3EL2A

Crystal structure of monomeric actin bound to ca-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 118
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3el2A03
1KXPA 3UE5A 2A5XA 3FZLA 1BWFO 3HBTA 2P9IA 3QFUA 3H45C 2YI1A 3WXIA 2A42A 4WYBA 3CJAA 3VGLA 1T44A 3MMVA 3MN5A 4AM6A 2CH5A 2YHXA 3L4IA 2CGJA 3OHRA 3SLCA 3H3OB 2Q31A 3R8EA 3ULEB 1ZC6A 4BRKA 4BRNA 3L0QA 1SAZA 4BRQA 4QS7A 4HTLA 4CZEA 1WOQA 5AQQA 3BUZB 3LDQA 5AQRA 3EKUA 4PKIA 2NZTA 5AQKA 1ZXOA 3BEXA 2YJEA 5CE3A 3HI0A 2GWKA 3R6MA 2P9SB 4CBXA 2KHOA 2YCHA 1RDWX 5BRDA 5AZJB 2W40A 3UKUA 2GUPA 4BRFA 2FF3B 4RWTA 1BG3A 5AFUA 2ZGYA 2A40A 5LJWA 4FWQA 2VWBA 2FF6A 4LC9B 3KVGA 4FOEA 1S22A 2CH6A 3VEWA 3GDQA 4BR5A 5F0XA 4CD3A 3I8BA 2E8AA 4DB3A 4H0OA 1BO5O 2V51B 2QWLA 4H0VB 3EO3A 2P9NB 3ENOA 4PL7A 3JS6A 5AQHA 1KAYA 5KPTA 4IXCA 2HMPA 2PBDA 3IMXA 2P9KB 4FOIA 2QW9A 5E84A 3VEOA 5F1XA 5AQGA 3IFRA 4BGAA 3BF1A 3H1VX 1GLBG 5JLHA 1ZBSA 3C0BA 1IJJA 3O08A 2IVPA 2GTDA 2FSKA 1X3NA 1SZ2A 3O1WA 4WQ5A 3A0IX 1GLFO 5ADXA 4H5VA 1BOTO 2HF3A 4MO5A 3VETA 1DEJA 2P9LA 1T6DA 3WXJA 3AAPA 5BREA 2YJFA 1KAZA 3BP8A 4AM7A 4ISGA 2F9WA 4BRLA 4MLHA 1K8KA 5B8HA 3P4IA 4CZFA 3FR0A 4RCHA 1U2VB 2FSJA 4A2AA 3DWLA 4A62A 4BRIA 1U6ZA 4M63C 1D4XA 4CBWA 4BR7A 4IJNA 2W41A 1G99A 5TKYA 3L6QA 1JCEA 1BU6O 3GE1A 4A61A 3H46O 5LY3A 3CQYA 3GG4A 3H6EA 5EY4A 2FXUA 4XEIA 3W0LA 3WQTA 2P9IB 4EIAA 3VPZA 4IZ9A 1ATSA 1GLEG 4BR2A 4E1JA 1TUUA 1NBWA 2Q0UA 4O8KA 3IUCA 3QB0A 4XH4A 5AQLA 3F9MA 3VEZA 1IG8A 1XQSC 2FLOA 4BR0A 5AQYA 3DJCA 4H0XB 2D0OA 3D2FA 1ATNA 3ZX3A 3H1QA 3BF3A 2QWMA 3LM2A 1GLJO 4B1XB 4H0TB 2IVOA 4JN4A 3LDLA 4IWVA 2E88A 4NO7A 5BPMA 5KPRA 4I6MA 1HUXA 2E2PA 4H0PA 4M7XA 3QFPA 4BC4A 3ZEUA 1H1VA 1E4FT 3CI5A 3QBWA 1ATRA 2E20A 2CGKA 3MN7A 2CGLA 1HPMA 1RGIA 2PAVA 4FWRA 5AQZA 1NGAA 3VGKA 2P9PA 2A3ZA 1NGJA 4BG9A 1MDUB 3VEXA 4JHDB 2QXLA 3FZKA 3VEVA 1R59O 3G25A 3MN9A 3ZX0A 5AQSA 4FWPA 3CJ1A 1NGFA 3UKRA 3LDPA 1YAGA 4HWIA 1HLUA 4MO4A 