3EL2A

Crystal structure of monomeric actin bound to ca-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
total genus 118
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3el2A03
2Q2RA 2D4WA 4CZJA 1U2VB 4CBUA 1DGKN 1XQSC 4CBXA 3D7EO 4BRHA 3L0QA 4B1ZA 4FWLA 3LM2A 4LC9B 3KZBA 3WEEB 1NGIA 3IDHA 4FWNA 4FPBA 3I8BA 1ESVA 4B1XB 1T6DA 4FOEA 3CQXA 5F0XA 2P9KB 3O80A 3BUZB 2Q36A 4H5RA 3C7NA 4B1VA 1YAGA 1RFQA 3QFUA 1NGJA 3HM8A 2D0PA 3O4WA 4EFHA 1C0GA 1BWFO 1MA9B 4FSVA 4IWVA 5AQNA 3VF2A 1WUAA 3H45C 1GLCG 1ZBSA 4F9OA 2W40A 3WXIA 5ADXA 1GLJO 2GTDA 1P8ZA 2Q0RA 4XH4A 4BG9A 5AQVA 2QWMA 1BO5O 4IO8A 3LDOA 3CI5A 2E8AA 2CGLA 1TYQB 4YDUA 1HUXA 4B9QA 1Q18A 3VETA 3D2FB 1J6ZA 1HKCA 3DXKA 4M7YA 2YJEA 3DXKB 3KVGA 5FPEA 2DPNA 2YHXA 2E2NA 2D1KA 2CGKA 3L4IA 3VEVA 4MLEA 1NLVA 2FSKA 3VOVA 1HPMA 4MLHA 2QW9A 3O08A 3R9PA 3EL2A 4M63C 3QFPA 3BP8A 1NGHA 5LJWA 3O1WA 1NGGA 1GLEG 2HMPA 3UKRB 1NGAA 1KAXA 2V52B 3MCPA 1K8KB 3HBTA 4EIAA 5BN9A 4O5FA 3GBTA 2FF6A 3WT0A 1KAYA 4WQ5C 5LY3A 5AQXA 4CD1A 3UKUA 5EX5A 3O5BA 1EQYA 2NLXA 3VERA 2A40A 5AQZA 1DEJA 3M6GA 4BR2A 4H0TB 4H03B 3ATUA 3C7NB 4A62A 3ULEB 4CZEA 4CBWA 2ZF5O 4BRIA 1T44A 1BDGA 3HI0A 4CZLA 3MN9A 5TKYA 1YUWA 3ZETA 1SZ2A 2P9PA 3CERA 3CJAA 4ISGA 4BVPA 4CZIA 4RWTA 3CJCA 1X9JA 4BGAA 3IMXA 5AQKA 5AQPA 4BGBA 4I6MA 5I9EB 2IVPA 2PAVA 1K8KA 5JMVA 3H46O 2BTFA 1H1VA 1ZXOA 2VWBA 1U6ZA 3MDQA 5AR0A 3D2EB 4QS7A 2A6AA 5AQRA 1QQOA 1ZC6A 3F9MA 3FZFA 3WUHA 3H6EA 3CJ7A 3WXKA 1RDWX 4CZKA 5AQFA 3GOIA 4QS9A 5KPZA 1JCFA 1GLDG 1SQKA 4MO5A 3BEXA 3J8AA 2CH6A 4I6MB 1YXQA 2GELA 1RGIA 2E2QA 3EO3A 5AQGA 4FWPA 3H3NO 2ITMA 4BG8A 5ELZA 2FSNA 4NB4A 2ASOA 4XH5A 5KPRA 2P9SA 2HF4A 3ENOA 4CD3A 3ULEA 4DB3A 4A2AA 4CZGA 4XH1A 1Z6RA 2HOEA 5B8HA 5E26A 3MN6A 3JS6A 1JCEA 4CZHA 1QQNA 4BRAA 4JD2A 1SAZA 2GWJA 4GY2B 2QWNA 3QBWA 1NMDA 2FXUA 5CE3A 3R6MA 4JD2B 2P9PB 1R59O 2V7YA 3SMPA 3FZMA 4A2BA 4DQ8A 1ATRA 3EKUA 5AQTA 2FSJA 3VEZA 1ATSA 3SK3A 2D0OA 3WXLA 4AM7A 