3DRNA

The crystal structure of bcp1 from sulfolobus sulfataricus
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
152
structure length
152
Chain Sequence
b'VKVGDKAPLFEGIADNGEKISLSDYIGKHNIVLYFYPKDDTPGSTREASAFRDNWDLLKDYDVVVIGVSSDDINSHKRFKEKYKLPFILVSDPDKKIRELYGAKGFILPARITFVIDKKGIIRHIYNSQMNPANHVNEALKALKQIKEEEIS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the catalytic mechanism of the Bcp family: functional and structural analysis of Bcp1 from Sulfolobus solfataricus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin, bacterioferritin comigratory protein homolog
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 57
structure length 152
sequence length 152
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2008-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3drnA00
1A24A 4HZ2A 4WF5A 4XHMA 5LNKe 2XHFA 3C73A 3RBTA 3Q19A 5ABRA 4NPBA 2VAFA 1SD9A 2DJJA 1SD8A 1KEBA 4X0XA 4K2DA 5DVBA 5B8BA 2GDRA 2OE3A 2DJ3A 3KGKA 1VRSD 3GTUB 1Y6EA 3KM6A 1TRWA 5ECPB 2FD3A 4JZQA 4IVFA 1AQVA 1R26A 2LRTA 4OD7A 4LL4B 3TGZA 4QQ7A 4KE3A 4NHZA 3EMPA 3LG6A 2GZPA 3HHVA 4J2FA 1I9DA 16GSA 4IP1A 3EYTA 3G9BA 5J9CA 3GKXA 4JBBA 2GT5A 2YZHA 2CQ9A 3FEUA 4PX1A 3TKRA 4K0GA 4N0VA 2E2GA 2YJ7A 4QL9A 3UOMA 3DWVA 4JU5A 3NOFA 2BJXA 1GSDA 2YWNA 4XTSA 1X9MB 2O7KA 5AIVA 3RPNA 2LUSA 2XBQA 1QXHA 2B5YA 2PGTA 2H1GA 2HNLA 1GSEA 2LQOA 4K8MA 2VCWA 1ACVA 2X8HA 1EEJA 1TI1A 3KMNA 4ZL7A 1JZWA 1USBA 3S9FA 1PL1A 3EMXA 2YNXA 3EU3A 3FZAA 3UBLA 3IAM2 3L9VA 2O85A 3PGTA 2L6DA 3HY2A 4GTUA 5LD0A 2FA4A 5B6MA 2WZ9A 1ERTA 1R4WA 2TRXA 1XW6A 2DJKA 3UIWA 1B9XC 1OC9A 1MDIA 3L4NA 4V2NA 2MBSA 5KEJA 1WJKA 5JWOB 4GCIA 4ML6A 1MDKA 3GUSA 2JSYA 3F4SA 4O32A 3TRPA 1PQNA 4MZCA 3ZVJD 2NPBA 2C1YA 2R5GA 3ERWA 2JACA 3UAPA 5CRWA 1XXUA 1GTUA 4DSQA 1AIUA 2OE1A 2C3TA 5ECIB 5DJMA 1SKSB 1M9BA 1LJRA 1R5PA 3ZVJA 2DSAA 2GT6A 4OCFA 2DC5A 5ECMB 5JCGA 1N2AA 2G2QA 3QPMA 2WULA 1PX6A 1V9WA 4D73A 1QGVA 5DAKB 2PMTA 4ZB6A 2DLXA 3M9KA 3A2WA 1SU9A 4PUFC 1M2AA 3ZMKA 1XFLA 4Q5FA 2H01A 2HSHA 1B9YC 2VL2C 3TOTA 2NBSA 4Q5NA 3NZNA 4I6XA 