3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
1L5TA 4H5JA 1D9VA 3MVZA 4QFPA 4YKPA 3MPKA 3IAZA 3CVGA 2PT1A 4LATA 1S7YA 1D4NA 4BDOA 3OKTA 4J81A 4TQUQ 5I2KA 4BDQA 1WDNA 2F7AA 2E1SA 5ICTA 5DT6A 3TUSA 2XXYA 4G68A 5KCJB 4NF4B 1NFTA 2XXIA 4ZEDA 1TXFA 3TTKA 5SXMA 2Q2CA 4QRJA 4ESWA 3UVMA 3OKYA 3KJ7A 4LZ5A 3K27A 2DSFA 1DTGA 3C9HA 2HEUA 2Z22A 3PXTD 3PPOA 3P7IA 4G4PA 2Z8FA 2VD2A 2XX9A 4QFKA 2XL3A 1N3WA 3L6HA 4OEUA 3PPQA 2OJYA 3VVFA 2F6GA 1ZU0A 5F7VA 1B4ZA 2I3WA 5KDTB 3TEPA 3PPPA 1LAFE 3F3PA 3KSJA 4H5IA 2A5SA 4I79A 2F97A 3S9LC 5EMJB 4RPNA 3N26A 1SI0A 3HHFA 2P9PC 4E5ZB 1FQAA 1II5A 4G56B 3RN1D 4WKMA 1NKXA 3CFLA 2YBAA 3UORA 1EZPA 2VGQA 1B1XA 1YCJA 2AYSA 3IORA 4IO3A 3OO8A 2QMWA 1MPCA 3UN6A 3N6TA 2XXXA 5A2Qg 3SJLD 4A09B 5DTBA 3C31A 1QW0A 2I4BA 2W7YA 2Z23A 2ONKE 3R7XA 2I0TA 1SW4A 5DVJA 3AL8A 2F7CA 4F29A 3C9CA 3OO6A 3CR9A 1YTVA 2Q88A 3ONMA 4UA8A 4GXSB 4KCCA 2XXVA 4G68B 5H8FB 3SXTD 3KJTA 1WVJA 2REGA 3OKYB 4U1OA 1FCKA 3PGFA 2HAVA 3HV1A 4YB7A 5CXBA 3S9MC 4FIMA 1Q35A 1N0TA 5CBRA 2XXPA 1OQHA 4ZOVA 3T22A 3IB0A 4R72A 3CFZA 3T9VA 2HKMA 4QT8A 2I0RA 5ICQA 3MMYA 1O63A 5JK4A 3A09A 4ELOA 4CI2A 2O68A 1P1WA 4J79A 2Z2NA 2DYXA 5K19A 1VYHC 3T66A 3AFCA 3C99A 3IOTA 2ZNSA 2ABHA 2RC8A 4OFJA 5IKBA 4FATA 2PMSA 5AA2A 4J73A 3K00A 4C1TA 4FB1D 1O64A 3IK6B 4RA1A 3FVNA 4AB5A 3UVNA 4A2MA 4ZECA 3VGZA 1TWYA 3MVYA 1NR0A 5I5IA 2DVCA 5CI5A 2XHDA 1MY4A 3MC2A 3FVKA 4CZYA 2I4CA 4OWRA 4O3TB 2YNPA 3NVQA 3SHFA 1UTBA 3FVGA 3MP1A 3Q27A 1A54A 4F3PA 3OSRA 4Z8LA 2OCUA 5FKRA 4KCDA 3MXXA 3AL8B 3VH0A 3OMBA 3HO7A 5HE1B 2IAAA 2ZXTA 2QC5A 3PSLA 3FJMA 4EDPA 5C2WB 1P1QA 3BG0A 3OXNA 4IO2A 3G3IA 3VA6A 2I6EA 1Y20A 3SEUA 3V7DB 4ZS9A 5IT9g 4ZEKA 5CXBB 1YAEA 3CG3A 4O3BA 3I7PA 3MWBA 2DS9A 3H6UA 3RGYA 5ISUA 4ES0A 4NF6A 3TKDA 3P4FA 1JQFA 2J57G 2ZYMA 1Z7NE 3K6VA 3T9XB 4KYSA 4ELPA 4NF8A 2DE2A 3K2DA 2O7UA 4CI3A 3RLMD 3KSXA 2HXCA 