3EKZA

Structural characterization of tetrameric mycobacterium tuberculosis fructose 1,6-bisphosphate aldolase - substrate binding and catalysis mechanism of a class iia bacterial aldolase
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
345
structure length
334
Chain Sequence
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGGKLYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNVHGVYKPGNVKLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis for catalysis of a tetrameric class IIa fructose 1,6-bisphosphate aldolase from Mycobacterium tuberculosis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 130
structure length 334
sequence length 345
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ekzA00
4N9CA 3C0JA 3HF3A 4GUFA 3P84A 4O12A 4PL1A 3TUUA 3OVPA 4FX7A 3W2JA 1PL9A 4EF9A 1BWKA 3HPZA 5H2ZA 3KFTA 3NZ1A 2QAPA 1VQTA 3THAA 5HJLA 2WQPA 4JGDA 3HGSA 3GX9A 4C1KA 4XBSA 1R2SA 3RMJA 3L0GA 1Q6RA 5I3KA 4JNMA 4HN4A 3W87A 4WY0F 4AAJA 1DQXA 2GQ8A 3LRLA 1EPXA 1QPRA 3STCA 3P61A 1VHNA 1QO2A 3HG5A 1FBAA 1FUYA 1WA3A 3W1TA 3LI1A 2VFFA 2IQTA 4ZZ9A 4O54A 1O5XA 4MZYA 1ZY9A 2C0AA 3R13A 1IXOA 4O4VA 2ZRYA 1JCYA 3EKZA 3L2IA 2F84A 1EP1A 2EF9A 4O53A 3B8DA 1VYRA 1PS9A 2VELA 2QDGA 1FDJA 3S5YA 4M6VA 4FHAA 5E93A 5AYZA 1ZAIA 4LRSA 2OX1A 2CLFA 2H3BA 3ELFA 3LXAA 3UYCA 3MW7A 4YXGA 3LM7A 3QM3A 5K3VA 2EKCA 4K39A 1KFLA 2CZEA 2YDAA 2H8ZA 2ZRUA 1LORA 1VCVA 2BWGA 3LCHA 1XM3A 1F6KA 1LOLA 3P74A 4W9TA 2CZFA 1GTEA 5G4EA 4UMCA 3K30A 3SIZA 5F4XA 4AWSA 2Y85A 3CC1A 4LTSA 3WJSA 1VRDA 1XL9A 4UNLA 3M43A 3MBFA 3EKLA 2E5DA 3JS3A 1VLWA 1AL8A 2V5BA 2J9ZA 4QJ1A 3QEZA 1YPFA 2I1OA 4U4MA 5BW6A 2W0UA 2CZ5A 2WNZA 5IM51 3C4UA 1P1XA 3C52A 1GOXA 3BLEA 3NOEA 1G4PA 4NXSA 3WJXA 3NXFA 4PH6A 3OBKA 4DO5A 2P10A 4X22A 3STEA 1LRNA 3CTLA 2QUUA 4ZQCA 3QSTA 1A5AA 1ZAHA 3M5YA 2V81A 4K7VA 3MMTA 5HQEA 2YR1A 3L5MA 1O94A 2VFEA 1R2TA 4QSHA 1GT8A 2C15A 5CZ0A 3OHIA 1G67A 1XCFA 4IMCA 2NZLA 1U83A 1SZEA 4IXHA 5IBXC 3W7CA 6ALDA 5D04C 3UQNA 3TMLA 5F4SA 3W83A 3V75A 2QJHA 2ISVA 