3EX3A

Human orotidyl-5'-monophosphate decarboxylase in complex with 6-azido-ump, covalent adduct
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 97
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ex3A00
4NJGA 3B0UX 2H3DA 4UTTC 1FY6A 3LXAA 3TR2A 1LBMA 2A7NA 2B7QA 5I3FA 4RR4A 1FWWA 2H6RA 3B03A 1OFEA 2PRLA 2V2CA 5KZEA 3P8JA 1WV2A 2ZDRA 5D38A 4UMBA 1A5SA 4JTHA 4D2JA 3FJLA 3BV4A 2I9EA 2AAMA 1GEQA 4O15A 3EXRA 1TQJA 2ZA2A 3G1SA 1CW2A 1MEIA 4NXSA 1F05A 2NXGA 5DLCA 3UPWA 1LZOA 3ELFA 1GVSA 4Q32A 1BWKA 4K38A 3GDTA 3B06A 3G22A 3DI0A 5EYWA 4IXHA 5T26A 1H50A 2G96A 3P61A 3S1UA 3SW6A 3RNDA 4FIRA 4K36A 3N2MA 4O1CA 2IQTA 1JUBA 3PVFA 4OT7A 3M0ZA 4AB4A 1Z41A 2GQAA 1DQWA 1JCMP 3C3NA 3EXSA 3S1XA 1OFAA 4NNBA 1KTBA 3NXFA 3O1NA 4FX7A 5FI8A 3L67A 4N9CA 1W56A 3LCFA 3LOTA 3KRUA 1SZEA 1XBXA 3GZ3A 1GG0A 5G4WA 1I2PA 3LBCA 3KRSA 1Q6LA 4RKAA 3E96A 4BI5A 4FNUA 4UFLA 4JDYA 3G0XA 4OGZA 5F2LA 1C8VA 4WOZA 1W5QA 4XTIA 3P62A 3N2XA 4OU1A 3C8FA 4R53A 3NEVA 3LGEA 1XL9A 1DQXA 5C55A 2BZNA 2GVGA 5E0KA 1F6PA 1WX0A 4NT0A 1RQHA 3HMJG 4UMCA 1XC4A 3N3MA 3EWZA 3W1TA 1OJXA 2CZFA 2B7PA 3P5YA 3E02A 4AXKA 2ATSA 4N9BA 2HMCA 3IIPA 5TBOA 1FCUA 1S5WA 1SO3A 4WJEA 5D2VA 3MMTA 3W7DA 3STGA 3HO8A 3M5XA 4GFSA 5FESA 3DU0A 6ALDA 3PBWA 2ZFAA 1UJPA 1PVNA 1DHPA 3STCA 3ZFHA 3GR7A 3UY7A 1KTCA 3WJWA 3O06A 3CWOX 3PSVA 4UCGA 1SQ7A 1S5VA 3EEGA 4OV9A 3FIGA 2RFGA 3NVTA 4FEZA 4UFMA 1W5MA 1DBTA 2W79A 1GG1A 4S2CA 2YW4A 4BI6A 1H61A 1V5XA 2J24A 3TXZA 1LLZA 3DKLA 2CW6A 3LCIA 4EIVA 3HGOA 3W9ZA 1O60A 5HR6A 1BEUA 4TIMA 5DCBA 3W2NA 3NL3A 5D30A 2VKZG 3LTYA 1R47A 5HJLA 3ZR4A 4Z1DA 3B8DA 3CQ0A 3M5ZA 4MYAA 4YMZA 4DXVA 4IX0A 3DGRA 1OFPA 3QPZA 1B4KA 2ZZ3A 4E2BA 4CQ8A 5KTLA 4H6KA 1YTEA 4MIMA 3W7QA 1I45A 3U2OA 3T55A 4JEQA 3UWUA 5LHFA 3P60A 1KFBA 2I14A 4LOCA 1U83A 4RV8A 1IXQA 5CG7A 5BOOA 3MBFA 2YCEA 1MZHA 3NAVA 1G4SA 3WK1A 4AHOA 4QITA 1S5TA 3PBYA 5HWMA 4NX5A 4TO8A 3KX6A 5LNWA 