1RKMA 1VFDA 2Y7WA 3N94A 4ELQA 4M4GA 4NWCA 5AA2B 2XU7A 3U4YA 1A7LA 1MG3A 3G7WA 5EYFA 2IUQA 2H5YA 3EHUA 3LSWA 2CE8A 4I62A 3OL2A 1JMZB 2HESX 4QL1A 3RRMC 4R2BA 1Z7ME 2GH9A 3KOSA 3JZJA 1B5HA 1JW4A 4OESA 1UTBB 2OIZA 1RYOA 5TP9A 4EUOA 3TMGA 3IJXB 2Y84A 3V89B 1U2VC 2H4IA 4KYEA 3FGSA 5JTYA 1XOCA 4GGCA 4U22A 1ZJLA 3VE1B 1MQDA 3THIA 5EMMB 4OFLA 4LONB 2H9MA 1R9LA 3FJ7A 5H14A 4XKQA 2V84A 3EI4A 2X7QA 4EXLA 2YPNA 2B65A 2I58A 1FQCA 3UVKA 4ZZAA 1SDXA 4U1ZA 3H6VA 5DVFA 1MH4A 1N6FA 3BWSA 2XXRA 3VXCA 2B5NA 4A11A 5L9OA 4NF8B 4C1UA 1B0HA 1XHYA 1XKSA 1H43A 1Y1ZA 2G9AA 5JEIA 3AXFA 2F35A 4H5FA 1FTKA 1Y3PA 2ZYKA 4KI0E 3TQWA 3SEXA 2IEEA 5I5JA 5I84A 4YB6A 4JB7A 1I6QA 1LAHE 4MH5A 4X9TA 3B7DA 3IJ0A 1MRPA 5EAMA 3TCHA 3K1NA 1NH7A 2M8CA 5GSAA 4LVQA 4F1YA 2YMUA 3EI1B 5AJAA 3UKRC 2ZYOA 5TP9B 3T9UA 2I0CA 4ZOYA 3T96B 1MY1A 1QUKA 3KZGA 2PM7B 4GM3A 1GGGA 4O3CA 4XXUA 4X1BA 5JTYB 4GGAA 3UIFA 3OKWA 3H06B 3RQTA 5FKTA 1F9BA 1S50A 3VXBA 5IAIA 2UZYB 3EF7A 4J86A 1FQFA 3GREA 5FHOA 3L4MD 2AGZA 3SMRA 2H9LA 2J55H 3C32A 3FIRA 2QMXA 2UVGA 3W9VA 3EI4B 3C4MA 2XYIA 3PE7A 2HCAA 5DYHA 2DE3A 4OTEA 2OK6A 3F11A 2X26A 2XD2A 2VP1A 1GV8A 2UYFA 3D4GA 5FHMA 4QQEA 5HE3B 4J77A 4OZUA 1MM6A 3VFJA 3C36A 3U1OA 4IO4A 3K6UA 4OEVA 4LUBA 4GFRA 1NH8A 4K3ID 3IOVA 4PFWA 1MY3A 3MBPA 3C34A 3DXKC 3VDFA 3MPLA 2NOOA 4YB5A 1OVTA 1L0QA 3RUMA 2QJEA 4MLVA 3G3JA 4R6HA 4H8IA 3TDJA 4KPTA 3QYTA 2ANJA 2AGXA 5TU0A 3MP8A 3UGWA 5H8QB 3AH8B 1M5CA 4XIGQ 2G99A 3M3LA 4I1DA 4MLQA 2PT2A 4ZEBA 1SBPA 1JVXA 3E13X 1OMPA 3SN6B 2P1SA 3OD7A 3CRBA 4JD2C 3ULEC 1TFAA 3SEYA 4CY1A 1B3HA 4GQOA 2X7PA 3FRXA 1ELJA 4O3UB 5BUUA 2OLBA 2DVZA 3RY3A 1OLAA 2V3UA 3G3KA 3G3HA 1DOTA 1DMBA 3TTMA 2YLNA 1P1OA 1KWHA 1QUJA 4QFLA 5HE0B 3CFXA 2ZNTA 3LSXA 4DCYA 1GOTB 4KFQA 2H14A 1B6HA 1FTLA 4L9OA 1JETA 4A7JA 4CY2A 5M2VA 4UI9R 1VFEA 3A0FA 3RN0D 2O84X 4OZ9A 4XYIA 2XD3A 4YKKA 4K3FA 3ZKLA 