3FEU | Genus

Total Genus 58

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	58
sequence length	183
structure length	183
Chain Sequence	b'ADPKEGVQYEVLSTSLENDGMAPVTEVFALSCGHCRNMENFLPVISQEAGTDIGKMHITFNQSAHIASMFYYAAEMQVDGAPDHAFMEDLFAATQMGEGTTLTEQQEAYSKAFTSRGLVSPYDFNEEQRDTLIKKVDNAKMLSEKSGISSVPTFVVNGKYNVLIGGHDDPKQIADTIRYLLEK'

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of DsbA-like thioredoxin domain VF_A0457 from Vibrio fischeri rcsb
molecule keywords	putative Lipoprotein
source organism	Vibrio fischeri
molecule tags	Oxidoreductase
total genus	58
structure length	183
sequence length	183
ec nomenclature
pdb deposition date	2008-12-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13462	Thioredoxin_4	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3feuA00

4K6XA 5E59A 1YKCA 3CSHA 1H75A 1V2AA 2YP6A 2H74A 4KDXA 1XWKA 4GSNA 4MMMA 3ERFA 1LJRA 2L6DA 3HY2A 5IMZA 4MCUA 1ZOFA 2VUPA 4WXTA 5IPHA 3IK9A 3UEMA 3D21A 2LJKA 1GTIA 3GFKA 1K0AA 5ECNB 1ST9A 3VK9A 4ZB9A 1GRXA 2HFDA 1BAYA 4PXOA 1M2DA 2L5LA 4MH3A 2AAWA 1KTEA 1UA5A 2D2ZA 1YKAA 1PKWA 1X5DA 1EV9A 1B9XC 4DVCA 2IIYA 3EC3A 1THXA 2CA8A 1U3IA 4IVFA 3KXOA 1ZL9A 3FK8A 3GYKA 3KM6A 4HS1A 4OD7A 2ON7A 1ERWA 3EU3A 5B7CA 1OC9B 4HJMA 2OE3A 2DBCA 1TW9A 2H6XA 3EINA 3DRNA 3HVXA 3GH6A 1PGTA 3DVXA 3FKFA 4OWYA 3RDWA 5B8BA 3KP8A 3C1RA 2VCXA 3TCOA 5B8AA 2YPMA 5DQYA 3KD0A 1SJIA 3QR6A 3APQA 3D0ZA 2FY6A 4KSOA 3VI5A 3QAVA 2QKEA 2GT6A 1C72A 4X0XA 5J41A 5CYYA 1ML6A 2HSHA 2C3NA 4O5RA 1DBYA 2JADA 3TJGA 2MBTA 4OFMA 1MD4A 2PVOC 3MDKA 2ZUPA 1BX9A 2VD0A 3LFLA 1TDIA 1KEBA 2XC2A 3CSJA 2PVQA 1FB0A 2P31A 2HRNA 2K18A 4GSTA 1S3DA 4V2MA 1A0FA 4KCEA 6GSYA 4O7HA 2PPTA 4I8BA 3RHBA 5F8BA 7GSSA 2H6YA 2O8VB 