3FASA

X-ray structure of iglur4 flip ligand-binding core (s1s2) in complex with (s)-glutamate at 1.40a resolution
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
GRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of agonist recognition by the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor 4
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 4
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 90
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fasA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fasA02
3HSTA 4ISUA 1IXCA 4U2RA 2P2AA 3E3KA 1M5BA 1I6QA 3C31A 4NF6A 3I3VA 1UTHA 2AIXA 2XXTA 1FQCA 5I2NA 2H9BA 1QVSA 4GLIA 4YZZA 3IB1A 4H1XA 2QS4A 1URDA 3G3IA 2REGA 3SEWA 4RNSA 1B1HA 3G3KA 1Y9UA 1Q1KA 2OWSA 4IO2A 3SEXA 4H8JA 3O6GA 4ZEDA 2Z8FA 2XXIA 2B3FA 4FE8A 3TMGA 3EQ1A 3H03A 3M3KA 3LR1A 5I59B 4MFIA 4OVJA 1SW4A 2W7YA 1QUKA 3PD9A 4ELOA 1P1OA 3KJ7A 3PPOA 3FVOA 2DWHA 4IB2A 4R6YA 4WEDA 1XT8A 4G4PA 4Z7EA 3N26A 2DXYA 3H6UA 1OIBA 4QSEA 3MUQA 3H6VA 1LFIA 1LLSA 4GVOA 4OYVA 3IO6A 4H5GA 5H8SA 4R9GA 4BDLA 1URSA 1Y4CA 5I57A 3UK4A 2O7UA 3IAZA 1O7TA 1A7LA 1JW4A 2V84A 1EU8A 1JW1A 1SI1A 1VFEA 2HFBA 3LSLA 2ZNSA 4G68C 3OO8A 5B7DA 3MZ1A 5TU0A 1OLCA 1JVXA 4IY6A 2D21A 4YB6A 3TAJA 4TLMB 4IO7A 3BBRA 1UIVA 3R7XA 3FATA 4KI0E 4N13A 3K6WA 3ECRA 2G93A 3K02A 5KCJB 2DOJA 3FV1A 3MVXA 2ANJA 4YB7A 1MH4A 1Z7NE 2DWIA 5DT6A 4O3BA 1US4A 4OHNA 1Y3QA 1VFDA 3LSXA 4Q5TA 1B4HA 4BDQA 2PT2A 2ZYNA 4U22A 3M8UA 4YAHX 4LQ5A 1Y1MA 1Y3PA 5KDTB 2NXOA 3A3UA 2A5SA 3TCFA 3B6WA 3HO7A 2P1SA 3OEKA 2DQVA 3IL1B 2O1MA 4F31B 4X9TA 2AL5A 1B7HA 1B0HA 3IOVA 3KZGA 4OEUA 1MG1A 3H6WA 1FCKA 2ZYOA 4EQBA 4OWDA 3OSQA 2I0CA 1Z7ME 2I49A 1MQGA 3UGWA 5K2YA 2HZLA 2XD3A 3DM0A 5JK4A 2XX9A 3M3FA 1LAGE 1LCFA 3O6HA 1EZ9A 2H98A 5TP9B 1MQDA 4JSDA 5DVIA 4YKPA 2OCUA 4MBPA 1B3LA 2NWJA 2G29A 1FQDA 3K4UA 1LB8A 2GHAA 1ATGA 2DE3A 1B0LA 3KOSA 4ONYA 2XXWA 4ELPA 4G68B 4OERA 1ZTYA 4QF9A 3T9XB 2ZNTA 3RT8A 1PBQA 2REJA 