4WBJA 2HZEA 4EDZA 5IMAA 4OO5A 1GNWA 2IPAA 1WIKA 4HEA2 3HYPA 3K8NA 2FNOA 2R37A 3FZ9A 3J7Yk 1ERVA 1J08A 2BTOT 3CSIA 3IOSA 5FHIA 5J41A 1XWCA 5G31A 1K0AA 1XOBA 4ZB9A 4ZBDA 2L4CA 2GQLA 1C72A 2ALBA 3EVIA 5DCGA 2X99A 5HR1A 4EF0A 2HLSA 1T4YA 1WPIA 5ECNB 2WS2A 4OMVA 3HVVA 3IRAA 2JZTA 3M9JA 1SJ6A 2H0HA 1QMVA 1WP0A 2CVBA 3MDKA 3D6IA 2YN1A 3P7XA 1X5DA 3GSTA 10GSA 4O7HA 5A4UA 2VOCA 4IN0A 3ME8A 1A2MA 13GSA 2JU5A 5F8BA 2RUEA 3LWAA 1E2YA 3VWXA 3KEBA 2R2JA 3APQA 1PSQA 3GN3A 5DCHA 2GZYA 6GSSA 2AJQB 4CHSA 4P3YB 3F6DA 2ZNMA 1VF4A 4V1Ap 1W4VA 4ZL9A 3TJFA 2IN3A 1UVZA 3F3RA 2ON7A 4BPYA 4NWYA 3CTFA 1YQ1A 4POMA 3KTLA 4POKA 5F0GA 22GSA 2TIRA 2EIRA 4KA0A 2H0GA 3LEFA 3ZTLA 1TK0B 1ML6A 1CQHA 3QR6A 5CRGA 4L0UA 2YJHA 1U87A 3VWUA 5A4VA 4GQFA 3ZRDA 5J4UA 3HD5A 3CXGA 4OCEA 3IR4A 3VFIA 2V1MA 1X5EA 1KNGA 3FW2A 3UBKA 1OYJA 4HQZA 5H5RA 3IE3A 1UA5A 1V2AA 3N9JA 2YWOA 5D93A 1OAZA 4NV5A 1NSWA 1SK2A 4PUAA 4MABA 4TOPA 2GLRA 3CYNA 4BL7A 3IV4A 1Q98A 4NAXA 1EOGA 2OBIA 2YV7A 1YJ6A 1JHBA 3FR9A 2VLVA 6GSUA 2K8VA 2GTUA 1M2BA 3ZZXA 4ZL8A 4WR5A 4H86A 2D2ZA 2X64A 1SYXA 5G2ZA 2B1KA 1E6BA 5KN1A 17GSA 3ZREA 3I9V2 5GSSA 1GSUA 5CP1A 4IGJA 1V98A 2L5LA 2M72A 5CREA 1K0OA 1GNEA 1YZXA 3F4TA 3QDNA 3TKPA 1M2DA 2CT6A 4BVXA 1SKWB 4DSSA 2G0FA 1OKTA 1ZCPA 3IDVA 1GWCA 4ILFA 4O92A 4MH2A 4K7NA 1RW1A 2E0QA 6GSXA 2BMXA 3M3MA 4KX4A 4WF4A 1HQOA 1A2JA 3KJYA 1DE1A 2O87A 3N5OA 4NMUA 1OC8A 4ML1A 2OACA 2HXKA 4E8EA 1ABAA 3L9UA 2IFQA 3DKSA 4IW9A 1B48A 1GTBA 2IMFA 5D9XA 1K3OA 3VLNA 2DJ2A 4HDEA 3BCIA 2VIMA 5AIXA 3HCZA 2I81A 3FY7A 4FO5A 3ED3A 5DBQA 1Z3EA 2DJ0A 3GH6A 1DSBA 1NM3A 4FH8A 1XOAA 4XCSA 2WFCA 3CRUA 1VGLA 2FLSA 3PINA 4HOJA 5CYYA 1NHYA 1A8YA 2F9SA 2WB9A 3D0ZA 5F05A 3WT2A 1EV9A 2PUKC 1O8WA 4L0WA 2J9HA 4MDCA 3VPQA 4AJ8A 1DBYA 2JSZA 1BX9A 4LMWA 8GSSA 2QKEA 2CAIA 1XCCA 3LFLA 3GKNA 3GL5A 1H4OA 2R3XA 2REMA 4OFMA 1GH2A 4LMVA 1Z6NA 4KSOA 1PN9A 3Q18A 3V1WA 1IYIA 4HU9A 5H5QA 5JWRB 2V32A 3E9JB 3JCML 1G6WA 5GAPD 3WD6A 6GSTA 1PD21 1SL2B 5ID2A 3VWWA 2HZFA 3TKSA 12GSA 3CRTA 3ZL5A 1ZZYA 2YWIA 4D73B 5INYA 2A4VA 3H79A 2Z9SA 3ISOA 2FCHA 