3F9MA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose and activator showing a mobile flap
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
455
structure length
451
Chain Sequence
b'ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 186
structure length 451
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2008-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3f9mA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3f9mA01
3ENOA 2GELA 2E8AA 5JMVA 2W40A 4IJAA 3CJ9A 4IWVA 2YCHA 1BDGA 4BGAA 3GBTA 3FZMA 1QHAA 4CJ7A 2P9LA 2VWBA 3WT0A 2QWRA 4GNIA 3MDQA 3WQTA 2A6AA 3HM8A 3KZBA 4FWLA 4B1ZA 4CZGA 3HI0A 4XH5A 4BRLA 1U6ZA 3ZEUB 4H0TB 1EQYA 1Q18A 5AQKA 4FWQA 3ENHA 4CI6A 1GLJO 3IDHA 3WXIA 3U9DA 1ZC6A 1E4GT 3EZWA 2FSJA 1KXPA 2QWMA 2P9NA 2A41A 4JNEA 5AR0A 1NWKA 4FWPA 3H6EA 4XH4A 4Z94A 3LDLA 1NGFA 2P9KA 5LJWA 3ZX2A 3P4IA 3RSEA 2D4WA 1GLBG 3O08A 4BR7A 3D2FB 5FPDA 3ULEB 2Q36A 5F1XA 1H1VA 4M7XA 5AQRA 3DXMB 4BVPA 4QS9A 5FPMA 3O6WA 5AQLA 2F9TA 4CBWA 3WXKA 4DCHA 5AZIA 5KPTA 3CERA 4HWIA 2CGLA 3C7NA 1YAGA 2FSKA 1GLDG 3LDNA 2ZF5O 3BEXA 5AQPA 1NGGA 2CH5A 4FWNA 4MLEA 4AM7A 2KHOA 1Z05A 5BN8A 2F9WA 3WUHA 1IJJA 5ADXA 4XEIA 3UB5A 5ELZA 5AQHA 2P9PB 2E2OA 3DWLA 1RGIA 3KHYA 4LC9B 5B8HA 2D1KA 4EFHA 1RDWX 3GL1A 4L3QA 3FZHA 3WXJA 4O8KA 3CIPA 3VESA 3M3ZA 2BTFA 4BRHA 2FLOA 3LDPA 4KBOA 4XH1A 3ZETB 2DPNA 3VF6A 3BF3A 3D2EB 4HTLA 4JD2B 5E84A 4WQ5C 2IVPA 3VETA 3W0LA 2HF4A 4FWSA 3EO3A 1ZBSA 3IUCA 3QICA 1NM1A 3FZLA 3FFKB 3MK6A 4BRPA 2QWQA 4H0VB 1QQMA 3W3DA 4C23A 4PKGA 4JAXA 1ZXOA 1GLEG 2CGJA 3B8AX 4B1WB 4DB3A 3VENA 2P9NB 2ZWHA 5I9EB 4NO7A 3M6GA 1NBWA 2P9KB 5AQTA 3RSEB 4BROA 1GLCG 1HKGA 3O4WA 4FO0A 2HMPA 2P9SA 3EL2A 4EHTA 3AY9A 5AFUH 5AQXA 2OANA 1R59O 3LM9A 1P8ZA 4A2AA 3O1BA 3GDQA 2Q31A 3L4IA 5AQFA 3LL3A 3LDOA 4BR4A 5CE3A 2FXUA 2Q0UA 4I6MA 4NB4A 4JHDB 1GLLO 4QS8A 1E4FT 5JLHA 4FOIA 5AQUA 5AQYA 2E1YA 4BG8A 4H0XB 4QS7A 2D0PA 5AQMA 3CJ7A 1YXQA 1S22A 1Z6RA 2YJFA 3ATUA 4H0OA 2YI1A 1V4SA 1NGHA 4H0PA 3TPQA 4FPAA 3UKRB 