3EL2A

Crystal structure of monomeric actin bound to ca-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
total genus 118
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3el2A03
3ENHA 1X3MA 3FZFA 4BR7A 4C23A 4FSVA 3HI0A 4YDUA 4E1JA 2J4RA 5AZIB 5AQPA 3OHRA 4K42A 2E2QA 2Q2RA 2P9KB 4BVPA 4WQ5C 4RCHA 4BRNA 3EKUA 4PL8A 1ATRA 3FE1A 2PAVA 4H0PA 5AQKA 3VGLA 3J8AA 5ELZA 4RTFD 4BRLA 2NRHA 3QBXA 3UKUA 4JHDA 3BUZB 4PKIA 5BPNA 3CJ7A 3DXMB 2H3GX 1HX1A 4FO0A 4M7XA 1OKJA 1WOQA 3MN9A 3D2FB 4JN4A 4BR4A 3EO3A 4BRCA 5JLHA 1BDGA 4B1UB 3C7NB 2V7ZA 3H6EA 3CQXA 4MO4A 4JD2B 5CE3A 5FPDA 3EKSA 3MDQA 4BGBA 3VF2A 1C0FA 4HTLA 2AA4A 3HZ6A 3VEVA 5ADXA 2VYPA 1BA0A 1IG8A 4WYBA 4BQZA 1KAXA 2E8AA 3R6MA 4B9QA 3I33A 1XC3A 2E1ZA 4JHDB 2P9IA 3FLCO 1TYQB 4CZJA 1NMDA 1U6ZA 4FOIA 2AP1A 3D2EA 2GEMA 4PKGA 4PKHA 3HSCA 3W0LA 2QWLA 1BWFO 3VEWA 2P9NB 3A8YA 3ULEB 4QS9A 4BRGA 4O8KA 4GY2B 4KBOA 3VF4A 4B1WB 2QWMA 3ZEUB 1P8ZA 3VERA 2HF3A 3KVGA 1RGIA 5AQVA 2EWSA 2E2OA 1D4XA 5BN9A 3AAQA 4FWRA 4GNIA 3U9DA 2YHYA 4Z94A 5AFUH 3ZEUA 4JNEA 5AQYA 3P4IA 3WXIA 1BU6O 3CHWA 3EN9A 1YVNA 3DWLA 3CJ1A 1SZ2A 4HWIA 2P9LA 2P9NA 3VPZA 5EVZA 4BGAA 5AZJB 4NB4A 5AQXA 4B1YB 1MDUB 5F0XA 1Z6RA 4MLEA 4XEIA 1GLCG 4H03B 3MN6A 4IJAA 2FSJA 4XH4A 4BROA 3HTVA 3ATUA 4CZFA 3ULEA 3IMXA 2VWBA 3CI5A 3LM9A 4A61A 1ZBSA 1IJJA 5AQGA 4H0OA 4B1XB 2GWKA 3LL3A 4I6MB 3CJAA 4BC3A 3D7EO 1HPMA 3O8MA 1KXPA 2A6AA 3O1WA 1BO5O 3IUCA 5LJVA 3FR0A 1S3XA 2E2PA 4EHTA 4H0TB 3SJHA 3ID8A 3UKUB 4BRFA 1NGHA 4ISEA 3SK3A 2NZTA 3VGMA 1NGGA 4B1ZA 2QWRA 4CD3A 1HLUA 3H3NO 3VEXA 2F9TA 3B8AX 3BF1A 4H0YB 1HKBA 1Q18A 5I9EB 5KPZA 4BVOA 4RWTA 3HM8A 3UE5A 2F9WA 2E20A 1X9JA 3QBWA 1RFQA 1J6ZA 4CBUA 4PL7A 3ZX2A 4XH5A 3GG4A 4LC9B 3O4WA 2A3ZA 4FWKA 1NGIA 2BTFA 2OANA 1H1VA 2P9LB 3O80A 4WQ5A 3WT0A 2I7NA 4BRIA 3IFRA 1HKCA 2CH5A 3MK6A 2ZF5O 4BRHA 3EZWA 4B1VA 2HF4A 4CD1A 4XH1A 4FWOA 2Q97A 4J8FA 3FFKB 2V52B 3D2EB 2ZGZA 1K8KA 5AQIA 5BR9A 3ATVA 5TKYA 4EHUA 