3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
source organism Escherichia coli
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
1IXIA 1LBBA 3BWSA 3VLUA 3SBQA 4ESGA 5CBSA 3U94A 5CYKA 3C9CA 5IT9g 4KHZE 4J73A 2F6PA 3OKYB 5DVJA 4KYEA 3SESA 3CFXA 2DOJA 4XIGQ 3IB0A 3BBRA 3IJ1A 1N3WA 3RUMA 3IR1A 5HBCA 3I8CA 3KOTA 2HCAA 4GMBA 4CC9A 2IWFA 3UVNA 2G29A 2BJJX 4U21A 2G99A 4AB5A 2UYEA 4O3CA 4EXKA 5B70A 3O6GA 4XKPA 3S9NC 2GHAA 1NEXB 1TT1A 3D4GA 4YKJA 2DQVA 2HYEA 3K1PA 1Y9UA 3MZBA 2PX1A 1B5IA 4KYDA 1B1HA 4C1TA 4YKKA 2P1SA 3MC2A 3MKQA 3HO7A 3JRPA 3AL8B 1LAGE 4OMBA 5K2XA 4YZZA 3E0CA 5IAIA 3EN3A 4DLDA 2D5WA 2BBKH 2F97A 2GC7A 3GREA 2QL3A 2AH0A 3OO9A 1O64A 4LZ5A 2F7BA 4GRKA 5CMCA 3VV5A 3SKPA 4EF2A 2CMOA 3SLED 3RY3A 3EWEA 1ZIUA 3D4CA 3OL2B 4K3ID 1NNPA 3DP8A 4ZOYA 2OJTA 2AGZA 3MJNA 2HQ0A 3MQ9A 5EHSA 3IKOA 1ZMGA 4H6DA 4OFJA 1MG1A 2TRCB 3EHUA 2H6NA 3IOUA 1LCFA 4X1DA 3FXQA 5H8NA 3K27A 1Q1KA 2R6GE 4U23A 2VHAA 1ZJLA 1XIPA 2DVZA 4TOZA 4JT5C 4IO6A 2H25A 1DTGA 5KDTA 2HXWA 4X63B 4A2MA 1IXHA 4GQBB 5ICQA 3W9VA 4JXIA 4IMMA 4MBPA 1MQHA 3IIYA 4OEUA 3AL9A 3M3LA 1P1UA 2A5TA 3TODA 1O63A 5EAMA 1B58A 4ZECA 2OBGA 4XKQA 4ERYA 3FRXA 1JETA 3TYHA 4ELPA 2H68A 4DXCA 1BIYA 1AL3A 1MXXA 3CSBA 3TELA 1US5A 1IQ7A 4F1UA 3W9WA 5F7VA 1UTHA 2PVUA 2P9LC 1PBPA 1B40A 1B4HA 4P11A 4A2LA 1QW0A 1S7YA 1N0TA 3O28A 5AFU3 4FE8A 4CY2A 4ES0A 3OO6A 5FHMA 1VFEA 1N3XA 1D4NA 1N6EA 4KFMB 3AH8B 1MH4A 5DTBA 3A3CA 4H5FA 1MM6A 4A0BB 3TUSA 1K32A 4F29A 4EUOA 4A0AA 3N94A 4ZEDA 4RK2A 3MKSB 3ZKLA 3LR1A 3PPPA 4GFRA 4PP0A 1IZ1A 4QL1A 1MH3A 3FJGA 4KFQA 3C33A 2CE8A 3FJMA 3O66A 1MY4A 1MQIA 3PGFA 3SMRA 1Y4CA 4J77A 3RLFE 5A5XB 3S2VA 4LG8A 1HSLA 2GHBA 4JB7A 1GR2A 5C9ZB 4FEBA 1JW1A 4LGNA 3IJCA 4HCYA 4P0IA 4XKRA 5L9SA 3MW0A 4ZE9A 3VFJA 1MRPA 1FTKA 3K6VA 2Q88A 4M4GA 4RNSA 1TWYA 4RJZA 4XEIC 3L4MD 4A09B 2QC5A 2IURA 3KRWB 1NR0A 1B51A 4G68B 1M5BA 3FJ7A 5ITPA 3UVLA 2RKMA 3FXRA 3PPRA 3TQLA 1USYH 2FNCA 4A08B 4Z8LA 