4HDEA 3P90A 16GSA 5DCGA 3VPTA 2V1MA 1WIKA 3FEUA 1ZZYA 2ZCTA 3GKXA 2IL3A 1A23A 3ISOA 4N30A 1A24A 2YNXA 2M80A 2IMFA 3A2WA 1AQVA 2BMXA 2HRFA 4TOPA 2GSTA 2LRNA 9GSSA 4V2NA 3Q18A 1SKWB 5HFKA 3E9JB 1WWJA 2GQKA 3HDCA 4DSSA 2YANA 3DKSA 4L8EA 1SENA 4KNDA 3ZMLA 1QK8A 2C3TA 3LEFA 2LNSA 3CTGA 1GUKA 4IQ1A 3RAZA 1TOFA 1YDKA 1M7TA 5ELGA 1U6TA 1PA3A 4FYUA 1FG4A 3IE3A 4N10A 3QOUA 1E6BA 3RBTA 2X8HA 2GQLA 2B6MA 1GSSA 5HR2A 1AXDA 2HNLA 3GX0A 2F8AA 3TJBA 3DGQA 4ZBAA 4ML6A 1G6YA 4TR1B 2OBIA 1ILOA 2Z9SA 3NOFA 4NV5A 4QL7A 1O85A 3DVWA 4K8MA 1NHYA 1GSEA 3F8UA 3FW2A 1PKZA 3VWVA 2FWGA 5CRHA 2GSRA 1JZRA 1KNGA 1R5PA 2NTOA 3C1SA 1ON4A 4JRRA 1YEXA 2VCVA 20GSA 4AJ7A 2B5XA 1JZDA 4BA7A 2DJ2A 1OC3A 1AQXA 5COHA 1YZXA 1T1VA 5CRWA 4AJ8A 1V98A 14GSA 4EXJA 3PINA 5AN1A 3KTLA 3C73A 2V6KA 2QGVA 3ZLPA 5L71A 2WCIA 4ZXGA 4YQVA 1JLVA 3QAWA 3DD3A 3DYRA 3GRXA 4GLTA 5J3RA 2HZEA 4POLA 2P0GA 2DMLA 2IN3A 4QL9A 1OE8A 1XIYA 3HVSA 4F03A 1JHBA 4L5OA 1ERVA 1BJXA 4KDUA 1FOVA 2OACA 3P7XA 1EV4A 5J9CA 4PX1A 4GSSA 2OADA 1GNEA 1UN2A 1IYHA 2DJ0A 2L57A 4WBJA 4PQHA 3Q74A 1SL1B 5G5EA 5JCUA 2EIQA 2AHEA 2B1LA 1OVNA 5EY6A 2H30A 2XPDA 2RLIA 3M3MA 1PX6A 3GA4A 3FHKA 1UVZA 3GV1A 3ZITA 4KUNA 5ECQB 2H6ZA 4WBRD 4O92A 2RIIA 1E2YA 4GCIA 5G1KA 1PRXA 3VURA 4EVMA 2IFQA 4RUVA 2JACA 2G2QA 22GSA 2K8SA 2H75A 10GSA 1PN9A 3IV4A 2VAFA 2CAIA 4LMVA 3D4MA 2MBSA 4DEJA 1W89A 5G30A 1T8EB 2FNOA 3PH9A 4FH8A 3TOUA 5AISA 4N0ZA 8GSSA 2DJ3A 1A8LA 4IELA 2GZZA 2O7KA 2KOKA 5J5NA 4V1Ap 5D9TA 1EEJA 3ZFBA 3HJOA 2FWFA 1PQNA 1SL0B 1XW5A 1AQWA 2H1GA 2N5AA 1HNBA 4JE1A 3GSTA 3GH9A 3MWHA 2AUVA 3TKSC 3KH7A 1EWXA 4CHSA 4WF5A 3FR9A 1RW1A 1Z7RA 2V2GA 1USBA 3IPZA 1GWCA 2X8GA 3HZ8A 1EOGA 1A2JA 3GSSA 4EF0A 4LMWA 2O89A 4WEYA 1PL2A 3GHAA 2FWEA 4TVEA 