3F9MA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose and activator showing a mobile flap
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
455
structure length
451
Chain Sequence
b'ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
total genus 186
structure length 451
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2008-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3f9mA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3f9mA01
4PKHA 3WEEB 3ZETA 4ISEA 2IVPA 4H0PA 4RWTA 2OANA 3R8EA 4YDUC 1GLEG 3VENA 3WXKA 4B9QA 2ZGYA 5KPRA 1NGAA 1ZBSA 1S22A 4CZFA 5AQRA 4B1WB 3FZKA 4JHDB 3M6GA 3WQTA 3A5OC 2YJEA 2Q31A 4Y0WA 2A6AA 3CIPA 4H0YB 1SQKA 2YHWA 2ZWHA 3J8AA 3EKSA 3U8XA 3VETA 1Y64A 5BRHA 3D2EB 1V4TA 4H0OA 2QWNA 5AQPA 1X3MA 3A8YA 5F1XA 1U2VA 1TUYA 3FE1A 4MLEA 1MWKA 3QFUA 4FPBA 3F9MA 4MO5A 3VEYA 3M1FA 1ZXOA 1KAXA 1KAYA 3TPQA 1NGBA 3CJBA 4J8FA 5BRDA 1C0FA 3ULEA 3GOIA 3ENOA 3UKRA 4BG8A 1H1VA 3DJCA 3U9ZA 3WXLA 4DQ8A 4WQ5C 3MN6A 4B1XB 5JLHA 2P9KB 3FZLA 4FWNA 3O8MA 1QQOA 3D2FB 4M7XA 1BA0A 3ZEUA 4JAXA 4K43A 2QXLA 3VEOA 3FFKB 4BROA 4BC4A 5KQDA 3O6WA 5AQJA 1IJJA 4I6MA 1NGHA 2CGKA 1BA1A 3H3NO 5FPDA 5AZIA 5LY3A 2E2OA 2P9PA 3MDQA 1RDWX 5AQIA 2QWLA 2A42A 1BOTO 2P9IB 4NO7A 3VPZA 5JLFA 4QS7A 5ADXA 2Q97A 4FPAA 3I8BA 1NGEA 4JNEA 3C0BA 1NGFA 3EZWA 1NGIA 3QMLA 3VEWA 4BGBA 4H5RA 5AQXA 3MMVA 5AQZA 4QS9A 5AZIB 2YHXA 4RTFD 1WOQA 5ELZA 3WEEA 3ZETB 5BPNA 3DWLA 2D0OA 2P9KA 3VF2A 2I7NA 2J4RA 3O4WA 2Q2RA 2NZTA 3LDPA 4FOIA 2CH5A 2IVOA 4WYBA 5FPNA 3KVGA 3VESA 5BPMA 4O5FA 3UE5A 5KPTA 3CJ9A 2I7PA 4M63C 4BREA 2Q1NA 1GLLO 4BRHA 1QQNA 1XC3A 4IO8A 1X9JA 2E2NA 1X3NA 1GLAG 5AQQA 5AQGA 4CZKA 2E2QA 2QWQA 5FPMA 3WT0A 5JMVA 2CGJA 1TYQA 4BRLA 3CJCA 2PAVA 4H5TA 2QWOA 2A41A 4B1VA 2ASMA 5KPZA 3GG4A 4K41A 4JD2B 3VGMA 2HF4A 5AFUH 2D1KA 4FL9A 3ZX2A 4BR5A 2W41A 2KHOA 3EN9A 4H0VB 3EO3A 2GTDA 1BDGA 4BG9A 3QBXA 3UB5A 3CQXA 3BF1A 4Z94A 1XUPO 4H5WA 1JCEA 3OHRA 4DB3A 2Q0RA 4LC9B 4KBOA 2YCHA 3ATVA 4NB4A 1HUXA 3QFPA 1NMDA 3MCPA 