The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
41
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sequence length |
157
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structure length |
157
|
Chain Sequence |
TLSILVAHDLQRVIGFENQLPWHLPNDLKHVKKLSTGHTLVMGRKTFESIGKPLPNRRNVVLTSDTSFNVEGVDVIHSIEDIYQLPGHVFIFGGQTLFEEMIDKVDDMYITVIEGKFRGDTFFPPYTFEDWEVASSVEGKLDEKNTIPHTFLHLIRK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| molecule keywords |
Trimethoprim-sensitive dihydrofolate reductase
|
| publication title |
Crystal structures of wild-type and mutant methicillin-resistant Staphylococcus aureus dihydrofolate reductase reveal an alternate conformation of NADPH that may be linked to trimethoprim resistance.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Staphylococcus aureus rf122
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| total genus |
41
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| structure length |
157
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| sequence length |
157
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| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2008-10-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Dihydrofolate Reductase, subunit A | Dihydrofolate Reductase, subunit A |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4QLG A; 3SH2 A; 3SR5 X; 4KFJ A; 3NXO A; 3UM6 A; 2ZZA A; 4NX7 A; 4IXF X; 3S3V A; 1CZ3 A; 3EEM A; 2G6V A; 4X5J A; 4QLE A; 1S3V A; 3FRE X; 1LY3 A; 2FZH A; 1DYI A; 4DPH A; 4KY4 A; 1RX6 A; 2W3W A; 3DG8 A; 4KM2 A; 3S9U A; 3DAU A; 4KJJ A; 1RA9 A; 5U27 A; 1RC4 A; 1DIS A; 1RX4 A; 4PSY A; 1LUD A; 1U72 A; 1IA1 A; 5ECX A; 3DL6 A; 3I8A X; 3JWC A; 1CD2 A; 3QL3 A; 3HBB A; 3QLX A; 2ITH A; 1BOZ A; 1HFQ A; 3Q1H A; 3HJ3 A; 4I1N A; 3TQ9 A; 4NX6 A; 3FRF X; 3VCO A; 2B3Z A; 3NZC X; 4I13 A; 4Q0E A; 3CSE A; 3JSU A; 3OCH A; 3QYO A; 4G8Z X; 3FY9 X; 3NU0 A; 4G3M A; 4ELG A; 3M09 A; 3R33 A; 2HXV A; 2W9H A; 3JW3 A; 1E26 A; 2GD9 A; 3SRW X; 3NXR A; 3FYW X; 4HOG A; 5HI6 A; 1DF7 A; 4LAG X; 1VJ3 A; 1PD8 A; 1U71 A; 1MVT A; 2D5N A; 3QLS A; 4KM0 A; 5HPB A; 1DRE A; 3TD8 A; 3F0S X; 1RB3 A; 4EIG A; 3JW5 A; 3IRM A; 1RX5 A; 4KLX A; 7DFR A; 4P68 A; 3QFX A; 1RX9 A; 3GYF A; 3KJR A; 3S7A A; 4KJL A; 2BLB A; 4KJK A; 4XT5 A; 3SQY X; 1DHJ A; 4DP3 A; 3TQA A; 1HFP A; 3NZD A; 3KY8 A; 2H2Q A; 4ELB A; 1S3Y A; 1RA8 A; 5CC9 A; 3K74 A; 1RX3 A; 