The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
43
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sequence length |
187
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structure length |
182
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Chain Sequence |
b'SAPAQEHPEATVLFSDIVGFTEIASRSSPLEVSLLDELYQRFDAAIEEYPQLYKVETIGDAYMVVCNVTVPCDDHADVLLEFALRMHEEASRVASSPVRIRVGMHSGPVVAGVVGRKMPRFLFGDTVNTASRMESHGEAGQIHISEACYCCLRSKERFEIRERGNITVKGKGTMRTYLLSPL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Soluble guanylyl cyclase beta
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| publication title |
The crystal structure of the catalytic domain of a eukaryotic guanylate cyclase.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Chlamydomonas reinhardtii
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| molecule tags |
Lyase
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| total genus |
43
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| structure length |
182
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| sequence length |
187
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00211 | Guanylate_cyc | Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Nucleotide cyclase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YBT A; 4NI2 A; 2WZ1 A; 1AZS A; 4WPA A; 4CLT A; 3C16 B; 5IV4 A; 4NI2 B; 1AZS B; 4OYI A; 5D0E A; 4UST A; 1WC5 A; 4CLK A; 4USV A; 1FX4 A; 4CLZ A; 1CUL A; 1WC3 A; 3UVJ A; 1CUL B; 4OYO A; 3UVJ B; 5D0H A; 1TL7 B; 4OYB A; 4CLW A; 4WP3 A; 4P2X A; 1WC6 A; 1YBU A; 2GVZ A; 1AB8 A; 2GVZ B; 4CLS A; 4CLF A; 4OYM A; 1CJK A; 4CLL A; 1WC0 A; 1CJK B; 4CM2 A; 3C15 A; 4OYW A; 1CJV A; 3G82 A; 4OYP A; 2W01 A; 2GVD A; 2QV6 A; 1CS4 A; 1Y10 A; 3C15 B; 4CM0 A; 1CJV B; 4OYX A; 2GVD B; 3R5G A; 1CS4 B; 4WP8 A; 3C14 A; 1CJT A; 4P2F A; 4WP9 A; 4CLP A; 2BW7 A; 3C14 B; 1CJT B; 1WC1 A; 4OYZ A; 4CLY A; 4P2M A; 3ET6 A; 5D0G A; 1FX2 A; 4USW A; 1Y11 A; 3ET6 B; 3MR7 A; 1YK9 A; 1U0H A; 3G82 B; 1WC4 A; 4OZ2 A; 4CLU A; 1CJU A; 1U0H B; 3MAA A; 5D0R A; 1CJU B; 4USU A; 1TL7 A; 5D15 A; 3MAA B; 4OYA A; 5IV3 A; 3C16 A; 4OZ3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FF2 A; 4QR0 A; 2H3E B; 2J9C A; 4OYI A; 2CQ3 A; 3BEG B; 3UFC X; 2WCX A; 4CLK A; 3BZQ A; 2Y3Y A; 2FC9 A; 4RBV A; 3EX7 B; 3M9O B; 3FDS A; 2YVS A; 3W2V B; 2GJF A; 3NS5 A; 1S10 A; 4HL9 A; 5F3Z A; 3CJ3 A; 2G1H A; 