3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
3RPWA 3I3VA 4OWDA 3VA6A 2OK2A 3A3UA 4H65A 3K2DA 1MQIA 3IKOA 4JT6C 3KG2A 3GFCA 1N7WA 2Y7IA 4F31B 1JOFA 4X60B 2ZNUA 3O6GA 1NMUA 3V9FA 4DE8A 2YNOA 2P9NC 1MDAH 2E0SA 3K6XA 3MZBA 1JEVA 3A0FA 3T9UA 1FQBA 4XKQA 3N5LA 1XT8A 4R6HA 1NR0A 3THIA 3QIMA 3EF7A 1GXRA 3SBQA 3H06B 3TTNA 4F3PA 4X3EA 2Z8FA 2VD3A 3MWBA 4A08A 1POTA 1GOTB 5FKTA 5HE2B 5BWJA 4GWOA 3Q29A 1B9XA 3DWLC 3SEVA 4IB2A 3TAJA 3RSEC 1N0TA 1PBQA 2Z8EA 5F1QA 4IA9A 1Y4CA 4XKRA 1ZTYA 3IAZA 1JQFA 2H25A 3NVXA 4G8HA 5L9MA 1R1NA 5CYKB 4H5FA 4FB1D 3OD7A 2P9IC 5DVFA 3C99A 4JSOA 3BG1A 1JW1A 2G29A 4GM8A 3H7MA 5TEEA 2V3UA 2Q2CA 2PM9B 1OLCA 4C0RA 1H44A 3CR9A 5I56A 2DE2A 3PD9A 4GLIA 3JZNA 3KJTA 2J57G 3JROA 4J77A 3EI1A 1LFIA 3PUZE 5ITOA 4OQOA 1QUJA 4Q8RA 3E0CA 1B3GA 2Q2AA 4ZN4A 1WDNA 3IOWA 3VVDA 1SVXB 2VGQA 1QNIA 2H68A 2XXQA 2XD2A 5H8HB 5H8QB 1N6DA 2AGZA 4O3TB 5EARA 5L9OA 4FORA 2UZYB 2I3SA 4X1BA 4L1QD 4R75A 3SEYA 2OZZA 3ZS6A 4G4PA 1ATGA 2F97A 3PVUB 4THIA 3IB2A 5IJ7E 3KN7A 1XVXA 5GXHA 3AL8A 2XL2A 3MMYA 3IL1B 2Q88A 4OENA 3DELB 1K32A 3DLNA 4A7JA 5FLXg 4JSPC 3H6UA 2HZLA 4CY1A 5TU0A 1TT1A 5AA2D 1QW0A 4JT5C 4GZ8A 3BFUA 2B65A 5EYFA 1MG3A 3OKYA 3E9XA 2I0BA 4A2LA 1MM6A 2IURA 3MJNA 4F3BA 3IJ0A 4ZEBA 1B3EA 2RF1A 5I5MA 4ELQA 5DTBA 1XVYA 4FWWA 3FATA 1SQ9A 1O64A 2Y7KA 3B7FA 3TCHA 1MDP1 3BFTA 1MQGA 3IO6A 4JWYA 2H9NA 4BDRA 4J8GA 2UVHA 1TFDA 2ABHA 3C31A 1AH5A 4GFRA 2THIA 2VP1A 4H8JA 4IO6A 3HN0A 2OVQB 3ILUB 1B5JA 1SI0A 1PC3A 4ESXA 4TQUQ 1IEJA 2H9MA 1MH4A 1MY0A 4PBYA 4P11A 3MVZA 2B3FA 3I89A 1NH8A 5EALA 3MVWA 3R7XA 1MY2A 3MVYA 1YCJA 4IO5A 1RKMA 3W9VA 1OMPA 1JETA 3EN3A 2ESNA 3TELA 4PBZA 3V8XB 2HZKA 4LUBA 5JWZA 4RNSA 1I6AA 1Q47A 1SHYB 2FNCA 4J8BA 5AMSA 1M5CA 2UZXB 4KYEA 2H98A 5K2YA 5EMLB 5CMKA 3CIJA 3Q25A 1JVXA 3FXRA 2J56H 1UIVA 3EI4B 4K3JB 4KPTA 3FV1A 3LSLA 2AH1A 3U8QA 3G3FA 1AIVA 4PNKB 