3FASA

X-ray structure of iglur4 flip ligand-binding core (s1s2) in complex with (s)-glutamate at 1.40a resolution
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
GRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of agonist recognition by the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor 4
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 4
total genus 90
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fasA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fasA02
2QS2A 3FXRA 1I6AA 2DS9A 3E13X 2XD3A 1URSA 3PUYE 1A40A 3TTNA 2I4CA 3LSWA 3PPQA 3K01A 3MW0A 4GD5A 2O1MA 3KG2A 1L5TA 4R6YA 4EXLA 1P1WA 1N3XA 4GWOA 1O63A 3MZ1A 3CSBA 1N0TA 2F34A 4DCYA 3KBRA 4EQ7A 1B7HA 1MPBA 4FJPA 3CRBA 3LSLA 3R7XA 1UIVA 4G8MA 1IEJA 4U1ZA 1SW5A 4PFWA 3Q28A 2DQVA 5CI5A 3UIFA 4ECFA 3K2DA 4YKJA 3TFLA 2HEUA 4OEVA 3DLNA 3EHUA 3N6TA 5CM6A 2E1SA 3B6QA 5H8QB 1LCTA 4R72A 3QK6A 1Q35A 3E9XA 3O2AA 4R9GA 5DVIA 3HSTA 2R9JA 2VOZA 4KCDA 2I6EA 5I58A 3B6WA 3OO6A 1LFHA 4GL8A 3O9PA 2Q9TA 4OVJA 2Z23A 5H8SA 1S9TA 4H1XA 2V25A 3BFUA 3MZBA 1HSLA 3RNNA 5DTBA 2VD3A 1FTMA 3FXQA 4HW8A 3V83A 5FTIA 4WEPA 2REGA 4R75A 3EHSA 5KZTA 2Y7KA 4GF8A 1NNTA 4DXBA 3K4UA 1RYOA 1YAEA 3C31A 1US4A 3KOTA 4BLAA 4WXJA 1D9VA 4R6HA 4RNSA 1PEBA 4C1TA 4H65A 3QYTA 2QPQA 5I2KB 2QJEA 4FIMA 3MP1A 1WVJA 4I62A 2V3UA 2LAOA 5F7VA 3FJMA 3K1PA 1BIYA 3T96B 1JEVA 3PU5A 1T0KA 3TTLA 2ONSA 5H8HB 4RY1A 2REJA 3ILTB 2KLFA 2RC7A 4DDDA 1N04A 5JTYB 1JW1A 1SQYA 3O6GA 1JVXA 1I69A 1PB9A 2XXXA 1LBCA 3O6HA 2H98A 4OESA 3KN7A 4IY6A 2THIA 1IXHA 2YJPA 1ZBMA 3SEYA 2I0CA 3RUMA 4MBPA 5HM4B 2QMXA 2NVUB 2DE2A 4XIGQ 2GRVA 4UACA 3M3LA 3DP8A 3H6TA 3P7IA 3VLWA 3ZSFA 4FEBA 3K00A 4ZZEA 2D5WA 3RN8A 3GLBA 1ATGA 1ZLQA 4Q8RA 