5F2LA 1W37A 1DJQA 2YX0A 1IIHA 2J24A 1KM5A 1K8YA 3QMTA 4O50A 1IIGA 3QW3A 1LRTA 3ATZA 2Y7DA 3GNDA 2WSYA 4WY0B 2C13A 2Z0IA 1XBZA 1DKWA 4AEOA 4NX5A 3QQ0A 4Z1AA 3KVJA 3QJAA 1F7BA 2ZFAA 2R14A 1GTHA 1L2UA 4NT0A 2FDSA 3W1MA 2CLHA 5KITA 1YXYA 1SO5A 1J4EA 3TAKA 1KA9F 5D30A 4IWWA 4QAIA 2CWNA 3L0KA 1FWWA 2QCLA 3L5AA 3W73A 1F73A 4OGZA 2EGZA 3HPXA 1LBMA 2Y61A 3W7LA 1B3OA 5K9CA 3HGJA 3N34A 2H3DA 2QCFA 4FXRA 1ZCOA 3TSMA 3DHFA 4O1DA 3G0UA 1LYXA 2OT0A 3OA3A 4OQVA 3H54A 4GNJA 1VYSX 3Q58A 4GRSA 5HMSA 2Z1BA 3B0PA 2A7RA 3UWYA 5LKYA 1XBXA 3KVLA 3B05A 2ZZ6A 3BV4A 3M6YA 1EUAA 1N8FA 3W1LA 4UR8A 3TFCA 1G7VA 3CHVA 1JULA 3W2LA 5BMWA 2NX9A 2QCEA 3NGJA 1H61A 3RFAA 3S6DA 1M5WA 3C3NA 5H91A 4ADUA 1VLIA 3NQEA 4UFIA 3O15A 1KLZA 2QCNA 3BG3A 4XBKA 4AH7A 4HNUA 3RNDA 3S5ZA 3DENA 3TE9A 4B5NA 5D02A 4O13A 3NQFA 5D2YA 1VHCA 2ZA1A 3N14A 1HFBA 3G1VA 3LX9A 4A29A 3W1UA 1GPWA 1W31A 3LRMA 4AF0A 4FNQA 2BZNA 2J6XA 1Q6LA 4N6FA 3N2XA 4WZHA 3W70A 3G1HA 3M16A 3TR2A 3P8JA 3A22A 1FQ0A 3THQA 3L67A 2ZTJA 1MO0A 2XFWA 2Y7FA 4ICNA 3SSJA 2WNQA 4N2YA 3TJLA 3C61A 4GBUA 2PCQA 3PG9A 2GJLA 4LV9A 5C2XA 1IXNA 5J5RA 5DELA 3LV6A 4H4IA 2ZDRA 3WK1A 1SUXA 4OV4A 3O8AA 3DH7A 3HOJA 1FXPA 5KZEA 2FJKA 2E5CA 1UJPA 1T96A 4R7JA 4CNPA 3HJZA 2C6QA 3BLFA 4AHQA 1YTKA 2DZSA 5G1TA 1L6WA 2WO5A 4L4MA 1L6SA 2H6RA 3L0NA 2Y70A 2X2GA 3OG3A 4E38A 1XKYA 4NJKA 1WQ5A 4CNNA 2FB3A 4JYFA 1VZWA 3ZWTA 1THFD 4TU1A 1M7OA 3B0UX 1B9BA 2DZUA 1G7UA 4UTLA 1ZNNA 2JBMA 1TPWA 3TJXA 3DFQA 2ATMA 1EP2A 3R2GA 4UC5A 2CLOA 4A3UA 5HWJA 1Z44A 4BI5A 5G2IA 1XFBA 1CW2A 1RD5A 3W7KA 3G3MA 2XN2A 2QCHA 5AFDA 5F4WA 3BGJA 5CPLA 4CCCA 4ZMGA 3UXDA 3LV5A 4NVTA 2A2IA 3GDTA 4Q4KA 1UASA 4CQAA 2XN1A 3MI6A 3F03K 3VNDA 2J27A 1SFLA 5CKSA 1S5TA 2X16A 3W72A 3IVTA 3W1AA 1GVFA 1W8SA 4M7SA 3W1RA 3EX1A 3NO5A 4MJZA 3MHGA 1WX0A 2ZTKA 3NVTA 1LLZA 4HKPA 4AHOA 3E12A 1KLYA 2CLIA 3IVSA 3AO0A 3EB2A 1MEHA 3TK7A 4X2RA 1PCKA 1TB3A 4ZVJA 3HQ1A 4JTSA 5C6MA 4N02A 2VFGA 3U8GA 3W2MA 2E6DA 4NUWA 1FDYA 3IVUA 5AOUA 2C3ZA 1KM0A 3RF9A 5AC7A 1IGSA 1UUMA 4JIPA 5AHLA 2YFNA 