3EFTA

Crystal structure of the complex between carbonic anhydrase ii and a spin-labeled sulfonamide incorporating tempo moiety
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
256
structure length
255
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Dissecting the Inhibition Mechanism of Cytosolic versus Transmembrane Carbonic Anhydrases by ESR
pubmed doi rcsb
total genus 77
structure length 255
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3eftA00
1J9WA 4R59A 2HKKA 4M2UA 3S78B 4QSBA 8CA2A 1G46A 5JQTA 3RG3A 3T83A 3V3FA 4YX4A 2VVAX 3M14A 2WEJA 1RJ6A 2GEHA 2X7UA 5E2RA 2WD3A 3F8EA 4QK1A 4Q78A 3S76A 3T5ZA 1OQ5A 1H9QA 1BICA 4E9OX 1CNBA 1RZBA 1RZCA 2NNGA 1YDDA 3M1JA 3P58A 3V5GA 1T9NA 3NJ9A 1UGEA 4Z1NA 3P3JA 4RFDA 1IF6A 2WD2A 4Q08A 4WW8A 5FL5A 3B1BA 3F7BA 4Q8ZA 4RUXA 5CACA 3M5TA 2H15A 3MHCA 3RLDA 3B4FA 4WR7A 5E28A 5EH7A 1G45A 3M40A 6CA2A 4XZ5A 4KNNA 2CBDA 4MDMA 1JV0A 4Q7SA 4KNIA 1RJ5A 2Q38A 3S71B 5DSQA 5SZ1A 5A25A 2QOAA 4HEYA 4HEZA 1BNWA 5LMDA 3NI5A 4Q8YA 1FQNA 3R16A 3DCCA 3IBNA 4HT0A 3OKVA 3KOIA 5EH5A 3M1WA 4KUVA 1MOOA 3MNHA 3V3IB 3DAZA 1G48A 5DSPA 3F4XA 4YXOA 1V9EA 4QK3A 3P55A 4RUZA 5EKHA 1ZSAA 1CVFA 1I9PA 4LU3A 1I9MA 4CQ0A 3S73B 1CRAA 4QJXA 4QEFA 2FW4A 4RIVA 2EU2A 4LHIA 1HVAA 4MTYA 3V3JA 2OSMA 5JESB 2NNOA 4N16A 2NXTA 5DSLA 5FLSA 4QJWA 1CVBA 1V9IC 1CVEA 3F7UA 1TH9A 4ITOA 2NNSA 4Q81A 4FVNA 1AM6A 1AZMA 1FSNA 3OILA 3Q31A 3DC3A 1FSQA 4Q83A 3RZ0B 1TEQX 3M5EA 1G0FA 2NMXA 4WUPA 3U47A 3P5LA 1Z9YA 3D93A 3OYQA 4Z1EA 1HEAA 2QO8A 2X7SA 1CNIA 4Q7WA 4E4AA 3HKUA 3MHLA 1HCBA 3RZ7A 4QJOA 1MUAA 5FNKA 2NN1A 3M96A 4BF1A 4FPTA 5HPJA 2FMZA 1BN3A 1G4JA 4FIKA 1I9LA 5EIJA 1IF4A 2OSFA 4FVOA 4QY3A 4Z1KA 3M2NA 4RFCA 4MDGA 4JSAA 5FLQA 3W6IA 5EHEA 3HLJA 3DCSA 5SZ6A 5EKMA 2Q1BA 1BNMA 3T85A 1XQ0A 3T82A 2GD8A 1ZNCA 3KONA 2HFWA 3HFPA 3S74B 1I9NA 5BRVA 4Q0LA 5FNGA 3U45X 1ZH9A 1UGAA 1UGDA 2POUA 4YGKA 5DSRA 1BNNA 3P5AA 5E5RA 2NXRA 3DA2A 4CNWA 4HU1A 3LXEA 4PZHA 5DRSA 5FNHA 1DMXA 4Z1JA 5AMDA 3TMJA 5FLTA 3TVOX 1CIMA 2POVA 4E49A 3S72B 3D9ZA 1IF5A 1DCBA 2H4NA 3U7CA 3T5UA 4Y0JA 3CAJA 4ZAOA 1ZSCA 1KOPA 1ZE8A 