3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
2XD3A 3K1MA 3IR1A 3S2VA 2I58A 4H65A 1M5DA 4F18A 4IY5A 5A2Qg 2DWHA 1LAFE 5IGOA 4ZOYA 4A09A 3MJNA 2DWJA 2NOOA 2Y7PA 4H5IA 4I62A 4FE8A 5B4WA 1TWYA 3T93B 1B32A 1MXXA 3G3HA 1XIPA 4H5GA 5H8FA 4J8BA 3V7DB 3IB2A 1XHMA 5I59A 5AA2A 3NVNA 4ECFA 1SQJA 4XKRA 3UP9A 1MY1A 5SXMA 3CI8A 3OXNA 4QRJA 4X1BA 1NH7A 3M3KA 3IK6B 3I8CA 4YB7A 1QUIA 4FA5D 4NF6A 3CSGA 4GGCA 1D9YA 5AA2B 2I3TA 3H6UA 4QFKA 3PXSD 4QSCA 3Q28A 3I7KA 2ZYKA 4KCDA 3I7PA 4F2OA 4KD5A 4YMBA 4YZZA 3UKRC 4QFLA 3FV2A 4O3TB 1XS5A 2J56H 1EZOA 2G93A 1AH5A 3C35A 4U1ZA 4Z7EA 2YNNA 4J82A 3P7IA 5TU0A 4YKIA 3FASA 1M5CA 4ERZA 1LCTA 3PPNA 3EF7A 4PFUA 3W9VA 1S9TA 3SERA 4KFMB 5C9ZB 2VP1A 1M5FA 2I3VA 2XU7A 1JJUB 1UTBB 5K19A 2PMSA 3T9HB 4R9GA 1B5JA 5DVJA 1N7WA 2CO0C 1MPDA 5CYKB 5DYHA 1NNPA 1J1NA 2XYIA 4H6DA 4I9DA 5I58A 3G3FA 5EMLB 2I4CA 3ORVD 4Y7RA 4MFIA 3C9HA 1H44A 2XX8A 3OKWA 1LBCA 2HYEA 5L8DA 3SWSD 2Y7WA 1A55A 4QFOA 3TKDA 3OL2A 4U4SA 4GQ1A 2P9NC 4NWCA 4GWOA 4GQOA 4GQ2P 3FVOA 2B5NA 2I0CA 3M8UA 1MXWA 3VXCA 2F36A 1PGUA 5H8QA 3FV1A 5HM4B 4FAJA 1LFHA 4GLIA 3IJXB 2AH0A 1PB9A 5GMKn 1UTHB 2HEUA 3IIYA 5CXCA 1P22A 4IY6A 1SW5A 1WVJA 3SEYA 2I0RA 2QC5A 5IKBA 4L17A 1LB8A 3O28A 5HE3B 2RINA 1ANFA 5FXYA 4ZN4A 4I1DA 3QYTA 3LC8A 5AA2D 2AGXA 4R6HA 1XVXA 4IMMA 1PEVA 4ZOXA 4ND9A 2QJEA 2X7PA 4X1DA 3NVXA 4LQ5A 2KLFA 4IO6A 1QNIA 2V25A 3B6TA 4OENA 5TP9B 2G99A 2ESNA 5EMKB 4FEBA 3CFZA 2RCAA 5ITPA 1B3EA 1N76A 4F1YA 5CC2A 3TYHA 4FA1D 1GR2A 3KJ7A 2DSFA 4QHQA 4E54A 4IO5A 2AIXA 1YAEA 3GZGA 3K1NA 4OFOA 1IEJA 5I59B 3K6XA 3EI4A 2DWAA 4PSWB 3PU5A 2Q2CA 3G3KA 4PP0A 4HCWA 4XYHA 3ODTA 4AQ4A 1B46A 1NNKA 5L9MA 3KJTA 5TEFA 4R72A 3OELA 2HZLA 4H0WA 4RNSA 3SBPA 