3GG4A 2NLXA 1JCFA 2FF3B 3O1WA 4BC5A 2AP1A 1QQOA 3R9PA 1J6ZA 2CGKA 4B1VA 4RCHA 2QWLA 2P9IA 2Q2RA 5EVZA 3QFPA 4BC2A 3OHRA 3L0QA 2GWKA 1BWFO 2Q0RA 1QQNA 4A62A 4BREA 3MMVA 5AZJB 3VGMA 2E2PA 3VEXA 2WUSA 1K8KA 1HJOA 1HLUA 1U2VB 2ASPA 5EOYA 1KAXA 3WEEB 4O5FA 5KQ8A 4MO4A 5EXWA 4IXCA 4IJNA 2QWPA 3FE1A 3AAPA 4CD1A 3SJHA 3R6MA 1X9JA 1Y64A 1JCEA 4H5TA 3SLCA 4AM6A 4RTFD 1NGBA 2HOEA 3CJ1A 4BQZA 3VEYA 2IVOA 3VF2A 2E2QA 1IG8A 3FZFA 4FWKA 1BG3A 1WOQA 1DEJA 2P9SB 3BF1A 4PL8A 3U8XA 4B1YB 4B1XB 2FSNA 4E1JA 4BRCA 1SZ2A 1T6DA 1YUWA 2QXLA 4EAHD 4K42A 3UKUB 5JLFA 5AQGA 3CETA 1HPMA 3SMSA 2Q97A 3MN7A 3A8YA 1XQSC 1NGEA 4IZ9A 4A61A 1HUXA 3F9MA 4K41A 4FWRA 1XC3A 3ATVA 3M1FA 2P9LB 2A40A 2I7NA 2A5XA 3ZEUA 2A42A 5KQDA 3DXKA 4WQ4C 3UE5A 2GWJA 4EHUA 3CHWA 3QDKA 3GE1A 5BPLA 1MDUB 2E2NA 2E1ZA 5AQSA 3EN9A 3DJCA 1NLVA 1ESVA 4PKIA 5AQNA 5F2RA 1MWKA 1NGAA 3CQYA 3VEOA 4H5NA 3I33A 4K43A 5AQIA 3JXUA 3AAQA 1X3NA 4CZHA 3MCPA 3A5NC 3HZ6A 2NRHA 5EX5A 4BVOA 3D2FA 4WQ5A 3ULEA 1NMDA 3MN9A 4CBUA 2ZGZA 1BA1A 1HKCA 4J8FA 3VPZA 1CZAN 4Y0WA 3DXMA 3VGKA 3EKSA 5BRDA 2VCPA 3QB0A 3CJBA 1SQKA 1K8KB 3DAWA 2YJEA 4BRMA 3ID8A 3MN5A 1BA0A 3R8EA 2PBDA 4BRAA 4BR9A 5BPNA 4FWMA 5AZIB 3ZX0A 4B1UB 4CZLA 3C7NB 1KAZA 3VERA 5KPZA 4PL7A 2ZGYA 2H3GX 4DHYA 5JICA 1HKBA 3LDQA 3VF4A 4BRKA 4CD3A 4BRDA 3A5LC 5FPEA 1NGCA 1QZ6A 2D0OA 2YHXA 1TYQA 2YHYA 4K25A 3A0IX 4BC4A 1ATRA 4BR2A 2P9PA 2W41A 4H5WA 4FOEA 3HTVA 3QMLA 2QWNA 4RWTA 1TUUA 1X3MA 4BGBA 1T6CA 2GTDA 5TKYA 1GLFO 2IIRA 1C0FA 2P9UA 3CJCA 2V7YA 4BQLA 2QW9A 3QFUA 2E20A 5AQQA 2V7ZA 3TU5A 4ISFA 5EY4A 4BRQA 1QZ5A 3VEZA 1MA9B 1MWMA 3IFRA 4JN4A 3ZETA 1HX1A 3SMPA 3D2EA 4JD2A 2ASOA 4H5VA 5AFUA 4FPBA 3BP8A 5BRHA 5AQOA 2PAVA 1TUYA 4FL9A 3VOVA 1KAYA 3U4LA 1ATNA 4BRFA 5BR9A 3DXKB 2GEMA 3H45C 5ADXH 3VGLA 3SK3A 2V52B 4BRGA 2UYTA 3QBWA 1NGDA 1DGKN 1S3XA 4CZEA 1BU6O 4ISGA 1XUPO 4MO5A 2FF6A 4F9OA 1BOTO 3QBXA 5FPNA 3L6QA 5BN9A 2IVNA 5BREA 5AQVA 4CZJA 4A2BA 3U9ZA 3H3NO 4M7YA 5LJVA 3G25A 4M63C 3VEVA 5AQJA 5BRFA 5AQZA 4BRIA 3CI5A 3FGUA 