3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
3KN7A 1IXCA 1MPDA 2UYEA 3C75H 4QFLA 5FKSA 4DIGA 4FORA 2YBAA 1SI1A 2XXUA 3G7WA 2GNQA 4YAHX 5GXHA 2YNOA 5A2Qg 3BBRA 4XKRA 1FCKA 4POXA 2QPQA 4FAJA 2CO0A 2GHAA 2QS2A 5I84A 4Z0IA 4LATA 3C9CA 1LCFA 3A3CA 1MPBA 2XX7A 4HCWA 5TDHB 3H03A 2HZKA 2PVUA 3R26A 3G3FA 3MZ9A 1SQYA 2AIXA 3TEPA 5FXYA 1PBQA 4RK9A 5FQDA 2QMXA 5TU0A 2DWHA 4KCDA 2W7YA 1RKMA 2I3SA 1S50A 3QSLA 4GXSB 4U1ZA 2XXWA 4ELOA 4G56B 4MFIA 5KZTA 3FUZA 2H6QA 4A0BA 3W9VA 3BFTA 1GR2A 3H3GA 4QF9A 5I59A 2X26A 2YPNA 1MM7A 4XTCQ 2AGYA 4CY2A 5EM2B 2HYEA 1FQAA 3NVNA 3A0FA 4XKPA 4HCYA 4GGDA 4XKNA 2AQ5A 1JMZB 3GLBA 2OJYA 4P0GA 1N6DA 2Y7KA 4OETA 1FQCA 3C34A 1A8FA 2Q8JA 3JRPA 1LFGA 3KFMA 2I3WA 1SQ9A 3MPKA 1MDQA 4MBPA 4DCYA 3SXTD 1DTGA 2GFEA 1LAHE 3IJ0A 3MP8A 1MRPA 1I6QA 2XX9A 4ZOXA 2H13A 2G93A 3O28A 2I3TA 2IURA 2RC7A 4ZOYA 2ZNSA 1GV8A 2PM7B 3Q28A 2P1SA 1BP5A 1MH4A 3FJGA 3Q27A 2YNPA 4O3BA 3FJMA 1IXIA 2HCAA 4QSEA 3QAXA 4K3JB 4F39A 3G3JA 5AA2B 4ZEIA 3O6GA 3OL2B 3IO4A 2ONKE 3PE7A 4BDLA 1JETA 3B7DA 1S9TA 2DE2A 1B3HA 5EMJB 1XVYA 3RT8A 1ELJA 3TMGA 2UXAA 1NFTA 4QSCA 3SESA 1U4CA 4HTGA 3RTFB 3KEIA 3P4FA 3TQWA 1B3LA 2A5SA 3K4UA 3FJ7A 4PE5B 2YB8B 3AXFA 2HJ4A 2OK2A 1ANFA 4JBZA 2NOOA 2CMOA 1EU8A 1GTKA 1YPNA 4BDOA 1RYOA 1TWYA 4GQ1A 3OTTA 1B9YA 1WDNA 1ZTYA 3ZKLA 4GWOA 3ZSFA 1LFHA 5JTYB 4EWRA 3I7HA 2XXXA 3K1PA 4LG9A 2H25A 4FATA 5GXIA 3VVEA 3L6GA 3Q25A 3PD9A 4QRZA 2XXYA 3KZGA 3RFHA 4G8NA 4FB1D 4TOZA 3OMBA 1B9XA 1NKXA 3EHTA 1N84A 3SEVA 4H5GA 1LSTA 2PT2A 3PMVA 3L6HA 4JSVC 5CC2A 1DPPA 2ONSA 2H14A 4FE8A 2O51A 1XVXA 2OWTA 5HPQA 3V9FA 3ZS6A 5IAIA 1FQDA 5CMBA 4ZEBA 4OHNA 3QXMA 1YCJA 4RK2A 4GM8A 1SYHA 4LQ2A 3PUWE 2IWKA 2TRCB 4H6DA 1ZIUA 3N26A 2IUQA 2NVUB 5EHMA 3I7PA 2AL4A 1ERJA 5TPAB 4RA1A 1N3XA 3OEKA 3FGBA 1B7UA 1JNFA 4N14A 1Y9UA 3DXMC 2RF1A 4F3GA 4JSOA 3FASA 4J84A 4H5FA 2B3BA 4H5JA 4Q5TA 