3F9MA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose and activator showing a mobile flap
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
455
structure length
451
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 186
structure length 451
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2008-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3f9mA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3f9mA01
2CH5A 5BPNA 3QFUA 4L3QA 4BR0A 3A5LC 1U2VA 3HZ6A 2HOEA 4FPBA 1HLUA 1BA1A 4BRMA 3EO3A 5AQJA 2ASMA 1NWKA 3CQYA 3VPZA 4BRLA 5AZIB 1RFQA 2D0OA 2F9TA 3WUHA 3KVGA 3UKRA 4H5WA 3UE5A 1HPMA 5AQSA 3FR0A 1SAZA 1NBWA 3CJ9A 1GLLO 4NB4A 4JHDA 1MWKA 1BA0A 4BC5A 4O5FA 3HSCA 4A2BA 3MDQA 3ATVA 5F1XA 3D2EB 5AFUH 2J4RA 2CGKA 3AY9A 3QMLA 3I8BA 1NGCA 2Q36A 5AQVA 3VF4A 1ZBSA 4YDUA 2AP1A 5BPMA 2V7YA 3H1VX 1GLCG 4PKIA 5AQIA 1XUPO 3LM2A 3U8XA 3CERA 2HF3A 3VEYA 2V51B 4BRHA 3ID8A 3S41A 5FPMA 3M3ZA 1P8ZA 3OHRA 1NLVA 3VGKA 3CHWA 1NGJA 4Y0WA 5AQGA 3DXMA 3BP8A 3HI0A 4K43A 1OKJA 4FPAA 1U2VB 3WEEA 3J8AA 4I6MA 1HKGA 4A61A 4B1WB 1HX1A 4FWMA 2IIRA 1LCUA 3L6QA 3H1QA 2Q2RA 2HMPA 3I33A 3DAWA 2GEMA 1SZ2A 3DJCA 2ZGYA 3CJAA 2UYTA 3UKRB 5AQNA 3VEXA 5KQDA 4DCHA 1XC3A 3IDHA 1H1VA 1HUXA 4ISFA 4BGBA 4JHDB 2QWRA 3H6EA 1GLEG 4FWNA 3UB5A 3H3OB 1QQMA 5B8HA 4IJAA 2E20A 3VESA 1YXQA 3BEXA 5AQUA 4KBOA 2ZWHA 1QQNA 2P9LA 2HF4A 3U4LA 4B1UB 4GNIA 4CJ7A 1LOTB 3CIPA 3VENA 1TYQA 3WXLA 4H5RA 1C0FA 3RSEB 2D0PA 5EX5A 3VEOA 4QS9A 2YCHA 1E4FT 1NGHA 4BC2A 4H0XB 4F9OA 2FLOA 3ZETA 3QICA 3U9ZA 3VERA 2VYPA 5BRDA 3DXMB 2NRHA 3VGLA 3EKUA 2IVPA 3LL3A 3WEEB 4I6MB 2E88A 4K41A 1HKBA 3A8YA 3D2EA 4JNEA 4CZHA 4EHTA 4XH4A 3IUCA 1WUAA 5LJWA 1WOQA 3LDPA 5BN9A 1NGGA 5ADXA 4H03B 3VF2A 4H0VB 4NO7A 3DXKA 3AARA 3D7EO 4HTLA 2IVOA 1JCGA 4DHYA 1ESVA 5JMVA 