5AFUH 2QWOA 1IG8A 2ZGYA 3AAQA 2A41A 3ZEUB 2BUPA 2W41A 3GG4A 4BR7A 5BRHA 3KHYA 2Q31A 4K41A 4FL9A 4Z94A 1X3MA 4RTFD 3H3OB 3QDKA 3A5LC 3DAWA 4GNIA 4HTLA 2QWRA 3AARA 4C23A 2UYTA 2QM1A 3OHRA 1XC3A 2FF3B 4JNEA 4FWOA 1MDUB 2V7ZA 4H5VA 3QBXA 3FZHA 4DHYA 5AZIB 1GLFO 4L3QA 3SMSA 3UB5A 1C0FA 4BQLA 3M3ZA 4FWMA 3U4LA 4FOIA 2CH5A 4BRNA 3R8EA 3IUCA 4IJNA 2VYPA 3JXUA 3H1VX 4PKHA 3W3DA 3EZWA 1QQMA 3CQYA 4KBOA 3W0LA 4H5TA 3ZEUA 5AQSA 1T6CA 2P9NB 3LM9A 1NBWA 4FWQA 2WUSA 1V4TA 2FLOA 5FPNA 3RSEB 1MWKA 2E88A 4BR0A 2P9NA 3HZ6A 3DWLA 3ENHA 3MN7A 5EXWA 3ZETB 5AQYA 3U9DA 3FE1A 2V51B 1LCUA 5AZJB 2A5XA 5JICA 1QHAA 1ATNA 3VENA 2H3GX 4WYBA 4BRLA 3LDPA 2YHWA 4WQ4C 3AAPA 1QZ6A 3CJ1A 3LDNA 1Z05A 3VEXA 3MK6A 4Y0WA 3S41A 3DJCA 1HKGA 2NZTA 4K42A 4CZFA 4BR9A 4H0OA 3H1QA 3CJ9A 4H0VB 5BPMA 2VCPA 4BRGA 4BC3A 3IFRA 1U2VA 4DCHA 4FWRA 4BRFA 3UE5A 3ZX0A 2P9LA 5AQJA 4JHDB 4M7XA 1NGBA 5AFUA 3O1BA 5EOYA 1NGCA 2Q0UA 3VGLA 3WXJA 2YI1A 3B8AX 3A8YA 3LDQA 1S22A 3VEYA 5KQDA 3EN9A 5EY4A 1KAZA 1BOTO 1Y64A 2QWQA 4BRDA 4WQ4A 4J8FA 2P9KA 5BPNA 3A5NC 4H5NA 4H0YB 2YCHA 2ZGZA 3I33A 4H0XB 2YHYA 2ASMA 2EWSA 4JAXA 5AQIA 3TU5A 1E4FT 4A61A 2OANA 3FFKB 3RSEA 3VGMA 2E2PA 2A42A 2GUPA 1NWKA 2F9TA 5AQWA 1CZAN 1S3XA 1BU6O 1LOTB 3A0IX 4BR4A 4EHTA 2P9IB 3L6QA 3TPQA 2QXLA 4FWKA 5AZJA 2A3ZA 1BA1A 5KQ8A 3M1FA 1BUPA 4BC4A 4CI6A 2P9SB 5FPDA 1G99A 2P9IA 5BR9A 1KXPA 2J4RA 5AQHA 3AY9A 3U9ZA 2ASPA 3CETA 1BA0A 4BRPA 4HWIA 4RCHA 3VPZA 4E1JA 4BQZA 4MO4A 3DXMA 3GE1A 4BC2A 2E1ZA 3QB0A 3GL1A 1HX1A 5AZIA 3VGKA 2Q1NA 3MN5A 5KPTA 4BRQA 4CZMA 1BG3A 2P9UA 3ATVA 5F1XA 1D4XA 1YVNA 4JHDA 3A5OC 3BF3A 2F9WA 3FR0A 2I7NA 3O8MA 3VEOA 5ADXH 3FZLA 2AA4A 4QS8A 3O6WA 3ZX3A 5BRDA 4EAHD 3D2EA 2IVNA 4IXCA 2CGJA 4PKIA 1DKGD 4FPAA 4ISFA 3A5MC 5FPMA 4B1UB 1V4SA 1GLAG 4PL7A 1NGEA 3G25A 4K25A 1HKBA 4BC5A 3WQUA 5JLFA 4FO0A 3ZX2A 3HTVA 4NO7A 1WOQA 1QZ5A 2GWKA 4IJAA 4ISEA 5AQUA 1NGFA 3QMLA 4EHUA 3SLCA 4BROA 4B1WB 2I7PA 2QWLA 1X3NA 5JLHA 