4J8FA 1QQOA 3FGUA 1DGKN 2QWQA 5AQUA 4A2BA 1ESVA 3A5MC 3U8XA 3WT0A 3EKSA 3CJ7A 5AQJA 3RSEA 3S41A 5JICA 4ISFA 2AA4A 4B9QA 2FSNA 3VENA 4GY2B 3DXMA 4FWKA 4WQ4C 4BRMA 3IDHA 2ASOA 2DPNA 3O8MA 1LOTB 2VCPA 4H5TA 3FZFA 5BR9A 3WEEA 5FPEA 4NB4A 4H0YB 1Y64A 2ASMA 2V7ZA 2QWNA 5AQVA 4BQLA 2YHWA 3DXKA 1HKCA 3EN9A 3KZBA 5KQ8A 4BC2A 3MDQA 2P9LB 3FZMA 4JNEA 4YDUC 3ZX2A 4B1UB 4IJAA 2NLXA 4BR4A 1XUPO 1K8KB 5AFUH 3VGMA 1BDGA 2Q2RA 4GNIA 2I7NA 3O1BA 1V4TA 4BVOA 3M1FA 1TYQA 4CZGA 4BRGA 3W3DA 5AZJA 3DAWA 4H5RA 3SK3A 4K25A 4FO0A 4CZIA 2IIRA 2P9UA 2ZWHA 5BN8A 3M3ZA 3WXLA 4FWOA 3HZ6A 5AQPA 4WQ4A 1JCFA 4EHUA 3M6GA 3SMPA 1S3XA 2ASPA 4B1VA 4KBOA 2Q36A 2VYPA 3CERA 4K41A 3FLCO 2ITMA 4B1YB 3VF2A 3WUHA 3QDKA 3CJCA 3U9DA 2GEMA 5BRHA 1GLDG 4QS9A 4BRAA 3AARA 5BN9A 4RTFD 4BC3A 1NWKA 3B8AX 5ADXH 3D2FB 3O80A 1QZ6A 4BR9A 4FWMA 5LJVA 1BA1A 1GLLO 3GOIA 4BGBA 4B1ZA 3AAQA 2J4RA 4BRDA 2E1YA 3ATUA 3LM9A 2HOEA 5AQIA 1SQKA 3LL3A 5EX5A 4I6MB 4JD2A 3A8YA 4DQ8A 2E2NA 2Q1NA 1LCUA 1V4SA 2E1ZA 3MK6A 3ZEUB 4CD1A 1NGDA 3O4WA 3U9ZA 4BVPA 4CZMA 3CJ9A 3GL1A 3R9PA 3ENHA 5FPMA 1XC3A 2P9PB 3ATVA 5EXWA 1HKBA 5AQOA 3AY9A 4XH1A 4FWSA 4BREA 4MLEA 1YUWA 2A6AA 4O5FA 4H03B 2HF4A 4CZJA 5AR0A 2ZF5O 4H5NA 3UKRB 5AZIA 1HKGA 1U2VA 2Q97A 4K43A 3D2EA 1C0GA 5E26A 3MN6A 1WUAA 3UKUB 5AQWA 3D7EO 2V52B 4M7YA 3RSEB 1MA9B 2NRHA 1DKGD 3C7NA 1QZ5A 5BPNA 4Y0WA 1Z6RA 3DXMB 3ZETA 3O6WA 1QHAA 3QMLA 4L3QA 2BTFA 3WEEB 3FZHA 1E4GT 3JXUA 2QWPA 4EFHA 2QM1A 4H5WA 2BUPA 1NGCA 5JLFA 4PKHA 3DXKB 3EL2A 4BRPA 5BRFA 3GBTA 4DHYA 3VEYA 3I33A 2D4WA 5AQNA 1HJOA 3VERA 1BUPA 1NGBA 5I9EB 4IO8A 5FPNA 1TUYA 1X9JA 3MCPA 4WQ5C 3HTVA 3KHYA 3A5LC 1TYQB 2QWRA 3J8AA 4CI6A 3VF4A 2H3GX 3ULEA 5EOYA 2E2QA 2P9UB 3TU5A 4CZLA 1MWKA 3VF6A 4FSVA 4JHDA 5BPLA 4BQZA 3HM8A 3WXKA 3EZWA 4PL8A 1HX1A 3CETA 2P9SA 4CZKA 2EWSA 2YHYA 2A41A 3CIPA 1JCGA 1YVNA 3HSCA 3FFKB 3O5BA 4QS8A 1NLVA 5EVZA 3WQUA 3H3NO 1CZAN 2GWJA 1NGGA 5AQFA 1GLCG 5AQTA 1QQNA 4JAXA 2OANA 