXA 3DGRA 4HNTA 3W72A 5AHMA 5FF7A 1MEWA 4HNUA 1L6YA 3KRZA 1OFRA 1XUUA 2Y7EA 3GKFA 3W07A 1WX0A 1E51A 5D2YA 2E5BA 2ZCGA 3QMRA 4TX9A 4RX0A 3P62A 5TQLA 3BG3A 4IOTA 3USBA 1HTIA 4UXDA 1F6KA 3ATYA 5CG7A 3G18A 5ABTA 4NXKA 3W7OA 4M6VA 1UCWA 1SZNA 5LGZA 4CQ8A 3NQCA 2ZA1A 3R89A 3NPVA 4NX5A 4RLIA 3E49A 3L21A 5D02A 2Y7DA 4LY8A 1SFJA 1MEIA 5DXYA 3S5OA 5AHNA 3B0VC 3GK0A 1DKWA 4IMEA 3W73A 1WBJA 4UNLA 3LX9A 4DPPA 2C16A 2ZRVA 1DVJA 3BV4A 3N9RA 4XQ6A 2OX1A 3IVSA 1H7OA 3FA5A 2J27A 1K03A 4NZFA 4UR8A 4UFIA 3NL3A 1QOQA 2E6AA 1WV2A 3NA8A 5D2VA 3GDKA 5AFDA 1ONRA 2Q8ZA 3LBMA 3BGGA 2BWGA 1LTDA 2JK2A 4JTIA 3MP3A 1KTNA 4UTUA 5LNWA 4UTTC 3L0KA 4QAIA 1LOQA 2Y88A 4MPQA 5G2HA 4EF9A 1W3TA 4JR5A 3BLEA 4EIVA 1DBTA 4TMCA 1H5YA 1RVGA 2XFWA 5DCEA 5G1YA 3UZ5A 3W1XA 4UNKA 2A6NA 4MY8A 4XWUA 1LOSA 4NX0A 4R33A 1RZMA 2R91A 4LC6A 3BVJA 3S9YA 2Y63A 2WSRA 4GJ1A 1TCDA 1W1ZA 3MJYA 1ICQA 1XM3A 2Y85A 2WOQA 1JCMP 1DOSA 2NUWA 2VEIA 3PS7A 4M6QA 3RFAA 3PY2A 1XI3A 5CZTA 4O17A 4FIRA 4DF2A 1OFPA 3TH6A 4S2BA 5I3FA 4NJKA 1HO4A 3RK8A 1GG0A 4K39A 3QJAA 1TREA 3VKJA 3W2NA 3V75A 3L67A 1A5SA 3EX4A 1JUEA 3W1PA 2NXIA 5EY5A 1NF7A 2P0OA 2ZA2A 4LVDA 4JEQA 1OG0A 1VH7A 4FX7A 3DZ1A 1L2UA 1MO0A 4AXKA 2CLMA 2RDUA 3LM7A 4YLWA 3CWOX 3T44A 2QJHA 1TMHA 1KM2A 4KWWA 1YXDA 2H8XA 1F74A 4I7VA 3NL5A 1FCBA 1I2QA 3IVUA 1GZGA 3L0GA 4K36A 3IIPA 3DU0A 5D2XA 1OYCA 3M5ZA 3HF3A 1ZAHA 4CCEA 2LLEA 2ATSA 3SGUA 4ZQNA 4AHQA 5I3GA 7TIMA 5HWNA 5LHEA 3SW6A 2DZWA 1YDVA 2J9XA 1Q3NA 4RCXA 2V81A 1H7XA 3NPXA 2ZRUA 5HULA 4AB4A 5FF2A 2PRHA 3BG9A 3M7WA 2C14A 1H7RA 3STEA 4QNEA 3QEZA 5D33A 1W56A 4S1FA 4O0KA 1S3HA 5L9FA 2V0TA 2CLFA 1JQVA 1JUKA 2NXHA 1VYPX 3G8EA 4LT9A 4X9SA 3C2FA 2E68A 3W7CA 1QR7A 4DBEA 4MYXA 1VCVA 1VYRA 3O6CA 4I7WA 2V5LA 3QRHA 3B0PA 4JN6A 5CPLA 4K37A 3S8HA 3Q37A 4N4PA 1LCOA 2FFCA 2EKCA 1GTHA 2ZTKA 3LRMA 4PH6A 4XZ9A 5LKYA 1K8XA 1OX4A 2HS6A 1M5WA 4X2RA 2FPTA 4DO4A 3BARA 4GE8A 1SO4A 4OGZA 3OIXA 4CNPA 3NR0A 1EP2A 2X30A 1BEUA 4M19A 3PSVA 3B06A 1NFBA 2A7RA 1YXYA 3WFAA 4JYEA 2QCLA 1CW2A 4N2YA 3N2XA 1TPUA 2OJPA 2ZZ3A 3NEVA 3C61A 4P61A 3MI6A 1JRBA 3P5YA 1L9WA 4OQVA 4IXXA 3W7MA 2VFDA 2J88A 2EHHA 2GVLA 1ZFJA 3RMJA 3O07A 1KM5A 1VQTA 3DFTA 1G6CA 1VR6A 3LXCA 4FO4A 4KFNA 5AC7A 3OEXA 1R2RA 3UWQA 5KITA 1WXJA 4Z1DA 4RXFA 2Y62A 1KV8A 4HPXA 4PCFA 3M5YA 3CU2A 5D37A 3UWVA 4TO8A 5LSMA 1GEQA 1WOAA 4M7TA 3T4CA 3EKLA 3M5XA 4EWND 