4P11A 2Y7KA 3PMWA 1D4NA 3DELB 1N76A 4LZ7A 4RPOA 3T66A 4DZ1A 2XXRA 2VD2A 5L9MA 2I3VA 4KR5A 1B3GA 4NF5B 4OETA 4BDOA 4F39A 5J1DA 3O66A 3N94A 3IOTA 2RC7A 2Y7WA 1SYHA 1M5DA 4F19A 5AA4A 2F34A 3UA8A 2F6PA 3MVYA 1NH8A 4KD5A 4FORA 3KN8A 2KLFA 3BFUA 4NTLA 2AYSA 2Q89A 5ITOA 3K6UA 3MP1A 1A54A 1XHYA 2F7CA 2QPQA 4U23A 3O6IA 5KDTA 4YKKA 2VGQA 2ZXTA 1S9TA 4HCWA 4C1TA 4XKRA 3C35A 5H8QB 3LC8A 2DSFA 1PC3A 2Q88A 1J1NA 4ZEFA 3S2VA 1OVTA 5A5XA 4U4XA 3VLWA 1H44A 4ELRA 5I2KB 2A5TB 1SD3A 2RF1A 3HHGA 4XXUA 1SDXA 3Q28A 5CC2A 3EN3A 5B70A 1IUDA 1TFDA 5DEXA 1S50A 1PBPA 1H43A 4ZEIA 4F1YA 3VXBA 3QIMA 4ZECA 3FASA 1N04A 4FJPA 1N0TA 2QRYA 1SI0A 4KYEA 4GL8A 3C9HA 1N3WA 1VSOA 1IXIA 5TP9A 2V3QA 2RC9A 1O64A 1ZKBA 2I6EA 1I6AA 2OJTA 2P0SA 2PVUA 3QK6A 2UVIA 3FVNA 5HPQA 4G68A 3PV0E 4MLVA 4OZ9A 2Q2CA 4L17A 3EHSA 3VLVA 1R9QA 3RY3A 3IB0A 3KG2A 4F3PA 3VV5A 4ND9A 3MVWA 1M5EA 1MPCA 2O6AA 3U1OA 4PP0A 3K6VA 3C4MA 4H67A 2V93A 3CVGA 1USYE 4JWYA 3VXCA 2YPNA 5I56A 3IOWA 4LA9A 3KJTA 3ODBA 4QSDA 2DWAA 1ZU0A 2Y84A 1O63A 1FTOA 4Z0IA 2XXVA 5F7VA 2WKYA 4I9DA 1MY4A 3WAEA 4LP2B 4IY5A 5CMKA 5AA2A 5CMCA 1M5CA 1GTKA 1PEBA 4ZE8A 3FXQA 3TTRA 2Y7RA 4RJZA 3OELA 1ZBMA 2A5TA 5I2KA 4PETA 1PDAA 2B3BA 3I6VA 1IEJA 4NF8B 3FXUA 1BLFA 1IIWA 3S4UA 5KZTA 3EF7A 2VP1A 2CZLA 2QMWA 3PPRA 1A99A 2VD3A 5CMMA 4F3BA 1B5JA 2D5WA 2QJEA 4X1DA 1LCTA 3PD8A 3IX1A 5M2VA 1N7WA 5FTIA 4I8CA 2O1LA 3TKDA 3MWBA 1NL5A 2I4BA 2I3WA 1XVXA 1H3DA 4C0RA 3VDFA 4H65A 4IO5A 4DXCA 1USYH 3W15C 3N5LA 1YPNA 4NF4B 3TTNA 3Q25A 3ZS6A 3TYHA 1B05A 1MM6A 1NNKA 1P1UA 1MXYA 3TTMA 5IKBA 2LAOA 4UA8A 3B7DA 4G77A 1B5IA 1POY1 5ELVA 1XS5A 4MH5A 2Y7IA 4P0GA 2RKMA 2QSXA 4JWOA 4DXBA 1B40A 2UVGA 4E0XA 4JWXA 3O28A 1B46A 3HV1A 3VFJA 3TCHA 4EXLA 4GD5A 3WAFA 3DP4A 3KN3A 3PPQA 1BP5A 5DTBA 3K01A 4ZEKA 1MY1A 1LAHE 1RYOA 5I84A 3KN7A 4O3AA 3W9WA 2HXWA 1FQFA 2PMSA 3ZKKA 3HN0A 2F78A 2X7QA 1TWYA 1MQIA 2PYYA 4IGRA 1PB8A 3SDFA 1MDQA 5H8NA 3B6TA 1DPPA 1A40A 3N6UA 4Q30B 2H5YA 3EHUA 3E13X 