3EL2A

Crystal structure of monomeric actin bound to ca-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
total genus 118
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3el2A03
1WUAA 2FF6A 3M6GA 4O5FA 3ZETA 3M1FA 5KPZA 3I33A 1NGCA 5ELZA 1TUYA 5ADXH 3CJAA 3GG4A 3U9ZA 2VCPA 1WOQA 4JNEA 2EWSA 4QS7A 1ZBSA 2FF3B 3FLCO 4HWIA 1LCUA 3LL3A 4B1UB 4J8FA 3WQTA 2HF4A 3ATUA 3GE1A 3AAQA 2A42A 3LDOA 4H5VA 4JHDB 1NGFA 3UKUB 5BRFA 3GOIA 5AQXA 3SK3A 5FPEA 4AM7A 1NGBA 4BRIA 4H5RA 1K8KA 2FXUA 4QS9A 3VGLA 1HJOA 1NGAA 1QQNA 4BRKA 2FSJA 3KZBA 2ZGYA 3LM2A 4B1XB 2E2QA 5E84A 5B8HA 1XC3A 5BPLA 4H0OA 3ZEUA 3L4IA 3LM9A 3VETA 2ASMA 5ADXA 4BRDA 1ESVA 3VF2A 3VEWA 4XH5A 4BRAA 2P9UA 3MN6A 3GBTA 4GNIA 1X9JA 3QDKA 1ATSA 4B9QA 3HBTA 5AQSA 4K41A 1Q18A 4RTFD 1HLUA 2PBDA 2DPNA 3CJCA 4L3QA 1J6ZA 3B8AX 5AR0A 1NGEA 3DXKA 2FSNA 3HSCA 4B1VA 3QMLA 3EZWA 4M7YA 5AZIB 3DJCA 3VEZA 4WYBA 4H5NA 4IWVA 3H45C 3VEVA 1NGIA 1MA9B 4EHUA 1T6DA 5BPNA 4IZ9A 1TYQB 2P9PA 3D2FA 2J4RA 3CJ1A 4B1YB 2ITMA 4CZFA 1IJJA 3DWLA 5EXWA 3QB0A 3FR0A 3O1WA 4FOEA 4LC9B 1XUPO 4CZMA 2OANA 3D7EO 5KQ8A 4FWQA 1IG8A 4CD1A 3VEXA 1GLFO 3FZHA 3VGMA 4CD3A 1G99A 2D0OA 1X3MA 2P9NA 1U2VA 2IVOA 2Q2RA 1S22A 3QBWA 4IJNA 4IO8A 3ULEB 4BG9A 3H46O 4E1JA 3C0BA 3O5BA 3VEOA 2YJFA 4MLHA 3O4WA 4CZHA 1NMDA 5E26A 3FE1A 4A2BA 3O8MA 3EN9A 1V4SA 1BA0A 3WEEB 5F0XA 3UKRA 4EFHA 2NRHA 4JD2B 1GLDG 4BVOA 4PL7A 3W0LA 4BRQA 4FWMA 3CERA 4BRGA 1NGHA 3VEYA 5EVZA 3FZFA 4FWNA 3ENOA 2V51B 3MCPA 4ISEA 3CETA 5AQPA 4BC3A 3LDQA 5JLFA 2VYPA 3MK6A 4BR5A 4GY2B 3HTVA 5LJVA 1HKBA 1RGIA 4FL9A 1YAGA 2QWLA 4FWKA 5JLHA 4KBOA 5AQKA 3A8YA 4Z94A 2AA4A 4BR9A 5F2RA 4BG8A 4JHDA 4H5WA 4FWPA 3UKUA 3JXUA 4CZJA 3F9MA 4B1WB 2KHOA 3W3DA 4BRPA 3P4IA 2GWJA 3BP8A 2I7NA 4CZGA 2QWOA 2QWRA 3J8AA 5AQIA 4A61A 3AAPA 5AQOA 2P9LB 1X3NA 4BR2A 3VERA 5FPDA 2E2OA 4WQ5C 1TUUA 1T6CA 4FPBA 3A5MC 2V7YA 3FGUA 2E8AA 4BQZA 3CJ7A 1Z05A 2P9KB 2P9IB 2A5XA 3HZ6A 2A6AA 5AQJA 3EL2A 1GLEG 