3FASA

X-ray structure of iglur4 flip ligand-binding core (s1s2) in complex with (s)-glutamate at 1.40a resolution
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
GRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 4
publication title Molecular mechanism of agonist recognition by the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor 4
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 90
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fasA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fasA02
3L6GA 3QXMA 1IXCA 3A3CA 4OFOA 5ISUA 4OXVA 5DEXA 1SW1A 1A8EA 5CMKA 3EN3A 3OENA 3PPNA 1B58A 1LAGE 5AA1A 3MJNA 2HXWA 2QMWA 3RT8A 2ZYMA 1F9BA 1AH5A 3IB2A 3Q29A 4ISUA 1Y3QA 1FW0A 4R6YA 1TFAA 4GD5A 1LAXA 4E0XA 3RTFB 4YB6A 4MBPA 1OVBA 5ITOA 3MVWA 1DMBA 3KJ7A 4GQOA 4ND9A 2FYIA 1UIVA 1EH3A 4FORA 1P1NA 3M3KA 4MLVA 1N04A 3S2VA 3U94A 4FEDA 1VE4A 1QULA 5HPQA 2OLBA 1M5EA 3VFJA 2F34A 1B1XA 1S50A 2F5XA 4ESWA 5AE4A 2OWTA 4JSOA 2RCBA 2Y84A 3N94A 4BDRA 4LZ8A 4ESXA 4H67A 5FHOA 4G8MA 1GV8A 4FEBA 1T0KA 3N6UA 1VFEA 1DPEA 2DVCA 4RK2A 1TXFA 3G3IA 2I6EA 3IB1A 4IGTA 3AXFA 1MPDA 4OFJA 1XVXA 1MQIA 2F8DA 4G68C 3H6UA 4DCXA 4QSEA 1FQBA 2F35A 4OVJA 3EQ1A 2AL4A 5FHMA 1JNFA 2XHDA 5I59A 1MXXA 1UIUA 3U93A 4XKRA 1FTKA 1HSLA 4G68A 4U4XA 2PBWA 2PT2A 4QHQA 2B3BA 5I58A 2DYXA 1MDQA 3MVZA 1JW4A 4OHNA 3BFTA 5DVJA 3TZAA 2ZYOA 5K2YA 3UA8A 5AA2D 1B6HA 5ICTA 4F1UA 1WODA 3K1NA 3FVKA 1ATGA 1QKAA 2F6GA 5DEXB 2ONKE 1MXVA 1SW2A 3TTLA 4RA1A 1Y1MA 1US4A 1M5FA 1TFDA 2UYEA 1MXZA 3OO8A 1FTJA 3TDJA 3VE1B 2XXPA 1XOCA 2YPNA 1JQFA 4C1TA 2OJTA 3PMVA 5DT6A 4EQ9A 1JVXA 3HHFA 3IL1B 2ZYNA 5J1DA 4XKQA 3RNNA 4LZ7A 3R6UA 1MXYA 2R71A 3RY3A 1AMFA 4F31B 2DWAA 1A8FA 3I3VA 4Z7EA 3O6HA 1M5DA 2XD2A 3GBBA 2G93A 1POTA 3O28A 4N6PA 3ZS6A 4YMBA 2DE2A 3Q25A 1B0LA 2LAOA 1B40A 2HCAA 2I4CA 1B4HA 2VD3A 1LBCA 3PV0E 1GTKA 3K6VA 1RYOA 3IOWA 4IB2A 2XXWA 3PPPA 4YAHX 5BUUA 2I49A 5F7VA 3RQTA 5CC2A 3VLUA 1M5BA 1B05A 5DVIA 