3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
source organism Escherichia coli
publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
3UR4A 3O2AA 4WKMA 3PPPA 3P7IA 1MQDA 3IJ1A 3I7OA 4GGCA 1OQHA 3U93A 3C9HA 3O6GA 4M4GA 3A3UA 3EI4B 1H76A 1PB7A 1VR5A 2CNXA 5IKBA 2J55H 4J78A 2H9LA 5TU0A 3ILUB 1P1WA 2DS9A 2XU7A 4BLAA 2Y7WA 4A08A 3JYRA 3F3GA 3RT8A 4IGTA 5H1MA 3OKTA 1YTVA 4G77A 4H65A 5DTBA 3R6UA 4NF5B 4E5ZA 3RT6B 3T9XB 3BKIB 1M5BA 4X61B 1OLCA 5H8FA 4E54B 2IA4A 3MP8A 3U94A 5B70A 3VGZA 2PMSA 4ZEDA 1YCJA 4NEDA 2Y7RA 5CI5A 5I2NA 1AOVA 2Z8DA 5HYNB 5ICQA 2H6KA 4BDMA 3VXBA 4KHZE 4GXAA 1N6DA 1XC1A 2I4CA 4QL1A 1B7HA 1XHYA 2XX9A 3RLFE 3AL8A 3G3JA 3DSMA 3MC2A 5I59A 4O45A 1N3WA 3VDFA 2XD2A 1XKSA 1MY2A 3DXMC 1CE2A 3VH0A 2I3SA 2ZNTA 2GFEA 4E54A 4GM9A 5H8FB 3SERA 2ALUA 2HESX 2HFBA 4E5ZB 4NF5A 5ITOA 3QUJA 2E1SA 2J57G 2ABHA 4AEZA 4QRZA 4XKRA 1R1NA 4F1VA 4E0WA 5AJAA 1QKAA 4DLDA 2ZMBA 3FVOA 3ODBA 1DMBA 3EG6A 4ERQA 3SBPA 5EMMB 2H5YA 3SLED 4J73A 1IQ7A 4NF8A 4TLMB 1I69A 1RKMA 3O66A 4ZOZA 4OWDA 5CRYA 1POTA 3DLNA 3K1PA 4YKPA 1OMWB 5DYHA 1NH7A 1FQCA 2A5TA 4ZEBA 5DVJA 3V83A 3B7DA 4I62A 2P9NC 3OD7A 4DXCA 1Y4CA 3PPNA 2H9MA 1NNKA 2HEUA 2QL3A 2IUVA 4ELOA 1Y20A 3OEKA 4J86A 4OENA 4A09B 3UKUC 1AL3A 2ZNSA 2B3BA 5HE0B 2F6GA 1CB6A 3K2DA 1LGBC 4KYDA 3I6VA 1XS5A 2CE9A 4C0RA 3ZS6A 4MH5A 3FVKA 5CM6A 2PBWA 3CR9A 4C1TA 1B9JA 1FQFA 4TZ4A 4Z0IA 5BUUA 1JQFA 5H17A 2Q9TA 1VFEA 5GXIA 1EZPA 4UACA 1N04A 4G4PA 2OIZA 4LP2B 4JXMA 2P0SA 4QRJA 4L3GD 3RPWA 4A0AB 2THIA 4K3JB 3KBRA 3EF7A 5JEIA 2MTAH 3MW0A 5SXMA 5AA4B 1ANFA 3SFZA 5I5JA 2PM7B 2XX7A 2FYIA 1LAHE 3MQ9A 3VFJA 4LZ5A 2B5NA 2HCAA 2YLNA 4F1UA 3J80g 3PSLA 3V9FA 5H8HB 1Z7NE 5EALA 3IR1A 1IXGA 4YMAA 4YICA 5AA3A 4D0KA 