5D04C 1H60A 1D3HA 4KWWA 1QO2A 3ZWTA 4POCA 3GAKA 1EUAA 4QAIA 1R2TA 4JY8A 4C1LA 4RZ4A 3MP5A 3MI6A 4HPXA 4O10A 4TMBA 4AMAA 3FOKA 3TV8A 4O4WA 1G4TA 4Y90A 3BARA 1SPQA 1JRCA 1K03A 1ZAJA 3C61A 3L5LA 3DBPA 3QM3A 2VELA 4XUGA 2LLEA 4KFPA 3M6YA 2Y7EA 4O0ZA 1H63A 3PF3A 2NUXA 3BW3A 3PWAA 4AH7A 3TSBA 3KVLA 5EA9A 3NDOA 3USBA 5D33A 3SJ3A 1DKWA 5LSMA 1DVJA 5EL1A 4EF8A 4LU0A 1VLWA 1UCWA 1TSIA 2Y7GA 4FNTA 3IVTA 5AC6A 1TPFA 5A5WA 3R8RA 2RH9A 2ZCGA 3BLEA 4WZHA 1A5BA 5EKYA 3G8EA 4O50A 1QR7A 1SW0A 1TV8A 4MY8A 3U8GA 1X1ZA 2X1TA 4GXMA 4DPPA 4TX9A 3W7JA 4XKYB 1IIGA 2EKCA 4ORMA 1UUOA 4A22A 1K02A 3A23A 1L2UA 2YYUA 4KWVA 3QC3A 2R91A 1LBLA 3W1UA 3PBUA 4JTEA 3MBDA 5E93A 3WK0A 4GRSA 2B4GA 3S9YA 1K8XA 1WOBA 1RVGA 3DI1A 3H54A 5IM51 1SW7A 2V82A 3G0SA 3TW6A 4AWUA 3S5YA 3QF0A 1L6YA 4MY9A 1ME8A 3UXDA 3UNDA 1TQXA 3HG5A 1BTMA 3W75A 3IIZA 2J6XA 2Z6JA 1H7OA 4ZVJA 4ZMGA 2DJXA 2GOUA 4JIPA 3W7KA 2QUUA 4FX6M 4NQ1A 4YLWA 2X1RA 1ME7A 4IPJA 4R33A 3C2EA 3TMQA 3NQMA 3LBMA 2QAPA 1IXPA 1LOSA 1D3GA 4TR9A 3QW4B 2B0MA 1T99A 2OMAA 1GPWA 3QW3A 3LCGA 3PB2A 4UTWA 1TYGA 5DBUA 3TNOA 1QWGA 3MUXA 3PBVA 5D2XA 2EPHA 2E5BA 4N6EA 4ZQOA 1WDWA 3W2UA 3T4CA 2EAWA 1YTDA 3BG5A 4E38A 2V8ZA 1RR2A 3VNDA 3D0CA 2PE4A 1YTKA 1P5BA 3T40A 2DZWA 1V7YA 3WK2A 4LRTA 4PL2A 2JBMA 1NEYA 4PCFA 3FFSA 3G3MA 2Y7DA 5LNUA 4K7YA 4EWND 2G5WA 1LTDA 3CLMA 4JR5A 2R14A 5TIMA 5K2ZA 1PV8A 2YZRA 3LV5A 3N9RA 4E2DA 1KFKA 3RMJA 2QJGA 3G24A 3BW4A 2PRHA 1Y0EA 1GVFA 1XDMA 1H7NA 1TIMA 1BWLA 1TPC1 1TTPA 3G18A 2ZZ4A 2A1YA 4O16A 5K4ZA 3E9AA 2E6YA 1OABA 3JRKA 4OV4A 4LWWA 4MOZA 4MLJA 4MJZA 3NQ6A 3OA3A 2EHHA 4CCDA 4FNRA 4IX2A 4UTTA 5K9DA 3TUUA 1VYSX 3UD6A 2GJNA 4NZFA 1RV8A 1I2OA 3FYOA 4MJMA 2Y63A 3HGSA 1TTJA 2CLFA 2X1SA 3CB8A 4JTFA 4RCXA 5A8GA 1GOXA 3SZ8A 3GNDA 1G6CA 1VHCA 1PIIA 1M7OA 4HSNA 1H62A 1YPIA 1OYBA 5CPMA 3LRLA 1I2NA 2ZTJA 1UASA 5AOUA 3W87A 5FF2A 1E51A 3B0VC 2F84A 1KFCA 3UZJA 3W1NA 2DP3A 1HO4A 3C0JA 