1D9YA 3IX1A 4LATA 1FQCA 4GL8A 4XXUA 3IJXB 4G77A 1XC1A 2QPQA 1EU8A 4F3BA 2DWJA 4IO6A 2XXTA 4GRKA 3PPRA 3VVEA 1LSTA 1MRPA 5I59B 1NH7A 2WKYA 3TELA 2ONSA 1M5CA 3CR9A 4KD5A 1JEVA 4ELRA 3JYRA 4G68B 2RF1A 4QSDA 3KN7A 1OQGA 4R74A 2O51A 2ABHA 1FTMA 3K4UA 2ESNA 1SBPA 5I57A 4GVOA 1BKAA 1MXWA 1N76A 2QJEA 4X1BA 3GZGA 1SYHA 3MPLA 3GBAA 2XX7A 3KFMA 1MM7A 2H9BA 2DQVA 3B6WA 4Q30B 5A5XA 1UQWA 4F3SA 4JSDA 2FNCA 1B32A 2QMXA 1NKXA 1QJMA 4QSCA 3N5LA 2F97A 4K3FA 2H5YA 3E3KA 3BBRA 4NF5A 2O7UA 1NFTA 3VVFA 4FECA 2B65A 4LQ2A 1AOVA 2ZXTA 2NXOA 3I6VA 3VLVA 1EZOA 1PC3A 4NWDA 1VR5A 2ONRA 1SYIA 1DTZA 1NL5A 1MM6A 1USYH 4OQOA 3VDFA 3RUMA 2H98A 3OO7A 3ECRA 2NUVA 3OO9A 2XXXA 3W9WA 3H7MA 3KZGA 2XXYA 4F2OA 3C31A 4TQUQ 1JW1A 4IGRA 4H5FA 1SQYA 1LAFE 2UVHA 4R9GA 4O3CA 2UYFA 5CBRA 2H4IA 1B5JA 4RJZA 5I84A 3K1MA 3FZVA 1P1WA 2HEUA 4POXA 3PU5A 3LSLA 3N6TA 3V5AA 3UP9A 4GIZA 4POWA 3TPAA 1D3KA 1MQDA 3QSLA 4JWOA 2RC7A 3TAJA 4THIA 3LBSA 3V8XB 1QUKA 1A54A 3B7DA 4MLQA 3M3LA 4ELOA 4WXJA 4UACA 4ZE9A 4HS7A 1A99A 2VP1A 3KG2A 2KLFA 3H06B 4OTEA 2UVIA 4DXCA 2O7IA 4RY1A 4P11A 2HZLA 5F1QA 4PFTA 2Z8EA 5AA2A 3SEVA 3VVDA 1SI0A 2PX1A 4U4SA 1N84A 1Z7NE 1B5HA 3E9XA 5I57B 4IO5A 2F7CA 4R72A 1PEBA 2REJA 3OELA 4OMBA 3CFLA 4EF2A 1Z7ME 2HZKA 3C34A 5A5XB 2VD2A 3E13X 1RKMA 4F3GA 1PDAA 3N26A 2E0SA 4MH5A 3H6VA 2F36A 4MF3A 3MVYA 2HAUA 3S9EA 5I56A 2R9JA 4ZE8A 3TMGA 1LFGA 4NF5B 4ZEBA 1TWYA 3G3KA 3FJ7A 3KN3A 1MQGA 4N13A 4PFUA 1II5A 5IKBA 3OOAA 4JXIA 4OEVA 1HSJA 3RT6B 3BFUA 1P99A 4F22A 1IITA 3O66A 2O68A 4HCYA 3T96B 3C35A 2R6GE 4IO4A 2F6PA 3K0VA 3H4ZA 3IK6B 1ZJLA 2GHBA 3GXAA 3TODA 3BKIB 4KYDA 4PETA 1N7WA 4U21A 1WDNA 1B5IA 2XX9A 2Z8DA 4H8IA 2I3VA 4GL0A 2PMSA 4FAJA 4U2RA 1A7LA 4YMAA 1YCJA 1AL3A 4NWCA 3I5OA 3KGCA 4FIMA 4C1UA 1SI1A 3QUJA 1POY1 4Q8RA 4E0WA 4L17A 1B3FA 1QVSA 4DXBA 3TCFA 3HO7A 4KYSA 3K00A 1CE2A 2AIXA 2DWIA 4LZ5A 1TT1A 2Q89A 3MP6A 4RYAA 4HCWA 3IORA 4KYEA 3EPEA 1DTGA 1IQ7A 5AA2B 5LOMA 3K6XA 1PB8A 1B46A 4U1ZA 5FTIA 