1FXPA 3LV6A 3W3OA 1QNVA 4QM1A 1ZENA 3MHFA 1S5VA 1SR9A 5AN7A 2RHGA 4FNPA 3U2OA 5CZSA 1WDWA 2E09A 5IM51 3LV5A 3GLCA 5MHBA 3PUEA 4FX6M 3GVGA 4MY1A 1YDNA 4QSHA 4AEOA 2ZZ4A 4O4VA 1KM6A 3ZWTA 1BWLA 1ZALA 4IQLA 5F1UA 2O7SA 1W8SA 1XBVA 4JXCA 3QYQA 4LRTA 1AK5A 3FKKA 3W86A 3GYEA 2FB3A 2Z0IA 2FPYA 4QQ3A 5I3JA 3AJXA 3GKAA 2E6FA 4EVZA 4UTWC 2R8WA 2V9DA 4C1KA 1TPC1 4N6EA 2WJZA 4FB7A 1XDLA 4LWWA 1XDMA 5CZ0A 2WO5A 4E2BA 3N3MA 1H62A 3LXAA 2JBMA 4LUIA 5AHIA 4A2RA 2CLEA 3HBLA 4YL2A 1N55A 5K2ZA 1C29A 1TQXA 4IX2A 3QPZA 2B7PA 3O05A 1JCXA 1KBIA 1T0OA 3FS2A 2VFHA 4PL1A 5FESA 2WPBA 3A22A 3RF9A 1F05A 1MXSA 3CM4A 3W22A 4E38A 3LCLA 2PRMA 1HUVA 1KM0A 3IIVA 1PE1A 4JTHA 1PVNA 4O28A 2CLIA 3GAYA 2WQPA 3GR7A 3W76A 1LBLA 4M5PA 4PODA 1OFBA 3TA6A 3BGJA 3N9SA 2ISSA 2VFGA 3MO7A 2Y70A 4NT0A 1IXNA 1H51A 3W7NA 4DF1A 3DFPA 3S1WA 3G8RA 3PWAA 2ZZ5A 3PVFA 2E1DA 4UTJA 2E6DA 4O1AA 4JTJA 1I2PA 2QJIA 3LRLA 2C6QA 4DELA 3PSWA 1XBYA 3CB8A 2VFEA 5AC8A 4MZYA 2VELA 3B8DA 1QPQA 2VFIA 3GIYA 3QMSA 2X1SA 3HGSA 3O1NA 1GWJA 2GPTA 1IIGA 3E96A 3TQ0A 3QC3A 2Z6JA 4KWVA 1YPFA 2AGKA 3LCXA 5DLCA 2OMAA 3IIOA 1FQ0A 3G1SA 1N8FA 2NWSA 3N34A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4CNP A;  1EP2 A;  1MQR A;  1BEU A;  4M19 A;  3EEZ A;  3ZJ8 A;  1B3X A;  1K70 A;  4PBE A;  3A9B A;  2R1K A;  1M65 A;  2NVC A;  4N2Y A;  4AW7 A;  5CQ1 A;  4DAF A;  2QS8 A;  3P5Y A;  1I60 A;  1V6X A;  1A5K C;  1M3U A;  2GVL A;  1NP0 A;  3OG2 A;  3NVD A;  4D6F A;  4L7Z A;  4KFN A;  2X0H A;  4V1X A;  1Q85 A;  3M5Y A;  3CU2 A;  3N25 A;  4M7T A;  4C91 A;  3EKL A;  4EWN D;  1FXP A;  2DH3 A;  3LV6 A;  1C7S A;  1SR9 A;  4EP8 C;  5AN7 A;  3N29 A;  3KBS A;  5M17 A;  3ITL A;  3LV5 A;  3BJT A;  3SSZ A;  3RN6 A;  1O66 A;  3GVG A;  1YDN A;  2WWC A;  3F5J A;  3VDH A;  4TQT A;  1ZAL A;  4TV5 A;  4IQL A;  5F1U A;  1W8S A;  2G3I A;  3BH4 A;  3FKK A;  5BWA A;  3WYZ A;  1JGI A;  5I3J A;  1MYR A;  3AJX A;  3AWO A;  4DWS B;  5I7G A;  1NEL A;  2VR5 A;  3K5X A;  3KWX A;  2I5G A;  3UG8 A;  3GNR A;  2B81 A;  4JNZ A;  3S9Z A;  2J62 A;  4X0V A;  3M0X A;  4QHR A;  2CBU A;  2WXD M;  2H9A B;  3HBL A;  1N55 A;  3K4A A;  1C29 A;  1VBH A;  3QPZ A;  1IR1 A;  3O05 A;  1XII A;  2VFH A;  4PL1 A;  4Q8N A;  1VFT A;  3A22 A;  1ENU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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