1NH7A 3G3HA 3E9XA 3KBRA 1AH5A 2XXXA 1FTKA 3IOUA 5AA1A 2DXRA 4KFQA 4YKIA 1ANFA 1R9LA 1DOTA 2DE4A 4IO3A 5LOMA 4GL0A 2QS3A 4N07A 1XC1A 2Z8DA 3K00A 3T9VA 4H6DA 2RCBA 3SEVA 4EQ7A 1POTA 3IO4A 2X7PA 3KSXA 1FQBA 1Y3NA 1QKAA 1MDP1 2OK2A 4XKPA 1B3FA 2HQ0A 2O84X 2DS9A 3THIA 3IJOB 3JYRA 1VE4A 4R2BA 1LSTA 4HTGA 2Z8EA 4NF4A 4R73A 4JXIA 1B7ZA 4GXAA 1TXFA 3PPPA 1BTJA 5ICTA 3SESA 5EHMA 3HPIA 2O69A 2PBWA 3R26A 5TPAB 3C36A 4RK2A 3VVDA 5I58B 2Z22A 5JTYB 2QMXA 1D9YA 3PUYE 3K6XA 4N6PA 1MM7A 4KHZE 3U93A 1FQAA 5DVFA 4G2ZA 3V83A 4PFTA 1MXUA 5I59A 3GBBA 3QSLA 2O68A 1A8EA 4XTCQ 3PGFA 1UTBB 3KGCA 2OLBA 4RYAA 3KOTA 1GV8A 3SEYA 4PFYA 3TELA 4NE4A 4LONB 1SYIA 1FTJA 4AB5A 5K2XA 2F35A 3R6UA 1DTGA 5CBRA 2UYEA 4NMYA 4ZZEA 3OXNA 4OFOA 4H5FA 1M5FA 2F7AA 3MZ9A 2NVUB 5IAIA 4BLAA 5H8HB 4YICA 1VR5A 3PMXA 4OEVA 3U94A 3K1MA 5H8FB 3TUSA 1NKXA 4U21A 1ELJA 4ESWA 2QL3A 1T0KA 4R74A 4YB5A 3OMBA 1B32A 4TOZA 1QUIA 2FYIA 3FXRA 4QFKA 3OO9A 5CMBA 3IK6B 1ZIUA 5KCJA 4POXA 1Y1ZA 4RPNA 1B2HA 3MJNA 1B7UA 2HAVA 3GZGA 2BJJX 4POWA 2UXAA 3AXFA 3RNNA 3SERA 4THIA 4DCXA 4H0WA 3SEUA 2F6GA 3H4ZA 4U4SA 2UYFA 4PE5B 1PB7A 3CRBA 1LAXA 2Q2AA 4ZS9A 2NUVA 4OTEA 2YLNA 3MPKA 3FJ7A 2ZNUA 4XKNA 4Q8RA 4OQOA 1HSJA 2UVJA 3CFXA 3MC2A 3OO7A 4LUBA 4F1VA 3M3LA 3TODA 1H76A 4FIMA 4AQ4A 4RK9A 1UTBA 2RINA 1B4ZA 1OLAA 2Q9TA 4R2FA 3TZAA 3QUJA 4NWDA 3DP8A 1URGA 1LAFE 4MLQA 3TQWA 4XIGQ 2UVHA 4GF8A 3TDJA 2GH9A 1CE2A 1AMFA 1B52A 4JB7A 3TEPA 4YU0A 3PUWE 3FUZA 2I0BA 3K0VA 4H8IA 2O7IA 3QYTA 5H8HA 1SW2A 4GFRA 3OO6A 4R72A 2QS2A 2OBGA 4NF6B 3HCQA 2E0SA 3I5OA 5AA2D 3RUMA 1B5HA 4ZDMA 2PT1A 5I2NB 4G8MA 5EHSA 1LBCA 3FD3A 2OWTA 3RQTA 1FW0A 4OENA 2DP8A 3L6GA 4PFUA 1LB9A 4NF5A 5FHNA 3F11A 1AOVA 4KCCA 4QRZA 3T96B 2HCAA 4PQJA 3FV2A 4PFWA 4LZ5A 3B6QA 1YCJA 3C32A 4GOTA 2NOOA 5F1QA 3V8XB 2B65A 3ONMA 3Q29A 2F97A 2YJPA 1L5TA 1GVCA 3FZVA 3LUYA 1BIYA 1S7YA 1Q35A 5HBCA 3PPNA 4HW8A 3S9EA 5H8QA 1EH3A 3CFLA 2GRVA 2HAUA 4C1UA 4FAJA 1AIVA 3ZKLA 4EQ9A 1AL3A 5HM4B 3H3GA 