2YPIA 1HTIA 2DU2A 3L5AA 2WNNA 2ZA1A 3GXPA 4MZYA 1I8JA 2CU0A 4N6FA 3L66A 2E6DA 4GJ1A 4PA8A 1KM6A 5G4EA 4YL2A 1LRQA 2HSAA 3W7RA 3TC7A 3CHVA 1TPDA 2KZHA 4AF0A 2ZRXA 5DELA 2C1HA 1EP3A 4HIBA 2RDTA 3LRKA 2DZUA 1IIHA 3LLFA 4UUIA 1L6WA 4YWIA 1QCWA 3ANYA 2OT0A 4XBKA 4S2BA 4LY8A 1XUUA 2QCMA 4UTWC 3EWBX 4K7VA 3HJZA 2BSLA 4LC6A 5GVJA 1WXJA 1FXQA 3LI1A 1EP2A 4LNYA 5I3JA 5F1UA 3TROA 1YDOA 4RXGA 3O6YX 5G2HA 1O5XA 3GKFA 3S5OA 1W54A 1G4PA 1IGSA 2ZZ6A 3P82A 3LHYA 5DY2A 1XCFA 2WOQA 2JKPA 1LOLA 3SI9A 3PUOA 1JRBA 1O4UA 1HG3A 2E1DA 4XZ9A 3F4WA 2NZLA 2XN2A 4QNEA 3L5MA 4UTHA 2NWSA 2ZZ5A 3A5VA 3RFAA 2ZZ7A 3N14A 1TCDA 2E5DA 1GTHA 2ISSA 2HTMA 1VJIA 1MO0A 3EWUA 1ZY9A 5LZLA 1ZJIA 3W7HA 5KZDA 2QCDB 3RLVA 2V9DA 4UXDA 3EX1A 3NPWA 3B0PA 1AMKA 4JTJA 4QSHA 2ABAA 4ZZ9A 3G1FA 2CZ5A 1GZGA 3G0UA 4FF7A 3W2LA 1F6KA 3FEMA 1VHNA 3G1XA 3BPWA 3K30A 3TFXA 4RK8A 3GXTA 1K8ZA 1IXOA 2A0NA 4CNNA 1LORA 1GYLA 1QNVA 1XI3A 3BVJA 3OIXA 1I2QA 1K7FA 5AHFA 1OX4B 2P1FA 2PURA 5DCEA 3SR7A 3LX9A 3W74A 1LROA 4N2YA 3L68A 5SWUA 4HPJA 1PE1A 1YDNA 4DO6A 3O15A 3W1AA 3OG3A 5AN7A 3NO5A 3O05A 3MP4A 4HNNA 2Z6IA 1A5AA 3QZEA 4LVBA 3IV3A 3CTLA 4UTMA 3MO7A 5TQLA 3IGSA 5HINA 3UWVA 3STEA 5KSWA 2J88A 2NX9A 3CC1A 1Q6QA 4WY0B 3HQ1A 4JY9A 2Y7FA 2R8WA 3TK7A 1AL7A 3M5VA 4E0CA 3GB6A 3LHTA 4WD0A 1NF7A 1YADA 3ABRA 1KM5A 4FIQA 2CLKA 3GNNA 3ATYA 3NL5A 1FWRA 4PH6A 3EKZA 3MHGA 4Q33A 1OHLA 2CZDA 5KMYA 2NXHA 4QIUA 4I7UA 1OVDA 3GDLA 2X2GA 2Z0IA 2ZZ1A 2YSWA 2DORA 4NXKA 3WJSA 5HQEA 1QPQA 3UWQA 4A2SA 3NQAA 5G1TA 4R34A 1A50A 4DO5A 3MI2A 4DQWA 4O52A 1KA9F 1TREA 1TTIA 4BR1A 5AFDA 2CFFA 2W6RA 4RJEA 4IJBA 2XFWA 4I9AA 1WBJA 5AHIA 3S5NA 3FA5A 5AHNA 3W3OA 1ZNNA 4GUIA 4LS1A 5AHMA 3O07A 4UTIA 3W1LA 4JX5A 2DZSA 3A21A 1VCVA 1W0MA 3PAJA 3S42A 3W1MA 1JCNA 3ABSA 4Z08A 4B5NA 1GVRA 2XN0A 1X6UA 3L2IA 3QEZA 3QMSA 1IF2A 4UR8A 1W37A 2P0OA 4NJJA 4HSOA 3CEPA 3VE9A 4GNJA 8TIMA 1C9DA 4BF9A 5F4SA 3P74A 4NJIA 1KLYA 