4PP0A 3RFHA 4N6PA 4EQBA 3DP8A 1S4UX 3CSBA 4PNKB 2P9LC 4H65A 3IOWA 1JOFA 4X1DA 2XL2A 4Z7EA 3SVWD 3K6XA 5CMMA 2GC4A 3TZAA 4HS7A 2RC7A 3NVXA 1MDQA 4H6DA 5H1MA 3E4RA 4L1QD 1AH5A 1IIWA 3PPRA 3VLUA 3I7NA 4ZOXA 1R1NA 3I3VA 4JBZA 3PUZE 2UVHA 3HN0A 1PC3A 1PGUA 3WAEA 3EI3A 3IB2A 5FXYA 4OWDA 3VLWA 3I8EA 5K1CC 1ZBMA 5B7DA 3SBPA 4J0WA 3UR4A 4PFTA 2ZYNA 3IIWA 3DSMA 3MZ1A 2CNXA 3IIYA 5HYNB 4OFOA 3IJCA 3IKOA 2HZKA 3S2VA 4HCYA 3OENA 2DOJA 1NNPA 3PMVA 5THAA 4F3SA 3V83A 3CFVA 2Q89A 1UIVA 3MAMA 1NNTA 4YMBA 1H45A 4Y5RD 3R26A 3FGBA 4FECA 2V93A 1PEBA 5AA1A 3CIJA 3DP4A 1XVXA 2HXWA 4RK2A 3TCGA 1NMUA 5H17A 3EG6A 3GLBA 4Q8RA 3SBRA 4BDNA 4TOZA 4GIZA 1R6ZA 3GFCA 3IX1A 3QUJA 3OW8A 5C2VB 1ZLQA 3MUQA 3K1MA 2AGYA 2OVQB 2GFEA 1BTJA 4NF5A 5GXHA 4KHZE 1POTA 3EHTA 3IO4A 3S9NC 3IB1A 5TEEA 1A55A 3OO9A 5I2KB 2O7IA 3KN3A 3UP9A 3KRWB 3I2NA 2DXRA 1NL5A 3C75H 4PBZA 3MVXA 4MFIA 4LGNA 5H8NA 3K6WA 3RPWA 3UA8A 1OQGA 1FW0A 4KYDA 1Y3QA 2GC7A 3SEVA 3EI3B 1FTJA 4LQ2A 3BG1A 1B7HA 1B3GA 3EPEA 3JZNA 4X61B 4EXKA 3SLED 4ELRA 1B46A 3HPIA 2UXAA 4N14A 3GBAA 4P11A 1MG1A 1N7WA 3ILUB 3K1PA 1VE4A 1US5A 1XS5A 2YB8B 4IA9A 2Y7RA 1A8EA 1BIYA 4KD5A 3N0DA 1VSOA 3I7KA 3N6UA 4GMBA 2P9SC 1MQIA 4GQ1A 3SBQA 1MY0A 1RI6A 3O9PA 4IGTA 2P9UC 3QAXA 2AGWA 3L4OD 4ND9A 4GM9A 4BUJC 1YFQA 4NSXA 4THIA 1IXIA 1QJMA 1H76A 5JWZA 3O6HA 4U4SA 2BCJB 1ZTYA 1OLZA 5EM2A 3FASA 4KFMB 4E0WA 5BWJA 4WEDA 3SWSD 4GZ8A 3FV1A 3ECRA 1MS7A 3OELA 2YNOA 4OYVA 1MH3A 1B40A 4G8MA 1I69A 3SEWA 3IO6A 3BFTA 5FQDA 5B4WA 2O9KA 4PC0A 3N5LA 5K2XA 5CRYA 4R6KA 1B7UA 3ZS6A 3B6WA 5AE4A 1MPDA 3CFSB 3U72A 4M1VA 3N0EA 1MDAH 3IR1A 3VVEA 3TYHA 3B7FA 1FTOA 2HJ4A 1FTMA 4FE8A 5GXIA 1Q1KA 1OLCA 3PMWA 1JW5A 3I7LA 2O69A 2A5TA 5LOMA 4ZN4A 5IJ7E 2Q8JA 3V8XB 3MKSB 1B51A 1XC1A 5I57A 1IXGA 4BDLA 3M8UA 4LA9A 4O45A 1AMFA 2DXYA 3O29A 4J0XA 3O6GA 2CZLA 1MXVA 4F1VA 4DDDA 2TRCB 3PSCB 5KZTA 4E0XA 