4QS7A 4BROA 1QZ6A 4BVOA 2GELA 1KXPA 3O5BA 4CZKA 2H3GX 3WXKA 3MN9A 4BR2A 5AQLA 2I7PA 5KPRA 3FE1A 1YVNA 2NZTA 5AQXA 1V4TA 1TUUA 3HTVA 3MN7A 2QWLA 4FWPA 2P9LB 3FZLA 4EFHA 4B9QA 2ZGZA 4JD2B 4CBXA 1TYQB 1IG8A 1C0GA 4M7YA 1QZ5A 4BG8A 4RTFD 4BR4A 3VOVA 3ZETB 1G99A 5JLFA 1NGDA 2E1ZA 5AQMA 4BRIA 4IWVA 4RCHA 3MN6A 2P9NA 3C0BA 2A5XA 1GLJO 5AR0A 3QBXA 3M6GA 4DQ8A 3QBWA 4XEIA 3ULEA 4BC3A 4H5NA 4BRQA 3ENHA 1JCEA 3WQUA 2IVNA 2W41A 3H46O 3SK3A 1TUYA 4Z94A 1HKCA 5BR9A 1MWMA 3DXKB 2QW9A 4FWOA 3O1BA 3HBTA 3RSEA 3SMSA 5AQPA 4BR5A 3CJBA 1T6CA 5EY4A 1YAGA 4FWSA 2FSKA 4FWKA 3A5MC 4PL8A 1GLFO 4FL9A 4CZFA 3H45C 3LM9A 4CD1A 1T44A 3JXUA 3O4WA 3ZX0A 5AQYA 3O1WA 1X3NA 1Z6RA 4ISEA 1RGIA 1NGAA 4O8KA 2QM1A 4BR7A 2VCPA 4HWIA 4A2AA 4BRKA 3WT0A 3JS6A 2P9NB 4BRGA 4CBUA 1E4GT 3D2FB 5EOYA 4FOEA 2E8AA 2QWPA 3U9DA 3BUZB 4BRAA 3EL2A 4PL7A 5AQOA 3ULEB 3C7NA 2E2QA 4FWQA 3FLCO 5I9EB 1BU6O 4YDUC 1GLAG 2FF3B 4JD2A 3W0LA 1GLDG 5AQTA 3SLCA 4WYBA 2QWOA 3TU5A 2BUPA 4E1JA 2FSJA 4M7XA 5AQKA 4JAXA 5AZJA 1MDUB 4C23A 4BQLA 4GY2B 4MO4A 4XH1A 3F9MA 2YI1A 4BRDA 4CZLA 4JN4A 4AM6A 3O08A 4CZEA 3ENOA 4LC9B 3BF1A 2NLXA 3M1FA 3W3DA 1SQKA 3FZFA 3UKUA 5F0XA 4RWTA 5FPNA 1JCFA 3EKSA 3LDLA 1J6ZA 2A41A 3P4IA 2P9PA 4DB3A 2E1YA 1Y64A 2A3ZA 4PKGA 4K25A 4IJNA 1ATNA 4CBWA 3CETA 3CJCA 3O6WA 3CI5A 1DKGD 4QS8A 3LDOA 3GG4A 3AAQA 3C7NB 3ZX2A 3HM8A 3L0QA 3IFRA 3GDQA 3ZEUB 5FPDA 1V4SA 2Q0RA 3MCPA 4WQ4C 1R59O 5AFUA 4H5VA 1XQSC 4BQZA 4FWRA 2V52B 1BDGA 1KAYA 5AZJB 2QXLA 3FZKA 2D4WA 4CZMA 5BREA 4CI6A 5AQRA 5EXWA 3WQTA 4A62A 1BUPA 1ZXOA 2PBDA 3VF6A 5BRFA 3WXIA 3R9PA 1MA9B 2A6AA 4H5TA 5E84A 5F2RA 1NMDA 3O8MA 3QB0A 4CD3A 3D2FA 1BWFO 4BRPA 5BPLA 1NGIA 2KHOA 3LDQA 4BRFA 3A5NC 4WQ5C 3VEWA 1X3MA 2I7NA 5LJVA 1KAZA 5ADXH 5KPTA 4MLHA 3UKUB 2YJEA 3VETA 2YJFA 1BO5O 4BREA 2ASOA 