4YKIA 3OSQA 4U4SA 4RJZA 4N07A 1DPEA 1WODA 2XXTA 5JEIA 4PFUA 1OMPA 3VDFA 1SI0A 4NF5B 2O7IA 3A3UA 2IA4A 4N6PA 2HZKA 1AL3A 2Z22A 1Y4TA 1EZOA 1PB8A 4NF8B 3FVGA 3JV9A 3G3JA 1P1QA 5AE4A 1MRPA 4MF3A 4NF4B 2DOJA 3SEVA 3RGYA 4LUBA 5KCJB 3IO6A 1B05A 3C4MA 2DP8A 4RXLA 4NF8A 1XOCA 5BWJA 4Z7EA 3H03A 4E0WA 2F78A 2PBWA 4ONYA 2AYSA 1J1NA 3S2VA 3MZ9A 4IGTA 4NF4A 1N3WA 2XX7A 4BDNA 1S50A 1NKXA 4NF6B 5KCJA 3T9VA 3TEPA 4THIA 3TAJA 1A55A 3CFLA 3SERA 2ONKE 5A5XA 4Q30B 1FQAA 4YMBA 4LQ2A 1FCKA 1B2HA 4BDRA 4F3GA 1ZMGA 1B1XA 3W9WA 3UA8A 3TTKA 4IO6A 3MWBA 2F5XA 1BKAA 3FVOA 3MC2A 4NF6A 3QXMA 3T93B 4IO5A 4FEDA 3GZGA 1IUDA 3VLVA 3TCFA 2RCAA 4QF9A 4LA9A 4H67A 3PUXE 4F1UA 1JW4A 3Q27A 1O64A 3TQLA 1B32A 2ALUA 1LCFA 3Q26A 1B51A 3USDA 4U2RA 4TOZA 2NUVA 2H25A 1GGGA 3CR9A 3N6UA 1SBPA 3U8QA 4NTLA 2HZLA 1YTVA 1N84A 4MFIA 1SVXB 1LAXA 3PPNA 3OO8A 3K0VA 4F29A 1MDP1 1LAHE 3U94A 2QL3A 3TELA 1FQBA 4GVOA 1TFAA 3CFZA 1B1HA 1VFEA 2V3QA 3S9EA 4LP2B 4G68C 4F18A 1VFDA 4HS7A 5ICQA 2OWSA 4YKPA 1SW2A 5I2NB 3OELA 5TPAB 3SEUA 4G68B 5I57B 2O1LA 3PD9A 4QSCA 1LGBC 5ELVA 5ICTA 1BLFA 2F7AA 4IO3A 4IY5A 4NWCA 1IXCA 1PB7A 3IK6B 1B5IA 4QFKA 4O3CA 2X7QA 1FQDA 5CC2A 1ELJA 3ILUB 1A99A 3H6UA 5I2NA 1YCJA 3BKIB 2V84A 4PP0A 5I57A 1MS7A 3FIRA 5L9MA 4MLVA 4F39A 3IB0A 3EPEA 2F8DA 2RF1A 4KHZE 1F9BA 1B9JA 3PV0E 2ZYOA 4DLDA 2ESNA 4ZEFA 2DVZA 1UTHA 1MQJA 3C35A 2H4IA 2H9BA 4Z0IA 2ANJA 2X7PA 2I58A 3C36A 1POY1 1SD3A 2P0SA 1S7YA 5H8FB 3WAEA 3IOVA 1Q1KA 3HCQA 4QFNA 4LQ5A 2RCBA 3LUYA 1Y1ZA 2E0SA 4KFQA 1LFGA 3KSJA 4GXAA 4DXCA 3KJTA 2D3IA 4FECA 3U92A 1FQCA 3G3FA 1XS5A 3ONMA 3S9NC 1MXZA 4KI0E 5H8FA 3THIA 3UGWA 1Y3NA 3FUZA 1TXFA 2IEEA 4OQOA 4F3SA 2Z8FA 2XXIA 1R9LA 3V5AA 3D4CA 1AH5A 4KCCA 3A3CA 3IO4A 4KD5A 4IGRA 5B70A 4DXUA 