3K26A 4A0AB 5K2XA 2DE4A 3L4OD 4ZS9A 3HN0A 3QIMA 5I2KA 4H8IA 4YKKA 3B6WA 2F6GA 1MG3A 5HYNB 3K1MA 1H45A 2F7AA 2O7IA 3EN3A 4KCCA 3Q26A 3RUMA 2G29A 2DP8A 4ZE9A 4IY5A 4LVQA 1US4A 3JZGA 1FTOA 2HESX 3E9XA 3B7FA 2Z2OA 4J73A 2XL3A 2I48A 1NEXB 3EWEA 1NL5A 3LBSA 2QS3A 4DCXA 2E1SA 1M5EA 3LR1A 2RINA 5H8HA 4MLQA 4I9DA 1EH3A 4ND9A 5GSAA 5AA3A 5EARA 2DWIA 1VSOA 1NNFA 3RT6B 3IAZA 4JT6C 3SEWA 1SI0A 2H9MA 2XXHA 1H3DA 4WXJA 1FTMA 3U93A 4FAND 1PB8A 3USDA 3OELA 5K19A 3VV5A 4I62A 1B3EA 5CXCA 3KG2A 2X7QA 3ORVD 2V3QA 5EAPA 3T9UA 5EAMA 1B52A 1AL3A 2Y7RA 4J8BA 4EQ9A 3OSRA 4R6KA 4F3SA 4DE8A 2DOJA 1B7ZA 3FXUA 4Q8RA 3IKOA 1H43A 3K6VA 3IJOB 3T93B 1PBYB 2W18A 4CZYA 3I5OA 2OJTA 1AMFA 3KN8A 1AH5A 4YKPA 1DSNA 4N13A 4R75A 2O69A 4QT8A 2J55H 1QKBA 3OEMA 4CZXA 4L1QD 4E0WA 1XC1A 3IJ1A 4CZVA 2XU7A 4Z8LA 1JW4A 1XT8A 4H65A 3IIWA 2H68A 4ESXA 4EUOA 1B05A 4LZ7A 3TUSA 3GBAA 2P9UC 4O3CA 4XYHA 4OVJA 2OK4A 5M2VA 3UR4A 4EXKA 1Y1MA 5HM4B 5F1QA 1GXRA 4YB7A 4WKMA 3TCGA 3EI1B 3VLWA 5H1MA 3I6VA 4OFJA 2OBGA 4GM3A 3O29A 3K6WA 3T9HB 4ERZA 5C2WB 4PBZA 4U2RA 4AOWA 4ERYA 5EHSA 4GOTA 4OWRA 4BL0A 4GL8A 1MXYA 2HXCA 4OEVA 4D0KA 2H4IA 3CSBA 3O9PA 1VFEA 5L9SA 5ISUA 4K3ID 1A7LA 3U4YA 3IB2A 1MQGA 4NF4A 4H0WA 3FD3A 4A0BB 1NNKA 4EF1A 3FV2A 3KSJA 4GF8A 3KRXB 4ECFA 3V83A 2H9NA 2HEUA 5DTBA 1MS7A 2I58A 5AA4B 2REGA 4BH6A 2Z2PA 3I8EA 4GQBB 3FGSA 3BWSA 3HV1A 4IO2A 1N0TA 2F34A 1IQ7A 3RQTA 5IT9g 4ZOZA 1PEBA 4KYSA 1LBCA 2THIA 3IK6B 5ICQA 5TP9A 4FWWA 3MXXA 3B6QA 5JEIA 4PSXB 2A5TA 1MDAH 3T9XB 3THIA 4IO7A 4JT5C 4J78A 3TAJA 2HZLA 3PMWA 3QUJA 2Z8FA 1PBPA 3BKIB 4FA5D 2YNNA 1URSA 2IUPA 3IO6A 5HE1B 2ZYKA 1A54A 4IB2A 1POY1 2AGWA 5HBCA 2QRYA 1MDP1 2H6NA 4O3UB 2O68A 4PP0A 2IAAA 4KR5A 3PXSD 3FATA 3PUYE 3BG1A 3OO8A 3SVWD 2Q7QA 4X3EA 1GGGA 4GMBA 4X61B 3UKUC 2A5TB 1ATGA 4X1BA 4ES0A 2OZZA 2F35A 1XOCA 2RCAA 1B3GA 1IEJA 3O6IA 2V3TA 5L9OA 3KJ7A 2REJA 