3F9MA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose and activator showing a mobile flap
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
455
structure length
451
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
total genus 186
structure length 451
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2008-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3f9mA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3f9mA01
5AQWA 2D1KA 1JCFA 3VESA 3ZX3A 3MN6A 4FWMA 1DKGD 1NGJA 4IO8A 5FPEA 4Y0WA 4EAHD 3DJCA 3GG4A 1CZAN 1HKCA 2FSNA 5KPTA 5KQ8A 4YDUA 5LJVA 2P9KA 4O8KA 3H3NO 3EKSA 4CD3A 3WEEA 1T44A 4XH4A 3VEYA 4FOEA 1T6CA 3FZMA 1Q18A 5AQYA 3VEWA 2E8AA 4H5RA 2E20A 2D0PA 4CZEA 1GLAG 4WQ5A 3SMSA 3HBTA 4DHYA 5AZIB 3W0LA 1Z6RA 2QWRA 3U9ZA 5JICA 4BC5A 5KPZA 3P4IA 3DWLA 1U2VB 2VCPA 2W40A 3VGKA 3WXJA 4BVPA 2IVPA 1RDWX 5F0XA 4FWNA 3CI5A 4CZKA 4FWOA 2CH6A 4H5TA 1KAZA 1Y64A 1G99A 4WQ4A 2CGKA 4FWRA 4H0PA 2GWKA 2QWPA 1GLLO 3GDQA 3ENHA 4CZIA 4BGAA 5AQLA 2ASPA 2FF6A 3I33A 4BR7A 3WT0A 1E4FT 4EFHA 4EHUA 4BRDA 2IVNA 1S22A 4K25A 1H1VA 1QQNA 3J8AA 3KVGA 3HSCA 2QW9A 3D7EO 1NGFA 3GBTA 2GEMA 4FWQA 2YI1A 4BR4A 1LOTB 2J4RA 1DEJA 1HLUA 3QMLA 2AA4A 5AQPA 3O5BA 1MDUB 3FE1A 1YXQA 3WXIA 3H1VX 1MA9B 1BUPA 2P9PA 3U9DA 4BREA 3R6MA 4CBWA 1ATRA 5B8HA 2YJFA 1U2VA 2YJEA 3MMVA 5AQUA 4BR2A 2E2QA 2IVOA 1BWFO 2FSJA 2Q0RA 3VETA 3MN7A 4BC4A 1U6ZA 2HF3A 1ATNA 2E2PA 4IJAA 5FPMA 5EXWA 1NMDA 2QXLA 3SK3A 1BOTO 2QWOA 2ASMA 5ADXH 3EL2A 5AQNA 3DXMA 5EOYA 5FPDA 5BPNA 4FWLA 4YDUC 3L6QA 3MDQA 3CJ9A 3ULEB 5AQGA 3H45C 3W3DA 3WQTA 3WEEB 3VF6A 4BG8A 1EQYA 4CZLA 3B8AX 1S3XA 3QFUA 3C0BA 3D2FB 4WQ4C 2OANA 3HM8A 1ZXOA 3A5NC 3H46O 1BA0A 2P9NB 2E2NA 5AQSA 3HI0A 1GLFO 3WXLA 3EN9A 4A62A 4CJ7A 2Q97A 3VPZA 4K41A 4A2BA 4H5VA 3DXKA 5LY3A 4CZGA 1XQSC 3CJAA 5AQOA 3JS6A 1LCUA 1ESVA 4JD2A 4NO7A 4J8FA 4FSVA 2ASOA 3A0IX 1HKBA 3BF3A 1QZ5A 3DAWA 1K8KA 3UB5A 1QQMA 3R8EA 1YAGA 2I7PA 1K8KB 1YUWA 1JCGA 1TUYA 1YVNA 2E1YA 4JN4A 1D4XA 4E1JA 3WUHA 1C0GA 4BRKA 