3ERWA

Crystal structure of stoa from bacillus subtilis
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
PAVPAVFLMKTIEGEDISIPNKGQKTILHFWTSWCPPCKKELPQFQSFYDAHPSDSVKLVTVNLVNSEQNQQVVEDFIKANKLTFPIVLDSKGELMKEYHIITIPTSFLLNEKGEIEKTKIGPMTAEQLKEWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure and Functional Properties of Bacillus subtilis Endospore Biogenesis Factor StoA
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus subtilis
molecule keywords Sporulation thiol-disulfide oxidoreductase A
total genus 37
structure length 134
sequence length 134
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3erwA00
4MF5A 4HQZA 3PGTA 4KSMA 5LNKe 3FW2A 1GL8A 4J57E 1UC7A 2RM5A 4XS1A 2ALBA 3GRXA 1K0OA 4EE0A 1AQVA 3WD6A 3KD0A 2IFQB 4F82A 4KX4A 2H19A 2PVQA 1YQ1A 1OKDA 3IOSA 2BMXA 4MDCA 12GSA 4D73B 1B4PA 1E2YA 3HZ8A 3MNGA 2CAQA 6GSTA 2AHEA 3E0UA 4KE3A 1I9DA 3RPPA 4L0UA 3UBLA 1XCCA 3HVVA 2H0IA 1PD21 2XC2A 3F4TA 2MBSA 1MDJA 3BCKA 1SKSB 3CXGA 2H66A 1TRUA 4ILFA 4GSSA 1WOUA 4ISDA 2GTUA 3Q18A 2HRFA 2BJXA 3CSJA 1TXXA 3F3RA 1K0MA 4L5LA 11GSA 2GS3A 5J41A 2GQMA 1H4OA 1R5AA 3D22A 4FYCA 1O85A 2HNLA 5KN3A 2AB6A 1TTZA 4MZCA 1V98A 3DVWA 3LQ7A 6GSSA 4IP6A 2WCIA 3U6VA 2F3MA 2M46A 3SBCA 2GZZA 1GSDA 3GA4A 2FLSA 5HFIA 4GCIA 2KP2A 2MBTA 5GSSA 2PGTA 4KDXA 5AGYA 1OE8A 2XPDA 1EGOA 5F0GA 5EY6A 5GZZB 6GSYA 4K9ZA 5AISA 3ED3A 5EPFA 1URMA 2RM6A 1VF4A 1JZOA 6GSUA 1JZRA 5HFKA 2IMDA 2B7JA 3LXZA 3IV4A 2M72A 5HR0A 2CVBA 4MCUA 3ZRDA 2B3SA 1H75A 1VF2A 3L9UA 2D2ZA 2OBKA 1PN9A 5IMZA 2YWOA 1ERWA 5DAKA 2L6DA 3FK8A 4F9ZA 1AAZA 5DAKB 3APQA 5ELGA 1QMVA 3ZITA 2H30A 4AGSA 1XIYA 5DCGA 2LQQA 10GSA 2MZCA 4HJMA 1EOGA 2OKAA 3TJBA 3ZMLA 4EC0A 3H79A 2DMMA 2E2GA 2O8VB 4WBJA 1VF3A 3GH9A 4WR5A 5B6MA 4ECCA 2H0HA 1XVWA 5DJMA 2B5XA 3TJGA 3K8NA 1A8LA 4EVMA 2A4VA 1XWGA 1EEJA 2FUG2 4NXIA 2FA4A 4MPFA 1G0TA 1F37A 1TI3A 3F3QA 1XWKA 4ZL7A 2C0DA 1XWAA 3HJMA 3H1NA 3U5RE 2OADA 2H0GA 4IQ1A 3ZIJA 4GLTA 1XVQA 4Q5NA 4FO5A 2H1AA 4LL4B 1Z9HA 5A4VA 2DJ3A 4QL9A 1NHYA 1ZCPA 3A2VA 2R3XA 