2P2AA 2R6GE 1SDXA 3TFLA 1MQJA 3D4CA 3FRXA 3UVNA 4IO4A 1NNTA 1RI6A 4ZZAA 2P9IC 3GREA 4CY1A 4GRKA 2PX1A 5CXBB 4GQ2P 1O64A 5JK4A 4PFYA 3EG6A 4NF5A 1WVJA 1Z7NE 4UI9R 3MP1A 4QL1A 3EF7A 3HCQA 2V25A 4FEBA 4DDDA 2V3UA 5AA2A 2RC9A 4IO6A 1OMWB 2QSXA 3U1OA 2HKRA 3G3HA 4X63B 1OMPA 3MVZA 4CI2A 3N0EA 5CXBA 3K02A 3CG1A 3OOAA 5FKRA 5I56A 4IO3A 4XXUA 1POTA 1D9YA 1XHYA 4IGRA 3EU7A 2OVRB 4PETA 4FAVD 5K2YA 3PPOA 3MP6A 4FA9D 1Y20A 4JSNC 4O9DA 2AL5A 2Y84A 4UACA 3SDFA 3JZJA 3PVWB 4ONYA 3VH0A 3LSLA 3T66A 3LSXA 1FWXA 2QC5A 3I89A 1ZU0A 4A09B 4A08A 1MQHA 1IUDA 1MXUA 1MY2A 3RLMD 3JYRA 3KJTA 4J82A 3KRWB 5H8QB 2XXTA 4BDMA 1M5FA 3MKSB 4F3BA 5JTYA 2X7PA 3IR1A 2QL3A 3I2NA 3MC2A 3K00A 1SW1A 5AFU3 5KDTB 3O6HA 3VLVA 4NTLA 5TP9B 2H5YA 4OXVA 2I0TA 1B1HA 3PU5A 4IY6A 1URDA 3EI2B 3SEXA 2VOZA 3N6UA 1VE4A 5EYFA 4G68C 5DT6A 2CZLA 3FIRA 3FV1A 4R6HA 2GC7A 5AMSA 2ZYMA 1B58A 4NF8B 3CFZA 2P0SA 4OFOA 4CY5A 1USYH 1J1NA 4PBYA 4ERQA 2RC8A 5I58A 5FHOA 2H3XA 3DLNA 2F7BA 3MWBA 4E54A 3SBPA 2AH1A 3DP4A 1US5A 2XX8A 3QUFA 1A40A 2Y7IA 1B46A 3ULEC 4GLIA 1JOFA 3EI4B 4PSWB 4R9GA 1PB9A 1QNIA 5HE3B 3ONMA 4BUJC 1EZOA 3OO7A 4NWCA 5H8SA 2DQVA 1WODA 3HHFA 2BBKH 3TDJA 4ZECA 4JWYA 3UVLA 2H9LA 3U92A 5I2NB 3JPXA 1T0KA 4F31B 5CI5A 3OO6A 3PPQA 2PT1A 3JV9A 2J57G 3E0CA 3C99A 4OWDA 4KFMB 3PSLA 4U23A 2J56H 3F3FA 5AJAA 3VGZA 5J1DA 3I7LA 3EMHA 3TELA 2OK6A 2XD2A 2Y7PA 2ZXTA 4OESA 2IA4A 1SVXB 1R5MA 2ALUA 1OIBA 5HQGA 4KYDA 4OQOA 1M5BA 5TF2A 4E54B 3U72A 4ZDMA 3I3VA 1JW1A 2ESNA 3FVKA 4U1EI 4JD2C 4U21A 5TPAA 3CSGA 3RN0D 2I0BA 3M3KA 4O3AA 1Y4TA 1ZJLA 3H6VA 3L4MD 4M1VA 4DXUA 4YKIA 2CNXA 2Q89A 4C1TA 3JZHA 3UK4A 1JW5A 4DZ1A 4J0XA 1MQIA 5B4WA 2OIZA 4R6YA 3C4MA 2B5MA 2F8DA 4J81A 3RGYA 2H9BA 3E13X 1ZKBA 2UVJA 4RXLA 4HS7A 2UYFA 2B5LA 3U94A 3DWLC 1MG1A 1A55A 1O63A 3CFXA 4CI8A 5FA5B 3FXRA 4BDRA 1NMUA 2AYSA 3S9EA 4ESWA 2NWJA 3K27A 3U8QA 1R9QA 4NF6B 