2FMGA 2NWYA 4YVYA 4YGNA 3PO6A 3HS4A 1URTA 5DSNA 1CCTA 4CACA 5BNLA 2FOYA 4LP6A 4FU5A 1UGFA 1HECA 1CZMA 3IBIA 1LGDA 4CNVA 2FNMA 5JEGB 5JG3B 4KNJA 3MWOA 4QSJA 1ZFQA 3RZ1B 3M98A 1CAHA 5CA2A 2AX2A 2NWPA 3DVBA 4UOVA 4YGLA 5SZ0A 3GZ0A 1CAIA 3SBIA 1UGCA 1G6VA 4HBAA 3M2XA 5G01A 3EFIA 12CAA 3HKNA 3VBDA 4YHAA 1Y7WA 1HEDA 2EU3A 4HT2A 3M04A 1FR4A 1CAMA 4Q49A 1G4OA 4ZWZA 4MDLA 4R5AA 3SAXA 1RZDA 4C3TA 4Q99A 3M2YA 3QYKA 2F14A 4L5VA 3MHOA 4QJPA 2NWOA 5FLPA 4IWZA 1BV3A 1ZFKA 3UYQA 3P44A 5FNMA 2ZNCA 4ILXA 4K0ZA 2NWZA 2HL4A 3FE4A 4YXUA 4CNRA 1CA3A 4Q06A 1CVDA 3MYQA 5FNLA 4ZWIA 3S77B 1Z97A 3ZP9A 5FLRA 1G0EA 3MNKA 5CJFA 2FNKA 1BZMA 3KOKA 3BL1A 3CZVA 9CA2A 4Q7PA 3PJJA 5SZ5A 4M2WA 4KAPA 3L14A 1RAYA 3M1KA 1RZAA 1BNQA 1LUGA 2X7TA 4MLXA 5BRWA 3HKQA 4KUYA 5JDVB 1CVHA 3MDZA 4MO8A 5JG5B 1CCSA 1JD0A 3N0NA 3RYVB 2WEHA 4CA2A 3SBHA 4K0SA 3DD0A 4BCWA 3MNIA 1CAJA 3MHMA 1I9OA 3BL0A 3RYJB 4YXIA 4WUQA 3NB5A 1YDAA 5DSOA 1TEUX 1HUHA 2W2JA 3OKUA 1F2WA 1CAZA 4XE1A 3MMFA 4ETQC 4Q87A 3D8WA 3MNAA 2HD6A 3N3JA 4HF3A 3M67A 5FDIA 4DZ9A 4QIZA 2ABEA 4YYTA 4KP5A 1CVAA 1TBTX 4JSZA 1LG5A 4JSWA 5EH8A 5DSKA 4WW6A 1H9NA 4XFWA 5EOIA 1KWRA 4FRCA 4Q8XA 3MZCA 4KV0A 1G3ZA 5E2SA 1YO2A 4ITPA 2FOQA 4Q09A 1CVCA 5C8IA 1CNKA 3JXFA 3DVDA 3FFPX 5L3OA 3RYXB 5DOGA 5SZ4A 4M2VA 3V2MA 1TE3X 4ZWXA 1KEQA 1YO1A 3FW3A 4RH2A 2VVBX 4K0TA 1HEBA 1A42A 1CNWA 3DCWA 3T84A 3RG4A 4Z0QA 5DSIA 5FNIA 3HKTA 4YGJA 3S97A 1CA2A 4RN4A 4G0CA 3CA2A 3IBLA 3BETA 4L5WA 4TWLA 5J8ZA 4Q90A 1TG3A 3OYSA 4QTLA 2NNVA 2O4ZA 1FQLA 3KS3A 1UGBA 4KUWA 3RZ5A 2HNCA 2FOUA 5BRUA 1CCUA 1ZGEA 1RZEA 4E5QA 5JEHB 1OKNA 4DZ7A 1YDBA 1YO0A 5SZ3A 3P4VA 3PYKA 3EFTA 3UYNA 1TTMA 2IT4A 4MLTA 3V3HB 4KP8A 4E3HA 2WEGA 1AVNA 4FL7A 2EZ7A 3MNJA 3N4BA 1G1DA 3RYZA 5JQ0A 4QJ0A 1FQMA 3IBUA 5EHVA 4RUYA 4JS6A 5EZTX 5A6HA 4BF6A 1BN1A 1JCZA 4K1QA 3DV7A 5E5UA 5EKJA 2CBBA 1THKA 3N2PA 2ILIA 3KIGA 1BNTA 4L5UA 5E2KA 4JSSA 2FNNA 3S9TA 3M1QA 3SAPA 1I91A 1CNXA 3K7KA 4Q6EA 4GL1X 1KOQA 3JXGA 5FNJA 5FLOA 1G54A 4WL4A 5L6KA 3W6HA 3M5SA 1CILA 2QP6A 1ZSBA 2HOCA 4Q7VA 1FR7A 5DVXA 5G0CA 1BNVA 1XEGA 3P3HA 1IF7A 1CAOA 1ZGFA 5SZ7A 1OKMA 2POWA 