1NH7A 3PPPA 3GXAA 1Y9UA 2V3TA 3FD3A 2CZLA 3Q25A 1ANFA 5CBSA 4FORA 3B6TA 4AB6A 3W15C 4P0IA 1MXXA 2OZZA 3MVXA 2A5TB 1OQHA 3DP4A 3TUSA 1AMFA 1MH3A 4JWXA 4XTCQ 1OVBA 1QJMA 2D21A 4OTEA 1B52A 4AQ4A 4DCXA 1GV8A 1H76A 4JSOA 4QSDA 4ELPA 3K02A 2DVCA 3C9HA 2FYIA 4U21A 3OSRA 4ZDMA 4DZ1A 1D3KA 3IOUA 4ZE9A 1TFDA 1B0HA 4RYAA 1N7XA 2O51A 3OEMA 2XX9A 2Q89A 3MVYA 5H8QA 5HBCA 4IO7A 3R6UA 3VVDA 1IXGA 1SYHA 3KGCA 4YKKA 1MM6A 1MPDA 4ZEIA 1EZ9A 3S9MC 1FW0A 1FTOA 3HO7A 4FAJA 1SW1A 1Y20A 2B3BA 2Y7IA 1BTJA 3SESA 3IB2A 3FJ7A 3BBRA 3OO9A 4QSEA 2ZNUA 1M5BA 1QVSA 3U93A 5I59B 3G3GA 3EF7A 1M5DA 2ZYMA 3I6VA 5CMKA 3BFTA 5FHMA 3H4ZA 1NL5A 3EN3A 1NNPA 2XHDA 5AA2B 5I59A 3JZJA 4XKRA 4ESWA 5I2KA 5TP9B 5AA3A 2FNCA 2RC9A 1RKMA 2WKYA 3C32A 4R9FA 3VFJA 1H45A 3N26A 1LLSA 1XVXA 1NMUA 1DTGA 2GFEA 2AIXA 2O6AA 3IL1B 1DMBA 5H8HA 2VHAA 1Y3PA 5JTYA 3MP6A 2ZNSA 3OXNA 1B5JA 4P11A 2Z8EA 5HPQA 2OJTA 1ZJLA 3IB1A 1OIBA 4LVQA 4ESXA 1P1NA 2R71A 3MQ9A 2B65A 4YB6A 1QW0A 4U23A 4ZECA 4H8IA 4QFLA 1IITA 1EZPA 3IR1A 3ODBA 4XXUA 5L9OA 4QFOA 5DT6A 1SI1A 3PMXA 5H8NB 2RINA 2M8CA 3TZAA 3O97A 3LSFB 3K1MA 4F2QA 3TTRA 4TLLB 2UXAA 2XX8A 4JWOA 5AA1A 1B4ZA 4POWA 4JDFA 4MH5A 4NF5A 1B5HA 1P1UA 4C0RA 1MXUA 3H3GA 2UYEA 3DP6A 2H5YA 2AL4A 1PC3A 1SDXA 3HHGA 4OFOA 5H8NA 3SEWA 3L6GA 2W7YA 4XKNA 1SYIA 4GLIA 2I0BA 2Q2AA 1WDNA 3FGSA 4BDOA 2F36A 1MQDA 2DWHA 3SDFA 4E0XA 3IJXB 2PX1A 2NOOA 3VE1B 2Y84A 2HAVA 3D4GA 1XT8A 3RT6B 1P99A 4IO4A 4G77A 1VE4A 2QS3A 3O66A 1MXWA 4ZEKA 3FVKA 4LZ7A 4JWYA 3E3KA 4R6KA 1ZIUA 1QKAA 4PETA 1UTBB 2ZNTA 5JK4A 2RKMA 3EHTA 3UN6A 3OEKA 3MVZA 1NNKA 1R9QA 4OHNA 2P2AA 4ELRA 3VVFA 2ONRA 3K6XA 2DWJA 1M5EA 4KPTA 2DWAA 4F1YA 2Y7RA 5CRYA 1B3LA 1MXYA 3PUZE 3Q29A 1A7LA 3KN3A 4YMAA 3K6UA 2XXYA 4QRZA 3UORA 