The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
186
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sequence length |
455
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structure length |
451
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Chain Sequence |
b'ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Glucokinase
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb |
| total genus |
186
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| structure length |
451
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| sequence length |
455
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| ec nomenclature |
ec
2.7.1.2: Glucokinase. |
| pdb deposition date | 2008-11-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00349 | Hexokinase_1 | Hexokinase |
| A | PF03727 | Hexokinase_2 | Hexokinase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Hexokinase; domain 1 | Hexokinase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4PKH A; 3WEE B; 3ZET A; 4ISE A; 2IVP A; 4H0P A; 4RWT A; 2OAN A; 3R8E A; 4YDU C; 1GLE G; 3VEN A; 3WXK A; 4B9Q A; 2ZGY A; 5KPR A; 1NGA A; 1ZBS A; 1S22 A; 4CZF A; 5AQR A; 4B1W B; 3FZK A; 4JHD B; 3M6G A; 3WQT A; 3A5O C; 2YJE A; 2Q31 A; 4Y0W A; 2A6A A; 3CIP A; 4H0Y B; 1SQK A; 2YHW A; 2ZWH A; 3J8A A; 3EKS A; 3U8X A; 3VET A; 1Y64 A; 5BRH A; 3D2E B; 1V4T A; 4H0O A; 2QWN A; 5AQP A; 1X3M A; 3A8Y A; 5F1X A; 1U2V A; 1TUY A; 3FE1 A; 4MLE A; 1MWK A; 3QFU A; 4FPB A; 3F9M A; 4MO5 A; 3VEY A; 3M1F A; 1ZXO A; 1KAX A; 1KAY A; 3TPQ A; 1NGB A; 3CJB A; 4J8F A; 5BRD A; 1C0F A; 3ULE A; 3GOI A; 3ENO A; 3UKR A; 4BG8 A; 1H1V A; 3DJC A; 3U9Z A; 3WXL A; 4DQ8 A; 4WQ5 C; 3MN6 A; 4B1X B; 5JLH A; 2P9K B; 3FZL A; 4FWN A; 3O8M A; 1QQO A; 3D2F B; 4M7X A; 1BA0 A; 3ZEU A; 4JAX A; 4K43 A; 2QXL A; 3VEO A; 3FFK B; 4BRO A; 4BC4 A; 5KQD A; 3O6W A; 5AQJ A; 1IJJ A; 4I6M A; 1NGH A; 2CGK A; 1BA1 A; 3H3N O; 5FPD A; 5AZI A; 5LY3 A; 2E2O A; 2P9P A; 3MDQ A; 1RDW X; 5AQI A; 2QWL A; 2A42 A; 1BOT O; 2P9I B; 4NO7 A; 3VPZ A; 5JLF A; 4QS7 A; 5ADX A; 2Q97 A; 4FPA A; 3I8B A; 1NGE A; 4JNE A; 3C0B A; 1NGF A; 3EZW A; 1NGI A; 3QML A; 3VEW A; 4BGB A; 4H5R A; 5AQX A; 3MMV A; 5AQZ A; 4QS9 A; 5AZI B; 2YHX A; 4RTF D; 1WOQ A; 5ELZ A; 3WEE A; 3ZET B; 5BPN A; 3DWL A; 2D0O A; 2P9K A; 3VF2 A; 2I7N A; 2J4R A; 3O4W A; 2Q2R A; 2NZT