2CGJA 2P9PB 3B8AX 3KZBA 2CH6A 1NGBA 3H3NO 4BGAA 1NGEA 1GLBG 3G25A 3O80A 2YHYA 2F9WA 4CZIA 1ATRA 2Q0UA 2P9KA 4J8FA 1Z05A 4FSVA 1U6ZA 2GWKA 3CJ1A 4MLEA 2YHXA 3EN9A 2P9UA 2PAVA 5JLHA 5EVZA 3LDNA 2Q31A 5JICA 2E2OA 3L4IA 1CZAN 2BTFA 1D4XA 2A42A 3FZMA 2WUSA 3KHYA 3VEZA 2P9IA 4EHUA 2W40A 5AQHA 4AM7A 3MMVA 5FPEA 2QWMA 3MN5A 5AQZA 1K8KA 2E2PA 4ISGA 4H0OA 1Q18A 4H0TB 3A0IX 3GE1A 1T6DA 2YHWA 2QWQA 4IZ9A 4CZJA 4EAHD 4B1VA 4BVPA 3ZEUA 4BR9A 3VEVA 2GTDA 4BRCA 1DEJA 2Q1NA 3VGMA 1KAXA 3R6MA 1YUWA 2ITMA 4B1YB 3CJ7A 5KQ8A 1ZC6A 2P9SA 2AA4A 3GL1A 5AQFA 3ATUA 3DWLA 2GWJA 4IO8A 4EIAA 2FXUA 3TPQA 1RDWX 2P9KB 3EZWA 5KPZA 3FFKB 3SMPA 4CZGA 2P9UB 4WQ4A 5CE3A 2GUPA 5BRHA 3QFPA 1ATSA 5AQWA 2V7ZA 3R8EA 2FF6A 2P9IB 2D1KA 1DGKN 4IXCA 5AQQA 5AZIA 3FZHA 4M63C 3MK6A 4FO0A 2Q97A 3IMXA 2ZF5O 3ZX3A 4XH5A 5LY3A 1K8KB 1QQOA 1NGFA 1X9JA 2A40A 3AAPA 4MO5A 5BN8A 2EWSA 4FWLA 1S22A 4FOIA 4H0PA 1QHAA 4WQ5A 1BOTO 2QWNA 5E26A 4B1XB 1BG3A 1HJOA 2VWBA 4H0YB 3GOIA 4K42A 5ELZA 1NM1A 2FSNA 2DPNA 4PKHA 3FGUA 3WXJA 2OANA 3CQXA 3A5OC 3QDKA 4B1ZA 2P9SB 3SJHA 1EQYA 2E2NA 2CGLA 4BC4A 1IJJA 3BF3A 4BRNA 1S3XA 2ASPA 5TKYA 4BG9A 3GBTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4L3QA 3OVNA 4FJ9A 4M3RA 4WFBL 4CJRA 1VQPN 3ULDA 1A5XA 1HLUA 1BA1A 3DRRA 2HVHA 5AQJA 2IOCA 4PA1A 4O4GA 3TAGA 4YOUA 1RFQA 2YHBA 3KK7A 1T8EA 2F9TA 3WUHA 3KVGA 5AQSA 2UUAK 2EHGA 2NRXA 3FR0A 1OH6A 3E01A 3OW2M 4BC5A 4A2BA 2HNZA 5F1XA 1VQON 4JKGB 3O3GA 1YI2N 4GKKK 1NGCA 1ZBSA 4YDUA 4B3MK 5BPMA 4HCCA 2OPPA 5KRSA 1C0UA 4CW7B 5I3UA 2HF3A 3VEYA 1TKTA 2V51B 1N6QA 3ZT2A 3ALYA 4CJ4A 3HL8A 3OHRA 4CFDA 1NLVA 2KLAA 3WNHA 5CY4A 4CIGA 2OTJN 4Z4IA 3BP8A 3HI0A 3C6UA 4K43A 3KLHA 1VSIA 3WNEA 5J2PA 3WEEA 3ZSVA 4KTWA 3F5TA 3PY8A 4NXMK 4JI7K 1HKGA 3WNFA 1OH8A 5FRMA 4FJ7A 3JSMA 1SL0A 2HMPA 1O1WA 