4G68B 3TPAA 1HSLA 4LGNA 3EHUA 1Q1KA 3DSMA 1O7TA 5FHMA 1OLCA 3SHFA 3SBRA 1QKAA 1LB8A 4JXMA 5BUUA 3EHSA 3WAFA 3DXKC 3I7KA 3MUQA 2PBIB 1B1XA 1F9BA 5HE0B 3S4UA 3N5LA 3K2DA 4LUBA 3WAEA 2F36A 4ZE8A 3UVMA 4U7AA 4YB5A 1GG2B 4J0WA 2IWFA 1QUKA 5IJ7E 4LQ5A 4F22A 1A8EA 3TYHA 5CYKA 4Q0CA 2HAVA 4L9OA 3PSCB 3OL2A 4ZEFA 4O45A 2F7CA 4R2BA 1QJMA 3OSQA 1UTBA 2O6AA 1PGUA 4JWXA 3MZBA 5EMLB 1P22A 3TZAA 3TTKA 4KD5A 3MBPA 3UVKA 4NWDA 4IO5A 1A99A 4M4GA 4E5ZB 3VVDA 3IL1B 4G68A 2FA7A 3PXWD 4JWOA 4FHLA 1URGA 3UGWA 3M8UA 2HXWA 4R9FA 2AGLA 5I57B 4ELPA 1IXGA 3C9HA 1VFDA 4ZZEA 2PM9A 2D5WA 3DP6A 4UA8A 4MLVA 4FA1D 1SQJA 4OZUA 2WKYA 4A2MA 1OQHA 4F29A 1AIVA 1IIWA 1RYXA 1ZMGA 5CBSA 4Z7EA 2UZYB 3I7OA 3Q29A 2V84A 3H6WA 4IGTA 3VXBA 2F97A 3GZGA 2HQ0A 1IZ1A 1PDAA 4LONB 3BG0A 4XIGQ 3OW8A 1BKAA 3SN6B 1LFIA 4R73A 1MG2A 3VDFA 4QFOA 4YKJA 4A0AA 2Z22A 2G99A 5I57A 3PUVE 1D3KA 4D6VA 1LAFE 1LGBC 4YZZA 5B70A 2V93A 2I4CA 1TBGA 4BLAA 2O9KA 3SMRA 1QULA 2AH0A 2DXRA 3EI3A 4GVOA 4RPNA 3V5AA 1S4UX 2BCJB 4O1QD 1ZLQA 3RMZD 1NNPA 3IOWA 4O3TB 2I6EA 3PVUB 2I0RA 1LBBA 1JEVA 4U4SA 4QHQA 5SXMA 3ODTA 4I1DA 5FTIA 3RN1D 4QFPA 5I5MA 4F2QA 3SBQA 4GD5A 3MKQA 4HW8A 4MK0B 4A11B 3O97A 4I79A 4LA9A 3ILTB 3OXNA 4G77A 5KCJB 3EPEA 2BJJX 3PPNA 3EI1A 2GRVA 1XKSA 4ELQA 5IKBA 1BLFA 2QXVA 3M3FA 2D3IA 3C35A 1TYQC 2Z8DA 3MPLA 3K6UA 4R7AB 1H76A 3MZ1A 2P9NC 1QUJA 4U22A 4MF3A 1P99A 2R9JA 1GP2B 4L3HD 1JEUA 2OLBA 1GVCA 3T22A 1R6ZA 3EQ1A 2DE3A 5IGQA 5DVJA 5LOMA 4F1UA 4TZ4A 5GMKn 5IC7A 1Q35A 2QS1A 4H1XA 3RY3A 4QFNA 3EI2A 4JSXC 3OKYB 1KWHA 4PXWA 1B4ZA 1N76A 3C36A 3RTWB 3TCHA 1K8KC 3CFVA 3C33A 1B32A 5KDTA 5H17A 2HKMA 4AQ4A 3MZKA 3MVYA 2OCUA 1M5DA 2O1LA 5I58B 3VE1B 4POWA 1B4HA 2O1MA 4OENA 2F78A 3PGFA 4P0IA 3TTLA 4CY3A 3CIKB 5EMKB 1OVTA 4F1VA 1B9JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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