4OERA 3V89B 2O7IA 2DWJA 1B1XA 1VFDA 3U94A 3S9LC 4MK0B 4EF1A 4YU0A 3U92A 1LCTA 3UVNA 1CB6A 1JW4A 1SDXA 2J55H 4FAVD 5K1CC 4D0KA 2RC8A 4L17A 3OMBA 3F3FA 4OMBA 3MPLA 5HE1B 2RCBA 2CNXA 1A55A 3JYRA 3O6HA 4YKJA 1ZKBA 4DXBA 4NF4B 1B51A 1N7XA 4UA8A 5JTYB 4LGNA 3DM0A 1L5TA 4YKIA 4CI3A 4JB7A 4E0XA 1MS7A 2GC4A 3ILTB 4ZEDA 1JMXB 1B2HA 1MY3A 4OFJA 3K6VA 3OEMA 2ONKE 4DCYA 5H8FB 3OTTA 3RGYA 1VSOA 1TFAA 1LAXA 2GNQA 5H17A 1EZPA 1EU8A 1MQDA 2HJ4A 1P1QA 4ES0A 5TPAA 3VV5A 1R6ZA 4GXAA 2G93A 2H9LA 2G9AA 4LP2B 4NSXA 2V25A 3OO8A 3JZGA 5HE3B 3SN6B 3UK4A 3I8CA 5IT9g 2F78A 4ECFA 1B32A 3TTMA 3B6WA 5EM2B 3VLUA 1MH3A 1B1HA 1MXUA 3H6VA 2CO0C 1ZBMA 4OHNA 4KYSA 3Q26A 3PVWB 4RK9A 3W9WA 3UVOA 4R2FA 3EI2A 5I2KB 2IWFA 4O1QD 1MPBA 4H8IA 3H6WA 4QSEA 4I62A 4GGCA 2AGLA 5I5IA 4PSXB 2O1LA 1Y1ZA 1S4UX 5AFU3 3PPPA 4D6VA 3OKTA 3UR4A 3FVKA 3QXMA 1QVSA 1URSA 3TZAA 3KGCA 1AOVA 1B5HA 5CMCA 2O1MA 3H4ZA 3T22A 1DTGA 3BG0A 5HE0B 2IWKA 4EQ9A 2I0TA 3SMRA 3PPOA 2UXAA 4IO7A 2DVCA 2CMOA 3TDJA 2AIXA 5A5XB 2DWAA 3EI2B 2HYEA 5GMKn 5KCJA 5CM6A 1JVYA 5FKQA 3O66A 1YPNA 3KFMA 3CFVA 4JWXA 4N14A 2H6QA 5BUUA 1R9QA 4Q0CA 1URGA 4WXJA 1II5A 1M5EA 4JDFA 4ERYA 1QULA 4PXWA 4O3BA 3PU5A 4PQJA 3WAFA 3TQWA 4F18A 4OFOA 4J0XA 3M3FA 3LSFB 2OK4A 4GXSB 1ZIUA 3MVXA 3RY3A 4KD5A 1SQJA 1MY4A 2ZMBA 5AA4B 4L3GD 3HSTA 5GSAA 5KCJB 3OL2A 4X9TA 4I79A 3O28A 1PEVA 4IGRA 1FQAA 4OEVA 4LVQA 3RTFB 3EQ1A 1SW5A 4X1DA 4OWRA 1I6BA 3EWEA 4ONYA 4AEZA 3NVNA 1BIYA 4J87A 5KDTA 2HAUA 3PXSD 4LATA 1A40A 2I4BA 4R9GA 5FTIA 4A11B 4N07A 2DOJA 3RQTA 1ELJA 2XXTA 3FVNA 4HTGA 3HO7A 3LBSA 1MM7A 5B7DA 5ELVA 5IGQA 5CBRA 5ICTA 5FXYA 4EXLA 3TUSA 3BKIB 3OL2B 2QSXA 3RN8A 2HJBA 3SETA 5IC7A 4AQ4A 3FXQA 2Q89A 1IZ1A 4BUJC 4ERQA 1FCKA 2O51A 4OEUA 3KSJA 3TYHA 3UN6A 1LBCA 2HAVA 1BKAA 1Q35A 1PBYB 4O9DA 1MXVA 4AB6A 2UYEA 4NF8B 1OQHA 1VFEA 2R71A 1NEXB 2REJA 2V93A 3C9CA 2AGXA 3ORVD 4RYAA 