2MZR A; 5J2N B; 5DDQ C; 5HLF A; 3K57 A; 2E5L F; 2H4Y B; 2O66 A; 5JUM A; 1SVD A; 3HVT B; 5LSL A; 2LDY A; 1ZS6 A; 2YKN B; 2U2F A; 2BJ9 A; 4HTI A; 3UO0 A; 3KLH B; 1EAY C; 4V1A k; 2HZA A; 1M5S A; 3KHR A; 3VTI A; 4OZ1 A; 5B7W A; 2UVU A; 4U8V A; 1QSL A; 2V69 A; 3CJK B; 4J7C A; 1S1U B; 1ZPV A; 1FWL A; 2HFO A; 4PZV A; 2X7I A; 1H0H B; 5DG7 A; 5IT9 U; 2A3J A; 3ICL A; 1TL7 A; 2CNO B; 4FNI A; 5IT4 A; 1VQN S; 4LFB F; 4LBP A; 2MTL A; 2XY7 A; 4X62 F; 2UVR A; 5F0U A; 4AL5 A; 2GV1 A; 3NS6 A; 4ZLN A; 1S9G A; 1Z2L A; 2XCP A; 4LFC J; 2HK2 A; 4UUW A; 5J1N A; 4ZVF A; 2GVZ A; 3FBB A; 4DSE A; 2B6A B; 1NK5 A; 3IBC B; 5G0R A; 2OTJ S; 1M1K T; 5FLX Y; 2ZC4 A; 2Y8Y A; 1S79 A; 5KFL A; 4YR2 A; 2QEX S; 1VBK A; 1TQL A; 3EM1 A; 2N7C A; 1FNX H; 2BJ8 A; 2VV5 A; 4DX7 A; 3HT3 A; 1FJ7 A; 3KK3 B; 1W7W A; 3M9M B; 2WB4 A; 3W64 A; 2LU1 A; 3OUY B; 4MIB A; 1FRJ A; 2AX1 A; 4PEO A; 3GWC A; 2BEF A; 2ZVI A; 1U1O A; 4RNH A; 4XPE A; 1UFK A; 4B9L A; 7AT1 B; 4TQR A; 2A6O A; 4X65 J; 1RT3 A; 4LIR A; 3RB6 A; 2BR0 A; 5I4M A; 1RXO B; 2A0F B; 4L75 A; 4I6W A; 4LFA J; 3JSM B; 4ZN3 A; 2HMI A; 3FBF A; 2YQ3 A; 1AZS B; 3RB3 A; 2ERR A; 1U6B A; 3L09 A; 2IC3 B; 3RB4 A; 3QRQ A; 1ULR A; 3NGR A; 2VBY A; 1RZM A; 3IRX A; 4N5S A; 5AE3 A; 1SH3 A; 2MZJ A; 2CNN B; 2RQC A; 3AA8 A; 1YGY A; 1FJG J; 1OS5 A; 1EQM A; 4OJ3 A; 3SXL A; 2MSS A; 2ACM A; 3IG1 A; 2DNK A; 4M5I A; 4N47 A; 1HNV A; 2QX0 A; 3C15 B; 5D78 A; 2RRA A; 2MZ1 A; 1ZA1 B; 1JLE A; 3HZE A; 5FII A; 4USM A; 1U02 A; 3CCU S; 2R3V A; 2IYI A; 5D0G A; 4Z7C A; 2HAF A; 4LJM A; 1RAF B; 2QG9 B; 4J91 A; 3MWB A; 4FYX B; 4QIE A; 3TA2 A; 4PXC A; 3M4X A; 2IMW P; 1WEX A; 2QYG A; 1GX6 A; 1RT7 A; 1BUX A; 3AA9 A; 3C16 A; 3DGV A; 4HDH A; 3FBC A; 2H4W B; 3SCK E; 2XMW A; 3DU5 A; 2YPZ A; 4LRC A; 1EP4 B; 2JC0 A; 1WOS A; 1JLC A; 2ZH1 A; 3GV8 B; 3KJV B; 2KM8 C; 4P10 A; 1FHT A; 2KHC A; 2VDI A; 2VHG A; 5HP1 A; 2H51 B; 3D1H A; 2VZ9 A; 5A8K A; 4ZVE A; 1RBO B; 1ZA2 B; 3X1L B; 2KYZ A; 4ILM A; 2QFJ A; 2Y0B B; 2BUN A; 4USH A; 5SZT A; 1OQ3 A; 3RGI A; 1C1C B; 2C42 A; 3EPG A; 2H5J B; 4KC5 A; 4UQG A; 3D0H E; 1YJ9 S; 1X9M A; 1CJT A; 1WKL A; 3O2I A; 4GKJ F; 2BOA A; 4LF5 F; 1YTY A; 1IVZ A; 3K8V A; 4O3O A; 2J7U A; 2B9W A; 4NZ7 A; 3DDI A; 5HVH A; 1MU2 B; 4IR9 A; 4WFY A; 2AV5 A; 1WC4 A; 3CCT A; 3A3P B; 1IBK J; 3BDP A; 2AU0 A; 2XS2 A; 4RKU C; 3E01 A; 4RNO A; 4JI2 F; 2LQJ A; 2MJN A; 1KBR A; 4UY8 T; 2MB0 B; 2IPO B; 1U0S A; 2CVI A; 1NKE A; 1NZ8 A; 2DIV A; 5GAD