3F0IA

Arsenate reductase from vibrio cholerae.
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
119
structure length
119
Chain Sequence
SNAMSVVIYHNPKCSKSRETLALLENQGIAPQVIKYLETSPSVEELKRLYQQLGLNEVRAMMRCKEELYKELNLGDSQLSDDALFAAMAEHPKLIERPIVVCNGQARHGRPPEQVLEIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Arsenate reductase
publication title X-ray crystal structure of Arsenate reductase from Vibrio cholerae.
rcsb
source organism Vibrio cholerae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 32
structure length 119
sequence length 119
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f0iA00
2M80A 1XWCA 1UA5A 3CYNA 4KX4A 4D73A 4KNDA 2L5OA 1DE2A 3EC3A 5KN3A 2FNOA 1Z9HA 3HXSA 3WYWA 3QAVA 2VCQA 3C8EA 2TIRA 3Q18A 1OE7A 1PX7A 5HR3A 2TRCP 17GSA 5IPHA 1FW1A 2HSYA 1M9AA 1Q98A 2FGXA 2YWMA 2CAIA 6GSTA 4ZBDA 4POMA 4RI7A 2QGVA 2CX3A 1OKDA 1K0MA 4XRAA 1FVJA 4IELA 1GLQA 3MSZA 1TXXA 5ECPB 4N0VA 4TN8A 2VCVA 5AN1A 2QKEA 5GSTA 2ALBA 3KMNA 1GTUA 1EOGA 5J5NA 4PQIA 3GMFA 2OE3A 5DJMA 2C3QA 4NHWA 2KHPA 3F0IA 5B6NA 3H4KA 2P0GA 4JRRA 3G9BA 2HT9A 2FWGA 2JSZA 3VI7A 3GSTA 2F51A 2IMDA 5JWQB 4K9ZA 1VF3A 2IN3A 3EU3A 2GQKA 4F9ZA 5D73A 4IKHA 3KGKA 3UIWA 2FUG2 1W89A 3UVTA 4MDCA 1YQ1A 4ZL9A 2H75A 3ZTLA 1X0RA 5INYA 1ERUA 1TP9A 4PNFA 5LD0A 3WT2A 4L0UA 5JCUA 3FYGA 4EVMA 3RPNA 3G7YA 3TGZA 3ZREA 1TRSA 3JCML 2X8GA 2OACA 3VWUA 4NAXA 4MF5A 3U5RE 3L0HA 1M99A 2DJ3A 4MF7A 5CRWA 4N10A 4XS4B 1T4ZA 2YWOA 3RHBA 1SK2A 4J57E 3UBKA 3L78A 3APSA 3A5WA 2IJYA 5IO0A 5JWRB 2OA7A 2MZCA 4NWYA 5G5EA 4F2IA 2OE0A 1R5AA 3EMXA 3IBHA 3A2WA 1E6BA 5C04A 1GTIA 1A8YA 4POLA 3TKSC 2NDOA 4GSSA 1SJIA 1VF1A 4I5QA 2M46A 3HCZA 5G1LA 1GH2A 4DEJA 3H8QA 5EPFA 4E8EA 3ME8A 1AQVA 5CREA 2B7KA 5DQYA 2PN8A 5CRDA 4GXZA 4IVFA 5ENUA 1GTBA 3AY8A 4EC0A 4YAPA 1T8EB 4JBBA 3F63A 3HYPA 2H0IA 4TXOA 3TRPA 2IL3A 2AHEA 12GSA 16GSA 3ERGA 3LXZA 5A5KA 3L9SA 2YV9A 3ZMLA 1EEMA 2B5XA 1KNGA 1FG4A 3IPZA 2FWHA 3CSJA 4KUNA 2J23A 1U3IA 18GSA 5DJLA 2R5GA 2JZRA 2GLRA 1W4VA 1DE1A 4TR3A 3TJKA 4O7HA 4G19A 