3E3EA

Human thioredoxin double mutant c35s,c73r
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPSKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKRMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of human thioredoxin exhibits a large conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords Thioredoxin
total genus 38
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3e3eA00
2FHEA 3TJGA 1USBA 2LV3A 1YDKA 1M99A 5ECLB 5GAND 4ZILA 1O81A 4IP6A 3P2AA 1GSDA 2DJ1A 2G2QA 2REMA 5ECOB 1T00A 3NOFA 2IMFA 1M9AA 4D73A 1M2BA 3G7IA 2NDOA 1K0CA 1PQNA 3P7XA 1EZKA 2QGVA 5DAKB 1HD2A 4MA9A 1CQHA 3ERWA 3UARA 1U88A 3ZVJA 2IMIA 1X5DA 1JZDA 1ERVA 4QQ7A 1GULA 1FO5A 4GLTA 3LEFA 1A0FA 1TOFA 2C0FA 4PGTA 5G2ZA 3F3QA 2DJ0A 4ULXA 4XHMA 2ES7A 4H86A 1THOA 4ZB9A 2FWHA 3GURA 3CRUA 2GT6A 4GCIA 3HVXA 3MSZA 2VL2A 3SBCA 4LA1A 14GSA 5EY6A 3RHCA 5G30A 2VCWA 4PQ1A 3VWVA 2H0GA 1TDIA 4IJIA 1HNAA 2OE0A 2C0EA 3GFKA 5ELGA 5D9XA 3KXOA 1T4YA 2H72A 1SYXA 5HFGA 3HA9A 4KDYA 4KCEA 2K9FA 2E7PA 2A2RA 1PX7A 2P5QA 3FZAA 1XWCA 2MZCA 1O6JA 3D0ZA 3ERGA 1TK0B 3HDCA 3LORA 4XTSA 2K8VA 2YPMA 4IN0A 5CRDA 3N9JA 4MJEA 4EXJA 1OC9A 1GTUA 1Z9HA 2IMKA 2VCQA 1GSFA 1XCCA 2F51A 2OADA 1IYHA 3GKXA 2KLXA 5DCHA 2V6KA 1XWGA 2L59A 1WRYA 4WR5A 5ECRB 3RAZA 4X1UA 4HU9A 5ENUA 1GNWA 3TKSC 4MJCA 2JL4A 5F06A 1SD9A 1DE1A 3ERFA 4V2MA 1B9XC 1SK1A 4KAEA 2VL9A 5ECHB 4MK3A 3HD5A 4PUFC 1JFUA 4G10A 3LG6A 5G1KA 3DIEA 1ZGNA 3DVWA 5IMAA 5DALB 3KH7A 3KP9A 1YQ1A 1TK5B 1K0AA 2H76A 3KMNA 2KOKA 4KDXA 1K0OA 1BEDA 1TKDB 3EVIA 4DSQA 3QR6A 2H75A 5J3RA 5AN1A 1B4QA 4IQ1A 1ZMAA 4F9ZA 3HYPA 1GNEA 3F6DA 2L5LA 4ID0A 2FUG2 1MDJA 4OFMA 5DBQA 1NHYA 4RI6A 3HZ4A 4N30A 4GF0A 3MDKA 1A8LA 5IMZA 1O73A 2X99A 1G7EA 3KZQA 2JSYA 2F8FA 3TJKA 1ST9A 1EV9A 3TRQA 3TCOA 1G7OA 1GH2A 1UVZA 2GDRA 4IGJA 3IE3A 4TXOA 3D4MA 1Q98A 3VI5A 5H5QA 1FVJA 2WFCA 3ZMKA 2B7KA 4JU5A 1YEXA 2MYGA 3IBHA 1A0RP 1MD4A 2HRNA 2JSZA 1J0FA 5HFIA 1A2JA 1SENA 4G19A 2JACA 4HUAA 4E8EA 3NZNA 4BWSA 1M2DA 