2RUEA 2VLVA 1SL0B 4Z7XA 3FY7A 2OE0A 4Q5QA 2DJKA 2OJLA 3EMPA 4G10A 4OO5A 4KDUA 4KSOA 4TR0A 1R7HA 4GRFA 1V9WA 4ECIA 2PN8A 2IL3A 1YDKA 4YQVA 3AY8A 2EC4A 1RW1A 4DSSB 1I5GA 4HS1A 4ID0A 3DEXA 1TKDB 1G6WA 3M9JA 1FO5A 3KEBA 3QPMA 1BG5A 5ECIB 5KEJA 4ZIJA 1FB6A 2H76A 2L4CA 4O92A 2DJ0A 4WBRD 5A4UA 3QOUA 5F8BA 4K8MA 3GKMA 4K7NA 1GUKA 3E9JB 1MEKA 5GAND 4PGTA 2VD0A 3GUSA 3TJJA 4YQUA 3D4TA 2IMIA 3HD5A 1M0UA 1AW9A 3V1WA 3LEFA 2VIMA 1V40A 3QAGA 2F51A 2WDUA 4KH7A 3GX8A 3IPZA 1TU8A 5F07A 3DMLA 2FCHA 3E3EA 4FH8A 3CRUA 2C3NA 3DVXA 1FHEA 4PNFA 3ZVJD 5CO3A 5DQYA 2JSZA 1G7OA 2JSYA 3H8QA 22GSA 5ECKB 2H75A 5F05A 1TU7A 4WF5A 1RQMA 1ZL9A 1BQ7A 1MD3A 7GSSA 5G30A 1THOA 2H1BA 3WYWA 2CVKA 5GAPD 1GSYA 4EXJA 5JWRB 2HE3A 1YEPA 2L6CA 4POMA 4KW6A 4XIHA 4NHZA 3UJ1A 2HSHA 3TKQA 4E8HA 4WXTA 2WJUA 3VPQA 2CT6A 1ST9A 1SYRA 1ABAA 4NWYA 4HUAA 1GWCA 2V2GA 5IMFA 2EIRA 2CX4A 2DJ2A 4TXOA 5G31A 3APSA 5HR1A 3LG6A 1OYJA 1EZKA 5ELAA 2C0GA 1GH2A 4TXOB 3GN3A 1GLQA 2B1LA 2WGRA 3D21A 2WFCA 4ZB6A 3HJPA 4CW9A 3DGQA 2I4AA 4K6XA 2QGVA 5E59A 3KZQA 3HXSA 1O81A 4JEDA 5E4WA 4JZQA 3ZTLA 3MSZA 2H6ZA 3UARA 3FKFA 2C0EA 1Z7RA 5IIZA 3HZ4A 5IPHA 1OVNA 4AJ6A 4JRRA 5FHIA 2XHFA 4HEA2 2DSAA 5ECRB 3DKSA 2FNOA 1YKCA 1GSEA 3FR9A 3GKNA 3UVHA 2DJ1A 4KUNA 3Q19A 2EIOA 3LFLA 3UIWA 2HYXA 3ZFLA 1WJKA 2X8CA 3D6IA 2GDRA 1PX7A 4QL7A 1MD4A 1VF1A 5AIVA 1T1VA 3P7XA 5G5EA 3JCML 5D93A 2N5BA 3GYKA 1X9MB 3W8JA 4KB3A 2VM1A 1GSQA 2E7PA 4EO3A 2AAWA 1V2AA 1LBKA 4ZL9A 5LCZA 2O85A 3EU4A 3EWLA 2FA8A 3ME8A 1EV9A 5ENUA 2KOKA 5IO2A 2KLXA 2AUVA 4GTUA 4E8EA 4JBBA 3DWVA 5IQYA 4OO4A 4I5QA 2CZ3A 5CRGA 1W89A 3BOAA 3MDKA 4I2UA 1SJZA 2IJYA 2GVPA 2C80A 2LS5A 3EINA 2VL3A 1R5PA 3RBTA 1UN2A 2HRNA 2YZUA 4PQIA 5F06A 1PSQA 4ZBDA 3ZVJA 2VCZA 2VLUA 3GV1A 4P3YB 4AJ7A 1JLVA 2CV4A 1ZMAA 2X64A 2NDOA 1MTCA 1J0FA 3LWAA 5ECMB 2V6KA 4MJCA 4N0VA 2PPTA 2NPBA 4PXOA 4DSQA 4YAVA 5ECLB 3CSHA 5JWQB 3GHAA 4TR1A 5DJLA 2ZNMA 3FR6A 1KTEA 1CQHA 3VWUA 1O8XA 3ERGA 13GSA 1TOFA 4HOJA 2P5RA 5ECHB 1U88A 4TR1B 1C72A 3IAM2 4DSRA 4RQXA 2V1MA 1OC8A 5ECOB 