5ECRB 3ZZXA 1EWXA 2AV4A 3GHAA 1GSFA 3M9JA 4L5OA 2GT6A 5F06A 1R4WA 4L5LA 4HS1A 4Q5QA 2C8UA 2WDUA 5KN1A 1KEBA 3HY2A 3TJJA 3DKSA 1GP1A 1NHYA 4XCSA 4KDUA 1SYRA 6GSXA 3EINA 4ML1A 1K0BA 3GL3A 2P31A 2FCHA 4MP4A 2FD3A 1SL0B 3TUEA 5EVOA 3F4RA 2L59A 1VF2A 3KJYA 2K8SA 1YZXA 2O89A 1HD2A 2H70A 3UJ1A 2I81A 2HE3A 1LJRA 1QK8A 4DSRA 4PQ1A 4OCFA 1KTEA 3VWXA 1GLPA 4ECCA 1PRXA 3WGXA 2MBSA 1OE8A 2GZYA 3HJPA 2ZUPA 2B6MA 5G30A 1O7UA 2F9SA 2YV7A 5IQYA 1FB0A 2OBKA 1KBNA 1PGTA 2ZNMA 4BL7A 1FOVA 1MDJA 20GSA 5F0GA 2F8FA 4NHZA 2NPBA 3DVXA 3R2QA 5G5FA 3LQ7A 1NW2A 1MD3A 2IWTA 3FW2A 1EP8A 4N0ZA 1ML6A 5LNKe 3UOMA 2R6KA 2MMAA 1MD4A 1PD21 3TKPA 1F2EA 1GSQA 4ZILA 1GULA 4F0BA 1XVWA 1ZCPA 1K0CA 2C0DA 3KEBA 3QPMA 5A4WA 2TRXA 2C1YA 2PGTA 3QR6A 4KDYA 5ABRA 4MK3A 3MNGA 2LQQA 4ZB9A 3OR5A 2ZCTA 2H74A 3GV1A 2H1GA 1U88A 3Q19A 1GUKA 1F3AA 4K8MA 2YZUA 5D9WA 1XW6A 4OO5A 4TR1A 1FVKA 4TR1B 1CQGA 3FZAA 2GZZA 2A2SA 2JZSA 4DSQA 2MBTA 4BWSA 2AUVA 1G6WA 4MPFA 1OKTA 3HJOA 3TJBA 2HSHA 3IAM2 4XIHA 3WD6A 2O85A 4I8BA 2HYXA 2LJRA 1SENA 2IIYA 4KAEA 2LRNA 1ZMAA 4K0NA 4J56E 2RLIA 1T00A 1NM3A 1AIUA 3BOAA 4I2UA 2O8VB 1THXA 3GSSA 3KM6A 1A23A 4I97A 1PMTA 2ES7A 3M8NA 4XS6A 2H8LA 2A4VA 1AQXA 1V57A 3ZMKA 1T3BA 5CAXA 1VGLA 5HFKA 3GIXA 4O92A 4MJEA 4HZ2A 4V1Ap 2XBIA 4PX1A 2V32A 2WGRA 3D6IA 3VWVA 2PPTA 2LUSA 5IMAA 1ZOFA 1PQNA 3GN3A 1GUMA 4ZBBA 1USBA 1QFNA 1ERWA 5DVBA 2GSRA 1SKRB 3KXOA 2DC5A 3TOTA 4LA1A 3TCOA 3CSIA 2H73A 1ON4A 5D93A 2CQ9A 2LJKA 3HDCA 2C80A 2I9HA 4RQRA 3E9JB 2P5RA 3L4NA 2HI7A 3C1RA 4HJMA 1XWGA 2H66A 1OAZA 5HR2A 1FO5A 3DD3A 2VAFA 2VCTA 5DDLA 3UEMA 4EKZA 1R26A 1BAYA 13GSA 1XW5A 3J7Yb 1XBSA 1FB6A 4WR5A 1XW9A 1F3BA 2LSTA 1SJZA 1ZZYA 2MMOA 3CRTA 2L5LA 2YZHA 4EF0A 3EE2A 1R5PA 3WGDA 1EV4A 4GCIA 2GZPA 2K6VA 3GX8A 5D9VA 1V2AA 2VM2A 1C72A 4EE0A 3P7XA 1TRVA 5ELAA 4GF0A 1G7EA 3VK9A 1UVZA 2C4JA 4LMVA 2J9HA 5IOWA 1T7PB 5IMFA 1A0FA 4EDYA 2H30A 1O81A 1JHBA 4ZBAA 1TU8A 5H5SA 4GLTA 3UMAA 2CVDA 4AJ7A 1WP0A 4D73B 4I6XA 1EEJA 4MJAA 1R7HA 5KN0A 1K0NA 3NZNA 1NSWA 4GTUA 2YOIA 3UARA 