3DXMB 1YVNA 4BRFA 4BRHA 2BTFA 4RCHA 4EHTA 3GDQA 1KXPA 5FPMA 4HTLA 4FOIA 5AQHA 3R6MA 5CE3A 3H3OB 2E2NA 5JICA 3D2EB 4BC5A 3IMXA 3RSEB 2H3GX 3BUZB 5AZIA 1HX1A 2VWBA 3ZX2A 1JCGA 4EAHD 4DQ8A 1Z6RA 2CGJA 5JMVA 3WQUA 3AY9A 1TYQA 4CJ7A 4H0PA 3OHRA 3VPZA 1T44A 5AQLA 1HPMA 3WT0A 4WQ4C 2CGKA 1C0GA 2IVNA 4H5TA 3O08A 1KAZA 2QW9A 4I6MB 3QBXA 4BQLA 1KAXA 4NB4A 3EKUA 3R8EA 5FPNA 2GWKA 3CHWA 4XH1A 4EIAA 3CJBA 4H0XB 1QHAA 3H3NO 4XH4A 3LDPA 4FWLA 3IUCA 1QQMA 2D1KA 1NGDA 5BR9A 1DEJA 1OKJA 3C7NB 4M63C 1NGGA 3G25A 3WEEA 1BU6O 4FPAA 4JD2A 1NBWA 4XEIA 3TU5A 3A0IX 3CQXA 2Q0UA 4FSVA 4BR0A 3L0QA 3A5OC 2BUPA 3LDLA 1JCEA 3O80A 1S3XA 1QZ5A 3I8BA 3HI0A 4H03B 2YHWA 3D2FB 2FSKA 2CH5A 2D0PA 2PAVA 4CBXA 4DB3A 2YHXA 5AQWA 4CZLA 2YHYA 4BRLA 1Y64A 5BREA 3M3ZA 4H0TB 5AQGA 1HKGA 4BR4A 3SMSA 1QQOA 3H1VX 2Q1NA 3EKSA 3ZX0A 2QWQA 2Q0RA 4O8KA 5F1XA 2HMPA 2YCHA 5EX5A 2Q36A 2Q97A 2E20A 4QS8A 1YUWA 1R59O 1SAZA 3O1BA 1NM1A 4MLEA 5AQTA 4K43A 4DCHA 3A5NC 4FWRA 2P9NB 1BDGA 2WUSA 3BF3A 4BC4A 2QXLA 5AZJB 3WXIA 2F9WA 2AP1A 5EOYA 3VF4A 1EQYA 2CH6A 1BUPA 2W41A 3UB5A 2P9LA 2NLXA 3KHYA 2E1YA 3H6EA 5BRDA 4BROA 3QFPA 5BN9A 3WXLA 5AQQA 3ENHA 3UKRB 4RWTA 5I9EB 1BO5O 1YXQA 2P9KA 3JS6A 4B1ZA 2P9IA 3SLCA 4H0VB 3BF1A 1H1VA 3KVGA 3MMVA 3FZLA 1U6ZA 3DXMA 4AM6A 1CZAN 2V7ZA 3FZKA 4PKHA 4C23A 4BVPA 4PL8A 2ASOA 4Y0WA 1GLCG 3D2EA 1RDWX 2NZTA 3U9DA 2P9SB 3RSEA 4H0YB 5AQFA 2A41A 3WXJA 4BRMA 1C0FA 1ATNA 3IFRA 1LOTB 3QICA 4BC2A 4BR7A 3WXKA 1MWMA 2V52B 1E4FT 4PKGA 4BGAA 1GLLO 1BA1A 2YI1A 3ZETB 4CZEA 3MN5A 3FZMA 1BOTO 4FWOA 1DKGD 1ZXOA 3O6WA 3AARA 5AQMA 3QFUA 3VENA 3IDHA 4CBUA 4I6MA 1NLVA 4ISFA 5AQVA 5KPRA 3CJ9A 1GLAG 3SJHA 3DAWA 5TKYA 1ZC6A 4K25A 5AQZA 1K8KB 3UE5A 1E4GT 3A5LC 5EY4A 2UYTA 4YDUA 3H1QA 2HF3A 1V4TA 5AQUA 3U4LA 2ASPA 3FFKB 2GUPA 3CQYA 4IXCA 3ZEUB 3C7NA 2CGLA 4F9OA 2IVPA 1HUXA 2W40A 1BWFO 1NWKA 3CI5A 5BPMA 4BREA 1BG3A 2P9UB 3ULEA 2I7PA 3CIPA 1JCFA 4PKIA 5AFUH 2ZWHA 1NGJA 1QZ6A 5LJWA 3VESA 