3S5NA 1E51A 2FLIA 5L6UA 4N9DA 3PULA 2YFOA 3HB9A 3N9RA 3DXIA 2VXNA 3PB2A 1OYCA 3TC7A 2A1YA 3W74A 4EIVA 1H50A 2V82A 4MY8A 2BLEA 8TIMA 3NQDA 3E02A 4UMAA 4ML9A 3W7PA 1LROA 2LLEA 4XTIA 1B4KA 4MY9A 4MY1A 3MYPA 2TSYA 3CU2A 3TH6A 1H63A 2R8WA 4DELA 4IMDA 3TSDA 1M6JA 4OBTA 1G4SA 4R33A 2VKZG 3EWWA 5AN7A 2PRHA 4HPJA 1P0NA 3C56A 1UBSA 1VYPX 3I65A 3SI9A 4BK9A 3UY8A 1H5YA 2X1UA 2CU0A 3LTPA 2G97A 4IGHA 1K8ZA 5LNUA 2V2CA 2PURA 4XQ6A 3TX9A 3EWYA 1R46A 5AHIA 2CW6A 3GAYA 3KRUA 4ZQOA 4JDYA 3IGSA 4LVBA 3UZ5A 3B0VC 3CB8A 5EA9A 5DXYA 3FFSA 2B7OA 1XDLA 2YSWA 2BTMA 3O63A 1EEPA 3MUXA 1F5ZA 4RZ5A 3EWBX 2HTMA 3W7RA 1BEUA 4LW7A 2YGYA 1EA0A 2WSQA 1KFJA 1GG0A 1SR9A 3HG4A 1AL7A 4K6AA 4Y9AA 4Z1CA 4ONVA 1SPQA 4O14A 5FEXA 4PL2A 4O10A 3T40A 3CPRA 1FWNA 3LI0A 1DBTA 3N2MA 4M19A 2X30A 4TMBA 2WOQA 3GNNA 2DJLA 3A23A 3OVQA 2GUUA 1ZAJA 2H90A 4LUIA 4LU0A 5K4ZA 4RV8A 3P7YA 4L4LA 1W0MA 3UWWA 2YXGA 1WXJA 1OVDA 3FA5A 1XUZA 1SSGA 5G2HA 1LCOA 1AW5A 1SZFA 3TDFA 3P62A 2CLEA 2ISWA 3ANYA 4QNWA 4TX9A 5D33A 4AF0B 2E09A 3MI2A 4K36A 3W1QA 4KFPA 4R53A 4EVZA 2Z6JA 3CLMA 4HIBA 1SSDA 3T7VA 3MP3A 3Q37A 1SW3A 1AG1O 3BO9A 2OMAA 5DY2A 4RLIA 3NQMA 3KHJA 3DZ1A 3P8IA 2VEIA 1W3TA 3IIVA 4FX8A 5C5YA 5D38A 1TREA 4FNUA 3UPBA 1I2RA 3IEBA 2R91A 3W7QA 3O07A 2WKJA 4ADTA 4N9EA 2YCEA 3T55A 1G4EA 3LRKA 2VENA 3FLUA 3S0CA 1VCGA 3G1DA 3GIYA 4QQ3A 4JX5A 1VR6A 3NL2A 3DI1A 2I9EA 2RDWA 3GR7A 3QRHA 2PC4A 1DL3A 3QMRA 5CG7A 1MEIA 5TIMA 4EF8A 3IIOA 1T0OA 2GVGA 3W7HA 1VPXA 1ICQA 3NQVA 3LLDA 1S3HA 4LOCA 5U4NA 3HG2A 4MFEA 1KV8A 2DZTA 3CWNA 1TPDA 4UFMA 5A5WA 1OF6A 1TTIA 1VS1A 1NVMA 1YADA 5D32A 3W7GA 3G1SA 1H7PA 3INPA 4HNNA 3BW2A 2X1RA 4LVGA 1FXQA 5GVJA 1Y0EA 4S2BA 3AJXA 2X1SA 5FF2A 5CPMA 3UWQA 4JX6A 3L65A 1OX6A 3PBWA 3I7SA 3PR2A 4XZ9A 4O18A 5T26A 1GYLA 4UNKA 1HG3A 4PC8A 3UD6A 1KTNA 2A6LA 2VOMA 1I45A 3WJYA 4IPJA 3TA6A 4DF1A 2C19A 2AQWA 1KFKA 3BW4A 5F2IA 2C18A 5HULA 2YW4A 3G1XA 2E1DA 2NLIA 1PHWA 1JRCA 1PV8A 5CPOA 4D2JA 4LWWA 4ZQPA 1P5BA 2ZA3A 4WOZA 3TW6A 3GLCA 1QMLA 3FJLA 2ZRWA 3USBA 2E5BA 1R47A 4XUGA 