4XTSA 2M72A 1U6TA 3IOSA 4MPGA 5ID2A 3QAGA 2V6OA 2RM5A 1V9WA 2VLTA 1BX9A 2H01A 1B4QA 1THOA 4TRXA 1O6JA 2IMKA 1CQHA 1XWAA 2KUCA 3IC4A 4WF4A 4WBJA 3TRQA 5HR1A 5F07A 3EMPA 5DCHA 5IO2A 3KH9A 3QCPA 3IRAA 4CW9A 3HJMA 4KB3A 2K9FA 3F6DA 2MMZA 1EP7A 2H6XA 3QAWA 4O5RA 3M1GA 2CZ3A 4N30A 2LS5A 1LBKA 4OCEA 5AIXA 2AB6A 1BEDA 3QD9A 2X8HA 5DCGA 3H79A 4TXVA 4MJCA 2PWJA 4MCUA 3LXTA 1TRWA 4G2EA 3TRXA 2VD0A 1K0AA 2H72A 3W8SA 2B7JA 5HFIA 4IN0A 2G2QA 3FZ5A 1WOUA 4WEYA 1F6MC 2WB9A 3HVVA 4ILFA 4IQ1A 1H4OA 1H75A 3F3QA 1Z6MA 4MZBA 2RUFA 5IMVA 3PH9A 2L6CA 1GL8A 2B1KA 5EL8A 2L4CA 4ID0A 4JE1A 3LJRA 4K0GA 1M7TA 2WJUA 3A2VA 3F6FA 2GQMA 4XHMA 3IE3A 4MH2A 1AAZA 1VF4A 1YEPA 1YKCA 5GZZB 2QC7A 4OFTA 1OC8A 3S9FA 2FWFA 3VI5A 1G6YA 1GNEA 2YJ7A 1I9DA 4ISDA 3GKKA 4ULXA 1AXDA 3LG6A 2CT6A 3BCKA 1JZOA 1QMVA 4MH3A 4KA0A 4KH7A 4TXOB 5DAKA 3N5OA 2MYGA 5IMZA 2ON5A 5DAKB 5F05A 5FHIA 1X9MB 4YH2A 4ZXGA 2HRFA 2H6YA 4IJIA 1Z3EA 2H0GA 3WT1A 1GSEA 2IPAA 1ABAA 4ZL7A 5A4VA 1S3CA 2HZFA 1X9SB 2DSAA 1RW1A 3BJ5A 3KMOA 1ZYQB 5B8AA 1XIYA 1QXHA 1BJXA 5B7CA 2LRTA 3QFBC 2PBJA 2H1AA 2LV3A 3ERFA 5J9BA 1S3AA 3V1WA 2CVBA 4QL9A 2XBQA 4WXTA 3ZYWA 5G31A 3Q74A 1B4PA 3FR3A 4OFMA 4XS1A 1YKAA 5CRHA 2O7KA 1JZDA 4K7NA 1XWBA 1B9XC 3A2XA 4PURA 1AW9A 4BVXA 3IK9A 4OFNA 3ZFLA 1MDKA 3LSZA 4ACSA 2RM6A 4H86A 5LCZA 1EGRA 1XZOA 1HQOA 1YEXA 4LL4B 3GX0A 2H1BA 4HDEA 4YAVA 2DJ0A 1TKDB 5CO3A 1V98A 2LEGA 4PXOA 1SK0A 6GSYA 3WGEA 3VFIA 3LYKA 5JWOB 1F9MA 2L57A 1I5GA 4PUAA 2C0GA 3HVSA 5ECLB 3ZFBA 4J2FA 3H93A 2XC2A 2C0FA 2XHFA 1O8XA 1NHOA 1XOBA 4KCEA 4KSMA 4X1UA 1EV9A 2H6ZA 5CRGA 4CDOA 2R37A 3MAKA 4FIWA 1K3YA 1TI1A 2AJQB 4QQ7A 1N2AA 3APQA 2HLSA 4GRFA 2VL2A 3UAPA 3GURA 1VRSD 2DJKA 4NXIA 3D21A 3IR4A 4P3YB 3LFLA 3GKMA 3M3MA 2VCWA 1OC9A 3D4MA 3KTBA 2GGTA 3LWAA 3UBLA 3GL5A 2EIRA 4OO4A 1OC9B 5F8BA 1M0UA 3IDVA 4TKYA 3KP9A 3GKNA 3I43A 1ZYEA 4JR6A 4NV2A 2Z9SA 1TJDA 1GSSA 4OMVA 2HZEA 2HZEB 3D5JA 5ECIB 1S3DA 3FRCA 5COHA 5ECSA 5IM9A 1JLVA 3C73A 2DJ1A 3DMLA 3L9VA 9GSSA 2YN1A 2JL4A 1O8WA 4EDZA 2YNXA 4AJ6A 3P2AA 4Q5RA 