5FL6A 3JXHC 3CYUA 3IAIA 2CBAA 2NXSA 4E3GA 3KKXA 1FQRA 4XIXA 3K34A 4ZX1A 4N0XB 4QSIA 3M2ZA 4PXXA 1XPZA 1CNYA 2CABA 1G52A 1CALA 4HEWA 1CRMA 3ML2A 5E2MA 3IEOA 3S75B 5BYIA 1BNUA 5DSJA 4PQ7A 1H4NA 3U3AX 3OIMA 4Q07A 2Q1QA 2AW1A 3D92A 4E3DA 3C7PA 4Q6DA 4PYYA 4TWMA 1TB0X 3RGEA 7CA2A 2WEOA 3S8XA 5DOHA 5FDCA 3MNUA 3ZNCA 3R17B 5G0BA 3V2JA 1I9QA 3RJ7A 4K13A 1HUGA 1FLJA 5AMGA 1LZVA 1IF8A 1YDCA 3ML5A 1HCAA 4YWPA 3OIKA 1CNJA 5CLUA 3MHIA 5G03A 3D0NA 1I8ZA 5AMLA 4CNXA 3V7XA 4COQA 4ZWYA 3DBUA 4RIUA 3K2FA 3DD8A 1I90A 2CA2A 1DCAA 1DMYA 5SZ2A 5JEPB 5DSMA 3RYYA 3M3XA 1UGGA 3KNEA 5FL4A 1KWQA 1CNHA 1IF9A 5IPZA 2FOVA 4ZX0A 1Z93A 4E3FA 1CNCA 1LG6A 2FOSA 2NN7A 1CINA 1XEVA 4KNMA 3TVNX 3RZ8A 1RAZA 1G53A 1TG9A 4G7AA 4PYXA 5JGSB 3KWAA 1FSRA 4QK2A 4X5SA 5EHWA 1OKLA 1CNGA 1EOUA 4QIYA 5JGTB 4QSAA 4M2RA 1CAYA 4XIWA 3IGPA 4QJMA 5E2NA 3KLDB 4YGFA 1CAKA 1CANA 3DC9A 4R5BA 4Q9YA 3V3GB 3OY0A 1BN4A 1BCDA 2CBEA 2CBCA 4IDRX 3DVCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1J9W A;  4R59 A;  2HKK A;  4M2U A;  3S78 B;  4QSB A;  8CA2 A;  1G46 A;  5JQT A;  3RG3 A;  3T83 A;  3V3F A;  4YX4 A;  2VVA X;  3M14 A;  2WEJ A;  1RJ6 A;  2GEH A;  2X7U A;  5E2R A;  2WD3 A;  3F8E A;  4QK1 A;  4Q78 A;  3S76 A;  3T5Z A;  1OQ5 A;  1H9Q A;  1BIC A;  4E9O X;  1CNB A;  1RZB A;  1RZC A;  2NNG A;  1YDD A;  3M1J A;  3P58 A;  3V5G A;  1T9N A;  3NJ9 A;  1UGE A;  4Z1N A;  3P3J A;  4RFD A;  1IF6 A;  2WD2 A;  4Q08 A;  4WW8 A;  5FL5 A;  3B1B A;  3F7B A;  4Q8Z A;  4RUX A;  5CAC A;  3M5T A;  2H15 A;  3MHC A;  3RLD A;  3B4F A;  4WR7 A;  5E28 A;  5EH7 A;  1G45 A;  3M40 A;  6CA2 A;  4XZ5 A;  4KNN A;  2CBD A;  4MDM A;  1JV0 A;  4Q7S A;  4KNI A;  1RJ5 A;  2Q38 A;  3S71 B;  5DSQ A;  5SZ1 A;  5A25 A;  2QOA A;  4HEY A;  4HEZ A;  1BNW A;  5LMD A;  3NI5 A;  4Q8Y A;  1FQN A;  3R16 A;  3DCC A;  3IBN A;  4HT0 A;  3OKV A;  3KOI A;  5EH5 A;  3M1W A;  4KUV A;  1MOO A;  3MNH A;  3V3I B;  3DAZ A;  1G48 A;  5DSP A;  3F4X A;  4YXO A;  1V9E A;  4QK3 A;  3P55 A;  4RUZ A;  5EKH A;  1ZSA A;  1CVF A;  1I9P A;  4LU3 A; 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