3EF7A 1PB7A 4GF8A 2X7PA 4F2QA 1FQEA 3LR1A 1R6ZA 4LUBA 3OD7A 4YZZA 4N07A 3FATA 4KFQA 1P1OA 1EZPA 5JEIA 3PPOA 1CB6A 3CVGA 3T66A 1KWHA 2PYYA 3DELB 3IAZA 3TFLA 4PFYA 5KDTA 4EQ7A 1BTJA 5EYFA 3WAFA 1VFDA 1IUDA 5I56B 3MZBA 5H8QA 5I2NA 1MY2A 3FXRA 1MQJA 1N3XA 3TEPA 1IIWA 2CMOA 3SKPA 3OO6A 5JK4A 1UTHA 2H99A 3QIMA 3TTRA 4U22A 3QUFA 3RTWB 5AA4A 2DWHA 4EXKA 1IXIA 3HHGA 4RPOA 4O3BA 5H8NA 3C33A 5B7DA 3IJOB 3IOTA 3MUQA 4EQBA 1FQAA 1NNPA 1MPCA 4AQ4A 3VXBA 3IOUA 1HSEA 2Q88A 3V89B 1B0HA 4G8NA 1Q35A 4Q0CA 3KBRA 4I9DA 3MWBA 3RN8A 2RINA 4M4GA 2XD3A 1XT8A 2DSFA 2IEEA 3SDFA 1URSA 4EF1A 3U8QA 3CIJA 5K2XA 1P1QA 1NMUA 1I6AA 1PBPA 1ZU0A 3VV5A 1ZBMA 3PMWA 1FTOA 2REGA 3MAMA 1IXGA 5TPAA 2P1SA 1OMPA 1YTVA 4H5GA 3FV1A 3QAXA 3IOVA 2DS9A 1IXHA 1I6BA 4XKPA 4NF6A 1ZTYA 2QS4A 1FQFA 2QS3A 4LVQA 3LUYA 3TCGA 1L5TA 2X26A 1UTBA 4F1VA 3LSFB 5I2KA 4NTLA 4KHZE 2O6AA 5ICQA 5JTYA 4QFOA 1YPNA 4WEDA 3MP8A 1B51A 2M8CA 1PB9A 5CBSA 5DVFA 5DYHA 4NF4A 1LFHA 4KCDA 1MS7A 1B3LA 3THIA 1R9QA 2D3IA 3KOSA 2F7AA 4QFKA 1SW4A 5I58B 2E1SA 4FE8A 5ITPA 3PUZE 4RK9A 1Y20A 3MPKA 3W9VA 4PP0A 4OYVA 5H8QB 2I48A 4LP2B 3U72A 2RCAA 2A5TA 3ILUB 2GH9A 2O69A 3RLFE 1UTHB 1MY1A 1Y4TA 3ILTB 4EDPA 4R9FA 3HSTA 2XXVA 2OZZA 2OK2A 1URGA 1H43A 4FJPA 3T9HB 5H8NB 3LC8A 1O63A 3S9NC 2XXRA 4YB5A 5M2VA 2DE3A 4ZECA 3OEMA 4C0RA 3UIFA 4ELPA 1ZIUA 1R9LA 1OIBA 2UVJA 3SEYA 1JVYA 4OFLA 3T9VA 1IZ1A 2QRYA 3FUZA 4R6KA 1MY4A 4H0WA 4F29A 4OENA 3TTKA 1Y1ZA 2F7BA 3O6GA 3FXQA 3VLWA 4H65A 4RXLA 1Y3PA 4G8HA 3A09A 1S7YA 1NNKA 4ZEDA 4GFRA 5TU0A 2P0SA 1SW5A 3H6WA 3P7IA 3C9HA 3PUXE 3IB0A 1B9JA 4DDDA 2AYSA 5CMMA 1MPBA 3K6UA 3CSBA 2Q2CA 5TPAB 4F3PA 1BLFA 3HPIA 1LB8A 3PUWE 4HTGA 1SD3A 5H8SA 4G4PA 1B7HA 3SESA 3ZKLA 4NF8A 4H8JA 3HN0A 5B70A 1Y3NA 3R26A 3K6WA 3FJGA 4NF6B 1RYXA 3V83A 2XXQA 3JZJA 4U1OA 2DXRA 2OCUA 2I0BA 3FGSA 3H03A 2V3TA 3GLBA 2V84A 4RNSA 1ELJA 4DLDA 2I3WA 2V93A 4NF4B 4DZ1A 5DTBA 1B7UA 3K01A 4IO3A 4LA9A 2Y7IA 3CRBA 1R1NA 2DVZA 1FQDA 4BDMA 3K1PA 