1IQ7A 2QPQA 3UA8A 4U1EI 3N0EA 5CYKA 4CI8A 3PSLA 3MKSB 3SBRA 3CG1A 4A0BB 4KCCA 4H5JA 3KN3A 3D4CA 5EHSA 4PETA 4ZEKA 3VFJA 3RT8A 4QSDA 3I2NA 2O69A 1JEUA 4GRKA 4GVOA 2PM9A 2HESX 4I1DA 4GQ2P 3U93A 1K8KC 1ANFA 5DVJA 4J81A 2RINA 1P1OA 3UVLA 1O63A 3GLBA 3N0DA 4PFWA 3USDA 3AL9A 2QL3A 5FQDA 1JJUB 1HSEA 3K0VA 5L9SA 1SW1A 3SEWA 2Q9TA 4RK2A 3TPAA 1OLAA 1Y20A 5H8HA 2Z2PA 5H8QA 2O7UA 5FHOA 4YVDA 3PPNA 1AMFA 4JBZA 4DXCA 2Z8DA 2Q8JA 4MH5A 5I58B 2OIZA 2ONRA 4U1OA 4HW8A 2CN2A 3TTKA 3EI3B 4JSXC 1MRPA 3DP8A 4ELPA 3MXXA 4O3UB 3CG3A 2Z2NA 3ULEC 2I48A 4YB5A 1H45A 4E5ZA 2ZYKA 2YBAA 2QJEA 3RUMA 4POXA 1N04A 1IUDA 4J86A 4JXMA 4MBPA 3F11A 4DIGA 3C5MA 5C2VB 1PB7A 3I7LA 4LQ5A 2W7YA 4QHQA 2HXWA 1Y4TA 4A09B 3SCYA 3RN0D 4KFMB 3ODTA 5H14A 2OJYA 3GBAA 3Q28A 4O3CA 5DEXB 2H6NA 3PGFA 3KSXA 3VLVA 3SJLD 3SESA 1N84A 1BTJA 4H0WA 3P7IA 4E5ZB 4DZ1A 4GF8A 1B3HA 2VD2A 1B7ZA 4YMAA 3PSCB 3OW8A 1VE4A 2UYFA 4FHLA 5HQGA 1USYE 3G3GA 3MAMA 2HXCA 3UKRC 1H43A 3OSQA 1RI6A 4CI1A 3VDFA 3MP6A 4FECA 5K19A 2XX7A 2F34A 1A99A 1LAGE 4ISUA 2UVGA 1UQWA 3SKPA 4ESGA 3MPKA 2O9KA 1M5DA 3FJMA 4QFOA 1DTZA 4LG9A 3CFZA 2HKMA 1B9JA 4F22A 4M1VA 1LSTA 1P1NA 5IKBA 4G8NA 2X7QA 4PFUA 3N6TA 2O6AA 2AGYA 3S4UA 3FVGA 4YICA 4QQEA 2TRCB 1OMWB 2R6GE 3EI4A 4F2QA 2H99A 1A54A 2H14A 2DWHA 5FTHA 3TCFA 3PUXE 2NOOA 3H3GA 2XD3A 3SERA 4WEDA 4QFNA 1FQEA 1FQCA 3PXTD 3FUZA 4QSCA 3DP4A 3EU7A 4IO4A 4DDDA 3UP9A 1GGGA 4NF5B 3IOVA 3OO7A 2H6KA 5CMBA 5I57B 4A0AB 4YMBA 5B4WA 4CZXA 5H8SA 4K3ID 2DQVA 1SBPA 1SQYA 3TODA 1LFHA 4NF4A 2I6EA 5EMMB 5I2NA 4KYDA 4LQ2A 2YNNA 1SD3A 4FA9D 3IB0A 3EG6A 5JTYA 2Z2OA 2I4CA 1B58A 1B46A 3FJGA 4ZS9A 4GM9A 1VR5A 4J79A 5KZTA 3U1OA 1L0QA 3VVFA 4J78A 1B05A 3IB1A 2DXRA 3E13X 3IIWA 3OOAA 1D9VA 1EZ9A 1ERJA 5H8FA 2I0CA 4CI2A 2IA4A 3PMWA 1ZMGA 5C9ZB 4M4GA 3HCQA 2HQ0A 2Y7PA 1NNTA 5H1MA 1B4HA 5I84A 2YMUA 2IUVA 3MP1A 1UTHB 3EHSA 1VYHC 1A8EA 