3F9MA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose and activator showing a mobile flap
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
455
structure length
451
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
total genus 186
structure length 451
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2008-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3f9mA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3f9mA01
2ASMA 3R8EA 4I6MB 2HOEA 5EOYA 4CJ7A 1JCEA 3KVGA 2QWMA 4B1WB 3VGKA 1NGHA 2ITMA 4HTLA 1NGBA 2YJEA 1XQSC 3EKSA 3VGLA 3SMSA 4PKGA 5BPLA 3SLCA 3MK6A 4BGAA 3EN9A 3O1BA 2YHXA 3ULEA 4RWTA 1HJOA 2P9KB 1SQKA 1KAXA 1BUPA 3C7NB 2EWSA 3IDHA 3ZX0A 2QWNA 2VCPA 3O5BA 4FO0A 3CJAA 3L4IA 3AY9A 3VEWA 1XC3A 3CJ7A 2A40A 4BRLA 5CE3A 2QM1A 5AQYA 3VERA 1ATSA 1NM1A 3HSCA 4CZMA 3B8AX 4CBWA 3EKUA 4BVOA 3HTVA 2QWLA 2V7ZA 3ATUA 5AQMA 5AQJA 3DJCA 1JCGA 5JLFA 1RFQA 5F1XA 2Q31A 4NB4A 4H5NA 2FLOA 3GDQA 4RTFD 3UKRA 4BG9A 3A5NC 4PKHA 2I7PA 2NLXA 2QW9A 4FWNA 3CETA 2FSNA 4BRFA 1NGGA 3RSEB 4WQ5A 2YCHA 3CQYA 3CQXA 2NZTA 4CBXA 4BREA 1H1VA 5EVZA 4JHDA 5E84A 3LDQA 3L6QA 1YVNA 4WQ5C 5AQSA 2E2OA 3ZEUB 3WEEA 2YHWA 1V4SA 2Q36A 5AR0A 3BUZB 4WQ4A 2P9SB 3WXJA 4XH4A 1NMDA 2QWQA 2V52B 3GG4A 3HZ6A 5AQOA 3RSEA 3BF1A 4F9OA 2A6AA 4DHYA 1GLLO 2D1KA 1MDUB 4BR5A 1GLEG 1JCFA 2CH6A 1QHAA 3FR0A 1Z05A 4H0YB 2E20A 4B1YB 1BA1A 4FWRA 3BEXA 3QFUA 4CZIA 5AFUA 3FLCO 5AQFA 3O8MA 3MN9A 3ULEB 1QQNA 1NGEA 3EO3A 1S22A 4MLEA 1U2VA 4H0OA 3A0IX 4IZ9A 4CZJA 2A3ZA 2E1YA 3CERA 5BPMA 4GNIA 1NGFA 1RDWX 4B1UB 4PL7A 2GEMA 3H46O 3R9PA 3EZWA 4BG8A 3HBTA 3FFKB 5AZIA 5AZJA 1IJJA 1BG3A 1QQOA 2D0OA 2PAVA 5F2RA 5AQVA 2CH5A 3MCPA 2YI1A 4B1VA 3H3OB 2IVOA 1R59O 4FOIA 2A41A 2HMPA 1BU6O 5AQQA 1T44A 1TYQA 2P9PB 3D2EB 4GY2B 4YDUA 2CGLA 4M63C 5EX5A 1K8KB 1MWMA 2HF3A 1X3NA 3J8AA 1QZ5A 4BR9A 3AAPA 4JD2A 2ZGYA 1TUYA 2P9IA 1C0FA 1TUUA 3CI5A 3DXKA 4K42A 5TKYA 1CZAN 2Q0RA 1NGJA 3O6WA 3VESA 2Q1NA 1ZXOA 3A5LC 5AQRA 4CZHA 3GBTA 4H03B 1ATNA 1BO5O 1P8ZA 4CZLA 