4EDZA 1S3AA 1O6JA 1QUWA 1JZOA 5IMDA 4ZL9A 1R5AA 1O8XA 1K0NA 1HD2A 4K0GA 4MA9A 2FHEA 5JCWA 4CDOA 4V1Ag 5F05A 1OKTA 3EURA 6GSWA 2LTKA 1I9DA 5GAND 1AC1A 2A4VA 4ML1A 3WT2A 4POKA 2LSTA 5FHIA 1PMTA 2NBSA 3ZFLA 3HHVA 3F4RA 4HZ2A 1F37A 1XOAA 2DJKA 4KE3A 2JZSA 4NAXA 1FVKA 3JCML 3CXGA 2OE1A 2HXKA 1F2EA 2YWMA 1ZYQB 1SK2A 3P8WA 3KCMA 4TR0A 3FR3A 2LUSA 1G7OA 3UVTA 3WT1A 1F3AA 5AIXA 5CRDA 3HJMA 2H76A 3ZIJA 3A3TA 5H5QA 4BL7A 4ZILA 2JL4A 1TU8A 5D73A 3KJYA 4FYCA 1CQGA 1TK0B 3QFAC 2DLXA 2LNTA 3BBYA 4XS4A 1ACVA 4GTUA 3U6VA 1W4VA 3F0IA 1FB6A 1N8JA 1VF2A 1SK0A 1PSQA 3LXTA 1AW9A 2L6CA 4OMVA 2CVBA 4MJCA 2OKAA 1EP7A 1TJDA 1G6WA 1SU9A 5KN2A 4K2DA 3I9V2 5D8IA 4PNFA 1U88A 4Q5QA 3QMXA 4MZWA 5KN0A 2M46A 2L4QA 3ZRDA 4JEDA 5ID2B 3GNJA 4IGJA 1EP8A 3A2XA 5AGYA 4BVYA 4H86A 4OCFA 3H79A 3VWWA 3TKSA 4X1UA 3QFBC 4ECCA 4AF2A 2WGRA 5G2ZA 4BVXA 1MTCA 4MF6A 4AJ6A 5D9XA 3GN3A 4GRFA 3IR4A 2HI7A 2VLVA 3UARA 1EGOA 2C3QA 1G7EA 2VCQA 2J23A 3IA1A 3G9BA 5DJLA 4XTSA 2NPBA 1ABAA 4JU5A 3R2QA 2CT6A 2EIOA 2B7JA 3UBKA 4K0NA 4IHUA 2FUG2 4WKWA 3TJFA 3L9SA 3TDGA 4F0BA 4GF0A 2VL2C 2VIMA 1XVQA 3M9KA 3ZYWA 3WYWA 5IO2A 3IK7A 1YJ6A 2RM5A 3OR5A 2PU9C 4OFNA 3GURA 4GQCA 3L78A 2F9SA 2WULA 3HYPA 4HQZA 3O76A 2B7KA 4IJ3A 2YJ7A 1SJZA 5F06A 4PQIA 4ZL8A 4EC0A 2HLSA 2F51A 1LBKA 2E0QA 2P5RA 1M2BA 2X8CA 4TN8A 2F3MA 2FLSA 4EE0A 1SYXA 1K3LA 2JSYA 4HQSA 3BOAA 1WJKA 3VPQA 4D73B 5IQYA 1B4PA 5GSSA 3PGTA 3GKMA 3L9VA 4WR4A 1XZOA 3IDVA 3NZNA 1NM3A 2R5GA 3C8EA 2R3XA 4ZIJA 3GKNA 1HYUA 3KMNA 1GSUA 2YV7A 4TKYA 2O85A 1J08A 2YJHA 2FCHA 5EPFA 1FVJA 3M8NA 1X0RA 2VCZA 1MD3A 5JWOB 2WDUA 2H72A 3TJJA 1SD9A 2QC7A 1K0BA 3M1GA 2KUCA 3HZ4A 1PX7A 2TRXA 2YWIA 1AUCA 2AB6A 3F4TA 4G19A 4POBA 1A2MA 2OBKA 1OC9A 2RUEA 3IAM2 1GNWA 