3EL2A

Crystal structure of monomeric actin bound to ca-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein
total genus 118
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3el2A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3el2A03
3WXJA 5ADXH 2IVNA 5BPLA 4CZLA 2GEMA 2Q0RA 5EOYA 1BOTO 1BA0A 4B1WB 1MWMA 3LL3A 2P9NB 5AQNA 3LDLA 2A42A 3BF3A 5AQRA 4FO0A 4AM7A 2J4RA 3O8MA 3H1VX 2P9KA 1YVNA 5BRDA 4CBWA 2ZGYA 5CE3A 2F9TA 3WXIA 2E8AA 5AQPA 3ULEA 2E2PA 2P9LA 2HOEA 3O6WA 3ATUA 1GLFO 1D4XA 3L0QA 1NGBA 1GLLO 5AQWA 3VGKA 3FFKB 1GLDG 2P9UB 2QWMA 3D2FA 1HLUA 2QWQA 2ZGZA 5JMVA 4B1XB 2BUPA 1BU6O 2AP1A 2KHOA 1KXPA 2I7NA 4BRQA 3HBTA 4H0OA 3WQUA 4QS9A 2W40A 3QFUA 2W41A 1RGIA 4FWKA 2CH6A 4H5NA 5EVZA 3U9DA 4JHDA 4K43A 2P9SA 4CI6A 3CJ1A 4BC4A 1QZ6A 1SQKA 1X9JA 2QXLA 3CETA 2E88A 3EL2A 4BC2A 1TUYA 2FF6A 4K42A 3ENHA 2YHXA 1RFQA 1NMDA 5BPMA 3W3DA 1ATNA 4KBOA 1WUAA 5AQHA 2QW9A 5FPMA 1ZC6A 1C0GA 3RSEB 3KHYA 5LJWA 5FPEA 1WOQA 4IJAA 3KZBA 3OHRA 4YDUC 3CIPA 4FWRA 5BR9A 5BREA 5KPZA 5BPNA 2GUPA 3R8EA 3CJAA 5FPDA 2VYPA 5AZJA 5AQUA 4JHDB 3VETA 4A61A 3L4IA 2I7PA 2IVPA 1NGGA 3MN5A 4A62A 3GE1A 4BQZA 4Y0WA 2FXUA 5EX5A 2ASOA 2FSNA 1C0FA 3I8BA 3QBXA 4PL7A 3ENOA 3IDHA 3FZKA 3CJ9A 4O5FA 1BG3A 3S41A 3VF2A 3TPQA 3MDQA 3DXKB 4MO4A 4H03B 4BRPA 1JCGA 4EFHA 5F2RA 2ASMA 2Q2RA 2V51B 2NLXA 2ZWHA 3UKRA 3IMXA 5LY3A 2QWOA 3CHWA 2P9PA 4CZMA 2QWNA 3UKUA 5BN9A 2QWRA 3CERA 4CD1A 2D0OA 4WQ4C 2H3GX 3EZWA 4BR4A 3O08A 4MLHA 4B1YB 4YDUA 3FZHA 4GY2B 4CD3A 4BRIA 1QQMA 2E2NA 4I6MA 2A41A 2GWKA 4PKHA 3DXMA 3KVGA 1H1VA 2QWPA 4H0PA 3MMVA 4CBUA 2D4WA 4BGBA 4EHTA 4DCHA 2A3ZA 1KAXA 3CI5A 5AQTA 4WYBA 4CBXA 5KPTA 1JCFA 5TKYA 5I9EB 2A6AA 1QQNA 1EQYA 4M7YA 1NGDA 2FSKA 4JD2B 4ISFA 1V4TA 3LDNA 2D1KA 4BRDA 2NRHA 1TYQA 3B8AX 3R9PA 4BRNA 1T6CA 1Y64A 4BROA 1BDGA 5AQLA 3H1QA 3H6EA 3U4LA 3M1FA 1V4SA 3O1WA 4B9QA 2ZF5O 4RWTA 1TUUA 3DWLA 3WQTA 4RCHA 4WQ4A 4E1JA 3R6MA 4XH1A 3MK6A 2YCHA 5JLFA 3GBTA 5JICA 2E20A 