3IK7A 4N11A 4L5OA 5IMDA 5A4WA 4MF6A 4DVCA 4J56E 5B6NA 4L0WA 1AUCA 4IKHA 2HLSA 3GTUA 1GSUA 2LV3A 5IM9A 3FZ9A 4PQ1A 5DDLA 5JCWA 1TJDA 3GTUB 1WMJA 1VRSD 4EKZA 1NW2A 2AJQB 3TB2A 2VL2C 4GQCA 4TVEA 2LEGA 2O7KA 2IMFA 2K8SA 1B9XC 19GSA 2HI7A 2DLXA 2H70A 3TJKA 3ME7A 4YAPA 3F8UA 4EUYA 1Z6MA 3BBYA 4YH2A 4HZ2A 2VUPA 2LNSA 1ILOA 2VCXA 4PQHA 2MYGA 5JCGA 1K3OA 2LJRA 1TRVA 3EE2A 5HR3A 2VOCA 4V2MA 2O89A 2IMKA 1WRYA 4IS0A 4Q5FA 1DBYA 4MABA 1F3AA 2LTKA 1T3BA 3RAZA 5G5FA 2H8LA 2XBQA 3PR8A 1A8YA 4NHWA 2QSIA 5HR2A 1DE2A 1EGRA 1WIKA 3EURA 2YOIA 4BVYA 3C1SA 1U3AA 3H4KA 3KH7A 3ZL5A 2GT6A 1K0BA 1XW9A 3L0HA 3PINA 4XRAA 1JLWA 1K3LA 3KJYA 2J9HA 1FB0A 4MJAA 1XXUA 1FW1A 3F4RA 3ERWA 4KNDA 5D9WA 4K0NA 3HYPA 1B8XA 2IMEA 5A5KA 2JZSA 3IXRA 2K8VA 1SL1B 5IOXA 1GLPA 1OC9A 1GNEA 1R26A 5KN0A 5JWOB 1XFLA 4XCSA 4ML6A 4RUVA 1YKAA 2YANA 1OC9B 3GFKA 2QC7A 3RDWA 1OKTA 5H5SA 1PX6A 1U3IA 4IQAA 5C04A 1GRXA 4L8EA 1XW6A 2NTOA 3IE3A 1THXA 4WEYA 2A2RA 2E0QA 3ERFA 2ON5A 1ML6A 2YP6A 2VO4A 2H1GA 1ERUA 2R37A 3Q74A 2GZPA 3CBUA 1SK0A 3QD9A 4AF2A 2XPEA 1NSWA 9GSSA 2I9HA 3APOA 2I81A 2A2SA 5LD0A 2F8FA 4TR3A 2H71A 3FZAA 4RI6A 2VCVA 4I6XA 5J3RA 4HJ2A 3M8NA 3DYRA 3GL3A 1RK4A 3F6DA 3KH9A 3HCZA 1GNWA 4K1FA 3FRCA 1PL1A 4POLA 4TN8A 4MP4A 2FD3A 1TK8B 1AIUA 3F0IA 5G1LA 1Y25A 2B1KA 3C7MA 3TKSA 8GSSA 3ZYWA 4NMUA 1BX9A 2GQLA 4XRDA 5B8AA 3WT2A 2ES7A 2L57A 2VCQA 4OFMA 1V58A 5ECSA 1F3BA 3GKKA 2DBCA 4HQSA 1AXDA 4PNGA 2MMNA 4XS6A 2JACA 3FYGA 2CA8A 4GXZA 1OE7A 4TKYA 1SKRB 1PMTA 1X5EA 1FVJA 5D9VA 2DJJA 2H01A 2QKEA 1TDIA 3M9KA 3NOFA 2DIZA 2K9FA 3ISOA 3D4MA 3HDCA 1SL2B 2VCTA 4K7OA 4IHUA 5KN2A 1ZOFA 1U6TA 1G7EA 4MPGA 3KTBA 2XBIA 3S9FA 1WWJA 2CX3A 4WKWA 3L4NA 4JE1A 1MDIA 4O32A 1Y6EA 3GH6A 4MF7A 1PGTA 3WGXA 2YWIA 18GSA 3EMXA 2K6VA 3D0ZA 4FIWA 3VLNA 4BA7A 1XOBA 2LRTA 4IN0A 5IMVA 3TOUA 1JFUA 4OFNA 2X99A 3DRNA 2CAIA 5G2ZA 1K0NA 5EL8A 2CVDA 4MLYA 1S3DA 1JHBA 1M99A 1GULA 2YJHA 1SKWB 1UA5A 2GSQA 1ZYEA 5CRHA 3UVTA 1T4YA 1GTAA 4IBPA 4MZBA 3P90A 2GSTA 2RIIA 3GMFA 1Z7PA 5ECPB 2PMTA 5J4UA 1FG4A 4X43A 