5FLXg 3PU5A 4KD5A 2ZNUA 1L0QA 2P9UC 1B9YA 3GBBA 3UK4A 5H1MA 4IGTA 3IOTA 2V3TA 4DDDA 2XX8A 4QFPA 4GD5A 3PPOA 5TP9B 1OMWB 4N14A 1R9LA 3CFZA 4DXBA 4GGAA 3TCHA 2HESX 4HCWA 3MBPA 4EXLA 1MY0A 3PV0E 4E0WA 5JTYA 1Q47A 1DPPA 2DYXA 4GIZA 3I6VA 1MM7A 4M1VA 3OKWA 4YVDA 2B3BA 1MDAH 2PM9B 4R2BA 4R6KA 5H8FA 1ZTYA 4I79A 2XX7A 2H9LA 3I7PA 2O9KA 1AOVA 3EF7A 3DELB 4QFLA 4FAVD 1QKBA 4G68C 4AQ4A 4F3PA 2Z2PA 3IOWA 3I7LA 2OCUA 3EPEA 1B2HA 3CFSB 2F7AA 3OKYA 3AFCA 1R5MA 3KEIA 2P2AA 4NWDA 4JWYA 4HDJA 4CZYA 3TPAA 1AIVA 1PB9A 3FVOA 3I7NA 4OFLA 2XXUA 2DSFA 3TTRA 2ZNSA 2I49A 2B5NA 5HE1B 1FQBA 3HSTA 4NF5B 3F3PA 4YICA 3OO7A 5DEXB 4J87A 5H8SA 3GBAA 3TTMA 4YB5A 4E0XA 4KR5A 3T96B 3LUYA 2AIXA 4OVJA 5TU0A 3AL8A 1YTVA 3IOVA 3K4UA 1Q35A 4OZ9A 3IK6B 4MK0B 3SHFA 2Y7KA 1B3GA 5KZTA 3TCGA 1B7HA 2O84X 4F3BA 2ANJA 3O9PA 1SW2A 1A7LA 1Y3QA 5CMKA 4OENA 1A40A 2NUVA 4U2RA 3OO8A 3PUYE 1DPEA 2UVIA 1Y3PA 2H4IA 4PETA 2P9KC 4CI3A 4TZ4A 3LSWA 1R6ZA 3OSQA 1LCTA 3EI2A 2Q8JA 3K26A 4R75A 2QS4A 5EAPA 1URGA 5GXHA 1XVYA 3KOSA 3JAMg 1SVXB 1NKXA 3CI8A 4U4XA 4KCCA 2OK6A 4OESA 1MXWA 3OKTA 2I6EA 4PFWA 4GQ1A 1SQYA 4CY5A 1MPDA 1OLCA 3LSFB 1A0RB 4RXLA 2I0CA 2P9NC 4IO3A 4LG9A 2O1MA 3W15C 3K02A 1P1WA 2DE4A 3L6GA 3DP6A 3C75H 4FA9D 2H9BA 3PVUB 5DVIA 1MPBA 3PMXA 3Q28A 3EI4B 1YPNA 3RMZD 5I5IA 3R26A 3DM0A 4FORA 4L1QD 2F8DA 5I5MA 4F1VA 1OIBA 3IJ0A 5FTIA 4R2FA 4NF4B 4LQ2A 3I3VA 1B5JA 3CR9A 4KCDA 5GMKn 3I89A 4H8IA 4LONB 3EU7A 4A0BA 5M2VA 1MPCA 1MXVA 2J57G 3CG3A 3SERA 3RNNA 3EI1B 3G3HA 3JZNA 1NH8A 1ZBMA 3JV9A 4GLIA 3RPWA 2F5XA 3RN0D 2OLBA 4F2OA 1EZPA 4BDLA 2ZYKA 2Z22A 1JEUA 2XXRA 4CI1A 3JPXA 3H3GA 3HPIA 4QFOA 1Y3NA 3RN8A 5HE3B 4Y7RA 4F2QA 3MZ1A 2ZYMA 3B7FA 1JEVA 2H9PA 1IXGA 1PB8A 3H7MA 2AH1A 5A5XA 3Q27A 4ZS9A 4I8CA 3EHSA 3DLNA 4H5GA 4PBZA 2XXHA 1B7ZA 5H8HB 4G56B 5IKBA 3C5MA 3UR4A 4QT8A 3V9FA 1RYXA 2H98A 2NOOA 2B5MA 3ODBA 3FXUA 3PUWE 4QSDA 3C99A 2Z8DA 3FVNA 2IUVA 2HKRA 3HHFA 4U1EI 1B0HA 5GXIA 3QAXA 4G68A 