I; 2ZE2 A; 1WF1 A; 2BAC A; 2EFG A; 3AB4 B; 1U8S A; 3RBD A; 1X4A A; 5DDO C; 3PRD A; 1H73 A; 2WK4 A; 4TYA A; 3PIP Q; 3EYZ A; 3IRW P; 4DUY J; 5DET A; 3GSI A; 1TL5 A; 1VK3 A; 3LO3 A; 2LEP A; 2LVW A; 3QWU A; 2E5I A; 4JYA F; 1KFS A; 4RW6 B; 5IC4 B; 4ZLL A; 2IAJ A; 5K8O A; 5F0W A; 5KT7 A; 3FRZ A; 4PWW A; 1OY8 A; 3DLE B; 1HYS B; 5K9F A; 3J80 U; 2VFV A; 4URS A; 3KDO A; 4A4J A; 3UN5 A; 2WOM B; 1VS3 A; 4ALZ A; 1WEZ A; 2W9C A; 3I4P A; 4AYB D; 1IBM F; 2GHP A; 1G3O A; 4PPZ A; 1RCX B; 4C98 A; 2Z8Q A; 4PUO B; 1JIH A; 4NEZ A; 2CDR B; 2BW2 A; 3MDF A; 4GKK J; 2MPU A; 4EFA C; 1DTQ A; 4J9O A; 5DLG A; 2QLX A; 4YB6 A; 3OTC A; 2LKZ A; 4Q8F A; 1FNM A; 3O5T B; 2OD6 A; 2ZDP A; 4OYO A; 3R2D J; 2WW4 A; 2WSF C; 2HWI A; 2DRB A; 2J7W A; 4KO0 A; 1SCJ B; 4OX7 A; 3HVA A; 4Q43 A; 1Z4U A; 2Y1J A; 5I3U A; 2OEM A; 4M5D B; 4WCE Q; 4B08 A; 3W1Y C; 3KJF B; 1R0B G; 3NAI A; 4JI3 J; 2U1A A; 3TAR A; 4ZJO A; 3JQK A; 1HHT P; 5LMN J; 3FEX B; 5F8H A; 4MMO A; 4MK8 A; 3ILJ A; 1JXL A; 4XPC A; 1X60 A; 1Y11 A; 3CB4 A; 3LAL A; 1ZZF A; 3C6U B; 4U96 A; 3W66 A; 3OR2 A; 1HQU B; 1TK8 A; 3I56 S; 1BQN A; 2HS3 A; 1U2F A; 4O0I A; 1VJW A; 2MLY A; 3RBX A; 2VJU A; 3C19 A; 2R7V A; 3GJQ B; 4F3Q A; 1HR0 F; 4EK2 A; 2DBB A; 2IBK A; 3RRH A; 1UJ4 A; 3KLF A; 4DV3 F; 1J27 A; 2C3Y A; 5HJX A; 3O44 A; 3KOA A; 1O5J A; 4U7U K; 4DL2 A; 2LA4 A; 4JB8 B; 3AOC A; 2YX7 A; 2I2Y A; 1TP7 A; 1B0P A; 1Y7P A; 4EEY A; 4U7C A; 1JLA B; 5JJB A; 3EVO A; 1QVF R; 5T7L B; 1NU4 A; 2BQU A; 5L38 A; 1S0O A; 2DD8 S; 2K7K A; 1U8W A; 1Q8K A; 3T1H F; 2Q3P A; 1SV5 B; 3EWG A; 4ECV A; 1HWJ A; 4DUT A; 4WII A; 2KJW A; 5LMU J; 3I9Z A; 2R2R A; 1EHW A; 1P6T A; 3MI7 X; 2BZ2 A; 4KHR A; 5HMY A; 2JVR A; 5KFR A; 5HMX A; 5EWG A; 4AUK A; 1R3N A; 1S49 A; 3W61 A; 2HVI A; 3M2U A; 3D5M A; 4GVB A; 1N5Y B; 5GAH U; 3QBC A; 3GII A; 2MGZ A; 3SMZ A; 2PI4 A; 1Q79 A; 2QC3 A; 2R4F A; 1TKD A; 3Q0A A; 1S77 D; 2QRR A; 3GFY A; 4RUB A; 2RKI B; 3MUT P; 3E51 A; 3K59 A; 1Q8I A; 4CO0 A; 1TL3 A; 4DQS A; 4IFY B; 1WD6 A; 1GX5 A; 1IQZ A; 2IDL A; 2Y1R I; 1X4H A; 5KFP A; 3GU0 A; 4P71 A; 2J0S D; 3BBB A; 1QUV A; 2BAN B; 4N77 A; 2JWN A; 5KG2 A; 3L9Z A; 2ASL A; 3OL8 A; 5L1K A; 2ZBQ A; 2KXF A; 2BXJ A; 4WFA Q; 4URG A; 3HHD A; 3DCA A; 3M9N B; 1T05 B; 5CYM A; 1JJC B; 1KDN A; 3KLG B; 2CQC A; 4AD6 A; 1OSC A; 2FLP A; 4CLY A; 4NZ6 A; 1S6P B; 2UUB J; 4ZIT A; 3WX4 A; 4NLX A; 4DV2 J; 2YNF B; 1WHW A; 5CYQ B; 1R27 B; 3JB9 k; 2WW8 A; 3CJT A; 1WTB A; 1JX4 A; 1RT4 