1T8EB 3KIJA 5CNWA 5A4WA 4KGIA 4GSNA 3UARA 1BJXA 5J9BA 1JZOA 1SJZA 2CVDA 3O3TA 3RPPA 1XPVA 2C3QA 1M0UA 3D4MA 1AXDA 5CRDA 2HZEB 1FO5A 3P2AA 2H66A 1GULA 3UEMA 3L9SA 1J9BA 3CMIA 5IMVA 6GSWA 4N10A 3GKMA 2QC7A 9GSSA 1M7TA 2IIYA 2YZUA 2LRCA 1TRVA 1PGTA 5G1LA 2VLTA 3SBCA 3DGQA 4PURA 4G9HA 2H0IA 2XBIA 2FUG2 4YAVA 5G1KA 2OADA 4E8HA 1EV4A 5HR0A 1PL2A 4GSSA 2VM1A 3Q6OA 4AGSA 3BJ5A 1GSFA 4KDYA 2H8LA 1B4QA 3F4RA 4JR4A 2TRCP 2CAQA 2H70A 3E3EA 3I6AA 1Y25A 3GX0A 5F07A 3D5JA 4AF2A 1TU7A 3HA9A 4MLYA 1GL8A 2VCTA 1G0TA 4GSTA 5D8IA 2ZCTA 1XWGA 4ECIA 2B7JA 2OA7A 4WETA 1TK5B 1ST9A 4HU7A 3SWLA 5C04A 4X1UA 4GQCA 4OO4A 2V2GA 4XS4B 2H71A 3HZ8A 2WRTA 14GSA 3GMFA 1F3BA 1XBSA 1BAYA 4N30A 4OFTA 3G7JA 3BCKA 2NVLA 4N0ZA 2H30A 1DE2A 3ME7A 4MZBA 5D73A 3FRCA 3HVXA 4FIWA 4JEDA 1AW9A 1R5AA 3FZ5A 4RUVA 2HI7A 2KUCA 3IXRA 1FVKA 2JZSA 4LLRA 1EP8A 2N5BA 3TCOA 4FYCA 2GQMA 4MF7A 1O81A 4PNFA 4KSMA 4MK3A 3RHBA 1V57A 1X9WB 2H19A 2XC2A 1YF0A 4MJAA 4PQ1A 1GTIA 4TR4A 2YPMA 1XWKA 1THOA 1T1VA 1TJDA 2HT9A 3GYKA 2EC4A 2F8AA 3KCMA 3RHCA 4MJBA 2YANA 2I9HA 3GSSA 4K0NA 1Z5YE 1AQXA 2ES7A 2DMMA 5GAND 3G7IA 4K6XA 2O8VB 2EIOA 5AGYA 4POBA 3QOUA 5IMFA 3O6TA 1GSQA 2LNSA 1YDKA 2IJYA 4KNDA 2C8UA 2AAWA 1YY7A 4ECBA 1GSYA 3OR5A 3HKRA 3QAGA 1TK8B 3DRNA 2GS3A 3M8NA 3TJGA 4MPFA 4G2EA 3PH9A 5IPGA 1XVQA 5KN0A 4F9ZA 4V2LA 3KH9A 1K3YA 2VD1A 2CA8A 4I2TA 3LQ7A 5J5NA 4ACSA 3MSZA 1QUWA 1FHEA 1FOVA 2LNTA 3F8UA 2YOIA 2EIQA 2YP6A 2LJKA 1N8JA 4EXJA 5DJLA 1ZYEA 4PQHA 1B4PA 2LQQA 3H93A 4KDUA 2VLUA 3QFAC 4KAEA 1WMJA 5G30A 3ZYWA 2C0GA 4TR1B 5IOWA 3TJKA 1A8LA 1OE7A 3MNGA 3QAWA 2IWTA 1HNBA 2B1LA 1K0CA 2AUVA 2N5FA 5ECSA 4TXVA 5DAKA 5ECOB 2B7KA 2LTKA 4XRDA 4ISDA 2VO4A 1FB0A 1A23A 5IPHA 5COHA 3DVXA 4Z7XA 3DD3A 2C4JA 1T00A 5D96A 2K8SA 1YEXA 1Z9HA 4MF5A 3KP8A 3IHQA 2DIYA 2NDOA 1ILOA 4KH7A 2CV4A 4ZILA 2N5AA 2V6KA 3LSZA 3F9UA 3DIEA 1QQ2A 2P5QA 2VL9A 5FWGA 1EWXA 2PVQA 4IP6A 2WCIA 4XRAA 5B6NA 2LKUA 1HNAA 5CO3A 2E7PA 5HFKA 3EINA 6GSVA 2VL2A 1XIYA 3WGXA 1T4ZA 1URMA 4PXOA 2CX4A 3IC4A 2VM2A 4FYUA 1F3AA 2VD0A 1GSSA 19GSA 1BQ7A 4PGTA 3TOUA 