3LDNA 4B1WB 1NGIA 1NGHA 4JD2B 3QICA 3CQXA 5ELZA 1EQYA 4EAHD 2D0PA 2P9NA 5KPZA 4K42A 4FPAA 1Z05A 1KAXA 2V7YA 3U4LA 3SJHA 4YDUA 4FPBA 4ISEA 2F9TA 2P9KA 3LDOA 4PKGA 4FWLA 1Q18A 5AQXA 4XH5A 4FL9A 1MWMA 5JMVA 2D1KA 5AQMA 1YXQA 3CHWA 4BROA 5FPDA 1X3MA 2WUSA 5AZIB 4DCHA 1RFQA 1J6ZA 4BRCA 4BC5A 5KQDA 3D2EB 3ID8A 1NMDA 4F9OA 1T6CA 4BG8A 3UB5A 2I7PA 3TPQA 2ZGZA 2Q0RA 3VOVA 2GELA 1GLAG 1OKJA 3FE1A 3A5OC 1C0FA 1NM1A 3VESA 1QQMA 2QWOA 3C7NB 5F2RA 4BRHA 2AP1A 4CJ7A 2E2OA 3CJBA 2UYTA 3ZETB 4Z94A 2IVNA 3A5NC 1NGEA 4FWNA 3QBXA 1BA0A 4C23A 3SMSA 4EHTA 1P8ZA 4CZHA 4CBUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UE5A 1Q7YO 4YY3K 4CIEA 3S3MA 3VQ9A 2P5GA 3FZLA 4DLEA 4FJLA 2GUIA 3VQDA 1K8AO 2KFZA 1XHZA 5GADP 2O4IA 4DTNA 3CJAA 3JAMO 3VGLA 2NUBA 3VA0A 1YT3A 1WNSA 2CH5A 3L4IA 2CGJA 4DSLA 3SLCA 3H3OB 2Q31A 1CZBA 2RPIA 1B92A 4MDBA 3L0QA 4O0JA 1KVCA 1JXEA 3K59A 4CZEA 3LDQA 4E7KA 4FJGA 1KRPA 2NZTA 2YJEA 5M1FA 3HI0A 2P9SB 4E1MA 4C8KA 2YCHA 1RDWX 5AZJB 4BRFA 4FJ5A 3DI6A 4RWTA 1BG3A 2ZGYA 1Z25A 3F5TA 2RF2A 4LSLA 2E6LA 4BE7B 5F0XA 4DFKA 2E8AA 3THXA 3AVAA 2V51B 2QWLA 4OPHA 4DTMA 1W7AA 3RRHA 2HBJA 1IBKK 4DV1K 1VQ6N 2PBDA 3OJUA 5JVGL 3QEVA 1J5EK 3AA5X 2JWLA 3NDKA 2YX6A 4KRFA 4CEFA 3VEOA 1Y97A 4QOZB 3IFRA 4BGAA 1KTQA 3H1VX 3BZKA 3I55N 4FJNA 2YHBA 4BE0A 3C0BA 3CYMA 2KQ2A 4N5SA 1X3NA 4WQ5A 3QETA 3QIOA 3KLGA 1C1BA 3R3LA 1BOTO 2HF3A 3WXMB 1OH7A 3VETA 1T6DA 1DLOA 3ZSVA 5BREA 1YVUA 5IWAK 4CFAA 3SI6A 4BRLA 5B8HA 4JI6K 4DTSA 4J2DA 2ZE2A 1FK9A 1NK5A 1SKSA 4RCHA 5C24A 3LANA 2OYQA 5I42A 4FK0A 2FSJA 4A2AA 3KLEA 2G8FA 3HYFA 3DWLA 3T69A 4A62A 4JI1K 4M63C 4CBWA 3I0SA 1W97L 3CCRN 1C6VA 2W41A 1G99A 5GAEP 4E7HA 2P5OA 4GV3A 4LH4A 5EY4A 1EWQA 1HYZA 3TARA 3SJJA 4DU1A 1ATSA 4KTQA 3OYIA 3SQ0A 1DTQA 3G71N 3VN5A 4MDAA 2F96A 3HO1A 3F9MA 2FLOA 5M1QA 1VSJA 3TAQA 5LL6Z 3D2FA 1ATNA 2KTQA 4CJKA 3MXMA 2HNZA 2O8EA 4JN4A 2E88A 4M3ZA 2E2PA 2EX3A 3V9XA 4QCLA 3RRGA 2PZSA 4V19S 1WAFA 