1NWKA 3L6QA 1NGCA 4FWKA 4A2AA 2A3ZA 4WQ4A 3LDNA 2BTFA 3A5LC 3U9DA 5AQOA 3H46O 2VCPA 3AAQA 3CJ1A 5I9EB 1GLJO 2FLOA 3O80A 4FWLA 4H03B 4EIAA 4MO4A 2IVNA 1QHAA 3HZ6A 1BG3A 4AM7A 2V52B 3FR0A 3KHYA 3MN5A 4FWRA 4BC2A 3EL2A 4FOEA 4IJAA 4FWSA 4F9OA 5AQKA 1SZ2A 3VEVA 3W0LA 4RCHA 3IFRA 1HKGA 4H0TB 4M7YA 4H5NA 2CGLA 3IDHA 5B8HA 5LJWA 1E4FT 2GWKA 5AQHA 1YVNA 3QICA 4FSVA 3P4IA 2P9NA 3R9PA 1SAZA 2E20A 5EOYA 5BPLA 1CZAN 1Z05A 3B8AX 3WXJA 2EWSA 2P9UA 4JN4A 4XEIA 4HWIA 1QZ6A 3FZFA 2HF3A 3RSEB 3ENHA 1Z6RA 1BO5O 5AQFA 3AY9A 4BVOA 3ID8A 2GUPA 3QBWA 4H5VA 3ZEUB 1ATNA 1DGKN 3MN7A 4BRKA 2V7ZA 5F2RA 5EX5A 2FSJA 3CERA 2ITMA 4BRQA 4I6MB 4BRDA 1K8KB 4EHUA 1MWMA 2WUSA 2YHYA 3EKUA 3BP8A 4FWPA 3H3OB 5AZJB 4BRNA 2FSNA 1OKJA 4FWMA 4BRIA 3VEXA 4BGAA 4IJNA 2F9WA 1QQMA 3CHWA 4EHTA 5KQ8A 5AQUA 4DHYA 1JCFA 5AQYA 1GLCG 1HPMA 5FPEA 2E88A 3UKUA 3H45C 3GE1A 3BF3A 3JS6A 2V7YA 4L3QA 4BQLA 4BR4A 5AFUA 3IMXA 4O8KA 2DPNA 5BN8A 4IZ9A 4A2BA 3R6MA 4BRAA 2HOEA 2AP1A 2P9LB 2QW9A 2V51B 1LCUA 4JD2A 5EVZA 1GLBG 4CZGA 4FO0A 2F9TA 1U6ZA 3A5NC 3CQYA 2P9PB 3A5MC 4CZEA 3LDOA 1XQSC 3BUZB 1GLDG 4BR7A 1V4SA 2P9IA 1DEJA 1T6CA 4BR0A 3HBTA 1HJOA 1S3XA 2D0PA 4K25A 3CJAA 3TU5A 4A61A 3GBTA 1KXPA 4EAHD 1ESVA 1QZ5A 4B1ZA 4HTLA 4MLHA 3KZBA 1TYQB 3VERA 3MK6A 3QB0A 1C0GA 2E8AA 2ZF5O 2BUPA 1BWFO 2GELA 2P9SB 3SMSA 1HLUA 1R59O 5AQTA 2FF3B 4FWQA 3QDKA 4BVPA 5ADXH 2NRHA 4BRFA 3O1WA 1NGDA 1JCGA 1U2VB 2QWMA 4WQ5A 4BR9A 4BRCA 2GWJA 3FGUA 2A40A 3JXUA 1ATSA 4XH4A 1RGIA 3HI0A 2ASPA 4IWVA 4JHDA 2QM1A 3U4LA 1T44A 4ISFA 3SMPA 3M3ZA 5BRFA 1P8ZA 3G25A 4BRMA 4XH1A 1NBWA 4DCHA 1ATRA 3HM8A 3LM9A 1NLVA 4C23A 3DXKB 1KAZA 1HX1A 3FZMA 4GNIA 1D4XA 2YJFA 2GEMA 1NM1A 1YXQA 4B1YB 5CE3A 3FLCO 3GDQA 3CETA 3ATUA 4CZLA 2D4WA 4BRPA 4CBXA 4BRGA 2A5XA 5E84A 1LOTB 2FXUA 5LJVA 5AQSA 3ZX3A 3VGKA 3DXMA 3H1QA 5F0XA 1YAGA 1Q18A 3WQUA 5AQLA 4FWOA 3WXIA 4YDUA 4QS8A 1EQYA 3D2EA 3LDLA 4PKIA 3AAPA 2VYPA 1T6DA 4WQ4C 2E2PA 3O08A 3DXMB 1RFQA 4BQZA 2PBDA 1DKGD 3D7EO 2E1ZA 3H6EA 5AR0A 4XH5A 3DXKA 5AQNA 3UKRB 3LM2A 