4XH1A 1NGDA 3ENHA 3CHWA 3CJBA 3QFPA 3UE5A 5LJWA 3VF2A 1KAYA 3ID8A 4BVPA 4XEIA 5AQLA 5AQTA 2HF4A 1GLDG 1OKJA 3FZFA 4BRQA 3WT0A 1KAZA 3FE1A 3AARA 4BRGA 4CZKA 2V51B 3L0QA 4A62A 3H1QA 3KHYA 1EQYA 3CIPA 3BP8A 4K25A 2BTFA 3ZEUA 1T6CA 2P9PA 1HX1A 3D2EA 2E2PA 4B1XB 2Q2RA 3QMLA 1BA0A 4DB3A 5B8HA 2Q0UA 2DPNA 3F9MA 3M1FA 1WUAA 5KQDA 3UKUA 4BGBA 2P9NB 2ASPA 4BRIA 3QICA 2I7NA 1ATRA 1QZ6A 3TU5A 3SMPA 3P4IA 5ADXA 1NLVA 3U8XA 2FSKA 1NGIA 3KZBA 1BDGA 2GTDA 2J4RA 4H5VA 4RCHA 3UKRB 2IIRA 2AA4A 4NO7A 4DCHA 4Y0WA 1NWKA 3H1VX 3U4LA 2F9WA 1T6DA 2QWOA 3M6GA 5EY4A 5KPZA 5ELZA 3MDQA 4I6MA 4K41A 5BPNA 2H3GX 3ENOA 4H5TA 5AQPA 1MA9B 4FOEA 2IVNA 3VPZA 3GL1A 1ZC6A 4B9QA 4MO5A 2YHYA 4M7YA 4FSVA 5AQXA 4BQLA 4BRNA 4XH5A 5KQ8A 4FL9A 4H5RA 2E88A 3VEVA 3W3DA 1BWFO 5JLHA 3CJCA 1GLBG 2P9KA 5AQKA 3ZX2A 3WEEB 3WXIA 4HWIA 1LCUA 1GLCG 1NBWA 3UB5A 5JICA 3WQTA 2A42A 1X9JA 1V4TA 2P9IB 4L3QA 3R6MA 4YDUC 4B1ZA 4H0TB 1Q18A 1S3XA 4O8KA 4EFHA 4IJAA 2A5XA 1NGAA 3JXUA 4H0VB 3VEXA 2GWKA 5F0XA 2PBDA 3FZLA 3LM2A 4BRAA 5BR9A 2P9UB 3A5MC 4JAXA 5BN9A 2FSJA 3GOIA 2FXUA 3JS6A 3C7NA 2QWPA 3AAQA 5FPMA 4A2BA 3HI0A 2AP1A 4FPAA 4PL8A 2CGJA 1QQMA 3IUCA 1ESVA 4LC9B 3H45C 3ZX3A 4A61A 1E4FT 3ATVA 4EHUA 2CGKA 4BR7A 3H6EA 3O4WA 3DXMB 4MLHA 2FF6A 4BR2A 4BRDA 4H5WA 4A2AA 4KBOA 1SZ2A 4C23A 3S41A 3D2FB 3O1WA 4JHDB 4BRPA 4K43A 1DGKN 3I33A 5AFUH 3MN6A 2P9LA 3GE1A 1NGCA 1K8KA 1KXPA 1RGIA 1HLUA 1MWKA 5LJVA 5LY3A 5BRDA 3LDOA 1J6ZA 3CJ1A 4BC3A 3UKUB 3VF6A 1WOQA 1XUPO 1YXQA 3MMVA 5FPEA 3IMXA 3U9ZA 4CZEA 3I8BA 5BRHA 1Z6RA 1U6ZA 3LDPA 2KHOA 3G25A 4FWQA 3SK3A 3H3NO 3WXLA 4Z94A 5ADXH 4CBUA 2E2NA 4QS7A 2NRHA 4JNEA 3VENA 3LDLA 3SJHA 4EHTA 1DEJA 2GELA 4BC5A 2IVPA 4MO4A 3LDNA 3O08A 3O80A 4EIAA 3FGUA 4BRMA 3BF3A 1U2VB 1BOTO 1DKGD 5AQNA 1C0GA 4H0PA 4BROA 3FZHA 5BRFA 3LM9A 4BC4A 4BC2A 4M7XA 4FWKA 2UYTA 5FPDA 4IXCA 5AQGA 5AZJB 5AZIB 3VF4A 3VEZA 4PKIA 3A5OC 1ZBSA 2FF3B 1HKCA 4WQ4C 3WQUA 3VOVA 1YUWA 4IWVA 3VGMA 5AQIA 3HM8A 4JD2B 2YJFA 4ISGA 4CD1A 2W41A 4BR4A 1X3MA 2E2QA 4CI6A 