5BR8K 4KFBA 1KSPA 1T7PA 3RWUA 1H1VA 3CI5A 3QBWA 4LY7A 1LWFA 4PHTX 1NGAA 4JV5K 3D0PA 4BG9A 3HOTA 3A2FA 3CFPA 4DMNA 2E4LA 3VEXA 1SS6A 3DRPA 4JHDB 1DTTA 5LMNK 3FZKA 4WE1A 1R59O 4FJ9A 1JLCA 3DOKA 3ZX0A 2BANA 4FWPA 3CJ1A 3UKRA 4ZTJA 1YAGA 3THXB 1HLUA 1O13A 4WFAL 5I3UA 2G8HA 5AQUA 4A2BA 4CEAA 3VQ8A 1W2BM 1ESVA 3OYDA 3CPEA 5JICA 2X74A 4AHCA 2AA4A 3O4NA 4DUZK 1EP4A 1D5AA 1FJGK 3NF7A 3TR8A 1NNEA 4BRMA 2ASOA 2DPNA 3O8MA 1U4BA 4B9SA 4CEBA 3DYAA 3WEEA 5FPEA 1RT2A 4H0YB 2X6NA 2ASMA 4CF2A 2X6SA 5C25A 1WB9A 2OPQA 4AHTA 5KQ8A 3DLBA 3VQBA 2BDPA 4YOWA 4ICLA 4DSFA 4R5PA 4FJ7A 5AFUH 4ID5A 4JKGA 2I7NA 4OGEA 2D0AA 3OYJA 1V4TA 4NLBA 4BVOA 1TYQA 4FVMA 4JI0K 3CC7N 4KHSA 2YNGA 2P9UA 5BN8A 3SPYA 3CG7A 2Z1JA 4HUFA 2I5JA 1NJIO 4B3RK 3SMPA 2ASPA 4OKEA 1B9FA 3IKMA 3TSPA 3PX0A 3U9DA 2GEMA 2P51A 3HM9A 4CHOA 4AHVA 3NH1A 3AARA 5HRSA 1BCMA 1RT5A 3MXIA 1W0HA 3D2FB 3PX4A 2OZSA 1RBTA 3ZSWA 3CC4N 5J2MA 1WBBA 3L8BA 3AAQA 4BRDA 2O8EB 5AQIA 3R1XA 1RTDA 4JD2A 3A8YA 4DQ8A 1Q9XA 1QHTA 1L3UA 4JEPA 3MK6A 1D9FA 3U9ZA 3ZLJA 3CJ9A 3R9PA 2O8DA 2RKIA 4OPJA 4BWMA 3SPZA 4B3OA 5AQOA 3NGIA 3OS1A 2WBNA 2G8WA 3O9SA 4O5FA 2ZF5O 4C8MA 4H5NA 3UKRB 2HVHA 1HKGA 1S6QA 4BEBA 1S9EA 4DQPA 3MN6A 4KHNA 2OPRA 1JKHA 2HHIA 3D7EO 5MLCQ 3TAPA 4DV7K 2NRHA 3CYGA 4DV0K 3CCQN 4CIGA 3O4QA 5BPNA 4DQRA 1Z6RA 3PUFA 3TAMA 4JI5K 2BTFA 3WEEB 1JLFA 3LAMA 4EFHA 1NKCA 2BUPA 1KVAA 4AH9A 1OH6A 4YOTA 5HOOA 3E9OA 1JLQA 4BY9C 4JKGB 4DFJA 5K14A 3SV3A 4O8UA 3MWTA 1TYQB 2F7TA 2UUBK 4B9UA 1XHXA 3J8AA 3G4SN 3SCXA 1HNVA 1RDCA 2H3GX 3ULEA 5C2DA 2P9UB 3TU5A 4CJVA 1ASUA 4H4OA 3UIQA 2DFFA 4FSVA 2O8BB 1BISA 3WXKA 3AVFA 4GMJB 3EZWA 1U45A 3T1HK 4FLYA 3CETA 3RTVA 3EY1A 2YHYA 3DLKA 1QTMA 2C1GA 2A41A 1SL0A 2HB5A 1QVGM 3SAGA 3QO9A 2W42A 1T05A 4C1NK 3C65A 4OPAA 1TKTA 5DK5A 3CMAN 1GLCG 5AQTA 1KVBA 3QERA 2OANA 1RT1A 5M1KA 1NGHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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