2VCTA 1JZOA 4KUNA 3WT2A 4ZL9A 3KJYA 4POMA 4GSNA 3Q18A 3G9BA 4WETA 4MP4A 3FEUA 3M9JA 3VLNA 4NPBA 4FO5A 1E6BA 2MBTA 3VPTA 4K2DA 3VWUA 3GV1A 2H19A 2C0DA 2VOCA 1TW9A 3QOUA 2FCHA 3LWAA 4MF5A 1N2AA 3H93A 2O85A 1F2EA 5KEJA 3GSTA 5B6MA 2DIYA 2JZTA 2Z9SA 2VCXA 1GUHA 4DVCA 3LFLA 4DEJA 2LJKA 2PBJA 4IKHA 1WMJA 4Q5NA 3G7YA 3Q19A 2E2GA 2WZ9A 1ABAA 1G0TA 5HR0A 1ON4A 1FB6A 1Z6NA 3GH6A 1NSWA 2JZSA 4PNFA 1BJXA 5J5NA 5B8AA 1BAYA 2VO4A 3DMLA 4ML6A 3K8NA 1H4OA 4Q5QA 5A4UA 2PN8A 4G9HA 4RQRA 1BYEA 2MMZA 2R5GA 1GLPA 1GTBA 3F4SA 2YWMA 4OO5A 2MMOA 1DSBA 3ZMLA 1ZOFA 3L9VA 4OO4A 4EVMA 1K0NA 3ZIJA 2DJKA 3LSZA 2AJQB 5JCGA 1K3LA 5F0GA 5DJLA 11GSA 4MPFA 1F37A 3W8JA 1QMVA 1YJ6A 2CX3A 1EP7A 4HI7A 3DEXA 4X43A 2LEGA 4YQMA 3WT1A 4IQAA 2VIMA 4YH2A 4MZWA 4TOPA 1MTCA 4NHWA 2TIRA 4K6XA 3A3TA 1X5CA 4EDZA 2CQ9A 5ECQB 1GSUA 2M46A 4HQSA 5LCZA 3M9KA 3UBKA 3I43A 4OFTA 1FVKA 2C3QA 3H8QA 2LJRA 2YWIA 2V2GA 3CRTA 5J41A 1Q4JA 1A2MA 4V1Ap 1WWJA 4POLA 1DBYA 2CZ2A 1TP9A 6GSYA 2L5OA 4L5OA 1EOHA 4WXTA 3IDVA 5G5FA 4TKYA 2YV9A 3TKSE 4ZB6A 2H74A 1FAAA 1TU7A 3O3TA 1SL2B 1AXDA 5F07A 3MAKA 3EINA 1TRUA 2H1GA 1RK4A 2OBKA 5C04A 1GSEA 4RUVA 3EMPA 2VM2A 4X0XA 2JU5A 2WB9A 2B1KA 2LNTA 1YKCA 3RPPA 5COHA 10GSA 3F3RA 1XIYA 1FB0A 5EL8A 2LRCA 5A4WA 1B48A 1TTZA 2VUPA 3EURA 2DMMA 3R2QA 4N0ZA 4WKWA 1X0RA 2O7KA 4FYBA 2C3NA 3L9UA 2IPAA 4HZ4A 4KA0A 3RBTA 2E2MA 3FW2A 4HJMA 1BX9A 3FKFA 1SL0B 1JLWA 3M3MA 4G2EA 1TI1A 2YANA 2HSYA 4LL1B 2CV4A 1OKTA 1GUMA 1W89A 1T1VA 1T4ZA 2IWTA 5B8BA 2MBSA 5D9TA 2XC2A 1M0UA 3FHKA 4K7IA 3CTGA 3HVVA 1Y6EA 4QL9A 5IOWA 3UJ1A 3M1GA 3QAGA 1ZYEA 1O8WA 1SK2A 4EC0A 3LQ7A 1V58A 2LQQA 1R4WA 17GSA 1T8EB 4QL7A 1F9MA 2WULA 2OKAA 1VGLA 1X9WB 3ZZXA 1AC1A 1A8YA 4NWYA 4F82A 1PL1A 3TDGA 2HXKA 1B4PA 1G6WA 3BOAA 4KSOA 4KNDA 4HOJA 3H1NA 1SYRA 1GLQA 2HT9A 2B6MA 19GSA 3DVXA 2L6DA 1V2AA 1EEJA 3F9UA 1PA3A 1AQWA 2RUEA 1O8XA 3FR3A 4LLRA 1LJRA 1SU9A 5IMCA 3LGCA 1EWXA 2GZYA 3WD6A 5DQSA 4IHUA 3FZ9A 3IRAA 2VLTA 5D73A 1XWKA 5JWQB 2L4QA 4FYCA 