1JW1A 4J81A 3IO4A 3HHFA 5FTHA 2F6PA 1B9YA 3IOWA 3C33A 3Q29A 3EHUA 4FATA 5CXBA 3S9NC 2O7UA 4EQBA 3K26A 3TODA 1B3FA 4FE8A 4U23A 2OVQB 2ONRA 5DVIA 4IY5A 3MP6A 1GTKA 3RUMA 4FAND 5HBCA 4X9TA 5J1DA 4OFOA 3QYTA 4POWA 5ITPA 3TQLA 1SQ9A 2AYSA 4GD5A 5TDHB 4PP0A 2I3TA 3MBPA 4L3HD 3J81g 4YKKA 5I84A 3WAFA 3OO7A 3TYHA 1ZU0A 1UTHB 3PMVA 1OMPA 3TFLA 2AGYA 4NF4B 1HSJA 4X48A 3EWEA 2ANJA 5FHMA 4ZN4A 4OEUA 2YPNA 2O1LA 3TAJA 3TPAA 2UYFA 2RC7A 2O51A 2Y7KA 5F1QA 3PUVE 3RN1D 1N84A 2H4IA 4IMMA 2RCAA 3I5OA 4F29A 3CIJA 1OIBA 3RY3A 5ELVA 1U2VC 3AXFA 3IK6B 3CSGA 1D3KA 2RC9A 3TTLA 2IURA 1ZJLA 3JZGA 1XIPA 1QVSA 5H8HA 4JT5C 4YB7A 4FAVD 3FASA 1A99A 2OJYA 4DDDA 2G93A 4NWDA 3T93B 5H8QA 4R75A 2RF1A 4TLLB 4RXLA 1IUDA 2Q7QA 1NNPA 3NVXA 1EZ9A 3OKYA 3ORVD 4A0AA 5EHMA 4EUOA 2FA7A 1N3XA 2H9PA 4XEIC 1BIYA 1UTHA 2H13A 1P22A 1RI6A 2ONKE 3AFCA 5EHSA 4PSXB 3K6WA 5K2YA 3OSRA 3VLVA 4DXUA 1QUJA 1IXCA 2Y7PA 5FHOA 3M3FA 4QSCA 2ZXTA 3R26A 4DCXA 3TCFA 4AQ4A 2IUQA 5DVFA 2XXPA 4A09A 3KSXA 4I79A 4G2ZA 1JEUA 1H3DA 2P9UC 3K6XA 4LATA 2GHAA 1PBPA 4L9OA 4DZ1A 3OMBA 2X26A 4GL8A 2NVUB 4J87A 1JMXB 4QQEA 3T66A 4KFQA 3O97A 4A7JA 4PBZA 1B4HA 4R7AB 3CIKB 2PM9A 3NVNA 1MQIA 4ZE9A 2H6NA 3AH8B 3RTFB 2J56H 1SBPA 3C32A 2UVGA 1GXRA 1I6QA 2YB8B 2HYEA 4NF8B 3E3KA 4DCYA 5LOMA 5TF2A 1B2HA 3H6TA 3SHFA 1B0LA 2F36A 4RY1A 3U1OA 2Y84A 4NMYA 5KDTA 1GOTB 4UA8A 1SYHA 3ECRA 3S9MC 2REJA 4JWOA 4Z7EA 2CN2A 1JVYA 4R6YA 4HCWA 3K1NA 3MKSB 4ZOYA 1PC3A 4POXA 2AGXA 2HJBA 1Y9UA 3H6VA 3UVKA 4O3CA 3AL8B 1B05A 2B3FA 3U8QA 1HSEA 4JBZA 4U4XA 3TDJA 3H06B 3PV0E 3ULEC 4PFTA 1U4CA 2PT2A 4F2OA 3C4MA 1IXIA 3UVMA 3EI3A 3VLUA 2DWIA 2CN3A 3MXXA 2Z8FA 2XXHA 1LB9A 2R71A 3TTRA 2I0RA 3PUXE 4MLVA 3OL2A 2H99A 3PUYE 1PDAA 3SVWD 3EI2B 