2YCHA 1E4GT 3LDOA 5F1XA 1NGDA 3SMPA 3TPQA 2Q2RA 3QBWA 1X3MA 2YHXA 2ZGZA 3HZ6A 5BRFA 4B1XB 4FPBA 4CBXA 1NGBA 2I7NA 2QM1A 4K42A 5TKYA 5AQVA 3UKUB 3U4LA 3QDKA 2GELA 4O5FA 3VF4A 4B1UB 3ATUA 4BRLA 5AFUA 4A2AA 4PKHA 4H0YB 2HOEA 3IDHA 3ZX0A 3FZLA 2E88A 1JCEA 4MO5A 4XEIA 5F2RA 4H0XB 3C7NA 4IXCA 4FOIA 3ULEA 4FWPA 3VGMA 1BO5O 4H0VB 1V4SA 2GWJA 5BREA 1MWKA 3KZBA 2P9SA 2ITMA 1SAZA 2YHWA 4CD1A 3LL3A 2PBDA 2P9LA 5JMVA 3HTVA 3VEVA 4JAXA 5JLFA 4XH1A 1P8ZA 5KQDA 4HTLA 3FZKA 5LJWA 3M1FA 3ZEUA 4BRIA 4FO0A 1HKGA 4EIAA 3SJHA 4QS9A 5AQHA 3GE1A 1GLJO 2A3ZA 1HJOA 2FLOA 1BG3A 3RSEA 4PL7A 2EWSA 3LDNA 5AR0A 1IG8A 4IZ9A 5BR9A 5AZJB 3CJ7A 2FXUA 4H5NA 4M7YA 3FZHA 3O6WA 3QB0A 4H5WA 4H0OA 2H3GX 1C0FA 4KBOA 1NGGA 2ZF5O 4ISFA 4BRFA 4CI6A 3CJBA 5AQXA 4DQ8A 1NGHA 3H6EA 4BGBA 4BRAA 2WUSA 4WYBA 3O1BA 3WXKA 3D2FA 1ATSA 3L4IA 4H0TB 4HWIA 3AARA 4JNEA 2V51B 2GUPA 3CETA 4ISEA 1XC3A 4CZJA 4PL8A 5AQKA 4MLEA 2DPNA 3LDLA 3SLCA 3VOVA 1BA1A 3QBXA 3BUZB 1IJJA 3IMXA 3UE5A 5AZJA 2D4WA 5BRHA 1WUAA 2QWNA 2Q36A 4CZMA 3DXMB 1J6ZA 5AQFA 4JHDB 4BRMA 4IWVA 2FSKA 3CJ1A 4Z94A 5AZIA 1NGEA 2P9NA 3FR0A 4LC9B 1QQOA 5E84A 4BROA 5AQIA 3VENA 1NGAA 5AQMA 1RFQA 3BEXA 4B1ZA 3MCPA 4M63C 4DCHA 2QWMA 3M6GA 1RGIA 3C7NB 3QICA 2F9WA 4FWSA 3ZETB 5CE3A 3TU5A 2D0OA 1XUPO 3WQUA 2P9KB 4MLHA 4BRNA 5BN9A 3ATVA 3EO3A 2HMPA 5AQZA 3RSEB 4B1WB 5AQRA 2AP1A 2P9IB 4B1YB 2GTDA 4BRCA 1TYQB 3A5MC 4FL9A 4H03B 3F9MA 3VEOA 4PKGA 4BR5A 3KHYA 1BU6O 3ZEUB 3FGUA 3LDPA 3VF2A 5KPRA 1HPMA 3L0QA 2F9TA 4I6MB 3I8BA 4BVOA 4EHTA 5AQTA 1SZ2A 4QS8A 4JHDA 4BC2A 2P9LB 4AM6A 2P9PB 5I9EB 4B9QA 1KXPA 1R59O 3CIPA 3LM2A 3VEZA 4FPAA 3O80A 1MWMA 2V7YA 2CH5A 2PAVA 2NZTA 3IFRA 4C23A 4BR0A 2A42A 4MO4A 3UKRA 1SQKA 4CZFA 1GLCG 4WQ5C 1HUXA 2P9IA 2Q31A 3CQXA 4GY2B 5AQQA 5BPMA 3AY9A 1V4TA 3MN5A 4RCHA 4BRPA 3ENOA 1GLEG 5ELZA 1GLDG 4DB3A 1BDGA 4A61A 3O4WA 2BTFA 3A5LC 3GL1A 1X9JA 2A5XA 3O08A 5BPLA 4BRHA 2IIRA 1NWKA 3ZETA 1GLBG 2V7ZA 2ZGYA 1QZ6A 4AM7A 1TUUA 3U8XA 3EZWA 2A40A 3UKUA 5FPNA 3ZX2A 4RWTA 4B1VA 3MN9A 