A; 3LDP A; 4FOI A; 2CH5 A; 2IVO A; 4WYB A; 5FPN A; 3KVG A; 3VES A; 5BPM A; 4O5F A; 3UE5 A; 5KPT A; 3CJ9 A; 2I7P A; 4M63 C; 4BRE A; 2Q1N A; 1GLL O; 4BRH A; 1QQN A; 1XC3 A; 4IO8 A; 1X9J A; 2E2N A; 1X3N A; 1GLA G; 5AQQ A; 5AQG A; 4CZK A; 2E2Q A; 2QWQ A; 5FPM A; 3WT0 A; 5JMV A; 2CGJ A; 1TYQ A; 4BRL A; 3CJC A; 2PAV A; 4H5T A; 2QWO A; 2A41 A; 4B1V A; 2ASM A; 5KPZ A; 3GG4 A; 4K41 A; 4JD2 B; 3VGM A; 2HF4 A; 5AFU H; 2D1K A; 4FL9 A; 3ZX2 A; 4BR5 A; 2W41 A; 2KHO A; 3EN9 A; 4H0V B; 3EO3 A; 2GTD A; 1BDG A; 4BG9 A; 3QBX A; 3UB5 A; 3CQX A; 3BF1 A; 4Z94 A; 1XUP O; 4H5W A; 1JCE A; 3OHR A; 4DB3 A; 2Q0R A; 4LC9 B; 4KBO A; 2YCH A; 3ATV A; 4NB4 A; 1HUX A; 3QFP A; 1NMD A; 3MCP A; 1NWK A; 3L6Q A; 1NGC A; 4FWK A; 4A2A A; 2A3Z A; 4WQ4 A; 3LDN A; 2BTF A; 3A5L C; 3U9D A; 5AQO A; 3H46 O; 2VCP A; 3AAQ A; 3CJ1 A; 5I9E B; 1GLJ O; 2FLO A; 3O80 A; 4FWL A; 4H03 B; 4EIA A; 4MO4 A; 2IVN A; 1QHA A; 3HZ6 A; 1BG3 A; 4AM7 A; 2V52 B; 3FR0 A; 3KHY A; 3MN5 A; 4FWR A; 4BC2 A; 3EL2 A; 4FOE A; 4IJA A; 4FWS A; 4F9O A; 5AQK A; 1SZ2 A; 3VEV A; 3W0L A; 4RCH A; 3IFR A; 1HKG A; 4H0T B; 4M7Y A; 4H5N A; 2CGL A; 3IDH A; 5B8H A; 5LJW A; 1E4F T; 2GWK A; 5AQH A; 1YVN A; 3QIC A; 4FSV A; 3P4I A; 2P9N A; 3R9P A; 1SAZ A; 2E20 A; 5EOY A; 5BPL A; 1CZA N; 1Z05 A; 3B8A X; 3WXJ A; 2EWS A; 2P9U A; 4JN4 A; 4XEI A; 4HWI A; 1QZ6 A; 3FZF A; 2HF3 A; 3RSE B; 3ENH A; 1Z6R A; 1BO5 O; 5AQF A; 3AY9 A; 4BVO A; 3ID8 A; 2GUP A; 3QBW A; 4H5V A; 3ZEU B; 1ATN A; 1DGK N; 3MN7 A; 4BRK A; 2V7Z A; 5F2R A; 5EX5 A; 2FSJ A; 3CER A; 2ITM A; 4BRQ A; 4I6M B; 4BRD A; 1K8K B; 4EHU A; 1MWM A; 2WUS A; 2YHY A; 3EKU A; 3BP8 A; 4FWP A; 3H3O B; 5AZJ B; 4BRN A; 2FSN A; 1OKJ A; 4FWM A; 4BRI A; 3VEX A; 4BGA A; 4IJN A; 2F9W A; 1QQM A; 3CHW A; 4EHT A; 5KQ8 A; 5AQU A; 4DHY A; 1JCF A; 5AQY A; 1GLC G; 1HPM A; 5FPE A; 2E88 A; 3UKU A; 3H45 C; 3GE1 A; 3BF3 A; 3JS6 A; 2V7Y A; 4L3Q A; 4BQL A; 4BR4 A; 5AFU A; 3IMX A; 4O8K A; 2DPN A; 5BN8 A; 4IZ9 A; 4A2B A; 3R6M A; 4BRA A; 2HOE A; 2AP1 A; 2P9L B; 2QW9 A; 2V51 B; 1LCU A; 4JD2 A; 5EVZ A; 1GLB G; 4CZG A; 4FO0 A; 2F9T A; 1U6Z A; 3A5N C; 3CQY A; 2P9P B; 3A5M C; 4CZE A; 3LDO A; 1XQS C; 3BUZ B; 1GLD G; 4BR7 A; 1V4S A; 2P9I A; 1DEJ A; 1T6C A; 4BR0 A; 3HBT A; 1HJO A; 1S3X A; 2D0P A; 4K25 A; 3CJA A; 3TU5 A; 4A61 A; 3GBT A; 1KXP A; 4EAH D; 1ESV A; 1QZ5 A; 4B1Z A; 4HTL A; 4MLH A; 3KZB A; 1TYQ B; 3VER A; 3MK6 A; 3QB0 A; 1C0G A; 2E8A A; 2ZF5 O; 2BUP A; 1BWF O; 2GEL A; 2P9S B; 3SMS A; 1HLU A; 1R59 O; 5AQT A; 2FF3 B; 4FWQ A; 3QDK A; 4BVP A; 5ADX H; 2NRH A; 4BRF A; 3O1W A; 1NGD A; 1JCG A; 1U2V B; 2QWM A; 4WQ5 A; 4BR9 A; 4BRC A; 2GWJ A; 3FGU A; 2A40 A; 3JXU A; 1ATS A; 4XH4 A; 1RGI A; 3HI0 A; 2ASP A; 4IWV A; 4JHD A; 2QM1 A; 3U4L A; 1T44 A; 4ISF A; 3SMP A; 3M3Z A; 5BRF A; 1P8Z A; 3G25 A; 4BRM A; 4XH1 A; 1NBW A; 4DCH A; 1ATR A; 3HM8 A; 3LM9 A; 1NLV A; 4C23 A; 3DXK B; 1KAZ A; 1HX1 A; 3FZM A; 4GNI A; 1D4X A; 2YJF A; 2GEM A; 1NM1 A; 1YXQ A; 4B1Y B; 5CE3 A; 3FLC O; 3GDQ A; 3CET A; 3ATU A; 4CZL A; 2D4W A; 4BRP A; 4CBX A; 4BRG A; 2A5X A; 5E84 A; 1LOT B; 2FXU A; 5LJV A; 5AQS A; 3ZX3 A; 3VGK A; 3DXM A; 3H1Q A; 5F0X A; 1YAG A; 1Q18 A; 3WQU A; 5AQL A; 4FWO A; 3WXI A; 4YDU A; 4QS8 A; 1EQY A; 3D2E A; 3LDL A; 4PKI A; 3AAP A; 2VYP A; 1T6D A; 4WQ4 C; 2E2P A; 3O08 A; 3DXM B; 1RFQ A; 4BQZ A; 2PBD A; 1DKG D; 3D7E O; 2E1Z A; 3H6E A; 5AR0 A; 4XH5 A; 3DXK A; 5AQN A; 3UKR B; 3LM2 A; 3CI5 A; 2QWP A; 5AQM A; 3S41 A; 2NLX A; 2QWR A; 4CJ7 A; 2H3G X; 3MN9 A; 1MA9 B; 3HTV A; 2P9N B; 1BU6 O; 2P9S A; 1K8K A; 5BR9 A; 4GY2 B; 3D2F A; 1IG8 A; 2W40 A; 5AZJ A; 2E1Y A; 2P9U B; 4CZH A; 3HSC A; 3LL3 A; 3O5B A; 1NGG A; 2AA4 A; 3RSE A; 3IUC A; 1HKB A; 3C7N A; 4PL7 A; 3BEX A; 3H1V X; 3O1B A; 4CZI A; 4H0X B; 5AQW A; 1MDU B; 1G99 A; 4K42 A; 2Q36 A; 4AM6 A; 3UKU B; 4ISG A; 2P9L A; 3I33 A; 4CD3 A; 3ZX0 A; 1YUW A; 1ZC6 A; 3A0I X; 3SLC A; 4BC3 A; 3W3D A; 4IXC A; 1WUA A; 2Q0U A; 5E26 A; 3CJ7 A; 1J6Z A; 4B1U B; 4CBU A; 4CBW A; 2YI1 A; 1HKC A; 3C7N B; 4PL8 A; 3WUH A; 5TKY A; 4A62 A; 5EY4 A; 3L4I A; 3SJH A; 5EXW A; 3VF4 A; 3VF6 A; 4CZJ A; 3VOV A; 4CZM A; 4EFH A; 3SK3 A; 1E4G T; 1TUU A; 2ASO A; 2FSK A; 5BRE A; 3DAW A; 1NGJ A; 2FF6 A; 4CD1 A; 2IIR A; 5BN9 A; 4BC5 A; 3VGL A; 5JIC A; 3L0Q A; 3LDQ A; 5AQV A; 3FZH A; 4CI6 A; 3ULE B; 2ZGZ A; 2VWB A; 1GLF O; 2CH6 A; 3AAR A; 3GL1 A; 1BUP A; 2UYT A; 4E1J A; 3VEZ A; 4PKG A; 4BR2 A; 2HMP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2YNF A; 4LF6 K; 1GOC A; 2Z1I A; 1S1X A; 2IVP A; 4CGG A; 4RWT A; 2OAN A; 3MAQ A; 3MEG A; 4GV6 A; 3KK3 A; 1NGA A; 1HQE A; 3RMA A; 1N6Q A; 3TAR A; 3SPZ A; 4R79 A; 3WQT A; 3A5O C; 2IS3 A; 4Y0W A; 1M90 O; 3CIP A; 4H0Y B; 3NGY A; 2ZWH A; 3EKS A; 4WFB L; 1EP4 A; 2NNW A; 1V4T A; 3QIN A; 1KSP A; 2HBL A; 