2QM1A 1D4XA 4BGBA 3L6QA 3ID8A 5BRHA 3DXKB 4K42A 3WUHA 2E2PA 4FWSA 1GLJO 2QWMA 4NO7A 2ZF5O 3MDQA 1RFQA 4WQ5A 3VGKA 2Q31A 4JAXA 3VOVA 4JN4A 2YJEA 1SQKA 3R9PA 1MWKA 2A40A 4CI6A 2GELA 4DHYA 2P9PB 3MN7A 5LY3A 5KQDA 3ATVA 4BRNA 5AFUA 2FLOA 4CZIA 4M7XA 5AZJA 5KPTA 4CZKA 2D4WA 2ZGZA 2GEMA 5AQYA 4A62A 1KAYA 5AQRA 3EO3A 3BEXA 4ISGA 3ZX3A 3TPQA 4A2AA 2HOEA 1MDUB 4MO5A 2F9TA 1U2VB 3S41A 2A3ZA 2E1ZA 1HKCA 4CBWA 3HM8A 2QWNA 1SZ2A 2E88A 4YDUC 1ATRA 1GLBG 5BN8A 4FO0A 3GL1A 4MO4A 3U8XA 3LDNA 4IJAA 3VF6A 2QWPA 4WQ4A 3MN9A 3SMPA 5AQNA 2P9SA 1XQSC 4BRCA 2GTDA 2IIRA 1DGKN 1P8ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FF6A 5CZ2A 4M3UA 1VQPN 3OYCA 1U45A 3U9ZA 3E66A 4JNEA 3KKRA 4JK8A 4BE7B 3I0SA 2KW4A 3K0SA 4H4MA 2BGGA 2PYLA 1JLAA 4ICLA 3T3FA 3SPYA 1WBBA 3HYFA 1NGBA 4BRIA 3S3OA 2O8CB 4LSNA 2YHBA 1HJOA 2RKIA 3T19A 1ZYQA 2FSJA 4DFPA 5M1NA 1RTHA 3RR8A 3L4IA 2ASMA 3O9SA 1Q82O 1NJXA 3VEWA 4BRAA 3NH1A 4OO1J 2HVIA 3WNEA 2QI2A 3PSIA 1ATSA 2X74A 4B3TK 4FJMA 3HBTA 4K41A 1HLUA 1N6QA 4BECA 1IKYA 3DOKA 3HSTB 3CJCA 1J6ZA 3B8AX 3QNOA 4Q0BA 4LF6K 1TAUA 3TI0A 2RN2A 3DXKA 1C0MA 3MWTA 1L3UA 4NCBA 3EE8A 3ZSZA 1NJYA 5AZIB 3DJCA 1HMVA 1SV5A 3JAMO 3THXA 1NJWA 1EKEA 4WYBA 3H45C 5K14A 3VEVA 1NGIA 5BPNA 2Q3SA 3CM5A 4IDHA 3CD6N 1QSYA 3V9ZA 3AA3A 5EXWA 2BE2A 4B9LA 3QB0A 4FJKA 4DV7K 3B6PA 1Q81O 1X9MA 4LC9B 2G8UA 3LWLA 3D7EO 1OH6A 5KQ8A 1VSDA 3HJFA 4FWQA 1GLFO 3RRHA 3TAQA 4CHYA 1S22A 4QOZB 4BG9A 2ETJA 3T7ZA 1WSJA 4E1JA 4OGCA 3D0PA 2YJFA 2YKNA 4MLHA 1J5EK 4A2BA 3O8MA 5F0XA 1V4SA 1BA0A 1VAZA 3UKRA 3PX0A 1GLDG 4BVOA 1HRHA 3L4QA 1HR0K 3HT3A 3TAGA 3CERA 3C6AA 3MCPA 4ISEA 4BC3A 3LDQA 4E19A 4BR5A 4GY2B 3HTVA 2G8VA 4FL9A 4CJPA 3CFRA 1IV0A 4KBOA 5AQKA 2YNGA 2ZD1A 4FZYA 3C65A 3ZSOA 2VGMA 3T1YK 5C10A 3L2UA 2NRRA 4L8RB 3CPEA 1RT7A 4FWPA 4H5WA 1OVQA 4CFBA 4DUYK 3W3DA 4BRPA 3P4IA 1YHQN 1T8EA 3VTHA 3E01A 4DTUA 3BP8A 3SUOA 1YI2N 4A61A 4CFDA 5CY4A 3AAPA 4CE9A 5AQOA 3G71N 2P9LB 1X3NA 4CK2A 3VERA 4X65K 1WSEA 4UQGA 2E2OA 2KFNA 4FPBA 3V9XA 3SYZA 3AO2A 4JI4K 3AVJA 2OZMA 1WNSA 1IKWA 4IFYA 4KHYA 3DXMB 1YVNA 4BRHA 2HHTA 3GDQA 1JL2A 4FOIA 2DTUA 3R6MA 4FW2A 4F2SA 2E2NA 4DU1A 3OBYA 1KFSA 4BC5A 3IMXA 2H3GX 3BUZB 2VWBA 3ZX2A 5CR4A 3TAPA 4DQ8A 3J7ZO 3CCRN 3TR8A 1A5VA 1OH5A 3WQUA 3HOSA 1T44A 1XNRK 3WT0A 4J2BA 2CGKA 3KK7A 4OKEA 2G8KA 3ASMA 1Z25A 2OPPA 4NB4A 3R8EA 3VQ8A 4DSEA 3CHWA 2IC3A 4FK2A 4FK4A 4J2EA 3LPTA 3CJBA 4H0XB 1IBMK 1OVYA 4JKGB 4IEEA 1QQMA 4ILHA 2D1KA 2G8FA 1HNIA 1OKJA 3C7NB 3ZT0A 4KB1A 4YORA 1BQMA 3G25A 4JI7K 3L2WA 4CEQA 3LPUA 4FPAA 4TSXA 1NBWA 3CQXA 1WB9A 4KTWA 4JI5K 1LWCA 3OYEA 2BUPA 4N56A 3LDLA 1S1VA 4I9QA 1S3XA 1WBDA 1QZ5A 4DKWA 1N5YA 3HI0A 3OYGA 2YHWA 3D2FB 5AQWA 1B92A 4B3SK 3DM2A 2RE2A 4DV2K 1BIZA 2FBXA 4H0TB 1HKGA 4BR4A 4LF7K 3SMSA 4BEBA 3H1VX 2QWQA 4B9UA 4AHSA 5EX5A 2Q36A 4EZ9A 4WCEL 2VQFK 1FKOA 5AQTA 2B6AA 3NVMA 4FWRA 3OY9A 2P9NB 4FYDA 4BC4A 3NCIA 2F9WA 3THYB 2E1YA 3H6EA 1TVRA 5BN9A 3WXLA 1YITN 3ZT3A 1DTQA 3AVCA 1BO5O 1YXQA 4B1ZA 4AQYK 3HRGA 1H1VA 1KVAA 3ULDA 1MU2A 3CCUN 2F8SA 4HVJA 5SZTA 1CZAN 3OBWA 1ZBIA 4KPYA 2V7ZA 3E9PA 2ASOA 4Y0WA 1GLCG 3D2EA 4DTNA 3U9DA 2Z1HA 4H0YB 2R7YA 1S1WA 2A41A 4M45A 1C0FA 1ATNA 2BH1A 4CECA 1A5WA 4WFNL 5JVGL 4BR7A 3WXKA 2V52B 1NNEA 2O4GA 4Z4GA 4PKGA 4CVNE 2YI1A 4M3RA 4CJ3A 4FZZA 3O3GA 4IO9L 3MN5A 1D5AA 1VQ6N 4DF4A 1CZBA 2QTDA 3OYJA 4IFEA 4I6MA 5HL7L 2ZJQL 5KPRA 2WC9A 4A5AA 3CJ9A 4KI6A 3SJHA 3OYAA 4DQRA 1ZC6A 2FBTA 4K25A 3J81O 4JV5K 4CF8A 1GOCA 4YDUA 5IT9O 2HF3A 1V4TA 2OPQA 2ASPA 5HRPA 2UXBK 2CGLA 1HUXA 3AV9A 3PX6A 1BG3A 5I42A 3T69A 2HNDA 4YOXA 4G9ZA 3HP6A 4K8ZA 3O9QA 4C1NI 3AA5X 4DS5A 1NGJA 4E3SA 2FBYA 3VQ6A 4MQ3A 5BRHA 1VSEA 3DXKB 4CHOA 4FJLA 1VRUA 4FWSA 4K0KK 3THXB 4E7JA 3VN5A 4CEEA 2ZF5O 2O8DA 2DFEA 1C1BA 3VMFB 3NE6A 3VOVA 3DLEA 3MEGA 3R9PA 4CI6A 2A40A 2GELA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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