3CI5A 2QWPA 5AQMA 3S41A 2NLXA 2QWRA 4CJ7A 2H3GX 3MN9A 1MA9B 3HTVA 2P9NB 1BU6O 2P9SA 1K8KA 5BR9A 4GY2B 3D2FA 1IG8A 2W40A 5AZJA 2E1YA 2P9UB 4CZHA 3HSCA 3LL3A 3O5BA 1NGGA 2AA4A 3RSEA 3IUCA 1HKBA 3C7NA 4PL7A 3BEXA 3H1VX 3O1BA 4CZIA 4H0XB 5AQWA 1MDUB 1G99A 4K42A 2Q36A 4AM6A 3UKUB 4ISGA 2P9LA 3I33A 4CD3A 3ZX0A 1YUWA 1ZC6A 3A0IX 3SLCA 4BC3A 3W3DA 4IXCA 1WUAA 2Q0UA 5E26A 3CJ7A 1J6ZA 4B1UB 4CBUA 4CBWA 2YI1A 1HKCA 3C7NB 4PL8A 3WUHA 5TKYA 4A62A 5EY4A 3L4IA 3SJHA 5EXWA 3VF4A 3VF6A 4CZJA 3VOVA 4CZMA 4EFHA 3SK3A 1E4GT 1TUUA 2ASOA 2FSKA 5BREA 3DAWA 1NGJA 2FF6A 4CD1A 2IIRA 5BN9A 4BC5A 3VGLA 5JICA 3L0QA 3LDQA 5AQVA 3FZHA 4CI6A 3ULEB 2ZGZA 2VWBA 1GLFO 2CH6A 3AARA 3GL1A 1BUPA 2UYTA 4E1JA 3VEZA 4PKGA 4BR2A 2HMPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YNFA 4LF6K 1GOCA 2Z1IA 1S1XA 2IVPA 4CGGA 4RWTA 2OANA 3MAQA 3MEGA 4GV6A 3KK3A 1NGAA 1HQEA 3RMAA 1N6QA 3TARA 3SPZA 4R79A 3WQTA 3A5OC 2IS3A 4Y0WA 1M90O 3CIPA 4H0YB 3NGYA 2ZWHA 3EKSA 4WFBL 1EP4A 2NNWA 1V4TA 3QINA 1KSPA 2HBLA 1X3MA 3A8YA 1TUYA 4AHSA 5I42A 4JK9A 4CJVA 3NVKA 3KLGA 1XNRK 1C0FA 5C24A 3ENOA 4FXDA 5JS2A 4BG8A 1H1VA 4LSNA 1TVRA 4DQ8A 4B1XB 3F5TA 5JLHA 3MX2A 3FZLA 3OS0A 4KV8A 4WCEL 3HOSA 1RTDA 3NF9A 4RW6A 3BDPA 4CHOA 4JAXA 4B3OA 3VEOA 4GMJB 5KQDA 4KI4A 3PO5A 1VSIA 1QVGM 3TTCA 4YOXA 3AA3A 3TABA 2CGKA 3OYBA 1JLGA 3DMJA 4B9UA 1RDWX 4FM1A 4B9VA 4NCBA 1IV0A 4NO7A 2D0AA 3VPZA 1C0TA 4QS7A 5JLFA 1U48A 1NGEA 3C0BA 4BGBA 3OYAA 2NRRA 1EX4A 2VQEK 1WAFA 3ITHA 3TI0A 5AZIB 1JL1A 3ZETB 1RT2A 4OX9K 1RT1A 4KI6A 3O4WA 2HVHA 2NZTA 2RKIA 5H1SQ 3KVGA 2O8EA 4DV0K 1RDAA 3F9KA 4BREA 2NRXA 1VQ7N 1GLLO 2OPQA 2Q3SA 3VQ5A 3THWB 1Z26A 1X3NA 3LWMA 3I55N 2OYQA 4F3TA 4CZKA 3OYCA 4IOAL 2CGJA 1VSJA 3VQ7A 4CIFA 2PAVA 2QWOA 1I39A 2OPRA 4B1VA 3CFPA 2P1JA 4DTNA 3KIOA 3C94A 2GV9A 5AFUH 4FL9A 1TL1A 2PZSA 2KHOA 4LY7A 1IKWA 5DMRA 5HROA 1TKTA 4IFVA 3DOKA 3BF1A 4HUFA 1X1PA 4GV9A 1NOZA 3A2FA 4DQSA 1QE1A 4DQRA 4LC9B 4KBOA 2YCHA 4DSLA 4DSJA 4NLCA 1HUXA 1SS6A 4IDHA 1VSDA 4M3ZA 5C25A 1C1BA 3TAFA 