4A2MA 2Z2PA 3ODBA 1B1HA 2Z2NA 1MH4A 4A7JA 1Y3NA 4XKPA 3WAEA 3RLMD 2H3XA 1N6EA 1JEUA 5H8SA 2P2AA 1B6HA 3FD3A 3EN3A 3G3JA 1PBYB 4WEPA 3CSBA 2O9KA 1B9JA 3IOUA 2H47A 4YMAA 1MM7A 1Y9UA 3U8QA 3SN6B 1P1OA 5ICTA 1EZPA 1MQJA 3W15A 2PT1A 4KR5A 2CN3A 1LFGA 5KCJB 1S7YA 2HJ4A 5CYKA 5CBSA 2F7BA 1MDAH 2H9LA 4J78A 3LSFB 4OZ9A 3U1OA 3C34A 2CZLA 4ES0A 3JYRA 5I57A 3CVGA 4XIGQ 4CZXA 2YNOA 3OSQA 4CI2A 5IJ7E 2AQ5A 1B3GA 5TDHB 3I8EA 4GFRA 3JAMg 1NNTA 1USYE 2F35A 4NMYA 4FWWA 1DPPA 4ERQA 5CRYA 5TPAB 1N6FA 4KPTA 1DSNA 3PMVA 5L9OA 2B65A 1MXYA 2YLNA 4RY1A 3GLBA 4YAHX 4D0KA 1B3FA 5LOMA 3SBQA 3K01A 1H45A 4YKJA 4JT6C 3C5MA 4TLLB 4AB6A 2O84X 3MBPA 4ZOVA 3TTRA 3RNNA 2IAAA 4KHZE 5CMMA 2QMWA 3N0EA 2MTAH 3V83A 2M8CA 1QUJA 3CIJA 2HXCA 5IC7A 3OMBA 1MM6A 4J0XA 4EF2A 4ELQA 4A0BA 4PXWA 2ABHA 4IO4A 2O68A 4Q8RA 2CE9A 4AEZA 4DXBA 1K32A 3DP6A 3SJLD 3EI1A 3FJMA 3G3GA 1NL5A 2RC7A 1LFIA 1RYOA 3CG1A 4YKPA 5FHNA 3FVNA 4N07A 2GHAA 2O51A 1TXFA 3K4UA 5B7DA 1SQYA 1VYHC 2H9BA 3VVFA 1WDNA 3TTKA 2QS4A 1IQ7A 3PUXE 1POY1 5F7VA 2B5MA 3KN3A 4ZS9A 1MDP1 1TYQC 1MS7A 4EF1A 1FW0A 2I0SA 1OIBA 1Y3PA 3LBSA 1H3DA 3KGCA 1P99A 1Q47A 2ZXTA 5GXIA 3K2DA 1N84A 3PV0E 5CXBA 4JBZA 3N6TA 2THIA 3DSMA 5HPQA 4LG9A 4DIGA 2B4EA 1FQFA 4ESGA 5ICQA 3PXTD 3DXKC 3PVUB 2OWSA 4X60B 2XXXA 4EWRA 4OFLA 3K26A 5B70A 1N7XA 4PFTA 3BWSA 4OXVA 3JZJA 4LZ8A 4ZDMA 5DVFA 5K2YA 3EHUA 2A5TA 4POXA 1FQCA 3Q29A 3SKPA 3UORA 5CM6A 4GM9A 2OJTA 5FKQA 3V89B 4POWA 1URDA 2Y7IA 1N0TA 3DP8A 1QULA 2H25A 1NMUA 3G3IA 3IOVA 3ZS6A 4N13A 5H8NB 1AMFA 3S4UA 5DEXA 1ZBMA 3T9XB 3LSLA 5IAIA 4BL0A 4JD2C 4IO3A 2BCJB 3TUSA 4EQ7A 4A2LA 1LGBC 1D4NA 3C9CA 2DP8A 3DWLC 4JDFA 3MZ1A 4M1VA 4GGAA 4EUOA 1UIVA 3OEKA 1SI0A 2O1LA 4DXCA 5I56A 