2VL3A 3TKRA 1B8XA 5DDLA 2AB6A 4F0BA 4IBPA 5INYA 2K8SA 4YQVA 3IXRA 1VF3A 3GUSA 4KSMA 1SKRB 1HQOA 2YWNA 2WRTA 1G6YA 4POKA 3FK8A 2IL3A 2JZRA 1M7TA 4O32A 1XVWA 1QGVA 1GSSA 3LJRA 4DSSB 4K0NA 2AYTA 4I97A 1WP0A 1ERUA 2V41A 5AIVA 1GSQA 4Q5FA 3E9JB 4JBBA 4ZXGA 2PGTA 4HJ2A 1I9DA 3QDNA 2F9SA 4JR4A 1A24A 3GTUB 2YZUA 4MLYA 1GTIA 3NIVA 4FIWA 3ME7A 3WGEA 3HJMA 2ON7A 1LBKA 5B7CA 1KTEA 3P90A 1SJ6A 2BTOT 3VK9A 4NAXA 4ZL7A 2CA8A 3VWXA 5DVBA 1Z6MA 1XOAA 2WJUA 1XOBA 4RQXA 5E4WA 3IK7A 2H1AA 3C1RA 1K3OA 3UVTA 1K0MA 2MMAA 4V2LA 1U6TA 4MH2A 5DALA 3Q74A 2B7JA 4KE3A 1UA5A 5ECIB 6GSTA 4J2FA 1AW9A 2XPDA 2YWOA 2RLIA 3FR9A 1OE8A 3CTFA 1T7PB 1MEKA 2CAIA 3EYTA 1VF4A 4TRXA 7GSSA 2LNSA 3CSIA 4HS1A 1QXHA 2G0FA 4O92A 3KH9A 1QFNA 2HYXA 1XPVA 3VURA 5L71A 3TJBA 3CXGA 1SJIA 4J57E 3C1SA 4BVXA 4Z7XA 4YAPA 1GWCA 3EE2A 4JE1A 3A2WA 5AGYA 5HR1A 1W4VA 1MDKA 3E0UA 4YQUA 1XZOA 1EV4A 2FD3A 2DMLA 3GA4A 4ACSA 1TK8B 1YZXA 1WPIA 2L57A 2EIRA 4AJ8A 3TRXA 1WIKA 3TKPA 1TRVA 5ECKB 1E2YA 2X8GA 5JCUA 2BMXA 22GSA 5FT3A 4ZB8A 2YJHA 5A5KA 3IPZA 3HJOA 5ID2B 1ERTA 2VD1A 5ECNB 1K3YA 4OFNA 2GSQA 4OD7A 5IO0A 3IC4A 3P8WA 2H1DA 3UL3A 2AHEA 2GQKA 4EL1A 3TJJA 2DJ2A 4GQFA 5IMDA 3HY2A 4WEYA 3L4NA 3UOMA 1U3AA 2C80A 2HZEA 1S3CA 1EP8A 1ZYQB 3CSHA 5FHIA 1ERWA 1OKDA 2VL2C 1TRWA 4WBRD 2LJAA 1DUGA 4HEA2 3BCKA 3G7JA 3HKRA 2GQLA 2ZCTA 3ZL5A 3ME8A 2WGRA 3WGDA 1EOGA 2I3YA 2L4CA 5H5RA 3WYWA 1QQ2A 3JCML 3D22A 1YF1A 3D21A 4ECJA 2OBIA 3H79A 2FWEA 2CT6A 3GL3A 4NV2A 1XXUA 3KM6A 4CDOA 1WJKA 3EWLA 1KBNA 2N5FA 2LRTA 1HNBA 4MDCA 2CX4A 3ZREA 2B5EA 3FYGA 4WR4A 1AAZA 1A2LA 3EC3A 3UAPA 2GTUA 2EIQA 4IVFA 2MMNA 5CNWA 3QPMA 2X8HA 5ABRA 1PRXA 2VAFA 3C8EA 3TOUA 1J08A 1RW1A 2DLXA 3VWWA 2KP2A 4JEDA 4JR6A 5HR3A 4TR3A 2PVOC 4RI7A 5LD0A 2OJLA 5CRGA 2KP1A 4BPYA 1MD3A 1VF1A 2H73A 4F2IA 1J9BA 2LQOA 5F05A 2DC5A 3KIJA 4AJ7A 3F4TA 4I6XA 4PUAA 2PMTA 1K0BA 3FZ4A 1XFLA 2GSTA 5G31A 3HJPA 3HZ8A 3W6GA 2C8UA 4WBJA 3EU4A 1ML6A 3TRPA 2DJJA 1PSQA 5JWRB 3QMXA 3APSA 3N5OA 5KN0A 3C71A 4PXOA 