3FASA 1VSOA 3M8UA 4XKQA 1DOTA 1DTZA 2OLBA 2O84X 5K2XA 1I6QA 3OENA 4PQJA 5I84A 2F97A 5DVFA 4PFYA 4QHQA 3ECRA 2Q88A 2Q2CA 4Q0CA 4JB7A 4GFRA 4PFTA 1B40A 4MLQA 4BDQA 2PT1A 4F1VA 2QS4A 4OMBA 4YB5A 1MY3A 5AA2D 2H99A 1Z7NE 3S4UA 4RA1A 1UQWA 4TQUQ 4NWDA 1ZTYA 1B7UA 2YPNA 2OCUA 3DM0A 4KQPA 2ABHA 4I8CA 2XXPA 1QUJA 3V8XB 3T22A 4RK2A 5FHOA 2GH9A 1YPNA 1GTKA 4LONB 1MQHA 1N76A 4AB5A 3PMWA 5TPAA 2F35A 1PBQA 3IORA 4G68A 4FATA 1MY2A 3H06B 1OVTA 3OMBA 5ITOA 1XHYA 5DEXB 4GIZA 4RPNA 1B0LA 4KYDA 4KYEA 1A54A 5AA4B 2B3FA 1DSNA 3IX1A 2HFBA 4X48A 3H7MA 3VXBA 3MBPA 5L9SA 2UVGA 4EQBA 2I3WA 1FQFA 3RTWB 3U1OA 4DIGA 2HXWA 3W9VA 4O3AA 3MPKA 3LC8A 1NH8A 2ZYNA 2XXQA 1MY4A 2Y7PA 1Y1MA 1NFTA 4LZ8A 4EQ9A 3U72A 3IOTA 3CI8A 4HCWA 3GBAA 3H6VA 3CSGA 1QULA 3G7WA 1JEUA 1JNFA 4H5FA 5BUUA 4EDPA 4YU0A 4H0WA 1Z7ME 1H44A 2XXWA 3IJOB 3KFMA 3G3IA 1A8FA 4G8HA 2G93A 3RTFB 2PVUA 4F19A 1MY1A 3G3KA 4G8NA 2O69A 4WEDA 3TODA 2VD2A 4QFPA 3FV1A 4HCYA 1JQFA 4C1UA 1OLAA 4IO2A 3HPIA 5CMMA 3HHFA 1HSJA 2VP1A 4F31B 3DELB 3K6WA 2XXUA 5KDTB 4G2ZA 3TQWA 3CG3A 3O28A 3B7DA 4H5GA 5L8DA 4DE8A 1B46A 2AL5A 4M4GA 3SETA 4POXA 3CFXA 4KR5A 2A5TA 4ZEBA 1MY0A 4X9TA 2OBGA 1QUIA 2OWTA 5I58B 1QKBA 4EF1A 1A8EA 5M2VA 2R6GE 1USYE 1P1OA 4H6DA 5KDTA 3K6VA 4F2OA 2I3VA 3C34A 2A5SA 3RQTA 1R6ZA 1GVCA 2HAUA 1OQGA 2F7CA 3ZKLA 2F6PA 2PT2A 3M3KA 5I56B 3LBSA 2P1SA 1US5A 3MUQA 2Q8JA 1IZ1A 3WAFA 4EF2A 1BP5A 1II5A 4OFJA 3T9HB 3R26A 4L17A 1TWYA 3RT8A 4JXIA 2Z8DA 2UVJA 1B4HA 3G3HA 4F22A 4M1VA 1CB6A 1MM7A 5I56A 4EXKA 3QAXA 3MPLA 1Y3QA 1B3FA 3V89B 1LB9A 2GHBA 3IOWA 2HQ0A 1FQEA 2QRYA 4BDMA 4P0GA 2V93A 1MQIA 2VGQA 4GL0A 1JETA 4NEDA 1D4NA 3LR1A 2DXRA 3QIMA 1B6HA 2F6GA 3S9LC 3TDJA 3MVWA 1B7ZA 3CIJA 1JW5A 5EHMA 1LBBA 5CMBA 3TTMA 4BDLA 1Y4CA 