3VEXA 2Q36A 1IJJA 1BUPA 4BC3A 4BRGA 3O4WA 5AFUH 4CZGA 4ISGA 3MCPA 5AQQA 4Z94A 3P4IA 3SJHA 5AQZA 2QM1A 4QS7A 3LM9A 1KAYA 3SMPA 3VF4A 1HX1A 1BWFO 4CZJA 2P9KB 4BVOA 3BF1A 2UYTA 5KQDA 4NO7A 5AR0A 4EIAA 2CGLA 4PKGA 3ULEB 2P9LB 4H0YB 3VERA 1Q18A 5BRHA 4H5VA 4BRFA 2P9IA 3ZX3A 2Q1NA 5AQMA 4M63C 3D2FB 1GLCG 1MA9B 3CQXA 3ZETA 3JXUA 3D2EA 3A5NC 4FOIA 3VEYA 3C7NA 1XQSC 3I33A 1X3MA 3VEZA 3QFPA 1T6DA 3TU5A 1S3XA 1DGKN 3JS6A 4XH4A 1J6ZA 2DPNA 4CZEA 3HI0A 4HTLA 2E2QA 3O80A 4FWPA 2VCPA 3GG4A 3ZEUA 2P9SB 4H5WA 3O1BA 3G25A 4MO5A 4MLEA 4BC5A 1HKGA 4C23A 3D7EO 3WT0A 1ZXOA 3FZMA 5AQJA 3SK3A 3HSCA 1CZAN 3HTVA 3VPZA 3C7NB 3WEEA 1NGHA 1ATSA 5ADXA 4FPAA 2CGJA 3U8XA 1S22A 2WUSA 4M7XA 3WXKA 4B1UB 3VOVA 4BG9A 1GLEG 5AZJB 4H0XB 4H5RA 3ZEUB 4BRHA 2V52B 3VEWA 5AZIA 3ZX0A 5F0XA 2PBDA 2PAVA 3CJCA 4BG8A 1K8KA 1NGCA 1GLBG 4CZIA 4O8KA 3GDQA 1KAZA 3EKUA 3MN9A 3DJCA 3DAWA 3WUHA 3SLCA 4F9OA 4BR5A 4FWQA 4A2BA 4B1ZA 2D0PA 3A8YA 4BRMA 4QS8A 2AA4A 3IUCA 3GL1A 4ISEA 1RDWX 3UKRB 5AZIB 5KPRA 3H45C 3VGLA 3EKSA 2P9PB 3UKUB 3QICA 4L3QA 5B8HA 1DEJA 2GELA 1Z05A 1ZBSA 3VESA 3CJ7A 2IVOA 2NZTA 4FWSA 3AY9A 1U2VA 2E1ZA 2A40A 4JN4A 4EHUA 1GLJO 3CQYA 3A5MC 1X3NA 4I6MB 1HPMA 1T44A 2HMPA 4DQ8A 3DXMB 4IWVA 3A5LC 4JAXA 2V7YA 4BRKA 1YXQA 1HKBA 4IXCA 2P9NA 1ATRA 3BUZB 4NB4A 4FOEA 3M6GA 4K25A 2GTDA 3LDQA 3BEXA 5AQOA 2FSJA 4BGAA 3MN7A 3UB5A 3AAPA 5LJVA 1ESVA 1TYQB 1XC3A 1LOTB 3AARA 3QB0A 2YHYA 5AQSA 3SMSA 1NGAA 3M3ZA 4DHYA 2BTFA 4H5TA 4LC9B 5EY4A 2P9UA 3EO3A 4CZFA 4H0VB 4CJ7A 1QQOA 4J8FA 1QZ5A 3F9MA 3H3OB 3LDPA 1U6ZA 1YUWA 3O5BA 4RTFD 1Z6RA 1YAGA 3L6QA 3EN9A 5AQKA 3MN6A 3ATVA 3QDKA 4AM6A 1MWKA 5E84A 3QMLA 1QHAA 3UE5A 2E1YA 2OANA 2CGKA 3FZLA 4A2AA 3C0BA 5AQXA 1NLVA 4BR9A 3RSEA 5E26A 4BR7A 2IIRA 4HWIA 2HF3A 3CJBA 3H46O 3LDOA 5AQFA 1R59O 1E4GT 3AAQA 3WXLA 2FLOA 2P9IB 1IG8A 4JNEA 3FE1A 4FPBA 2A5XA 4XH5A 4FWOA 3W0LA 4BVPA 3HZ6A 4WQ5C 5F1XA 4H0TB 3ZETB 1DKGD 2F9WA 3BP8A 3D2EB 3GOIA 4PKIA 1BA1A 3IFRA 2ASPA 1NGFA 