2HNDA 2UYTA 4DSEA 1RTDA 3QNOA 3QEXA 3LALA 1WSGA 2QWRA 1ZBIA 4LH4A 1UAXA 1KSPA 5J2QA 1QQMA 4JEPA 2A1RA 1XHXA 2E20A 1EKEA 1LW2A 4CHNA 2Z1IA 4KBOA 3AVKA 1WSIA 4B1UB 3U4LA 4IO9L 4CJ7A 1LOTB 3VENA 3AO4A 3NF9A 2D0PA 1KRPA 1KD1O 4QS9A 2QTDA 2YCHA 4AHUA 1E4FT 4QCLA 4C1NI 4F9OA 1VSJA 2RE2A 3CMAN 3VERA 3EKUA 3SNNA 2YHAA 4M3XA 3WEEB 1ASWA 4HCBA 4FVUA 4K41A 3CMEN 1HKBA 3S3OA 1J53A 4GVMA 3D2EA 1NK7A 3AA2A 2G8VA 1TKXA 3C6HA 3O9TA 3THYA 3IUCA 1NOZA 1WUAA 1Z26A 1L5UA 4FCYA 1N34K 2HSTA 1WAJA 4NO7A 3DLHA 3SQ0A 3DXKA 1W2BM 3LZJA 2IVOA 1ESVA 4CE9A 2UUCK 1ASVA 4CZKA 3SI6A 3WXKA 1N36K 2NZTA 4ELUA 3K5NA 5AQXA 1TUUA 3HTVA 3MN7A 4B8AB 2VQEK 4B9QA 4JD2B 4CBXA 1JJ2M 1BQNA 1NK8A 4KHYA 2G8IA 4M7YA 3HOSA 4W5OA 4RTFD 4BE1A 3VOVA 3OS0A 2E1ZA 3PIPL 1LWFA 4DQQA 3NVKA 1SKRA 4IWVA 3MN6A 2P9NA 5AR0A 4A57A 4RW6A 4CJKA 2RPIA 3J7YP 3K9JA 1NG9A 3ENHA 3THYB 3WQUA 3DMJA 2P51A 4DSLA 1HKCA 4J2DA 3DXKB 4FWOA 5M1OA 3BZKA 3O9SA 3I0SA 3CJBA 1Y97A 3OYAA 1NKCA 1UWBA 1YAGA 3CFRA 1HNZK 2D0BA 3DOKA 5LMNK 3A5MC 1LWEA 4CZFA 2P1JA 1HNWK 3E66A 1S1WA 3O4WA 5AQYA 1X3NA 3THWB 1VSHA 4BR7A 1IO2A 1FW6A 4Z4GA 4BRKA 4JKEA 2P9NB 1C1CA 1VSDA 3D2FB 4FOEA 1ITGA 3RVCA 1QVGM 4I2PA 5JS2A 5MLCQ 2B5JA 3AVHA 4LF9K 1IG9A 1HNVA 3AO3A 2GV9A 1XMOK 4YDUC 3NFAA 2FF3B 5AQTA 4WYBA 2X6NA 3TU5A 2FSJA 4JI2K 4OKEA 3OYGA 4JAXA 5AZJA 2O8FB 3J81O 1MDUB 4WF9L 1FJGK 3V4IA 2HNYA 1B9DA 4XH1A 4FM0A 4FK4A 4CZLA 1T7PA 2OZMA 3BF1A 4J2EA 3K5OA 1WB9A 2E5LK 3OBWA 5IT9O 2KW4A 1JCFA 3NAEA 1RILA 1J6ZA 2A41A 3O3HA 4KREA 1WSHA 4CGDA 2OZSA 3DM2A 1VQKN 1NJIO 4PKGA 1N5YA 3OJSA 1VK0A 4CGJA 4DU3A 1YJ9N 3QO9A 1J9AA 3K58A 3OYLA 3L0QA 1HQEA 3IFRA 4CJPA 3GDQA 3ZEUB 4IDKA 1R59O 4H5VA 2KFZA 4BQZA 3SPZA 4XIUA 3VQEA 1HNXK 3Q7CA 1BCOA 4IG0A 1KAYA 3I56N 5AZJB 3HP6A 3AVFA 2D4WA 5BREA 4CI6A 5EXWA 4A62A 1ZBFA 