3ZWLB 1S9TA 1POTA 1VE4A 1TBGA 1I6QA 1SYIA 4A08A 3EMHA 3WAFA 2V93A 4RY1A 1SQ9A 5EALA 3TTNA 3UVMA 1II5A 3QK6A 4J8BA 2IWKA 3PXSD 3TKDA 3JB9L 3QUFA 2Z2NA 5CC2A 1D9VA 1MQDA 3N5LA 3J80g 1KWHA 4GQOA 2MTAH 4FAND 3BFTA 5TP9A 4YMAA 5LOMA 4GGCA 4PBYA 1GG2B 5CMMA 5H17A 2V25A 3GXAA 4O3TB 2ONRA 2UVGA 4RPOA 4R9GA 2OVQB 3V8XB 4O45A 1Z7ME 5SXMA 3VLWA 2XXPA 4PSXB 1L5TA 1TFDA 3MP8A 4O3UB 4MFIA 1ERJA 3U92A 1MS7A 1FTMA 2PM9A 1OMPA 3T9UA 1HSEA 3H4ZA 4FECA 4QFNA 3KSJA 5CMBA 3J81g 4LQ5A 1LFIA 3SEVA 1HSJA 1JW4A 4IO7A 3K6WA 5J1DA 3S9MC 1ATGA 2V84A 4J82A 1NL5A 3OENA 1FCKA 1MXYA 3B6QA 1PEVA 3VGZA 4BDRA 2XHDA 3KSXA 4PNKB 1Y1ZA 1B1XA 3K1NA 5BWJA 3IAZA 2WKYA 3O2AA 3A3UA 4JD2C 2ALUA 3L4OD 2LAOA 1JMXB 3Q25A 1OLAA 1B0LA 2FA7A 2Z23A 4NF5A 2ZXTA 5DEXA 4IA9A 4DZ1A 1LGBC 4YKPA 3S9LC 1Y4TA 4GQ2P 4LZ7A 4OETA 3W15A 3E4RA 4ESXA 4JSNC 3U8QA 3KBRA 1WDNA 3C35A 5I58B 5I5JA 4R6HA 3ONMA 1FTJA 4H8JA 3TEPA 2DS9A 5EMKB 1JW5A 1IITA 2Z2OA 2HFBA 3SBPA 3DWLC 1QJMA 5L9MA 3MVZA 5DYHA 1QUJA 3UKUC 4DIGA 3HHGA 3T9XB 4GM9A 1MDP1 4Q8RA 2R71A 3SEWA 1FQFA 4OQOA 1POY1 4CI8A 4F18A 4DE8A 5EARA 3OTTA 3G3IA 2DWJA 4D0KA 4I9DA 4OTEA 2W7YA 4YB7A 4DCXA 2HKMA 3MPLA 1N6FA 4LVQA 2YNOA 4QFKA 1OLZA 4UA8A 1UTBB 1B4ZA 4JSVC 1FQDA 4FA4D 3UIFA 1R9QA 4BUJC 4NF6B 2D21A 5CXCB 4JWOA 1XVXA 3LBSA 2YNPA 4G8NA 5JWZA 3U72A 2Q2AA 2I3WA 3PD9A 1R1NA 3FGBA 4J84A 3R6UA 3I7HA 2XX9A 4RYAA 1CE2A 1IEJA 4BH6A 5HE2B 2B5LA 4FWWA 3TAJA 2O6AA 4J0WA 3LSLA 3U1OA 2YLNA 3ILTB 2H47A 4C1UA 4YU0A 3EI4A 2HZLA 3KJ7A 2F7CA 3CIJA 4N07A 3HV1A 4N6PA 2GH9A 1MXZA 4MH5A 4OFOA 2CN2A 4ZOXA 1MY1A 5IGOA 2OVPB 3PUVE 4L3HD 3K00A 4NWCA 3HFQA 5DT6A 4ZEKA 4FATA 2ZYNA 2YNNA 5AA4B 3EI1A 3IL1B 3FVGA 4QHQA 3N26A 2IUQA 3K6UA 5TEEA 4GL8A 1A8FA 2UYFA 1UIVA 4IO5A 1N7WA 5TF2A 3HN0A 2EBSA 3VVEA 2QSXA 1A55A 1ZU0A 2F35A 3KFMA 3T9VA 1IUDA 5K1CC 3F3FA 2P0SA 2PYYA 3PD8A 5H8QB 1JOFA 1JJUB 3OOAA 1B46A 5CI5A 5H8HA 1B3HA 3PE7A 2HEUA 2I48A 5DVFA 1ELJA 2QPQA 1NNFA 4ERQA 1MY3A 