3F9MA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose and activator showing a mobile flap
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
455
structure length
451
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 186
structure length 451
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2008-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3f9mA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3f9mA01
5KPZA 2CH6A 2UYTA 3DJCA 4BGBA 2ZGZA 3MN9A 3VF2A 4B1UB 2A6AA 4QS9A 3A5LC 1ZXOA 4ISGA 3C7NA 5FPNA 4DHYA 4MO4A 1GLEG 3CETA 3IDHA 5FPMA 1XQSC 1K8KB 1TUUA 3ZX3A 4B1VA 2W41A 3HI0A 4FWPA 2EWSA 4B1ZA 5F0XA 4IWVA 3WQUA 4K43A 3S41A 3H3OB 1JCFA 4ISFA 3VOVA 3WUHA 3IUCA 3RSEA 3C0BA 3LDPA 2E1ZA 2E88A 1BU6O 5AQMA 5AQRA 3GDQA 4RTFD 4CZMA 2P9LB 3G25A 2P9SB 3UKUA 4CBXA 3BUZB 3H3NO 4CZEA 2VWBA 2ASPA 1BG3A 1Q18A 4FO0A 2GELA 2P9UB 3WXIA 2ASOA 1JCEA 1NGIA 2A40A 2E8AA 3D2EA 2CGKA 2P9LA 4BRIA 3O1WA 3SJHA 4LC9B 1XC3A 3VEXA 5BREA 4JAXA 4BRDA 5JLHA 4HTLA 2D1KA 4CZHA 2YHYA 4M7YA 4JN4A 3ID8A 3LDLA 3ATUA 3ZEUA 1NGGA 3AARA 3FGUA 4H5RA 1HKBA 2FLOA 2P9IB 1KAYA 4FWMA 4I6MB 5EY4A 2QWQA 3GOIA 2AA4A 2AP1A 4MO5A 2WUSA 4FOIA 3LDQA 2P9IA 2FF3B 4K25A 3U9ZA 3L6QA 4I6MA 5AQOA 1YVNA 4CJ7A 1U2VA 2VYPA 4B1YB 3BP8A 1RDWX 4BR9A 4C23A 4WYBA 4Y0WA 5AQZA 1YAGA 1TYQB 1CZAN 1ZC6A 1QQNA 3AAQA 3U8XA 3VPZA 5KPRA 3VF4A 4H0OA 4CD3A 3H45C 5AQVA 2IVOA 4H5NA 4PL7A 5AQYA 2QW9A 3CQXA 1TUYA 2GWKA 2NLXA 4BVPA 5E84A 4BC2A 4EAHD 4BRQA 5B8HA 1NGBA 5AQTA 4WQ5C 2Q0UA 3EL2A 3MMVA 5CE3A 3BF1A 2ZGYA 4BRLA 2E2PA 2BTFA 2D0OA 3GL1A 5BPLA 2QWRA 5BRFA 4BRPA 2V7ZA 2YJEA 3O08A 3ZX0A 3VF6A 1E4GT 4IJAA 3VEWA 1NGJA 3M6GA 3A5NC 4CZKA 4CZGA 3O1BA 2E2QA 2P9NB 3DXMB 1EQYA 2QWPA 4K42A 5AQFA 4CZIA 4FWNA 3UKRA 3QBWA 5AZJB 4BVOA 2YI1A 2D0PA 2FSJA 5KQDA 1R59O 3MN6A 4DQ8A 4BRFA 5E26A 2IVNA 2Q97A 1GLFO 3TPQA 4YDUC 5LY3A 4EHTA 3CI5A 2I7NA 4BREA 4FWRA 2Q36A 1GLAG 1NBWA 4BR4A 3EKSA 2P9PA 4EIAA 4M7XA 2GWJA 4XEIA 1D4XA 3AAPA 3L0QA 3WQTA 5BRDA 4BQLA 1DGKN 