1M5CA 4F19A 3FRXA 3TQWA 4OEVA 4GOTA 4FHLA 1MXZA 2BJJX 3CFXA 3O6IA 4MBPA 3SCYA 4NF6A 3LR1A 3KEIA 2DXYA 2M8CA 4H5IA 5C9ZB 1JJUB 1O63A 2ZYKA 2VD2A 4I9DA 1Y3PA 3IOTA 4O1QD 3C9CA 3PD9A 3OW8A 1GV8A 3DM0A 3BBRA 4OTEA 3USDA 3MZKA 2Z23A 3CI8A 5I57B 5CYKB 2XD3A 5KDOB 3FV2A 3UN6A 3CFVA 2Q89A 2I4BA 3IJ0A 2YNPA 5A5XB 4RPNA 2H9BA 4O3AA 3BG1A 1MQJA 4UI9R 4OHNA 3BG0A 1FQAA 2I48A 2QS2A 4IGRA 3V89B 3BFUA 1FWXA 2D21A 1DPPA 3SBRA 3M3KA 4CI3A 5THAA 2XL3A 3DELB 3OO6A 1PBYB 4N13A 5TEEA 3SN6B 2F35A 4MFIA 5FA5B 3MPLA 2QJEA 4R73A 4GQBB 4NE4A 4PE5B 2G9AA 5I57A 4OQOA 4GRKA 3MMYA 4M1VA 4I1DA 3CFSB 4R2FA 3PU5A 3I8CA 4FA9D 1D9YA 5IGQA 1FTKA 4IY6A 2XXRA 3P4FA 3C31A 4LQ2A 2P2AA 2Z2PA 4NWCA 5AFU3 2ZNUA 3L6GA 1SQYA 1PB8A 3UP9A 1P99A 1QNIA 1VE4A 4N14A 1VSOA 4U4SA 1BKAA 1H43A 4ZE8A 2OZZA 2XXTA 4BDQA 2PX1A 5C2VB 3C5MA 3OL2B 2HQ0A 3IOVA 3QIMA 4LQ5A 3EHSA 3MZLA 2XL2A 2CE8A 3TKDA 3W15C 1B5IA 4YU0A 2VOZA 3PMWA 4ELQA 1FQBA 2I0BA 3H4ZA 3N6UA 2GHBA 1WVJA 3KGCA 3QAXA 4IA9A 3UGWA 4Y7RA 4Q0CA 3FJ7A 3M3LA 1O7TA 1A40A 4HDJA 1KWHA 5TP9A 1LFGA 3RFHA 1JEVA 4TOZA 4RNSA 2ZYNA 1M5EA 2I49A 2B4EA 2Q2CA 3I7NA 3PVWB 2H6QA 4G8NA 1UIVA 2OK4A 2NWJA 3FXQA 2UZYB 3QSLA 3IB0A 1UTBA 4OETA 3DP6A 5CC2A 2IWKA 1MDP1 2FNCA 2QMWA 3JAMg 2V3TA 2W7YA 4U2RA 3OKYB 4LGNA 1SDXA 1SI1A 4DIGA 4F1YA 5CMBA 3TCHA 2DQVA 2O6AA 4KD5A 1D4NA 4ZOVA 1GVCA 3I7PA 3PVUB 2R9JA 3EI1B 1ELJA 3IO6A 1DTGA 1M5DA 4XXUA 4XIGQ 3PMXA 4OVJA 3FJMA 3D4CA 2QPQA 3VVFA 1WODA 1Q35A 2DWAA 2QMXA 3EHTA 4RK9A 3QK6A 4GL0A 1ZLQA 5TPAB 2IEEA 2BCJB 2QS4A 1B4ZA 4JSOA 2OBGA 3GXAA 3HN0A 3M8UA 1HSLA 3KN7A 2UZXB 3FXRA 4IO4A 1B3HA 3CVGA 2HAUA 3RRMC 4FA4D 2I0TA 2YBAA 3MZ1A 2GRVA 2XHDA 2F34A 3KSJA 5KCJA 3LSWA 4FIMA 1TFAA 4NTLA 5IC7A 4JSDA 2E0SA 1JOFA 