2NVUB 2G93A 1PDAA 1PGUA 4OWDA 2I0TA 3JROA 2RC9A 3KZGA 1FQEA 4RK9A 3PPQA 4C0RA 3H6VA 2X26A 1YCJA 2PBWA 1VFDA 4KYSA 2ZYOA 2XXXA 4OYVA 3SETA 3KRXB 4EWRA 4QF9A 5BUUA 3N6UA 4H65A 1MQGA 2PMSA 4J79A 4ZEBA 1QUKA 1FW0A 4H67A 2QS1A 2XXVA 4XTCQ 3GZGA 3VE1B 3O6HA 3V5WB 2V3QA 5I59B 3I7OA 4NTLA 1QKAA 3V89B 4EDPA 1OQGA 2KLFA 3KGCA 1MXUA 3E13X 1B5HA 4GZ8A 1JNFA 3Q29A 3SCYA 1M5EA 3I2NA 3TTLA 1VYHC 5KCJB 2XXIA 2O51A 3OEMA 2Y7RA 4FA1D 4H5JA 3RGYA 2F34A 4N13A 2QRYA 2IAAA 2PM6B 1SHYB 3MZKA 5EMLB 4F3SA 2AL4A 1CB6A 3C34A 4HW8A 1I6BA 5FHOA 4Y5RD 2UVHA 4E5ZB 4AB6A 4DXUA 2DE2A 3B6WA 4BDNA 2PBIB 4WKMA 5ELVA 2P9SC 3TCFA 5HYNB 3RLMD 4BDOA 1WVJA 3E3KA 3H03A 3VVDA 3QXMA 3SVWD 2I3SA 3MP6A 3OL2A 1I69A 4JSPC 3ULEC 4PFTA 1UIUA 1A99A 4J8GA 4PFUA 1P22A 1UTHB 2VGQA 4JWXA 3MVWA 2YPNA 4JDFA 5CXBB 3PVWB 1BTJA 4U1ZA 1FWXA 1J1NA 1DMBA 1Y20A 5I56B 2UVJA 5EMJB 1FTOA 1XHYA 1B9XA 1M5DA 4Q30B 1WODA 1B32A 2Q2CA 2XU7A 3RFGA 3V83A 4GGDA 1PBYB 4LATA 4IO2A 4ZOZA 5FTHA 3PPNA 3M3FA 4KI0E 1GXRA 5FXYA 2AYSA 1XS5A 4YAHX 4JSOA 2OK4A 1JQFA 4J78A 5C2WB 1LAXA 2PM7B 2PT1A 1P1OA 5I57B 2DXYA 5I58A 4OXVA 2NWJA 2H9NA 2YB8B 2RCBA 2UZYB 4KQPA 2V3UA 1Y1MA 3FASA 3H06B 3BKIB 1QNIA 1ZKBA 3QYTA 1B3LA 1N04A 3M3KA 2OIZA 4L17A 4BLAA 3F11A 4FAJA 4BDQA 2YMUA 4L3GD 1LFGA 4EQ9A 3F3GA 2H6KA 2X7PA 3BFUA 4GOTA 4FHLA 4G77A 3ODTA 3MZLA 4JBZA 5EHMA 3FM0A 2NXOA 1B3FA 5FKQA 3MAMA 3NVNA 1OVTA 4CY3A 3P4FA 2OWSA 1UTBA 1YFQA 2XXTA 4KPTA 5B7DA 5TDHB 2AL5A 4O3AA 1SQJA 1U2VC 4NF6A 1N84A 4R7AB 5CXCA 3MUQA 5HE0B 3RQTA 4GM3A 2DXRA 4R73A 4GVOA 3NVXA 2Q89A 2F78A 2I0RA 5THAA 1QUIA 3O6IA 2A5SA 2BCJB 2Q7QA 3AXFA 4GM8A 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 2DWI A;  2E0S A;  3M8U A;  4GWU A;  3ZSF A;  4YMB A;  4U1O A;  3FGS A;  3KG2 A;  4F3G A;  1NV1 A;  4GWO A;  2D3I A;  2XDW A;  4PSW B;  4JSX C;  4I62 A;  4PQJ A;  2VOZ A;  1NUX A;  4ZDM A;  2AQ5 A;  1JTD B;  1SI1 A;  2XXY A;  5L8D A;  5AJA A;  3S4U A;  5IJ8 E;  