4TVEA 3ME7A 1YJ6A 4IBPA 2AAWA 4O32A 2YCDA 3E3EA 1MTCA 3HZ8A 2YWNA 5AGYA 3IV4A 7GSSA 1HNCA 1YF1A 2EIOA 4PGTA 3LEFA 2H19A 4K6XA 4AGSA 2CV4A 3O3TA 1N8JA 3TJFA 3UVHA 2HXKA 4WR4A 1LU4A 1GUHA 3CSHA 4LMWA 3J7Yk 3FK8A 2E7PA 4EUYA 5IIZA 3KZQA 3RDWA 1TU7A 5IMDA 1URMA 3TJGA 3E0UA 5GSSA 3GH9A 2C3NA 3TB2A 3Q6OA 2FY6A 1TDIA 1WPIA 4DVCA 2I3YA 3LGCA 4PQHA 2JZTA 3PINA 2RIIA 4NMUA 2CAQA 3GKXA 3KH7A 2FWEA 1JLWA 3H1NA 3HA9A 2BMXA 2QSIA 1Z7PA 1X5DA 1SK1A 2WULA 4V1Ag 4MZCA 1XFLA 1JFUA 4V2NA 3F8UA 3QMXA 2IFQA 1MDIA 3HVXA 1X5EA 3F4SA 2IFQB 1SKSB 3DYRA 4K2DA 3CBUA 4TOPA 2KP1A 1TK8B 5ECNB 3CTFA 2H1DA 2LTKA 6GSWA 1TI3A 2V2GA 1PX6A 1XXUA 4HQZA 1X9WB 4YQMA 4IQAA 1TRUA 1PKZA 4L0WA 4MJBA 4NPBA 3APOA 1UN2A 2E2GA 3GFKA 3GYKA 1QUWA 1GSUA 5AIVA 4LL1B 10GSA 4IP1A 1SL2B 3M0FA 3QOUA 3C71A 3GRXA 4BA7A 2X8CA 1AC1A 1TOFA 3FKFA 2VIMA 2DBCA 1T4YA 1PL2A 1DSBA 3QFAC 3BD2A 1J08A 2I1UA 4HU7A 4ML6A 1V58A 4G10A 1ACVA 2E0QA 2KLXA 2WFCA 2VCZA 3DIEA 11GSA 3HD5A 1OYJA 2YJHA 3FHKA 5AISA 8GSSA 1F37A 5L71A 3DXBA 1DBYA 2VLVA 2GDRA 4LLRA 2HNLA 2MMNA 5JCGA 3P90A 1ZL9A 2VLUA 5ID2B 5D96A 3ZVJA 4JU5A 4JZQA 1BYEA 3ERWA 2JSYA 2EIQA 4K7IA 4EXJA 4HOJA 3FR6A 3VURA 2IMEA 4MZWA 1B48A 2OE1A 5EY6A 2VD1A 5E4WA 4ECIA 1Y6EA 4FYUA 2R4VA 2KP2A 2JADA 1WMJA 2PMTA 3K8NA 1GSDA 1QQ2A 3LYPA 5HFGA 4TR4A 1A0RP 4E8HA 2OJLA 2PVQA 4HU9A 1XVQA 1DUGA 2OADA 3VPTA 3VWWA 2NVLA 4MMMA 3RBTA 4KDXA 3BCIA 1ZGNA 1MEKA 3I9V2 1YY7A 3CMIA 4HI7A 2A2RA 3FEUA 1A2LA 4HJ2A 4TR0A 1BG5A 2D2ZA 2L4QA 2DJJA 4KE3A 1JZRA 3D0ZA 4EL1A 2RUEA 2LNSA 1M9BA 4Q5FA 1RQMA 3ZIJA 2VL3A 2WCIA 1SU9A 2V1MA 3ED3A 1A8LA 2VCXA 2FLSA 5J3RA 5CP1A 3HZ4A 1A24A 1YF0A 2DMMA 2FA4A 1X5CA 2F8AA 2WS2A 2K18A 1GSYA 3LORA 3L9UA 3P8WA 4F0CA 1YDKA 2VOCA 4WETA 4XS4A 3TKSA 3GNJA 2B1LA 2DIYA 3RAZA 2REMA 4N11A 4WKWA 2IMIA 1GWCA 3US3A 3RPPA 2LNTA 3ZRDA 1Y25A 1U87A 2O87A 1G0TA 4FYBA 5FWGA 2G0FA 1PA3A 5D9TA 2R3XA 1M2BA 4GQFA 3DRNA 3SWLA 5GAND 1T1VA 4I2TA 1AQWA 3D22A 5ELGA 4XRDA 2VUPA 1PKWA 5IPGA 2R2JA 3IAS2 1GNWA 2NTOA 5H5RA 5H5QA 3SBCA 2LJAA 3O6TA 1HYUA 