3ZTLA 3US3A 3ZVJA 4MJAA 2LJAA 1MEKA 4KA0A 3TB2A 5DALB 4ZBDA 1XWBA 1M2AA 3QAGA 1WOUA 1TRSA 1Y6EA 3FY7A 2TIRA 1SYRA 3Q6OA 1HNAA 5G5FA 3KH9A 4GWRA 3LJRA 3CYNA 5F0GA 4RI6A 2OE0A 2JZRA 1O73A 3F6DA 4XS6A 2HZFA 4JR6A 2LV3A 5J9BA 4ZL7A 3GX8A 1R26A 3H8QA 1B8XA 1TKDB 1MDKA 2C1YA 1TRUA 3BD2A 3IOSA 2FGXA 2ALBA 2C0EA 4DSRA 4EKZA 2CZ3A 1GLPA 2KLXA 1V58A 2VCTA 3ZL5A 4AGSA 5KEJA 4KGIA 1YEPA 1T00A 3GL3A 4TR4A 2HSYA 2VOCA 3J7Yb 3EVIA 3EMXA 5J4UA 4HI7A 4N0VA 1B9YC 1AAZA 3HJPA 3GMFA 1Z3EA 3PR8A 2GSQA 3AY8A 4TXOB 1TK5B 2JSZA 1WE0A 3C7MA 2B3SA 2JU5A 2WS2A 3IHQA 2YWNA 3KIJA 1N2AA 1FW1A 5ECSA 5ENUA 2DJJA 1G0TA 2MMOA 1FAAA 4V2LA 3TRPA 2CQ9A 2H8LA 2QSIA 2VL9A 1GULA 3H4KA 2C0GA 5C00A 3VI7A 2IMKA 4HUAA 2FWHA 3IAS2 1XVWA 2E7PA 1RK4A 3TKPA 1GTBA 3IBHA 1SK1A 2L59A 2V32A 4MJEA 1K0OA 3H1NA 4OFTA 5B6NA 4TXVA 1K0CA 4TR1A 4POMA 3FR6A 4ZB8A 1MDIA 3RPPA 4MZCA 1AIUA 5H5RA 2H0GA 2MYGA 2OA7A 2IPAA 4HZ4A 2H1DA 3I6AA 1F3BA 3DWVA 4OO5A 1BYEA 2GTUA 2M72A 4ACSA 3WGXA 5CAXA 2JZTA 3W6GA 2LRTA 2VM2A 6GSTA 5DAKB 2V6OA 1K3YA 3I69A 5LCZA 1TRWA 4I5QA 4OO4A 2ON5A 4E8EA 2H73A 5B6MA 1Q98A 4EDYA 4TR3A 2DIYA 3LORA 1BEDA 3L4NA 2C0FA 5IMAA 3CBUA 4J2FA 1XW6A 2DSAA 4MZBA 2H0HA 4IKHA 3EMPA 3RHCA 2B5EA 5DBQA 5IO0A 1T7PB 1Z5YE 1ZGNA 1ZYEA 4L5LA 3GTUB 4XCSA 1YY7A 2MMZA 1TXXA 1X9WB 2A2SA 1R4WA 3HA9A 4I2UA 1QFNA 5EVOA 5IM9A 2H19A 4FYBA 2KP1A 4IP6A 4DSQA 4NPBA 2YWOA 3FRCA 1O81A 5C04A 3QDNA 4G2EA 1V9WA 4YQMA 4NHZA 2FD3A 5A4WA 4J56E 1GTAA 1QXHA 1DE1A 2R6KA 3WGEA 3M9JA 1H4OA 3QCPA 4ECBA 2ES7A 1SD8A 2WFCA 4QQ7A 4RQXA 3BCKA 3CRTA 3E3EA 2WJUA 6GSSA 1B48A 4NHWA 1OAZA 3O6TA 3F3QA 4G10A 2IJYA 1R7HA 1XOBA 2R37A 3ME7A 2PWJA 2KP2A 4K1FA 3UJ1A 1GSDA 3QD9A 4LL4B 3G7IA 1GUMA 1TP9A 5ECLB 1T4ZA 4OCEA 4G9HA 