2ZD1A 4AHRA 1RBVA 3M8PA 1OVQA 3KIOA 3PO5A 4JKFA 3R9PA 1MA9B 5E84A 1NMDA 3O8MA 3QB0A 4CD3A 3KK2A 1M1KO 2KHOA 4BRFA 3VEWA 4WQ5C 4CIFA 1KAZA 3V6DA 2VG6A 3TTDA 3S3NA 3SZ2A 3NMUA 3S9HA 1X9SA 2YJFA 4EZ6A 1QQCA 2FBYA 3B8AX 3OS1A 3KZBA 4CF9A 3H3NO 1J5OA 3G25A 4R5PA 1OH5A 2F9WA 1ATRA 4IG3A 1Z05A 2GWKA 3AVIA 1KFDA 3OYKA 2VG5A 3ZCMA 3AGRA 4OPAA 1VQMN 2BGGA 4DF8A 1CZAN 3IRXA 4EHUA 3VEZA 3ZLJA 2P9IA 2HHXA 4JKDA 4W5RA 5FPEA 3MN5A 1K8KA 2E2PA 2DY4A 2AJQA 3GE1A 1VSFA 2QWQA 4EAHD 2HBMA 3ZT0A 1RDCA 3AVGA 3ZSRA 2RF2A 3HJFA 3VEVA 1VHXA 1WSJA 2Y1IA 4PY5A 3HVRA 3R6MA 4IKFA 4B1YB 4CEOA 2KZZA 2KKZA 3VQCA 1IBLK 2AA4A 3THVA 4IFYA 3ATUA 5T7BA 1JXEA 2VGMA 4EIAA 3O3FA 4DV3K 3BZCA 5A2QO 3VMFB 3ITHA 4AHTA 5M1QA 3EZWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4AHS A;  1XMQ K;  2Q31 A;  3TI0 A;  1IBK K;  2E2O A;  4DV7 K;  1YIT N;  4JKA A;  5CZ1 A;  2BTF A;  1D4X A;  2A42 A;  2NRZ A;  3T19 A;  2ZM6 K;  2W40 A;  5AQH A;  4AM7 A;  4EP5 A;  4DKW A;  4ISG A;  1X9M A;  3SBT A;  3NVM A;  1VSK A;  1S5J A;  3HP9 A;  4IZ9 A;  1N32 K;  4CJS A;  2QKK A;  3I55 N;  3TAE A;  1KLM A;  5CYM A;  4BR9 A;  2GTD A;  1SV5 A;  2G8H A;  4DTX A;  1DEJ A;  3OTO K;  3ZSY A;  4ZHR A;  1JXB A;  2R7Y A;  3CJ7 A;  4DQP A;  4FLZ A;  3GL1 A;  1L3S A;  4UY8 O;  1UA1 A;  2HB5 A;  4IO8 A;  1VQ4 N;  2IDO A;  3LZI A;  1QSS A;  1VQN N;  3NGI A;  3K5M A;  5CE3 A;  4WE1 A;  1TGO A;  3J80 O;  4O44 A;  2D1K A;  5AQQ A;  1U04 A;  1TK8 A;  3IMX A;  3ZX3 A;  3HXM A;  3SCX A;  4MO5 A;  5C42 A;  4FWL A;  3CCJ N;  1BCM A;  2QWN A;  4B1X B;  1F21 A;  4JKG A;  3T1Y K;  3CFP A;  3D0P A;  3CQX A;  4CJW A;  4BC4 A;  1S1X A;  4WFN L;  4LFC K;  1S3X A;  2KQ2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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