1D4XA 5BN8A 2ZF5O 4BQZA 2E1ZA 3MN7A 5AQZA 4FWPA 3QBXA 4WYBA 2ASOA 1HKBA 3IFRA 4CD3A 4DQ8A 2W40A 3M3ZA 5E26A 3D2FA 3DWLA 5EXWA 4AM7A 2Q97A 3VEYA 1LOTB 3QDKA 4FWSA 2P9SA 2VYPA 2BUPA 3LL3A 4QS9A 4CZGA 1Y64A 4BRCA 2WUSA 4FWOA 3C0BA 4J8FA 3QB0A 3W0LA 3DAWA 4FWLA 4H0XB 3TPQA 4FPBA 4BRKA 4E1JA 1GLAG 2VWBA 3DXKB 2P9NA 4IO8A 3VEOA 4FWMA 5KPTA 4IJNA 3FZKA 3OHRA 5I9EB 1GLFO 5FPNA 2F9TA 2D4WA 4BRHA 4AM6A 3QBWA 4ISFA 3ZETA 1HPMA 1G99A 5AQUA 2QWRA 2GUPA 2GWJA 2QXLA 4ISEA 3FZMA 1E4GT 3U9DA 1YAGA 3WUHA 1HKGA 1GLJO 4JN4A 4EAHD 2E8AA 1HUXA 2ZWHA 4O5FA 3DXMA 3A8YA 3D7EO 3EL2A 2OANA 3VETA 3MN5A 4BR0A 5AQWA 2V7YA 3CJ9A 2ZGZA 5KPRA 5JMVA 2D0PA 2P9UA 4QS8A 3ZETB 5AQHA 1TYQB 3WXKA 4CZFA 2P9LB 1IG8A 5BREA 1SAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CGJA 3WNFA 1IG9A 2HOEA 4DTSA 4JKGB 4CE9A 2KLAA 4CHPA 1RT5A 2IOCA 3BGRA 3EKSA 5HRSA 2BANA 3NH0A 3AO4A 4H4MA 1BL3A 2JLEA 3KLHA 4F2RA 2HVIA 2YHXA 2F96A 1GOCA 3CG7A 3ZX0A 1KAXA 1C0MA 3O5BA 3O9SA 2KFZA 1EXQA 3VTHA 2KKZA 3L8BA 3CJ7A 2QM1A 4DTJA 5AQYA 3VERA 1IKWA 4CHYA 2QA4N 1K6YA 3B8AX 3AVGA 4OLAA 3CYMA 4BVOA 1Q82O 2G8IA 1LWFA 2D5RA 3ZLJA 5AQMA 4CHOA 3KLIA 5I3UA 5JLFA 4IO9L 5E41A 3NH2A 4NB4A 4H5NA 3T69A 4DLEA 4RTFD 4BG9A 4JI7K 1JLBA 3A5NC 3HOTA 4OPAA 5C42A 1NOZA 1IKVA 1REVA 4JKGA 4LH5A 4FWNA 3KD5E 4WQ5A 3G6EN 4E19A 3NDKA 1U49A 4PWDA 3CQXA 4CBXA 1H1VA 3OJUA 3KK2A 3SQ4A 4WQ5C 2E2OA 3ULDA 3CCSN 3SV4A 3OYMA 4OX9K 4JKBA 1NMDA 4KTQA 3GG4A 2XO7A 4DQSA 4N5SA 3QEIA 4KB0A 5C2FA 3RSEA 3BF1A 4F9OA 2A6AA 3OTOK 2UU9K 1TAQA 2D1KA 5JVHL 4M3XA 4BR5A 1RILA 1JCFA 4FVMA 1IKXA 1QHAA 1LAVA 1Z05A 4B1YB 1BA1A 3BEXA 3QFUA 3P39A 4DR6K 3FLCO 3O8MA 1QQNA 4RW4A 4AHTA 4FM2A 4MLEA 1U2VA 4H0OA 4DUZK 3DRRA 5CYMA 3RRGA 2RE2A 1FW6A 3CERA 5BPMA 4B1UB 1NGFA 4YOWA 3R9PA 3EZWA 3SQ0A 3HBTA 4JI2K 1C1CA 5AZIA 5M1PA 5AZJA 4WFAL 1QQOA 1HRHA 1XC9A 5F2RA 5AQVA 1SL0A 3H3OB 2NRXA 3OYNA 4GY2B 3PX6A 3J8AA 1QZ5A 4FW2A 3AAPA 3S9HA 4DF4A 1TUYA 5HRRA 4FJ8A 2P9IA 3O3HA 2PY5A 4LF5K 1C0FA 2NNWA 3L2UA 2Q0RA 2Q1NA 4QAGA 