3H06B 2V3TA 3LSFB 5FHOA 3PUXE 4DDDA 4DXUA 4IO4A 1MXZA 3H6TA 3OD7A 4X1BA 3T22A 3VVFA 3GLBA 4P0IA 2IEEA 3RPWA 2AL4A 3UN6A 5L9SA 4F2OA 4FEBA 2ALUA 2FNCA 5ITPA 1OVBA 1HSEA 4OESA 2GFEA 1N84A 2XX7A 1SQYA 3MAMA 3FVGA 3USDA 3MBPA 1QJMA 4QFLA 1DSNA 3G3FA 3PMVA 1P1WA 2THIA 3FVKA 4M4GA 1XOCA 5DVJA 4R6HA 3FIRA 1TT1A 4LATA 1DMBA 1LBBA 2DE2A 1B51A 4F3SA 2VOZA 3UORA 4NWCA 2XXUA 3JV9A 4GWOA 1ZJLA 5CI5A 1P99A 3RN8A 3T9HB 2XXPA 4I1DA 3W9VA 1ZMGA 4G8HA 3G3GA 2H99A 3S9MC 1D9VA 3DP6A 5BUUA 1WODA 4X48A 2IA4A 1F9BA 1QW0A 3TQLA 3Q27A 3RTFB 1BKAA 3TPAA 3ILTB 3GBAA 2GHBA 1MPBA 4YKJA 4KYSA 2DVZA 3BKIB 4KCDA 1B6HA 5AA3A 3T9UA 4NF8A 4UACA 4G8NA 3MW0A 2ZMBA 1JVYA 4ECFA 2X26A 1ZLQA 4QSCA 1QUJA 3CG1A 3G7WA 1JEVA 1B58A 1B3EA 4ZE9A 3CI8A 5DYHA 3TFLA 2I58A 4TQUQ 2VHAA 4EUOA 1Y4TA 2V25A 4RA1A 5ISUA 1RYXA 3U92A 4U1ZA 3RGYA 1NNPA 3GXAA 4HCYA 3A3CA 4EF1A 3TTLA 4EDPA 2HEUA 3QXMA 2XD2A 3L6HA 1MY0A 2ONKE 3ILUB 4WXJA 1A8FA 3OENA 2R71A 2H25A 2V3UA 4F1UA 1QULA 5AA4B 1EZPA 3ZSFA 2RC8A 5AE4A 5BWJA 2PX1A 3O97A 1FTLA 3TCGA 1JW5A 1OQGA 2Q8JA 1FQEA 4OFLA 2F8DA 3A09A 1MQHA 4XKQA 1WDNA 4GIZA 1TFAA 1US5A 4AB6A 2ONSA 1IXGA 3HHFA 1LGBC 3PU5A 4QFPA 1RKMA 3QAXA 3VLUA 5A5XB 1OQHA 3BFTA 4LQ2A 1LFGA 1SW1A 3P7IA 2I48A 1MQJA 2ONRA 3MP6A 3D4CA 3V5AA 3DLNA 4RY1A 3U8QA 3VVEA 3Q26A 5DEXB 5CBSA 1P1NA 1H45A 2DYXA 3RTWB 5L9OA 3C33A 1UIUA 4MF3A 2XXQA 2XX8A 3LSWA 3T93B 2FA7A 4ZZAA 4ZEBA 2E1SA 3FGSA 4GQOA 3OOAA 4YMAA 3N6TA 3MPLA 1NMUA 3S9LC 1I6BA 3MZBA 1Y20A 3VE1B 1CB6A 4HS7A 4OXVA 3PUVE 1SVXB 2Y7PA 1II5A 4FEDA 4QHQA 1LFHA 4IGTA 1R6ZA 3UP9A 1I69A 3CSBA 4RXLA 4BDRA 3MVZA 3O29A 1DPEA 4DE8A 1B3HA 3IJXB 3KEIA 4F2QA 3IORA 1OMPA 1HSLA 3PUZE 1MS7A 2XXHA 3MP8A 2ZYKA 4BDNA 1IITA 2F36A 5TPAA 4JBZA 5CRYA 3UIFA 1D3KA 5I58A 3CG3A 3S9NC 5I56B 4K3FA 5JTYA 2R9JA 1MY3A 3CR9A 4R6KA 3OEMA 1XVYA 5AA2B 3LBSA 4NEDA 2O51A 4U1OA 2ESNA 2OZZA 3CIJA 4M1VA 4OMBA 4TLLB 1JEUA 1SW5A 4E0WA 3H7MA 3K2DA 5JEIA 3JZJA 1B1XA 2XHDA 2F7BA 3CSGA 4FECA 1MXVA 