5CMCA 2VOZA 1LCFA 3U92A 3LSWA 4OERA 4X1DA 5CM6A 3JV9A 5FTHA 3L6HA 3IR1A 4PQJA 1VSOA 1OLCA 2ZNSA 2BJJX 5H8FA 2Z22A 2XX8A 1SVXB 3PPQA 1GGGA 5KZTA 4FATA 4IO7A 3EHTA 2DXYA 4ZZAA 2Y7WA 3O6IA 1LBBA 2ZNTA 5HBCA 3FXUA 4WEPA 4ELQA 2GRVA 4YB7A 1ZMGA 1Y9UA 1EZ9A 3RGYA 1MH3A 2AL5A 4TLLB 1GR2A 2OBGA 3O97A 4ZEFA 3USDA 2Q8JA 4GXSB 3KSXA 4R2FA 2I0CA 4OESA 2A5SA 3KJTA 4OWDA 4F18A 5IAIA 3QYTA 4QFNA 3ONMA 3TQWA 4RPNA 3KSJA 3MW0A 5L8DA 4XKNA 3LSXA 3UN6A 3M3FA 3DP8A 4PE5B 2GHAA 2ZMBA 1NH8A 1D9VA 3K2DA 3OEKA 3FIRA 1MY0A 4IO2A 4BDNA 4Q5TA 3TYHA 3MVXA 1A40A 3OMBA 4F19A 1JEUA 4LQ5A 3PD9A 4UA8A 2PVUA 3SETA 4LONB 4NF8B 2Q2AA 3PD8A 5CI5A 2Z23A 4R2BA 3O9PA 1QKBA 3B6QA 4XIGQ 1B3HA 3TCHA 2DP8A 2QSXA 4QF9A 3FV2A 4XTCQ 2ZNUA 4QRZA 1DOTA 2QL3A 1MH4A 4I8CA 4EXLA 2HAVA 1B3GA 2XXUA 1XS5A 4AB6A 1Y4CA 4I1DA 1BIYA 3S4UA 3B6TA 1MDP1 3UGWA 2HQ0A 4YKJA 3WAEA 3EHSA 1OVTA 3DP4A 2CZLA 1LB9A 1LCTA 2DE4A 4R73A 3SERA 3TKDA 4BDOA 5H8FB 3MC2A 4GLIA 4KR5A 1OQHA 1LAHE 2W7YA 3F11A 3HV1A 4BDQA 2RC9A 4O3AA 5TP9A 1H45A 1MQHA 5L9SA 3IO4A 4MFIA 1B1HA 4QFLA 3SEWA 4DXUA 1MG1A 3FVGA 4X48A 3S9MC 3PMXA 1IEJA 2GFEA 1DSNA 1D4NA 1XHYA 4G2ZA 2F78A 1PBQA 1QUJA 4TLMB 4YKPA 1H44A 4OZ9A 2YJPA 1FCKA 1AIVA 4R6HA 3PUVE 2D21A 2ALUA 3D4GA 1N0TA 4P0IA 2Z8FA 1US5A 4PFWA 2Q9TA 4R75A 3CSGA 3TUSA 3ZKKA 2V25A 1MY3A 4YKKA 3MBPA 5CRYA 4NE4A 4IY5A 3O29A 4EUOA 1P1UA 4H6DA 1H3DA 2O1LA 3DLNA 3D4CA 5L9MA 2P2AA 3C32A 3RPWA 4DIGA 3Q27A 4NEDA 2DOJA 2I58A 3Q26A 3CG3A 2VHAA 5BWJA 1B7ZA 2Y7PA 3HCQA 4NMYA 2NWJA 5H8HA 1S9TA 2G29A 2VGQA 3ZSFA 5KCJA 3M8UA 5FHNA 3EHUA 3E4RA 3UK4A 3CI8A 4KCCA 3IO6A 1B2HA 4BLAA 2OWSA 4ONYA 3UORA 2D5WA 4F39A 4JDFA 5L9OA 5ELVA 1B52A 1Q1KA 2YLNA 4TOZA 4ZZEA 1YAEA 1N3WA 3H6TA 4ZDMA 2RC8A 2XXHA 3G7WA 2XXIA 4Z0IA 3U1OA 4H1XA 2QS2A 1NNTA 3PGFA 4F1YA 5KDTB 1H76A 2IA4A 4BDLA 3DM0A 5EHMA 1JW5A 3OSRA 2I4BA 5CMBA 5TP9B 3T9XB 5I2NB 2V3QA 4GOTA 3K02A 1ANFA 2UXAA 2V3UA 3Q28A 4KQPA 5AA4B 3TQLA 3FASA 3T9UA 3R7XA 3MP1A 4QFPA 1O64A 