2L5OA 2I4AA 3A5WA 4HU9A 2FA8A 2CV4A 4FO5A 12GSA 4BWQA 4LL1B 2GDRA 3LGCA 4ZB6A 3GL5A 5A5KA 5IIZA 4EO3A 1U87A 2I81A 3DIEA 1VF3A 2MZCA 2N5FA 1MDJA 2E2GA 5FWGA 4BWSA 3FZ4A 3MSZA 4IN0A 2X99A 4K9ZA 4E8HA 2EC4A 1QQ2A 3K8NA 3VLNA 4MABA 1WPIA 1EEMA 5HQPA 4YH2A 3U5RE 4I6XA 1NSWA 1NHOA 1BQ7A 1K3OA 4I2TA 1OE7A 5G31A 1A8YA 4HJ2A 1V40A 1GP1A 5HR3A 1JLWA 3UMAA 1F6MC 2XPEA 1PD21 3DXBA 2O87A 2GLRA 4GXZA 3BCIA 5DDLA 5CO3A 5IMFA 3ZMKA 1XW9A 2RUFA 4WR5A 1Q4JA 1YF1A 4NMUA 1GTUA 3FZ5A 5ECHB 5DVBA 3VFIA 3KEBA 2N5BA 4HU7A 4KDYA 1QMVA 4YQUA 5D93A 1DSBA 1X9MB 3D4TA 2BTOT 17GSA 1GH2A 5JWRB 2GVPA 4JR4A 3BJ5A 2VO4A 3DMLA 4RI7A 3HD5A 2FA4A 2K6VA 1DUGA 1YF0A 1XWCA 2LQQA 2DIZA 4XHMA 2CVDA 2PMTA 2C0DA 5CP1A 1ERTA 3RPNA 3L9UA 3Q19A 1Y25A 3F3RA 3H93A 3UVHA 4MLYA 5DQSA 3UIWA 1UC7A 4ECIA 5D9VA 4DSSB 5EL8A 2BJXA 2VM1A 5DCHA 2H1AA 3QPMA 2H66A 3UOMA 1I5GA 3V1WA 2GZYA 5ECOB 4LA1A 1XFLA 3LXZA 3ZZXA 2PN8A 1EOHA 2YV9A 3HCZA 1EGRA 1BG5A 3GIXA 4NWYA 2REMA 3IXRA 2V41A 2CX3A 3FZAA 2I9HA 5ID2A 4X43A 4XRAA 3TOTA 3SBCA 5KN3A 3N9JA 3D5JA 6GSUA 3KZQA 2WZ9A 5ECMB 2CX4A 2A2RA 1EZKA 5D9WA 4RQRA 4LLRA 4XS1A 4WETA 1O8WA 2J9HA 2GZPA 2VLUA 4Q5NA 2K9FA 2MMAA 4MK3A 2AYTA 2X64A 1KBNA 2GT5A 3HXSA 3D6IA 4IBPA 2K8VA 5GSTA 1GLQA 4MF5A 4YAPA 1GUHA 2YOIA 4TRXA 1WP0A 1F9MA 1O7UA 4K7IA 2XBQA 1VRSD 4J57E 3N5OA 1XWAA 2HZEB 1GL8A 4BPYA 1ERUA 5ECIB 4Q5RA 3TRQA 3GUSA 2R4VA 4KAEA 4PNGA 4GQFA 3KP9A 1J9BA 2HYXA 1T4YA 2LQOA 3P2AA 4PURA 4L0WA 2LS5A 5IPGA 1IYIA 2CVKA 5DJMA 1ZMAA 4IS0A 1CQHA 3F6FA 4FIWA 1NW2A 4KSMA 1XXUA 2TRCP 1OYJA 4NXIA 2H1BA 5CRGA 3LYKA 4D73A 2DC5A 2GS3A 2P5QA 4HEA2 2PBJA 3ME8A 1ZCPA 4F82A 2H70A 3LSZA 5G1LA 1K0MA 1HQOA 2CZ2A 4PUFC 5GAPD 2PGTA 1PL1A 2VL2A 4NV2A 3W8JA 1XPVA 2YCDA 4K7OA 2LRCA 