1PB9A 1JNFA 4EXKA 4R75A 3RT6B 3CFZA 5FTHA 1YAEA 1MPDA 4JSOA 1B9JA 3KSJA 1WVJA 4O3CA 1GGGA 4F22A 3RLFE 1A55A 1IXHA 4WKMA 5EYFA 4DIGA 5H8FA 1UTHB 3TTKA 1SBPA 4IO6A 2RCAA 2Z23A 4ELQA 1NNFA 4I62A 1NNTA 1IZ1A 2ABHA 1N3XA 3MQ9A 2F5XA 3O9PA 1KWHA 4KPTA 3IB2A 2H4IA 1MXXA 2R6GE 4LVQA 4EF2A 2QS1A 1IQ7A 4F18A 1FTMA 4R9FA 1R1NA 3V89B 1MXWA 1MY2A 1NFTA 3D4GA 3FJMA 4F3GA 3QUFA 3G3JA 1P1QA 5FHMA 3C34A 4OFJA 3O2AA 1N7XA 2HZKA 4LZ8A 4Q0CA 5ICQA 3E4RA 1QKBA 4KQPA 3EPEA 4BDMA 4GXSB 1MRPA 4JDFA 4KYDA 1EZOA 2DWJA 2CMOA 5L8DA 3SKPA 3KFMA 3SETA 1DTZA 4DCYA 2D3IA 4YMBA 1UQWA 4ESXA 4QFNA 1GR2A 2DVCA 1MH3A 3OSRA 4FATA 5I57B 3K1NA 5H8NB 2XXYA 4QFOA 2I4CA 1JETA 4DLDA 3IR1A 4F29A 1JQFA 3U72A 4GRKA 3FJGA 1YTVA 2M8CA 2ZYMA 3K1PA 4WEPA 5CM6A 3EHTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HSTA 4ISUA 1IXCA 4U2RA 2P2AA 5IGAA 3E3KA 3KC1A 1M5BA 1I6QA 3C31A 4NF6A 4XF5A 1INPA 3IFCA 3I3VA 1UTHA 4N91A 4P56A 2AIXA 2XXTA 1FQCA 5I2NA 2H9BA 1QVSA 4GLIA 4YZZA 3IB1A 4H1XA 2QS4A 1URDA 3G3IA 2REGA 3SEWA 4RNSA 1B1HA 3G3KA 1Y9UA 1Q1KA 1NUZA 2OWSA 1FBHA 4IO2A 3SEXA 4H8JA 3O6GA 4OVPA 4ZEDA 2Z8FA 2ZZWA 2XXIA 2B3FA 4FE8A 3TMGA 3EQ1A 3H03A 4NN3A 1FPLA 1G0IA 3M3KA 3LR1A 2PFZA 4PAIA 4HE0A 5I59B 1LBXA 4MFIA 4OVJA 1SW4A 2W7YA 1QUKA 3PD9A 4ELOA 1P1OA 3KJ7A 3PPOA 3FVOA 2DWHA 4IB2A 4R6YA 4WEDA 1XT8A 4G4PA 4HE1A 4Z7EA 3N26A 2DXYA 3H6UA 1OIBA 4QSEA 3MUQA 3H6VA 1LFIA 1LLSA 4GVOA 4OYVA 3IO6A 4H5GA 5H8SA 4R9GA 4BDLA 1URSA 4JVDA 1Y4CA 5I57A 3UK4A 2O7UA 3IAZA 4H45A 1O7TA 1A7LA 1JW4A 2V84A 3LV0A 1EU8A 1JW1A 1SI1A 1VFEA 2HFBA 3LSLA 2ZNSA 4G68C 3OO8A 5B7DA 3MZ1A 5TU0A 1OLCA 1JVXA 4IY6A 2D21A 4YB6A 2QFLA 3TAJA 4TLMB 4IO7A 3BBRA 2F3BA 1UIVA 3R7XA 2ZZVA 3FATA 4KI0E 4N13A 3K6WA 3ECRA 2G93A 3K02A 5KCJB 2DOJA 2F3DA 3FV1A 3MVXA 3EKIA 2ANJA 4YB7A 4PFRA 1MH4A 1Z7NE 2DWIA 5DT6A 4O3BA 1US4A 4OHNA 1Y3QA 1VFDA 3LSXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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