5F2RA 3QICA 1HJOA 3CIPA 4IZ9A 2E2OA 5BPLA 1OKJA 3UKRA 1TUUA 3P4IA 3SJHA 1NM1A 3FZKA 3UKUB 1XUPO 3CJBA 2IVOA 2E1YA 4WQ5A 5AQMA 1GLLO 3WEEA 1JCGA 4BRCA 2IIRA 4AM6A 2E20A 5AQQA 2PBDA 3BF1A 5BRFA 2AP1A 2GEMA 2YJFA 2P9LB 3VF4A 5AQLA 3VEWA 2HF3A 2QWPA 2NRHA 3FGUA 3LDLA 5AQOA 5BREA 5BN8A 4PL8A 1HLUA 1TUYA 4H0PA 4H5WA 3C0BA 5LJVA 5E84A 4BR5A 4FWSA 3U8XA 3CHWA 4K43A 4PKGA 4YDUC 1NGDA 2P9UB 4B1YB 4BRMA 2Q97A 3VF6A 3FLCO 4BVOA 3WQTA 3ID8A 3MMVA 4XEIA 3EKSA 5EVZA 4BRKA 2KHOA 4BREA 4JN4A 2ZWHA 4CJ7A 3LL3A 1MWMA 1IJJA 1GLBG 4O8KA 3D2FA 3DXMB 3HSCA 3GDQA 3VESA 1TYQA 1E4GT
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D4WA 4G1QA 3CCEN 4MFBA 4CBXA 3D7EO 5K14A 1OH8A 1LV5A 1CLQA 1BCOA 4FWLA 4CEAA 4LC9B 4AHSA 1S1WA 2ZJPL 4FWNA 2HB5A 3OYIA 4CEDA 4FOEA 3CQXA 5F0XA 2RPIA 3AVIA 2P9KB 1TKXA 4NLCA 3K5OA 1K73O 4DTMA 3IKMA 2Q36A 1YAGA 3QFUA 3VTHA 1KFSA 3O4WA 3SBGA 4BWMA 1WUAA 3H45C 1GLCG 3L3VA 3AVFA 1BGXT 4B9LA 5ADXA 1GLJO 1RDCA 1QSSA 3L2RA 4CJEA 3DLHA 4XH4A 4TSXA 3K2PA 3DRSA 1S6PA 3K0SA 4IO8A 3MWPA 3HM9A 2E8AA 4X65K 2GX9A 2I5JA 3VTIA 1TKDA 3D2FB 3KD1E 1HKCA 3DXKA 4CGFA 1YJWN 4IFEA 3LZJA 2YHXA 4JI2K 2E2NA 5H1SQ 1TK5A 3VEVA 3BZKA 1NLVA 4JKGB 1HPMA 3O08A 4DR2K 3EL2A 4M63C 4CHOA 3BP8A 4LF8K 4C1NK 1NGGA 1BCMA 1JLEA 1IH7A 1KAXA 1VQ4N 4CVNE 4BDPA 1K8KB 4EIAA 2D0AA 3GBTA 1KAYA 1WSIA 3D45A 3Q7BA 3UKUA 3PO5A 4EP5A 1EQYA 2NLXA 3E01A 3KK3A 3VERA 2A40A 1SKRA 4X62K 2HHIA 4H03B 1JLQA 3C7NB 2W00A 4CBWA 1YJNN 3KK2A 3HI0A 1OH7A 3QEPA 4XJXA 3L2VA 4ISGA 4BVPA 4CZIA 1R0AA 1X9JA 4CEBA 5AQPA 4I6MA 3DLEA 4CHPA 1NK7A 3NFAA 4I2PA 3H46O 4BE1A 3PX6A 3QIPA 5FROA 3F73A 1T05A 3C65A 3LPTA 4DU1A 4FK0A 3WNEA 4QS7A 1QQOA 3ENBA 4NCBA 4CEFA 5LL6Z 2UXBK 2R7YA 3RMBA 5IWAK 5CY4A 3KK7A 1D5AA 3ZSYA 3J8AA 4DS5A 3C95A 2FBYA 2OPQA 3EO3A 4JRPA 3NMUA 4DTSA 4CF2A 1JL1A 4UY8O 4M3UA 5KPRA 5HROA 4OPAA 4DB3A 3RTVA 2Z1IA 5CZ2A 4XH1A 2HOEA 1BQNA 4BE0A 5E26A 3MN6A 4ID1A 4CZHA 3O9QA 2G8HA 1RTJA 4JS4A 