4ZS9A 1ZLQA 4U23A 4WKMA 1USYE 3C4MA 4OETA 4YU0A 4HW8A 3FD3A 5EHSA 4P0GA 4M1VA 2UVGA 5AA3A 4JWXA 4YKIA 4IY6A 2HFBA 1JETA 3TTNA 2O1MA 4GWOA 3QK6A 3A3UA 3CG1A 3KEIA 2O84X 1B3EA 3SEUA 1QUIA 3G3FA 2THIA 3FVNA 3FJMA 4AB5A 1N7XA 3MQ9A 2NOOA 4X9TA 1LLSA 3SEXA 3FVOA 3W15C 1GVCA 5H8HB 4KI0E 3CFXA 1FTLA 1SDXA 5KCJB 3S9LC 1UTBB 3OSQA 3T93B 4I62A 3DP6A 5I2KB 1XVYA 3KOTA 5JTYB 3C36A 1DPPA 2QS1A 1A55A 2RKMA 2NVUB 3T22A 1NNFA 2FA7A 2X7QA 4OEUA 3G3GA 3CFZA 1I69A 4ZEKA 1OLAA 1QW0A 2ANJA 2H25A 4ZEIA 2Y7RA 1ZKBA 1BP5A 2B3FA 4YICA 3TTMA 1LFIA 3ODBA 4DE8A 3MZ9A 1WVJA 3G3HA 3OXNA 4DCYA 5HM4B 1LGBC 1J1NA 4JBZA 4KPTA 1MXUA 3MZ1A 1B4ZA 4JWYA 3VXCA 2ZYKA 4GXAA 4JB7A 2Y7KA 2A5TB 1I6QA 3O2AA 1O7TA 4ECFA 2PT1A 3H3GA 3KN8A 1URDA 3PUYE 3G3JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3BFTA 5DVJA 3TZAA 2ZYOA 5K2YA 3UA8A 5AA2D 4N4UA 1B6HA 5ICTA 4F1UA 1WODA 3K1NA 3FVKA 1ATGA 1QKAA 2F6GA 5DEXB 2DDKA 2ONKE 1MXVA 1SW2A 3TTLA 4RA1A 1Y1MA 1US4A 1M5FA 1TFDA 2UYEA 1MXZA 1NUZA 3OO8A 1FTJA 3TDJA 3VE1B 3QMFA 3KBZA 2XXPA 1XOCA 2YPNA 1JQFA 4C1TA 2OJTA 3PMVA 5DT6A 4EQ9A 1JVXA 3HHFA 1G0HA 3IL1B 2ZYNA 4GWXA 5J1DA 4XKQA 3RNNA 1NI9A 4N15A 4LZ7A 3R6UA 1MXYA 1FJ6A 2R71A 3RY3A 1AMFA 4F31B 2DWAA 1A8FA 3I3VA 4Z7EA 3O6HA 1M5DA 2XD2A 3GBBA 2G93A 1POTA 4O7MA 4PF6A 3O28A 4N6PA 4GWYA 3ZS6A 4YMBA 2DE2A 5EQ8A 3Q25A 1B0LA 2LAOA 1B40A 2GQ1A 2HCAA 2I4CA 4X04A 1B4HA 2VD3A 1LBCA 1NV6A 3PV0E 1GTKA 2VT5A 3K6VA 1RYOA 3IOWA 4IB2A 2XXWA 5IM2A 3PPPA 4YAHX 5BUUA 2I49A 5F7VA 3RQTA 5CC2A 4OVQA 3VLUA 1M5BA 2OWZA 2R8TA 1B05A 5DVIA 1D9YA 3IX1A 4LATA 1FQCA 4GL8A 4GBVA 4XXUA 3IJXB 5IGAA 4G77A 1XC1A 2QPQA 1FPBA 4DI3D 1EU8A 4F3BA 2DWJA 4IO6A 2XXTA 4GRKA 1XI6A 3PPRA 3VVEA 1LSTA 1MRPA 3IFCA 5I59B 1NH7A 2WKYA 2ONSA 1M5CA 3CR9A 3TELA 4KD5A 1JEVA 4ELRA 3JYRA 4G68B 2RF1A 4QSDA 3KN7A 1OQGA 3SZPA 4R74A 2O51A 4H45A 1FPFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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