4KB3A 3M8NA 2A4VA 2QSIA 1XWBA 4IP1A 5D96A 4EE0A 3LXTA 2NVLA 2HZFA 1F6MC 3AY8A 2A2SA 1NM3A 5IMVA 2N5BA 5G1LA 2OACA 5KN2A 2QKEA 4OWYA 3GYKA 3CMIA 2ZUPA 4WF5A 1ACVA 2EIOA 3KMOA 3MNGA 4NHZA 1NW2A 5CRHA 4KX4A 3D5JA 2CVKA 4MMMA 3IR4A 3EU3A 1PMTA 1AQXA 4XS1A 4K7OA 4XS4B 5ELAA 5CO3A 1M2AA 4BL7A 13GSA 3TGZA 3LXZA 4TR4A 2ALBA 3ZVJD 1R7HA 2DSAA 5JCWA 4TR1B 2EC4A 2R2JA 3ISOA 5IOXA 2IFQB 2J23A 5AISA 1EEMA 3M0FA 5FWGA 4HZ2A 3IHQA 1GRXA 5EVOA 2DBCA 6GSWA 2LUSA 1OYJA 6GSVA 3BBYA 3APQA 4OCEA 2L6CA 3QAWA 1TI3A 2IN3A 3IK9A 3GN3A 4NV5A 5HR2A 2PWJA 2WCIA 2C1YA 2CVDA 3GSSA 4EF0A 1XW6A 5IPGA 3CBUA 4ZBBA 3LYPA 5ECPB 3D6IA 4TW5A 2GGTA 3RDWA 2V6OA 2C3TA 4L8EA 3DGQA 3ZFBA 4I2UA 1V40A 5J4UA 1X9MB 3A2VA 1XVQA 2M80A 2PVQA 3I69A 2H6XA 2B5XA 4BVYA 3QFBC 3TOTA 2LKUA 1PX6A 2GT5A 2K18A 2FA8A 2AAWA 2B3SA 2B1LA 2FA4A 2GSSA 3L78A 3TKQA 1I5GA 4AF2A 2IMEA 5EPFA 5CRWA 3L0HA 3KGKA 2TRXA 5DAKA 3TUEA 4XS6A 3QD9A 4OMVA 1JLVA 1WOUA 2GZPA 2OE3A 2H0IA 4K7NA 4J56E 1EGRA 1RQMA 2FGXA 1Y25A 5IQYA 3F4RA 3ZITA 2YP6A 4PX1A 3F63A 4TR0A 3PGTA 2WDUA 1OAZA 2I81A 1XWAA 4I5QA 4MABA 2CAQA 2FWFA 3TJFA 1VRSD 1R5AA 2FLSA 4F0CA 1B9YC 4E8HA 2P5RA 2FNOA 3GIXA 4MF7A 2I1UA 2H01A 1Z5YE 4L0WA 2YNXA 4MCUA 2FY6A 4DSSA 4D73B 4JRRA 4K0GA 4EUYA 2P0GA 1ILOA 3CSJA 3GKKA 2C4JA 1GSYA 3KTLA 9GSSA 5DQYA 1SD8A 4DSRA 1HYUA 3LYKA 5A4VA 4XRAA 2I9HA 2NTOA 4V1Ag 1PD21 3KP8A 5IIZA 3GTUA 4MPGA 4ISDA 12GSA 3FZ5A 3PINA 2YN1A 2K6VA 4GSTA 3KTBA 2LRNA 5CAXA 2H70A 2O87A 4FH8A 3S9FA 4JZQA 2F3MA 1H75A 4HDEA 3J7Yb 4PQIA 3FRCA 4K1FA 20GSA 2XBIA 1HNCA 4XRDA 1SKSB 2N5AA 2PPTA 2BJXA 2VLUA 4IELA 4POBA 3QFAC 2PERA 2R4VA 4EO3A 2GSRA 2AV4A 3MWHA 4GTUA 1M9BA 3WGXA 2GZZA 4IS0A 1SJZA 2V32A 1OE7A 3PH9A 1SL1B 1T3BA 4PQHA 1C72A 3DWVA 4MZBA 2R3XA 1XW9A 3Q6OA 5C00A 1FG4A 1N8JA 2VM1A 5D8IA 1OC9B 1PKWA 5G5EA 2XHFA 2IIYA 5LNKe 4GSSA 2PU9C 4ZBAA 3APOA 1PKZA 1R5PA 2O8VB 1TXXA 4L5LA 2ON5A 2VD0A 3IOSA 2XBQA 3FY7A 3UMAA 4AGSA 2YV7A 4O5RA 2GVPA 3E3EA 2LTKA 1A23A 4IW9A 3GKNA 5CREA 4ECIA 