1IXIA 1H43A 3H6WA 4X1BA 4O3BA 5DYHA 5AA2A 3KJ7A 4OWDA 5TP9A 3PGFA 1TT1A 4OENA 1LFIA 1HSEA 3UP9A 2ZYKA 1AOVA 3ZS6A 1VR5A 2O68A 2I49A 3T9UA 1FTLA 3TPAA 2I4BA 4F3BA 3FJGA 2UVIA 4R74A 3SEXA 1EU8A 1FTKA 4LATA 1EH3A 3QUFA 3RPWA 4OETA 3T66A 3FVNA 2DE3A 1H3DA 2UYFA 5EYFA 4G4PA 5CMCA 4RPOA 5FTHA 5IAIA 3PUWE 3RLFE 1MG1A 4OYVA 1MQGA 3TKDA 3AXFA 3SKPA 4I9DA 2YLNA 3KN8A 1LAFE 1M5FA 4HTGA 3FV2A 4YB7A 3TYHA 3I5OA 2OK2A 3QUJA 5FHNA 2X26A 3L6HA 3FXUA 4XKPA 1XVYA 1N7WA 3OO7A 4N13A 4OXVA 1I6BA 1B3EA 5A5XB 4NMYA 3MP8A 4UA8A 2RC8A 4NE4A 5TU0A 1KWHA 3VXCA 2DYXA 1AIVA 1B3GA 3VLUA 3FATA 3I3VA 4ISUA 2GHAA 3CG1A 1OLCA 3K1NA 1URDA 2F7BA 4KYSA 2ZMBA 2DWIA 4JBZA 3RY3A 1JVYA 1O7TA 2XXHA 3HN0A 4YAHX 3PUVE 3QSLA 3VV5A 4EUOA 4U4XA 2DXYA 5CBRA 3JYRA 3TMGA 4IB2A 2HCAA 1ZU0A 1UTBA 3OD7A 3GBBA 1FTJA 3CVGA 1LB8A 4JSDA 1LSTA 1SW4A 1POTA 5J1DA 1B3HA 4R2BA 1D9YA 4ZZAA 2DSFA 3KEIA 1MH4A 2NXOA 1XC1A 2ZXTA 1QUKA 4GRKA 4X1DA 4R73A 3LSXA 2XD2A 4OFLA 2XXVA 4OEUA 2I48A 2DE4A 2UVHA 2CMOA 1IQ7A 1PBPA 3PMVA 3O29A 1IIWA 1LAGE 3PPOA 3PPRA 4ZE8A 5F1QA 1ZKBA 3MJNA 4ELOA 5ISUA 2FA7A 3T9XB 5IKBA 1GR2A 1USYH 4RK9A 2Y7WA 5B7DA 3UK4A 4TLMB 4ZS9A 4WKMA 4K3FA 3OOAA 2XXRA 3TCHA 4F3PA 3KOSA 4ZEDA 2BJJX 4U22A 4PE5B 2PMSA 3A09A 4FE8A 1MPCA 1B58A 4YZZA 3O6IA 3N94A 4GXSB 1MXVA 4GOTA 4U1OA 3N5LA 3M3FA 1UIUA 5EHSA 2PYYA 1R1NA 4ELQA 3VVEA 2NWJA 1CE2A 3TCGA 1UTHB 2QS1A 3ZKKA 3MAMA 3KZGA 4LZ5A 4YICA 2QMWA 3FZVA 1URGA 4Q5TA 3IAZA 5DVJA 3PD8A 4R2FA 1NNFA 4H8JA 1PDAA 5DEXA 3E4RA 2O7UA 3C33A 5AA4A 3KSXA 1DPPA 2QSXA 4GQOA 1M5CA 3F11A 2G29A 4I1DA 5K2YA 4OERA 4OZ9A 3HV1A 3EQ1A 5LOMA 1MDQA 4ND9A 5ITPA 1RYXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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