1SVXB 2HJBA 3MVZA 2HZKA 2ZNSA 1LAHE 2HXWA 3E3KA 3MP6A 5I5JA 3PPRA 1B7HA 2CNXA 2F7CA 1QJMA 2VGQA 4FJPA 3TTLA 2H68A 2R71A 2Q7QA 2XXPA 1LCFA 3AL8B 1JVYA 3EI3A 5EMJB 1P1NA 2ONSA 4U4XA 4YB5A 3VV5A 3L4MD 1Q35A 4XYIA 1HSEA 3TZAA 3EI1B 4MBPA 3EI2A 5EHMA 4GIZA 3S9NC 2QS1A 3VDFA 1N6DA 2F8DA 5CI5A 3BKIB 2X7QA 3EMHA 1GGGA 3K6WA 4Q0CA 4GXSB 3KG2A 5I2NB 5K2XA 4R9FA 4WKMA 3TDJA 1U4CA 3SDFA 1PI6A 1B52A 3KN8A 1N3WA 1R1NA 3EQ1A 3HO7A 3E9XA 4NWDA 2AGLA 4UI9R 4JT5C 5H8QB 4FA4D 1TT1A 3F11A 4MK0B 4A08B 1I6BA 2ZYMA 5FQDA 2E0SA 5TP9A 3A3CA 4NE4A 4KYDA 1I69A 2CN2A 4ERYA 5H8HB 5FKSA 1ZU0A 2I6EA 2FYIA 2G29A 3SLED 4HS7A 4RYAA 2XD2A 4IO2A 3I2NA 2ZYOA 4R6KA 3H4ZA 1OLAA 2XXWA 3HV1A 5EAMA 3PD9A 2QMXA 4F29A 4QF9A 1IITA 2PBWA 5FHMA 3C33A 3JRPA 1H76A 3KOSA 3ONMA 1WODA 4EDPA 4L1QD 4FB1D 4Q5TA 3A3UA 3JZNA 3MZLA 1SW4A 2V3TA 2XXYA 2OCUA 4MLVA 3S9LC 3O6IA 3VVEA 2AGWA 1QKBA 4LG8A 1URGA 1FTJA 4XKQA 3MKQA 2P9KC 2P9LC 2OK6A 4R7AB 2O1MA 2QL3A 4LA9A 1YPNA 4GF8A 2XX9A 4K3JB 1MY4A 4P11A 4F19A 3T22A 4ONYA 1EU8A 3SESA 5I56B 4THIA 4YICA 3OO6A 1B7UA 1LAXA 3GREA 4F3SA 2ZMBA 3C31A 3TTMA 4DZ1A 3C75H 1Z7ME 3IJ1A 2I3WA 1US5A 2PX1A 4N14A 3BFTA 1M5EA 2V3UA 1O63A 3KSXA 4ESWA 5EMMB 1XC1A 3MUQA 2D3IA 2NXOA 4BDOA 1B0HA 4NF8A 2NWJA 5HE0B 5I5MA 3T96B 4JSXC 2V84A 4F1UA 3H6TA 2DWIA 2AGYA 3UVKA 3IB1A 3FJ7A 3OO8A 3RN0D 2HESX 1FTLA 1NFTA 1L0QA 3GXAA 3KEIA 3UK4A 3A0FA 4M4GA 4DCYA 1XHYA 5H14A 4A0AA 4LGNA 4G8HA 5I84A 5TPAA 4NTLA 3SMRA 1AOVA 3HFQA 3JZHA 3EHTA 5GXHA 3IAZA 4NF5A 2OBGA 3R7XA 4QSEA 4FIMA 4O3CA 4DLDA 5GSAA 2UVIA 4PFYA 4U22A 1URSA 1R6ZA 3TQLA 1DTGA 4OEVA 3RUMA 3ILUB 1MH3A 2Z22A 4OWDA 4LZ7A 3NVQA 5JEIA 4RA1A 2RCBA 4LUBA 1LSTA 3VGZA 3RFGA 4X9TA 2CE8A 1OMPA 1SHYB 3E4RA 