2H0HA 4JEDA 2H76A 1XCCA 2CA8A 4GWRA 6GSVA 4PUFC 3DVWA 4IGJA 5HR0A 1J9BA 3EVIA 3G7IA 1ILOA 2N5AA 1K3OA 4NV5A 1U3AA 2PU9C 1O85A 3NIVA 1Z6NA 1QGVA 3BBYA 4MLYA 4BPYA 1TK0B 2FHEA 4POBA 4V2LA 4V2MA 5J4UA 1A2JA 4AF2A 3TKRA 3I69A 2OBIA 1E2YA 1GTAA 3F4TA 3TKSE 1FHEA 3G7JA 2X64A 4HZ4A 14GSA 2N5BA 4KCAA 5IOXA 1SKWB 4K7OA 5KN2A 1HNAA 3GTUA 4ECJA 2LRCA 3F9UA 3GTUB 2WRTA 3IXRA 3VPQA 1JZWA 3TOUA 3U6VA 3GA4A 3FR9A 4F82A 4QL7A 2B5YA 5D8IA 3CXGA 2VO4A 1WE0A 1TW9A 1IYHA 1WJKA 1J0FA 4FO5A 5FT3A 4OD7A 1SL1B 2GSSA 5ECKB 1A2MA 2B5EA 4OWYA 3N9JA 4RI6A 2E2MA 1ERTA 1B9YC 1WWJA 2GQLA 2GSQA 1EGOA 4RQXA 4GQCA 5G1KA 1EOHA 5DQSA 3EWLA 1SD9A 2DIZA 5DBQA 5E59A 5ECMB 4MA9A 2XPDA 4EO3A 2YWIA 4TW5A 3VLNA 2JU5A 4KW6A 1G7OA 3HHVA 4MABA 5DALA 2X99A 5DALB 3ISOA 1TTZA 4RUVA 1O73A 2VM1A 4DSSA 2BTOT 2C0EA 2XPEA 4F03A 2YPMA 4DSSB 2F3MA 1M2DA 4POKA 3QDNA 3UL3A 3NOFA 3ZITA 1K3LA 2N5FA 4ECBA 2HFDA 2KOKA 2VL2C 5CYYA 22GSA 4YQUA 5B8BA 1K0OA 5CNWA 4ZB6A 1TK5B 3KD0A 6GSUA 5IMCA 4KSOA 4YQVA 2WZ9A 1WRYA 5HQPA 2IMFA 2CX4A 4BVYA 3IHQA 2K8VA 3KCMA 1OC3A 1OVNA 1UC7A 3M9KA 2V6KA 4IP6A 3KTLA 1IYIA 3ZL5A 1ERVA 4L8EA 3GH6A 2PVOC 3DGQA 3ZLPA 4CHSA 2DLXA 5C00A 3KP8A 4HQSA 5B6MA 2GS3A 3MDKA 3TKQA 1Z7RA 3RHCA 5D9XA 19GSA 3IK7A 5JCWA 4X43A 2V41A 5J41A 2GSTA 5ECOB 3W6GA 1AUCA 5ECHB 1XOAA 1ST9A 4GSNA 2DJ2A 1HNBA 1M2AA 1SD8A 1XPVA 1Q4JA 4MF6A 3I6AA 4Z7XA 2PUKC 3TDGA 2FA8A 4AJ8A 2CZ2A 5GAPD 3CTGA 2AYTA 2HRNA 4IS0A 3PR8A 3KIJA 1Z5YE 4IW9A 2NBSA 5G2ZA 1WIKA 2C3TA 3ZIVA 2YP6A 3EU4A 4WF5A 2PERA 3F3RA 5J9CA 3C7MA 4WBRD 3FZ9A 4GSTA 4HUAA 2H71A 3HKRA 4JR4A 1SYXA 1B8XA 2LQOA 3FY7A 1K0DA 4PNGA 1EZKA 1XWKA 2DMLA 3EYTA 2VL9A 2GT5A 3FZ4A 4BWQA 3O76A 3GUSA 4FYCA 2LKUA 1RK4A 3ZVJD 2L6DA 1SJ6A 3DWVA 5A4UA 5ECQB 3DEXA 2EC4A 4FH8A 4IHUA 1PSQA 2B3SA 4K1FA 4G9HA 1PN9A 4ZB8A 2GTUA 3IA1A 3D4TA 3W8JA 2JACA 4ZL8A 5KEJA 2YANA 3A3TA 3EURA 4X0XA 3PGTA 4Q5NA 2I4AA 1V40A 4ZIJA 3MWHA 3C1SA 2OKAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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