4BRAA 5EXWA 3VGMA 1NWKA 3LM2A 2YHWA 3DXKA 4FWMA 5BRFA 4BQLA 2YJFA 5AQYA 5AQGA 4GNIA 4CZKA 1NM1A 4DB3A 3FZFA 1SAZA 4FWNA 1BO5O 4K41A 3WEEB 3A0IX 3J8AA 3H3NO 2CH5A 5ELZA 2Q31A 1OKJA 5AFUA 2Q97A 1E4FT 2HF4A 5AQVA 3VEOA 1HKCA 4IJNA 1GLAG 4IZ9A 1HJOA 3FLCO 1K8KB 2VWBA 4XEIA 1NBWA 3FR0A 4PL8A 4B1VA 5KQ8A 4WQ5A 5JLHA 4FSVA 2YJEA 4BRCA 4BRLA 1G99A 2V7ZA 2FF3B 1XUPO 3VEVA 1SZ2A 2Q0UA 1P8ZA 5AQIA 2YI1A 1LCUA 4JD2A 1NGIA 1MDUB 4BR2A 3HM8A 3QBWA 1JCEA 5FPNA 2QWLA 4FL9A 3ZX2A 1NGEA 2GWJA 4EAHD 4FWLA 3A5OC 4BREA 3U9ZA 3ID8A 1NGJA 4CZHA 2ITMA 5BN8A 3VF6A 4IO8A 4BR0A 1U2VB 3VENA 1HUXA 3FGUA 2E2OA 2EWSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XMQK 2I5JA 3QEWA 4CZLA 2GEMA 1LW2A 2Q0RA 4B9MA 1LV5A 4K8ZA 3AGRA 4BECA 4BEBA 4CVNE 3LL3A 5AQNA 3LDLA 2BANA 3TABA 3H1VX 3C95A 1JJ2M 1C0MA 5CE3A 3QO9A 4CFCA 5AQPA 3ULEA 2E2PA 5KGXA 3NGYA 3TSPA 1NGBA 4DV4K 3VGKA 2OZMA 1HLUA 4R5PA 4YOYA 4B1XB 4GKJK 4FZYA 2G8IA 2AP1A 1C1BA 1FJGK 4CK1A 1XC9A 4RW9A 5DM6L 2I7NA 3OYGA 4BRQA 1J9AA 3LZJA 2IC3A 5FRNA 5EVZA 4KO0A 2YHAA 4M41A 4DR5K 4KPYA 4E0DA 3CETA 3EL2A 4BC2A 3T3FA 1TUYA 1TKDA 1RFQA 2BDPA 1D9DA 1EWQA 4HHTA 1VQ4N 4F2RA 4RW7A 4KTQA 1I3AA 2GUPA 3CJAA 5FPDA 4DFMA 2KLAA 1M1KO 3IG1A 1NGGA 4Y0WA 2FXUA 5EX5A 4DV6K 1C0FA 2O8CB 3IDHA 1WN7A 4Z4GA 3FZKA 3CJ9A 1BG3A 4DMNA 3OYHA 3VF2A 4MO4A 3TTFA 2RPIA 3I0SA 4BRPA 3PX6A 1JCGA 4JKHA 2ASMA 4BE0A 4B9TA 4FLWA 4DSIA 3DOLA 3QIOA 3O9RA 1YIJN 4KH5A 4CZMA 5BN9A 2QWRA 3ZT1A 5C2DA 4M3YA 2H3GX 4BR4A 4JYAK 1XNRK 3CF5L 3RR7A 1TL3A 1NK4A 2E2NA 4I6MA 3CFOA 2GWKA 2QWPA 3MMVA 5GIOA 1OH5A 2D4WA 4FK4A 2JLEA 2A3ZA 2D5RA 3CM5A 3MXMA 4FJIA 5AQTA 4WYBA 5TKYA 5I9EB 5LMUK 1RBTA 2B6AA 4M7YA 4CF2A 3LDNA 4BRDA 4W5OA 2P5OA 4RW6A 3B8AX 1KLNA 5M1PA 1T6CA 4BRNA 3TI0A 2NRTA 3O3FA 1KQSM 1BDGA 1IKVA 3TSUA 1YTUA 2G8WA 1K9MO 3H6EA 3U4LA 4JS5A 3AVNA 3M1FA 3AVCA 1SL2A 4WQ4A 4FXDA 3R6MA 1NMNA 4DV7K 2E4LA 2YCHA 1IKXA 4N76A 4CJVA 3O4NA 2VGMA 2QXFA 1IJJA 4B8AB 4BRGA 2YNIA 