2XX8A 2QXVA 2OWTA 5DT6A 2RC8A 2HKRA 3CFLA 4JB7A 4PFWA 3RNNA 3I8EA 2ESNA 2V3QA 5L9SA 4A0BA 4ISUA 2BBKH 4F3BA 5L9MA 3HV1A 1H45A 2O69A 1FQEA 3KN3A 4XKQA 1QULA 2DP8A 1B3LA 2DVCA 2EBSA 3WAEA 3C36A 3MVZA 4QHQA 5IT9g 1JW4A 4EDPA 2RINA 1B51A 3KOTA 4CZVA 3TUSA 3FGBA 3SEUA 2PT1A 5CXCA 1PB9A 3MVYA 4L1QD 1MDAH 4CY2A 3VLWA 3TTKA 4OYVA 3H03A 3S2VA 2AL5A 2WKYA 2XXUA 4QFKA 4GVOA 4ND9A 3GBAA 5JK4A 1FTMA 1IZ1A 1TFDA 4GFRA 4EXKA 1NMUA 4GMBA 1FW0A 1B52A 1P1NA 3E4RA 2AQ5A 3MUQA 1MQGA 4J79A 1QUKA 2W18A 3A09A 5F7VA 4QFNA 4YZZA 3OENA 4PFYA 4CC9A 4BDLA 1FTJA 4P0GA 5M2VA 1PBQA 1IIWA 4QFPA 1MXYA 2OWSA 4J82A 4OFJA 3FVGA 4IO5A 2AGZA 3EN3A 4ZEFA 4BH6A 4YB6A 3TMGA 4JSPC 1A7LA 4GQOA 3GREA 3CFZA 2HXCA 5K19A 3UK4A 4X3EA 4P11A 4CI2A 4F22A 2CO0A 1PI6A 3OELA 4X63B 5K2XA 3Q25A 4JSVC 1MPBA 5A2Qg 5FTIA 2DYXA 2AH0A 1Z7ME 5B7DA 2F7CA 4ESGA 3C34A 4GXSB 1BLFA 4U21A 4EWRA 4A0BB 1MY1A 4LA9A 2QRYA 4GF8A 4H8IA 3K27A 1EU8A 1SD3A 3N94A 3SEXA 1NFTA 4U22A 1MPDA 4IO2A 2CMOA 1MDQA 4DE8A 3O6HA 4H1XA 3PXSD 4H5JA 1EH3A 4XKNA 3K1MA 4ESXA 2QC5A 5ICTA 5IJ7E 1L5TA 4PXWA 1Y3QA 4AB5A 3B6WA 3C75H 1WDNA 4YKJA 5EM2A 3E9XA 1B0HA 1T0KA 1A0RB 1TYQC 5TPAA 3MZBA 4YMBA 3UVLA 1N7XA 4YAHX 1MQHA 3JZJA 2PYYA 2XXQA 1AMFA 4J84A 2Q8JA 1JW5A 3LUYA 5TEFA 1K8KC 1YFQA 4R9FA 3DWLC 4GZ8A 1FTOA 2QS1A 2YNNA 5FKQA 2UVIA 2NUVA 1A8FA 5FXYA 3T9HB 4FEDA 4ZZAA 1LFIA 3ZWLB 1B32A 4XTCQ 5GMKn 4N6PA 1ZIUA 2Q88A 1MY3A 4BL0A 2DWHA 3IB2A 2YNOA 4ZZEA 3B7FA 2V25A 3JZNA 3T9UA 3O9PA 4EXLA 4AB6A 3VVDA 2H25A 5I59B 4OXVA 4P0IA 3CSBA 4CZXA 2RCBA 4A11A 4OESA 2F7BA 5EAPA 4ES0A 1B7ZA 5HQGA 4FECA 2PM6B 3F3PA 4JSXC 3SXTD 4CY3A 4WXJA 1P1OA 1NNFA 1MY0A 4ERZA 2HXWA 2H14A 1PEBA 2NOOA 1N7WA 3IJCA 4LVQA 1I6BA 4OZ9A 4ZS9A 4R2BA 3I89A 