3KVGA 4BC3A 3ZX3A 4EIAA 2J4RA 3FLCO 4GY2B 4JHDA 4MLHA 1LCUA 2E88A 3AARA 3S41A 4FWOA 4ISEA 4CZIA 4I6MB 1BUPA 3I8BA 2CH6A 4H5RA 2EWSA 4DQ8A 1BO5O 2QWOA 5BPMA 1JCGA 1TYQB 1V4TA 2A3ZA 3C0BA 4BR5A 4BR0A 4CZFA 3VEWA 3O5BA 3WXLA 4YDUC 3FR0A 1NGIA 2V51B 1T44A 1OKJA 3UKRA 3O8MA 4WYBA 2Q1NA 2YHWA 3CQXA 2P9UB 3O80A 1RFQA 4PKHA 3MN6A 4BRNA 3HSCA 4H03B 2I7PA 1C0GA 2P9IB 2GUPA 2HF3A 2AA4A 3A5MC 5AZJA 4YDUA 1LOTB 2ASMA 4WQ4A 2BUPA 3IMXA 1U2VA 3FZKA 3WEEA 4H0YB 3D7EO 3CJAA 1D4XA 4CZMA 2NZTA 2QM1A 1YVNA 3GOIA 1GLAG 4CBXA 5KPRA 5AQWA 1SAZA 1WUAA 2ITMA 2VYPA 3A5OC 3J8AA 3H1VX 4FSVA 4B9QA 3EKUA 3H1QA 1NGJA 5E26A 4CZKA 3HBTA 3UKUA 4BG9A 1G99A 3H3OB 3H46O 3BUZB 1ATSA 3LM2A 3WQUA 5F0XA 1DKGD 4IO8A 3JS6A 5LY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ENOA 1TKDA 3QIOA 4IJAA 4JI5K 2YCHA 3OYFA 1VSLA 4BGAA 3RMAA 3DRPA 3MECA 2GV9A 4GNIA 2OTJN 3MDQA 2A6AA 4B1ZA 3NGZA 4F4KA 3HI0A 4UQGA 4XH5A 4BRLA 1RDAA 2FBTA 4H0TB 2OA8A 4Z4IA 4FWQA 4CERA 3ENBA 3HT3A 3MAQA 3CMEN 1IKYA 4DLEA 3U9DA 1ZC6A 4DFPA 3AVBA 4QOZB 1BHLA 4KI6A 5AR0A 4DFKA 3H6EA 5DM6L 3J7YP 4X62K 5FROA 3MXJA 3T19A 1VQ9N 4G9ZA 2HBMA 3K5OA 1H1VA 2EHGA 3CC2N 4BVPA 5FPMA 3CERA 3EY1A 1FKOA 1YAGA 2FSKA 1X1PA 2IS3A 4DS4A 1JXEA 4MLEA 1SKSA 4KH5A 4DKWA 2QXFA 1Z05A 3SAHA 3SBTA 3WUHA 2HW3A 4JS5A 5J2MA 4DF4A 4BDYA 4MDBA 3VQPA 3DWLA 2WTUA 3O3HA 4X66K 2OYQA 2QA4N 2D1KA 5C15A 4DR2K 3V1OA 3GL1A 4O44A 2NRZA 4L3QA 2G8UA 1L5UA 1UWBA 3HRGA 3NF9A 1LV5A 3K5NA 2Z1IA 1ILYA 3OY9A 3VQEA 1NOYA 4JRQA 2XY6A 1QSSA 1RDUA 4JK9A 4HTLA 4WQ5C 3CCVN 1NJIO 2LSNA 4FJLA 2VWJA 3EO3A 1YIJN 1YVUA 3SUQA 1X9SA 3L8BA 1QQMA 4CFAA 2CGJA 3BGRA 4DSKA 4DB3A 4B9VA 4V19S 1G15A 3L3VA 1I39A 5AQTA 4H8KA 1IKWA 5GAHP 3S3NA 4JK7A 2O4GA 3O4WA 2BANA 3K2PA 2HMPA 4OVLA 2P9SA 2BDPA 3AY9A 4CJ5A 3KK2A 2D0BA 5AQXA 3DRRA 4I9QA 3D45A 3LM9A 1EXQA 1N36K 2Q31A 4BR4A 5CE3A 1FJGK 1VSJA 3ZT1A 2D0CA 3C95A 1SS6A 4QS7A 4B3TK 4KTWA 1CXQA 3CPWM 2HNZA 4FJHA 3THYB 3PIPL 4H0OA 4DV3K 3EE9A 3HP6A 1KVCA 3LWLA 1K6YA 1BGXT 4FPAA 4FM1A 1JCFA 