2O4GA 2NRZA 5CYMA 1S5JA 3MCPA 3LWMA 4FJ8A 3B6PA 3AVFA 3SJHA 2QM1A 4QS7A 4AQYK 1KAYA 3SMPA 1HX1A 1BWFO 4H8KA 1RDUA 3E9OA 3WNEA 3ULEB 4H0YB 4KB1A 1Q18A 1HPZA 3K0SA 1BCMA 2WBNA 2OTJN 2YX6A 4ILJA 4B3RK 1J54A 1HMVA 1S9GA 4JI7K 3TTCA 3I33A 4YFUA 4DSKA 4M3ZA 3VEZA 2AJQA 3EYZA 3AVHA 4EZ6A 2DPNA 3HI0A 2E2QA 4FK0A 3HSTB 4FWPA 1VQ5N 4H5WA 3KD1E 3G25A 4WE1A 2ITGA 1KVCA 1J5EK 5SZTA 4FCYA 1ZXOA 3FZMA 3SK3A 4B3SK 2E5LK 1A5XA 3KIOA 3CFPA 3NFAA 3C7NB 3VPZA 4F8RA 3KLGA 2WFBA 2CGJA 3U8XA 1S22A 4OPJA 2WUSA 3WXKA 4B3TK 3NF8A 3OS2A 3K9JA 4DTOA 3PV8A 4AF1A 3VA0A 4IOXA 3ZX0A 5AZIA 3T1HK 4DSJA 2PBDA 2PAVA 3CJCA 4O8UA 1GLBG 4IO9L 1KC8O 4CZIA 3GDQA 1KAZA 4R79A 1JL1A 4FJKA 3DLHA 4QCLA 4F9OA 3OBWA 3LAKA 4JKEA 4O5BA 1VRUA 1KFSA 1S72N 5A2QO 1O13A 4A2BA 4GVMA 1Q81O 2EHGA 4QS8A 3DM2A 3IUCA 1NOYA 2DY4A 1RDWX 3QEIA 3KKRA 1ZBSA 4LFBK 3ALYA 3L2RA 2IVOA 3AO2A 1W97L 1DTQA 3AY9A 5GAEP 1WSJA 3CC4N 1LW0A 4JN4A 3A5MC 1X3NA 1F21A 4I6MB 4DQ8A 4LF6K 1HKBA 4IOCL 4NLBA 3TAGA 4IXCA 4ELUA 1T7PA 4AHUA 4K25A 1QVGM 1T05A 2F96A 5AQOA 1UAXA 2FSJA 4DS5A 1Q8IA 1ESVA 2QI2A 1XC3A 4Y1DA 1VQNN 1N34K 4X65K 1RILA 4CGJA 4FM1A 1QTMA 2G8HA 4W5RA 3V1OA 4H5TA 1BIUA 2P9UA 4CZFA 4H0VB 2OYQA 2HHVA 3MEDA 3G0ZA 3H3OB 1NJXA 1S1UA 4NCAA 3TTDA 1K8AO 3CCLN 4FLYA 3MN6A 3S3OA 3IKMA 3QDKA 4CJEA 3DLKA 3HOSA 1QHAA 1RBVA 4LSLA 4CGDA 4DU3A 3THYA 4CGIA 3TAEA 3C0BA 1E3MA 4OKJA 4C8LA 4KHQA 1C0TA 2IIRA 1LWCA 2P51A 3ZT4A 3HP6A 1L3TA 4HWIA 4IFEA 3H46O 1R59O 4OPKA 3ZT0A 3NDKA 2FLOA 2RHKA 1IG8A 2DFFA 3AVIA 4BVPA 3AA2A 4KB0A 1JLCA 4CJUA 1DKGD 3C6UA 4QOZB 4M45A 2OA8A 3OJSA 4FVUA 4CHNA 1EETA 1D9FA 4EZ9A 4FJ5A 1NWKA 3DXKA 3T1YK 4AHTA 3T69A 4FK2A 4GNIA 3HOTA 3VQQA 2OZSA 5CYQA 4GV9A 3QEXA 4X62K 3FZFA 4OPAA 4FJXA 3LZIA 4CFDA 2YKNA 3AVBA 1BQNA 1VQ9N 4JI1K 5AFUA 2Q97A 1E4FT 4FJLA 5CHIA 3AVAA 2HF4A 3C6HA 4IZ9A 4E7HA 4B9SA 4DTSA 4PHTX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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