4FYUA 4O5RA 1PKWA 2NBSA 3QAWA 3N5OA 3EVIA 4G9HA 1A2JA 17GSA 5INYA 1GSFA 4K7IA 1TP9A 1GTUA 5DBQA 2IWTA 2NVLA 1QFNA 3ZLPA 3TJFA 2B5YA 2VD1A 3VI5A 2YV7A 1TK0B 2PERA 1EOHA 4QQ7A 2OBIA 20GSA 1K0AA 4XTSA 3KIJA 2R6KA 3EU3A 4I8BA 1AC1A 3J7Yk 1AQXA 3O76A 1DUGA 1XZOA 4WR4A 1ZGNA 1SK2A 3WGDA 3HA9A 5IO0A 4EF0A 3HY2A 4EDYA 3P2AA 1YY7A 4MJEA 2G0FA 2VAFA 3HHVA 2C8UA 1JZWA 3TKPA 5FT3A 4IVFA 1BEDA 4V1Ag 4OFTA 1GUHA 2LSTA 2F9SA 1ACVA 4OCEA 4V2LA 1HYUA 3F4SA 4ZBAA 2H72A 4PUFC 2J23A 2R5GA 2O87A 4K2DA 1K0CA 4N10A 4NPBA 2ZCTA 1HNBA 3IA1A 3I69A 4F0CA 2YN1A 3A2XA 3TGZA 4O7HA 3NZNA 4LL1B 1S3CA 4PURA 1HQOA 3M1GA 1FOVA 5HFGA 5CREA 1F2EA 1SD9A 3F6FA 4G19A 3C73A 4POBA 4TRXA 1Z5YE 1QQ2A 3P8WA 4DEJA 1SK1A 1Z3EA 1YEXA 3TUEA 1JZDA 3KP8A 3UBKA 1DE1A 1KBNA 4MMMA 1UVZA 4GQFA 3RHCA 4BWQA 1M9AA 2OACA 3A2WA 2Z9SA 1K0DA 2VL9A 1USBA 2C1YA 1LU4A 4JR6A 1G6YA 5CP1A 3FHKA 2H73A 3DIEA 4X0XA 4IP1A 3QAVA 2LJKA 5EVOA 4ZB8A 1A0FA 3CMIA 4MZWA 1ZZYA 4GF0A 2VM2A 1V57A 1M2AA 2VCWA 1XPVA 1XWCA 2IFQA 1A2MA 2HSYA 3KXOA 3Q6OA 3O6TA 2AV4A 5G1KA 3GIXA 4TOPA 3UEMA 4D73A 1TRWA 1U87A 2YCDA 4AJ8A 3TRQA 4CHSA 2FWGA 3O3TA 1DSBA 5ECQB 1X5CA 2OE1A 3G7JA 2FGXA 5CYYA 4GSNA 3ZZXA 3R2QA 3UL3A 2TRCP 3FR3A 5IMCA 3HVXA 1SJ6A 1WPIA 2N5FA 3HVSA 4KA0A 4MA9A 4BVXA 3KTLA 4ZILA 2KUCA 2R2JA 2L5OA 4ZXGA 1YJ6A 1QXHA 2REMA 1J08A 3CYNA 3I43A 3GSSA 3LXTA 1SJIA 2JZRA 3VWXA 4TR4A 2GLRA 2JZTA 2JL4A 1T00A 2G2QA 1F9MA 1YZXA 1OAZA 4KDYA 2OE3A 3D5JA 5D9XA 5FWGA 4BPYA 1EV4A 3MAKA 4H86A 4YQMA 1R4WA 3IRAA 2YZHA 3ZREA 4LA1A 4EDZA 3FZ5A 3I9V2 2FWFA 3W6GA 3UMAA 2YPMA 4NV5A 1GTBA 6GSWA 1GUMA 2PBJA 3IHQA 4OWYA 2L4QA 3CRTA 3RPNA 3IBHA 5D73A 1SD8A 5J9BA 1GSSA 4MH3A 3C8EA 1T7PB 2GQKA 3BCIA 4ZB9A 1IYIA 3G7IA 2WRTA 3VURA 5H5QA 1X0RA 2FWHA 2P31A 4FYBA 2IIYA 3GL5A 3TDGA 1QUWA 5B8BA 4LMVA 1BAYA 1PL2A 2LKUA 2H1DA 4MJBA 2ON7A 1XOAA 4N30A 4ZBBA 3LJRA 1N8JA 2IPAA 2MMOA 2V41A 1TRSA 3FZ4A 3GURA 1PRXA 2H6YA 4NV2A 1A0RP 4PX1A 3TKSE 1VGLA 3H93A 2C3TA 1M7TA 4RQRA 4GSTA 3G9BA 5KN1A 1SENA 3N9JA 5AIXA 2HFDA 4ECJA 1X5DA 2PUKC 