3TABA 3A5LC 3T19A 3ZSOA 1XHZA 4NXMK 2KZZA 1S6PA 1NGDA 3UE5A 1O13A 3ID8A 5AQLA 3PV8A 3NMUA 5JS1A 4PY5A 1OVYA 2X6NA 2ZJQL 3AGRA 4MFBA 3WT0A 1W0HA 1LWCA 4BDZA 3S3NA 1WSGA 4CZKA 2DY4A 2V51B 3SAGA 4R5PA 4DFJA 3DI6A 4B3OA 4CK3A 1VRUA 4C8LA 1E3MA 2HHWA 2OTLN 4K25A 2P9PA 3D2EA 2A1SA 3EEQA 3QMLA 1TK5A 3KK1A 2Q0UA 3K58A 1NJWA 4CEZA 1WUAA 5FDLA 1MU2A 3HOSA 2ASPA 3KLEA 4DTNA 4DU1A 3AVLA 4CJQA 1QZ6A 3P4IA 3V6DA 2FSKA 3NF6A 4IFYA 3ASMA 1BISA 1OVQA 4JK8A 1RBVA 5CZ2A 1BDGA 2QI2A 3E9PA 4KRFA 4CEEA 4DCHA 2AA4A 1J9AA 3H1VX 2F9WA 1T6DA 2QWOA 3M6GA 1KD1O 1U04A 2KFNA 2NRZA 3MDQA 4I6MA 4I7FA 5K14A 5BPNA 3OYAA 3MECA 5AQPA 3OYCA 3SUPA 5GAHP 4PQUA 1MA9B 4FOEA 2IVNA 2VWKA 4AH9A 4B9QA 4M7YA 5AQXA 4BQLA 2O8FB 4DV0K 3N4PA 1SUQA 2PZSA 1BCMA 1VAZA 3ZSWA 3CJCA 4EZ6A 3ZX2A 1OH7A 3RMBA 5IWAK 5HBMA 5FRMA 4O44A 4HWIA 1LCUA 3U3YA 3UB5A 4ILJA 4B9NA 2HNYA 3WQTA 4IEIA 2P9IB 4B1ZA 4DMNA 2PYJA 3CF5L 3S3OA 4I9LA 1T7PA 2A5XA 4CFBA 1NGAA 1SL2A 2GWKA 4IEEA 2O8FA 5J2PA 4L8RB 3HYFA 2UXDK 3A5MC 4FLZA 4JAXA 3SPYA 4WF9L 2FSJA 1YIJN 3GOIA 4KHSA 3JS6A 3OYKA 5M1QA 3F73A 3HI0A 2AP1A 3KIOA 4FPAA 4PL8A 4W5RA 3IUCA 1VSEA 1IH7A 3KJVA 2P5GA 3DLHA 4LC9B 3ATVA 1KC8O 1LW2A 1JJ2M 2FF6A 1VQPN 1NG9A 2O8DB 4O4GA 3OYGA 1CLQA 4DV5K 2RKIA 1GOBA 4CFCA 3LZIA 1YITN 3T3FA 3MEEA 4JI4K 1XNQK 2HMIA 4Z0UA 4FLXA 2GBZA 4ZHRA 5AFUH 4DF8A 2P9LA 3EZ5A 4DTPA 4CFDA 4E1NA 4M3UA 1CZ9A 5BRDA 1VQ6N 1J6ZA 3VMFB 4DUYK 3UKUB 3VF6A 1XUPO 4JKHA 3ZT2A 3AVJA 1M90O 4DSLA 1Z6RA 5KGWA 4DS4A 3O4NA 3G25A 5D3GA 3SK3A 1TKTA 3WXMB 1L3SA 3AO2A 3HPGA 3CC2N 1A5XA 4HCBA 3O08A 1TK8A 3CCMN 4X62K 4Y1CA 2G8HA 1NJXA 2DFEA 2IC3A 3NE6A 3PLAA 4NCBA 4ELTA 4IOXA 4FWKA 3L3UA 5FPDA 3CPEA 4IXCA 1IKYA 4NYFA 4DSFA 1FXXA 4KO0A 3VEZA 2ZJRL 3J80O 3QEWA 4DR5K 4DQIA 4B8CA 4WQ4C 3WQUA 3VOVA 4AF1A 3NHGA 3ENBA 3M8RA 3BZKA 1IBKK 4WE1A 1I94K 4YNQA 3LP3A 4CI6A 1D4XA 1NK5A 2ZF5O 4FCYA 1YTAA 4FWPA 3QBXA 4RW7A 4AILC 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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