1SI1A 2HCAA 4NF8B 3L6HA 1FCKA 4FORA 3CFVA 3MP1A 3UVOA 3T9VA 1SQ9A 5I2KB 3AXFA 3FGSA 2AH1A 4PSXB 4GD5A 3SCYA 1JW5A 3CG3A 3FXQA 4G68A 3IO6A 2Q9TA 5FHOA 4R2FA 2Y7RA 1B40A 3CRBA 3TQWA 1P1QA 3RSEC 1R9QA 2H9MA 2Z8FA 1Y4TA 3TELA 4F3BA 3EG6A 4PBZA 2Z8EA 4NF5B 2AYSA 4GRKA 2VD2A 1H43A 2IUQA 1Y4CA 3I7OA 3SEXA 4GGDA 4L3HD 4G4PA 2IWKA 3UR4A 4OYVA 1BKAA 5JWZA 4P0GA 1QVSA 2UVHA 4GQBB 3KRWB 3SVWD 4NF6B 3RPWA 3HSTA 4CI8A 3GBAA 2H99A 2DXRA 2DXYA 3FVKA 4U23A 4A11B 2DE2A 3IL1B 3O6GA 3EU7A 3MPKA 5EM2A 1OQGA 1L5TA 3I3VA 4F3PA 3PXWD 3VVDA 1Y1ZA 3HCQA 3MP8A 4J87A 1MQGA 3PMWA 3RQTA 4F31B 1B4HA 5AFU3 4CI3A 3IB0A 1LAGE 2H6QA 3E0CA 1SD3A 2Q2AA 3RN1D 1A40A 2XHDA 4IB2A 4HW8A 4E54B 1ZJLA 3A09A 3ECRA 2F34A 1MPBA 3MVWA 2IA4A 1S50A 3T9UA 4O1QD 3Q25A 3BFUA 1Y1MA 5CXBB 4KI0E 1LBBA 3HN0A 5I58B 1MRPA 3UA8A 3EI4B 4IA9A 1MY3A 4TOZA 3AL9A 1IXCA 1GP2B 4FECA 3F3PA 2PM9A 4I8CA 3USDA 4DDDA 4DE8A 4TZ4A 3G7WA 5TEEA 4JSDA 5BUUA 3SEUA 5AE4A 4C0RA 2XXUA 4QRZA 3DP4A 4YU0A 1JNFA 3K00A 3PSCB 2RC9A 4MF3A 1CB6A 4RPNA 4AOWA 4A0AB 2V3QA 4ZECA 3K27A 3AH8B 1SBPA 4NEDA 5KDTA 1OLZA 4PFWA 3AFCA 4U7AA 1DTZA 1EH3A 4ELOA 4X63B 4Z0IA 3MMYA 2Z23A 1MXVA 3RT8A 2NVUB 1Z7NE 4YVDA 1DOTA 4ISUA 1A99A 4YB6A 4L9OA 4C1TA 1OVBA 5M2VA 4OWRA 2I3SA 3S9MC 3FGBA 5IJ8E 4KFQA 2Q8JA 5KCJA 5CBRA 2UXAA 4EXKA 4L3GD 1FQDA 2DE3A 4FATA 1B3LA 3KBRA 3IORA 2H98A 2X26A 4JXMA 1XKSA 3C99A 4GXAA 3K6VA 1FWXA 3RTWB 4F39A 3ZSFA 1A54A 4MH5A 3EI2B 3PUVE 2QS2A 2Y84A 5CMCA 4OEUA 4A11A 4EXLA 3I5OA 4C1UA 3JZGA 3DLNA 2F6GA 1B0LA 3H6VA 3PD8A 5F1QA 3SEVA 4G8MA 1PBPA 4E5ZB 3MC2A 5AA4B 4Z8LA 2BJJX 4O3UB 4GMBA 5EHSA 2XL2A 1IXGA 1FQBA 4F2QA 4R2BA 3B6WA 1PEBA 1VSOA 1BTJA 3OENA 4A0BB 5I57B 2XXTA 2A5TB 3PMXA 3K02A 