1PI6 A;  5H14 A;  1QUL A;  5I2K A;  1E5T A;  1AMF A;  2HAV A;  3SBR A;  4WXJ A;  3MVX A;  5F1Q A;  3MVY A;  1QVS A;  4ZEI A;  3B7D A;  4Q5T A;  4ZZA A;  1LB9 A;  4H5I A;  2ONK E;  1N6D A;  2HU5 A;  2DDK A;  2QR5 A;  2H6Q A;  2VZ3 A;  4GL0 A;  3SN6 B;  1DSN A;  1XOC A;  2FIX A;  1N76 A;  1NNT A;  1EH3 A;  3CSG A;  4JSD A;  1URS A;  1BLF A;  5JTY B;  4GWY A;  2HJ4 A;  4NF8 A;  2H13 A;  4LUB A;  4J86 A;  4AOW A;  2O69 A;  3MUN A;  3G7W A;  2Z8F A;  1SPI A;  4MMX A;  4WJK A;  4O9D A;  5M61 A;  2CZH A;  3RT6 B;  3G3J A;  3BG0 A;  3H6U A;  2RC7 A;  4X60 B;  4IY5 A;  1BKA A;  2QS3 A;  2RF1 A;  5H8F B;  4G8M A;  4NBM A;  1FPJ A;  1B6H A;  1USY E;  2O7I A;  2PT2 A;  1M5F A;  4WEP A;  3CIK B;  4G2Z A;  1O7T A;  5ISU A;  1PC3 A;  2R9J A;  4K3J B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1IXI A;  1LBB A;  3BWS A;  3VLU A;  3SBQ A;  4ESG A;  5CBS A;  3U94 A;  5CYK A;  3C9C A;  5IT9 g;  4KHZ E;  4J73 A;  2F6P A;  3OKY B;  5DVJ A;  4KYE A;  3SES A;  3CFX A;  2DOJ A;  4XIG Q;  3IB0 A;  3BBR A;  3IJ1 A;  1N3W A;  3RUM A;  3IR1 A;  5HBC A;  3I8C A;  3KOT A;  2HCA A;  4GMB A;  4CC9 A;  2IWF A;  3UVN A;  2G29 A;  2BJJ X;  4U21 A;  2G99 A;  4AB5 A;  2UYE A;  4O3C A;  4EXK A;  5B70 A;  3O6G A;  4XKP A;  3S9N C;  2GHA A;  1NEX B;  1TT1 A;  3D4G A;  4YKJ A;  2DQV A;  2HYE A;  3K1P A;  1Y9U A;  3MZB A;  2PX1 A;  1B5I A;  4KYD A;  1B1H A;  4C1T A;  4YKK A;  2P1S A;  3MC2 A;  3MKQ A;  3HO7 A;  3JRP A;  3AL8 B;  1LAG E;  4OMB A;  5K2X A;  4YZZ A;  3E0C A;  5IAI A;  3EN3 A;  4DLD A;  2D5W A;  2BBK H;  2F97 A;  2GC7 A;  3GRE A;  2QL3 A;  2AH0 A;  3OO9 A;  1O64 A;  4LZ5 A;  2F7B A;  4GRK A;  5CMC A;  3VV5 A;  3SKP A;  4EF2 A;  2CMO A;  3SLE D;  3RY3 A;  3EWE A;  1ZIU A;  3D4C A;  3OL2 B;  4K3I D;  1NNP A;  3DP8 A;  4ZOY A;  2OJT A;  2AGZ A;  3MJN A;  2HQ0 A;  3MQ9 A;  5EHS A;  3IKO A;  1ZMG A; 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