2HF4A 3AAQA 1DGKN 4CBUA 3JXUA 1Z05A 4BQLA 1NM1A 2UYTA 1NGCA 3DXKB 3O1WA 2Q0UA 4F9OA 2ZWHA 2VYPA 3R9PA 2P9SB 5EVZA 2Q1NA 3VEXA 4GNIA 2V52B 2E1ZA 4NB4A 3CHWA 3OHRA 1NGIA 5AQJA 3LM9A 4BQZA 1NBWA 1QHAA 3A8YA 3FLCO 1HX1A 3BP8A 3ID8A 2E2OA 3A5OC 1NLVA 1ZC6A 4BR9A 3EKUA 3M3ZA 3H3OB 3CJCA 1OKJA 4ISGA 4CZHA 2NLXA 2VWBA 3H1QA 3IUCA 2CGJA 4BC3A 5ADXA 3UKRB 2BUPA 1KAXA 1ZBSA 3GOIA 4FWKA 4M7XA 2P9UB 3VERA 3FZFA 5EY4A 3S41A 3CQYA 3O8MA 4IJNA 1T6DA 2W41A 3CERA 3LDQA 5EX5A 3D2EA 3BF1A 5BRDA 2YHYA 3FFKB 1KAYA 2QWQA 3G25A 2CGLA 4BRQA 4BRGA 2P9UA 3MK6A 3D2EB 2NRHA 4I6MA 4K43A 4XH5A 4JD2B 2A41A 5BN8A 1WOQA 4PKIA 4QS7A 2QWLA 2A6AA 3VGLA 4L3QA 2KHOA 5JLHA 4RTFD 3AAPA 5AFUH 1TYQA 1X3NA 5E26A 4BG9A 3QFPA 2FF3B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EKEA 3VESA 1TAQA 4FWMA 1XHZA 4CECA 3ISNC 4Y0WA 1CZAN 4YDUA 3G0ZA 4O8KA 3KKSA 2F96A 1VQ7N 4Z0UA 4KTZA 1T44A 4CHZA 3VEYA 4FJ7A 4FOEA 3VEWA 2E8AA 4H5RA 5HL7L 3E66A 1NOYA 1IKYA 1GLAG 4WQ5A 2BANA 4DV5K 5AZIB 1Z6RA 2QWRA 1A5WA 4AH9A 4BC5A 3DWLA 2VCPA 1GOCA 2IVPA 1RDWX 4M3UA 4E1NA 4KREA 3CI5A 4FWOA 4OGEA 3I56N 4H0PA 2GWKA 2G8KA 3G71N 3ENHA 5CHIA 3KTQA 3WNEA 3VQ9A 5AQLA 5CYMA 3OY9A 4ID5A 2ASPA 3I33A 4BR7A 5J1EA 1HNVA 1ZBUA 5GIOA 3WNHA 1H1VA 1QQNA 4AILC 3J8AA 1RBSA 3KVGA 3ALYA 5KGWA 3CC7N 4FJLA 1YIJN 3OYCA 2GEMA 4AHUA 1L3UA 4FWQA 3F73A 1HRHA 1NJXA 3P39A 2AA4A 3EE8A 4X65K 1YXQA 1TAUA 1N6QA 2O8EB 4CERA 3U9DA 3R6MA 1WAFA 4CBWA 2NRWA 3MEEA 4UQGA 1KVCA 3T1AA 3F5TA 2YJFA 4CJ4A 4CJ3A 3KKRA 4BR2A 3OJUA 4B9SA 2E2QA 2IVOA 4YOXA 3NAEA 1M1KO 2FSJA 4M45A 1YT3A 3ZSQA 4KHWA 4CJ5A 2HVIA 5EXWA 3DLKA 3SK3A 5ADXH 3CF5L 4DR2K 3PY8A 4JS4A 1NK9A 4CHOA 1B9FA 3SQ0A 5FPDA 4AHSA 4CIGA 4CJVA 3I8DA 3CFPA 3RTVA 4YDUC 3L6QA 3D0PA 5AQGA 4IEIA 3WQTA 4PWDA 3WEEB 5JS1A 4CIEA 4BG8A 2HBLA 3EE9A 1FJGK 4LD0A 3OS2A 1BL3A 3B8AX 1S3XA 2XO7A 4OKEA 3EZ5A 4M3TA 4WQ4C 2OANA 3HM8A 3HM9A 1BA0A 4LF4K 1RDCA 3OYIA 1JL1A 3DLGA 4I9QA 3T1YK 1C1CA 4U67L 5I42A 3VPZA 4H8KA 1C1BA 4HUFA 1UA1A 1XQSC 4A59A 5AQOA 1J53A 3JS6A 