1X3M A; 3A8Y A; 1TUY A; 4AHS A; 5I42 A; 4JK9 A; 4CJV A; 3NVK A; 3KLG A; 1XNR K; 1C0F A; 5C24 A; 3ENO A; 4FXD A; 5JS2 A; 4BG8 A; 1H1V A; 4LSN A; 1TVR A; 4DQ8 A; 4B1X B; 3F5T A; 5JLH A; 3MX2 A; 3FZL A; 3OS0 A; 4KV8 A; 4WCE L; 3HOS A; 1RTD A; 3NF9 A; 4RW6 A; 3BDP A; 4CHO A; 4JAX A; 4B3O A; 3VEO A; 4GMJ B; 5KQD A; 4KI4 A; 3PO5 A; 1VSI A; 1QVG M; 3TTC A; 4YOX A; 3AA3 A; 3TAB A; 2CGK A; 3OYB A; 1JLG A; 3DMJ A; 4B9U A; 1RDW X; 4FM1 A; 4B9V A; 4NCB A; 1IV0 A; 4NO7 A; 2D0A A; 3VPZ A; 1C0T A; 4QS7 A; 5JLF A; 1U48 A; 1NGE A; 3C0B A; 4BGB A; 3OYA A; 2NRR A; 1EX4 A; 2VQE K; 1WAF A; 3ITH A; 3TI0 A; 5AZI B; 1JL1 A; 3ZET B; 1RT2 A; 4OX9 K; 1RT1 A; 4KI6 A; 3O4W A; 2HVH A; 2NZT A; 2RKI A; 5H1S Q; 3KVG A; 2O8E A; 4DV0 K; 1RDA A; 3F9K A; 4BRE A; 2NRX A; 1VQ7 N; 1GLL O; 2OPQ A; 2Q3S A; 3VQ5 A; 3THW B; 1Z26 A; 1X3N A; 3LWM A; 3I55 N; 2OYQ A; 4F3T A; 4CZK A; 3OYC A; 4IOA L; 2CGJ A; 1VSJ A; 3VQ7 A; 4CIF A; 2PAV A; 2QWO A; 1I39 A; 2OPR A; 4B1V A; 3CFP A; 2P1J A; 4DTN A; 3KIO A; 3C94 A; 2GV9 A; 5AFU H; 4FL9 A; 1TL1 A; 2PZS A; 2KHO A; 4LY7 A; 1IKW A; 5DMR A; 5HRO A; 1TKT A; 4IFV A; 3DOK A; 3BF1 A; 4HUF A; 1X1P A; 4GV9 A; 1NOZ A; 3A2F A; 4DQS A; 1QE1 A; 4DQR A; 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5AFU A; 4CGF A; 4O8K A; 3UIQ A; 3OBY A; 3O4N A; 3R6M A; 3ENB A; 2P9L B; 3FFI A; 1L3T A; 5EVZ A; 4CJ3 A; 1GLB G; 4CZG A; 2O8E B; 3K5L A; 1U6Z A; 3A5N C; 3SYZ A; 4PA1 A; 2D0C A; 1V4S A; 1L3S A; 3ZSR A; 4E7J A; 4BE2 A; 1K73 O; 3WNG A; 1VHX A; 1HJO A; 1S3X A; 3CCV N; 4A59 A; 1QSS A; 2F4V K; 3AGK A; 2DTU A; 5FRM A; 4HCC A; 2BE2 A; 3LAN A; 2ZJP L; 3TU5 A; 4A61 A; 1NK5 A; 3GBT A; 1KXP A; 4EAH D; 3C6U A; 4WFN L; 2YKN A; 4OPK A; 3C65 A; 2BUP A; 1F21 A; 2O8B B; 3AA5 X; 2GEL A; 2P9S B; 1HLU A; 5AQT A; 3RTV A; 3V9Z A; 3PLA A; 3MEE A; 2NRH A; 3TAG A; 4A5B A; 3OVN A; 2B4J A; 4FW2 A; 3IS9 A; 1ATS A; 2YHA A; 1VQK N; 3HI0 A; 1VQL N; 4EZ6 A; 3G71 N; 1Q82 O; 2ASP A; 3AVB A; 2QM1 A; 4IFE A; 1T44 A; 4DR4 K; 1XMQ K; 4Z4F A; 4QAG A; 1S1W A; 1BGX T; 1P8Z A; 1VRT A; 4XH1 A; 1NBW A; 1YJW N; 4DU3 A; 3SUQ A; 2QKK A; 2YJF A; 4E7K A; 2NRT A; 5GIN A; 4CJP A; 5CE3 A; 3GDQ A; 4BAC A; 3CET A; 1JJ2 M; 4FJX A; 3O9U A; 4DFJ A; 2A5X A; 3O3F A; 4FVU A; 5LJV A; 5J2Q A; 4JKC A; 5J1E A; 3VGK A; 3D45 A; 3HPH A; 4CK2 A; 3ISN C; 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