3GHAA 3IAS2 3GKMA 3TB2A 2IJYA 3ZFLA 1TJDA 5ID2A 4MZCA 5KN1A 1KNGA 2GQMA 1GUKA 2I4AA 4P3YB 2YJ7A 4HQZA 1PGTA 3U5RE 1JZRA 3V1WA 5J9BA 2XPEA 3DRNA 4KGIA 2E0QA 4KDUA 1LU4A 1BQ7A 2DIZA 3QCPA 3CYNA 3J7Yk 2F8AA 1WE0A 2LSTA 4NMUA 1KEBA 4ZIJA 5D93A 2QC7A 3ZYWA 1IYIA 4MH3A 2H30A 3ZRDA 3UBLA 4ILFA 4CW9A 3SWLA 1PN9A 2J9HA 4F03A 3ZIVA 3IAM2 2WS2A 3HCZA 4I8BA 3C73A 2B5YA 5AIXA 5H5SA 5IM9A 4N0VA 3GL5A 4TXOB 2LS5A 2VCZA 6GSXA 2TRCP 3VFIA 3KD0A 2HLSA 4BWQA 3F6FA 1QUWA 5F8BA 5GAPD 2YCDA 2IMDA 3ZTLA 4GWRA 4XCSA 3IV4A 4PURA 3RPNA 4ECBA 2HZEB 5D9VA 4TXVA 1Z7RA 5DCGA 5KN3A 4KW6A 1U87A 3BCIA 1YEPA 5GSTA 5IO2A 4XIHA 1AIUA 2D2ZA 2H8LA 1SKWB 4AJ6A 1XBSA 1DE2A 3A2XA 3GMFA 1X5EA 3HXSA 4L0UA 1TRSA 1GP1A 1UN2A 2X64A 1K0DA 4KCAA 5CYYA 1FOVA 2NPBA 1BG5A 3BJ5A 1Z3EA 2V1MA 1ZL9A 2AUVA 1TU8A 4I2TA 4LL4B 3GX0A 2OA7A 1V98A 1ZZYA 4TVEA 2PUKC 3GRXA 4TN8A 3US3A 5B6NA 4GRFA 2DJ3A 2YZHA 3DYRA 3KEBA 1URMA 3ZLPA 2H66A 2HRFA 1SK0A 5GZZB 3GX8A 4LMVA 3F8UA 6GSSA 2H1BA 5ECSA 5HQPA 4KH7A 1FW1A 1THXA 4WF4A 2KHPA 3I6AA 3UIWA 1FHEA 2HFDA 1UC7A 1YKAA 2R6KA 3UEMA 1MDIA 3W8SA 1OC8A 3EMXA 2OE1A 1V57A 1ZCPA 2R37A 3FR6A 2M72A 4Q5RA 5J9CA 3HHVA 2CZ3A 2H6ZA 2RM5A 3DD3A 3D4TA 4XS4A 4YAVA 2C0GA 1U3IA 4CHSA 2NBSA 3O6TA 1PL2A 2JADA 3RHBA 5E59A 2VCVA 1GTAA 4TR1A 2VLVA 8GSSA 3L9SA 1AUCA 1S3DA 2IFQA 1QK8A 3VPQA 4FYUA 4K9ZA 3DXBA 1R26A 4ECCA 3U6VA 1X9SB 4IJ3A 1XW5A 3A5WA 4GQCA 1O7UA 5ECMB 1F3AA 2H71A 16GSA 3KCMA 6GSUA 4N10A 1F3BA 2X8CA 2HI7A 5GSSA 1EGOA 3PR8A 2GLRA 2GS3A 3BD2A 4EDYA 18GSA 3ED3A 5CP1A 4NXIA 2HSHA 3VI7A 3O76A 2FWGA 4ZL8A 3I9V2 4MJAA 4MJBA 4EKZA 2RM6A 5IMFA 2CVBA 5HFKA 2H6YA 1AQVA 2KUCA 5D9WA 2ZNMA 3DKSA 2RUFA 4LMWA 4PNGA 3TKSA 3OR5A 1V9WA 4N11A 1YY7A 1OC3A 1VF2A 5JWOB 1NHOA 4ZBDA 5DJMA 4ML1A 3QAVA 3F0IA 5IPHA 1YF0A 3UVHA 4V2NA 4BA7A 1JHBA 4MF6A 3C7MA 3HVSA 2P31A 4K8MA 2RIIA 2H0HA 1Z7PA 3IA1A 4GXZA 1S3AA 1GL8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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