2H68A 3K4UA 3AL9A 2G93A 2PVUA 1URGA 1N3XA 3H3GA 1J1NA 4BLAA 2AH0A 5CYKA 2YNNA 3W15C 4WEPA 3PVWB 1QVSA 5EM2B 2DWJA 4FAND 3EU7A 3G3GA 2XXUA 4FEBA 3FD3A 4XEIC 2CMOA 4EWRA 5HM4B 1M5DA 4PQJA 1JEVA 3ZSFA 3GXAA 4U2RA 3HHGA 1FQDA 2BBKH 1GP2B 4Q5TA 4Z0IA 1SVXB 4I9DA 3KRXB 4IB2A 2H25A 1OVBA 1NEXB 4HDJA 4IO6A 4X63B 2EBSA 1XIPA 2MTAH 4DIGA 2I0BA 4OETA 2VD3A 1TYQC 4A0BA 3JZGA 4ZEIA 1A0RB 3U8QA 3Q26A 4YMAA 3HCQA 3F3FA 3FXQA 4U7AA 4NF6B 5IJ8E 5A5XA 1B1HA 3RNNA 3H7MA 5I57B 4XYHA 3KEIA 3B6QA 4OXVA 3B6TA 3Q28A 3ZWLB 2GNQA 2Z8EA 3RSEC 2DQVA 3FZVA 2FYIA 4QHQA 4AB6A 2Q9TA 3PMXA 5CMBA 5IC7A 1IUDA 4PSXB 2OJTA 4GQ2P 4AEZA 4J8BA 1LCFA 4PXWA 5FLXg 2ZNUA 5ITOA 5ELVA 4DXCA 3OL2B 2O1LA 4EQ7A 1B9XA 4ISUA 2PBIB 3FATA 1SD3A 1TT1A 3SETA 2Z2PA 4RXLA 1CE2A 2CO0C 4YU0A 4A0AA 3KN8A 5AA3A 1Q47A 3BKIB 2V25A 1B9JA 4O1QD 4F2OA 4E54A 4P0GA 2IWKA 1MY2A 2RC9A 1JVYA 1FWXA 4QSDA 2GRVA 4OVJA 4LQ5A 2D3IA 4DLDA 5EARA 3TCFA 4F1UA 4U4XA 5FHNA 2G29A 4L3HD 1M5FA 2UVJA 1N84A 3OO7A 4D0KA 2HYEA 3RTWB 4GGDA 1N7XA 5CXCA 5FA5B 2H98A 2H6KA 5AA2D 3UVOA 1N6DA 5J1DA 1Y4CA 2P9IC 4R73A 2XXWA 3JPXA 2QS2A 4IGRA 4WXJA 4YVDA 5A5XB 2QRYA 4GXAA 3V5AA 3PUYE 5EHSA 4A11B 2OWTA 3UK4A 5CM6A 1P99A 2QS3A 1I6AA 4YKIA 2NUVA 4AQ4A 1B2HA 1B3FA 1UIUA 1OIBA 5K2YA 4PFYA 2V3TA 1P1NA 3CSGA 3Q29A 2UYEA 4OHNA 3E9XA 2AH1A 1NNKA 1YPNA 3KBRA 1LFHA 2OK2A 3JV9A 4ERQA 4OQOA 4ERYA 4NWDA 1MXZA 4P0IA 4R9GA 4R9FA 1QULA 1SW1A 5C9ZB 3RN8A 4BDMA 2OWSA 1SW5A 4AOWA 1IXHA 1N76A 2O6AA 3PD9A 4DXBA 3MJNA 5DEXA 1K32A 5KCJA 4NF4A 2P9NC 3M3KA 2AL5A 2PM6B 3JAMg 4A0AB 1GVCA 3VVDA 4E54B 3TAJA 2CE9A 1LB9A 4F3BA 1JW1A 2HFBA 4RYAA 3MZ9A 3RMZD 2Z2OA 5CMKA 2KLFA 3W15A 1PI6A 1B5IA 2F34A 1VR5A 2AIXA 3DELB 1SQYA 1CB6A 1IITA 3TELA 4K3JB 3QUFA 3FV2A 1QUIA 5I5MA 5HQGA 4F39A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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