3ZX0A 4BREA 3BF3A 4ISFA 2Q0RA 3A5MC 2D0OA 3FZLA 3FZKA 1BA1A 1E4GT 4CBWA 4K25A 4QS8A 4EIAA 2FSKA 3GL1A 4NO7A 4M7YA 1E4FT 3G25A 4H5WA 3VF6A 3CJBA 4BRDA 3HBTA 2GELA 1Y64A 2D0PA 2QW9A 2IVPA 1MWKA 1XUPO 3C0BA 1YUWA 3VESA 4H5TA 3L0QA 3ENOA 3QMLA 5AQFA 2A42A 5KQDA 1WUAA 1NGJA 2GWJA 5BRFA 1DEJA 1G99A 2E88A 2W40A 4Y0WA 5EY4A 3VOVA 2P9IB 3F9MA 4H0XB 3CJCA 5AQMA 3WXJA 5E84A 3WEEB 3QICA 2ZGYA 4H5NA 4M63C 2DPNA 3VEOA 1T6CA 5AQTA 1NWKA 4BC4A 3JS6A 1NGFA 3ZETA 4I6MA 2UYTA 1NM1A 2CGKA 4FWMA 2D4WA 5AQQA 3A5OC 1NGBA 4O5FA 4JD2A 2QWOA 1HUXA 2BUPA 3GE1A 3DAWA 3M3ZA 4CZLA 4H0VB 2FSNA 3W3DA 3ZETB 1NGEA 2GTDA 2FF6A 4A62A 3LDPA 3CJ9A 1TUUA 2P9UA 5JICA 3DXMA 3FGUA 5FPMA 3DJCA 4CZHA 3LM2A 1R59O 5AQJA 1NGCA 2A40A 3O6WA 4ISGA 4CZEA 2VCPA 4BRAA 4AM6A 3VENA 2Q31A 3UB5A 1GLJO 3O5BA 1GLEG 3DXKB 3A0IX 2E1YA 2CGLA 3RSEB 1GLFO 1JCGA 3O1BA 3LDLA 4BRQA 4BR5A 4CZIA 3RSEA 3BP8A 5LJWA 1U2VA 3DXKA 3MMVA 5AZJA 3KHYA 4DHYA 2YI1A 2IVOA 3FZMA 1GLBG 3I8BA 1X3NA 3BEXA 4FWPA 1GLDG 1MA9B 3L4IA 2W41A 5AQUA 1ZXOA 1LOTB 1YAGA 3A5NC 4MLHA 3WQUA 2GUPA 3CIPA 4FOEA 5AQNA 3SLCA 2Q1NA 5BRDA 3U4LA 2A41A 5F2RA 5AQRA 3VETA 4EAHD 3AARA 1DKGD 4DQ8A 3FZHA 4BR0A 3UKRB 1BG3A 4FWLA 5F1XA 1BUPA 1ATSA 1QZ5A 4BG8A 1JCFA 4H5VA 1C0GA 2IIRA 2Q36A 1T44A 5BPMA 4AM7A 1LCUA 1JCEA 2P9SB 3EL2A 3QDKA 1T6DA 2Q0UA 4BRKA 3VGKA 4BC2A 3AAPA 4IO8A 3H3OB 1ZC6A 5FPNA 2I7PA 3CETA 3M6GA 4CBXA 4A2AA 2NLXA 3LDQA 1SAZA 1EQYA 2CGJA 2ASOA 4EFHA 2QWNA 4MO5A 4YDUC 1NBWA 5EXWA 1YXQA 4CZMA 4CZKA 2HOEA 4FWNA 1ATNA 4BR2A 2D1KA 2ZWHA 4K41A 2HMPA 1NLVA 2E2NA 5KQ8A 1KAYA 2YCHA 3MN5A 3TPQA 4BC5A 4QS7A 1QQNA 3MN7A 2V51B 2P9PA 4CI6A 3R8EA 4A2BA 2P9KA 1GLAG 4L3QA 2QWPA 1V4TA 4WQ4C 1K8KB 4DCHA 4FPBA 2FF3B 3CERA 5BPLA 3ZX3A 2ASMA 3QFPA 3U9ZA 4BG9A 3WXLA 3CQYA 2YHWA 1Z05A 1NGAA 4FWQA 5BN8A 5AQWA 1HKGA 4IJNA 3LDNA 2V7YA 1QQOA 1QZ6A 2QXLA 3QB0A 5AQOA 4H5RA 3AY9A 1TYQA 2FXUA 2ITMA 3VEYA 2A5XA 3IDHA 5B8HA 4CZGA 2KHOA 4DB3A 1S22A 1XQSC 