4BROA 2YJFA 2OANA 3SMPA 4BRMA 3OHRA 1BOTO 3VERA 2E1YA 1K8KA 2FSKA 1HKCA 5JMVA 4RCHA 2Q31A 3H1QA 2V51B 1SQKA 5BR9A 3UE5A 4PKIA 3A5OC 4WQ4C 3O8MA 3CIPA 3HTVA 1YUWA 2J4RA 3JXUA 2HMPA 1X9JA 2Q0RA 3QMLA 3IMXA 1P8ZA 2FXUA 2P9SA 3WXLA 4A62A 3QB0A 5LJWA 2IVPA 2P9KB 3VGMA 1QZ5A 2P9UA 1U6ZA 4FWSA 2IIRA 4A2BA 4WQ5A 1MWMA 4M63C 1BDGA 3BF3A 3FR0A 1QZ6A 3EKUA 3M1FA 3HBTA 1BO5O 3CJ7A 3ZETB 4QS8A 1NGAA 4MLHA 3CERA 4BC3A 2GTDA 3FLCO 3R6MA 1XUPO 4FPBA 2VCPA 1ESVA 4PL8A 1OKJA 2QWMA 2PAVA 3U4LA 4CBUA 4CI6A 4CD1A 4L3QA 1V4SA 2H3GX 3HSCA 3H6EA 4O8KA 4BR5A 3CQYA 3D7EO 2E20A 3DWLA 4BR7A 2D4WA 5TKYA 4YDUA 4BQZA 1NGEA 2QXLA 3FZFA 4BG8A 1TYQA 1HKGA 5AQQA 4BC4A 3WEEB 3LM2A 1RGIA 3FZLA 4KBOA 1V4TA 3SLCA 2Q2RA 2QWOA 4A2AA 3O80A 1KXPA 2YCHA 1DEJA 5AFUA 1QQOA 1GLDG 3HZ6A 4JD2B 4GY2B 2QWLA 2E2NA 5AQJA 3ENHA 5EXWA 3LDNA 1E4FT 5BN9A 1ATNA 3IFRA 5AQGA 5BRHA 3CJAA 2CGJA 4H5WA 3P4IA 4CZLA 5AQPA 4WQ4A 4PKHA 4CZJA 5ADXA 2ASMA 3LL3A 4H0PA 5AQSA 3VETA 2KHOA 1NGDA 5BPMA 1C0GA 4H5TA 3H1VX 4FWQA 3ENOA 3SK3A 2P9NA 3DXMA 3LM9A 5AZIB 4H0YB 3W3DA 3A0IX 3O6WA 4H03B 1NWKA 3ULEB 5AZJA 5KQ8A 3TU5A 4XH4A 3SMSA 4HWIA 3A8YA 4FWOA 1G99A 4RWTA 3CJBA 3ATVA 2DPNA 1KAXA 3EO3A 3MCPA 2E2OA 2V52B 1BA1A 2HF4A 3QDKA 4BGAA 1SAZA 5LJVA 3GBTA 3C7NB 3R9PA 4H0XB 1NLVA 2V7YA 3MK6A 4AM7A 4IZ9A 3FE1A 4BRKA 2ITMA 1X3NA 4JHDB 5F1XA 4O5FA 2FF6A 3UB5A 5AQHA 1NGCA 3BEXA 4H5VA 1HPMA 2Q1NA 3GE1A 4FOEA 2QWNA 3QFPA 3RSEB 2HF3A 4JHDA 4EHUA 1GLCG 5EOYA 4DB3A 1X3MA 5EVZA 1HJOA 1DKGD 5AFUH 3UKUB 4CZFA 1BUPA 1QQMA 5AQKA 5AQNA 5AQUA 1ZBSA 4IJNA 5AQLA 2NZTA 5FPDA 3VGKA 3D2EB 3H46O 3WT0A 2P9KA 2ZWHA 3F9MA 1MWKA 1IG8A 2A42A 4B9QA 4BRCA 1MA9B 2I7PA 4A61A 5ADXH 4BRAA 3ZEUB 3QFUA 5KPTA 1Y64A 4ISEA 3VEOA 3ZETA 5BN8A 5JLFA 2F9TA 3M3ZA 4GNIA 1HUXA 4FPAA 1J6ZA 2W40A 4AM6A 3EZWA 2BUPA 5JICA 2PBDA 3J8AA 4DCHA 2NRHA 3LDOA 1T6CA 3VENA 3W0LA 2A41A 3L4IA 4NO7A 1U2VB 5EX5A 3KZBA 3VEYA 3O5BA 1WOQA 4QS7A 2GEMA 2A3ZA 4FWKA 3GG4A 4NB4A 1QHAA 3DAWA 2QM1A 4XH1A 1LCUA 1NM1A 1BWFO 1NGHA 5AR0A 