3T3FA 1LWCA 4ILJA 1QQOA 3R9PA 3DOLA 2UUAK 5KTQA 4OJRA 4B1VA 4B3SK 4KPYA 4RCHA 5HRPA 1VQLN 2GWKA 4A62A 3P39A 3LPUA 4C8MA 3MMVA 3TR8A 4OX9K 4KB0A 4CE9A 1R0AA 2VG7A 4JI6K 3VEXA 4DV0K 1RBSA 5CZ1A 1K8KA 1HLUA 4CHNA 4PHTX 1S1XA 3MXIA 4DTPA 2E6LA 2QTDA 2A1SA 2E4LA 1ITGA 4MO4A 4IJNA 4CGIA 1TK0A 1QSYA 4B8CA 4IKFA 3R6MA 4NYNA 1SUQA 1JCEA 3SLCA 3V4IA 3M8PA 3ZSRA 1NK5A 4CK2A 3CJ1A 1RT4A 3OYNA 3KIOA 3VA3A 3VEYA 3VF2A 2O8FA 1ZBFA 4FWKA 3C65A 2NRWA 4DTRA 4B08A 4B9NA 1BG3A 4JV5K 3QEWA 3OS2A 2P9SB 2O8CB 3QLHA 3OYIA 3SQ0A 4U7BA 4BRCA 4CCHA 3OS0A 2DFFA 4EAHD 1TV6A 5JLFA 4BWJA 5AQGA 1SL1A 5J1EA 3SMSA 1U49A 3AVIA 1N32K 3F9MA 5IWAK 3ATVA 4PA1A 2VGMA 4YHHK 4CGGA 4DU1A 1TK5A 4DQPA 2A5XA 1D9DA 4C8KA 4WQ4C 1T03A 4CFCA 3CHWA 2O8DA 4CF8A 2E2NA 3ZSZA 3DLKA 3EN9A 1WSGA 3DJCA 2HHWA 1ESVA 5AQNA 1MWKA 3HL8A 4K43A 3SZ2A 3AAQA 2HBKA 1VSFA 4CZHA 3MCPA 5J2PA 4GKKK 1C6VA 1JLGA 3O3FA 3AA3A 3CMAN 1JXBA 4J8FA 1CZAN 2JWLA 3DXMA 4HCBA 2FBXA 3V6DA 2RKIA 3CJBA 1KC8O 3LANA 1K8KB 1MU2A 3O9RA 3ZSYA 3ID8A 3MN5A 1BA0A 3THXB 1S6QA 3AO5A 4HUGA 3TAFA 4CJUA 1YJ9N 3DLBA 3L3UA 3LDQA 3VF4A 3KD1E 1UAXA 1HNWK 2D0OA 2YHXA 2NRXA 3A0IX 2O8FB 1QE1A 1ATRA 4OPHA 4FZYA 2W41A 4FOEA 4FJMA 4KH6A 2QWNA 1C0MA 2OPRA 1X3MA 1W0HA 1NK8A 4AH9A 5TKYA 1L3SA 4J2BA 4DU4A 1C0FA 2P9UA 4DF8A 1K73O 4BQLA 5CHIA 3KK7A 4KI4A 1KVAA 3VQ5A 4ISFA 2R7YA 4M42A 3PY8A 2P1JA 3VEZA 4J2DA 1GOCA 3ZYYX 4ZHRA 3SYZA 3SMPA 1IBLK 3D2EA 1QVFM 3AVGA 1TK8A 2QK9A 4DR1K 3VOVA 2KTQA 1KAYA 1M90O 4Z4CA 2GEMA 4KREA 3SJJA 4DSFA 4NCAA 3QINA 4N47A 3DRSA 3QBWA 1DGKN 2F96A 4J2EA 3TSUA 1S3XA 3CM5A 4CZEA 4NLBA 1S9EA 3P38A 2PZSA 4MO5A 3VQ9A 1VQMN 3B6OA 3QBXA 1Q81O 3DOKA 4TSXA 1EO1A 4BACA 4X64K 1VQ7N 1TAQA 3G25A 3LPTA 1VHXA 5AQZA 1HYVA 3CI5A 3G4SN 1EKEA 3FLCO 4MLHA 4OLAA 4FJIA 3CCLN 1VRUA 1E3MA 2EWSA 4DQ8A 1BCOA 2UXDK 1V4TA 4DQSA 4FZZA 3CM6A 4E7LA 4Z4GA 4JKFA 3HP9A 4CF0A 3FR0A 4M3WA 3UKRA 2Q3SA 5GAEP 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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