2ASPA 4FL9A 1QQMA 1SQKA 4K43A 4JAXA 4IWVA 2P9SA 3KZBA 1QHAA 5KPRA 3S41A 3GDQA 5JMVA 1RDWX 1MWMA 3WXKA 2WUSA 3H1QA 3H45C 3WEEA 4BQLA 3L6QA 3TU5A 2CH6A 3WUHA 1CZAN 5FPEA 3SMPA 5BRHA 1GLLO 1ESVA 3M1FA 1U2VB 1KAZA 3JXUA 2YJEA 3VEZA 2FLOA 1HJOA 3SMSA 3O08A 5LY3A 5E26A 1V4SA 3H1VX 3LDOA 3GBTA 3R9PA 5AFUA 4BRMA 5AR0A 4FPAA 4BR9A 3GOIA 2YHXA 5JLFA 3A5LC 4FWSA 2P9PB 2YJFA 4IXCA 4IZ9A 1NGDA 3C7NA 5AQSA 4BRPA 3UKRA 2QM1A 1DGKN 3H46O 4WQ4A 2PBDA 5EOYA 2QWQA 2IVNA 2P9UB 3D2FA 5AQZA 5KPTA 1BOTO 3U8XA 3MCPA 5EX5A 4F9OA 3QFUA 5AZIA 5BREA 1TUYA 5AQLA 3WQTA 4CJ7A 5ADXH 5AQHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ENHA 1ZBUA 4CJEA 1RT7A 4BR7A 4C23A 3HI0A 4KO0A 4KHNA 4OLBA 5AZIB 3OHRA 4FZZA 1TKDA 2Q2RA 3KK7A 4RCHA 5JS1A 1LW0A 4PL8A 4J2AA 3FE1A 5AQKA 3J8AA 4RTFD 4BRLA 2DY4A 4N5SA 5BPNA 4CHNA 1RDDA 3F2KA 5JVHL 4YOUA 5CHIA 4N76A 3AO3A 1N33K 3D2FB 4JN4A 4AF1A 4BR4A 4YORA 2NRRA 3EO3A 4BRCA 5JLHA 4DR7K 4B1UB 1RDBA 4MDAA 4KTWA 2D0CA 3H6EA 1WB9A 4JD2B 5CE3A 4JKEA 4NCGA 1G15A 4M3TA 4CFAA 2AA4A 5ADXA 2VYPA 1IG8A 4WE1A 1KAXA 5M1FA 3D6RA 3SQ2A 3NHGA 2W42A 4B9QA 4DSJA 3OS2A 4GW6A 3RTVA 3FLCO 2P1JA 3TR8A 5LL6Z 3O3GA 5KRTA 4DQRA 4CHQA 2UXDK 4PKHA 2Y1JA 3VEWA 2B6AA 4KHWA 2P9NB 3KLGA 2RE2A 4KHPK 2XHBA 4KBOA 4FJGA 4B1WB 4B8CA 4E7IA 4CF1A 2HF3A 3KVGA 3NH1A 5AQVA 4DSFA 2EWSA 4HUFA 3ZSZA 4GNIA 3U9DA 3HP6A 4JNEA 3P4IA 3O9QA 4CHOA 1P90A 4KH4A 5C12A 1BL3A 3KWGA 2P9LA 2DFHA 4BGAA 3CQ8A 3QEWA 3DLKA 4DQSA 1VSIA 5FRNA 4C8OA 4AHSA 4MLEA 2JWLA 4XH4A 3SYZA 3HTVA 3ULEA 3NF7A 2O8BA 3B6PA 3AA4A 1NK8A 1NMNA 4BC3A 4JI1K 4CJSA 3OJUA 4DTXA 2E6LA 1W0HA 3L2RA 2OCEA 2E2PA 3TWHA 1HNXK 2WC9A 4ISEA 1GOBA 3QEPA 2WTUA 1BGXT 4CD3A 1MU2A 3AVMA 3KJVA 3B8AX 3BF1A 1HKBA 2GV9A 1QTMA 1YT3A 1VQ5N 4H8KA 1HRHA 1OH7A 1NK4A 3MXIA 1N5YA 1I94K 1J54A 4AHVA 4DV5K 1XMQK 1WAJA 4CECA 4OVLA 3K2PA 4LC9B 3O4WA 1SL0A 3MAQA 2VG7A 3RR8A 3U3GA 3NGYA 3THWB 3AVCA 3VQBA 3NF9A 2Q97A 4KH5A 3ATVA 1S9EA 