1O73A 3MAKA 3APSA 1BEDA 1VF2A 2RM6A 4TXOA 5IM9A 4QL7A 2ZUPA 2AHEA 5AN1A 4EE0A 5IMZA 3R2QA 4IQAA 1EGOA 3DEXA 1OE8A 1B8XA 1QK8A 1EZKA 1FB6A 4GXZA 4MJCA 1NHOA 3EE2A 2E2MA 5HFGA 3IAS2 3RAZA 2JADA 3NIVA 3FHKA 4TKYA 2C0EA 1ZMAA 3GH9A 1ON4A 3A5WA 3W8SA 5GSTA 3LORA 1ZGNA 4ID0A 4JR6A 5DQYA 2F51A 3EURA 5ID2B 1FAAA 4MA9A 2K9FA 4K9ZA 3VURA 3W6GA 4ECJA 4YQUA 5B7CA 3RDWA 4YQMA 2L4QA 2GSRA 5KN3A 4BWQA 2C0FA 4TN8A 2NTOA 2RLIA 2H73A 3ERFA 4IELA 1SL0B 4IS0A 1IYHA 2P5RA 2K6VA 3IBHA 1SYRA 1O85A 3O76A 1W89A 2X8CA 2H74A 2H1AA 1T3BA 4YH2A 3DYRA 2A2RA 4MMMA 1U88A 1PA3A 1X5CA 1HD2A 5HR3A 1PMTA 2FWEA 1K0DA 2B5XA 3FZ4A 2H6XA 2MMZA 4HJMA 5ECQB 5CAXA 1ZL9A 2HE3A 2LRNA 4MF6A 3GL3A 5EY6A 4N11A 2IMEA 3GV1A 1BYEA 2GSTA 2KP2A 3C1SA 4V2MA 5D9WA 3P90A 1TTZA 1TXXA 3L78A 4Q5QA 1MTCA 2MMAA 1FG4A 4WXTA 1OC9B 2B5EA 1S3CA 3GNJA 3QAVA 1OKDA 1DUGA 3J7Yb 1XZOA 3D22A 3WGDA 5IIZA 4ULXA 4F0CA 1O8XA 2PPTA 3TKQA 4EL1A 1JZRA 3FKFA 4TRXA 5B8AA 5DALA 2C3NA 2J23A 3LYKA 4IKHA 4EVMA 1K3LA 3KP9A 3FR6A 2VCQA 4K7IA 3EU4A 4BVYA 4LL1B 3TJBA 2H72A 3VI5A 2H75A 5ENUA 3LJRA 2MBTA 3KMOA 3TRQA 4L5LA 4DVCA 3VK9A 2CX3A 5EVOA 5EL8A 2OKAA 3ZFLA 2ON5A 2RIIA 3KXOA 1YF1A 5H5SA 3APOA 2AV4A 4LA1A 5HQPA 2DJ1A 20GSA 3C7MA 3M0FA 2R4VA 1HYUA 2L57A 4K1FA 3IPZA 3C71A 1M9AA 5DDLA 4XS6A 1GP1A 4JRRA 2PBJA 1XW9A 2I4AA 3DXBA 3IK9A 1JFUA 1HNCA 3U5RE 2GZZA 3UJ1A 2CZ3A 1RK4A 3GHAA 1BG5A 2WJUA 4PNGA 4YQVA 4L5OA 1ZOFA 2R6KA 1AUCA 2F8FA 3M1GA 1XWAA 4L8EA 4NHWA 4WR4A 4HQSA 2V6OA 1JLWA 1LBKA 3EWLA 4TVEA 1AQWA 3H1NA 4J57E 4MJEA 3TB2A 4KUNA 1TW9A 2FWGA 2GSQA 2VUPA 3BD2A 1VF1A 1MD4A 3HJMA 2DBCA 1JLVA 3HDCA 2FGXA 1K0NA 2QGVA 1XVWA 1TI3A 3KH7A 5KN2A 1A0RP 2O89A 2RM5A 1F6MC 5IMDA 3UVTA 5ELGA 5G5EA 2KOKA 3US3A 5EPFA 4O5RA 4YAPA 2CVKA 3D4TA 2L6CA 3WYWA 4AJ7A 2WGRA 2VCVA 1F2EA 3IK7A 5E4WA 3FYGA 1MDJA 1QFNA 4GF0A 1GTAA 3I69A 3CSHA 3GTUA 3QCPA 3H4KA 1Q4JA 3D21A 1LU4A 2HYXA 2FWHA 5G5FA 1JZDA 2B3SA 2PVOC 1FVJA 2HSYA 5ECRB 4KW6A 2IMKA 1GLPA 1U3AA 4CDOA 1Z6MA 1GUMA 1ERUA 1TRSA 5JWQB 3KD0A 1GLQA 4BA7A 3QMXA 2AYTA 1A2LA 1T7PB 5A5KA 3MWHA 1FW1A 7GSSA 