3VQ6A 4NXNK 3F73A 2PFUA 1WSGA 4A5AA 1RBTA 4GVEA 3AAQA 4JS5A 4KHYA 5J2NA 2A1SA 4IG3A 5C42A 4CIGA 4KFBA 2G8VA 2UXBK 2OCEA 3MEDA 4MDAA 4MO4A 4DR1K 1UA0A 2PYLA 2YHBA 1VQPN 4AM7A 3KWIA 4IG0A 4BC2A 4JRPA 3EL2A 2Y1IA 4FWSA 5AQKA 3TSPA 3AVCA 1JLCA 3AVJA 4KAZA 4GVMA 1UWBA 1S1TA 1CLQA 4H0TB 1J5EK 5B8HA 3HPOA 1E4FT 4GKJK 3K0SA 3WXMB 1ZYQA 3QETA 4CJ5A 3OS1A 1SAZA 2ZD1A 5DK5A 4CJFA 1BISA 3KLHA 3OYKA 4O55A 4QCLA 4W5NA 3NFAA 4CF0A 3RSEB 2G8IA 2HNDA 2D0BA 4H5VA 4CJRA 4BRKA 4LF7K 4AHTA 4J2AA 3CERA 4EHUA 3HJFA 2WUSA 1KVAA 3BP8A 4FWPA 5AZJB 1EXQA 4CHYA 2VWKA 1NK0A 1GOAA 1JLEA 1W9HA 3ZT4A 4IJNA 3D0PA 5KRTA 5AQUA 4DR2K 1HPMA 2GX9A 3THWA 1IO2A 5I3UA 3I56N 4DSIA 3H45C 2V7YA 4L3QA 5AFUA 4CGFA 4O8KA 3UIQA 3OBYA 3O4NA 3R6MA 3ENBA 2P9LB 3FFIA 1L3TA 5EVZA 4CJ3A 1GLBG 4CZGA 2O8EB 3K5LA 1U6ZA 3A5NC 3SYZA 4PA1A 2D0CA 1V4SA 1L3SA 3ZSRA 4E7JA 4BE2A 1K73O 3WNGA 1VHXA 1HJOA 1S3XA 3CCVN 4A59A 1QSSA 2F4VK 3AGKA 2DTUA 5FRMA 4HCCA 2BE2A 3LANA 2ZJPL 3TU5A 4A61A 1NK5A 3GBTA 1KXPA 4EAHD 3C6UA 4WFNL 2YKNA 4OPKA 3C65A 2BUPA 1F21A 2O8BB 3AA5X 2GELA 2P9SB 1HLUA 5AQTA 3RTVA 3V9ZA 3PLAA 3MEEA 2NRHA 3TAGA 4A5BA 3OVNA 2B4JA 4FW2A 3IS9A 1ATSA 2YHAA 1VQKN 3HI0A 1VQLN 4EZ6A 3G71N 1Q82O 2ASPA 3AVBA 2QM1A 4IFEA 1T44A 4DR4K 1XMQK 4Z4FA 4QAGA 1S1WA 1BGXT 1P8ZA 1VRTA 4XH1A 1NBWA 1YJWN 4DU3A 3SUQA 2QKKA 2YJFA 4E7KA 2NRTA 5GINA 4CJPA 5CE3A 3GDQA 4BACA 3CETA 1JJ2M 4FJXA 3O9UA 4DFJA 2A5XA 3O3FA 4FVUA 5LJVA 5J2QA 4JKCA 5J1EA 3VGKA 3D45A 3HPHA 4CK2A 3ISNC 1K8AO 2F8TA 5AQLA 1YHQN 4DV3K 3NCIA 4DFKA 2VG6A 4YDUA 3CQ8A 4JI2K 1YIJN 1NK4A 1OH6A 1T6DA 4AHCA 4WQ4C 2W6LA 3S3OA 1XHXA 5FROA 3RR8A 3T19A 3DXMB 1FKPA 2Z1HA 3CM5A 3D7EO 3HP6A 4XH5A 2VGMA 3NHGA 3EE8A 2QWPA 5AQMA 3PUFA 3S41A 2QWRA 4CEEA 3CD6N 1MA9B 3HTVA 3DLHA 5BR9A 2P9SA 4UQGA 4GY2B 3D2FA 1C1AA 4HUGA 4YHHK 1YJNN 2X78A 1JL2A 4ELVA 2P9UB 3TR8A 3O5BA 4I9LA 4BDYA 2AA4A 3M8SA 3IUCA 1U04A 3C7NA 4YOYA 4FK2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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