B; 2JEJ A; 1GTH A; 3D28 A; 1REG X; 3PO5 A; 1C0T B; 3QZ8 A; 2WZ1 A; 1PKU A; 4FF1 A; 1RAC B; 1C1B A; 4YDD B; 5AXN A; 2VB6 A; 3EZO A; 3FQK A; 4RW4 A; 1F6T A; 4NCA A; 5C5J A; 5DG9 A; 1TU0 B; 3KG1 A; 3H2V E; 5I42 B; 2VFR A; 4C97 A; 1PJ6 A; 1LXJ A; 4OHW A; 4DFK A; 3M6W A; 4LRA A; 4RU9 A; 2HWT A; 1TZ0 A; 4C8Y A; 2D9P A; 4LQ9 A; 3BO3 A; 2V2V A; 2BRL A; 5ETL A; 5E3A A; 4V19 J; 3OJS A; 2PEB A; 2QSF A; 4FVM A; 4OJG A; 1SC6 A; 4LSZ B; 2JLE A; 2GVD A; 3GIM A; 1RTI B; 2FVR A; 1RAH B; 2AJF E; 1S99 A; 3P45 B; 1UVJ A; 4TVA B; 2YPY A; 4TY8 A; 1HQE B; 1QSY A; 1N54 B; 1FES A; 2DXD A; 3M2R A; 3Q23 A; 2A1B A; 1MN9 A; 2HQG A; 1F5C A; 4NCG A; 4IYQ A; 1DHM A; 2AZ3 A; 3MOJ B; 3PHT A; 4QIG A; 1GTE A; 1RTJ B; 1NJY A; 4OYA A; 4Q8E A; 3M8Q A; 1WG5 A; 1AA1 B; 1VRU A; 3MOZ A; 1RHJ B; 2HLU A; 2KN4 A; 2VPY B; 4UOG A; 2VC1 A; 4XO0 A; 4F7V A; 4F50 A; 2HPU A; 4XAK A; 4YDX A; 4B9M A; 2UVV A; 2ZHB A; 3PVX A; 3DDN A; 3GIR A; 2ZKU A; 2M4M A; 1R0C B; 5D0H A; 1QJH A; 5A2Q U; 1JKH B; 3QGI A; 1I94 J; 1F9E B; 1WC6 A; 2XLI A; 2SXL A; 1B99 A; 4ILR A; 1SQE A; 1CJK A; 2J7K A; 5KG6 A; 4YB5 A; 2X3D A; 1TUG B; 1NKC A; 2Q43 A; 2W8K A; 2BM0 A; 4NCB A; 2FGO A; 3M2V A; 2KVQ E; 1TL4 A; 2UXC J; 2ZH3 A; 1X31 C; 3IR7 B; 1IXK A; 2QJ3 A; 2B9X A; 1JLG B; 1RI7 A; 1SIW B; 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2UXB F; 2W4P A; 4JBC A; 1D3W A; 1CC7 A; 2UV8 G; 1R31 A; 3OFE A; 1HA1 A; 4CI0 B; 1GH8 A; 3VAH A; 4I6Y A; 1Y00 A; 2JX2 A; 3IWN C; 4K4S A; 3F44 A; 4C3L A; 4P72 A; 3E3X A; 2BA9 A; 4LSL A; 3RJM B; 2BMB A; 2APO A; 4ZLP A; 2K2P A; 4LR7 A; 4DSF A; 2GO8 A; 2PO4 A; 5L9X A; 4P73 A; 5J2Q A; 1BQM B; 5CH7 B; 1MWQ A; 3UDE A; 1YK9 A; 1KLN A; 2P9G A; 1U0H B; 1XIQ A; 2B8Q A; 3HKW A; 1EZZ B; 1U1R A; 1WUU A; 1BY9 A; 4DR2 J; 2QMU B; 1XMB A; 5J2N A; 1XNQ F; 5AE2 A; 3Q8V A; 4R25 A; 1N0V C; 2J8A A; 1E6V B; 2GMJ A; 5KFT A; 3HSG A; 1NUE A; 3W60 A; 4DMZ A; 1FD2 A; 4IO1 A; 1HBM A; 5HQM A; 2OEJ A; 1JMT A; 3Q8R B; 1P8G A; 4LFC F; 4LT6 A; 2JLF A; 4F36 A; 5E3Q A; 1XEZ A; 3PFE A; 3DLB A; 2VF3 A; 1X4C A; 4N76 A; 4I2Q B; 1SBR A; 3BH6 B; 5K8P A; 1VQ6 S; 4CO3 A; 4FYY B; 5ETN A; 3BQ1 A; 3UD3 P; 2RUG A; 1YRT A; 1HIY A; 3BYR A; 2AT1 B; 3GG0 A; 3BH7 B; 4XDD A; 2OPP B; 1J5O B; 4Y2C A; 5KT5 A; 3CJK A; 4DU8 A; 3A3O B; 2GS8 A; 2HUR A; 5HAO A; 4ICL A; 1TL1 B; 4CTA B; 4F3O A; 2JJ4 D; 3R5B A; 3SQG A; 5DQG A; 3UE2 A; 3J7Y I; 2PMH A; 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