3TAQA 1SAZA 4GVMA 4GY2B 3QBWA 1KLMA 1NMDA 3MXMA 4HVJA 5CE3A 1D9FA 3CYGA 3R6MA 2YHBA 3O3FA 4ZTFA 3JSMA 3G71N 1R59O 2V7YA 4DUYK 2OZMA 4DV5K 3DOKA 5HRPA 4CJLA 2D0OA 1HYVA 4AM7A 2QWOA 1IG8A 3LPUA 2ZGYA 3TSPA 3ZEUB 2A41A 2W41A 2HHUA 3T1HK 4J2EA 3S3MA 1D8YA 3OYNA 3CC4N 2E6MA 2JWLA 1T03A 4OO1J 5D3GA 3SBTA 4GNIA 1A5VA 4OKEA 2KW4A 3OYAA 1OH5A 3OHRA 1JLGA 1XC3A 1YTUA 4JNEA 1BL3A 3QBXA 5KRSA 4O8UA 4FK2A 3MX2A 3OYCA 3M3ZA 2FBVA 4KPYA 4E7HA 2CH5A 1TL3A 3IUCA 3E1YA 5E41A 1KVBA 1N32K 1VHXA 4R5PA 2ZJQL 1QQMA 3D0PA 4H5TA 2NRRA 2WUSA 5FPNA 2F8TA 4B9MA 4KB1A 1S1TA 4JK7A 3N4PA 1B92A 3DWLA 3ENHA 4O4GA 4ILGB 3CCJN 3SJJA 2ATQA 2V51B 4JKEA 3AVNA 5AZJB 4IOCL 3K5LA 1KC8O 2VGNA 3VENA 4KAZA 3O3GA 4CF1A 4BRLA 3OYFA 4CGJA 4PQUA 2P51A 2Y1JA 2HVHA 3VQ5A 4Y0WA 1HKGA 2NZTA 3NH0A 4K42A 4CEOA 4JKHA 4BR9A 3TAEA 2UUCK 2O4IA 3CJ9A 2IS3A 3CYMA 4H0VB 3HRGA 5BPMA 1QS4A 1RDBA 4BRGA 4DCHA 4FLWA 1HYSA 2BANA 2XY7A 3CPEA 2XO7A 2P9LA 1I39A 5AQJA 5KRTA 4JHDB 4Z4IA 1GOCA 3WXJA 3NE6A 2YI1A 3AVMA 4QOZB 3QEXA 1Q9XA 1S22A 5KQDA 2OPPA 4OKJA 1L3UA 3OS0A 1KAZA 4N47A 3PX4A 1Y64A 2QWQA 4BRDA 4IFVA 3TTFA 3DLBA 1TGOA 3A5NC 3AA2A 3G0ZA 2ASMA 4JKBA 5AQIA 1E4FT 1ASWA 2OANA 1VSJA 1EWRA 5AJ3K 1RTIA 1ILYA 4CK2A 5MLCQ 2XY8A 4I9LA 1LOTB 4BR4A 3T19A 3BZCA 4EHTA 4JI8K 4OLBA 2A3ZA 4CI6A 2P9SB 3DM2A 1G99A 1S6QA 2BH1A 5BR9A 1KXPA 5CR4A 1NNEA 3DOLA 5AQHA 4YOYA 4EZ6A 3IRXA 1BA0A 1RCHA 3THYA 3VPZA 4AF1A 2IC3A 2E4LA 1K8AO 4FZXC 2E1ZA 1RBSA 1WN7A 2ZQBA 3HT3A 4N5SA 5KPTA 1U47A 4JKGA 3L8BA 3CCLN 4KRFA 2OA8A 4A5AA 2KKZA 4JHDA 2F9WA 3KLIA 4F4KA 4YNQA 5ADXH 3O6WA 1NK0A 5GAHP 4CJUA 4EAHD 3D2EA 2CGJA 1YI2N 2KFNA 2Z1GA 4ISFA 4B1UB 3OJUA 3M5RA 3TSUA 3NDKA 2HBKA 2VGMA 4LF4K 3VQPA 2O8BA 1HKBA 1KD1O 3ZX2A 3HTVA 1Q7YO 4IJAA 5CHIA 2PY5A 3ZSOA 4BWJA 1S1XA 3SLCA 2FC0A 4OVLA 4YOTA 1JLFA 1X3NA 4FVMA 3KK1A 5JVHL 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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