1TRUA 4TW5A 2QSIA 3HXSA 3FR3A 4WEYA 1WOUA 2H1DA 2LS5A 4F0BA 3VI7A 1EOHA 2JL4A 3A3TA 2KHPA 5ECLB 3VWVA 4ZBBA 5L71A 2L5OA 4GWRA 4HJ2A 3KTBA 2X8GA 1ZYQB 1PKWA 5LCZA 5J3RA 4ZXGA 1G7OA 1GUHA 4MCUA 3G7YA 3H8QA 1TOFA 5IMCA 2LV3A 5D9VA 1UC7A 2FWFA 4Q5RA 1F9MA 3LXTA 3ZITA 5D9TA 2V41A 2CZ2A 2M46A 3C8EA 4MPGA 2MYGA 3BOAA 3A2VA 4TXOB 2C0DA 2LSTA 4KCEA 4ECCA 1MD3A 2OBKA 2DIZA 2L59A 1X0RA 4KDXA 3UL3A 4OFNA 1SK0A 2H6YA 2B6MA 4ZIJA 2IMIA 4JE1A 1SJIA 1YKAA 4ZB8A 3DMLA 2OJLA 1YKCA 1VF3A 3P8WA 3TKSE 4IQ1A 4AJ6A 2HFDA 2IL3A 1AC1A 2YV9A 1PKZA 3LYPA 1S3AA 3C1RA 4J56E 3HJOA 3EC3A 4DSSB 4XS4A 3LXZA 3HVSA 4NXIA 4HUAA 5AISA 4BWSA 3GIXA 4RQXA 1GRXA 4ZBAA 4KCAA 2OE0A 3DVWA 1UN2A 2XPDA 18GSA 5IQYA 5HFIA 1SKRB 2P31A 4HS1A 5ECHB 5JCUA 2PN8A 5E59A 3HZ4A 4XS1A 2IFQB 11GSA 4F2IA 1J0FA 3F63A 5ELAA 4EKZA 3PR8A 5IO0A 1KBNA 4K7OA 2GSSA 4RI7A 4OWYA 2RUFA 4G19A 4I8BA 3WT1A 1OVNA 3ZMLA 4TR0A 4NV2A 2MMNA 4F03A 1KTEA 1MEKA 5ECKB 4MZWA 2FA8A 4I2UA 1X9SB 2GVPA 1A0FA 3ZFBA 3GX8A 4F82A 3TRXA 4G10A 2C80A 1S3DA 4DSRA 4TR3A 1G6YA 2K18A 4RQRA 3W8JA 1WWJA 2DMLA 1WRYA 4IJ3A 5F06A 1RQMA 4EDYA 2YWMA 2FY6A 1Z7RA 2GQKA 3TKSC 5JCWA 1OC3A 3UVHA 1EP7A 5DALB 1PRXA 4XIHA 1XWBA 3HJPA 3GFKA 3CSJA 1XW5A 1I5GA 1U3IA 3CBUA 1V40A 1K0BA 2GGTA 5CRHA 4CW9A 1SK1A 3ERGA 2H76A 1SENA 4KB3A 2AB6A 4EO3A 3A2XA 1AAZA 3L0HA 3IA1A 3BBYA 1V58A 4I97A 2XPEA 1R7HA 1YEPA 3TUEA 4PQIA 3VPTA 1EGRA 1Z7PA 4MP4A 2HRFA 2LJAA 3GA4A 4V1Ag 4HZ4A 2KP1A 2P0GA 2I3YA 3U6VA 1GUKA 4TR1A 4WKWA 4RI6A 4POLA 2VL3A 3GURA 1THXA 2F3MA 3F0IA 2JZRA 3QFBC 3FK8A 1PX7A 3KZQA 4WBRD 5IOXA 3Q74A 1K0MA 3CTGA 1U6TA 5HR2A 2PU9C 2IMDA 4EUYA 4DEJA 5C00A 3ZIJA 1NW2A 1ERWA 2VCXA 2M80A 4EC0A 3QD9A 4FYBA 3E0UA 2MMOA 1O6JA 2I1UA 2PWJA 5FT3A 2YCDA 3UMAA 4GRFA 2H1BA 1TP9A 1F37A 2HRNA 3F3QA 2LJRA 6GSYA 2H6ZA 3ZIVA 1WE0A 3WGEA 1G7EA 1EEMA 2FHEA 2VCZA 4IBPA 2MZCA 2WDUA 3F6FA 3GRXA 2LEGA 5DQSA 1TDIA 2KLXA 1H75A 2A2SA 3LGCA 5IO2A 1SL1B 5GZZB 1O7UA 4HI7A 3I43A 2PERA 3ZLPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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