3EN9A 1GLLO 3VGLA 2YHXA 4EFHA 4MLEA 4FL9A 4BR0A 2A5XA 4PKGA 3A5MC 1GLJO 1Z6RA 2CH5A 3QICA 3CJ1A 1T6DA 3FFKB 4IO8A 3ZX2A 3WEEA 2F9WA 1NMDA 4BRHA 1MDUB 1C0FA 3VESA 3VEVA 4K41A 4Z94A 4H0TB 4CBWA 3FZMA 1GLBG 4JD2A 5ELZA 4XH5A 4FWLA 4BG9A 3MN7A 1HLUA 1KAZA 3HM8A 3I8BA 3MDQA 3QBXA 1T44A 1ATSA 3DXKB 3R8EA 5FPEA 3KHYA 3KVGA 5AQWA 5I9EB 3WXKA 1WUAA 4IXCA 4F9OA 1Z05A 3O4WA 3FZKA 3I33A 3D2FB 3U9DA 3DXKA 4BC5A 5AQXA 4B1XB 1LOTB 5AQIA 4JNEA 3VEZA 3MN5A 2GUPA 3UKRB 3FZHA 1YXQA 2YHWA 3CHWA 5AZIA 3D2FA 1JCGA 2HOEA 2CGLA 3ULEA 2FSNA 3JS6A 4BR2A 1SZ2A 4E1JA 3CJ9A 3CJCA 4B1WB 2ZF5O 1BA0A 5BPNA 4H0VB 1ATRA 1RFQA 3WXJA 1H1VA 1HX1A 5F2RA 4BRNA 1NGFA 1S3XA 1IJJA 3AY9A 4FSVA 2P9PB 4J8FA 3B8AX 4BRGA 1S22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UYTA 1BGXT 2ZGZA 3MN9A 4B1UB 4QS9A 3DRRA 4DTRA 1J9AA 1XQSC 3ZLJA 1OVQA 4B1VA 2YKMA 4H8KA 4FJXA 4CJ4A 3RMDA 4J2BA 2EWSA 3T1AA 1YJNN 3WQUA 1EWQA 4ISFA 3QEIA 1QQCA 3G6EN 4KHSA 4KREA 4FJNA 2HNDA 3LDPA 2E1ZA 2E88A 3M8QA 4KHWA 1BU6O 4GV9A 4JYAK 5AQRA 3GDQA 2P9LB 1Q9YA 1I94K 3OYBA 4CZEA 1JLQA 3VQ6A 2FBVA 1SKSA 4DF8A 1JCEA 3HT3A 2E8AA 3D2EA 4BRIA 4YNQA 1Q7YO 1XC3A 4DR7K 2OPSA 4DU4A 2KZMA 1NK5A 3CCQN 3ID8A 3MECA 1B92A 2Q3SA 1WSHA 3FGUA 2E6MA 2FLOA 4PWDA 2QWQA 3THVA 2AP1A 4E1MA 4BE1A 2Z1JA 4FOIA 3LDQA 3PX6A 4O0JA 2GV9A 1X9SA 1BHLA 4OLAA 1U2VA 4NLBA 4JV5K 3DRPA 4DV7K 3CM5A 3BP8A 5K14A 4B9LA 3S3NA 3ZT3A 3N4PA 3AVGA 5AQZA 3U8XA 4Z4FA 1CZAN 4OJRA 2HHHK 3G71N 2WBNA 3QERA 3H45C 2XY7A 3PSIA 4ZHRA 1XC9A 2QW9A 3AGKA 3CQXA 4JRPA 2GWKA 4CJLA 2NLXA 4IOAL 1YHQN 2O4GA 1XNQK 4KHYA 4WQ5C 2Q0UA 4WE1A 2HHWA 1QSYA 1NKBA 2RN2A 4J2EA 3PLAA 2ZGYA 2E2PA 4O4GA 3MEGA 3GL1A 2KW4A 5BPLA 2QWRA 3MXIA 3P83D 4CJVA 4IJAA 4N56A 4F8RA 5J2MA 3M6GA 4LF9K 4CZKA 1B9DA 4B9VA 4K42A 3DXMB 5M1PA 5AQFA 4IEIA 1J54A 2YNHA 4BRFA 5E26A 4E7HA 4CCHA 4CF2A 4ICLA 5LY3A 4EHTA 2I7NA 4M3UA 4KTWA 4BREA 5C0YA 3EKSA 4FW1A 3OBYA 4M7XA 4F4KA 4M3RA 1D4XA 3AAPA 1RT1A 4ILJA 3WQTA 2IC3A 3EYZA 1M1KO 1K9MO 2UXBK 3SMPA 5SWMA 4LSLA 