3MKQA 4R6HA 1NKXA 1P1UA 3RQTA 1B7UA 3SEWA 2VP1A 3O29A 3ONMA 1NR0A 3MP1A 4H67A 3EQ1A 5H8NA 3OSQA 2F7AA 1MXUA 1MS7A 4QF9A 4A2LA 3OXNA 3V5AA 4X1BA 5GSAA 4KYEA 2OVRB 1MM7A 5HE1B 4ELPA 3KZGA 4FA5D 4RJZA 5DEXA 2D3IA 4CY1A 1TT1A 3ZKLA 3EI4A 3JPXA 4CY5A 1URGA 5H8NB 2PVUA 3SDFA 4F3GA 1BTJA 1URDA 1PEVA 1Y4TA 2F78A 5I56B 3PSCB 4FB1D 1AH5A 1B9XA 4J8BA 4X60B 1GR2A 3FXUA 3DP8A 4NSXA 4J77A 1LBCA 4Q30B 2AH1A 3KG2A 3W9VA 1JMZB 3W15A 2H3XA 4PQJA 2Y7IA 4KCDA 2XXIA 3W9WA 3F11A 5HM4B 3EMHA 3FV1A 3TZAA 3S9EA 1LLSA 2G29A 3VA6A 1MPCA 4IO6A 2I3VA 1S7YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3UR4 A;  3O2A A;  4WKM A;  3PPP A;  3P7I A;  1MQD A;  3IJ1 A;  3I7O A;  4GGC A;  1OQH A;  3U93 A;  3C9H A;  3O6G A;  4M4G A;  3A3U A;  3EI4 B;  1H76 A;  1PB7 A;  1VR5 A;  2CNX A;  5IKB A;  2J55 H;  4J78 A;  2H9L A;  5TU0 A;  3ILU B;  1P1W A;  2DS9 A;  2XU7 A;  4BLA A;  2Y7W A;  4A08 A;  3JYR A;  3F3G A;  3RT8 A;  4IGT A;  5H1M A;  3OKT A;  1YTV A;  4G77 A;  4H65 A;  5DTB A;  3R6U A;  4NF5 B;  4E5Z A;  3RT6 B;  3T9X B;  3BKI B;  1M5B A;  4X61 B;  1OLC A;  5H8F A;  4E54 B;  2IA4 A;  3MP8 A;  3U94 A;  5B70 A;  3VGZ A;  2PMS A;  4ZED A;  1YCJ A;  4NED A;  2Y7R A;  5CI5 A;  5I2N A;  1AOV A;  2Z8D A;  5HYN B;  5ICQ A;  2H6K A;  4BDM A;  3VXB A;  4KHZ E;  4GXA A;  1N6D A;  1XC1 A;  2I4C A;  4QL1 A;  1B7H A;  1XHY A;  2XX9 A;  3RLF E;  3AL8 A;  3G3J A;  3DSM A;  3MC2 A;  5I59 A;  4O45 A;  1N3W A;  3VDF A;  2XD2 A;  1XKS A;  1MY2 A;  3DXM C;  1CE2 A;  3VH0 A;  2I3S A;  2ZNT A;  2GFE A;  4E54 A;  4GM9 A;  5H8F B;  3SER A;  2ALU A;  2HES X;  2HFB A;  4E5Z B;  4NF5 A;  5ITO A;  3QUJ A;  2E1S A;  2J57 G; 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