1KLK A; 1YHO A; 2INQ A; 3L3R A; 5JA3 A; 1AI9 A; 4GH8 A; 4XT7 A; 3SAI A; 4LAH X; 3NXY A; 3QGT A; 3INV A; 4M6J A; 6DFR A; 3E0B A; 3FL9 A; 4TU5 X; 4IXG X; 1ZDR A; 3ZPC A; 3GHC A; 3JWM A; 4H97 A; 1DDS A; 3KJS A; 4XEC X; 3QLY A; 4DFR A; 4XT4 A; 2W9T A; 4KD7 A; 3SRS X; 2W3V A; 3QLR A; 5E8Q A; 5HF2 X; 1DRH A; 3SGY A; 1KMV A; 1DG8 A; 3EX8 A; 2QK8 A; 1DR4 A; 1DR1 A; 4Q67 A; 5CCC A; 1DYR A; 3FYV X; 4H98 A; 5HSU A; 4X5G A; 5U26 A; 4M2X A; 3N0H A; 3FQO A; 4EJ1 A; 4FGH A; 1J3K A; 1J3J A; 2CIG A; 3FL8 A; 4OSG A; 2W3A A; 1TDR A; 1RE7 A; 2FZJ A; 1DRA A; 4XRB A; 3SA1 A; 1IA2 A; 4ELF A; 1DG5 A; 3GHV A; 3IRO A; 2HM9 A; 1DR6 A; 4M6K A; 3FY8 X; 3IA4 A; 1RX1 A; 1LY4 A; 3FRA X; 3D84 X; 4Q0D A; 5HQZ A; 2DRC A; 4QJZ D; 4KNE A; 3KGY A; 1JOM A; 4HA7 A; 1S3W A; 2FZI A; 2P4G A; 1DLS A; 2W9G A; 2BL9 A; 3F0U X; 3ROA A; 4QI9 A; 3DAT A; 3DRC A; 3SRU X; 4P3Q A; 3CLB A; 1QZF A; 3GI2 A; 1RX2 A; 4X5F A; 4Q6A A; 1DDR A; 4OR7 A; 4KEB A; 5HT5 A; 2OBC A; 4HOF A; 1DR2 A; 1DYJ A; 4QJC A; 3EEJ A; 4P66 A; 1DRB A; 1RX7 A; 1M79 A; 3NZ9 X; 1IA3 A; 3F0V X; 3NRR A; 3CL9 A; 3NZB X; 4M7V A; 4DPD A; 3EEK A; 2W3B A; 3RO9 A; 4XT8 A; 4G95 A; 1MVS A; 3EIG A; 5DFR A; 3NXX A; 4H96 A; 3EEL A; 4ELH A; 4M7U A; 5JG0 X; 4FGG A; 1SEJ A; 1U70 A; 1RF7 A; 3FRB X; 3SRQ X; 4PTH A; 1DHI A; 2AZN A; 3DL5 A; 2W3M A; 1JOL A; 4EIL A; 3LG4 A; 3F0X X; 3QLZ A; 3JTW A; 4X5H A; 4PTJ A; 1PD9 A; 2D0K A; 1RH3 A; 3F8Z A; 3NZ6 X; 4X5I A; 3D80 A; 3QG2 A; 2XW7 A; 4ECK A; 1J3I A; 1OHJ A; 1DYH A; 2DHF A; 4PST A; 3JVX A; 4XE6 X; 2HQP A; 3K45 A; 2ANQ A; 3FQZ A; 1RD7 A; 3JWF A; 3F91 A; 1S3U A; 5HT4 A; 3SRR X; 1DR3 A; 1DR5 A; 5HQY A; 1M78 A; 5HUI A; 1RA3 A; 1DLR A; 3SA2 A; 1JUV A; 3NTZ A; 4CD2 A; 2CD2 A; 1M7A A; 2LF1 A; 2C2T A; 5HF0 X; 4H95 A; 5HVE A; 1DG7 A; 3NZA X; 2L28 A; 3RG9 A; 3DGA A; 3FQF A; 3K47 A; 1DAJ A; 1PDB A; 1RB2 A; 3NXV A; 1AO8 A; 2W9S A; 1HFR A; 1RA2 A; 3K2H A; 5EAJ A; 1AOE A; 1DHF A; 4LAE X; 3GHW A; 3TQB A; 1DIU A; 4KBN A; 5FDA A; 3CD2 A; 3F0Q X; 1DRF A; 3QYL A; 5HVB A; 3JWK A; 4M6L A; 3ZPG A; 4KY8 A; 3FQV A; 4ELE A; 3M08 A; 4KAK A; 3NXT A; 4DDR A; 3F8Y A; 3UM8 A; 1DR7 A; 3QLW A; 4LEK X; 3UM5 A; 4HOE A; 4PSS A; 4P3R A; 8DFR A; 2JYB A; 3IA5 A; 2C2S A; 4QLF A; 3FRD X; 3IX9 A; 5DXV A; 4RGC A; 4FHB A; 3FQ0 A; 3QL0 A; 4IXE D; 3IRN A; 3TQ8 A; 1BZF A; 4XT6 A; 3I3R A; 5ECC A; 3DFR A; 1RX8 A; 2KGK A; 3OAF A; 5HSR A; 3FS6 A; 2OIP A; 4EIZ A; 4HA9 A; 2O7P A; 3F0B X; 1VDR A; 2BLC A; 