4FB7A 3EB2A 4WOQA 1Q6RA 4ZQCA 4MY1A 4UMAA 1EB3A 3IEBA 3EKLA 1TB3A 2B7NA 5DN1A 1J4EA 4YXGA 3THAA 1H7PA 4DELA 4WY0F 2WSYA 2VXNA 1ALDA 2V5BA 1W8SA 3HBLA 4GE8A 2UV8G 1THFD 3NQ8A 4GUJA 2Q8ZA 5EPDA 2GUUA 3GK0A 1N55A 2A6LA 3AO0A 1VR6A 4Z1AA 1TMHA 2NX3A 3CM4A 2AQWA 4PFMA 1MXSA 3VI2A 3W7CA 3O6CA 1AW1A 2W0UA 3M47A 4Q4KA 3E0IA 2C6QA 1PCWA 3FJ6A 4I7WA 3HPXA 4IMGA 4DPQA 1WOAA 4Y6GA 1BKSA 3TSMA 5LGZA 3MWAA 1PCKA 3VKJA 4X2RA 2TPSA 4W9TA 3W83A 3UXAA 3ATZA 4XWUA 4DBDA 3TIMA 5CPLA 3LI0A 3LERA 3S8HA 3MYOA 4JTUA 3TA6A 2A5HA 1Z44A 3LRMA 4LS2A 1N8FA 5D05A 3R2GA 1SW3A 3SY5A 1W5PA 3CPRA 1T96A 2QCFA 5D2TA 4AHPA 3BK0A 3F1QA 1M5WA 2DZTA 4O54A 3L0NA 3S1WA 3G1VA 1HO1A 1OFBA 1R2SA 4NU7A 5LNVA 3NPVA 3NNTA 2ISVA 2QCGA 1P0NA 2GJLA 5FF0A 4O18A 3W7IA 3P67A 1EEPA 1D9EA 4K6AA 4O8RA 1DJQA 5CZTA 3NM3A 1GQNA 3QMTA 4JTIA 4ONVA 1SR9A 2WJZA 2H3BA 3DFPA 4Y8FA 1EIXA 2HS6A 4RZ5A 5CZJA 5U4NA 5K7JA 5H91A 1UB3A 4DF2A 3MI3A 1DJNA 3R5EA 2VFFA 1OX6A 2OZ0A 4Z1BA 3KVMA 1EWDA 3V75A 1EUNA 3LHUA 1W3NA 3HGJA 5F2GA 3G1YA 3WK3A 2VFDA 2A7RA 2Y6ZA 2C13A 3TKFA 1TTQA 3KFTA 3HIJA 5CSSA 5K3VA 1NAL1 3FKKA 3DKJA 3PY2A 3JR2A 1Q45A 3GXNA 4O13A 1FXPA 4ZQRA 1ZFJA 3WFAA 2D73A 3TAKA 1B57A 3M44A 5F2MA 3S6DA 1ICQA 1SSDA 4UTUA 1P0KA 1MEHA 1R30A 2OJPA 1JCJA 2BWGA 1LLWA 1PHQA 4TMCA 3NQ7A 4JD4A 3NQDA 5FEXA 5FF3A 1JCXA 2EF9A 5FEZA 1VC4A 1GTEA 1VCGA 4G1KA 3P8IA 3W2JA 5AB3A 5D37A 3G3DA 4IUOA 3O16A 2H8ZA 3TSDA 3GYEA 3TCEA 6TIMA 2CZEA 3LV6A 2A7PA 1TJPA 3OVRA 4YCOA 1A53A 1HFBA 3HG4A 3MYPA 3R89A 2RKXA 1QMLA 4BK9A 3NL2A 1ICPA 1JCLA 3SGZA 3HG3A 1F5ZA 2E6FA 3FS2A 1TJRA 4XKYA 4MZ8A 3QMRA 2QEZA 1CX9A 4O1AA 3C6CA 3F4NA 4LV4A 4MZ1A 1EWEA 2CLIA 2R94A 3HPSA 5D2WA 3Q94A 4LTSA 2V2DA 5G2WA 4N9EA 1ZALA 2NWRA 3B4UA 3GDRA 1LCOA 1ZCOA 3NQFA 1P1XA 4MFEA 2RDUA 1OYCA 1H7RA 4AVFA 2FPVA 3LCXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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