1BOTO 3J7YP 1HKCA 5JMVA 4RCHA 2Q31A 4O0IA 3T1HK 1QTMA 1NOZA 2OPRA 4LH4A 3WNGA 4OKKA 2NNWA 3CIPA 1Y97A 3OYJA 2J4RA 4KHPK 1HNIA 2Q0RA 3CF5L 3QEWA 4CFDA 3QMLA 4RW8A 3IMXA 4ILHA 5CHIA 4DLEA 3VTHA 1VSMA 3I8DA 2P9KB 4DR3K 5KTQA 2WOMA 2IIRA 4WQ5A 1MWMA 1QZ6A 5M1FA 5HL7L 3CFOA 1BO5O 2W6LA 1OVYA 4QS8A 1VQLN 3LP0A 4MLHA 4BC3A 4AF1A 4FXDA 2RKIA 1C0MA 4FJLA 2VCPA 4ILGB 1JLCA 4PL8A 2PAVA 4CIGA 1D9DA 4Y1DA 4L3QA 5J2QA 5FRMA 3H6EA 1LW2A 3L2RA 3F2KA 2KTQA 3KJVA 3C6UA 3BZKA 3D7EO 5KI6A 3THYB 3OYIA 3PSFA 5FLXO 5HROA 2D4WA 5TKYA 1QE1A 5KGXA 3B6PA 2QTDA 3QETA 4CEBA 1RGIA 3FZLA 1VQ8N 3OBWA 2Q2RA 4E7LA 3HVRA 2YCHA 1KC8O 1DEJA 1RTJA 3V9UA 3CCUN 4OLBA 3VQEA 4JD2B 5CYMA 2QWLA 2E2NA 1N36K 3ENHA 5EXWA 1OH5A 3O4NA 1Q81O 4YOVA 4IFYA 2VGMA 3LAMA 3CJAA 3QNOA 1TKXA 3QO9A 1ZBHA 3ALYA 3P4IA 5AQPA 4PKHA 3WNEA 4H0PA 5HBMA 5I42A 1S9EA 4A5BA 3KLGA 2P1JA 2KHOA 3MCAB 2HHUA 2WFBA 1XMQK 3TAQA 4DLGA 2BDPA 4IG3A 3LM9A 3KD1E 1D9FA 3W3DA 3A0IX 4IFEA 5TKWA 3RMAA 4XH4A 3NGYA 3J80O 3A8YA 4DU3A 3VQ8A 3ID6A 4ELVA 4CHYA 3CJBA 3E01A 3OYLA 1VSDA 4NLCA 1W7AA 3EO3A 4M41A 4KHNA 4KTQA 1HJRA 1TV6A 3GBTA 1IV0A 3NFAA 1BQNA 4JKBA 4H0XB 4DSEA 3K5NA 1NLVA 2O8FB 1XMOK 1KFDA 4BRKA 2LSNA 4WFNL 4JHDB 3SQ2A 3DLHA 2OA8A 2IAJA 5AQHA 2QWNA 1VRTA 2HF3A 3RSEB 2X6NA 3F5TA 2XY8A 3THWA 1TAUA 1ZBFA 2YNFA 5EOYA 3SQ0A 5EVZA 1HJOA 3UKUB 5C42A 1JXEA 3KK1A 1L5UA 3CD6N 3AVLA 1LWFA 1TL3A 1DTTA 4IJNA 2NZTA 4CEAA 1U48A 4FJ9A 3WT0A 4ELUA 4DF4A 1IG8A 4CGJA 2HB5A 4LF4K 4A61A 4JK7A 5ADXH 4K8XA 2VG7A 3JSMA 3VQPA 5AJ3K 2NUBA 3VEOA 2Z1GA 1HUXA 4AILC 1LV5A 5JVHL 1YITN 3EZWA 5JICA 1S6PA 3J8AA 4DCHA 2NRHA 4IO9L 4DSLA 5HRPA 5SZTA 1RDBA 2O8EB 2QEXN 1C0TA 3VEYA 3THXB 3TSUA 2JWKA 4QS7A 1QVGM 2A3ZA 3GG4A 1QHAA 4OVLA 2W42A 4IBNA 3I0RA 1HNWK 3HK2A 2UXDK 4B8CA 5AR0A 4E3SA 5KRSA 2QK9A 4O5BA 4I9LA 3DI6A 4MLEA 1NK9A 2A5XA 4Z0UA 2CH5A 3RRGA 3WEEA 4H4MA 4BRHA 4NYNA 2O8CB 3NH2A 1GLBG 3TABA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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