1KMS A; 4KL9 A; 4KYA A; 4QHV A; 2BLA A; 1OHK A; 3FQC A; 1D1G A; 1RG7 A; 3KFY A; 1RA1 A; 2ANO A; 4PDJ A; 1IA4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4QLG A; 3SH2 A; 3SR5 X; 4KFJ A; 3NXO A; 3UM6 A; 2ZZA A; 4NX7 A; 4IXF X; 3S3V A; 1CZ3 A; 3EEM A; 2G6V A; 4X5J A; 4QLE A; 1S3V A; 3FRE X; 1LY3 A; 2FZH A; 1DYI A; 4DPH A; 4KY4 A; 1RX6 A; 2W3W A; 3DG8 A; 4KM2 A; 3S9U A; 3DAU A; 4KJJ A; 1RA9 A; 5U27 A; 1RC4 A; 1DIS A; 1RX4 A; 4PSY A; 1LUD A; 1U72 A; 1IA1 A; 5ECX A; 3DL6 A; 3I8A X; 3JWC A; 1CD2 A; 3QL3 A; 3HBB A; 3QLX A; 2ITH A; 1BOZ A; 1HFQ A; 3Q1H A; 3HJ3 A; 4I1N A; 3TQ9 A; 4NX6 A; 3FRF X; 3VCO A; 2B3Z A; 3NZC X; 4I13 A; 4Q0E A; 3CSE A; 3JSU A; 3OCH A; 3QYO A; 4G8Z X; 3FY9 X; 3NU0 A; 4G3M A; 4ELG A; 3M09 A; 3R33 A; 2HXV A; 2W9H A; 3JW3 A; 1E26 A; 2GD9 A; 3SRW X; 3NXR A; 3FYW X; 4HOG A; 5HI6 A; 1DF7 A; 4LAG X; 1VJ3 A; 1PD8 A; 1U71 A; 1MVT A; 2D5N A; 3QLS A; 4KM0 A; 5HPB A; 1DRE A; 3TD8 A; 3F0S X; 1RB3 A; 4EIG A; 3JW5 A; 3IRM A; 1RX5 A; 4KLX A; 7DFR A; 4P68 A; 3QFX A; 1RX9 A; 3GYF A; 3KJR A; 3S7A A; 4KJL A; 2BLB A; 4KJK A; 4XT5 A; 3SQY X; 1DHJ A; 4DP3 A; 3TQA A; 1HFP A; 3NZD A; 3KY8 A; 2H2Q A; 4ELB A; 1S3Y A; 1RA8 A; 5CC9 A; 3K74 A; 1RX3 A; 1KLK A; 1YHO A; 2INQ A; 3L3R A; 5JA3 A; 1AI9 A; 4GH8 A; 4XT7 A; 3SAI A; 4LAH X; 3NXY A; 3QGT A; 3INV A; 4M6J A; 6DFR A; 3E0B A; 3FL9 A; 4TU5 X; 4IXG X; 1ZDR A; 3ZPC A; 3GHC A; 3JWM A; 4H97 A; 1DDS A; 3KJS A; 4XEC X; 3QLY A; 4DFR A; 4XT4 A; 2W9T A; 4KD7 A; 3SRS X; 2W3V A; 3QLR A; 5E8Q A; 5HF2 X; 1DRH A; 3SGY A; 1KMV A; 1DG8 A; 3EX8 A; 2QK8 A; 1DR4 A; 1DR1 A; 4Q67 A; 5CCC A; 1DYR A; 3FYV X; 4H98 A; 5HSU A; 4X5G A; 5U26 A; 4M2X A; 3N0H A; 3FQO A; 4EJ1 A; 4FGH A; 1J3K A; 1J3J A; 2CIG A; 3FL8 A; 4OSG A; 2W3A A; 1TDR A; 1RE7 A; 2FZJ A; 1DRA A; 4XRB A; 3SA1 A; 1IA2 A; 4ELF A; 1DG5 A; 3GHV A; 3IRO A; 2HM9 A; 1DR6 A; 4M6K A; 3FY8 X; 3IA4 A; 1RX1 A; 1LY4 A; 3FRA X; 3D84 X; 4Q0D A; 5HQZ A; 2DRC A; 4QJZ D; 4KNE A; 3KGY A; 1JOM A; 4HA7 A; 1S3W A; 2FZI A; 2P4G A; 1DLS A; 2W9G A; 2BL9 A; 3F0U X; 3ROA A; 4QI9 A; 3DAT A; 3DRC A; 3SRU X; 4P3Q A; 3CLB A; 1QZF A; 3GI2 A; 1RX2 A; 4X5F A; 4Q6A A; 1DDR A; 4OR7 A; 4KEB A; 5HT5 A; 2OBC A; 4HOF A; 1DR2 A; 1DYJ A; 4QJC A; 3EEJ A; 4P66 A; 1DRB A; 1RX7 A; 1M79 A; 3NZ9 X; 1IA3 A; 3F0V X; 3NRR A; 3CL9 A; 3NZB X; 4M7V A; 4DPD A; 3EEK A; 2W3B A; 3RO9 A; 4XT8 A; 4G95 A; 1MVS A; 3EIG A; 5DFR A; 3NXX A; 4H96 A; 3EEL A; 4ELH A; 4M7U A; 5JG0 