1IKWA 3O9TA 4GVEA 1LCUA 3OBYA 1HNWK 4JKBA 2ASOA 2GV9A 1HR0K 3A0IX 1HKBA 3DAWA 3M8SA 2EX3A 1FKPA 4NXNK 4G9ZA 1YUWA 3AVNA 4JS5A 4DF4A 1SL0A 4DV4K 3NCIA 3NVKA 1W9HA 4BRKA 3ID6A 2UXCK 1XMOK 5GINA 4DF8A 3TSPA 3CCJN 2YNHA 3TAPA 2ZGZA 4FPBA 2QM1A 4K42A 3SI6A 5KRSA 3QDKA 4I9LA 5CR4A 2GELA 4X64K 4OVLA 4CEZA 3PLAA 4JK8A 4JLHA 2UU9K 2XY7A 2O8CB 4DV7K 5E41A 3AA5X 4B9NA 5F2RA 3C7NA 3ULEA 3VGMA 2BGGA 1FKOA 3OYMA 4FJIA 2HW3A 3C95A 1BISA 1MWKA 2P9SA 1U4BA 2OTJN 2YHWA 3LL3A 2ETJA 2JLEA 3CCLN 2RHKA 3VEVA 4JV5K 3DLHA 5JLFA 4XH1A 1P8ZA 5KQDA 2D0AA 1I94K 1QSLA 4FO0A 4GMJB 3SQ2A 1G15A 1IBMK 3OYBA 4QS9A 4YOWA 3HXMA 3OW2M 4M3YA 2A3ZA 1D9FA 3CYMA 3RSEA 4HCBA 4PL7A 1XNRK 1VSJA 4LSLA 4IZ9A 5JS2A 2FXUA 2HHHK 1KQSM 3QB0A 3K5LA 4H5WA 4J2AA 3I0SA 1IO2A 3O3GA 4DTPA 1ZBFA 4DQ8A 4NCBA 3CG7A 1HMVA 5FDLA 1NGHA 3H6EA 3QEWA 1VQPN 2WUSA 2QA4N 2NRXA 4BWJA 4CK1A 2GUPA 5K14A 2P5GA 5KI6A 2O4GA 4FZZA 3KLEA 5BR8K 3IMXA 3P5JA 4CEDA 4YHHK 5AZJA 2QWNA 4JHDB 2WFBA 4BRMA 3Q7CA 4KTQA 1RTIA 1C1AA 2DY4A 4ID1A 2PFUA 1QQOA 5E84A 5AQIA 3VENA 1KTQA 3NGYA 1N36K 4LF6K 4N76A 2HBJA 3M6GA 1RGIA 4JI7K 4FJHA 3V4IA 4LFAK 4DR4K 4AF1A 4MQ3A 3K58A 4B3RK 3SBGA 2D0OA 1LWEA 4B9MA 2NRZA 3VQ6A 3THWA 3NE6A 2IAJA 1W97L 1S9EA 2P9IB 2OZSA 4GV6A 2O8FB 2D0CA 1NK8A 4DTUA 1BU6O 3ZEUB 3FGUA 4DFPA 2OCEA 4CJKA 1HPMA 3TABA 5C25A 4KKOA 3OYGA 1L3VA 3I8BA 4OJRA 2UXDK 4FJMA 2HHTA 3AVFA 2Z1GA 5I9EB 3LM2A 5HRRA 3E9PA 3OYJA 2UUCK 4FM2A 3O80A 1MWMA 2NZTA 3IFRA 3HK2A 5DK5A 2A42A 1SQKA 2NRTA 4WQ5C 3LP2A 1EXQA 1N34K 4G1QA 3R1XA 3AVLA 1V4TA 4RCHA 4IDHA 4BRPA 3SPZA 1GLEG 2B6AA 3OBWA 4O55A 4DB3A 1L3SA 3CD6N 1VQLN 1YJ9N 1NU0A 5JVHL 2HHQA 3HSTB 3GL1A 4WCEL 3TAGA 4HVJA 4BRHA 1ZBHA 1VSIA 3TSQA 3PIOL 1GLBG 4DFKA 2F7TA 4DQSA 4JI1K 4BE0A 5FPNA 3ZX2A 1YVUA 3AO2A 3MN9A 3MXIA 4AHVA 3OS1A 2WTUA 1DGKN 1Z05A 3DLLL 3L2RA 1NGCA 4KI6A 1C0UA 5HRSA 4B9TA 3R9PA 2P9SB 4CJTA 5EVZA 2Q1NA 4GNIA 3AO3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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