2C1IA 4JS5A 2GBZA 3J81O 1BA1A 2YX6A 3PX6A 1TVRA 2F8TA 4EIAA 4BRDA 3VMFB 2GELA 4CFCA 1J9AA 4ILHA 1XUPO 3C0BA 3RWUA 4CK3A 4H5TA 2NRXA 3THVA 3CCEN 4DS4A 3OYFA 5HROA 1WUAA 3C6AA 2GWJA 1DEJA 5EY4A 4AHTA 2Z1IA 4M3UA 4N56A 2WFBA 1HNIA 2YNFA 3CJCA 1CZBA 4FJHA 3WEEB 1NU0A 1LV5A 3NMUA 3VEOA 2DPNA 1T6CA 1NJYA 4K8ZA 1KLMA 3JS6A 2HHSA 1NGFA 3OY9A 4I6MA 1QSSA 1IKWA 3EE8A 4YOVA 4Q0BA 4FWMA 5J2QA 2D4WA 3A5OC 1NGBA 4CJLA 4JD2A 4C8LA 4LFBK 2AJQA 2HMIA 3DRRA 2EX3A 4ILGB 1UOCA 4H0VB 2FSNA 3T1AA 3ZETB 4BDZA 4DV7K 2Z1GA 4A57A 3LDPA 2P9UA 5FRMA 4NYNA 2XY8A 1JLGA 4DLEA 1BI4B 1O13A 3LM2A 4CF8A 1NGCA 2VWKA 4RW7A 2HNYA 4FYDA 3LP0A 3VENA 1RDUA 3O5BA 1RT1A 4IG0A 3K57A 3QLHA 4LF7K 4BRQA 4CZIA 2PYJA 5J2MA 1XI1A 1EWRA 3KHYA 3VA3A 1OH8A 2IVOA 3FZMA 1A5VA 3I8BA 1X3NA 4ID5A 4OKKA 1NJWA 3BEXA 3VQ9A 2OZMA 1B9FA 4MLHA 3PX0A 4JS4A 2ETJA 3G4SN 5AQNA 3B6OA 2IS3A 3U4LA 1XHXA 3S9HA 1JLCA 3RMBA 1VRUA 5CY4A 4DTNA 1WAFA 4FCYA 2XY7A 1ATSA 1QZ5A 4BG8A 2G8UA 3LDSA 4H5VA 2IIRA 3NF6A 1T6DA 2Q0UA 1OH5A 1QSLA 2Y1IA 1ITGA 3VGKA 3IRXA 4PA1A 1FJGK 1SL2A 2X78A 4M41A 5FPNA 2DTUA 3CETA 4Z4GA 4UQGA 4DFKA 4A2AA 3OBYA 4O5BA 1YJWN 5KTQA 4B9NA 4KV8A 1W97L 1WSFA 2JGUA 1EQYA 4RW8A 3L3UA 3V81A 2IAJA 4DR4K 1VQ8N 4DR3K 4KTQA 3JAMO 3L2VA 4DQQA 3T3FA 3ZT4A 4AHRA 4ZTFA 2HMPA 3TAPA 1S1TA 4F4KA 1KAYA 1IKYA 3MN5A 3NGIA 4O8UA 4F8RA 3KLEA 2P9PA 1SS6A 3SBTA 1TKZA 3AGKA 3OYBA 3VN5A 2P9KA 1Y97A 4E3SA 4DCHA 4YOYA 1JXEA 2FF3B 4ICLA 3ZX3A 4YOTA 2XRIA 1WBBA 1WSHA 4IOXA 3THWA 4DQPA 2RHKA 1NGAA 5BN8A 4OKEA 4IJNA 3LP1A 2V7YA 4IEEA 1QQOA 5HRPA 2KLAA 3J7ZO 3UIQA 4DTPA 1RILA 4DKWA 3VEYA 4HCBA 3IDHA 5B8HA 3WNEA 2KHOA 3T19A 4FL9A 4E19A 2B5JA 2RN2A 4K43A 4JAXA 3OS1A 4IWVA 3G71N 4IKFA 3GDQA 3CPEA 4CHZA 5JMVA 1T8EA 1XWLA 4GV6A 1MWMA 4OGEA 3H1QA 4A59A 4FW1A 4OPKA 1W9HA 1IBKK 1RCHA 4BQLA 2FBVA 1CZAN 2RF2A 2NNWA 1ESVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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