X; 4FGG A; 1SEJ A; 1U70 A; 1RF7 A; 3FRB X; 3SRQ X; 4PTH A; 1DHI A; 2AZN A; 3DL5 A; 2W3M A; 1JOL A; 4EIL A; 3LG4 A; 3F0X X; 3QLZ A; 3JTW A; 4X5H A; 4PTJ A; 1PD9 A; 2D0K A; 1RH3 A; 3F8Z A; 3NZ6 X; 4X5I A; 3D80 A; 3QG2 A; 2XW7 A; 4ECK A; 1J3I A; 1OHJ A; 1DYH A; 2DHF A; 4PST A; 3JVX A; 4XE6 X; 2HQP A; 3K45 A; 2ANQ A; 3FQZ A; 1RD7 A; 3JWF A; 3F91 A; 1S3U A; 5HT4 A; 3SRR X; 1DR3 A; 1DR5 A; 5HQY A; 1M78 A; 5HUI A; 1RA3 A; 1DLR A; 3SA2 A; 1JUV A; 3NTZ A; 4CD2 A; 2CD2 A; 1M7A A; 2LF1 A; 2C2T A; 5HF0 X; 4H95 A; 5HVE A; 1DG7 A; 3NZA X; 2L28 A; 3RG9 A; 3DGA A; 3FQF A; 3K47 A; 1DAJ A; 1PDB A; 1RB2 A; 3NXV A; 1AO8 A; 2W9S A; 1HFR A; 1RA2 A; 3K2H A; 5EAJ A; 1AOE A; 1DHF A; 4LAE X; 3GHW A; 3TQB A; 1DIU A; 4KBN A; 5FDA A; 3CD2 A; 3F0Q X; 1DRF A; 3QYL A; 5HVB A; 3JWK A; 4M6L A; 3ZPG A; 4KY8 A; 3FQV A; 4ELE A; 3M08 A; 4KAK A; 3NXT A; 4DDR A; 3F8Y A; 3UM8 A; 1DR7 A; 3QLW A; 4LEK X; 3UM5 A; 4HOE A; 4PSS A; 4P3R A; 8DFR A; 2JYB A; 3IA5 A; 2C2S A; 4QLF A; 3FRD X; 3IX9 A; 5DXV A; 4RGC A; 4FHB A; 3FQ0 A; 3QL0 A; 4IXE D; 3IRN A; 3TQ8 A; 1BZF A; 4XT6 A; 3I3R A; 5ECC A; 3DFR A; 1RX8 A; 2KGK A; 3OAF A; 5HSR A; 3FS6 A; 2OIP A; 4EIZ A; 4HA9 A; 2O7P A; 3F0B X; 1VDR A; 2BLC A; 1KMS A; 4KL9 A; 4KYA A; 4QHV A; 2BLA A; 1OHK A; 3FQC A; 1D1G A; 1RG7 A; 3KFY A; 1RA1 A; 2ANO A; 4PDJ A; 1IA4 A; #chains in the Genus database with same CATH homology 4QLG A; 3SH2 A; 3SR5 X; 4KFJ A; 3NXO A; 3UM6 A; 2ZZA A; 4NX7 A; 4IXF X; 3S3V A; 1CZ3 A; 3EEM A; 2G6V A; 4X5J A; 4QLE A; 1S3V A; 3FRE X; 1LY3 A; 2FZH A; 1DYI A; 4DPH A; 4KY4 A; 1RX6 A; 2W3W A; 3DG8 A; 4KM2 A; 3S9U A; 3DAU A; 4KJJ A; 1RA9 A; 5U27 A; 1RC4 A; 1DIS A; 1RX4 A; 4PSY A; 1LUD A; 1U72 A; 1IA1 A; 5ECX A; 3DL6 A; 3I8A X; 3JWC A; 1CD2 A; 3QL3 A; 3HBB A; 3QLX A; 2ITH A; 1BOZ A; 1HFQ A; 3Q1H A; 3HJ3 A; 4I1N A; 3TQ9 A; 4NX6 A; 3FRF X; 3VCO A; 2B3Z A; 3NZC X; 4I13 A; 4Q0E A; 3CSE A; 3JSU A; 3OCH A; 3QYO A; 4G8Z X; 3FY9 X; 3NU0 A; 4G3M A; 4ELG A; 3M09 A; 3R33 A; 2HXV A; 2W9H A; 3JW3 A; 1E26 A; 2GD9 A; 3SRW X; 3NXR A; 3FYW X; 4HOG A; 5HI6 A; 1DF7 A; 4LAG X; 1VJ3 A; 1PD8 A; 1U71 A; 1MVT A; 2D5N A; 3QLS A; 4KM0 A; 5HPB A; 1DRE A; 3TD8 A; 3F0S X; 1RB3 A; 4EIG A; 3JW5 A; 3IRM A; 1RX5 A; 4KLX A; 7DFR A; 4P68 A; 3QFX A; 1RX9 A; 3GYF A; 3KJR A; 3S7A A; 4KJL A; 2BLB A; 4KJK A; 4XT5 A; 3SQY X; 1DHJ A; 4DP3 A; 3TQA A; 1HFP A; 3NZD A; 3KY8 A; 2H2Q A; 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