2XXRA 3PVWB 4H8JA 1K8KC 4QL1A 3H6WA 4HTGA 3OL2B 5ITOA 3N0DA 4BDQA 3FXUA 3PPPA 4WXJA 4ZEFA 2Q88A 2OLBA 3FIRA 1I6QA 3IIWA 1IUDA 3O9PA 2OK4A 3JPXA 2RKMA 4KYSA 4JB7A 2P9UC 3ZKLA 3J81g 1YTVA 2P1SA 4U1OA 2PVUA 4RXLA 4OVJA 4U21A 1VR5A 2IEEA 4FAND 2YPNA 3U93A 5FKTA 1GXRA 2REJA 3GBBA 4IGTA 3OO9A 1P1UA 5H1MA 1SDXA 1S4UX 1MG3A 5AMSA 4G77A 3I7HA 3MVYA 1MY0A 5EAPA 4J0WA 3EPEA 2TRCB 4JWYA 3C36A 5EALA 4ZZAA 1OLCA 3O29A 3B7FA 4U1EI 2DS9A 2AL5A 2EBSA 4H5JA 1PBQA 1YCJA 3PUWE 4G68B 3UIFA 3JV9A 3IKOA 4BDLA 4E0WA 4X61B 2HAUA 1SYHA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2XD3 A;  3K1M A;  3IR1 A;  3S2V A;  2I58 A;  4H65 A;  1M5D A;  4F18 A;  4IY5 A;  5A2Q g;  2DWH A;  1LAF E;  5IGO A;  4ZOY A;  4A09 A;  3MJN A;  2DWJ A;  2NOO A;  2Y7P A;  4H5I A;  4I62 A;  4FE8 A;  5B4W A;  1TWY A;  3T93 B;  1B32 A;  1MXX A;  3G3H A;  1XIP A;  4H5G A;  5H8F A;  4J8B A;  3V7D B;  3IB2 A;  1XHM A;  5I59 A;  5AA2 A;  3NVN A;  4ECF A;  1SQJ A;  4XKR A;  3UP9 A;  1MY1 A;  5SXM A;  3CI8 A;  3OXN A;  4QRJ A;  4X1B A;  1NH7 A;  3M3K A;  3IK6 B;  3I8C A;  4YB7 A;  1QUI A;  4FA5 D;  4NF6 A;  3CSG A;  4GGC A;  1D9Y A;  5AA2 B;  2I3T A;  3H6U A;  4QFK A;  3PXS D;  4QSC A;  3Q28 A;  3I7K A;  2ZYK A;  4KCD A;  3I7P A;  4F2O A;  4KD5 A;  4YMB A;  4YZZ A;  3UKR C;  4QFL A;  3FV2 A;  4O3T B;  1XS5 A;  2J56 H;  1EZO A;  2G93 A;  1AH5 A;  3C35 A;  4U1Z A;  4Z7E A;  2YNN A;  4J82 A;  3P7I A;  5TU0 A;  4YKI A;  3FAS A;  1M5C A;  4ERZ A;  1LCT A;  3PPN A;  3EF7 A;  4PFU A;  3W9V A;  1S9T A;  3SER A;  4KFM B;  5C9Z B;  2VP1 A;  1M5F A;  2I3V A;  2XU7 A;  1JJU B;  1UTB B;  5K19 A;  2PMS A;  3T9H B; 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