3TFLA 5I2NB 5EM2A 2V3TA 3C36A 3NVQA 5K2XA 3KZGA 3F3GA 3T93B 2A5TB 3QUFA 5AA3A 4G68C 3L6HA 4XEIC 3T9HB 3K1NA 3Q27A 1P1WA 4GL8A 4MLVA 3JZHA 4XYHA 3WAEA 5I2KA 4L9OA 1B52A 1URDA 3KN8A 2ALUA 1MXYA 2CO0A 1Y3PA 4EWRA 4TLLB 1EH3A 1D3KA 3SHFA 3S2VA 2D21A 2H13A 2RC9A 2NXOA 4BDNA 4G56B 5FKRA 3VE1B 1Y1MA 5HYNB 2P9LC 4FA1D 4IY5A 1Y3NA 4KQPA 1MY1A 1U2VC 4HCWA 1POY1 1US4A 5I59A 2I49A 3I7HA 4WEPA 2Q7QA 5HM4B 1D4NA 1N6FA 3FGBA 5HPQA 4QRJA 2BJJX 3FXUA 1N76A 4R74A 4JSNC 3EHTA 3MZ1A 1B7UA 5I5JA 1NL5A 4ZE8A 5CMMA 4MF3A 2IEEA 4GQ1A 2ZNTA 5A5XA 2OWTA 1MG1A 2PBWA 1GG2B 4AB5A 5TDHB 3LR1A 3DXMC 1DMBA 4GQBB 3N26A 3QK6A 1ZU0A 3CI8A 2QS3A 5ITPA 3MP8A 2XU7A 3ONMA 2D5WA 3PUVE 2P1SA 3KEIA 3I7NA 2Y7RA 3CRBA 3C35A 3M3KA 4JSVC 2ZYOA 5I59B 3MZKA 4IY6A 4R2BA 4AOWA 4IO2A 1B3LA 4JD2C 2QRYA 4HCYA 4BDQA 4PP0A 1FQDA 3JPXA 4GGAA 4EDPA 1MPCA 3VXBA 3OENA 2F7AA 4PC0A 4R7AB 5AA4A 3T96B 4L3HD 4I9DA 5J1DA 2PM7B 4PFYA 1XHMA 5JEIA 4BL0A 4GM3A 3MUQA 1DPPA 3VGZA 3GXAA 5FKSA 5DT6A 1UIUA 3TCGA 1N6EA 4F39A 1Q1KA 1F9BA 3DSMA 2XXRA 2D3IA 1OVBA 4JWOA 4H67A 4YB6A 4R73A 3IK6B 4A11A 1SYIA 4GD5A 3SDFA 1M5BA 3DXKC 2H9BA 3O9PA 3KBRA 4U23A 1NNKA 3K02A 1S7YA 3ZSFA 5AA2B 1PDAA 4FATA 2P2AA 1LBBA 4QF9A 3GREA 4ZOVA 3OKWA 1SYHA 3PD8A 2I3WA 2DSFA 3V5WB 3FD3A 4K3FA 3SFZA 2DVZA 1B4ZA 1YAEA 3KRWB 1XC1A 4J82A 1JNFA 1S9TA 3K1MA 4FJPA 3TKDA 5ISUA 4TZ4A 2XXPA 2E1SA 3SLED 5FA5B 2UVIA 3JRPA 2NVUB 3HHFA 5DVIA 1GV8A 4U2RA 4NF8A 1HSLA 4FEDA 1B40A 3PE7A 5ICQA 3IIYA 3UVKA 3UIFA 4NWDA 2DWIA 5AJAA 1SW2A 1UTBA 2QMXA 1P99A 1USYH 5TF2A 1OVTA 2AL4A 3TEPA 1J1NA 2YLNA 2RC7A 5CXBB 4QFPA 4A0BA 2GHBA 4Z7EA 1BP5A 2H4IA 2DP8A 3IX1A 4R9FA 3QSLA 3QAXA 1FTKA 1MDQA 4GMBA 4X48A 2I58A 4RXLA 1WVJA 4P0GA 2XXHA 2F35A 5IAIA 4CY3A 2B5MA 2QS1A 2OVRB 4OYVA 5H8NB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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