4NU7A 1PVNA 5CZTA 4A2SA 3PAJA 1DV7A 3O1NA 4ZQRA 3W23A 1XUUA 5I3JA 2QEZA 4NJHA 3RU6A 5MHBA 1HUVA 4MYXA 1QR7A 2W79A 1XXXA 4JY9A 1T8XA 4O57A 2DORA 1GVSA 4EWND 2E6FA 4RJEA 2DP3A 4CQ9A 1TO3A 2JKEA 3W88A 3M44A 1UB3A 4MOZA 5DLCA 4P2VA 1G4TA 4BWLC 3NPUA 1UCWA 3NDOA 3W7EA 2DZPA 1MXSA 4IQLA 1OFBA 5CPNA 1RPXA 1KBJA 3VKJA 5BMXA 3TKFA 3M9YA 1WBHA 3QPZA 1ZENA 2RDTA 4YMZA 4OV9A 2OZ0A 5FEZA 1EWDA 3UWZA 1PE1A 4UTMA 4QM1A 1F76A 2CLLA 5I3HA 5CSRA 5HWNA 2J9YA 1SO3A 2ABAA 3C8FA 4IJBA 1SW0A 3W2NA 5I3GA 3B03A 2WSRA 2JKPA 3PUOA 5HUOA 3VCRA 5K2ZA 3IIXA 5AC8A 4JD4A 4JTLA 1W5NA 3PSVA 3NQ6A 3TNOA 1IF2A 3I6RA 1JCXA 3W9ZA 3YPIA 3W84A 5FEWA 3PC0A 3LDVA 1H7RA 1DORA 3LHTA 4U28A 4BR1A 3LHWA 1W1ZA 5AHNA 1VH7A 4NX0A 2YZRA 2NUYA 3HG3A 4AWUA 5BOOA 1YDVA 3PY2A 1X1OA 4UFKA 3O16A 4DEFA 2Z2UA 3G8EA 4TMCA 1TTPA 2YYTA 2YPIA 3NQAA 2VEKA 1PIIA 1GQNA 3S1WA 5TBOA 1QO5A 1XDMA 4WD0A 4P61A 3Q2DA 3LBCA 5FEPA 3ZS4A 1VC4A 3LLFA 1QPQA 3TQVA 5C55A 1W3NA 1WV2A 2O7QA 1O95A 3VE9A 4UTHA 4UTWA 3QZEA 1HO4A 3EX4A 3DBPA 1JCLA 4UTIA 4LV4A 1GVRA 3ABRA 3ZR4A 3LCWA 1W56A 1TIMA 3DKJA 4LC8A 1FY6A 4GE8A 3DI0A 1GG1A 1JUKA 2P1FA 4O17A 4R34A 5D03A 1A5CA 2A7PA 1NEYA 3LCIA 3BVJA 1XC4A 1QPNA 4WOQA 5EYWA 3LXBA 4XKYB 4X9SA 5KSWA 1MSSA 1GWJA 2AAMA 4RCXA 3QMSA 4OWGA 2OT1A 2ISSA 2VEPA 3KOFA 3JR2A 4BI7A 3NQ2A 6TIMA 3MI3A 1W5MA 3SJ3A 5D05A 2FFCA 5DCDA 1HTIA 3HGRA 2WPBA 1LDCA 1GEQA 1I4NA 4RK8A 3KVKA 1I2OA 3C2VA 3R12A 2DU2A 1VGAA 3L5LA 3HIJA 3P5ZA 1JRBA 3W1NA 3ZWSA 4PODA 3G8RA 4Y90A 4DQWA 3PWAA 1L6YA 4O1BA 4PFMA 3HBLA 3GZ3A 2Y89A 1F2JA 2C14A 3FOKA 3G3DA 3NL3A 1JVNA 4OU1A 4MJMA 5D2TA 5EKYA 4AB4A 4LY8A 3WJWA 4DPQA 4HNVA 1ME9A 1TTJA 2NXIA 4K38A 5BNKA 2FTPA 5KZDA 4O1CA 1I2PA 3CT7A 1JCJA 5FF4A 1LM1A 4DXVA 2VEMA 3RK8A 2PE4A 1EUNA 3W2KA 3SW6A 3ATYA 4FNTA 4KWWA 5EY5A 3P81A 3V1PA 4NZJA 3WFAA 1CX9A 4J9JA 1ZALA 4G1KA 4HHPA 1OHLA 5G5IA 3EXSA 3M47A 1TQJA 3Q94A 5KTLA 1XI3A 1H7OA 3NPXA 5CZJA 5LHFA 4M6PA 1OK6A 3FKKA 5D09A 5FI8A 2B0MA 3W3OA 3BPWA 3SECA 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