2WB9A 3QDNA 3L9VA 2BTOT 2RUFA 1SU9A 3WT1A 1HNCA 3F9UA 1TK5B 3DD3A 5ABRA 3EYTA 2VLTA 3GKXA 3W8SA 1XWBA 2WZ9A 3A3TA 1TW9A 1FVKA 2F8AA 4ZL8A 1F6MC 2P0GA 4OMVA 5ID2A 3C71A 2JU5A 1GTIA 1T4ZA 1M2BA 1N2AA 2C3QA 2RLIA 2DIYA 2M80A 5ID2B 1Q98A 1W4VA 5D9TA 3CTGA 1YF0A 3A5WA 2LUSA 16GSA 2GT5A 5CRWA 5J9CA 1Q4JA 3QFBC 5CAXA 3VWVA 3BJ5A 3LYPA 2FHEA 3F63A 2DC5A 2P5QA 4MH2A 3TCOA 2L59A 3LGCA 14GSA 4KCAA 1HD2A 3NIVA 2H74A 4I2TA 3SWLA 5D8IA 2E2MA 1NHOA 1TI1A 2TRXA 3TRPA 3L9SA 4I97A 2WULA 4MK3A 3M3MA 5IOWA 2KHPA 4WETA 3EC3A 4HU7A 4IJIA 3IK9A 4N0ZA 1EWXA 4DSSA 3PH9A 2N5AA 3G7YA 1PA3A 3GX0A 4XHMA 4V2NA 2LRNA 1CQGA 4WF4A 1GP1A 2V32A 2R4VA 3C1RA 5CNWA 1QGVA 2CZ2A 2MMAA 1B4QA 3TKRA 2TIRA 2YV9A 3GNJA 1EP7A 2X8HA 4NAXA 2HT9A 3VPTA 5DCHA 2C0FA 4TW5A 1XW5A 3LORA 1ON4A 5IPGA 3KMNA 3TOTA 2L5LA 3UAPA 2FY6A 1WP0A 2HZEA 5J5NA 2MMZA 3IC4A 2B5EA 3LSZA 3QCPA 1S3AA 2HZEB 1BYEA 3J7Yb 1J9BA 1ERTA 4IJ3A 3KCMA 4F0BA 3IR4A 5AN1A 1X9SB 1A24A 3HJOA 4KGIA 1A2LA 1B9YC 2PU9C 3M0FA 1K3YA 1M9BA 5L71A 4IELA 2LQOA 3VFIA 2H6XA 1KEBA 2GGTA 1MDKA 4V1Ap 3VK9A 3VWWA 3ZFBA 4ECBA 4ML1A 4BL7A 4BWSA 1FAAA 2GSSA 3UOMA 2PVOC 2GZYA 4HDEA 4RI7A 5JCUA 6GSVA 3QMXA 5COHA 4K0GA 2LJAA 2B7KA 4IW9A 4HI7A 2EIQA 3TKSC 1KNGA 3WGEA 1B48A 4JU5A 4Q5RA 1LJRA 2X8GA 4HU9A 4F03A 2HZFA 3I6AA 5C00A 4PUAA 2LNTA 2YWNA 3QR6A 2DMLA 3GSTA 2HXKA 6GSXA 5D96A 5GSTA 5DVBA 4G2EA 1YF1A 4TXVA 1EEMA 1O6JA 1O7UA 1Z6NA 2GSRA 2YWMA 3MWHA 2B6MA 3IDVA 3KM6A 1ERVA 4HZ4A 1PQNA 2I1UA 3RHBA 2IN3A 3HKRA 2K18A 3KP9A 2JADA 4LLRA 3LYKA 3ZMKA 1IYHA 2YNXA 3VI7A 3KGKA 2WS2A 2KP1A 4GWRA 1SYXA 3L78A 1EP8A 2FWEA 4IGJA 4CDOA 3US3A 3ZIVA 4X1UA 1BJXA 2CQ9A 2AYTA 1M2DA 3IAS2 1ZYQB 3FEUA 4ULXA 1WE0A 3OR5A 2YJ7A 4JR4A 3BD2A 2LRCA 1T8EB 5DALA 4LMWA 2PWJA 3KMOA 3CSIA 1A23A 4J2FA 4KAEA 1QK8A 4EL1A 2C4JA 5DALB 5H5RA 4OCFA 1XBSA 3DXBA 2VL2A 4F2IA 3TRXA 5DQSA 4OD7A 4KCEA 2OA7A 5ECNB 1AQWA 1HNAA 4XS4A 1O8WA 2I3YA 1NM3A 3CTFA 1X9WB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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