5D96A 3VWXA 5A4VA 5ECKB 3CSIA 1LU4A 2VD1A 3FYGA 1J0FA 2IMEA 1OKDA 3KTBA 2IFQB 1X9SB 1VF1A 3TKRA 4KH7A 5JCGA 5IOWA 4MP4A 4KCAA 3ZREA 4IJIA 2IWTA 1SKSB 3EE2A 3CRUA 3HVVA 3DEXA 4P3YB 1K0DA 2NVLA 1TU7A 3S9FA 3G7YA 4WF4A 4PGTA 5DALA 2PERA 3ZIVA 3A2VA 5FT3A 2AJQB 3F63A 2H01A 4L0UA 18GSA 3LWAA 5GZZB 5KN1A 1SKRB 1M0UA 4IQAA 1Z6MA 1M9AA 1XWGA 2DJ1A 5INYA 3GKKA 1VF4A 3WGDA 4F9ZA 3EYTA 3APOA 4JBBA 5HR1A 1M9BA 3ERGA 4EUYA 1VGLA 1A2LA 1GSYA 2MMNA 4XRDA 4Z7XA 2OJLA 2LJRA 2GSSA 3I43A 2B1KA 2AV4A 4F0CA 19GSA 1XBSA 2ZNMA 2E2MA 1X5EA 2PUKC 4MH2A 1OC8A 4F2IA 2VLTA 5CNWA 2YZHA 1SJ6A 1THOA 3LG6A 2YN1A 13GSA 3TUEA 5LNKe 2C4JA 4TXOA 4CW9A 4MJBA 11GSA 3UAPA 1Z6NA 1SL2B 4PUAA 3TGZA 3L0HA 1URMA 2F8FA 2NDOA 3IRAA 4JZQA 5E4WA 1HNCA 4YAVA 4MPFA 1XCCA 2KHPA 2G0FA 4IP1A 4MF7A 1QGVA 3O3TA 1TK8B 5ABRA 5HR0A 3LYPA 5F07A 3TRXA 2VL3A 4MPGA 4IW9A 1Z9HA 2L4CA 3APSA 1YQ1A 3ZVJD 1TI1A 4MDCA 1GSFA 2IMDA 2CAQA 4Q5FA 1A0RP 3TJKA 4EL1A 4PQ1A 2IMIA 1V57A 4XS4B 4ZBBA 1WMJA 3E0UA 2I1UA 2GQMA 4ILFA 3TKQA 2XBIA 3SWLA 4ULXA 3D22A 2R2JA 6GSXA 3FZ9A 5IMCA 4ISDA 3C71A 3M0FA 5ELAA 3F4SA 3G7JA 1TTZA 2HT9A 2C80A 3LQ7A 4HOJA 3HKRA 5LD0A 2XHFA 4KX4A 3F9UA 2GGTA 3MAKA 4O32A 2I3YA 3KMOA 4TW5A 5IMVA 2WRTA 2H0IA 5DAKA 2LKUA 3IC4A 3CMIA 2WB9A 6GSVA 2YZUA 3J7Yk 5IOXA 5ECRB 1DE2A 3VWUA 3W8SA 2HE3A 5ECPB 4KW6A 2B5YA 3NIVA 3KGKA 3EWLA 3ED3A 1FO5A 4ECJA 4K7NA 2DMMA 1WRYA 3MNGA 3TKSE 3ERWA 2RM6A 1T3BA 3WD6A 5HFIA 5JWQB 3GTUA 4ID0A 5CREA 5A4UA 1Z7PA 1U3AA 1FHEA 3UBLA 4XIHA 1S3CA 1X5CA 4KB3A 1JFUA 2H71A 5HFGA 3CTFA 1TI3A 1TRVA 2EIRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3FEUA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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